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当前共找到 2164 篇文献，本页显示第 1061 - 1080 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1061 | 2025-10-06 |
BCMA: An integrative and versatile database for multi-scale and multi-omics molecular atlas of breast cancer
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.06.031
PMID:40621063
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研究论文 | 开发了一个整合多尺度多组学数据的乳腺癌分子图谱数据库BCMA | 整合了6个批量多组学数据集和9个单细胞转录组数据集，系统性表征乳腺癌分子特征并提供用户友好的基因中心搜索界面 | 未提及数据集的样本来源限制或平台技术局限性 | 建立乳腺癌多尺度多组学整合分析平台以促进精准治疗研究 | 乳腺癌患者样本（5424例病例和236,363个细胞） | 生物信息学 | 乳腺癌 | 多组学分析，单细胞转录组测序 | NA | 基因组学数据，转录组数据，表观基因组数据，临床数据 | 5424例病例和236,363个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq，批量多组学分析 | NA | NA |
| 1062 | 2025-10-06 |
Characterization of T-bet expressing B cells in lupus patients indicates a putative prognostic and therapeutic value of these cells for the disease
2025-Jan-21, Clinical and experimental immunology
IF:3.4Q3
DOI:10.1093/cei/uxaf008
PMID:39918986
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研究论文 | 本研究探讨T-bet+ B细胞在系统性红斑狼疮患者中的预后和治疗价值 | 首次系统评估T-bet+ B细胞及其亚群在狼疮患者中的临床意义，并测试多种药物对这些细胞的调控作用 | 样本量较小（10名健康供体和22名活动性SLE患者），部分结论基于间接证据 | 评估T-bet+ B细胞作为系统性红斑狼疮预后标志物和治疗靶点的潜力 | 系统性红斑狼疮患者和健康对照者的外周血B细胞 | 免疫学 | 系统性红斑狼疮 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序, 全血培养实验 | NA | 流式细胞数据, 单细胞RNA测序数据 | 10名健康供体和22名活动性SLE患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1063 | 2025-10-06 |
Identification of prognostic biomarkers related to epithelial-mesenchymal transition and anoikis in hepatocellular carcinoma using transcriptomics and single-cell sequencing
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1600546
PMID:40612108
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研究论文 | 本研究通过转录组学和单细胞测序技术鉴定与肝细胞癌上皮-间质转化和失巢凋亡相关的预后生物标志物 | 首次整合EMT相关基因和失巢凋亡相关基因，结合单细胞RNA测序技术识别肝细胞癌的新型生物标志物 | 研究主要依赖公共数据库数据，需要进一步实验验证生物标志物的功能机制 | 探索EMT相关基因和失巢凋亡相关基因在肝细胞癌中的作用机制并识别预后生物标志物 | 肝细胞癌患者样本和相关的基因表达数据 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，差异表达分析，WGCNA，RT-qPCR | 风险模型，列线图 | 转录组数据，单细胞测序数据 | TCGA-HCC，ICGC-LIPI-JP和GSE149614数据集中的肝细胞癌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1064 | 2025-10-06 |
Recent advances in biomarker detection of oral squamous cell carcinoma
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1597086
PMID:40612351
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综述 | 全面探讨口腔鳞状细胞癌生物标志物检测技术的最新进展与应用前景 | 系统整合单细胞测序、空间转录组学、纳米孔测序、生物传感技术和人工智能等新兴技术在口腔癌生物标志物检测中的创新应用 | 存在临床验证空白、实施成本高和分析复杂性等可扩展性障碍 | 评估新兴检测技术在口腔鳞状细胞癌早期诊断中的应用潜力 | 口腔鳞状细胞癌生物标志物检测技术 | 数字病理 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞测序, 空间转录组学, 纳米孔测序, 生物传感技术, 人工智能 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1065 | 2025-10-06 |
A novel, rapid, and practical prognostic model for sepsis patients based on dysregulated immune cell lactylation
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1625311
PMID:40612938
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研究论文 | 本研究基于免疫细胞乳酸化修饰开发了一种新型脓毒症预后模型 | 首次系统表征脓毒症乳酸化动态变化模式，并基于乳酸化相关枢纽基因构建预后预测模型 | 单中心前瞻性队列样本量有限(N=51)，需要更大规模多中心验证 | 探索脓毒症进程中乳酸化动态变化并开发基于乳酸化的预后预测模型 | 脓毒症患者和THP-1单核细胞 | 生物信息学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序，机器学习，伪时间轨迹重建，体外实验 | 机器学习算法，预后预测模型 | 转录组数据，单细胞RNA测序数据，临床数据 | 外部转录组数据集和51例前瞻性单中心脓毒症患者队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1066 | 2025-10-06 |
Applications and Prospects of Single-Cell RNA Sequencing and Spatial Transcriptomics in Cervical Cancer
2025, BioMed research international
IF:2.6Q3
DOI:10.1155/bmri/1532745
PMID:40612935
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综述 | 总结单细胞RNA测序和空间转录组学在宫颈癌研究中的应用进展与前景 | 整合两种新兴技术（scRNA-seq和ST）在宫颈癌研究中的协同应用，弥补各自技术局限性 | 作为综述文章，不涉及原始实验数据，主要基于现有文献总结 | 探讨scRNA-seq和ST技术在宫颈癌研究中的应用价值和发展前景 | 宫颈癌肿瘤异质性、肿瘤微环境、进化轨迹和治疗靶点 | 数字病理 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间位置数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1067 | 2025-10-06 |
Bridging aging, immunity, and atherosclerosis: novel insights into senescence-related genes
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1557266
PMID:40612944
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证，探索衰老相关基因在动脉粥样硬化中的作用机制 | 首次系统识别了89个关键衰老相关基因，并发现PDLIM1、PARP14和SEL1L3作为动脉粥样硬化诊断生物标志物，揭示了它们在巨噬细胞分化中的阶段特异性表达模式 | 研究主要基于公共数据库数据，实验验证仅限于小鼠模型，需要进一步临床验证 | 探索衰老、免疫与动脉粥样硬化之间的关联，寻找可靠的诊断生物标志物 | 人类组织样本和ApoE-/-动脉粥样硬化小鼠模型 | 生物信息学 | 心血管疾病 | RNA测序，单细胞RNA测序，免疫荧光 | LASSO，SVM，RF | 基因表达数据，单细胞数据 | 来自GEO数据库的人类组织数据 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1068 | 2025-10-06 |
Single-cell atlas of human skin implicates APOE pro-inflammatory signaling in diabetic foot ulcers
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1591944
PMID:40612951
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建人类皮肤细胞图谱，揭示APOE信号通路在糖尿病足溃疡中的促炎作用 | 首次在糖尿病足溃疡中发现过度表达APOE的独特成纤维细胞亚群，并证明其通过FGF信号通路和药物代谢-细胞色素P450途径促进纤维化和炎症 | 样本量有限，需要更大规模研究验证；机制研究主要基于体外实验，需要更多体内实验证实 | 探究糖尿病足溃疡的发病机制和细胞分子基础 | 人类皮肤组织样本，特别是糖尿病足溃疡患者的成纤维细胞 | 单细胞生物学 | 糖尿病足溃疡 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学染色，体外实验 | NA | 单细胞转录组数据，组织图像数据 | 未明确说明具体样本数量的人类皮肤组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1069 | 2025-10-06 |
Tumor-associated macrophage-based predictive and prognostic model for hepatocellular carcinoma
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0325120
PMID:40601653
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量测序数据，构建了基于肿瘤相关巨噬细胞的肝细胞癌预测和预后模型 | 首次整合单细胞RNA测序和批量测序数据，系统研究肿瘤相关巨噬细胞特征在肝细胞癌中的预后价值 | 需要在大规模前瞻性研究中进一步验证，并探索肿瘤相关巨噬细胞在肝细胞癌进展中的功能机制 | 研究肿瘤相关巨噬细胞在肝细胞癌预后中的作用，并开发有效的预后分层模型 | 肝细胞癌患者 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，批量测序，生物信息学分析 | Cox回归，逻辑回归 | 基因表达数据 | 多个肝细胞癌队列 | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | NA |
| 1070 | 2025-10-06 |
Identification of three T cell-related genes as diagnostic and prognostic biomarkers for triple-negative breast cancer and exploration of potential mechanisms
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1584334
PMID:40606662
|
研究论文 | 本研究通过整合TCGA和GEO数据库数据，识别出三个T细胞相关基因作为三阴性乳腺癌的诊断和预后生物标志物 | 首次将T细胞相关基因与三阴性乳腺癌诊断预后相结合，并构建了高精度的逻辑回归诊断模型 | 研究基于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 识别三阴性乳腺癌的诊断和预后生物标志物 | 三阴性乳腺癌患者 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,机器学习算法 | 逻辑回归 | 转录组数据,临床数据 | TCGA-BRCA数据集和GEO数据库样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1071 | 2025-10-06 |
Comprehensive bioinformatics analysis of the common mechanism of atherosclerosis and atrial fibrillation: emphasizing mitochondrial metabolic disorder and immune inflammation
2025, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2025.1595048
PMID:40607061
|
研究论文 | 通过生物信息学分析揭示动脉粥样硬化和心房颤动的共同机制，重点关注线粒体代谢紊乱和免疫炎症 | 首次建立MRPS23作为连接线粒体功能障碍和免疫失调的新型生物标志物，提出'线粒体-免疫轴'心血管共病新范式 | 需要在临床前模型和临床队列中进一步验证以转化为诊断或治疗应用 | 揭示动脉粥样硬化和心房颤动的共同分子通路，识别诊断生物标志物 | 动脉粥样硬化和心房颤动患者的转录组数据 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 转录组分析，单细胞RNA测序，机器学习算法 | LASSO，SVM，随机森林 | 转录组数据，单细胞转录组数据 | 多个独立数据集（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序，转录组测序 | NA | NA |
| 1072 | 2025-10-06 |
Interferon Regulatory Factor 4 Recruits Immature B Cells to Signal Tertiary Lymphoid Structure Immaturity and Progression of Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2025, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.113737
PMID:40607252
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研究论文 | 本研究通过整合转录组和临床数据构建了透明细胞肾细胞癌的三级淋巴结构相关预后风险评分，并揭示了干扰素调节因子4在促进TLS不成熟和免疫功能障碍中的机制作用 | 首次构建了ccRCC中TLS相关的预后风险评分，并发现IRF4通过招募不成熟B细胞阻碍TLS成熟的新机制 | 研究主要基于回顾性数据，需要进一步的功能验证实验确认IRF4的具体作用机制 | 探究三级淋巴结构在透明细胞肾细胞癌中的预后意义和调控机制 | 928名透明细胞肾细胞癌患者及其肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,免疫组织化学,多重免疫荧光分析 | 机器学习算法 | 转录组数据,临床数据,图像数据 | 928名ccRCC患者 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 1073 | 2025-10-06 |
Integrative multi-omics analysis of IFNγ-induced macrophages and atherosclerotic plaques reveals macrophage-dependent STAT1-driven transcription in atherosclerosis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1590953
PMID:40607379
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研究论文 | 通过整合多组学分析揭示巨噬细胞中STAT1驱动的转录调控在动脉粥样硬化中的作用机制 | 首次发现STAT1与PU.1共结合通过表观遗传修饰调控巨噬细胞特异性IFNγ激活的转录反应，并鉴定出新的巨噬细胞依赖性基因特征 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本，需要进一步临床验证 | 探究巨噬细胞STAT1介导的信号通路在动脉粥样硬化进展中的作用 | IFNγ诱导的巨噬细胞、人类和小鼠动脉粥样硬化斑块 | 生物信息学 | 心血管疾病 | ATAC-seq, ChIP-seq, RNA-seq, scRNA-seq, 多组学整合分析 | 统计分析、通路分析 | 基因组学、表观基因组学、转录组学数据 | 人类颈动脉和冠状动脉粥样硬化病变样本、LDLr-/-和ApoE-/-高脂饮食小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 染色质可及性测序, 染色质免疫沉淀测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 1074 | 2025-10-06 |
Integrative analysis of T cell-associated markers in Ewing sarcoma reveals prognostic signatures and immune dynamics
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1586544
PMID:40607387
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和生物信息学分析，揭示了尤文肉瘤中T细胞相关标志物的预后价值及免疫动态特征 | 首次系统鉴定CLEC11A、BDP1和ID3作为尤文肉瘤T细胞相关预后标志物，并构建了具有高预测准确性的预后模型 | 样本量相对有限，需要更多独立队列验证模型的普适性 | 探索尤文肉瘤肿瘤微环境中T细胞相关标志物的预后价值及免疫调控机制 | 尤文肉瘤患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 尤文肉瘤 | 单细胞RNA测序, 加权基因共表达网络分析, 批量RNA测序, CIBERSORT算法 | Cox回归模型 | 基因表达数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1075 | 2025-10-06 |
Single-cell analysis of peripheral blood and pleural effusion reveals functional diversity of γδ T cells in tuberculosis infection
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1605827
PMID:40607390
|
研究论文 | 通过单细胞测序分析结核病患者外周血和胸腔积液中γδ T细胞的功能多样性 | 首次在结核病患者中系统鉴定出7个γδ T细胞亚群，并发现效应性γδ2细胞在PBMC中占比最高(36.1%)，组织驻留γδ2细胞在PFMC中占比最高(70.5%) | NA | 探索γδ T细胞在结核病免疫应答中的具体作用和亚群分化机制 | 结核病患者的外周血单个核细胞(PBMC)和结核性胸腔积液(TPE) | 免疫学 | 结核病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1076 | 2025-10-06 |
Decoding neuroinflammation in Alzheimer's disease: a multi-omics and AI-driven perspective for precision medicine
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1616899
PMID:40607399
|
综述 | 本文探讨了利用多组学和人工智能方法解析阿尔茨海默病神经炎症机制的前景 | 整合单细胞RNA测序与AI分析及多组学平台，突破传统组织分析信号平均化的限制 | NA | 解码阿尔茨海默病复杂的免疫炎症网络，实现疾病亚型精准分类和早期诊断 | 阿尔茨海默病患者脑组织细胞 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 多组学分析 | AI驱动分析 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1077 | 2025-10-06 |
Landscape analysis of matrix metalloproteinases reveals key prognostic markers for prostate cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1582992
PMID:40607407
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研究论文 | 本研究通过综合分析基质金属蛋白酶在前列腺癌中的作用，发现MMP11是关键预后标志物并通过重塑肿瘤微环境促进癌症进展 | 首次系统评估24种MMP在前列腺癌中的表达特征和预后价值，并证实MMP11通过调控肿瘤微环境促进前列腺癌进展的新机制 | 研究主要基于公共数据库分析，需要更多实验验证MMP11的具体作用机制 | 探索基质金属蛋白酶在前列腺癌中的全面作用及其临床意义 | 前列腺癌组织和细胞 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 单细胞转录组测序,空间转录组测序,细胞功能实验 | COX回归分析 | 基因表达数据,单细胞数据,空间转录组数据 | 来自UCSC和GEO数据库的前列腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 1078 | 2025-10-06 |
The functional and clinical significance of nucleoporin NUP153 across human cancers: a systematic study based on multi-omics analysis and bench work validation
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1613688
PMID:40607419
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研究论文 | 通过多组学分析和实验验证系统研究核孔蛋白NUP153在人类癌症中的功能和临床意义 | 首次系统研究NUP153在多种癌症中的表达模式、突变特征、诊断价值及其与肿瘤免疫微环境的关系 | 需要进一步研究阐明NUP153在癌症中的具体分子机制并探索其临床适用性 | 探索核孔蛋白NUP153在人类癌症中的功能和临床意义 | 人类多种癌症类型，重点关注胃癌 | 生物信息学 | 多种癌症（胆管癌、结直肠癌、头颈鳞状细胞癌、胃癌等） | 多组学分析、免疫组织化学、RT-qPCR、单细胞分析、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、药物敏感性数据、单细胞数据、空间转录组数据 | 来自TCGA、GTEx等公共数据库的多种癌症样本，以及胃癌组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1079 | 2025-10-06 |
Identification and validation of a KRAS-macrophage-associated gene signature as prognostic biomarkers and potential therapeutic targets in melanoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1566432
PMID:40607411
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研究论文 | 本研究通过多平台数据分析识别并验证了KRAS-巨噬细胞相关基因特征作为黑色素瘤预后生物标志物和潜在治疗靶点 | 首次构建了KRAS-巨噬细胞预后相关基因(KMPAG)特征，整合了单细胞RNA测序和临床数据分析，重新分类巨噬细胞亚群 | 研究主要基于公共数据库数据，需要更多实验验证和临床队列验证 | 探索KRAS信号通路在黑色素瘤肿瘤微环境中对巨噬细胞浸润的影响及其预后价值 | 皮肤 cutaneous 黑色素瘤(SKCM)患者和黑色素瘤细胞系 | 生物信息学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 基因集富集分析, LASSO回归, 免疫组织化学, 功能实验 | LASSO回归模型, Monocle2算法, CellChat工具 | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据, 临床数据 | 来自GEO和TCGA数据库的黑色素瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1080 | 2025-10-06 |
SpatialDeX Is a Reference-Free Method for Cell-Type Deconvolution of Spatial Transcriptomics Data in Solid Tumors
2025-Jan-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-1472
PMID:39387817
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研究论文 | 开发了一种无需参考数据的空间转录组细胞类型反卷积方法SpatialDeX，用于解析实体瘤中的细胞空间组织 | 提出首个无需单细胞RNA-seq参考数据的空间转录组反卷积方法，在实验数据上表现优于基于参考和无参考的方法 | 主要针对多细胞分辨率的空间转录组数据，未在单细胞分辨率平台上充分验证 | 开发无需参考数据的空间转录组细胞类型反卷积方法 | 实体瘤组织中的细胞类型空间分布 | 空间转录组学 | 实体瘤 | 空间转录组测序 | 回归模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |