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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 981 | 2025-10-06 |
Single-cell technologies and spatial transcriptomics: decoding immune low - response states in endometrial cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1636483
PMID:40672944
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综述 | 本文探讨单细胞技术和空间转录组学在解码子宫内膜癌免疫低应答状态中的应用 | 整合单细胞测序与空间转录组技术进行多组学分析,揭示肿瘤微空间异质性 | 存在伦理和法律问题尚未解决 | 开发免疫治疗预测生物标志物并改善临床疗效 | 子宫内膜癌患者(特别关注NSMP亚型伴p53突变) | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间位置数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 982 | 2025-10-06 |
Multi-omics analysis reveals glutathione metabolism-related immune suppression and constructs a prognostic model in lung adenocarcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1608407
PMID:40672941
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了谷胱甘肽代谢相关的免疫抑制机制,并构建了肺腺癌预后预测模型 | 首次通过遗传因果分析结合单细胞RNA测序,系统阐明了谷胱甘肽代谢与肺腺癌免疫微环境的因果关系及其调控机制 | 研究主要基于公共数据库和体外验证,缺乏大规模临床队列的进一步验证 | 探究谷胱甘肽代谢重编程对肺腺癌免疫微环境的影响及其临床意义 | 肺腺癌患者样本、TCGA数据库、GEO数据库、肺腺癌细胞系 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 全基因组关联研究, 单细胞RNA测序, 伪时间分析, WGCNA, LASSO-Cox回归, qRT-PCR | 预后风险模型, 列线图模型 | 基因组数据, 转录组数据, 单细胞测序数据 | TCGA队列和两个独立GEO验证数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 全转录组测序 | NA | NA |
| 983 | 2025-10-06 |
Integrated single-cell chromatin and transcriptomic analyses of peripheral immune cells in patients with alopecia areata
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1565241
PMID:40672948
|
研究论文 | 通过整合单细胞染色质和转录组分析,研究斑秃患者外周免疫细胞的系统免疫失调 | 首次提供斑秃外周免疫细胞的整合单细胞染色质和转录组图谱,揭示疾病严重程度相关的系统免疫改变 | 仅分析外周血单个核细胞,未包括病变皮肤组织的直接比较 | 探索斑秃患者外周免疫细胞的系统免疫失调机制 | 斑秃患者(轻度和重度)和健康对照的外周血单个核细胞 | 单细胞多组学 | 斑秃 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 伪时序分析, 转录因子分析, 细胞间通讯网络推断 | 单细胞转录组数据, 单细胞染色质可及性数据 | 32,453个高质量细胞,涵盖36种免疫细胞亚型 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 984 | 2025-10-06 |
Prediction and immune landscape study of potentially key autophagy-related biomarkers in preeclampsia with gestational diabetes mellitus
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1571795
PMID:40672961
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析识别妊娠期糖尿病合并先兆子痫的潜在自噬相关生物标志物 | 首次整合多组学方法研究GDM合并先兆子痫的自噬相关基因特征,并利用单细胞RNA测序验证结果 | 样本量有限,需要更大规模研究验证生物标志物的临床适用性 | 探究妊娠期糖尿病合并先兆子痫的自噬相关基因表达变化及其分子机制 | 胎盘组织样本 | 生物信息学 | 妊娠期糖尿病合并先兆子痫 | 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 基因表达谱分析, WGCNA, GO/KEGG富集分析 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 985 | 2025-10-06 |
Precancerous pathways to gastric cancer: a review of experimental animal models recapitulating the correa cascade
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1620756
PMID:40673273
|
综述 | 本文全面分析胃癌前病变的动物实验模型,评估其模拟人类胃癌发生Correa级联的能力 | 系统分类并比较了五类胃癌前病变动物模型的优缺点,特别关注遗传工程小鼠模型的最新进展 | 现有模型主要产生SPEM而非真正的肠上皮化生,转化相关性有限 | 研究胃癌前病变的发病机制以制定有效预防和治疗策略 | 胃癌前病变动物模型 | 病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序、遗传工程 | 动物模型(感染模型、化学致癌模型、多因素诱导模型、遗传工程小鼠模型) | 实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 986 | 2025-10-06 |
Stratifin Is Necessary for Spasmolytic Polypeptide-Expressing Metaplasia Development After Acute Gastric Injury
2025, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101521
PMID:40280276
|
研究论文 | 本研究探讨了分层蛋白在急性胃损伤后胃主细胞转分化为表达解痉多肽的化生细胞过程中的关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序揭示分层蛋白在胃主细胞转分化过程中的调控机制,并发现其通过调节EGFR/ERK信号通路发挥作用 | 研究主要基于小鼠模型,在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究分层蛋白在胃主细胞转分化和SPEM发育过程中的分子机制 | Mist1CreERT2; LSL-tdTomato小鼠和Mist1CreERT2; Sfnflox/flox小鼠模型中的胃主细胞 | 单细胞生物学 | 胃部疾病 | 单细胞RNA测序,免疫组化,组织学检查 | NA | 单细胞转录组数据,组织图像数据 | 转基因小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 987 | 2025-10-06 |
Topologically associating domains of chromatin on single-cell Hi-C data: a survey of bioinformatic tools and applications in the light of artificial intelligence
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1602234
PMID:40666074
|
综述 | 本文综述了基于单细胞Hi-C数据的染色质拓扑关联域生物信息学工具及其在人工智能背景下的应用 | 首次系统综述了单细胞水平TAD结构计算分析中的人工智能策略,特别关注深度神经网络在处理大规模单细胞Hi-C数据中的优势 | 单细胞Hi-C数据存在超稀疏性、噪声干扰、实验伪影和细胞异质性等挑战 | 探讨单细胞Hi-C数据中拓扑关联域的计算分析方法及其在人工智能时代的发展趋势 | 染色质拓扑关联域(TADs) | 生物信息学 | NA | 单细胞Hi-C测序 | 深度神经网络 | 基因组三维结构数据 | NA | NA | 单细胞Hi-C | NA | NA |
| 988 | 2025-10-06 |
SPP1+ tumor-associated macrophages define a high-risk subgroup and inform personalized therapy in hepatocellular carcinoma
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1606195
PMID:40666097
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk RNA-seq数据,建立了基于SPP1和FOLR2特征的肝细胞癌TAMs新型分类系统 | 超越传统的M1/M2范式重新定义TAMs异质性,将TAMs轨迹基因与HCC患者分层联系起来 | TAMs的临床和治疗意义仍需进一步探索 | 探索肝细胞癌中肿瘤相关巨噬细胞的临床和治疗意义 | 肝细胞癌患者和肿瘤相关巨噬细胞 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA-seq,轨迹分析,多重免疫荧光 | 无监督聚类 | RNA测序数据,基因表达数据 | 大规模单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 989 | 2025-10-06 |
Integration of single-cell RNA and bulk RNA sequencing revealed malignant ductal cell heterogeneity and prognosis signatures in pancreatic cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1579184
PMID:40666516
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和bulk RNA测序揭示胰腺癌中恶性导管细胞的异质性及其预后标志物 | 首次通过整合单细胞和bulk RNA测序识别出ANLN、NT5E和CTSV作为胰腺癌新型预后生物标志物,并揭示恶性导管细胞与巨噬细胞之间的促肿瘤相互作用机制 | 样本量相对有限(74个单细胞RNA测序样本),需要在更大队列中进一步验证 | 探索胰腺癌中恶性导管细胞的异质性并鉴定预后相关基因标志物 | 胰腺癌患者样本中的恶性导管细胞和肿瘤微环境细胞 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,染色体拷贝数变异分析,非负矩阵分解,机器学习特征选择 | 非负矩阵分解,机器学习特征选择算法 | 单细胞RNA测序数据,bulk RNA测序数据 | 74个单细胞RNA测序样本,TCGA数据集和两个独立验证队列 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 990 | 2025-10-06 |
Identification and validation of genes related to stem cells and telomere maintenance mechanisms as biomarkers for breast cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1618193
PMID:40666524
|
研究论文 | 通过整合转录组和单细胞RNA测序分析,鉴定并验证与干细胞和端粒维持机制相关的乳腺癌生物标志物 | 首次整合转录组和单细胞RNA测序分析干细胞相关基因和端粒维持机制相关基因在乳腺癌中的作用,并识别关键细胞亚群 | 样本量较小(8对样本),需要更大规模研究验证 | 探索干细胞相关基因和端粒维持机制相关基因作为乳腺癌生物标志物的潜力 | 乳腺癌肿瘤组织和配对癌旁正常组织 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, RT-qPCR, LASSO算法, PPI网络分析 | LASSO | RNA测序数据, 单细胞数据 | 8对乳腺癌肿瘤和癌旁组织(共16个样本) | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 991 | 2025-10-06 |
Thymic hyperplasia in myasthenia gravis: a narrative review
2025, Mediastinum (Hong Kong, China)
DOI:10.21037/med-25-12
PMID:40666538
|
综述 | 本文综述了早发型重症肌无力中胸腺滤泡增生的病理特征、免疫机制及研究进展 | 整合了单细胞和空间转录组学等新兴技术对胸腺增生机制的研究前景 | 基于文献综述,缺乏原始实验数据验证 | 探讨早发型重症肌无力中胸腺增生的病理机制和未来研究方向 | 乙酰胆碱受体抗体阳性重症肌无力患者的胸腺病理 | 病理学 | 重症肌无力 | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 胸腺类器官模型 | NA | 文献数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 992 | 2025-10-06 |
Exploration of M2 macrophage-related biomarkers and a candidate drug for glioblastoma using high-dimensional weighted gene co-expression network analysis
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1587258
PMID:40661076
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研究论文 | 本研究通过高维加权基因共表达网络分析探索M2巨噬细胞相关生物标志物,并预测胶质母细胞瘤候选药物 | 首次结合单细胞RNA测序和hdWGCNA方法系统识别M2巨噬细胞相关基因标志物,并预测thalidomide作为候选治疗药物 | 研究基于公共数据库数据,需要实验验证;样本来源有限 | 识别M2巨噬细胞相关基因生物标志物并预测胶质母细胞瘤治疗药物 | 胶质母细胞瘤组织和细胞 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 高维加权基因共表达网络分析, 分子对接 | 诊断模型 | 基因表达数据 | GSE162631和GSE4290数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 993 | 2025-10-06 |
Silencing NEDD4L Effectively Inhibits the Malignant Behaviors of Hepatocellular Carcinoma
2025, Journal of hepatocellular carcinoma
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JHC.S511466
PMID:40661237
|
研究论文 | 本研究探讨NEDD4L在肝细胞癌中的表达、预后价值及其通过调控细胞周期和免疫检查点促进肝癌恶性行为的机制 | 首次系统揭示NEDD4L在肝癌中的双重调控作用——既通过泛素化降解细胞周期抑制因子促进细胞异常增殖,又通过下调免疫检查点促进免疫逃逸 | 研究主要基于数据库分析和体外实验,缺乏体内动物模型验证 | 探究NEDD4L在肝细胞癌发生发展中的作用机制及治疗潜力 | 肝细胞癌细胞系及患者单细胞测序数据 | 癌症生物学 | 肝细胞癌 | RNA-seq, 微阵列, 单细胞测序, Edu, CCK-8, Transwell, 伤口愈合实验 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据, 体外功能实验数据 | 多个数据库的肝癌患者数据 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 微阵列 | NA | NA |
| 994 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA-sequencing highlights a curtailed NK cell function in convalescent COVID-19 pregnant women
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1560391
PMID:40661959
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了康复期COVID-19孕妇中NK细胞功能受损的免疫特征 | 首次在康复期孕妇中发现SARS-CoV-2感染导致NK细胞和细胞毒性T细胞功能持续受损,揭示了感染后免疫系统长期改变 | 研究样本仅来自两个地理队列,需要更大规模研究验证 | 研究SARS-CoV-2感染对孕妇免疫系统的短期和长期影响 | 孕妇(包括COVID-19感染期和康复期) | 单细胞组学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,细胞因子检测 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据 | 两个独立地理队列的孕妇样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | Chromium Single Cell 3' Gel Bead Chip and Library Kit | 10x Chromium Single Cell 3'(Drop-seq方法) |
| 995 | 2025-10-06 |
Development of a Starvation Response-Based Model and Its Application in Prognostic Assessment of Liver Hepatocellular Carcinoma
2025, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/8828435
PMID:40662145
|
研究论文 | 本研究基于饥饿反应相关基因构建了首个肝细胞癌预后风险模型 | 首次基于饥饿反应相关基因构建肝细胞癌预后风险模型,揭示了SRRGs在LIHC预后预测中的价值 | 基于公共数据库的回顾性分析,需要进一步实验验证 | 开发基于饥饿反应相关基因的肝细胞癌预后评估模型 | 肝细胞癌患者、Huh7和THLE-2细胞系 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、转录组分析、WGCNA、功能富集分析、ssGSEA、伤口愈合实验、transwell实验 | RiskScore风险模型 | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 996 | 2025-10-06 |
Inhibition of Aspartate β-Hydroxylase Enhances Anti-Tumor Immunity
2025, ImmunoTargets and therapy
IF:6.2Q1
DOI:10.2147/ITT.S530987
PMID:40655119
|
研究论文 | 本研究探讨了抑制天冬氨酸β-羟化酶(ASPH)如何增强DNA疫苗诱导的抗肿瘤免疫反应 | 首次发现ASPH抑制可增强DNA疫苗激发的CD8+T细胞免疫反应,并对MHC-I下调的肿瘤产生有效免疫 | 研究仅使用小鼠TC-1/A9肿瘤模型,尚未在人类临床试验中验证 | 研究ASPH抑制对诱导抗肿瘤免疫的影响及参与的免疫细胞 | 小鼠TC-1/A9肿瘤模型及相关的免疫细胞 | 免疫肿瘤学 | 肿瘤 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序, ELISPOT检测 | NA | 基因表达数据, 细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 997 | 2025-10-06 |
The role of ATF3 in precision medicine of brain arteriovenous malformation: based on endothelial cell proliferation
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1567970
PMID:40655140
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和多组学分析揭示了ATF3在脑动静脉畸形内皮细胞增殖中的关键作用 | 首次发现ATF3在脑动静脉畸形发病机制中的关键作用,并验证其通过影响内皮细胞增殖促进疾病进展 | NA | 探索脑动静脉畸形的发病机制并开发新的治疗策略 | 脑动静脉畸形患者的内皮细胞 | 数字病理学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序, 多组学分析, 细胞转染, CCK-8, RT-qPCR, Transwell, EdU, 管形成实验 | monocle2, CytoTRACE, slingshot, CellChat, pySCENIC | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 多组学分析 | NA | NA |
| 998 | 2025-10-06 |
Using pseudotime derivative on single-cell RNA sequencing data to identify genes undergoing cell cycle regulation
2025, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbaf123
PMID:40655197
|
研究论文 | 开发了一种利用单细胞RNA测序数据和伪时间导数识别细胞周期调控基因的新方法 | 通过伪时间方法和基因表达速度计算,无需细胞周期同步化或选择实验即可研究细胞周期 | 方法主要适用于细胞系实验,可能受技术变异影响 | 开发无需化学修饰或特定阶段细胞选择的研究细胞周期的方法 | 细胞周期调控基因 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 伪时间分析方法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 999 | 2025-10-06 |
Single-cell analysis reveals the spatiotemporal effects of long-term electromagnetic field exposure on the liver
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1579121
PMID:40655943
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研究论文 | 通过单细胞分析研究长期电磁场暴露对肝脏的时空影响 | 首次在单细胞分辨率下系统评估长期电磁场暴露对肝脏的时空影响,揭示了不同肝细胞区域对电磁辐射的敏感性差异 | 研究仅使用小鼠模型,结果向人类外推需谨慎 | 系统评估长期电磁场暴露对肝脏的影响 | 小鼠肝脏细胞 | 单细胞分析 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序,脂质组学分析,组织学分析 | NA | 单细胞转录组数据,血清生化数据,组织学图像 | 长期电磁场暴露的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1000 | 2025-10-06 |
Multi-Omics Analysis Reveals the transforming growth factor-β Signaling-Driven Multicellular Interactions with Prognostic Relevance in Cervical Cancer Progression
2025, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.114505
PMID:40657372
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了宫颈癌进展中TGF-β信号驱动的多细胞相互作用及其预后相关性 | 首次在单细胞分辨率上系统描绘宫颈癌不同进展阶段的肿瘤微环境动态变化,发现TGF-β驱动的Epi0-中性粒细胞-CAFs生态位形成及其预后价值 | 样本量相对有限(scRNA-seq仅11例),需要更大队列验证 | 解析宫颈癌进展过程中肿瘤微环境异质性演变及其预后意义 | 宫颈癌患者肿瘤组织 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序,多重免疫组化 | 计算模型,基因集变异分析 | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,批量转录组数据 | scRNA-seq: 11例(局部3例、区域4例、转移4例),TCGA-CESC队列: 304例 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序 | NA | NA |