单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 2177 篇文献，本页显示第 1021 - 1040 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1021 | 2025-10-06 |
Disulfidptosis-Related Genes as Novel Biomarkers and Therapeutic Targets in Dilated Cardiomyopathy
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S525114
PMID:40735269
|
研究论文 | 本研究通过分析扩张型心肌病中双硫死亡相关基因的表达特征，建立了诊断模型并验证了核心基因的病理作用 | 首次将双硫死亡机制与扩张型心肌病关联，发现19个差异表达基因并建立高精度诊断模型 | 研究样本量有限，机制研究仍需进一步深入验证 | 探索双硫死亡相关基因在扩张型心肌病中的生物标志物和治疗靶点价值 | 扩张型心肌病患者和健康对照的基因表达数据，DCM小鼠模型 | 生物信息学 | 扩张型心肌病 | RNA-seq，单细胞RNA-seq，机器学习 | 支持向量机(SVM) | 基因表达数据 | 多个GEO数据集，包含DCM患者和健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1022 | 2025-07-31 |
Editorial: Single-cell sequencing of the immune microenvironment in cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1660831
PMID:40735316
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1023 | 2025-10-06 |
Targeting the KLF5/PI3K/AKT axis as a therapeutic strategy to overcome neoadjuvant chemoresistance in colorectal cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1593639
PMID:40735324
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了KLF5/PI3K/AKT轴在结直肠癌新辅助化疗耐药中的关键作用 | 首次在单细胞水平系统解析结直肠癌化疗耐药机制，并建立KLF5调控网络风险评分模型用于预后预测 | NA | 探索结直肠癌新辅助化疗耐药机制并寻找有效治疗策略 | 结直肠癌患者样本和动物模型 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, InferCNV, 差异表达基因分析, 通路富集分析, 细胞通讯分析, SCENIC, 高通量药物筛选 | 风险评分模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1024 | 2025-10-06 |
An integrated approach for analyzing spatially resolved multi-omics datasets from the same tissue section
2025, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2025.1614288
PMID:40735471
|
研究论文 | 开发了一种在相同组织切片上整合空间转录组学和空间蛋白质组学分析的实验与计算框架 | 首次在相同组织切片上实现空间转录组和空间蛋白质组的整合分析，确保组织形态和空间背景的一致性 | 仅在人肺癌样本中进行了验证，尚未在其他疾病类型中测试 | 开发空间多组学整合分析方法，研究肿瘤免疫微环境 | 人肺癌组织样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, H&E染色 | Weave软件 | 空间转录组数据, 空间蛋白质组数据, 图像数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 1025 | 2025-10-06 |
Collection of Growing Bovine Oocytes and Library Preparation for Single-Cell RNA Sequencing
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4658-8_4
PMID:40736790
|
研究论文 | 本文详细介绍了用于单细胞RNA测序分析的生长中牛卵母细胞收集和文库制备的详细实验方案 | 提供了针对牛卵母细胞的单细胞RNA测序标准化实验流程 | NA | 建立牛卵母细胞单细胞RNA测序的实验方法 | 生长中的牛卵母细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1026 | 2025-10-06 |
Promising Nanoparticles-Based Oral Therapy for Effective Inhibition of Hepatocellular Carcinoma with Portal Vein Tumor Thrombus
2025-01-29, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.4c05798
PMID:39808085
|
研究论文 | 开发基于碳酸钙@聚多巴胺纳米颗粒的口服给药系统，用于治疗肝细胞癌合并门静脉癌栓 | 利用门静脉独特解剖结构和单细胞RNA测序技术开发口服纳米颗粒系统，将门静脉阻塞挑战转化为药物递送优势 | NA | 开发针对肝细胞癌合并门静脉癌栓的有效口服治疗方法 | 肝细胞癌合并门静脉癌栓患者 | 纳米医学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1027 | 2025-10-06 |
Mapping the spatial atlas of the human bone tissue integrating spatial and single-cell transcriptomics
2025-Jan-11, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae1298
PMID:39817519
|
研究论文 | 通过整合空间和单细胞转录组学技术，构建了人类骨组织的高分辨率空间图谱 | 首次整合空间和单细胞转录组学绘制人类骨骼和骨髓的高分辨率图谱，发现了骨形成特化微环境和从骨小梁辐射的细胞组成空间梯度 | 研究仅基于股骨组织样本，未涵盖其他骨骼部位 | 揭示骨组织微环境中细胞的空间组织和相互作用 | 人类骨组织和骨髓细胞 | 空间转录组学 | 骨相关疾病 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 股骨组织样本 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1028 | 2025-10-06 |
Deciphering the cellular and molecular landscape of pulmonary fibrosis through single-cell sequencing and machine learning
2025-Jan-02, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-06031-8
PMID:39748378
|
研究论文 | 本研究结合单细胞测序和机器学习技术解析肺纤维化的细胞和分子机制 | 发现肺纤维化中激活的B细胞、CD4 T细胞、巨噬细胞和特定成纤维细胞亚群的显著富集，并鉴定出TMEM52B、PHACTR1和BLVRB等关键基因标志物 | NA | 提高肺纤维化的诊断准确性并发现潜在治疗靶点 | 肺纤维化患者的肺组织样本和博来霉素诱导的小鼠肺纤维化模型 | 机器学习 | 肺纤维化 | 单细胞测序，机器学习，基因敲低，基因敲除 | 机器学习诊断模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1029 | 2025-10-06 |
Reduced T-Cell stemness underlies Th17 expansion and graft dysfunction in kidney transplant recipients
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1588941
PMID:40584830
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析肾移植受者免疫机制，发现T细胞干性降低与Th17细胞扩增及移植物功能障碍相关 | 首次将CD4+ T细胞干性特征与肾移植后Th17极化及移植物功能障碍联系起来，并识别出S100A4等关键生物标志物 | 样本量相对较小（单细胞测序n=20），需要在更大队列中验证发现 | 阐明肾移植受者移植物功能稳定与功能障碍的免疫机制差异 | 肾移植受者外周血单个核细胞 | 单细胞基因组学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 加权基因共表达网络分析 | Monocle, iTalk, WGCNA | RNA测序数据 | 单细胞测序20例（正常功能10例，功能障碍10例），批量验证队列192例 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1030 | 2025-10-06 |
Single cell transcriptomic analysis reveals transcriptome differences of different cells between eosinophilic chronic rhinosinusitis with nasal polyps and non-eosinophilic chronic rhinosinusitis with nasal polyps
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0328241
PMID:40720416
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析比较嗜酸性和非嗜酸性慢性鼻窦炎伴鼻息肉的细胞差异 | 首次在单细胞水平系统揭示两种鼻息肉亚型的细胞组成、代谢特征和免疫细胞功能差异 | 样本量较小（3例健康对照+6例患者），需更大队列验证 | 探索嗜酸性和非嗜酸性慢性鼻窦炎伴鼻息肉的发病机制差异 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉患者（包括嗜酸性和非嗜酸性亚型）的鼻腔组织细胞 | 生物信息学 | 慢性鼻窦炎 | 单细胞RNA测序 | 聚类分析、功能富集分析 | 单细胞转录组数据 | 9例样本（3健康对照+3 eCRSwNP+3 neCRSwNP） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1031 | 2025-10-06 |
Single-Cell Data and Weighted Correlation Network Analysis Revealed the Regulatory Mechanisms of Macrophages in Carotid Plaques
2025, Journal of immunology research
IF:3.5Q2
DOI:10.1155/jimr/9987367
PMID:40727388
|
研究论文 | 通过单细胞数据和加权基因相关网络分析揭示颈动脉斑块中巨噬细胞的调控机制 | 在单细胞水平识别影响颈动脉斑块进展的潜在生物标志物，并研究其在免疫调节、程序性细胞死亡和炎症因子调控中的作用 | NA | 探索颈动脉斑块形成机制，重点关注巨噬细胞异质性 | 颈动脉斑块中的巨噬细胞和血管平滑肌细胞 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序, bulk RNA-seq, WGCNA, 随机森林, LASSO回归, qRT-PCR, Western blot, ssGSEA | 随机森林, LASSO回归 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1032 | 2025-10-06 |
Identifying and Diagnosing Lytic Cell Death Genes in Atherosclerosis Using Machine Learning and Bioinformatics
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S520039
PMID:40727462
|
研究论文 | 本研究结合机器学习和生物信息学方法，识别和诊断动脉粥样硬化中的裂解性细胞死亡基因 | 首次将人工神经网络模型应用于动脉粥样硬化中裂解性细胞死亡基因的诊断，并识别出CYBB作为潜在生物标志物 | 数据来源于公共数据库GEO，缺乏独立验证队列 | 研究裂解性细胞死亡在动脉粥样硬化中的作用机制和诊断价值 | 动脉粥样硬化患者基因表达数据和单细胞测序数据 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞测序，生物信息学分析，机器学习 | 人工神经网络(ANN) | 基因表达数据，单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1033 | 2025-10-06 |
Intercellular TIMP-1-CD63 signaling directs the evolution of immune escape and metastasis in KRAS-mutated pancreatic cancer cells
2025-Jan-18, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02207-4
PMID:39825392
|
研究论文 | 本研究揭示了KRAS突变胰腺癌细胞通过TIMP-1-CD63信号通路逃避免疫清除和促进转移的机制 | 首次发现早期浸润巨噬细胞通过TIMP-1-CD63信号维持ERKactiveDUSP2low癌细胞群体，形成恶性循环促进胰腺癌进展 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 探究KRAS突变上皮细胞如何获得逃逸衰老和免疫清除能力，进展为晚期胰腺导管腺癌 | 胰腺导管腺癌(PDAC)细胞、巨噬细胞、基因工程小鼠模型 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 数字空间转录组分析 | 基因工程小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 体内实验数据 | 原发PDAC肿瘤样本、人和小鼠原代胰腺癌细胞系、免疫健全小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1034 | 2025-10-06 |
FGFR2 directs inhibition of WNT signaling to regulate anterior fontanelle closure during skull development
2025-Jan-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204264
PMID:39775862
|
研究论文 | 本研究通过小鼠遗传学和单细胞转录组学揭示了FGFR2通过调控WNT信号通路影响前囟闭合的机制 | 首次发现FGFR2通过非自主性调控WNT信号通路影响前囟细胞分化，揭示了FGF-WNT信号回路在颅缝形成中的作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床应用需进一步验证 | 探究FGFR2如何调控前囟闭合的分子机制 | 小鼠前囟细胞和颅骨成骨前沿细胞 | 发育生物学 | 颅缝早闭综合征 | 单细胞转录组测序, 遗传学分析 | 小鼠遗传模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1035 | 2025-10-06 |
Immune cell single-cell RNA sequencing analyses link an age-associated T cell subset to symptomatic benign prostatic hyperplasia
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1585446
PMID:40692782
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析发现与年龄相关的T细胞亚群与症状性良性前列腺增生的关联 | 首次鉴定出与年龄相关的GZMKhi GZMBlow CD8+ T细胞亚群（Taa），并揭示其通过颗粒酶K介导的机制促进前列腺基质细胞衰老相关分泌表型 | 样本量有限，仅分析了少量年轻和老年前列腺样本 | 探究年龄相关免疫细胞变化在良性前列腺增生发病机制中的作用 | 人类前列腺组织中的免疫细胞和BPH患者来源的成纤维细胞 | 单细胞组学 | 前列腺疾病 | 单细胞RNA测序，ELISA，速度分析 | NA | 单细胞RNA测序数据，细胞因子测量数据 | 老年男性大小前列腺样本（≤40g和≥90g）及3个年轻器官捐赠者前列腺样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1036 | 2025-10-06 |
Mapping the immunological landscape and emerging immunotherapeutic strategies in cervical cancer: a comprehensive review
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1620501
PMID:40708940
|
综述 | 本文全面综述宫颈癌免疫景观特征及新兴免疫治疗策略 | 整合单细胞RNA测序、空间转录组学等前沿技术解析肿瘤免疫微环境异质性 | 缺乏预测免疫治疗疗效的可靠生物标志物，患者间免疫景观存在高度异质性 | 开发针对宫颈癌的有效个体化免疫疗法 | 宫颈癌肿瘤免疫微环境（肿瘤细胞、免疫浸润细胞、基质成分） | 肿瘤免疫学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多重成像 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1037 | 2025-10-06 |
Gut-tropic α4β7+CD8+ T cells contribute to pancreatic β cell destruction in type 1 diabetes
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1623428
PMID:40709181
|
研究论文 | 本研究揭示了肠道归巢CD8+ T细胞通过整合素α4β7介导迁移至胰岛并促进1型糖尿病β细胞破坏的新机制 | 首次发现肠道归巢CD8+ T细胞在1型糖尿病胰岛破坏中的关键作用，建立了肠道免疫系统与胰腺自身免疫的新联系 | 样本量有限，动物模型与人类疾病存在差异，机制研究仍需深入验证 | 阐明非特异性T细胞在1型糖尿病胰岛破坏中的机制和作用 | 1型糖尿病患者、健康对照者、NOD小鼠模型 | 免疫学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、细胞因子检测、细胞毒性分析 | NA | 基因表达数据、临床数据、实验数据 | 99例T1D患者、57例健康对照、10例T1D供体胰腺、11例自身抗体阳性供体、15例非糖尿病对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1038 | 2025-10-06 |
High Glucose Promotes the Ferroptosis and Dysfunction of Endothelial Cells by Downregulating SLC3A2 and Promoting the Development of Nephropathy
2025, International journal of endocrinology
IF:2.3Q3
DOI:10.1155/ije/1186113
PMID:40703306
|
研究论文 | 本研究探讨高葡萄糖通过下调SLC3A2促进内皮细胞铁死亡和功能障碍，从而推动糖尿病肾病发展的机制 | 首次发现SLC3A2是糖尿病肾病中铁死亡的关键调节因子，并证实STAT1抑制剂氟达拉滨具有治疗潜力 | 需要进一步研究具体机制和治疗策略，样本来源有限 | 探究糖尿病肾病中内皮细胞功能障碍和铁死亡的分子机制 | 人脐静脉内皮细胞(HUVECs)和STZ处理的糖尿病小鼠 | 生物医学研究 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序，qPCR，western blotting，铁测量，TUNEL检测，生物信息学分析 | NA | 基因表达数据，蛋白质数据，细胞表型数据 | GSE13535数据集和实验细胞及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1039 | 2025-10-06 |
Integrative multi-omics analysis reveals the interaction mechanisms between gut microbiota metabolites and ferroptosis in rheumatoid arthritis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1608262
PMID:40703513
|
研究论文 | 通过整合多组学方法揭示肠道微生物代谢物与铁死亡在类风湿关节炎中的相互作用机制 | 首次整合多组学数据与机器学习算法，结合单细胞转录组分析，系统阐明GPX3和MYC作为关键铁死亡调节因子在RA中的作用机制 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证相对有限，需要进一步的功能实验确认 | 系统研究类风湿关节炎中铁死亡关键基因与肠道代谢物的调控关系 | 类风湿关节炎患者的多组学数据 | 生物信息学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序，分子对接，分子动力学模拟 | LASSO，SVM，RFE-RF | 转录组数据，单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1040 | 2025-10-06 |
A novel mast cell marker gene-related prognostic signature to predict prognosis and reveal the immune landscape in head and neck squamous cell carcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1538641
PMID:40703522
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序鉴定肥大细胞标志基因，构建了基于14个肥大细胞相关基因的头颈鳞状细胞癌预后预测模型 | 首次结合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，构建基于肥大细胞相关基因的HNSCC预后预测模型，并揭示其与免疫景观的关联 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，需要进一步的前瞻性研究验证 | 开发头颈鳞状细胞癌的预后预测模型并探索其免疫特征 | 头颈鳞状细胞癌患者 | 生物信息学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, Cox回归, LASSO回归 | 预后预测模型, 诺模图 | 基因表达数据 | TCGA数据库中的HNSCC患者数据（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |