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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1081 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Macrophage Dynamics During MASH in Leptin-Deficient Rats
2025-01-10, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14020096
PMID:39851524
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示瘦素缺陷大鼠MASH模型中肝脏巨噬细胞的动态变化 | 首次在大鼠MASH模型中系统研究肝脏巨噬细胞的异质性和动态变化,发现独特的M1向M2表型转换特征 | 研究仅针对瘦素缺陷大鼠模型,结果在人类和其他物种中的普适性需要进一步验证 | 解析代谢功能障碍相关脂肪性肝炎中巨噬细胞的动态变化和细胞间通讯 | 瘦素缺陷大鼠的肝脏组织 | 单细胞生物学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 16周龄瘦素缺陷大鼠肝脏组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1082 | 2025-10-06 |
Immune Gene Expression Profiling in Individuals with Turner Syndrome, Graves' Disease, and a Healthy Female by Single-Cell RNA Sequencing: A Comparative Study
2025-01-10, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14020093
PMID:39851522
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序比较特纳综合征患者、健康女性和Graves病患者的免疫基因表达差异 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析特纳综合征患者抗原特异性CD4(+) T细胞的免疫基因表达谱,并与健康对照和自身免疫疾病患者进行比较 | 样本量较小(仅3个个体),需要更大规模研究验证结果 | 探究特纳综合征患者免疫相关基因表达特征及其与自身免疫疾病的差异 | 特纳综合征患者、健康女性、Graves病女性患者 | 单细胞基因组学 | 特纳综合征, Graves病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 3个个体(1名TS患者,1名健康女性,1名Graves病患者) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1083 | 2025-10-06 |
Temporal evolution of fibroblast responses following salivary gland ductal ligation injury
2025, Frontiers in dental medicine
IF:1.5Q3
DOI:10.3389/fdmed.2025.1581376
PMID:40375832
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析唾液腺导管结扎损伤后成纤维细胞的时序性反应 | 首次在唾液腺损伤模型中鉴定出三种独特的成纤维细胞亚群及其动态响应模式,并确定主要损伤响应性纤维化细胞类型 | 研究仅关注7天内的时间进程,未探讨长期慢性纤维化过程 | 阐明成纤维细胞在唾液腺损伤响应中的时序性变化机制 | 小鼠唾液腺导管结扎损伤模型中的成纤维细胞 | 单细胞组学 | 唾液腺疾病 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个时间点的唾液腺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1084 | 2025-10-06 |
Integrative single-cell RNA sequencing and bulk RNA sequencing reveals the characteristics of glutathione metabolism and protective role of GSTA4 gene in pancreatic cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1571431
PMID:40375987
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和bulk RNA测序数据,揭示了胰腺癌中谷胱甘肽代谢特征及GSTA4基因的保护作用 | 首次在胰腺癌中系统分析谷胱甘肽代谢相关基因的预后价值,并通过实验验证GSTA4基因的抑癌功能 | 研究主要基于回顾性数据,需要进一步的前瞻性研究验证 | 探究谷胱甘肽代谢相关基因在胰腺癌中的预后意义并识别关键分子靶点 | 胰腺癌患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 体外功能实验 | 预后分子分类器 | 转录组数据 | 930例胰腺癌患者 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 1085 | 2025-10-06 |
Integrating single-cell sequencing and transcriptome analysis to unravel the mechanistic role of sialylation-related genes in sepsis-induced acute respiratory distress syndrome
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1528769
PMID:40375981
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞测序和转录组分析,揭示了唾液酸化相关基因在脓毒症诱导的急性呼吸窘迫综合征中的机制作用 | 首次系统鉴定CD19和GPR65作为脓毒症诱导ARDS的关键唾液酸化相关基因,并通过单细胞RNA测序确定CD14单核细胞为关键细胞类型 | 研究基于公共数据库数据,临床样本验证规模有限,机制研究仍需进一步实验验证 | 探讨唾液酸化相关基因在脓毒症诱导的急性呼吸窘迫综合征中的分子机制 | 脓毒症诱导的急性呼吸窘迫综合征患者样本和公共数据库数据 | 生物信息学 | 急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 差异表达分析, WGCNA, 机器学习 | 列线图模型, 机器学习模型 | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 多个公共数据集(GSE32707, GSE66890, GSE151263)和临床样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1086 | 2025-10-06 |
Integrative multi-omics and Mendelian randomization analysis reveal SPP1+ tumor-associated macrophage-driven prognostic signature for hepatocellular carcinoma
2025, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2025.1594610
PMID:40376263
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学和孟德尔随机化分析,开发了基于SPP1+肿瘤相关巨噬细胞的肝细胞癌预后预测模型 | 首次将单细胞RNA测序与孟德尔随机化分析相结合,识别SPP1+肿瘤相关巨噬细胞相关基因并构建预后预测模型 | 研究结果需要在更大规模的前瞻性队列中进行验证 | 开发肝细胞癌患者的生存预后预测模型 | 肝细胞癌患者 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析, LASSO回归 | 风险评分模型 | 基因表达数据 | 来自TCGA和GEO数据库的肝细胞癌患者队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1087 | 2025-10-06 |
Tumor-microenvironment and molecular biology of classic Hodgkin lymphoma in children, adolescents, and young adults
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1515250
PMID:40376590
|
综述 | 总结儿童、青少年和年轻成人经典霍奇金淋巴瘤的肿瘤微环境特征及分子生物学研究进展 | 揭示了不同年龄段cHL患者肿瘤微环境组成和功能的年龄相关差异,并开发了年龄特异性预后指标 | NA | 解析cHL肿瘤微环境的作用机制及年龄相关差异,推动生物标志物驱动的靶向治疗发展 | 儿童、青少年和年轻成人经典霍奇金淋巴瘤患者 | 肿瘤生物学 | 经典霍奇金淋巴瘤 | 单细胞测序,多重空间成像技术 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1088 | 2025-10-06 |
Stratification of enterochromaffin cells by single-cell expression analysis
2025-Jan-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.24.554649
PMID:37662229
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学与空间图像分析整合,识别出14个沿肠道拓扑组织的肠嗜铬细胞亚群 | 首次系统性地识别出14个功能各异的肠嗜铬细胞亚群,并揭示其沿肠道的空间分布规律 | 肠嗜铬细胞功能多样性的分子和细胞基础仍需进一步明确 | 解析肠嗜铬细胞的功能多样性及其分子机制 | 肠嗜铬细胞 | 单细胞生物学 | 肠道疾病 | 单细胞转录组测序, 空间图像分析, 遗传学方法, 化学遗传学, 药理学方法 | NA | 单细胞转录组数据, 空间图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1089 | 2025-10-06 |
CENPF as a Potential Biomarker Associated with the Immune Microenvironment of Renal Cancer
2025 Jan-Dec, Technology in cancer research & treatment
IF:2.7Q3
DOI:10.1177/15330338251330791
PMID:40165474
|
研究论文 | 本研究探讨CENPF作为肾癌潜在预后生物标志物的作用及其与肿瘤免疫微环境的关联 | 首次系统揭示CENPF在肾癌中的表达特征及其与免疫细胞浸润的关联机制 | 研究主要基于公共数据库和回顾性样本,需要进一步实验验证 | 探索CENPF作为肾癌预后生物标志物的潜力及其在肿瘤免疫微环境中的作用 | 肾癌患者组织样本、血浆样本及公共数据库中的肾癌数据 | 生物信息学 | 肾癌 | qPCR, 单细胞测序, 生物信息学分析 | Cox回归分析, CIBERSORT算法 | 基因表达数据, 单细胞测序数据, 临床数据 | TCGA数据库中的KICH、KIRP、KIRC样本及GSE159115单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1090 | 2025-10-06 |
T-cell receptors identified by a personalized antigen-agnostic screening approach target shared neoantigen KRAS Q61H
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1509855
PMID:40165973
|
研究论文 | 开发了一种个性化抗原无关筛选方法识别T细胞受体,靶向共享新抗原KRAS Q61H | 提出不依赖已知抗原直接识别肿瘤特异性T细胞克隆型的方法,突破了当前TCR选择需要预先知道靶抗原的限制 | 研究样本量较小(7例NSCLC患者),需要在更大队列中验证 | 开发抗原无关的TCR筛选方法,推进实体瘤的过继性细胞治疗 | 非小细胞肺癌患者的手术标本和T细胞受体 | 免疫治疗 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,TCR测序 | NA | 基因表达数据,TCR序列数据 | 7例NSCLC患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1091 | 2025-10-06 |
Enhancing pancreatic cancer treatment: the role of H101 oncolytic virus in irreversible electroporation
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1546242
PMID:40170848
|
研究论文 | 本研究探讨H101溶瘤病毒联合不可逆电穿孔治疗胰腺癌的效果及机制 | 首次提出将H101溶瘤病毒与可逆电穿孔结合,通过激活JNK-MAPK通路增强胰腺癌治疗效果 | 研究主要基于细胞实验和小鼠模型,尚未进行临床试验验证 | 评估H101溶瘤病毒作为不可逆电穿孔辅助治疗胰腺癌的有效性 | 胰腺癌细胞系和小鼠皮下肿瘤模型 | 癌症治疗 | 胰腺癌 | bulk RNA-seq, scRNA-seq, 生化分析技术 | NA | 基因表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1092 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing in non-obstructive azoospermia: insights from primary and re-analysis studies
2025, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2025.1539063
PMID:40177631
|
综述 | 本文系统评估了单细胞测序在非梗阻性无精症中的原发性研究和数据再分析研究 | 首次整合了NOA领域的原发性单细胞测序研究和数据再分析研究,揭示了转录调控因子、RNA转录、内分泌干扰物和微管细胞骨架等新发现 | 缺乏对单细胞研究结果向临床应用转化的深入探讨 | 系统评估单细胞测序在非梗阻性无精症研究中的应用和进展 | 人类睾丸组织中的生殖细胞、支持细胞和间质细胞 | 单细胞测序 | 男性不育症 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | 10项原发性研究和22项再分析研究 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1093 | 2025-10-06 |
Integrating bulk and single-cell RNA sequencing reveals SH3D21 promotes hepatocellular carcinoma progression by activating the PI3K/AKT/mTOR pathway
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0302766
PMID:40179068
|
研究论文 | 本研究通过整合bulk和单细胞RNA测序数据,揭示SH3D21通过激活PI3K/AKT/mTOR通路促进肝细胞癌进展 | 首次发现SH3D21作为新型遗传生物标志物在肝细胞癌中的促癌作用机制 | 研究主要基于公共数据库和体外实验,缺乏体内实验验证 | 探究SH3D21在肝细胞癌中的表达、功能及其分子机制 | 肝细胞癌患者样本和肝细胞癌细胞系 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, qRT-PCR, CCK-8检测, 集落形成实验, Western blot分析 | NA | 基因表达数据, 实验数据 | 来自TCGA、ICGC和GEO数据库的肝细胞癌样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 1094 | 2025-10-06 |
Predicting and comparing transcription start sites in single cell populations
2025, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012878
PMID:40179341
|
研究论文 | 开发了scTSS计算流程,用于在单细胞水平预测和比较转录起始位点 | 首个同时支持双端和单端5'单细胞RNA测序数据的TSS分析工具,能够进行多样本联合分析和差异TSS使用检测 | 未明确说明样本数量和技术验证的局限性 | 开发单细胞水平转录起始位点的预测和比较分析方法 | 转录起始位点在单细胞群体中的使用模式 | 生物信息学 | NA | 5'单细胞RNA测序 | 二项广义线性混合模型 | 单细胞RNA测序数据 | 涉及两种不同疾病的单细胞数据 | NA | single-cell RNA-seq | NA | 5' scRNA-seq |
| 1095 | 2025-10-06 |
Unraveling the spatial and signaling dynamics and splicing kinetics of immune infiltration in osteoarthritis synovium
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1521038
PMID:40181977
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据,揭示了骨关节炎滑膜中免疫细胞浸润的空间动态和信号通路 | 首次构建骨关节炎滑膜的空间转录图谱,识别了OA特异性空间吸引子,发现OLR1和CD69基因的异常剪接动力学驱动炎症通路 | 样本量相对有限(8个OA和4个健康样本),需要更大规模验证 | 解析骨关节炎滑膜中免疫浸润的空间动态和信号通路机制 | 骨关节炎患者和健康人的滑膜组织 | 空间转录组学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 剪接动力学分析 | 空间转移张量分析, 非负矩阵分解 | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 8个骨关节炎滑膜样本和4个健康滑膜样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1096 | 2025-10-06 |
Temporal and spatial distribution of histone acetylation in mouse molar development
2025, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.19215
PMID:40183048
|
研究论文 | 本研究通过绘制小鼠磨牙发育过程中组蛋白H3和H4及其乙酰化位点的分布模式,揭示组蛋白乙酰化在牙齿发育中的作用机制 | 首次系统揭示小鼠磨牙发育过程中组蛋白乙酰化的时空分布特征及其调控机制 | 研究局限于小鼠模型,尚未在人类或其他物种中验证 | 探究组蛋白乙酰化修饰与牙齿发育的关联机制 | 小鼠磨牙发育过程中的上皮细胞和间充质细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序,免疫组织化学 | NA | 基因表达数据,组织切片图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1097 | 2025-10-06 |
Characterizing macrophage diversity in colorectal malignancies through single-cell genomics
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1526668
PMID:40191203
|
综述 | 通过单细胞基因组学方法表征结直肠恶性肿瘤中巨噬细胞的多样性 | 从单细胞组学角度探索近年定义的独特巨噬细胞亚型,并基于其潜在功能进行分类 | 缺乏对巨噬细胞多样性命名和分子特征的统一阐述 | 评估传统巨噬细胞极化亚型在结直肠恶性肿瘤中的应用 | 结直肠癌肿瘤相关巨噬细胞 | 单细胞基因组学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1098 | 2025-10-06 |
Successful cryopreservation of marine invertebrates immune cells enables long-term studies of common octopus, Octopus vulgaris Cuvier 1797, hemocyte immune functions
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1543587
PMID:40191212
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研究论文 | 本研究建立了普通章鱼血细胞冷冻保存方法,实现了长期保存后细胞仍保持高活性和免疫功能 | 首次报道了海洋无脊椎动物免疫细胞成功冷冻保存的方法,并验证了冷冻保存后细胞的功能活性 | 仅针对普通章鱼血细胞进行研究,方法在其他软体动物中的适用性需要进一步验证 | 开发软体动物免疫细胞的长期保存方法,为免疫机制研究提供可靠细胞来源 | 普通章鱼(Octopus vulgaris)的血细胞(免疫细胞) | 细胞生物学 | NA | 细胞冷冻保存技术、基因表达分析、吞噬功能检测 | NA | 细胞功能数据、基因表达数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 1099 | 2025-10-06 |
Molecular biology of the deadliest cancer - glioblastoma: what do we know?
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1530305
PMID:40191211
|
综述 | 本文整合了当前关于胶质母细胞瘤细胞及其微环境的生物学特性和分子通讯模式的知识 | 强调单细胞RNA测序技术揭示了胶质母细胞瘤的新见解,并提出个性化多免疫疗法的重要性 | NA | 总结胶质母细胞瘤的分子生物学特征并探讨潜在治疗策略 | 胶质母细胞瘤细胞及其肿瘤微环境 | 分子生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1100 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics reveals immunosuppressive microenvironment and highlights tumor-promoting macrophage cells in Glioblastoma
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0312764
PMID:40193323
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示胶质母细胞瘤免疫抑制微环境特征及肿瘤促进性巨噬细胞亚型 | 首次在单细胞水平系统鉴定胶质母细胞瘤中五种肿瘤相关巨噬细胞亚型,并发现具有M2极化特征的TAM_MRC1亚型和耗竭表型的CD56dim_DNAJB1自然杀伤细胞亚群 | 样本量相对有限(24名患者),未进行功能性验证实验 | 解析胶质母细胞瘤微环境的细胞异质性和免疫抑制机制 | 胶质母细胞瘤患者肿瘤组织中的免疫细胞和肿瘤细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 24名胶质母细胞瘤患者的48个肿瘤片段 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |