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当前共找到 2168 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-03-14 |
Integrative Genomic and Single-Cell Insights Into Efferocytosis-Mediated Immune Regulation in Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2025, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/8710699
PMID:41498044
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研究论文 | 本研究通过整合基因组学和单细胞技术，探讨了efferocytosis在透明细胞肾细胞癌中的免疫调节作用及其预后意义 | 首次在ccRCC中系统量化efferocytosis通路活性，构建基于岭回归的预后模型，并通过多组学整合及单细胞/空间转录组学鉴定RAC1为关键风险基因 | 研究主要基于公共数据集，缺乏前瞻性临床队列验证；IHC验证数据来源单一（Human Protein Atlas） | 阐明efferocytosis在ccRCC中的预后价值、分子机制及免疫调控作用 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）患者样本及相关基因组/转录组数据 | 计算生物学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 免疫组化, 基因组变异分析 | 岭回归模型 | 基因组数据, 转录组数据, 单细胞数据, 空间转录组数据, 蛋白质组数据 | 未明确样本数量（基于公共数据集） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 102 | 2026-03-13 |
CancerTrace: Multi-stage single-cell analysis of networked cancer evolution for driver and modulator gene identification
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.11.014
PMID:41322005
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CancerTrace的计算框架，用于从单细胞RNA测序数据中识别癌症驱动基因及其上游调控因子 | 结合转移熵和稀疏条件结构于变分贝叶斯模型中，实现时间感知的动态调控机制重建，无需匹配DNA或外部扰动数据 | 仅基于九个纵向scRNA-seq文库（来自三名肺腺癌患者），样本规模较小，且仅应用于肺腺癌 | 识别患者特异性癌症驱动基因及其上游调控因子，以推进精准肿瘤学 | 肺腺癌患者的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 变分贝叶斯模型 | 单细胞RNA测序数据 | 九个纵向scRNA-seq文库，来自三名肺腺癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 103 | 2026-03-13 |
Comparative single-cell landscape of immune cells in human livers affected HBV and non-viral cirrhosis
2025, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2025.1708675
PMID:41815278
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序比较了HBV与非病毒性肝硬化患者肝脏中的免疫细胞景观，揭示了疾病进展中的不同免疫机制 | 首次在单细胞水平上系统比较HBV与非病毒性肝硬化中的免疫细胞异质性，并整合空间转录组数据验证细胞共定位 | 样本量有限，主要基于HBV肝硬化患者，未涵盖所有非病毒性肝硬化亚型 | 阐明HBV与非病毒性肝硬化中免疫细胞景观的差异及其在疾病进展中的作用 | HBV肝硬化患者、非病毒性肝硬化患者及健康对照者的肝脏组织 | 数字病理学 | 肝硬化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据、空间转录组数据 | HBV肝硬化患者与健康对照者的肝脏组织（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 104 | 2026-03-11 |
Bayesian Sparse Gaussian Mixture Model for Clustering in High Dimensions
2025, Journal of machine learning research : JMLR
IF:4.3Q2
PMID:41799364
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研究论文 | 本文提出了一种贝叶斯稀疏高斯混合模型，用于高维数据聚类，特别是在单细胞RNA测序数据分析中应用 | 提出了一种计算可行的贝叶斯方法，使用连续尖峰-平板先验估计高维稀疏高斯混合模型，无需预先指定聚类数量，且后验收缩率达到了极小极大最优 | 未明确提及模型在处理极端高维或噪声数据时的具体限制，也未讨论计算复杂度随样本量增长的具体情况 | 开发一种在高维情况下能自适应估计聚类数量的计算可行聚类方法 | 高维数据，特别是单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 贝叶斯稀疏高斯混合模型 | 高维数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 105 | 2026-03-10 |
ScLineageAtlas: a comprehensive single-cell genomics database for characterizing cellular clones in cancer
2025-01-18, Database : the journal of biological databases and curation
DOI:10.1093/database/baaf046
PMID:40996711
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研究论文 | 介绍了一个名为ScLineageAtlas的综合单细胞基因组学数据库，用于表征多种癌症类型中的细胞克隆 | 整合了24个处理过的单细胞RNA测序数据集，涵盖13种不同癌症类型，并利用先进计算方法识别细胞克隆，提供克隆关系和进化动力学的详细视图 | 数据库目前仅包含24个数据集，可能覆盖的癌症类型和样本量有限，且依赖于现有计算方法，可能受算法准确性限制 | 通过表征细胞克隆来研究癌症的起始、发展和治疗机制，促进对肿瘤异质性和进化轨迹的理解 | 多种癌症类型中的细胞克隆，包括单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 24个处理过的单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 106 | 2026-03-06 |
Mapping cell-cell fusion at single-cell resolution
2025-Jan-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.11.627873
PMID:39896473
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研究论文 | 本文开发了一种名为ClonMapper Duo（CMDuo）的分子工具包，用于在单细胞分辨率下映射肿瘤细胞群体中的细胞-细胞融合事件 | 通过结合报告基因表达和工程化的荧光相关索引序列与随机生成的核苷酸条形码，CMDuo能够识别并追踪单个细胞融合事件的起源和结果，这是首次在单细胞水平上实现此类映射 | 由于依赖于特定的实验系统和条形码技术，CMDuo可能不适用于所有细胞类型或疾病模型，且需要单细胞RNA-seq数据支持 | 研究细胞-细胞融合在癌症进展和治疗反应中的作用，开发一种高通量单细胞数据平台来映射融合事件 | 三阴性乳腺癌细胞 | 单细胞组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 107 | 2026-03-06 |
Dimensionality reduction for visualizing spatially resolved profiling data using SpaSNE
2025-Jan-06, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giaf002
PMID:39960663
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研究论文 | 本文开发了一种名为SpaSNE的空间解析t-SNE方法，用于整合空间和分子信息，以更准确地可视化空间解析分析数据 | SpaSNE是首个针对空间解析分析数据定制的降维方法，整合了空间和分子信息，相比传统方法如t-SNE和UMAP能提供更准确和有意义的数据可视化 | NA | 开发一种针对空间解析分析数据的降维和可视化方法，以更好地解释细胞类型和分子结构 | 空间解析分析数据集，包括来自不同疾病、组织和细胞类型的细胞 | 空间转录组学 | NA | 空间解析分析技术 | t-SNE, UMAP, SpaSNE | 空间解析分析数据 | 多个公共数据集，涵盖3个实验平台和不同疾病、组织及细胞类型 | 10x Genomics, 其他 | 空间转录组学, 空间解析分析 | Visium, STARmap, MERFISH | Visium, STARmap, MERFISH平台生成的空间解析分析数据 |
| 108 | 2026-03-06 |
Lifting the curse from high-dimensional data: automated projection pursuit clustering for a variety of biological data modalities
2025-Jan-06, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giaf052
PMID:40440093
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研究论文 | 本文提出了一种名为自动投影追踪（APP）的无监督聚类方法，通过将高维数据顺序投影到低维表示来缓解维度诅咒，并在多种生物数据模态上验证其有效性 | 提出了一种替代传统高维空间聚类的方法，通过自动投影追踪技术降低维度诅咒的影响，从而更有效地揭示生物数据中的模式 | 未明确说明方法在极端高维或噪声数据下的鲁棒性，以及计算效率的详细评估 | 开发一种能缓解维度诅咒的无监督聚类方法，以改善高维生物数据的分析 | 高维生物数据，包括转录组学、蛋白质组学、单细胞组学数据等 | 机器学习 | NA | 自动投影追踪（APP） | 无监督聚类算法 | 高维生物数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 流式细胞术, 质谱细胞术, 多重成像, T细胞受体库分析 | NA | NA |
| 109 | 2026-03-06 |
Keeping an Eye Out for Autophagy in the Cornea: Sample Preparation for Single-Cell RNA-Sequencing
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/7651_2023_502
PMID:37930627
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研究论文 | 本文描述了利用单细胞RNA测序技术研究角膜缘上皮干细胞群及自噬对其功能影响的样本制备方法 | 开发了针对角膜/角膜缘组织活细胞单细胞悬液的分离协议，并结合自噬缺陷模型进行scRNA-seq分析 | NA | 研究自噬对角膜缘上皮干细胞功能的影响 | 小鼠角膜缘上皮干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 110 | 2026-03-06 |
Characterizing the immune infiltrate in secondary syphilis: implications for transmission and pathology
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1549206
PMID:40201184
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研究论文 | 本研究通过免疫组化、bulk RNA测序和单细胞RNA测序技术，分析了二期梅毒皮肤病变中的免疫浸润特征，并探讨了梅毒螺旋体在皮肤中的免疫逃逸机制 | 首次结合单细胞RNA测序和免疫组化技术，系统描绘了二期梅毒皮肤病变中的免疫细胞组成和细胞间通讯网络，并揭示了表皮TLR-MYD88通路在宿主应答中的关键作用 | 研究样本来源于福尔马林固定石蜡包埋的组织，可能影响RNA质量和单细胞测序的灵敏度；体外实验模型可能无法完全模拟体内复杂的免疫微环境 | 阐明梅毒螺旋体在皮肤感染过程中的免疫逃逸机制和宿主免疫应答特征 | 二期梅毒患者的皮肤活检组织、健康人外周血单个核细胞（PBMCs）、原代角质形成细胞和MyD88敲除角质形成细胞 | 数字病理学 | 梅毒 | 免疫组化（IHC）、bulk RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 图像、转录组数据 | 二期梅毒患者的皮肤活检样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 111 | 2026-03-06 |
Serine supplementation suppresses hypoxia-induced pathological retinal angiogenesis
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.105299
PMID:40303351
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研究论文 | 本研究探讨了丝氨酸补充对抑制缺氧诱导的病理性视网膜血管新生的作用及其机制 | 首次系统性地在氧诱导视网膜病变小鼠模型中，通过多组学分析和单细胞RNA测序，揭示了丝氨酸通过增强线粒体脂肪酸氧化和氧化磷酸化来抑制病理性血管新生的新机制，并鉴定出HMGB1蛋白作为关键介导因子 | 研究主要基于小鼠模型，其在人类疾病中的直接适用性尚需进一步验证；干预时间点和剂量方案有待优化；对丝氨酸代谢下游具体信号通路的解析还不够深入 | 探究丝氨酸代谢在抑制缺氧驱动的病理性视网膜血管新生中的作用及分子机制 | 野生型C57BL/6J小鼠的氧诱导视网膜病变模型 | 数字病理学 | 视网膜病变 | 代谢组学, 脂质组学, 蛋白质组学, 单细胞RNA测序, 蛋白质印迹 | 动物模型 | 多组学数据, 图像, 文本 | 未明确具体数量的小鼠视网膜样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 112 | 2026-03-06 |
Comparative transcriptomic analysis of tumor- infiltrating canine natural killer cells and candidate biomarkers from first-in-dog NK immunotherapy trials
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1646849
PMID:41208961
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序比较了犬和人类肿瘤浸润自然杀伤细胞的转录组特征，并评估了犬NK免疫疗法试验中的候选生物标志物 | 首次在犬类中整合血液、组织和肿瘤样本进行单细胞RNA测序分析，建立了犬肉瘤浸润NK细胞特征，并将此特征应用于首次犬免疫疗法临床试验的NK细胞变化背景分析 | 研究样本可能有限，且犬类模型虽与人类相似，但物种间差异仍需谨慎考虑，临床试验的规模和多样性可能不足 | 改善NK细胞在实体癌症中的疗效，并识别跨物种反应的潜在生物标志物 | 犬和人类捐赠者的血液、组织和肿瘤样本中的自然杀伤细胞 | 单细胞转录组学 | 肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 来自犬和人类捐赠者的血液、组织和肿瘤样本，具体数量未在摘要中指定 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 113 | 2026-03-04 |
Inhibition of vascular smooth muscle cell PERK/ATF4 ER stress signaling protects against abdominal aortic aneurysms
2025-Jan-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.183959
PMID:39846252
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研究论文 | 本研究探讨了血管平滑肌细胞中PERK/ATF4内质网应激信号通路在腹主动脉瘤形成中的作用，并验证了靶向抑制该通路对保护VSMC功能和减少AAA扩张的潜在治疗效果 | 首次通过单细胞RNA测序在人AAA组织中识别出PERK/eIF2α/ATF4通路在VSMCs中的激活，并揭示了TNF-α诱导的PERK依赖性ATF4活化导致细胞凋亡的机制，为AAA治疗提供了新的细胞特异性药物靶点 | 研究主要基于动物模型（弹性酶和血管紧张素II诱导的AAA模型），人类组织的验证可能有限，且长期安全性和临床转化效果尚未明确 | 探究腹主动脉瘤形成中血管平滑肌细胞功能障碍和凋亡的分子机制，并开发有效的治疗策略以预防主动脉破裂 | 腹主动脉瘤组织中的血管平滑肌细胞，以及小鼠AAA模型 | 心血管疾病 | 腹主动脉瘤 | 单细胞RNA测序，基因敲除（Eif2ak3fl/fl Myh11-CreERT2），药物抑制 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 人AAA组织样本和小鼠模型，具体数量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 114 | 2026-03-03 |
Spatial Transcriptomics in Inflammatory Skin Diseases Using GeoMx Digital Spatial Profiling: A Practical Guide for Applications in Dermatology
2025-Jan, JID innovations : skin science from molecules to population health
DOI:10.1016/j.xjidi.2024.100317
PMID:39559817
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研究论文 | 本文提供了使用NanoString GeoMx数字空间分析仪在炎症性皮肤病中进行空间转录组学研究的实用指南 | 提供了制造商指南中未包含的RNA捕获优化方法和潜在问题解决方案，并通过具体疾病案例展示了空间分析策略 | 主要关注GeoMx平台在皮肤病学的应用，可能不直接适用于其他空间转录组技术或其他组织类型 | 为皮肤病研究者提供数字空间分析技术的实用操作指南和优化策略 | 炎症性皮肤病（银屑病、扁平苔藓、盘状红斑狼疮）的组织样本 | 数字病理学 | 皮肤病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx Digital Spatial Profiler | GeoMx数字空间分析仪 |
| 115 | 2026-03-03 |
Network pharmacology, bioinformatics and in vitro/in vivo validation elucidate the anti-lung cancer activities and potential targets of Rhoifolin
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1727729
PMID:41614077
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研究论文 | 本研究通过整合网络药理学、生物信息学及体外/体内实验，系统探讨了Rhoifolin的抗肺癌活性及其潜在分子靶点EPHB2 | 首次将网络药理学、转录组学与机器学习相结合，识别出EPHB2作为Rhoifolin的关键治疗靶点，并通过分子对接、动力学模拟及体内外实验验证了其直接作用机制 | 研究主要基于H358细胞系和小鼠异种移植模型，临床前数据需在更多肺癌模型和临床试验中进一步验证 | 系统研究Rhoifolin的抗肿瘤效应并识别其关键分子靶点，为肺癌治疗提供新策略 | 肺癌细胞系（如H358）及H358异种移植小鼠模型 | 生物信息学 | 肺癌 | 网络药理学、转录组分析、机器学习、RT-qPCR、Western blot、免疫荧光、分子对接、动力学模拟 | 机器学习 | 转录组数据、单细胞RNA测序数据、临床数据 | 体外细胞实验及H358异种移植小鼠模型，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 116 | 2026-03-02 |
Highly multiplexed spatial transcriptomics in bacteria
2025-Jan-24, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adr0932
PMID:39847624
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研究论文 | 本文介绍了一种名为bacterial-MERFISH的新方法，通过结合1000倍体积扩展与多重错误鲁棒荧光原位杂交技术，实现了细菌中数千个操纵子的高通量空间解析分析 | 开发了bacterial-MERFISH方法，首次将MERFISH技术应用于细菌，克服了细菌mRNA高密度的挑战，实现了单细菌水平的高通量空间转录组分析 | 未明确提及具体限制，但可能涉及技术复杂性、成本或适用范围 | 研究细菌在复杂环境中的单细胞决策行为，特别是空间结构环境下的异质性 | 细菌，包括对碳饥饿的响应、亚细胞RNA组织以及肠道共生菌在哺乳动物结肠微米级生态位中的适应 | 空间转录组学 | NA | 多重错误鲁棒荧光原位杂交（MERFISH） | NA | 图像 | 未明确指定样本数量，但涉及个体细菌和肠道共生菌的微环境分析 | NA | 空间转录组学 | NA | bacterial-MERFISH（结合1000倍体积扩展与MERFISH） |
| 117 | 2026-03-02 |
Serinc5 Regulates Sequential Chondrocyte Differentiation by Inhibiting Sox9 Function in Pre-Hypertrophic Chondrocytes
2025-01, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.31490
PMID:39568258
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析，揭示了Serinc5作为前肥大软骨细胞标记基因，通过抑制Sox9功能调控软骨细胞从增殖到肥大的顺序分化过程 | 首次将Serinc5鉴定为前肥大软骨细胞的标记基因，并阐明其通过抑制Sox9转录活性来调控软骨细胞分化的新机制 | 研究主要基于体外实验和测序分析，体内功能验证和临床相关性有待进一步探索 | 探究前肥大软骨细胞的分子基础及其在生长板软骨细胞分化中的作用机制 | 生长板软骨细胞，特别是前肥大软骨细胞 | 发育生物学 | NA | scRNA-seq, ChIP-seq, ATAC-seq, 荧光标记, 组织学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 染色质免疫沉淀测序数据, 染色质可及性测序数据, 组织学图像 | 荧光标记的生长板软骨细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq | NA | NA |
| 118 | 2026-03-02 |
Single-Cell RNA-Seq and Histological Analysis Reveals Dynamic Lrig1 Expression During Salivary Gland Development
2025-01, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.31487
PMID:39587709
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和组织学分析，揭示了Lrig1在小鼠颌下腺发育过程中的动态表达模式及其功能 | 首次结合单细胞RNA测序与组织学技术，系统性地研究了Lrig1在唾液腺发育中的时空表达及其调控机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类细胞系实验的生理相关性可能有限 | 探究Lrig1在唾液腺发育和成熟过程中的表达模式及功能 | 小鼠颌下腺及人类唾液腺细胞系 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 免疫荧光染色, RNAscope染色 | NA | 单细胞RNA测序数据, 图像数据 | 不同发育阶段的小鼠颌下腺样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 119 | 2026-03-02 |
Refining breast cancer genetic risk and biology through multi-ancestry fine-mapping analyses of 192 risk regions
2025-Jan, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-02031-y
PMID:39753771
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研究论文 | 本研究通过多祖先精细定位分析，细化了192个乳腺癌风险区域，揭示了新的关联信号和候选易感基因 | 整合多祖先数据，识别了131个先前未报告的关联信号，并将50个信号的因果变异缩小至单个变异，通过功能基因组学数据鉴定了195个假定的易感基因 | 因果变异和目标基因的验证仍需进一步实验，部分关联信号的生物学机制尚未完全阐明 | 精细定位已知的乳腺癌风险位点，以揭示因果变异和目标基因 | 172,737名女性乳腺癌病例和242,009名对照，涵盖非洲、亚洲和欧洲祖先 | 基因组学 | 乳腺癌 | 全基因组关联研究（GWAS），单细胞RNA测序，体外实验 | NA | 基因组关联数据，功能基因组学数据 | 414,746名参与者（172,737例病例和242,009名对照） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 120 | 2026-03-02 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals Biomechanical Loading-Induced Imbalance in Bone and Fat, Leading to Ossification in Lumbar Intervertebral Disc Nucleus Pulposus Degeneration
2025-01, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.31506
PMID:39854079
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了生物力学负荷如何导致腰椎间盘退变中髓核的骨化和骨-脂肪失衡 | 首次在单细胞水平上识别出受生物力学负荷影响的CITED4+METRN+软骨细胞亚群，并揭示了其在椎间盘退变骨化中的关键作用 | 样本量较小（仅5例新鲜组织），且为回顾性分析，需要更大规模的前瞻性研究验证 | 探究生物力学负荷对腰椎间盘退变中髓核骨化的影响机制 | 腰椎间盘退变患者的髓核组织 | 单细胞转录组学 | 椎间盘退变 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 5例新鲜髓核组织（L3-S1节段）及回顾性石蜡包埋样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |