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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1181 | 2025-10-06 |
Exploring the role of neutrophils in inflammatory pain hypersensitivity via single-cell transcriptome profiling
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1552993
PMID:40503232
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析探索中性粒细胞在炎症性疼痛超敏反应中的作用 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析术后和CFA诱导炎症中CD11b+细胞的组成,并发现CXCR2抑制剂NAMO通过抑制中性粒细胞分化成熟缓解疼痛 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证 | 探索中性粒细胞在炎症性疼痛中的作用机制 | 小鼠术后和CFA诱导炎症模型中的CD11b+细胞 | 单细胞转录组学 | 炎症性疼痛 | 单细胞RNA测序,蛋白质组学分析,生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质表达数据 | 小鼠炎症模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1182 | 2025-10-06 |
Identification of mitophagy-related biomarkers in severe acute pancreatitis: integration of WGCNA, machine learning algorithms and scRNA-seq
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1594085
PMID:40503237
|
研究论文 | 本研究通过整合多种生物信息学方法和实验验证,识别出MAPK14作为重症急性胰腺炎中关键的线粒体自噬相关生物标志物 | 首次将WGCNA、机器学习算法和单细胞RNA测序技术相结合,系统性地识别重症急性胰腺炎中的线粒体自噬相关基因,并发现MAPK14在胰腺巨噬细胞中的重要作用 | 研究主要基于生物信息学分析和动物模型验证,需要在人类临床样本中进一步验证 | 识别重症急性胰腺炎中关键的线粒体自噬相关基因,为深入研究其发病机制提供理论基础 | 重症急性胰腺炎患者基因表达数据、SAP小鼠模型 | 生物信息学 | 重症急性胰腺炎 | WGCNA, 机器学习算法, 单细胞RNA测序, ssGSEA | 机器学习算法 | 基因表达数据 | GSE194331和GSE279876数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 基因表达分析 | NA | NA |
| 1183 | 2025-10-06 |
A Risk Model Based on Ferroptosis-Related Genes OSMR, G0S2, IGFBP6, IGHG2, and FMOD Predicts Prognosis in Glioblastoma Multiforme
2025-Jan, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.70161
PMID:39815665
|
研究论文 | 本研究基于铁死亡相关基因构建了一个风险模型,用于预测多形性胶质母细胞瘤的预后 | 首次基于铁死亡相关基因构建了包含OSMR、G0S2、IGFBP6、IGHG2和FMOD五个基因的风险预后模型 | 研究依赖于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 探索铁死亡分类及其风险模型在GBM中的意义,评估其在预后评估中的潜力 | 多形性胶质母细胞瘤患者 | 生物信息学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序, 多组学分析, 单变量Cox回归, LASSO回归 | 风险预测模型 | 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | TCGA-GBM和CGGA-GBM数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1184 | 2025-10-06 |
Exploring the mechanism of action of succinic acid in ovarian cancer via single-cell sequencing of the tumor immune microenvironment
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1535504
PMID:40196737
|
研究论文 | 通过单细胞测序技术探索琥珀酸在卵巢癌肿瘤免疫微环境中的作用机制 | 首次结合生物信息学和单细胞测序技术系统分析琥珀酸在卵巢癌治疗中的潜在靶点和作用机制 | 研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证 | 探索琥珀酸在卵巢癌治疗中的潜在靶点和治疗机制 | 卵巢癌患者和正常个体的肿瘤免疫微环境细胞 | 生物信息学 | 卵巢癌 | 单细胞测序, 生物信息学分析 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1185 | 2025-10-06 |
Gene set optimization for single cell transcriptomics
2025, Computational intelligence methods for bioinformatics and biostatistics : ... international meeting, CIBB ... : revised selected papers. CIBB (Meeting)
DOI:10.1007/978-3-031-89704-7_14
PMID:40487192
|
研究论文 | 本文提出了一种针对单细胞转录组数据的基因集优化方法 | 利用人类蛋白质图谱单细胞类型图谱中的细胞类型特异性信息,为基因集计算权重,实现基因集测试的定制化 | 方法依赖于HPA数据库的81种人类细胞类型数据,可能不适用于其他物种或罕见细胞类型 | 提高单细胞RNA测序数据中基因集测试的统计功效和可解释性 | 单细胞转录组数据和基因集 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 基于HPA单细胞类型图谱的81种人类细胞类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1186 | 2025-10-06 |
Multi-omics analysis and single-cell sequencing revealed the lysosome associated molecular subtypes and prognostic model development of papillary thyroid carcinoma
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0325486
PMID:40493560
|
研究论文 | 通过多组学分析和单细胞测序揭示了甲状腺乳头状癌的溶酶体相关分子亚型并开发了预后模型 | 首次系统研究溶酶体在PTC中的作用,开发了基于五个预后相关LAGs的评分系统,并通过单细胞测序解析了这些基因在不同细胞类型中的表达 | 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步实验验证;样本量可能有限 | 研究溶酶体在甲状腺乳头状癌中的作用机制并开发预后预测模型 | 甲状腺乳头状癌患者和细胞系 | 生物信息学 | 甲状腺癌 | 多组学分析, 单细胞测序, western blot, qRT-PCR, 集落形成实验, Transwell实验 | 预后评分模型 | 基因组数据, 转录组数据, 单细胞测序数据 | TCGA和GEO数据库中的PTC样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 多组学分析 | NA | NA |
| 1187 | 2025-10-06 |
Malignant epithelial cell marker-driven risk signature enables precise stratification in esophageal cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1610991
PMID:40496864
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,构建了食管癌恶性上皮细胞标志物驱动的风险特征模型 | 首次在单细胞分辨率下系统表征食管癌上皮细胞异质性,基于恶性上皮亚群标志基因构建六基因预后模型,并实验验证关键基因HMGB3的致癌功能 | 研究样本量有限,主要基于公共数据库数据,需要更多独立队列验证模型的普适性 | 开发能够精确预测食管癌预后、免疫状态和药物反应的风险分层模型 | 食管鳞状细胞癌(ESCC)组织和细胞系 | 数字病理 | 食管癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, qRT-PCR, 细胞功能实验 | 多基因风险评分模型 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | TCGA和GEO(GSE53624)队列的食管癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1188 | 2025-10-06 |
Deciphering mitochondrial dysfunction in keratoconus: Insights into ACSL4 from machine learning-based bulk and single-cell transcriptome analyses and experimental validation
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.05.013
PMID:40496889
|
研究论文 | 通过机器学习驱动的转录组分析和实验验证揭示ACSL4在圆锥角膜线粒体功能障碍中的关键作用 | 首次结合机器学习算法、单细胞转录组分析和体外实验验证,系统阐明ACSL4作为圆锥角膜线粒体功能障碍的关键生物标志物 | 研究主要基于转录组数据,功能机制验证仍需进一步深入 | 探究线粒体功能障碍在圆锥角膜发病机制中的作用 | 圆锥角膜患者转录组数据和人类基质角质细胞 | 机器学习 | 圆锥角膜 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, qPCR, Western blot | 多种机器学习算法 | 转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1189 | 2025-06-13 |
[ELUCIDATION OF PATHOGENESIS IN HUMAN INFLAMMATORY SKIN DISEASES USING SINGLE-CELL RNA-SEQ ANALYSIS]
2025, Arerugi = [Allergy]
DOI:10.15036/arerugi.74.107
PMID:40500185
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1190 | 2025-10-06 |
Coupling of response biomarkers between tumor and peripheral blood in patients undergoing chemoimmunotherapy
2025-Jan-21, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101882
PMID:39731918
|
研究论文 | 本研究通过分析接受化疗免疫治疗的间皮瘤患者肿瘤组织和外周血样本,揭示了治疗反应相关的生物标志物 | 首次将外周血单细胞RNA测序与肿瘤转录组数据相结合,发现CD8 T效应记忆细胞在应答者外周血中更丰富且治疗后扩增 | 单臂二期临床试验,样本量有限(N=54),需要更大规模研究验证 | 探索化疗免疫治疗在间皮瘤中的免疫学机制并寻找预测性生物标志物 | 间皮瘤患者 | 生物信息学 | 间皮瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, TCR-seq | NA | 转录组数据, 单细胞测序数据 | 54例患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1191 | 2025-10-06 |
Innate immune cell barrier-related genes inform precision prognosis in pancreatic cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1559373
PMID:40486509
|
研究论文 | 本研究通过整合先天免疫细胞屏障相关基因和机器学习算法,开发了胰腺癌预后预测模型并发现新的治疗靶点 | 首次系统研究先天免疫细胞屏障相关基因在胰腺癌预后中的作用,开发了基于随机生存森林的CDRG-RSF预后模型,并鉴定出UBASH3B作为新的免疫抑制和耐药标志物 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,需要前瞻性临床研究进一步验证模型的临床应用价值 | 识别胰腺癌预后生物标志物,开发预测模型,发现个性化治疗新靶点 | 胰腺癌患者及其相关基因表达数据 | 机器学习 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,差异表达分析,功能富集分析,免疫浸润分析 | 随机生存森林(RSF),14种机器学习算法 | 基因表达数据,临床生存数据 | TCGA和GTEx数据库中的胰腺癌样本 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1192 | 2025-10-06 |
TSLP pretreatment inhibits M1 macrophage polarization and attenuates LPS-induced iNKT cell-dependent acute lung injury
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1583235
PMID:40486522
|
研究论文 | 本研究探讨TSLP预处理通过抑制M1巨噬细胞极化和iNKT细胞依赖途径减轻LPS诱导的急性肺损伤 | 首次揭示TSLP在脓毒症相关ARDS中的保护作用机制,发现其通过调控iNKT细胞和巨噬细胞极化发挥作用 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化价值需进一步验证;机制研究尚未完全阐明所有信号通路 | 探究TSLP在脓毒症相关急性呼吸窘迫综合征中的作用机制 | 野生型小鼠、Jα18-/-基因敲除小鼠、骨髓源性巨噬细胞 | 免疫学 | 急性肺损伤/ARDS | 转录组测序、单细胞转录组测序、流式细胞术 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | 小鼠模型和体外细胞实验 | NA | 单细胞转录组测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1193 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptomic Profiling Reveals KRAS/TP53-Driven Neutrophil Reprogramming in Luad: A Multi-Gene Prognostic Model and Therapeutic Targeting of RHOV
2025, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2025.062584
PMID:40486872
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了KRAS/TP53突变驱动的中性粒细胞重编程在肺腺癌中的作用,并开发了五基因预后模型 | 首次系统揭示KRAS/TP53突变通过OSM/CALCR/IL-1信号通路驱动中性粒细胞异质性重编程,建立首个中性粒细胞中心的五基因预后特征 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证仅限于细胞系模型,缺乏体内动物实验验证 | 阐明KRAS/TP53突变对肿瘤微环境异质性的影响,开发肺腺癌预后预测模型 | 肺腺癌患者样本、A549/H1299肺癌细胞系 | 生物信息学、癌症生物学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序、转录组分析、siRNA敲低、CCK8检测、伤口愈合实验、transwell实验 | hdWGCNA、Cox回归、LASSO回归、预后列线图 | 单细胞RNA测序数据、转录组数据、临床数据 | TCGA-LUAD队列、IMvigor210免疫治疗队列、GSE78220数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1194 | 2025-10-06 |
Topology entropy: Enhancing graph partitioning for TAD identification and single-cell clustering
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.04.037
PMID:40487196
|
研究论文 | 本文提出拓扑熵概念用于量化生物图复杂度,并开发了TEC-O和TEC-U两种图分区方法 | 首次将拓扑熵应用于生物图复杂度量化,证明最小化熵等价于最优图分区,开发了针对有序和无序生物图的专用方法 | NA | 开发能够捕捉生物图复杂结构的有效度量方法 | Hi-C接触图谱中的拓扑关联域和单细胞测序数据中的细胞聚类 | 生物信息学 | NA | 图分区算法 | TEC-O, TEC-U | Hi-C接触图谱,单细胞测序数据 | 5个细胞系的Hi-C数据和10个单细胞测序数据集 | NA | Hi-C,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1195 | 2025-10-06 |
Exploring the anti-gastric cancer mechanisms of Diosgenin through integrated network analysis, bioinformatics, single-cell sequencing, and cell experiments
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1600960
PMID:40487391
|
研究论文 | 本研究通过整合网络分析、生物信息学、单细胞测序和细胞实验,系统探索薯蓣皂苷元抗胃癌的作用机制 | 首次采用多方法策略(网络分析、生物信息学、单细胞RNA测序、孟德尔随机化和细胞实验)系统研究薯蓣皂苷元的抗胃癌机制 | NA | 全面研究薯蓣皂苷元抗胃癌的作用机制 | 胃癌细胞 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 加权基因共表达网络分析, 孟德尔随机化, 蛋白质印迹分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据, 蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1196 | 2025-10-06 |
Single-cell and transcriptomic analyses reveal the role of PCDH17 in the non-inflammatory tumor microenvironment of pancreatic cancer
2025, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2025.1559909
PMID:40487760
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和转录组分析揭示了PCDH17在胰腺癌非炎症性肿瘤微环境中的作用机制 | 首次系统阐明PCDH17在胰腺癌内皮细胞中的表达特征及其与炎症基因和免疫细胞浸润的关联 | PCDH17调控肿瘤微环境的具体分子机制仍需进一步验证 | 探究PCDH17在胰腺癌肿瘤微环境调控中的作用机制 | 胰腺癌组织样本和单细胞测序数据 | 单细胞分析 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,免疫荧光 | NA | 单细胞测序数据,转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1197 | 2025-10-06 |
Utilizing Multi-omics analysis to elucidate the role of mitochondrial gene defects in Gastric cancer progression
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0325520
PMID:40489463
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示线粒体自噬相关基因在胃癌进展中的作用 | 首次结合bulk RNA-seq和单细胞RNA测序数据,识别出8个线粒体自噬相关预后基因并构建风险评分模型 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析,需要进一步实验验证 | 阐明线粒体自噬相关基因在胃癌进展中的作用机制 | 胃癌组织和细胞 | 生物信息学 | 胃癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 生物信息学分析 | LASSO-Cox回归, 风险评分模型 | 基因表达数据 | TCGA和GEO数据库中的胃癌样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1198 | 2025-10-06 |
Integration of Bulk and Single-Cell Transcriptomics Reveals BCL2L14 as a Novel IGKC+ T Cell-Associated Therapeutic Target in Breast Cancer
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S523147
PMID:40491783
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk转录组数据,发现BCL2L14是乳腺癌中新型IGKC+ T细胞亚群的关键调控因子和潜在治疗靶点 | 首次识别出IGKC+ T细胞亚群,并确定BCL2L14作为该亚群中驱动乳腺癌进展的关键基因 | 研究主要基于转录组数据分析,需要更多实验验证BCL2L14的临床转化价值 | 识别乳腺癌肿瘤微环境中的新型T细胞亚群及相关生物标志物,为靶向治疗提供新策略 | 乳腺癌患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,机器学习算法,体外功能验证 | 预后风险模型,列线图 | 转录组数据 | 多个乳腺癌队列样本 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 1199 | 2025-10-06 |
GSDMD is a novel predictive biomarker for immunotherapy response: in the pan-cancer and single cell landscapes
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1570901
PMID:40491921
|
研究论文 | 本研究通过泛癌分析和单细胞测序揭示了GSDMD作为免疫治疗反应预测生物标志物的潜力 | 首次在泛癌水平和单细胞景观中系统评估GSDMD作为免疫治疗预测生物标志物的价值,并发现PARPi通过增强GSDMD介导的焦亡发挥抗肿瘤作用 | 研究主要基于生物信息学分析,需要更多实验验证GSDMD的临床预测价值 | 探索GSDMD作为免疫治疗反应预测生物标志物的潜力 | 多种肿瘤类型和免疫细胞 | 生物信息学 | 泛癌 | 单细胞RNA测序, 类器官功能实验 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | TCGA数据集中的多种肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1200 | 2025-10-06 |
A telomere-associated molecular landscape reveals immunological, microbial, and therapeutic heterogeneity in colorectal cancer
2025, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2025.1615533
PMID:40492114
|
研究论文 | 本研究开发了一种名为TELscore的端粒评分系统,用于揭示结直肠癌中免疫、微生物和治疗异质性 | 首次整合转录组和瘤内微生物组数据构建端粒评分系统,全面表征了结直肠癌中端粒生物学与免疫微环境、微生物生态和治疗反应的关联 | 基于公共数据库的回顾性分析,需要前瞻性研究验证临床实用性 | 开发端粒相关分子标志物用于结直肠癌患者分层和精准治疗 | 结直肠癌患者队列 | 数字病理 | 结直肠癌 | 转录组测序, 16S rRNA测序, 单细胞RNA测序, 免疫组化, 全切片图像分析 | NA | 转录组数据, 微生物组数据, 病理图像, 单细胞数据 | 多个独立结直肠癌队列 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 微生物组测序 | NA | NA |