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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1101 | 2025-05-17 |
Single-cell analysis reveals potential therapeutic markers of peripheral blood mononuclear cells from bladder cancer patients
2025, Brazilian journal of medical and biological research = Revista brasileira de pesquisas medicas e biologicas
DOI:10.1590/1414-431X2025e14002
PMID:40367012
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析膀胱癌患者外周血单个核细胞,揭示潜在的治疗标志物 | 首次在膀胱癌患者外周血单个核细胞中鉴定出LAG-3和TIM-3等新型潜在免疫检查点抑制剂靶点,并发现多个与肿瘤进展相关的细胞亚群及其特征基因 | 样本量相对较小(仅包括患者和一名健康供体),且未进行功能验证实验 | 探索膀胱癌免疫治疗的潜在新靶点和生物标志物 | 膀胱癌患者和健康供体的外周血单个核细胞 | 单细胞转录组学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 44,022个细胞(来自膀胱癌患者和一名健康供体的外周血单个核细胞样本) | NA | NA | NA | NA |
| 1102 | 2025-05-17 |
The CD38+HLA-DR+ T cells with activation and exhaustion characteristics as predictors of severity and mortality in COVID-19 patients
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1577803
PMID:40370439
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研究论文 | 该研究通过流式细胞术和单细胞RNA测序技术,分析了COVID-19患者外周免疫细胞的特征,发现CD38+HLA-DR+ T细胞的扩增与疾病严重程度和死亡率相关 | 首次将CD38+HLA-DR+ T细胞确定为COVID-19预后的新型生物标志物,并揭示了其独特的激活-耗竭表型及对NAD+代谢的影响 | 样本来源仅限于外周血,未评估组织中的免疫细胞特征;研究人群的多样性可能有限 | 寻找COVID-19的新型治疗靶点和早期预测生物标志物 | 健康人、细菌性肺炎患者和COVID-19患者的外周免疫细胞 | 免疫学 | COVID-19 | 流式细胞术、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 细胞表型数据、基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量,但包括健康人、细菌性肺炎患者和COVID-19患者三类人群 | NA | NA | NA | NA |
| 1103 | 2025-05-17 |
Single-cell transcriptome reveals potential mechanisms for gout in children
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1577109
PMID:40370447
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探索了儿童痛风的分子机制 | 揭示了CD14+单核细胞和DN T细胞在儿童痛风中的关键作用,以及与成人痛风的异同 | 样本来源仅限于外周血,未涉及痛风关节组织 | 探索儿童痛风的分子机制 | 儿童痛风患者和健康对照的外周血样本 | 生物医学 | 痛风 | scRNA-seq | NA | RNA测序数据 | 儿童痛风患者和健康对照的外周血样本(具体数量未说明) | NA | NA | NA | NA |
| 1104 | 2025-05-17 |
Exploration the role of pro-inflammatory fibroblasts and related markers in periodontitis: combing with scRNA-seq and bulk-seq data
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1537046
PMID:40370461
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量转录组数据分析,探索了促炎性牙龈成纤维细胞(PIGFs)在牙周炎中的作用及其相关分子机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别出与牙周炎发展密切相关的促炎性牙龈成纤维细胞亚群,并发现MME和TSPAN11两个基因作为潜在治疗靶点 | 研究样本量有限,且未在更大人群中验证MME和TSPAN11的临床效果 | 探索促炎性牙龈成纤维细胞在牙周炎发病机制中的作用及其分子机制 | 牙龈成纤维细胞(GFs)及其亚群促炎性牙龈成纤维细胞(PIGFs) | 数字病理学 | 牙周炎 | scRNA-seq, bulk-seq, qPCR, 免疫荧光染色 | 多种机器学习算法 | RNA测序数据 | 来自正常和牙周炎患者的scRNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA |
| 1105 | 2025-05-17 |
Unraveling the role of histone acetylation in sepsis biomarker discovery
2025, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2025.1582181
PMID:40370519
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研究论文 | 本研究通过转录组和单细胞RNA测序数据,结合机器学习算法,发现了与组蛋白乙酰化相关的脓毒症生物标志物 | 首次将组蛋白乙酰化与脓毒症生物标志物发现联系起来,并利用多种机器学习算法和孟德尔随机化方法进行验证 | 研究样本量未明确说明,且需要进一步临床验证 | 发现脓毒症早期诊断和预后的有效生物标志物 | 脓毒症患者(具体样本信息未提供) | 生物信息学 | 脓毒症 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 孟德尔随机化 | LASSO, SVM-RFE, Boruta | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1106 | 2025-05-17 |
Resveratrol targeting MDM2/P53/PUMA axis to inhibit colonocyte apoptosis in DSS-induced ulcerative colitis mice
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1572906
PMID:40371345
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research paper | 该研究探讨了白藜芦醇通过调节MDM2/P53/PUMA轴抑制结肠细胞凋亡,从而治疗DSS诱导的溃疡性结肠炎的潜力 | 揭示了白藜芦醇通过MDM2/P53/PUMA轴抑制结肠细胞凋亡的新机制,并验证了MDM2作为溃疡性结肠炎治疗靶点的潜力 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,尚未在人体中进行验证 | 研究白藜芦醇在溃疡性结肠炎治疗中的作用机制和疗效 | DSS诱导的溃疡性结肠炎小鼠模型和体外培养的结肠细胞 | 生物医学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞测序、免疫荧光染色、腺相关病毒系统 | 小鼠溃疡性结肠炎模型 | 实验数据 | 未明确说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 1107 | 2025-10-06 |
Identification and validation of m6A RNA methylation and ferroptosis-related biomarkers in sepsis: transcriptome combined with single-cell RNA sequencing
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1543517
PMID:40124361
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研究论文 | 本研究通过转录组和单细胞RNA测序技术识别并验证了脓毒症中m6A RNA甲基化和铁死亡相关的生物标志物 | 首次将m6A RNA甲基化与铁死亡机制结合研究脓毒症,并在单细胞水平验证生物标志物的表达 | 研究依赖于公共数据库数据,临床样本验证范围有限 | 识别和验证脓毒症中m6A RNA甲基化和铁死亡相关的生物标志物 | 脓毒症患者样本和对照样本 | 生物信息学 | 脓毒症 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 分子对接 | 机器学习, WGCNA, ROC分析 | 基因表达数据, 单细胞数据 | 未明确具体样本数量,包含公共数据库数据和临床样本 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 1108 | 2025-10-06 |
Integrative analysis of single-cell and bulk RNA sequencing reveals the oncogenic role of ANXA5 in gastric cancer and its association with drug resistance
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1562395
PMID:40124374
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研究论文 | 通过整合单细胞和批量RNA测序数据,揭示ANXA5在胃癌中的致癌作用及其与耐药性的关联 | 首次通过整合单细胞和批量RNA测序识别MUC5AC+恶性上皮细胞亚群在胃癌侵袭和EMT中的关键作用,并验证ANXA5的致癌功能 | 研究主要基于公共数据库数据,需要更多实验验证和临床样本确认 | 探索胃癌恶性上皮细胞亚群及其在肿瘤进展和耐药性中的作用机制 | 胃癌组织和细胞 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,肿瘤突变负荷分析 | 预后模型 | 基因表达数据 | 来自TCGA、GEO和OMIX001073数据库的多组数据集 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 1109 | 2025-10-06 |
TGF-β-mediated activation of fibroblasts in cervical cancer: implications for tumor microenvironment and prognosis
2025, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.19072
PMID:40124621
|
研究论文 | 本研究探讨TGF-β信号通路在宫颈癌相关成纤维细胞中的激活作用及其对肿瘤微环境和预后的影响 | 通过单细胞RNA测序揭示TGF-β信号在成纤维细胞中的激活机制,并构建基于三个基因的预后预测模型 | 研究样本量有限,需要更大规模临床验证 | 阐明TGF-β信号通路在宫颈癌肿瘤微环境中的作用机制 | 宫颈癌患者肿瘤微环境中的细胞类型,特别是癌症相关成纤维细胞 | 生物信息学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序,加权基因共表达网络分析,实时定量PCR,细胞功能实验 | Cox回归模型,LASSO回归 | 单细胞RNA测序数据,基因表达数据,临床数据 | TCGA-CESC数据集及单细胞RNA测序样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1110 | 2025-10-06 |
AQP1 Affects Necroptosis by Targeting RIPK1 in Endothelial Cells of Atherosclerosis
2025, Vascular health and risk management
IF:2.6Q2
DOI:10.2147/VHRM.S487327
PMID:40129682
|
研究论文 | 本研究揭示AQP1通过靶向RIPK1抑制内皮细胞坏死性凋亡从而影响动脉粥样硬化斑块稳定性 | 首次发现AQP1通过结合RIPK1并抑制RIPK3/MLKL表达来调控内皮细胞坏死性凋亡的新机制 | 研究主要聚焦内皮细胞,未涉及其他细胞类型在动脉粥样硬化中的作用 | 探究AQP1是否通过结合RIPK1影响动脉粥样硬化中的坏死性凋亡过程 | 人股动脉粥样硬化样本、正常主动脉样本和ox-LDL处理的内皮细胞 | 生物医学 | 心血管疾病 | 单细胞测序, 空间转录组, 加权基因共表达网络分析, 差异表达基因分析, 蛋白质印迹 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据, 蛋白质数据 | 动脉粥样硬化组织与正常主动脉组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1111 | 2025-10-06 |
Hypoxia-associated genes as predictors of outcomes in gastric cancer: a genomic approach
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1553477
PMID:40129974
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研究论文 | 本研究通过分析缺氧相关基因构建了胃腺癌预后预测模型 | 首次识别了胃腺癌中缺氧细胞亚群特异性转录因子并构建了新型预后模型 | 研究基于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 研究缺氧相关基因在胃腺癌中的作用并构建预后模型 | 胃腺癌患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 胃癌 | scRNA-seq, qRT-PCR, WGCNA, GO-BP/KEGG富集分析 | LassoCox算法 | RNA表达数据,临床数据 | TCGA和GEO数据库数据,GSE183904原发胃癌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1112 | 2025-10-06 |
Interleukin-27-polarized HIV-resistant M2 macrophages are a novel subtype of macrophages that express distinct antiviral gene profiles in individual cells: implication for the antiviral effect via different mechanisms in the individual cell-dependent manner
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1550699
PMID:40129989
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了IL-27极化的巨噬细胞(27-Mac)是一种新型巨噬细胞亚型,具有独特的抗HIV机制 | 首次发现IL-27极化的巨噬细胞构成新型M2亚型,在单细胞水平表达独特的抗病毒基因组合 | 研究样本来源于健康供体,未在HIV感染者中验证;样本量未明确说明 | 比较IL-27极化巨噬细胞与M2d亚型的生物学功能和基因表达谱差异 | 健康供体来源的单核细胞分化形成的巨噬细胞 | 免疫学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), p24抗原捕获试验, 过氧化氢检测, 吞噬试验, 细胞因子检测 | NA | 基因表达数据, 蛋白质检测数据, 功能测定数据 | NA | IsoPlexis | 单细胞RNA测序, 细胞因子检测 | NA | IsoPlexis系统用于细胞因子检测 |
| 1113 | 2025-10-06 |
Myosin 1f and Proline-rich 13 are transcriptionally upregulated yet functionally redundant in CD4+ T cells during blood-stage Plasmodium infection
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0320375
PMID:40132035
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现Myo1f和Prr13基因在疟疾感染期间CD4+ T细胞中表达上调,但功能验证表明这两个基因对效应和记忆T细胞反应并非必需 | 首次在T辅助细胞中发现并功能验证了Myo1f和Prr13两个基因在疟疾感染期间的表达模式,同时确认了cMaf对滤泡辅助T细胞分化的关键作用 | 研究仅限于小鼠疟疾感染模型,未在人类样本中验证;基因功能冗余性可能掩盖了某些特定条件下的功能 | 探究疟疾感染期间CD4+ T细胞中新型基因的表达调控和功能作用 | 小鼠CD4+ T细胞,特别是疟原虫特异性T细胞 | 免疫学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序,条件性基因敲除,T细胞受体转基因技术 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1114 | 2025-10-06 |
Single-cell and transcriptome analyses revealed CTHRC1 a potential therapeutic target mediating invasion and tumor microenvironment in TNBC: experimental validation
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1534981
PMID:40134434
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研究论文 | 通过单细胞和转录组分析揭示CTHRC1作为三阴性乳腺癌潜在治疗靶点,实验验证其介导侵袭和肿瘤微环境的作用 | 首次系统揭示CTHRC1阳性癌症相关成纤维细胞通过调控M2型巨噬细胞在TNBC免疫抑制微环境中的关键作用 | 基于公共数据库的回顾性分析,需要进一步实验验证机制 | 探究CTHRC1在三阴性乳腺癌肿瘤微环境中的关键作用及其治疗潜力 | 三阴性乳腺癌患者样本和相关的基因表达数据 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序, RNA转录组分析, 多重免疫荧光 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 来自TCGA和GEO数据库的三阴性乳腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 1115 | 2025-10-06 |
Jing-Yin-Gu-Biao formula protects mice from postinfluenza Staphylococcus aureus infection by ameliorating acute lung injury and improving hypercoagulable state via inhibiting NETosis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1567522
PMID:40134435
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研究论文 | 研究荆银固表方通过抑制NETosis改善流感后继发金黄色葡萄球菌感染引起的急性肺损伤和高凝状态 | 首次揭示荆银固表方通过抑制ERK/ROS轴调控中性粒细胞胞外诱捕网形成,改善继发感染 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化价值需进一步验证 | 探究荆银固表方对流感后继发金黄色葡萄球菌感染的防护作用及机制 | 流感病毒PR8感染后继发金黄色葡萄球菌感染的小鼠模型 | NA | 急性呼吸道感染 | 单细胞RNA测序, 体外验证 | NA | 基因表达数据, 病理学数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1116 | 2025-10-06 |
Differential neuropilin isoform expressions highlight plasticity in macrophages in the heterogenous TME through in-silico profiling
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1547330
PMID:40134439
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示神经纤毛蛋白异构体NRP1和NRP2在肿瘤相关巨噬细胞中的差异性表达及其在肿瘤微环境中的作用机制 | 首次在单细胞水平上系统分析NRP1和NRP2在不同癌症类型肿瘤相关巨噬细胞中的差异性表达模式及其功能特异性 | 研究主要基于生物信息学分析,需要后续实验验证;样本类型有限,仅包括肾透明细胞癌和皮肤黑色素瘤 | 探究神经纤毛蛋白异构体在肿瘤相关巨噬细胞中的表达差异及其在肿瘤微环境中的作用机制 | 肾透明细胞癌和皮肤黑色素瘤中的肿瘤相关巨噬细胞 | 生物信息学 | 肾癌, 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 差异基因表达分析, 共富集分析 | 聚类算法, 生物信息学分析流程 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1117 | 2025-10-06 |
Application and Progression of Single-Cell RNA Sequencing in Diabetes Mellitus and Diabetes Complications
2025, Journal of diabetes research
IF:3.6Q2
DOI:10.1155/jdr/3248350
PMID:40135071
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在糖尿病及其并发症研究中的应用进展 | 系统总结了单细胞RNA测序在糖尿病研究中发现的新型生物标志物和免疫治疗靶点 | NA | 探讨单细胞RNA测序在糖尿病及其并发症研究中的应用价值 | 糖尿病及其并发症(包括糖尿病视网膜病变、糖尿病心肌病、糖尿病肾病等) | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1118 | 2025-10-06 |
Programmed cell death-related prognostic genes mediate dysregulation of the immune microenvironment in triple-negative breast cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1563630
PMID:40145099
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析三阴性乳腺癌中程序性细胞死亡相关基因对肿瘤微环境免疫调节的作用 | 首次系统揭示CEBPB阳性癌症相关成纤维细胞通过MDK-NCL信号轴介导三阴性乳腺癌免疫微环境异质性和不良预后的新机制 | 样本量较小(仅9个TNBC样本),需要在更大队列中验证研究结果 | 阐明程序性细胞死亡介导三阴性乳腺癌肿瘤微环境失调的具体机制 | 三阴性乳腺癌患者样本和TNBC模型小鼠 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 免疫印迹, 免疫组织化学染色, 多重免疫荧光共定位分析 | NMF, SCENIC, Monocle, CellChat, scMetabolism | 单细胞转录组数据, 临床样本数据 | 9个TNBC样本,临床乳腺癌样本和TNBC模型小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1119 | 2025-10-06 |
High resolution tissue and cell type identification via single cell transcriptomic profiling
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0318151
PMID:40138334
|
研究论文 | 开发了一种名为scTissueID的高灵敏度单细胞注释流程,用于通过单细胞转录组数据精确识别细胞和组织类型 | 引入了关键的参考细胞质量区分阶段,专门针对高置信度细胞作为参考,在细胞和组织类型鉴定中实现了比现有方法更优且一致的性能 | NA | 开发高精度单细胞注释工具以改进法医调查和生物医学研究中的组织和细胞类型鉴定 | 法医相关数据和人类细胞图谱(HCA)数据中的单细胞转录组谱 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | 机器学习算法 | 单细胞转录组数据 | 大规模综合比较研究(包含法医相关和HCA数据) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1120 | 2025-05-16 |
Natural history, immunological and genetic characteristics of preclinical inflammatory bowel disease (EARLY): study protocol for a prospective cohort study
2025, Therapeutic advances in gastroenterology
IF:3.9Q1
DOI:10.1177/17562848251338647
PMID:40365077
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研究论文 | 本研究旨在探讨炎症性肠病(IBD)在临床前期的自然史、免疫学和遗传学特征,并通过前瞻性队列研究设计,整合多组学数据以预测疾病长期预后 | 首次系统研究IBD临床前期的特征,整合临床与多组学数据(基因组、蛋白质组、转录组、代谢组和微生物组)进行长期预后预测 | 研究周期长达10年,短期内无法获得完整结果;样本来源限于结直肠癌筛查项目中发现的无症状患者 | 描述IBD临床前期的特征并开发疾病长期预测工具 | 结直肠癌筛查中发现的无症状IBD患者、新诊断的有症状IBD患者和健康对照者 | 数字病理 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序、多组学分析(基因组/蛋白质组/转录组/代谢组/微生物组) | NA | 生物样本(血液/尿液/粪便/活检组织)和多组学数据 | 三组队列:无症状IBD患者、有症状IBD患者(<3月病程)和健康对照者,具体数量未说明 | NA | NA | NA | NA |