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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1041 | 2025-10-06 |
Identification of prognostic biomarkers for endometrioid endometrial carcinoma based on the miRNA and mRNA co-expression network regulated by estradiol
2025, Clinics (Sao Paulo, Brazil)
DOI:10.1016/j.clinsp.2025.100672
PMID:40319860
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研究论文 | 基于雌二醇调控的miRNA和mRNA共表达网络识别子宫内膜样腺癌的预后生物标志物 | 首次构建雌二醇调控的miRNA-mRNA共表达网络,并识别出miR-142-5p-SACS和miR-30a-5p-GPR157作为EEC潜在预后生物标志物 | 样本量有限,特别是实验验证部分仅使用细胞系,需要更多临床样本验证 | 识别与雌二醇调控相关的子宫内膜样腺癌预后生物标志物 | 子宫内膜样腺癌患者和子宫内膜癌Ishikawa细胞系 | 生物信息学 | 子宫内膜癌 | RNA测序, 单细胞转录组测序, 生物信息学分析 | 共表达网络分析, 蛋白质-蛋白质相互作用网络 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | TCGA数据库408例EEC患者,实验组9个细胞样本(6个雌二醇处理,3个对照) | NA | RNA-seq, 单细胞转录组测序 | NA | NA |
| 1042 | 2025-10-06 |
Single cell RNA-sequencing identified CCR7+/RELB+/IRF1+ T cell responding for juvenile idiopathic arthritis pathogenesis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1528446
PMID:40406113
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析鉴定出CCR7+/RELB+/IRF1+三阳性T细胞在幼年特发性关节炎发病机制中的作用 | 首次在单细胞水平揭示HLA-B27阳性和阴性JIA患者的免疫细胞差异,并鉴定出CCR7+/RELB+/IRF1+三阳性T细胞这一新型致病T细胞亚群 | 样本来源仅限于外周血单核细胞,未涉及关节组织等病变部位 | 探索幼年特发性关节炎不同亚型的疾病异质性及其发病机制 | 幼年特发性关节炎患者的免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 幼年特发性关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | JIA患者、pSS患者和SLE患者的外周血单核细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1043 | 2025-10-06 |
Decoding multiple myeloma: single-cell insights into tumor heterogeneity, immune dynamics, and disease progression
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1584350
PMID:40406148
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析多发性骨髓瘤的肿瘤异质性、免疫动态和疾病进展机制 | 首次在单细胞水平揭示多发性骨髓瘤中神经免疫相互作用的机制,并识别出关键的未分化IGLC3+骨髓瘤细胞亚群 | 样本量有限,需要更大规模验证神经免疫轴在肿瘤进展中的具体作用机制 | 探索多发性骨髓瘤的肿瘤异质性、免疫动态和神经免疫调控机制 | 多发性骨髓瘤和高风险冒烟型多发性骨髓瘤患者样本 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | CytoTRACE, Monocle2, Slingshot | 单细胞转录组数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1044 | 2025-10-06 |
Identification of common hub genes and construction of immune regulatory networks in aplastic anemia, myelodysplastic syndromes, and acute myeloid leukemia
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1547289
PMID:40406144
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证,识别了再生障碍性贫血、骨髓增生异常综合征和急性髓系白血病中的共同枢纽基因及其免疫调控网络 | 首次发现POLG和MAP2K7作为三种血液疾病的共同枢纽基因,并揭示其通过MIF介导的细胞通讯调控20多条免疫调控通路 | 枢纽基因对细胞增殖和迁移无显著影响,研究样本来源有限 | 识别再生障碍性贫血、骨髓增生异常综合征和急性髓系白血病的共同枢纽基因,构建免疫调控网络,为预防疾病进展提供基础 | 再生障碍性贫血、骨髓增生异常综合征和急性髓系白血病患者样本 | 生物信息学 | 血液系统疾病 | 基因表达差异分析、基因集富集分析、加权基因共表达网络分析、免疫浸润分析、单细胞测序、细胞通讯分析、孟德尔随机化、RT-qPCR、ELISA、细胞增殖实验 | 加权基因共表达网络分析 | 基因表达数据 | GEO数据库相关数据集 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 1045 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals adrb1 as a sympathetic nerve-regulated immune checkpoint driving T cell exhaustion and impacting immunotherapy in esophageal squamous cell carcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1520766
PMID:40406147
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序发现ADRB1是交感神经调节的免疫检查点,驱动T细胞耗竭并影响食管鳞状细胞癌的免疫治疗 | 首次通过单细胞RNA测序揭示ADRB1在食管鳞癌中的免疫调节作用,并建立基于肾上腺素能受体信号通路的预后模型 | 研究样本量有限,需要更大规模验证 | 探索肾上腺素能受体信号通路在食管鳞癌免疫治疗中的作用机制 | 食管鳞状细胞癌患者样本 | 单细胞测序分析 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA分析, 免疫荧光, 流式细胞术, 拷贝数变异分析 | 预后模型 | 单细胞RNA测序数据, 批量RNA测序数据, TCGA数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1046 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA-Seq Recognized Key Genes for Metastasis and Macrophage Infiltration in Colorectal Cancer
2025, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/9488531
PMID:40406545
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序识别结直肠癌转移和巨噬细胞浸润的关键基因ZFAND2A | 首次通过单细胞测序技术系统识别结直肠癌转移和巨噬细胞浸润的关键基因ZFAND2A,并验证其功能 | 研究主要基于公共数据库和体外实验,缺乏体内实验验证 | 识别结直肠癌转移和巨噬细胞浸润的关键基因 | 结直肠癌细胞和巨噬细胞 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, WB分析, CCK-8, transwell实验, ELISA, 流式细胞术 | lasso回归 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的GSE261012和GSE234804数据集,以及TCGA数据库数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1047 | 2025-10-06 |
CD9 expression rivals IDH mutation as a prognostic marker in glioma: a novel nomogram approach
2025, Frontiers in neurology
IF:2.7Q3
DOI:10.3389/fneur.2025.1507443
PMID:40406701
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研究论文 | 本研究评估了四跨膜蛋白CD9在胶质瘤中的预后意义和功能机制,开发了CD9整合的预后列线图模型 | 首次将CD9表达与IDH突变作为胶质瘤预后标志物进行比较,并通过孟德尔随机化验证了CD9与胶质瘤风险的因果关系 | 研究基于公共数据库的回顾性分析,需要前瞻性研究进一步验证 | 评估CD9在胶质瘤中的预后价值和功能机制,开发精准预后模型 | 胶质瘤患者样本 | 生物信息学 | 胶质瘤 | 多组学分析、单细胞RNA测序、孟德尔随机化、蛋白互作网络分析 | Cox回归、列线图 | 基因组数据、转录组数据、单细胞数据 | 1033个胶质瘤样本(来自TCGA和CGGA队列),20例胶质母细胞瘤单细胞测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1048 | 2025-10-06 |
Distinct myeloid-derived suppressor cell populations in human glioblastoma
2025-Jan-17, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abm5214
PMID:39818911
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序鉴定人胶质母细胞瘤中两种不同的髓源性抑制细胞群体及其空间分布特征 | 首次在IDH野生型胶质母细胞瘤中发现两种功能不同的MDSC亚群,并揭示其与肿瘤干细胞的空间共定位和相互作用机制 | 样本量相对有限(33例胶质瘤),且主要关注IDH野生型肿瘤 | 阐明胶质瘤相关髓系细胞在肿瘤进展和免疫逃逸中的作用机制 | 人胶质瘤组织中的免疫细胞和肿瘤细胞 | 单细胞组学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据,空间基因表达数据 | 33例人胶质瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 1049 | 2025-10-06 |
Isolation and Preparation of Embryonic Zebrafish Retinal Cells for Single-Cell RNA Sequencing
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4087-6_6
PMID:39240518
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研究论文 | 本文描述了从斑马鱼胚胎眼睛中制备高质量单细胞悬液用于单细胞RNA测序的方法 | 开发了可重复生成高质量斑马鱼胚胎眼睛单细胞悬液的方法,并建立了定量评估细胞产量和活力的质量控制参数 | 该方法主要针对斑马鱼胚胎眼睛,在其他组织或模型系统中的适用性需要进一步验证 | 建立斑马鱼胚胎视网膜细胞单细胞RNA测序的样品制备和质量控制方法 | 斑马鱼胚胎眼睛的视网膜细胞 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10× Genomics v3.1系统 | 10× Genomics v3.1单细胞测序系统 |
| 1050 | 2025-10-06 |
Insights into early acne pathogenesis: Exploring intercellular dynamics and key dysregulated genes
2025, Cell signaling
DOI:10.46439/signaling.3.053
PMID:40401196
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评论 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学数据探讨早期痤疮发病机制中的细胞间通讯和关键失调基因 | 首次在早期痤疮研究中整合单细胞RNA测序与空间转录组学数据,揭示主要皮肤细胞类型中与炎症反应和角化过度相关的关键失调基因 | NA | 探索早期痤疮发病机制中的细胞间动态和关键失调基因 | 痤疮患者的皮肤组织样本,包括内皮细胞、成纤维细胞、淋巴细胞、髓样细胞、角质形成细胞和平滑肌细胞 | 数字病理学 | 痤疮 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1051 | 2025-10-06 |
TLR7 responses in glomerular macrophages accelerate the progression of glomerulonephritis in NZBWF1 mice
2025-Jan-27, International immunology
IF:4.8Q2
DOI:10.1093/intimm/dxaf005
PMID:39868591
|
研究论文 | 本研究通过TLR7缺陷小鼠模型揭示肾小球巨噬细胞中TLR7信号通过促进单核细胞迁移和炎症因子表达加速狼疮性肾炎进展 | 首次阐明肾小球巨噬细胞特异性TLR7信号在狼疮性肾炎中的致病机制,发现其通过CD31介导的单核细胞迁移和补体因子B表达促进疾病发展 | 研究局限于NZBWF1小鼠模型,尚未在人类患者中验证;血清补体因子B水平未升高与局部表达的关联机制需进一步探讨 | 探究巨噬细胞TLR7信号在狼疮性肾炎发病机制中的具体作用 | NZBWF1小鼠模型及其肾小球巨噬细胞 | 免疫学 | 狼疮性肾炎 | 单细胞RNA测序,基因敲除模型,免疫荧光 | Tlr7基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,蛋白质表达数据,组织病理数据 | NZBWF1小鼠及Tlr7-/- NZBWF1小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1052 | 2025-10-06 |
Plasticity in metastatic colorectal cancer
2025-01-20, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.12.018
PMID:39837278
|
研究论文 | 通过单细胞转录组测序研究结直肠癌进展过程中癌细胞状态的变化 | 使用单细胞转录组测序技术绘制结直肠癌进展过程中癌细胞状态变化的图谱 | NA | 探索结直肠癌转移和治疗抵抗的机制 | 结直肠癌细胞 | 单细胞组学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1053 | 2025-10-06 |
Comprehensive analysis of autophagy-related prognostic genes in breast cancer using bulk and single-cell RNA sequencing
2025, American journal of clinical and experimental immunology
IF:1.4Q4
DOI:10.62347/XPCM9169
PMID:40401006
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序分析乳腺癌中的自噬相关基因,构建了一个3基因预后模型 | 首次结合单细胞和批量RNA测序技术系统分析乳腺癌自噬景观,并开发了基于FEZ1、STX11和ADAMTSL1的新型预后特征 | 研究依赖于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 阐明乳腺癌自噬景观并开发预后模型 | 乳腺癌患者和细胞 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, Cox回归分析 | Cox比例风险模型, 预后风险模型 | 基因表达数据 | 来自TCGA、GSE75688、GSE20685和GSE48390数据集的多个样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1054 | 2025-10-06 |
Erratum: Integrated Analysis of Single-Cell RNA-Seq and Bulk RNA-Seq Combined with Multiple Machine Learning Identified a Novel Immune Signature in Diabetic Nephropathy [Corrigendum]
2025, Diabetes, metabolic syndrome and obesity : targets and therapy
DOI:10.2147/DMSO.S540734
PMID:40406633
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更正 | 对一篇关于糖尿病肾病免疫特征的论文进行勘误 | NA | NA | NA | NA | NA | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 多种机器学习 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1055 | 2025-10-06 |
Single-cell analyses of intestinal epithelium reveal the dysregulation of gut immune microenvironment in systemic lupus erythematosus
2025-Jan-27, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06147-5
PMID:39871323
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示系统性红斑狼疮中肠道上皮免疫微环境的失调机制 | 首次在狼疮背景下构建肠道上皮的高分辨率单细胞图谱,发现CD8αα+ IELs减少、CD8αβ+ IELs增加以及γδT细胞减少与氧化应激和铁死亡的关联 | 研究主要基于MRL/Lpr小鼠模型,人类样本验证尚需进一步研究 | 探究系统性红斑狼疮中肠道免疫微环境的失调机制 | MRL/Lpr狼疮小鼠和MRL/Mpj对照小鼠的肠道上皮细胞 | 单细胞组学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序,qPCR,流式细胞术,体内实验 | NA | 单细胞转录组数据 | 狼疮小鼠和对照小鼠的肠道上皮样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1056 | 2025-05-23 |
Author Correction: Uncovering functional lncRNAs by scRNA-seq with ELATUS
2025-Jan-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-55730-9
PMID:39774948
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1057 | 2025-10-06 |
Self and parasite-derived peptides selected upon DERAA-bearing HLA-DRB1 alleles activate CD4+ T cells from Chagas cardiomyopathy patients and are associated with ventricular dysfunction
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1527115
PMID:40391216
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研究论文 | 本研究揭示了携带DERAA基序的HLA-DRB1等位基因在查加斯心肌病患者中通过呈递宿主和寄生虫来源的肽段激活CD4+ T细胞,并与心室功能障碍相关 | 首次发现特定HLA-DRB1等位基因通过交叉反应性肽段激活致病性CD4+ T细胞,并建立其与心肌纤维化和心室功能障碍的直接关联 | 样本量有限,需要更大规模研究验证;机制研究尚未完全阐明T细胞活化的具体信号通路 | 探究HLA-DRB1等位基因在查加斯心肌病发病机制中的作用 | 查加斯病患者(包括无症状期和心肌病期患者)的CD4+ T细胞和心脏组织 | 免疫学 | 查加斯心肌病 | 计算分析、体外功能实验、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、功能实验数据、临床数据 | 查加斯病患者(包括IND和CCC两组) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1058 | 2025-10-06 |
Comprehensive Single-Cell RNA Sequencing Analysis of Cervical Cancer: Insights Into Tumor Microenvironment and Gene Expression Dynamics
2025, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/ijog/5027347
PMID:40395456
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析宫颈癌的肿瘤微环境和基因表达动态 | 首次在宫颈癌中应用大规模单细胞RNA测序技术揭示细胞异质性和基因表达动态 | NA | 探索宫颈癌的肿瘤微环境特征和基因表达动态 | 宫颈癌样本 | 生物信息学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | 细胞聚类分析、伪时间分析、基因共表达网络分析 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1059 | 2025-10-06 |
Pan-cancer analysis of phagocytosis regulators in female-specific cancers: a focus on HMGB2
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1565924
PMID:40396172
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研究论文 | 通过对女性特有癌症中吞噬作用调节因子的泛癌分析,重点关注HMGB2的功能机制 | 首次系统分析女性特有癌症中吞噬作用调节因子的表达特征,并验证HMGB2在调控肿瘤细胞增殖、迁移和巨噬细胞吞噬功能中的关键作用 | 基于公共数据库的分析可能存在数据异质性,体外实验需要进一步体内验证 | 探索吞噬作用调节因子在女性特有癌症中的分子机制和临床意义 | 女性特有癌症(乳腺癌、宫颈癌、卵巢癌、子宫内膜癌) | 生物信息学 | 女性特有癌症 | 单细胞测序、DNA甲基化分析、体外功能验证 | NA | 基因组数据、转录组数据、表观遗传数据 | 公共数据库中的多癌种样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1060 | 2025-10-06 |
Integrative single-cell and spatial transcriptomics analysis reveals MDK-NCL pathway's role in shaping the immunosuppressive environment of lung adenocarcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1546382
PMID:40396179
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研究论文 | 通过整合单细胞和空间转录组学分析揭示MDK-NCL通路在肺腺癌免疫抑制微环境形成中的作用 | 首次结合单细胞RNA测序、空间转录组学和批量RNA测序数据,系统揭示了MDK-NCL信号轴在肺腺癌免疫抑制微环境形成中的关键作用 | 研究主要基于公共数据库数据,实验验证样本量有限,需要进一步的功能实验验证机制 | 研究肺腺癌肿瘤微环境的细胞组成及MDK-NCL信号通路的作用 | 肺腺癌组织样本及配对癌旁正常组织 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序,实时PCR,Western blotting | Seurat,inferCNV,MCPcounter,Niches | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,批量转录组数据 | TCGA-LUAD队列和内部队列的肺腺癌样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序 | NA | NA |