单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1340 篇文献，本页显示第 1101 - 1120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1101 | 2025-01-31 |
Evolution of a SHOOTMERISTEMLESS transcription factor binding site promotes fruit shape determination
2025-01, Nature plants
IF:15.8Q1
DOI:10.1038/s41477-024-01854-1
PMID:39668212
|
研究论文 | 本文通过全器官活细胞成像和单细胞RNA测序分析，揭示了Capsella果实形状决定的分子机制，发现了一个由生长素诱导的机制，该机制由一个顺式调控元件决定 | 揭示了Capsella果实形状决定的分子机制，发现了一个由生长素诱导的机制，并确定了一个关键的顺式调控元件 | 研究主要集中于Capsella果实，可能不适用于其他植物或器官的形态发生 | 研究Capsella果实形状决定的分子机制 | Capsella果实 | 植物生物学 | NA | 全器官活细胞成像, 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 图像, RNA序列数据 | NA |
| 1102 | 2025-01-31 |
Ex Vivo Regional Gene Therapy Compared to Recombinant BMP-2 for the Treatment of Critical-Size Bone Defects: An In Vivo Single-Cell RNA-Sequencing Study
2025-Jan-01, Bioengineering (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/bioengineering12010029
PMID:39851303
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术比较了区域基因治疗与重组BMP-2在治疗临界大小骨缺损中的效果 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析了区域基因治疗与重组BMP-2在骨再生中的细胞和转录机制差异 | 研究仅在大鼠模型中进行，未涉及人类临床试验 | 比较区域基因治疗与重组BMP-2在骨再生中的效果及其机制 | 六只大鼠的临界大小股骨缺损 | 数字病理 | 骨缺损 | 单细胞RNA测序（10x Genomics） | NA | RNA测序数据 | 六只大鼠，每组2393个过滤细胞 |
| 1103 | 2025-01-31 |
The Prognostic Significance of TRs in Hepatocellular Carcinoma: Insights from TCGA and GEO Databases
2025, Biomarker insights
IF:3.4Q2
DOI:10.1177/11772719251315321
PMID:39866810
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验研究，探讨了甲状腺激素受体（TRs）在肝细胞癌（HCC）中的预测价值 | 首次结合TCGA和GEO数据库，通过Kaplan-Meier分析、Cox回归和逻辑回归分析，发现THRB低表达与HCC患者总体生存率降低显著相关，并通过功能实验验证了THRB在抑制HCC细胞增殖和迁移中的作用 | 研究主要依赖于公共数据库的数据，可能受到数据质量和样本量的限制，且实验部分未详细说明样本来源和数量 | 探讨甲状腺激素受体（TRs）在肝细胞癌（HCC）中的预测价值 | 肝细胞癌（HCC）患者 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | Kaplan-Meier分析、Cox回归分析、逻辑回归分析、伤口愈合实验、CCK-8实验、Transwell迁移实验、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | TCGA和GEO数据库中的HCC患者数据 |
| 1104 | 2025-01-31 |
Single-Cell RNA-Seq Uncovers Cellular Heterogeneity from Deep Fascia in Necrotizing Fasciitis Patients
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S496650
PMID:39867946
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术揭示了坏死性筋膜炎患者深筋膜中的细胞异质性 | 首次报道了坏死性筋膜炎患者深筋膜中的细胞异质性，并发现了与抗感染相关的关键细胞亚群和蛋白质 | 样本量较小（NF组3例，对照组4例），可能需要更大规模的研究来验证结果 | 研究坏死性筋膜炎患者深筋膜中细胞的变化及其在抗感染中的作用 | 坏死性筋膜炎患者和健康志愿者的深筋膜样本 | 数字病理学 | 坏死性筋膜炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、多重染色、多光谱成像和免疫组织化学 | NA | RNA测序数据、图像数据 | NF组3例，对照组4例 |
| 1105 | 2025-01-28 |
Single-cell transcriptomics identifies the common perturbations of monocyte/macrophage lineage cells in inflammaging of bone marrow
2025-Jan, Journal of orthopaedic translation
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.jot.2024.09.013
PMID:39868348
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，识别了骨髓炎症衰老中单核/巨噬细胞系的共同扰动 | 首次在多种衰老和炎症小鼠模型中，通过scRNA-Seq技术揭示了单核/巨噬细胞系通过App-Cd74轴激活的共同病理途径 | 研究仅限于小鼠模型，未在人类样本中验证 | 探讨骨髓炎症衰老中是否存在共同的病理途径 | 骨髓中的单核/巨噬细胞系 | 生物信息学 | 老年病 | scRNA-Seq | NA | 单细胞转录组数据 | 多种小鼠模型（TERCko/ko、5×FAD、Dmp1 Cre -DTA ki/wt、高脂饮食喂养小鼠、腰椎5神经压迫小鼠） |
| 1106 | 2025-01-31 |
Extracellular Vesicles From Bone Marrow-Derived Macrophages Enriched in ARG1 Enhance Microglial Phagocytosis and Haematoma Clearance Following Intracerebral Haemorrhage
2025-Jan, Journal of extracellular vesicles
IF:15.5Q1
DOI:10.1002/jev2.70041
PMID:39868438
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研究论文 | 本研究探讨了骨髓来源巨噬细胞（BMDMs）通过细胞外囊泡（EVs）增强小胶质细胞吞噬能力，促进脑出血后血肿清除的机制 | 揭示了BMDMs通过EVs传递ARG1增强小胶质细胞吞噬能力的新机制，为脑出血治疗提供了新的治疗靶点 | 研究主要基于实验模型，尚未在临床环境中验证 | 研究脑出血后小胶质细胞吞噬能力的调控机制 | 骨髓来源巨噬细胞（BMDMs）和小胶质细胞 | 生物医学 | 脑出血 | 多组学分析、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组学数据、RNA测序数据 | NA |
| 1107 | 2025-01-31 |
Integrative Machine Learning of Glioma and Coronary Artery Disease Reveals Key Tumour Immunological Links
2025-Jan, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70377
PMID:39868675
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研究论文 | 本文结合机器学习和单细胞RNA测序技术探索了胶质瘤肿瘤微环境，并通过全基因组关联研究和孟德尔随机化方法发现了影响癌症和心血管疾病结果的TME元素相关遗传变异 | 利用机器学习技术分析高维数据，获得新的分子亚型和生物标志物，揭示了TME中的潜在血管生成和免疫原性特征，为精准肿瘤学治疗提供信息 | NA | 探索胶质瘤肿瘤微环境，识别影响癌症和心血管疾病结果的遗传变异，并发现新的分子亚型和生物标志物 | 胶质瘤肿瘤微环境（TME） | 机器学习 | 胶质瘤, 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）, 全基因组关联研究（GWAS）, 孟德尔随机化（MR） | NA | RNA测序数据 | NA |
| 1108 | 2025-01-31 |
Identifying Key Biomarkers Related to Immune Response in the Progression of Diabetic Kidney Disease: Mendelian Randomization Combined With Comprehensive Transcriptomics and Single-Cell Sequencing Analysis
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S482047
PMID:39871959
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研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化结合转录组学和单细胞测序分析，识别了与糖尿病肾病（DKD）进展相关的关键免疫反应生物标志物 | 结合孟德尔随机化、转录组学和单细胞测序分析，识别了与DKD进展相关的关键基因，并探索了其作为治疗靶点的潜力 | 研究主要基于小鼠模型，需进一步在人类样本中验证 | 识别DKD发病和进展中的关键基因，并探索其作为治疗靶点的潜力 | 糖尿病肾病（DKD）患者和小鼠模型 | 生物信息学 | 糖尿病肾病 | 孟德尔随机化、转录组学分析、单细胞测序、RT-qPCR | NA | 基因表达数据、单细胞数据 | DKD小鼠模型 |
| 1109 | 2025-01-31 |
Tumour heterogeneity and personalized treatment screening based on single-cell transcriptomics
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.12.020
PMID:39877290
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研究论文 | 本文基于单细胞转录组学数据，研究了肿瘤异质性及其对个性化治疗的影响 | 通过整合多种生物信息学分析，构建了多种癌症的肿瘤细胞异质性蓝图，并识别了肿瘤细胞亚群特异性生物标志物和潜在治疗药物 | 研究仅基于五种癌症的单细胞转录组数据集，样本类型和数量有限 | 探索肿瘤细胞异质性在单细胞水平上的生物学差异，并为个性化治疗提供新的见解 | 肺癌、乳腺癌、结直肠癌、胃癌和肝癌患者的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 肺癌、乳腺癌、结直肠癌、胃癌、肝癌 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 五种癌症的单细胞转录组数据集 |
| 1110 | 2025-01-30 |
MAIT Cell-Mediated Immune Mechanisms of Dialysis-Induced Peritoneal Fibrosis and Therapeutic Targeting
2025-Jan-28, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000627
PMID:39874111
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研究论文 | 本研究探讨了MAIT细胞在长期腹膜透析诱导的腹膜纤维化中的免疫机制及治疗靶点 | 首次揭示了MAIT细胞通过MR1受体与间皮细胞相互作用，激活mTORC1信号通路，促进腹膜纤维化的机制，并提出了通过阻断MR1-MAIT相互作用来治疗纤维化的新策略 | 研究主要基于体外模型和Mr1基因敲除小鼠，尚未在人体临床试验中验证其治疗效果 | 探讨MAIT细胞在腹膜透析诱导的腹膜纤维化中的作用，并寻找潜在的治疗靶点 | 长期接受腹膜透析的患者及Mr1基因敲除小鼠 | 免疫学 | 腹膜纤维化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、流式细胞术 | NA | RNA测序数据、流式细胞数据 | 长期腹膜透析患者及Mr1基因敲除小鼠 |
| 1111 | 2025-01-29 |
Human Dermal Microvascular Arterial and Venous Blood Endothelial Cells and Their Use in Bioengineered Dermo-Epidermal Skin Substitutes
2025-Jan-28, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202401588
PMID:39871784
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1112 | 2024-12-24 |
Cholinergic waves have a modest influence on the transcriptome of retinal ganglion cells
2025-Jan-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.05.627027
PMID:39713433
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研究论文 | 研究了视网膜波对视网膜神经节细胞类型转录组变化的影响 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了视网膜波对不同类型视网膜神经节细胞基因表达的微弱影响 | 研究仅限于小鼠模型，且样本量较小 | 探讨视网膜波对视网膜神经节细胞基因表达的影响 | 视网膜神经节细胞的转录组变化 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 野生型小鼠和β2KO小鼠的视网膜神经节细胞 |
| 1113 | 2025-01-29 |
Distinct causes of three phenotypic hallmarks of hematopoietic aging
2025-Jan-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.14.632900
PMID:39868295
|
研究论文 | 本文探讨了造血衰老的三个表型特征的原因，特别是炎症如何促进这些衰老表型 | 提出了一个实验模型（IkappaBminus）来解析NFkappaB在造血衰老表型中的作用，并发现HSC自主的NFkappaB活动损害其功能，而骨髓环境中的炎症驱动髓系偏倚 | 研究主要基于实验模型，可能无法完全反映人类造血衰老的复杂性 | 解析造血衰老的三个表型特征的独立调控机制 | 造血干细胞（HSC）及其在衰老过程中的功能变化 | 生物医学 | 衰老相关疾病 | scRNA-seq | IkappaBminus模型 | 基因表达数据 | 小鼠和人类的HSC数据集 |
| 1114 | 2025-01-28 |
COSIME: Cooperative multi-view integration and Scalable and Interpretable Model Explainer
2025-Jan-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.11.632570
PMID:39868220
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研究论文 | 本文介绍了COSIME，一种用于多组学数据集成和可解释性模型解释的新方法 | COSIME通过可学习的最优传输（LOT）的反向传播和蒙特卡洛采样，实现了多视图数据的集成和特征关系的解释 | NA | 解决多组学数据集成和特征关系解释的瓶颈问题 | 单细胞转录组学、单细胞空间转录组学、表观基因组学和代谢组学数据 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 可学习的最优传输（LOT）、蒙特卡洛采样 | 深度神经网络 | 多组学数据 | 模拟数据和真实世界数据集 |
| 1115 | 2025-01-28 |
Inhibition of Glutamine Metabolism Suppresses Tumor Progression through Remodeling of the Macrophage Immune Microenvironment
2025-Jan-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.10.632174
PMID:39868269
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研究论文 | 本研究探讨了抑制谷氨酰胺代谢通过重塑巨噬细胞免疫微环境来抑制肿瘤进展的机制 | 使用免疫活性小鼠模型和单细胞RNA测序技术，开发了一种仅在癌组织中生物激活的GLNi前药JHU083，揭示了其对肿瘤微环境中不同巨噬细胞亚型的影响 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证 | 探索谷氨酰胺代谢抑制剂在癌症治疗中的作用及其对肿瘤免疫微环境的影响 | 免疫活性小鼠模型中的妇科癌症 | 癌症研究 | 妇科癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 免疫活性小鼠模型 | RNA测序数据 | 免疫活性小鼠模型中的肿瘤样本 |
| 1116 | 2025-01-28 |
The construction of a breast cancer prognostic model by combining genes related to hypoxia and endoplasmic reticulum stress
2025-Jan-27, Computer methods in biomechanics and biomedical engineering
IF:1.7Q3
DOI:10.1080/10255842.2025.2453941
PMID:39868728
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研究论文 | 本研究通过结合与缺氧和内质网应激相关的基因，构建了一个乳腺癌预后模型 | 结合缺氧和内质网应激相关基因构建预后模型，并分析免疫浸润和药物敏感性 | 未提及样本量是否足够大，以及模型在其他数据集上的验证情况 | 预测乳腺癌患者的预后 | 乳腺癌患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA-seq | Cox回归和Lasso回归 | RNA-seq数据和临床数据 | 未明确提及具体样本量 |
| 1117 | 2025-01-28 |
Evolution of SARS-CoV-2 T cell responses as a function of multiple COVID-19 boosters
2025-Jan-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.08.631842
PMID:39829792
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研究论文 | 本文通过一项为期三年的纵向研究，探讨了多次COVID-19疫苗接种对78名无症状感染者的T细胞和抗体反应的长期影响 | 研究发现，尽管抗体滴度随每次加强针逐渐增加并稳定，T细胞反应迅速达到平台期并保持稳定，且约30%的参与者显示出对非Spike抗原的CD4+ T细胞反应 | 研究仅限于无症状感染者，未涵盖有症状感染者的免疫反应 | 探讨多次COVID-19疫苗接种对适应性免疫的长期影响 | 78名无症状感染者 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 免疫反应数据 | 78名无症状感染者 |
| 1118 | 2025-01-28 |
Deciphering the senescence-based tumoral heterogeneity and characteristics in pancreatic cancer: Results from parallel bulk and single-cell transcriptome data
2025-Jan, IUBMB life
IF:3.7Q2
DOI:10.1002/iub.70001
PMID:39865528
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研究论文 | 本文通过整合分析和单细胞RNA测序数据，揭示了胰腺癌中基于细胞衰老的肿瘤异质性及其特征 | 首次在胰腺癌中通过整合分析和单细胞RNA测序数据，揭示了基于细胞衰老的肿瘤异质性及其特征，并鉴定了与胰腺癌迁移和预后相关的衰老相关基因 | 研究依赖于公开数据集，可能受到数据质量和样本量的限制 | 揭示胰腺癌中基于细胞衰老的肿瘤异质性及其特征，以促进胰腺癌的治疗和精准治疗发展 | 胰腺癌患者 | 数字病理学 | 胰腺癌 | RNA-seq, ssGSEA算法, infercnv算法 | NA | RNA测序数据 | 来自TCGA-PAAD、PACA-AU、PACA-CA和GSE154778数据集的胰腺癌患者样本 |
| 1119 | 2025-01-27 |
HemaScope: A Tool for Analyzing Single-cell and Spatial Transcriptomics Data of Hematopoietic Cells
2025-Jan-25, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf002
PMID:39862439
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研究论文 | 本文介绍了HemaScope，一个专门用于分析造血细胞单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组学（ST）数据的生物信息学工具包 | HemaScope工具包结合了scRNA-seq和ST技术的优势，提供了模块化设计，能够处理造血细胞的特异性特征，如谱系归属评估、细胞周期预测和标记基因收集 | 未明确提及具体限制 | 开发一个用户友好的工具包，用于分析造血细胞的单细胞和空间转录组学数据 | 造血细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），空间转录组学（ST） | NA | 单细胞RNA测序数据，空间转录组学数据 | 案例研究中使用了人类骨髓细胞图谱、小鼠急性髓性白血病细胞、血管免疫母细胞性T细胞淋巴瘤和原发性中枢神经系统淋巴瘤的微环境 |
| 1120 | 2025-01-27 |
Aberrant c-AMP signalling in richter syndrome revealed by single-cell transcriptome and 3D chromatin analysis
2025-Jan-23, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-024-00723-5
PMID:39849544
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和高通量染色体构象捕获技术，揭示了Richter综合征（RS）中cAMP信号通路的异常及其在B细胞转化中的作用 | 首次结合单细胞RNA测序和Hi-C技术，全面解析了RS中的B细胞转化和染色质结构变化，并发现了cAMP信号通路的异常 | 研究仅基于一个患者的样本，样本量较小，可能限制了结果的普适性 | 揭示Richter综合征的分子机制，特别是cAMP信号通路在B细胞转化中的作用 | Richter综合征患者的DLBCL-RS样本 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、高通量染色体构象捕获（Hi-C） | NA | 单细胞RNA测序数据、染色质构象数据 | 超过10,000个细胞 |