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当前共找到 2164 篇文献，本页显示第 981 - 1000 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 981 | 2025-10-06 |
Evolution of a SHOOTMERISTEMLESS transcription factor binding site promotes fruit shape determination
2025-01, Nature plants
IF:15.8Q1
DOI:10.1038/s41477-024-01854-1
PMID:39668212
|
研究论文 | 本研究通过活细胞成像和单细胞RNA测序揭示了荠菜果实形状决定机制 | 发现单个顺式调控元件的独立进化决定了果实形状转变 | 研究主要集中于十字花科植物，在其他植物中的普适性有待验证 | 探究器官形态建成的分子机制 | 荠菜果实发育过程 | 植物发育生物学 | NA | 全器官活细胞成像,单细胞RNA测序 | NA | 图像,单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 982 | 2025-10-06 |
Linking tumor immune infiltration to enhanced longevity in recurrence-free breast cancer
2025-Jan, ESMO open
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.esmoop.2024.104109
PMID:39765189
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研究论文 | 本研究探讨了B细胞/免疫球蛋白基因特征与乳腺癌患者生存期的关系 | 首次发现14基因IGG特征与乳腺癌患者死亡风险降低41%-47%显著相关，并识别出其中7个关键基因与B细胞/T细胞克隆性密切相关 | 研究基于回顾性数据分析，需要前瞻性研究验证 | 探究肿瘤免疫浸润与乳腺癌患者长期生存的关系 | 9638名乳腺癌患者 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 空间GeoMx分析，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据，临床数据 | 9638名乳腺癌患者（来自三个数据集） | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 983 | 2025-10-06 |
Accurate identification of single-cell types via correntropy-based Sparse PCA combining hypergraph and fusion similarity
2025, Journal of applied statistics
IF:1.2Q2
DOI:10.1080/02664763.2024.2369955
PMID:39926175
|
研究论文 | 提出一种基于相关熵的稀疏PCA结合超图和融合相似度的单细胞类型识别新方法CHLSPCA | 创新性地将相关熵与PCA结合处理scRNA-seq数据中的噪声和异常值，并整合超图结构提取局部信息，同时引入高斯核函数和欧氏度量挖掘细胞间相似性信息 | NA | 解决单细胞RNA测序数据的高维度和噪声问题，提高细胞聚类准确性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | PCA, 稀疏PCA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 984 | 2025-10-06 |
Cell-specific transcriptional signatures of vascular cells in Alzheimer's disease: perspectives, pathways, and therapeutic directions
2025-Jan-29, Molecular neurodegeneration
IF:14.9Q1
DOI:10.1186/s13024-025-00798-0
PMID:39876020
|
综述 | 本文综述了阿尔茨海默病中脑血管细胞特异性转录特征及其治疗前景 | 整合单细胞转录组学研究揭示AD脑血管细胞特异性转录特征及细胞间通讯异常 | 基于已发表文献的综述，未包含新的实验数据 | 探讨阿尔茨海默病中脑血管细胞的转录特征及潜在治疗方向 | 人脑尸检组织中的脑血管细胞（内皮细胞、壁细胞等）及其亚型 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序,单核RNA测序,空间转录组学 | NA | 转录组数据,神经影像数据,神经病理数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 985 | 2025-10-06 |
Organ-specific microenvironments drive divergent T cell evolution in acute graft-versus-host disease
2025-Jan-29, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.ads1298
PMID:39879321
|
研究论文 | 本研究通过非人灵长类动物模型探索急性移植物抗宿主病中组织特异性T细胞免疫反应的机制 | 首次在aGVHD模型中系统揭示不同器官微环境驱动T细胞转录程序分化的机制，证明这种分化与抗原特异性无关 | 研究基于非人灵长类动物模型，结果向人类临床转化的有效性需要进一步验证 | 探究组织特异性微环境在急性移植物抗宿主病中对T细胞编程的影响机制 | 非人灵长类动物急性移植物抗宿主病模型中的组织浸润T细胞 | 系统免疫学 | 移植物抗宿主病 | 多参数流式细胞术, 转录组分析, 单细胞RNA测序, TCR测序 | NA | 单细胞转录组数据, TCR序列数据, 流式细胞数据 | 非人灵长类动物aGVHD模型 | NA | 单细胞RNA测序, TCR测序 | NA | NA |
| 986 | 2025-10-06 |
Transformer-based modeling of Clonal Selection and Expression Dynamics reveals resistance mechanisms in breast cancer
2025-Jan-10, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-024-00485-8
PMID:39794360
|
研究论文 | 提出一种基于Transformer的深度学习模型TraCSED，用于分析乳腺癌中克隆选择和基因表达动态，揭示耐药机制 | 开发了首个基于Transformer的动态深度学习方法来建模克隆选择过程，能够识别与克隆选择相关的可解释基因程序及其时间动态 | 仅针对乳腺癌特定治疗药物进行研究，未验证在其他癌症类型或治疗方案的普适性 | 研究癌症细胞转录异质性及其对治疗反应的影响，识别耐药机制 | 乳腺癌细胞系，使用giredestrant（选择性ER拮抗剂和降解剂）或palbociclib（CDK4/6抑制剂）处理的细胞 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，克隆条形码技术 | Transformer | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 987 | 2025-10-06 |
CSI-GEP: A GPU-based unsupervised machine learning approach for recovering gene expression programs in atlas-scale single-cell RNA-seq data
2025-Jan-08, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2024.100739
PMID:39788105
|
研究论文 | 开发了一种基于GPU的无监督机器学习方法CSI-GEP，用于从大规模单细胞RNA测序数据中恢复基因表达程序 | 提出首个基于GPU的无监督学习方法，能够在大规模单细胞RNA测序数据中一致且可扩展地推断基因表达程序 | 未详细说明参数选择的具体方法，且仅在小鼠脑图谱和人类肿瘤数据集上验证 | 开发可扩展的无监督学习方法以更好地分析单细胞RNA测序数据 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达程序 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 无监督机器学习 | 基因表达数据 | 220万个小鼠脑细胞及人类肿瘤和细胞系数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 988 | 2025-10-06 |
Hypoxia-inducible factor 2 regulates alveolar regeneration after repetitive injury in three-dimensional cellular and in vivo models
2025-Jan-08, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adk8623
PMID:39772774
|
研究论文 | 本研究通过三维细胞和体内模型揭示了缺氧诱导因子2在重复损伤后肺泡再生中的调控作用 | 首次发现HIF2信号通路在异常上皮细胞中的持续激活，并证明靶向抑制HIF2可促进功能性肺泡修复 | 研究主要基于动物模型和类器官，需要进一步验证在人类患者中的效果 | 探究特发性肺纤维化中异常上皮细胞出现和持续存在的机制 | IPF患者、小鼠模型、小鼠肺泡类器官、人远端肺类器官 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序, 遗传谱系追踪 | NA | 基因表达数据 | IPF患者和小鼠模型的单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 989 | 2025-10-06 |
A single-cell compendium of human cerebrospinal fluid identifies disease-associated immune cell populations
2025-Jan-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI177793
PMID:39744938
|
研究论文 | 通过整合公共数据集和自身研究，构建了包含139名受试者的人类脑脊液单细胞转录组图谱，揭示了神经系统疾病相关的免疫细胞群体 | 发现了CSF中特有的AREG+树突状细胞新亚群，并在多发性硬化症患者中更为丰富 | 研究主要基于现有数据集整合，可能受到原始数据质量和一致性的限制 | 建立脑脊液免疫细胞的单细胞转录组参考图谱，用于神经系统疾病研究 | 人类脑脊液和血液样本中的免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | 数据整合分析 | 单细胞转录组数据 | 139名受试者，包含135份脑脊液样本和58份血液样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 990 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA Sequencing before and after Light Chain Escape Reveals Intrapatient Multiple Myeloma Subpopulations with Divergent Osteolytic Gene Expression
2025-01-01, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-24-0170
PMID:39699274
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究多发性骨髓瘤患者轻链逃逸现象，揭示与骨溶解基因表达相关的肿瘤亚群 | 首次在单细胞水平追踪轻链逃逸现象，发现LAMP5过表达与骨溶解风险的新关联 | 研究基于单个患者的纵向样本，样本量有限 | 理解多发性骨髓瘤中轻链逃逸现象的分子机制和临床意义 | 多发性骨髓瘤患者骨髓活检样本 | 单细胞组学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序，药物敏感性测试，拷贝数变异推断 | NA | 单细胞转录组数据，临床血清数据 | 1名患者在诊断时、首次复发和复发/难治时间点的系列骨髓活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 991 | 2025-10-06 |
Graph-Based 3-Dimensional Spatial Gene Neighborhood Networks of Single Cells in Gels and Tissues
2025, BME frontiers
IF:5.0Q1
DOI:10.34133/bmef.0110
PMID:40084126
|
研究论文 | 开发了3D空间基因邻域网络嵌入方法，用于识别亚细胞基因邻近关系和细胞间通讯中的关键亚细胞模式 | 结合3D成像空间转录组学和图深度学习，首次在三维空间中分析亚细胞基因邻近关系 | 三维空间数据复杂度增加，需要新的分析方法，未明确说明样本量大小 | 识别亚细胞基因邻近关系和细胞间通讯中的关键亚细胞模式 | 间充质干细胞、外周血单核细胞、小鼠下丘脑和皮层中的星形胶质细胞与神经元 | 空间转录组学 | NA | 3D成像空间转录组学、多重误差鲁棒荧光原位杂交(MERFISH) | 图自编码器 | 3D空间转录组数据、图像数据 | NA | NA | 空间转录组学、3D成像 | NA | NA |
| 992 | 2025-10-06 |
Comprehensive sequencing of the lung neuroimmune landscape in response to asthmatic induction
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1518771
PMID:40181989
|
研究论文 | 本研究通过多组学测序技术全面解析哮喘诱导下肺神经免疫图谱的转录组变化 | 首次结合单核RNA测序与空间转录组学揭示哮喘诱导下迷走神经节和肺组织中神经免疫转录组的细胞簇特异性及空间分布特征 | 研究仅使用小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探究哮喘诱导如何改变肺神经免疫转录组 | 小鼠迷走神经节（结状/颈静脉神经节）和肺组织 | 空间转录组学 | 哮喘 | RNA测序, 单核RNA测序, 空间RNA测序 | NA | 转录组数据 | 初始状态和经链格孢诱导的哮喘小鼠模型 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学, 标准RNA测序 | NA | NA |
| 993 | 2025-10-06 |
Robust Cluster Prediction Across Data Types Validates Association of Sex and Therapy Response in GBM
2025-Jan-28, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17030445
PMID:39941811
|
研究论文 | 利用稳健集成机器学习构建跨数据类型的预测模型，验证胶质母细胞瘤中性别与治疗反应的关联 | 使用注释的“遗留数据”训练能够跨平台（包括RNA-seq和潜在scRNA-seq）进行多目标预测的稳健模型 | 预测特征集仅对女性患者有效，应用于男性患者产生意外结果 | 验证胶质母细胞瘤中性别特异性分型与治疗反应的关联 | 胶质母细胞瘤患者 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | 基因微阵列，RNA-seq，scRNA-seq | 稳健集成机器学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 基因微阵列，RNA-seq，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 994 | 2025-10-06 |
Low fucosylation defines the glycocalyx of progenitor cells and melanocytes in the human limbal stem cell niche
2025-01-14, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2024.11.008
PMID:39706176
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研究论文 | 本研究揭示了人角膜缘干细胞微环境中祖细胞和黑色素细胞糖萼的低岩藻糖基化特征 | 首次发现角膜缘祖细胞和黑色素细胞表面存在特异性低岩藻糖基化特征，并证明岩藻糖基化调控对干细胞增殖潜能的重要影响 | 研究主要基于体外实验，需要进一步验证在体内环境中的生理意义 | 探索成人干细胞糖萼的独特组成及其在干细胞自我更新和分化中的调控作用 | 人角膜缘上皮细胞、毛囊上皮和睑板腺导管基底细胞 | 细胞生物学 | 眼科疾病 | 荧光激活细胞分选,单细胞转录组学 | NA | 流式细胞数据,转录组数据 | 人角膜缘组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 995 | 2025-10-06 |
Robust single-nucleus RNA sequencing reveals depot-specific cell population dynamics in adipose tissue remodeling during obesity
2025-Jan-13, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.97981
PMID:39804687
|
研究论文 | 开发了一种稳健的单核RNA测序技术，用于研究肥胖期间脂肪组织重塑中的细胞群体动态 | 提出了一种适用于多种组织类型的核分离技术，显著提高了snRNA-seq数据质量，并首次通过整合bulk核RNA-seq识别了按大小和功能分类的脂肪细胞亚群 | 研究主要基于小鼠模型，技术在不同组织类型中的普适性需要进一步验证 | 研究肥胖过程中脂肪组织重塑的细胞动力学机制 | 小鼠脂肪组织中的各种细胞类型，特别是脂肪细胞亚群 | 单细胞测序 | 肥胖 | 单核RNA测序(snRNA-seq), bulk核RNA-seq | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单核RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 996 | 2025-10-06 |
Deep topic modeling of spatial transcriptomics in the rheumatoid arthritis synovium identifies distinct classes of ectopic lymphoid structures
2025-Jan-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.08.631928
PMID:39829741
|
研究论文 | 开发DeepTopics方法分析类风湿关节炎滑膜空间转录组数据，识别异位淋巴结构的细胞组成和微环境特征 | 提出基于狄利克雷变分自编码器的无参考解卷积方法DeepTopics，首次在类风湿关节炎滑膜中发现两种不同的异位淋巴结构细胞模式 | 仅分析6名患者的8个滑膜组织样本，样本量有限 | 研究类风湿关节炎滑膜中细胞类型相互作用和微环境对细胞状态的影响 | 类风湿关节炎患者的滑膜组织和异位淋巴结构 | 空间转录组学 | 类风湿关节炎 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | 狄利克雷变分自编码器 | 空间转录组数据 | 6名患者的8个滑膜组织样本 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 997 | 2025-10-06 |
scProAtlas: an atlas of multiplexed single-cell spatial proteomics imaging in human tissues
2025-Jan-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae990
PMID:39526396
|
研究论文 | 构建了一个名为scProAtlas的多重单细胞空间蛋白质组学成像图谱数据库 | 开发了首个整合多种空间蛋白质组学技术的综合性功能注释知识库，包含近1,750万个细胞的详细空间信息 | 与空间转录组学相比，空间蛋白质组学检测的蛋白质数量有限 | 帮助用户全面理解不同组织类型在单细胞分辨率和多尺度下的空间背景 | 人类组织中的细胞空间分布 | 数字病理学 | NA | 空间蛋白质组学成像 | NA | 空间蛋白质组学图像数据 | 17,468,394个细胞，来自15种组织的945个感兴趣区域 | NA | 空间蛋白质组学成像 | NA | 八种空间蛋白质成像技术 |
| 998 | 2025-10-06 |
Spatial Expression of Long Non-Coding RNAs in Human Brains of Alzheimer's Disease
2025-Jan-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.27.620550
PMID:39554066
|
研究论文 | 通过空间转录组学分析阿尔茨海默病患者大脑中长链非编码RNA的空间表达模式 | 首次系统绘制人类大脑中lncRNA的空间表达图谱，发现lncRNA比mRNA具有更强的亚区域特异性表达 | 样本量相对有限（78个脑切片，21名参与者），仅分析前额叶皮层区域 | 探索长链非编码RNA在阿尔茨海默病发病机制中的空间表达和功能作用 | ROSMAP研究参与者的78个死后大脑切片 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | 网络分析，统计建模 | 空间转录组数据 | 78个脑切片来自21名ROSMAP参与者 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 999 | 2025-10-06 |
FlyPhoneDB2: A computational framework for analyzing cell-cell communication in Drosophila scRNA-seq data integrating AlphaFold-multimer predictions
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.06.032
PMID:40677242
|
研究论文 | 介绍FlyPhoneDB2计算框架，用于分析果蝇单细胞RNA测序数据中的细胞间通讯，整合了AlphaFold-multimer预测 | 显著扩展了配体-受体对知识库，整合哺乳动物物种注释和AlphaFold-Multimer结构预测，优化算法性能并增加新功能 | 原始FlyPhoneDB受限于可用配体-受体对数量较少 | 开发改进的计算工具来分析细胞间通讯 | 果蝇单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序，AlphaFold-Multimer预测 | 计算框架 | 单细胞RNA测序数据 | 果蝇全身单核RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1000 | 2025-10-06 |
Medulloblastoma: biology and immunotherapy
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1602930
PMID:40677711
|
综述 | 本文综述了髓母细胞瘤的生物学特征及免疫治疗最新进展 | 整合单细胞转录组学对髓母细胞瘤亚型的新发现，系统探讨肿瘤微环境与免疫治疗的关联机制 | NA | 探讨髓母细胞瘤生物学特性与免疫治疗策略的协同应用 | 髓母细胞瘤及其肿瘤微环境组分 | NA | 髓母细胞瘤 | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |