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当前共找到 2151 篇文献，本页显示第 1001 - 1020 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1001 | 2025-10-06 |
Integration of Multi-Scale Profiling and Machine Learning Reveals the Prognostic Role of Extracellular Matrix-Related Cancer-Associated Fibroblasts in Lung Adenocarcinoma
2025, International journal of medical sciences
IF:3.2Q1
DOI:10.7150/ijms.113580
PMID:40657391
|
研究论文 | 本研究通过整合多尺度分析和机器学习方法，揭示了细胞外基质相关癌症相关成纤维细胞在肺腺癌进展和预后中的关键作用 | 首次系统鉴定eCAFs作为CAF分化的进化终点，发现其通过COL1A1-CD44和COL1A2-CD44配体-受体对与SPP1+巨噬细胞相互作用的新机制 | 需要进一步的实验验证 | 研究肺腺癌中细胞外基质相关癌症相关成纤维细胞的预后作用和治疗靶点价值 | 肺腺癌肿瘤样本和多个队列的转录组数据 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 机器学习 | 101种机器学习算法 | 单细胞RNA测序数据, 转录组数据 | 15个LUAD肿瘤样本，整合TCGA、GSE31210、GSE72094多队列数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组分析 | NA | NA |
| 1002 | 2025-10-06 |
Histopathologic Evaluation and Single-Cell Spatial Transcriptomics of the Colon Reveal Cellular and Molecular Abnormalities Linked to J-Pouch Failure in Patients with Inflammatory Bowel Disease
2025-Jan-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.27.635092
PMID:39974918
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研究论文 | 本研究通过组织病理学评估和单细胞空间转录组学分析结肠组织，揭示与炎症性肠病患者J型储袋失败相关的细胞和分子异常 | 首次结合组织病理学特征和单细胞空间转录组学技术系统分析J型储袋失败的预测因素和分子机制 | 回顾性研究设计，单细胞空间转录组学仅分析了部分患者亚群 | 探究与炎症性肠病患者J型储袋失败相关的组织病理学特征和分子机制 | 接受回肠储袋肛管吻合术(IPAA)的炎症性肠病患者 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞空间转录组学，组织病理学评估 | NA | 空间转录组数据，组织病理图像 | 417名患者队列，部分患者进行单细胞空间转录组分析 | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 1003 | 2025-10-06 |
The chromatin remodeler ADNP regulates neurodevelopmental disorder risk genes and neocortical neurogenesis
2025-Jan-21, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2405981122
PMID:39808658
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研究论文 | 本研究揭示了染色质重塑复合物ChAHP通过调控神经发育障碍风险基因和神经发生过程在脑发育中的关键作用 | 首次发现Adnp通过两步过程调控大脑皮层上层神经元生成：维持祖细胞增殖和调控神经元基因表达程序 | 研究主要基于小鼠模型，在人类中的直接相关性需要进一步验证 | 探究染色质重塑复合物ChAHP在神经发育和神经发育障碍中的作用机制 | 小鼠新皮层发育过程中的神经祖细胞和分化神经元 | 神经发育生物学 | 神经发育障碍 | 单细胞转录组学, cut&run-seq, 组织学方法 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 染色质结合数据, 组织图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1004 | 2025-10-06 |
Rational therapeutic targeting of myeloid cells in glioblastoma: challenges and perspectives
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1472710
PMID:40642066
|
综述 | 探讨胶质母细胞瘤中髓系细胞的异质性与可塑性，以及靶向治疗的前景与挑战 | 整合多组学、单细胞转录组学和空间多模态分析揭示脑髓系细胞多样性及其在肿瘤微环境中的调控机制 | NA | 阐述胶质母细胞瘤中髓系细胞的治疗靶向策略 | 胶质母细胞瘤中的髓系细胞（包括小胶质细胞、边界相关巨噬细胞和单核来源的胶质瘤相关巨噬细胞） | 肿瘤免疫学 | 胶质母细胞瘤 | 多组学分析, 单细胞转录组学, 空间多模态分析 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1005 | 2025-10-06 |
Integrated analysis of single-cell RNA-seq and spatial transcriptomics to identify the lactylation-related protein TUBB2A as a potential biomarker for glioblastoma in cancer cells by machine learning
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1601533
PMID:40642071
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学整合分析，结合机器学习识别乳酸化相关蛋白TUBB2A作为胶质母细胞瘤的潜在生物标志物 | 创新性地开发了基于四分位距的乳酸化筛选方法，并在单细胞分辨率下评估胶质母细胞瘤中的乳酸化活性 | 研究样本量有限，需要进一步扩大验证 | 阐明乳酸化在胶质母细胞瘤患者异质性和复发中的具体作用机制 | 胶质母细胞瘤癌细胞和组织 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 机器学习 | AUCell, UCell, 机器学习算法 | 基因表达数据, 空间转录组数据, 组织图像数据 | 人类胶质母细胞瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1006 | 2025-10-06 |
Enhancing fibroblast-epithelial cell communications: Serpine2 as a key molecule in Fusobacterium nucleatum-promoted colon cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1563922
PMID:40642075
|
研究论文 | 本研究通过整合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据，揭示了Fusobacterium nucleatum通过增强成纤维细胞-上皮细胞通讯促进结肠癌进展的分子机制 | 首次发现Serpine2作为Fn促进结肠癌进展和转移的关键分子标志物，并阐明了Fn通过增强成纤维细胞-巨噬细胞-上皮细胞相互作用促进癌症进展的新机制 | 研究样本量有限，需要更大规模的临床验证；机制研究仍需进一步深入 | 阐明Fusobacterium nucleatum促进结肠癌进展的分子机制 | 结肠癌组织样本、临床组织样本、体外共培养实验 | 生物信息学 | 结肠癌 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 机器学习算法, 体外共培养实验 | 三种机器学习算法 | RNA-seq数据, 临床数据 | 临床组织样本和外部数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1007 | 2025-10-06 |
Amplification of select autonomous HERV loci and surrounding host gene transcription in monocytes from patients with post-acute sequelae of COVID-19
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1621657
PMID:40642078
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现COVID-19后遗症患者单核细胞中特定自主HERV位点及其周围宿主基因转录的扩增 | 开发了基于窗口的HERV比对方法，首次在PASC患者单核细胞中鉴定出三个共同表达的HERV位点，并发现与邻近宿主基因的共扩增现象 | 样本量有限（12名PASC患者），仅分析了单核细胞数据，未涉及其他免疫细胞类型 | 研究COVID-19后遗症患者单核细胞中人类内源性逆转录病毒的激活模式 | COVID-19患者、流感患者、登革热患者、脓毒症患者和正常个体的单核细胞 | 基因组学 | COVID-19后遗症 | 单细胞RNA测序 | WHA（基于窗口的HERV比对方法） | 单细胞RNA测序数据 | 31名正常个体、多个COVID-19研究队列、12名PASC患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1008 | 2025-10-06 |
Multi-omics analysis reveals the role of ribosome biogenesis in malignant clear cell renal cell carcinoma and the development of a machine learning-based prognostic model
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1602898
PMID:40642093
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示核糖体生物发生在恶性透明细胞肾细胞癌中的作用，并开发基于机器学习的预后模型 | 首次系统整合bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq和空间转录组学数据，揭示核糖体生物发生在ccRCC中的关键作用，并构建了基于118种机器学习算法组合的预后模型 | 研究主要基于回顾性数据分析，需要进一步实验验证核糖体生物发生的具体分子机制 | 探究核糖体生物发生在ccRCC发病机制和预后中的作用，开发预后预测模型 | 透明细胞肾细胞癌患者和肿瘤组织 | 生物信息学, 机器学习 | 肾细胞癌 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, qRT-PCR, 代谢通量推断 | 机器学习算法组合 | 基因表达数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 | 内部和外部验证队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1009 | 2025-10-06 |
Conserved patterns of transcriptional dysregulation, heterogeneity, and cell states in clear cell kidney cancer
2025-01-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.115169
PMID:39792555
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学分析肾透明细胞癌的转录调控模式和细胞状态异质性 | 首次在肾透明细胞癌中系统识别保守的转录失调模式、上游调控因子及与转移潜能相关的14q染色体缺失的亚克隆转录后果 | 样本量相对有限（75例多区域活检），未涉及其他癌症类型的比较分析 | 解析肾透明细胞癌中肿瘤和基质细胞组分的转录程序及其与肿瘤异质性的关系 | 肾透明细胞癌肿瘤组织和正常肾脏组织 | 单细胞转录组学 | 肾癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 75例多区域活检样本（来自肾肿瘤和正常肾脏） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1010 | 2025-10-06 |
Targeting mitophagy in diabetic retinopathy: novel insights into SQSTM1/BNIP3L pathway regulated by luteolin
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1593213
PMID:40635752
|
研究论文 | 本研究探讨了木犀草素通过SQSTM1/BNIP3L通路激活线粒体自噬对糖尿病视网膜病变的保护作用 | 首次揭示木犀草素通过SQSTM1/BNIP3L通路激活线粒体自噬的新机制，并发现单核细胞活性与VISFATIN信号通路在DR进展中的新联系 | 木犀草素的确切分子机制仍未完全阐明 | 探索木犀草素治疗糖尿病视网膜病变的局部和全身免疫机制 | 糖尿病视网膜病变患者的PBMC和视网膜组织 | 生物医学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序,分子对接模拟,DCFDA测定,H&E染色,PAS染色,ELISA,免疫荧光,免疫组化,Western blotting | NA | 单细胞RNA测序数据,分子对接数据,蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1011 | 2025-10-06 |
Integrated single-cell and bulk RNA dequencing to identify and validate prognostic genes related to T Cell senescence in acute myeloid leukemia
2025, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2025.1606284
PMID:40635996
|
研究论文 | 通过整合单细胞和bulk RNA测序数据，识别并验证与急性髓系白血病中T细胞衰老相关的预后基因 | 首次结合单细胞RNA测序和bulk RNA测序数据，系统分析T细胞衰老相关基因在AML预后中的作用 | 研究依赖于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 探索T细胞衰老相关基因在急性髓系白血病进展中的作用并构建预后模型 | 急性髓系白血病患者和T细胞 | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, RT-qPCR | 风险模型, UMAP, 回归分析 | 基因表达数据, 生存数据 | TCGA-LAML队列和多个GEO数据集 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 1012 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome and multi-omics integration reveal ferroptosis-driven immune microenvironment remodeling in knee osteoarthritis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1608378
PMID:40636124
|
研究论文 | 通过单细胞转录组和多组学整合分析，揭示铁死亡驱动的免疫微环境重塑在膝骨关节炎中的作用 | 首次在单细胞分辨率下探索铁死亡与免疫功能障碍的相互作用，并鉴定出铁死亡活跃的稳态软骨细胞作为FGF介导滑膜炎和ECM重塑的关键枢纽 | 样本量相对有限（单细胞数据n=11，批量RNA-seq队列样本数较少），需要更大规模验证 | 解析膝骨关节炎中铁死亡驱动的免疫重塑机制并鉴定诊断生物标志物 | 膝骨关节炎患者的软骨细胞和免疫微环境 | 生物信息学 | 膝骨关节炎 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 生物信息学分析 | LASSO-SVM诊断模型 | 基因表达数据 | 单细胞数据11个样本，批量RNA-seq队列：GSE114007（20例KOA/18例对照），GSE246425（8例KOA/4例对照） | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1013 | 2025-10-06 |
Investigating the role of tumor cell heterogeneity and angiogenesis genes in the prognosis of multiple myeloma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1610833
PMID:40636123
|
研究论文 | 本研究通过整合转录组和单细胞RNA测序数据，探讨肿瘤细胞异质性和血管生成相关基因在多发性骨髓瘤预后中的作用 | 首次发现C1亚群中CREB3L2高表达与血管生成抑制及肿瘤细胞增殖迁移的关联，并构建了基于血管生成和转录因子的预后模型 | 研究依赖于公共数据库的回顾性数据，缺乏前瞻性验证 | 探索肿瘤细胞异质性和血管生成相关基因对多发性骨髓瘤预后的影响 | 多发性骨髓瘤患者 | 生物信息学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, CNV分析, 转录因子分析, 细胞通讯分析, 免疫浸润分析 | 预后预测模型 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1014 | 2025-10-06 |
A bibliometric analysis of studies related to the nuclear factor kappa B signaling pathway in knee osteoarthritis between 2004 and 2023
2025, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2025.1572161
PMID:40636390
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文献计量分析 | 对2004-2023年间核因子κB信号通路在膝骨关节炎研究中发表文献进行文献计量分析 | 首次系统分析NF-κB信号通路在膝骨关节炎领域的研究趋势和热点演变 | 缺乏实时可视化NF-κB活性的体内成像技术 | 识别NF-κB信号通路在膝骨关节炎研究中的主要领域和趋势 | 752篇相关研究文献 | 文献计量学 | 膝骨关节炎 | 文献计量分析 | NA | 文献数据 | 752篇研究文献 | NA | 单细胞转录组, 空间转录组 | NA | NA |
| 1015 | 2025-10-06 |
Delineation of single-cell Altas provides new insights for development of coronary artery lesions in Kawasaki disease: bad and good signaling molecules
2025, Frontiers in pediatrics
IF:2.1Q2
DOI:10.3389/fped.2025.1596643
PMID:40636515
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析川崎病冠状动脉病变患者的免疫细胞图谱，揭示疾病发展的分子机制 | 首次在单细胞水平系统描绘川崎病冠状动脉病变患者的免疫细胞图谱，发现SPI1和MT2A的表达异常与B细胞发育紊乱相关 | 样本量较小（仅12个样本），缺乏独立验证队列 | 探索川崎病冠状动脉病变发展的分子机制 | 川崎病患者的周围血单核细胞 | 单细胞组学 | 川崎病 | 单细胞RNA测序 | 伪时间分析，细胞通讯分析 | 单细胞RNA测序数据 | 12个样本（3组KD非CAL患者治疗前后，3组KD CAL患者治疗前后） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1016 | 2025-10-06 |
Identification of Shared Biomarkers in Chronic Kidney Disease and Diabetic Nephropathy Using Single-Cell Sequencing
2025, Diabetes, metabolic syndrome and obesity : targets and therapy
DOI:10.2147/DMSO.S514319
PMID:40636753
|
研究论文 | 通过单细胞测序技术识别慢性肾脏病和糖尿病肾病的共享生物标志物 | 首次在单细胞水平系统比较CKD和DN的共享生物标志物，发现MX1、IRF7、STAT1和ISG15在两种疾病中的共同表达特征 | 样本量较小（仅9例），仅使用血液样本而未包含肾脏组织样本 | 识别慢性肾脏病和糖尿病肾病的共享生物标志物，探索其诊断和治疗潜力 | 人类血液样本中的免疫细胞 | 单细胞组学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | 差异表达分析，蛋白质相互作用网络分析 | 单细胞转录组数据 | 9例人类血液样本（3例对照，3例CKD，3例DN） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1017 | 2025-10-06 |
SeuratExtend: streamlining single-cell RNA-seq analysis through an integrated and intuitive framework
2025-Jan-06, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giaf076
PMID:40627366
|
研究论文 | 介绍SeuratExtend——一个基于Seurat框架构建的综合性R软件包，通过整合关键工具和数据库来简化单细胞RNA测序数据分析 | 在广泛采用的Seurat框架基础上构建，通过统一R接口整合多种Python工具和数据库，提供优化的可视化功能和精心设计的配色方案 | NA | 开发一个集成化、直观的单细胞RNA测序数据分析框架 | 单细胞RNA测序数据分析工具和数据库 | 生物信息学 | 肿瘤相关疾病，自身炎症性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1018 | 2025-10-06 |
Molecular insights into glioblastoma progression: role of CHCHD2P9 in tumor heterogeneity and prognosis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1581850
PMID:40630954
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现CHCHD2P9是胶质母细胞瘤终末亚群的关键标志物，其高表达与不良预后相关 | 首次发现CHCHD2P9在胶质瘤进展中的关键作用，并建立基于CHCHD2P9的风险预后模型 | 未明确说明样本具体数量，机制研究可能不够深入 | 探究胶质母细胞瘤异质性及预后相关分子机制 | 胶质母细胞瘤亚群细胞 | 数字病理学 | 脑癌/胶质瘤 | 单细胞RNA测序, 细胞实验, 流式细胞术 | 风险预后模型 | 单细胞RNA测序数据, 实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1019 | 2025-10-06 |
Immunogenic cell death-related biomarkers in heart failure probed by transcriptome and single-cell sequencing
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1560903
PMID:40630963
|
研究论文 | 本研究通过转录组和单细胞测序识别并验证了心力衰竭中三个免疫原性细胞死亡相关生物标志物 | 首次系统识别并验证了心力衰竭中CD163、FPR1和VSIG4这三个免疫原性细胞死亡相关生物标志物 | 研究主要基于公共数据库数据，需要更多实验验证 | 识别心力衰竭中免疫原性细胞死亡相关生物标志物并探索其机制 | 心力衰竭患者和动物模型 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, 实时定量PCR | 机器学习, 加权基因共表达网络分析 | 基因表达数据 | 多个GEO数据集(GSE57338、GSE3586、GSE5406、GSE183852) | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 1020 | 2025-10-06 |
Taurine-mediated metabolic immune crosstalk indicates and promotes immunosuppression with anti-PD-1 resistance in bladder cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1618439
PMID:40630945
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和批量转录组分析，揭示了膀胱癌中牛磺酸代谢失调如何重塑肿瘤微环境并驱动免疫抑制 | 开发了牛磺酸代谢失调指数(TMs)作为预后生物标志物，揭示了牛磺酸代谢通过Notch信号和EGFR通路促进免疫抑制的新机制 | 研究主要基于计算分析和体外共培养验证，需要进一步的体内实验验证 | 阐明牛磺酸代谢在膀胱癌免疫抑制中的作用机制，为免疫治疗提供新靶点 | 膀胱癌患者样本和肿瘤微环境中的各类细胞 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量转录组分析, 共培养系统 | 机器学习, 生存模型 | 基因表达数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 | TCGA队列患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |