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当前共找到 2177 篇文献，本页显示第 981 - 1000 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 981 | 2025-10-06 |
Unraveling NK cell heterogeneity through single-cell sequencing: insights from physiological and tumor contexts for clinical applications
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1612352
PMID:40761786
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综述 | 通过单细胞测序技术解析NK细胞的异质性，探讨其在生理和肿瘤环境中的特征及临床应用前景 | 系统阐述单细胞测序技术在揭示NK细胞异质性方面的应用，分析肿瘤微环境中NK细胞的动态变化及治疗响应机制 | NA | 探讨NK细胞异质性机制及其在肿瘤免疫治疗中的临床应用价值 | 自然杀伤细胞（NK细胞） | 单细胞生物学 | 肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 982 | 2025-10-06 |
Integrated multi-omics analysis and machine learning identify G protein-coupled receptor-related signatures for diagnosis and clinical benefits in soft tissue sarcoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1561227
PMID:40761790
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研究论文 | 本研究通过整合多组学分析和机器学习方法，构建了软组织肉瘤中G蛋白偶联受体相关特征的诊断和预后预测模型 | 首次在单细胞和bulk RNA-seq水平结合12种机器学习算法及其127种组合，构建了GPR相关特征的诊断和预后预测模型 | 研究依赖于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 开发软组织肉瘤的诊断和预后预测工具 | 软组织肉瘤患者 | 机器学习 | 软组织肉瘤 | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 多组学分析 | Stepglm+Enet, 机器学习集成框架 | 基因表达数据 | 基于TCGA和GEO数据库的样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 983 | 2025-10-06 |
Analysis of immune characteristics and inflammatory mechanisms in COPD patients: a multi-layered study combining bulk and single-cell transcriptome analysis and machine learning
2025, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2025.1592802
PMID:40761855
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研究论文 | 通过整合bulk和单细胞转录组分析与机器学习方法，研究COPD患者的免疫特征和炎症机制 | 首次结合bulk和单细胞转录组数据，利用机器学习算法筛选COPD炎症相关特征基因，并发现肉桂醛可能靶向CXCL8蛋白发挥抗炎作用 | 研究基于公共数据库数据，缺乏实验验证；样本来源有限 | 探讨炎症基因在COPD中的潜在作用和机制 | COPD患者和正常个体的气道上皮组织 | 生物信息学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 转录组测序，单细胞RNA-seq，分子对接，分子动力学模拟 | Lasso回归，随机森林 | 基因表达数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 984 | 2025-10-06 |
Resolving Resident Colonic Muscularis Macrophage Diversity and Plasticity During Colitis
2025-01-06, Inflammatory bowel diseases
IF:4.5Q1
DOI:10.1093/ibd/izae155
PMID:39102823
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序解析了结肠炎期间结肠肌层巨噬细胞的多样性和可塑性 | 首次在单细胞水平揭示了结肠肌层巨噬细胞在生理和结肠炎状态下的转录组特征，发现Lyve1+巨噬细胞亚群在结肠炎期间消失而Cx3cr1+巨噬细胞保留并表现炎症可塑性 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 解析结肠炎期间肠道肌层免疫细胞群的异质性和动态变化 | 结肠肌层巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学，流式细胞术，细胞谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据，流式数据 | 正常结肠和葡聚糖硫酸钠诱导的结肠炎模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 985 | 2025-10-06 |
FlyRNAi.org 2025 update-expanded resources for new technologies and species
2025-Jan-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae917
PMID:39435987
|
研究论文 | 介绍FlyRNAi数据库2025年更新，扩展了支持新技术和物种的资源 | 新增单细胞转录组学数据挖掘分析资源，将CRISPR试剂和基因中心生物信息学方法应用于传染病节肢动物载体 | NA | 支持功能基因组学研究，促进生物和生物医学理解 | 果蝇、节肢动物载体、常见遗传模型物种、人类生物学 | 生物信息学 | 传染病 | RNAi筛选、CRISPR、单细胞转录组学 | NA | 组学数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 986 | 2025-10-06 |
Construction of a New Ferroptosis-related Prognosis Model for Survival Prediction in Colorectal Cancer
2025, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 本研究构建了一个基于11个铁死亡相关基因的预后模型，用于结直肠癌患者的生存预测 | 首次结合单细胞RNA测序和转录组数据分析铁死亡相关基因在结直肠癌中的预后价值，并开发了11基因特征模型 | 研究依赖于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 开发结直肠癌的铁死亡相关基因预后特征并探索其分子功能 | 结直肠癌患者样本 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 转录组测序, ssGSEA, WGCNA, Cox回归分析 | 预后预测模型, 列线图 | 基因表达数据, 临床数据 | 来自GSE161277、GSE17537和TCGA-CRC数据库的结直肠癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 987 | 2025-10-06 |
Role of pericytes in regulating penile angiogenesis and nerve regeneration
2025-01-01, Asian journal of andrology
IF:3.0Q1
DOI:10.4103/aja202455
PMID:39162179
|
综述 | 本文综述了周细胞在阴茎血管生成和神经再生中的作用及其与勃起功能障碍的关系 | 首次系统分析周细胞在糖尿病性和神经性勃起功能障碍中的具体作用机制 | 主要基于文献综述，缺乏原始实验数据验证 | 分析周细胞在勃起功能障碍中的具体作用机制 | 周细胞在阴茎组织中的功能 | 病理生理学 | 勃起功能障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 文献数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 988 | 2025-10-06 |
Uncovering plaque-glia niches in human Alzheimer's disease brains using spatial transcriptomics
2025, Molecular neurodegeneration advances
DOI:10.1186/s44477-025-00002-z
PMID:40740481
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术揭示人类阿尔茨海默病脑中斑块-胶质细胞微环境的分子特征 | 首次在人类AD脑组织中系统描绘斑块-胶质细胞微环境的空间转录组特征，并整合多组学数据验证胶质细胞反应 | 样本来源于死后脑组织，可能无法完全反映疾病过程中的动态变化 | 解析阿尔茨海默病中斑块与胶质细胞相互作用的分子机制 | 人类阿尔茨海默病患者脑组织样本和iPSC来源的细胞培养模型 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学, 免疫组织化学, 单核RNA测序, 单细胞RNA测序, 基因集富集分析 | NA | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 组织图像数据 | 21名个体的78个死后脑切片 | NA | 空间转录组学, 单核RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 989 | 2025-10-06 |
Deciphering the role of SEMA4A/MAPK signaling in sepsis: insights from Mendelian randomization, transcriptomic, single-cell sequencing analyses, and vitro experiments
2025, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2025.1606509
PMID:40756031
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研究论文 | 通过孟德尔随机化、转录组学、单细胞测序分析和体外实验，揭示SEMA4A/MAPK信号通路在脓毒症发病机制中的关键作用 | 首次结合孟德尔随机化与多组学分析鉴定脓毒症核心基因，并通过单细胞测序明确其在单核细胞中的特异性表达 | 研究主要基于公共数据库和体外细胞实验，缺乏体内动物模型验证 | 探索脓毒症的新治疗靶点 | 脓毒症患者转录组数据和THP-1人单核细胞 | 生物信息学 | 脓毒症 | 转录组测序,单细胞RNA测序,孟德尔随机化分析,体外实验 | 差异表达分析,富集分析,细胞模型 | 基因表达数据,单细胞测序数据 | 3个独立脓毒症患者转录组数据集 | NA | 单细胞RNA测序,转录组测序 | NA | NA |
| 990 | 2025-10-06 |
To explore the potential of LOXL2 as a biomarker in glioma and construct a genomic integrated clinical prognostic model
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1602475
PMID:40756111
|
研究论文 | 本研究探索LOXL2作为胶质瘤生物标志物的潜力并构建基因组整合的临床预后模型 | 首次系统评估LOXL2在胶质瘤中的生物学功能及其与患者预后的潜在关联，构建了基于LOXL2的预后预测模型 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步实验验证LOXL2的具体分子机制 | 为改善胶质瘤诊疗策略提供新的理论基础 | 胶质瘤患者和LOXL2基因 | 生物信息学 | 胶质瘤 | 生物信息学分析，单细胞RNA测序，GO/KEGG通路分析，免疫浸润分析 | COX回归，KM生存分析，列线图，决策曲线分析 | 基因组数据，临床数据，单细胞测序数据 | CCGA探索队列和TCGA验证队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 991 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing using split-pool barcoding reveals transcriptional heterogeneity in Porphyromonas gingivalis with implications for periodontal pathogenesis
2025, Journal of oral microbiology
IF:3.7Q2
DOI:10.1080/20002297.2025.2540827
PMID:40756339
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研究论文 | 本研究首次通过单细胞RNA测序揭示了牙龈卟啉单胞菌的转录异质性 | 首次在单细胞水平绘制牙龈卟啉单胞菌转录图谱，发现具有功能意义的稀有亚群 | 仅使用W83菌株在厌氧条件下培养，未涵盖其他菌株或体内环境 | 探究牙龈卟啉单胞菌在单细胞水平的转录异质性及其与牙周病发病机制的关系 | 牙龈卟啉单胞菌W83菌株 | 单细胞转录组学 | 牙周病 | 单细胞RNA测序 | 聚类分析，差异表达分析 | 单细胞基因表达数据 | 1,942个牙龈卟啉单胞菌细胞 | NA | split-pool barcoding单细胞RNA测序 | NA | split-pool barcoding技术 |
| 992 | 2025-10-06 |
New insights into acute ischemic stroke from the perspective of spatial omics
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.113396
PMID:40756344
|
综述 | 从空间单细胞组学角度总结急性缺血性脑卒中后不同细胞类型在时空分布中的生物学功能和相互作用机制 | 首次从空间单细胞组学视角系统阐述急性缺血性脑卒中后中枢驻留细胞与外周免疫细胞亚群在时空分布中的动态互作机制 | NA | 理解急性缺血性脑卒中后复杂细胞间相互作用机制，为精准干预提供理论基础 | 小胶质细胞、星形胶质细胞、少突胶质细胞及其亚群、浸润外周免疫细胞 | 空间转录组学 | 急性缺血性脑卒中 | 空间转录组技术 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 993 | 2025-10-06 |
Analysis of histone modifications in key cellular subpopulations in the context of azoospermia using spermatogenic single-cell RNA-seq data
2025, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2025.1626153
PMID:40756901
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序数据分析非梗阻性无精子症中关键细胞亚群的组蛋白修饰作用 | 首次在单细胞水平揭示NOA患者睾丸组织中特定细胞亚群（如Leydig细胞、PTM细胞和巨噬细胞）的组蛋白修饰相关基因异常表达 | 研究基于公共数据库数据，样本来源有限；未进行实验验证组蛋白修饰的功能机制 | 探究非梗阻性无精子症的分子机制，特别关注组蛋白修饰在疾病进展中的作用 | 非梗阻性无精子症患者和对照组的睾丸组织细胞 | 单细胞转录组学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序 | AUCell, CellChat | 单细胞RNA测序数据 | 来自GEO数据库GSE149512数据集的样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 994 | 2025-10-06 |
Integrated analysis of single-cell and bulk transcriptomic data reveals altered cellular composition and predictive cell types in ectopic endometriosis
2025, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2025.1641982
PMID:40757199
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研究论文 | 通过整合单细胞和批量转录组数据分析，揭示了子宫内膜异位症的细胞组成变化和关键预测细胞类型 | 首次通过整合单细胞和批量转录组数据识别MUC5B+上皮细胞和dStromal晚期间充质细胞作为子宫内膜异位症纤维化和炎症的双重驱动因子 | 依赖公共数据库数据，样本来源可能有限 | 研究子宫内膜异位症的细胞分类和组成，探索其诊断和治疗新方法 | 子宫内膜异位症患者的组织样本 | 生物信息学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序，批量转录组测序，免疫组织化学 | 随机森林 | 基因表达数据，图像数据 | GEO公共数据库中的样本，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 995 | 2025-10-06 |
TIME-CoExpress: Temporal Trajectory Modeling of Dynamic Gene Co-expression Patterns Using Single-Cell Transcriptomics Data
2025-Jan-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.23.634392
PMID:39896591
|
研究论文 | 提出一种基于copula的方法来建模单细胞转录组数据中基因共表达模式沿细胞时间轨迹的非线性变化 | 使用数据驱动的平滑函数建模基因共表达的非线性变化，能够处理scRNAseq数据中的过度离散和零膨胀特征 | 仅通过模拟分析和单个数据集验证方法性能，需要更多真实数据验证 | 开发时序轨迹建模方法以识别细胞发育过程中差异共表达的基因组合 | 单细胞转录组数据中的基因共表达模式 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | copula模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 996 | 2025-10-06 |
SeqBMC: Single-cell data processing using iterative block matrix completion algorithm based on matrix factorisation
2025 Jan-Dec, IET systems biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1049/syb2.70003
PMID:39943646
|
研究论文 | 提出基于矩阵分解的迭代块矩阵补全算法SeqBMC，用于处理单细胞RNA测序数据中的缺失值 | 使用基因频率对矩阵分块，通过矩阵分解算法完成分块后的小矩阵，同时保留块矩阵中可能存在的生物零值 | NA | 改进单细胞RNA测序数据中基因表达矩阵的缺失值补全方法 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达矩阵 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 矩阵分解算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 997 | 2025-10-06 |
Analysis of the Relationship Between NLRP3 and Alzheimer's Disease in Oligodendrocytes based on Bioinformatics and In Vitro Experiments
2025, Current Alzheimer research
IF:1.8Q4
|
研究论文 | 通过生物信息学分析和体外实验验证NLRP3在少突胶质细胞中与阿尔茨海默病的关联 | 首次结合生物信息学与分子生物学实验系统研究NLRP3在少突胶质细胞中与AD的关联，并构建了基于五个关键基因的诊断模型 | 研究主要基于公共数据库数据，需要进一步在体实验验证 | 探索NLRP3在少突胶质细胞中与阿尔茨海默病的潜在关联 | 阿尔茨海默病患者与健康对照的基因表达数据，少突胶质细胞 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 生物信息学分析，单细胞转录组学，RT-qPCR，免疫荧光，Western blot | LASSO回归，随机森林，支持向量机 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的AD相关公共数据集 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 998 | 2025-10-06 |
scRSSL: Residual semi-supervised learning with deep generative models to automatically identify cell types
2025 Jan-Dec, IET systems biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1049/syb2.12107
PMID:40261690
|
研究论文 | 提出基于残差半监督学习的深度生成模型scRSSL，用于自动识别单细胞转录组数据中的细胞类型 | 首次将残差网络引入半监督生成模型，通过残差神经网络提取单细胞数据的局部特征 | NA | 解决单细胞数据高维度、大样本量、高稀疏性和样本不平衡等挑战，实现准确的细胞类型识别 | 单细胞转录组测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度残差生成模型, 半监督学习 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 999 | 2025-10-06 |
SAE1 May Play a Pro-Carcinogenic Role in Pancreatic Adenocarcinoma: A Comprehensive Study Integrating Multiple Pieces of Evidence
2025 Jan-Dec, IET systems biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1049/syb2.70017
PMID:40302186
|
研究论文 | 本研究通过整合多种证据探讨SAE1在胰腺腺癌中的促癌作用 | 首次在胰腺腺癌中系统研究SAE1的作用，整合了mRNA数据、免疫组化、CRISPR修饰细胞系分析和单细胞RNA测序等多种方法 | 未明确说明样本量大小和研究人群特征 | 评估SAE1在胰腺腺癌发生发展中的作用机制 | 胰腺腺癌细胞系和临床样本 | 癌症生物学 | 胰腺癌 | mRNA分析,免疫组化,CRISPR,单细胞RNA测序,ChIP-Seq,分子对接 | 分子对接模型 | mRNA数据,蛋白质表达数据,单细胞测序数据,临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,ChIP-Seq | NA | NA |
| 1000 | 2025-10-06 |
Exploring Key Genes of Glutathione Metabolism in Systemic Lupus Erythematosus Based on Mendelian Randomisation, Single-Cell RNA Sequencing and Multiple Machine Learning Approaches
2025 Jan-Dec, IET systems biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1049/syb2.70021
PMID:40458850
|
研究论文 | 通过孟德尔随机化、单细胞RNA测序和多种机器学习方法探索系统性红斑狼疮中谷胱甘肽代谢的关键基因 | 首次整合孟德尔随机化、单细胞RNA测序和多种机器学习方法系统性研究谷胱甘肽代谢在系统性红斑狼疮中的作用 | NA | 识别与系统性红斑狼疮相关的关键代谢物和基因，揭示谷胱甘肽通路的作用机制 | 系统性红斑狼疮患者的外周血单个核细胞和单核细胞 | 生物信息学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 机器学习 | LASSO回归, CatBoost, XGBoost, NGBoost | 基因表达数据, 代谢组数据 | 多个数据集（包括训练集、验证集和GSE112087数据集） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |