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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1061 | 2025-10-06 |
Application of Cellular Indexing of Transcriptomes and Epitopes by Sequencing (CITE-Seq) to Precisely Dissect the Brain Tumor Immune Microenvironment
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4558-1_3
PMID:40402445
|
研究论文 | 应用CITE-Seq技术精确解析脑肿瘤免疫微环境 | 将CITE-Seq技术应用于脑肿瘤研究,同时获取单细胞转录组和表面蛋白信息 | NA | 精确解析脑肿瘤免疫微环境的细胞组成和功能 | 脑肿瘤微环境中的恶性细胞、免疫细胞、星形胶质细胞和其他基质细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | CITE-Seq, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表位数据 | NA | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 1062 | 2025-10-06 |
Immune Single-Cell Annotation by Molecular Signature-Based Deconvolution with MIXTURE
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4558-1_13
PMID:40402455
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研究论文 | 提出基于MIXTURE算法的单细胞RNA测序注释协议,用于改善肿瘤免疫微环境中细胞类型的识别 | 使用v-SVR反卷积算法MIXTURE解决无监督注释方法的局限性,提供更精确的细胞类型注释和组成分析 | NA | 优化单细胞RNA测序数据中的细胞类型识别,以解析肿瘤免疫微环境和改进免疫治疗策略 | 黑色素瘤单细胞RNA测序数据集 | 生物信息学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | v-SVR反卷积算法 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1063 | 2025-10-06 |
Mapping Human Uterine Disorders Through Single-Cell Transcriptomics
2025-01-21, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14030156
PMID:39936948
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综述 | 通过单细胞转录组学技术绘制人类子宫疾病图谱 | 系统整合单细胞RNA测序和空间转录组学在子宫疾病研究中的最新进展,揭示细胞异质性和分子机制 | 存在可扩展性和可重复性方面的挑战 | 探索单细胞转录组学在子宫疾病研究中的应用价值 | 子宫内膜异位症、子宫腺肌症、子宫内膜癌和子宫肌瘤等子宫疾病 | 数字病理学 | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1064 | 2025-10-06 |
Liver X receptor unlinks intestinal regeneration and tumorigenesis
2025-Jan, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08247-6
PMID:39567700
|
研究论文 | 本研究揭示了肝X受体(LXR)在肠道损伤修复中作为调控开关,既能促进组织再生又能抑制肿瘤发生 | 首次发现LXR通路在肠道损伤适应中的双重作用机制,通过调控amphiregulin协调再生与肿瘤发生的平衡 | NA | 探索肠道再生与肿瘤发生之间的解偶联机制 | 肠道上皮细胞、肠道类器官、结直肠癌模型 | 分子生物学 | 结直肠癌 | RNA测序、单细胞RNA测序、药理学干预、转录组学分析、基因敲除实验 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1065 | 2025-10-06 |
A research protocol for a prospective, multicenter, cohort study on interferon therapy for chronic hepatitis B combined with metabolism-associated fatty liver disease to achieve clinical cure
2025, Frontiers in public health
IF:3.0Q2
DOI:10.3389/fpubh.2025.1546182
PMID:40161022
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研究论文 | 评估聚乙二醇干扰素治疗慢性乙型肝炎合并代谢相关脂肪性肝病患者的疗效和安全性 | 填补慢性乙型肝炎合并代谢相关脂肪性肝病患者治疗策略的研究空白,首次探讨MAFLD对HBsAg清除的影响 | 干扰素治疗常伴随副作用可能影响患者依从性,MAFLD人群异质性可能对治疗效果产生不同影响 | 阐明MAFLD对聚乙二醇干扰素治疗慢性乙型肝炎患者实现临床治愈的影响 | 优势慢性乙型肝炎患者和慢性乙型肝炎合并MAFLD患者 | 数字病理 | 慢性乙型肝炎, 代谢相关脂肪性肝病 | 单细胞转录组测序 | NA | 临床数据, 转录组数据 | 多中心研究,具体样本量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1066 | 2025-10-06 |
TNFRSF12A expression in stomach adenocarcinoma and its preliminary role in predicting immunotherapy response
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1578068
PMID:40391219
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研究论文 | 本研究探讨TNFRSF12A在胃腺癌中的表达模式及其在预测免疫治疗反应中的潜在作用 | 首次系统分析TNFRSF12A在胃腺癌中的表达特征,发现其与免疫细胞浸润和免疫治疗反应的相关性,并验证其对癌细胞迁移和侵袭能力的影响 | TNFRSF12A表达与临床特征无显著差异,需要更大样本验证其临床价值 | 研究TNFRSF12A在胃腺癌中的表达模式及其在免疫治疗预测中的作用 | 胃腺癌细胞和组织样本 | 生物信息学 | 胃腺癌 | scRNA-seq, 体外功能实验, 生物信息学分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据, 体外实验数据 | 来自TCGA、GEO和GEPIA数据库的多个数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1067 | 2025-10-06 |
Single-cell and multi-omics integration reveals cholesterol biosynthesis as a synergistic target with HER2 in aggressive breast cancer
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.04.030
PMID:40391299
|
研究论文 | 通过单细胞和多组学整合分析发现胆固醇生物合成与HER2在侵袭性乳腺癌中的协同治疗靶点 | 开发了整合单细胞RNA测序和多组学分析的计算框架,首次揭示胆固醇生物合成与HER2表达在乳腺癌中的显著相关性,并验证了联合靶向治疗的协同效应 | 研究主要基于计算分析和体外实验验证,缺乏体内动物模型和临床试验数据支持 | 通过系统计算方法解码乳腺癌分子机制并识别新的治疗靶点 | 乳腺癌患者的恶性细胞亚群 | 计算生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,多组学分析,蛋白质组学,基因表达谱分析 | 整合计算框架 | 单细胞RNA测序数据,多组学数据,蛋白质组数据,药物处理数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,多组学分析 | NA | NA |
| 1068 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA Sequencing on Formalin-Fixed and Paraffin-Embedded (FFPE) Tissue Identified Multi-Ciliary Cells in Breast Cancer
2025-01-29, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14030197
PMID:39936988
|
研究论文 | 本研究评估了FFPE和FF样本用于单细胞RNA测序的适用性,并在乳腺癌中识别出多纤毛细胞亚群 | 首次在乳腺癌中通过单细胞RNA测序识别并验证了肿瘤性多纤毛细胞亚群的存在 | 研究样本量较小,仅包括一例浸润性导管癌和一例浸润性小叶癌 | 评估FFPE和FF样本用于单细胞RNA测序的适用性,并分析乳腺癌细胞异质性 | 乳腺癌组织样本,包括FFPE和匹配的FF样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学,荧光原位杂交,电子显微镜 | NA | 单细胞RNA测序数据,图像数据 | 2例乳腺癌患者(1例IDC,1例ILC),扩展验证包含214例ER阳性浸润性癌 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1069 | 2025-10-06 |
Smooth Muscle Cells and Fibroblasts in the Proximal Thoracic Aorta Exhibit Minor Differences Between Embryonic Origins in Angiotensin II-driven Transcriptional Alterations
2025-Jan-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.23.610985
PMID:39896657
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析血管紧张素II诱导的胸主动脉近端平滑肌细胞和成纤维细胞的转录组变化 | 首次在血管紧张素II诱导的主动脉病变前病理阶段,比较了不同胚胎起源(第二心场和心脏神经嵴)的平滑肌细胞和成纤维细胞的转录组差异 | 研究仅关注了病变前病理阶段(3天灌注),未观察长期效应;样本量有限 | 探究不同胚胎起源的胸主动脉近端细胞在血管紧张素II诱导的转录改变中的差异 | 小鼠胸主动脉近端的平滑肌细胞和成纤维细胞 | 单细胞转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,细胞分选 | NA | 单细胞转录组数据 | Mef2c-Cre R26R mT/mG小鼠,基线组和3天血管紧张素II灌注组 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1070 | 2025-10-06 |
A panoramic view of cell population dynamics in mammalian aging
2025-Jan-17, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adn3949
PMID:39607904
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研究论文 | 通过构建包含2000多万个细胞的单细胞转录组图谱,系统揭示哺乳动物衰老过程中的细胞群体动态变化 | 开发了PanSci单细胞转录组图谱,首次在哺乳动物中系统描绘了不同生命阶段、性别和基因型的细胞群体动态变化 | 研究主要基于小鼠模型,在人类中的适用性需要进一步验证 | 阐明衰老相关的细胞群体动态变化规律 | 623个小鼠组织的2000多万个细胞 | 单细胞组学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 超过2000万个细胞,来自623个小鼠组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1071 | 2025-10-06 |
Cholecystokinin (CCK) Is a Mediator Between Nutritional Intake and Gonadal Development in Teleosts
2025-01-08, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14020078
PMID:39851506
|
研究论文 | 本研究揭示了胆囊收缩素(CCK)作为营养摄入与硬骨鱼性腺发育之间的中介分子 | 首次发现CCK通过下丘脑-垂体-性腺轴调控鱼类生殖过程,并证实CCK可作为营养传感器 | 研究主要基于草鱼模型,结果在其他硬骨鱼中的普适性需要进一步验证 | 探究营养摄入影响性腺发育的分子机制 | 草鱼的下丘脑-垂体-性腺轴组织及原代培养细胞 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 原代细胞培养, 体外实验 | NA | 基因表达数据, 细胞培养数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1072 | 2025-10-06 |
Comprehensive Analysis Identifies THEMIS2 as a Potential Prognostic and Immunological Biomarker in Glioblastoma
2025-01-07, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14020066
PMID:39851494
|
研究论文 | 首次发现THEMIS2作为胶质母细胞瘤中肿瘤相关巨噬细胞介导免疫抑制的关键调控因子 | 首次揭示THEMIS2在胶质母细胞瘤免疫微环境中的关键作用及其与肿瘤相关巨噬细胞免疫抑制功能的关联 | NA | 探索胶质母细胞瘤免疫逃逸机制并寻找新的预后标志物和治疗靶点 | 胶质母细胞瘤患者样本和肿瘤微环境中的免疫细胞 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1073 | 2025-10-06 |
Skeletal stem/progenitor cell-derived rather than osteoblast-derived IGF2 supports the development and homeostasis of skeletal system via STAT3
2025, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.112605
PMID:40384861
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研究论文 | 本研究揭示了骨骼干细胞/祖细胞来源的IGF2通过STAT3信号通路维持骨骼系统发育和稳态的机制 | 首次发现SSPCs而非成骨细胞来源的IGF2通过STAT3信号调控骨骼发育,为Silver-Russell综合征骨骼畸形提供了新的治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床应用的转化仍需进一步验证 | 探究IGF2在骨骼系统发育和稳态维持中的细胞来源和作用机制 | 小鼠模型、骨髓间充质干细胞、骨骼干细胞/祖细胞 | 发育生物学 | 骨骼发育异常 | 单细胞RNA测序,RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | 多种细胞特异性Igf2敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1074 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing of adult primate neocortex reveals the regulatory dynamics of neural plasticity
2025, American journal of translational research
IF:1.7Q4
DOI:10.62347/ZEOR5569
PMID:40385068
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析成年灵长类新皮质基因表达动态,揭示神经可塑性的调控机制 | 首次在成年灵长类新皮质中发现抑制性神经元的基因表达轨迹与发育期相似,并识别出与神经可塑性相关的关键驱动基因 | 研究仅聚焦于初级视觉皮层的特定抑制神经元亚型,未涵盖其他脑区或神经元类型 | 探究成年灵长类新皮质基因表达动态及其分子基础 | 食蟹猴初级视觉皮层的抑制性神经元(源自内侧神经节隆起) | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序, RNA velocity, scVelo算法 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1075 | 2025-10-06 |
Intra-tumoural RAMP1+ B cells promote resistance to neoadjuvant anti-PD-1-based therapy in oesophageal squamous cell carcinoma
2025, Immunotherapy advances
IF:4.1Q2
DOI:10.1093/immadv/ltaf012
PMID:40385640
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现RAMP1+ B细胞在食管鳞癌中对新辅助免疫治疗产生耐药性,并揭示了其通过CGRP-RAMP轴抑制CD8+ T细胞活性的机制 | 首次在食管鳞癌中发现RAMP1+ B细胞亚群介导免疫治疗耐药,并证明靶向CGRP-RAMP轴可增强抗PD-1疗法效果 | 研究主要基于体外实验,需要进一步临床验证 | 研究B细胞亚群及其分化上游信号在食管鳞癌免疫治疗耐药中的作用 | 食管鳞癌患者肿瘤样本 | 单细胞生物学 | 食管鳞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 具有不同免疫治疗反应的食管鳞癌标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1076 | 2025-10-06 |
Targeting Tumor Differentiation Grade-related Genes Prognostic Signature Including COL5A1 Based on Single-cell RNA-seq in Gastric Cancer
2025, International journal of medical sciences
IF:3.2Q1
DOI:10.7150/ijms.107509
PMID:40386054
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研究论文 | 基于单细胞RNA测序技术鉴定胃癌肿瘤分化等级相关基因预后标志物 | 首次通过单细胞RNA测序结合WGCNA分析构建包含COL5A1的胃癌分化等级相关基因预后特征 | 基于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 建立胃癌肿瘤分化等级相关的基因预后标志物 | 胃癌患者样本 | 单细胞测序分析 | 胃癌 | 单细胞RNA测序,加权基因共表达网络分析,HE染色,Kaplan-Meier生存分析 | Cox回归模型 | 单细胞RNA测序数据,临床数据 | GEO数据库中的胃癌单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1077 | 2025-10-06 |
IL7-IL7R Interaction Mediates Fibroblast-Driven Macrophage-to-Osteoclast Differentiation in Periodontitis
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S524284
PMID:40386183
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和实验验证发现IL7R+巨噬细胞是牙周炎中潜在的破骨细胞前体,并揭示了成纤维细胞通过IL7-IL7R信号轴驱动巨噬细胞向破骨细胞分化的新机制 | 首次鉴定出IL7R+巨噬细胞作为牙周炎中具有显著破骨分化潜能的特定亚群,并揭示成纤维细胞通过分泌IL7激活该信号通路的新机制 | NA | 鉴定牙周炎中具有破骨细胞生成潜能的巨噬细胞亚群及其调控机制 | 人类和小鼠牙周炎样本中的巨噬细胞和单核细胞 | 单细胞生物学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序, ELISA, TRAP染色, micro-CT, qPCR, 流式细胞术, 免疫荧光染色 | 机器学习 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1078 | 2025-10-06 |
Single-Cell and Spatial Transcriptomics Explore Purine Metabolism-Related Prognostic Risk Model and Tumor Immune Microenvironment Modulation in Ovarian Cancer
2025, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/5530325
PMID:40386292
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研究论文 | 本研究利用单细胞和空间转录组学探索嘌呤代谢相关预后风险模型及其在卵巢癌肿瘤免疫微环境调控中的作用 | 首次构建基于12个嘌呤代谢相关基因的预后风险模型,并发现NME6+上皮细胞作为卵巢癌保护性因子 | 使用公共数据集,样本来源可能受限;需要进一步实验验证 | 探索嘌呤代谢在卵巢癌预后评估和免疫微环境调控中的作用机制 | 卵巢癌患者样本和细胞系 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, RT-qPCR | LASSO回归, 多元回归分析 | 单细胞测序数据, 空间转录组数据, 基因表达数据 | 来自不同公共数据集的卵巢癌样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1079 | 2025-10-06 |
Exploring the comorbidity mechanisms between atherosclerosis and hashimoto's thyroiditis based on microarray and single-cell sequencing analysis
2025-01-13, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-85112-0
PMID:39805933
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研究论文 | 本研究通过微阵列和单细胞测序分析探索动脉粥样硬化与桥本甲状腺炎之间的共病机制 | 首次结合WGCNA、生物信息学分析和单细胞测序技术系统揭示AS与HT的共享致病机制,鉴定出PTPRC和TYROBP作为关键生物标志物 | 研究基于公共数据库数据,需要进一步实验验证;样本来源和数量可能存在限制 | 探索动脉粥样硬化与桥本甲状腺炎之间的共病分子机制 | 动脉粥样硬化和桥本甲状腺炎患者基因表达数据 | 生物信息学 | 心血管疾病,自身免疫性疾病 | 微阵列测序,单细胞测序分析,生物信息学分析 | WGCNA, Limma, CIBERSORT, cytoHubba | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的多个数据集,包含119个候选基因 | NA | 单细胞测序,微阵列分析 | NA | NA |
| 1080 | 2025-10-06 |
Infants display reduced NK cell responses in RSV and increased inflammatory responses in SARS-CoV-2 infections
2025-Jan-13, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5640872/v1
PMID:39877087
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研究论文 | 本研究通过单细胞技术比较了婴儿对RSV和SARS-CoV-2感染的免疫反应差异 | 首次在婴儿群体中同时使用单细胞转录组学、表观基因组学和细胞因子分析系统比较两种呼吸道病毒的免疫反应特征 | 样本量相对有限(RSV 19例,SARS-CoV-2 30例,健康对照17例),且研究对象仅限于婴儿群体 | 探究RSV和SARS-CoV-2感染在婴儿中引发不同临床严重程度的免疫机制 | 婴儿血液样本(中位年龄2.3个月) | 免疫学 | 呼吸道感染 | 单细胞转录组学,单细胞表观基因组学,细胞因子分析 | NA | 单细胞RNA测序数据,表观基因组数据,细胞因子数据 | RSV感染19例,SARS-CoV-2感染30例,健康对照17例 | NA | 单细胞RNA-seq,单细胞ATAC-seq | NA | NA |