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当前共找到 1956 篇文献，本页显示第 981 - 1000 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 981 | 2025-10-06 |
Omics based technology application in poultry meat research
2025-Jan, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2024.104643
PMID:39662255
|
综述 | 本文综述了组学技术在禽肉研究中的应用，包括基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学和脂质组学等方法 | 系统整合多种组学技术研究禽肉品质问题，特别关注空间转录组学和代谢组学在木质胸病研究中的应用 | NA | 探讨组学技术如何增进对禽肉品质问题和复杂性状的理解 | 家禽肉类品质，特别是鸡肉品质和肌肉病变 | 生物信息学 | 禽类肌肉疾病 | 基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、脂质组学、空间转录组学、空间代谢组学、多组学分析 | NA | 组学数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间代谢组学, 多组学分析 | NA | NA |
| 982 | 2025-10-06 |
A novel Tc17 population recruited by tumor cells promotes tumor progression in gastric cancer
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1592328
PMID:40452847
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和空间转录组学技术揭示了胃癌微环境中Tc17细胞的免疫抑制功能及其促进肿瘤进展的机制 | 首次系统性地揭示了Tc17细胞在胃癌微环境中的免疫抑制功能，发现肿瘤细胞通过CXCL16-CXCR6轴招募Tc17细胞，而Tc17细胞通过分泌IL-17A和IL-26促进肿瘤进展 | 研究主要基于体外实验验证，缺乏体内动物模型验证；样本量相对有限 | 探究Tc17细胞在胃癌肿瘤微环境中的功能和作用机制 | 胃癌患者组织样本和细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多色免疫组化染色, SCENIC分析, 伪时间分析, 细胞-细胞相互作用分析 | NA | 单细胞测序数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 65例胃癌样本的单细胞测序数据(296,879个细胞), 10例胃癌样本的空间转录组数据 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 983 | 2025-10-06 |
Metabolic reprogramming signature predicts prognosis and immune landscape in small cell lung cancer: MOCS2 validation and implications for personalized therapy
2025, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2025.1592888
PMID:40452920
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析建立了小细胞肺癌的代谢重编程预后模型，并验证了关键基因MOCS2的功能 | 首次系统识别小细胞肺癌代谢重编程特征并构建基于梯度提升机的预后模型，通过实验验证MOCS2基因功能 | 使用公共数据集，样本来源有限；功能验证仅限于体外实验 | 开发小细胞肺癌预后预测模型并探索代谢重编程的临床意义 | 小细胞肺癌患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, siRNA敲低, WGCNA分析 | 梯度提升机(GBM) | 基因表达数据 | 来自GSE60052和cBioportal队列的公共数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 984 | 2025-10-06 |
Single-Cell Analysis Reveals Aspirin Restores Intervertebral Disc Integrity via Ferroptosis Regulation
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S519218
PMID:40453974
|
研究论文 | 通过单细胞分析发现阿司匹林通过调控铁死亡恢复椎间盘完整性 | 首次在椎间盘退变中鉴定出CDKN1A⁺aNPC亚型作为早期预警标志，并揭示阿司匹林通过靶向GPX4抑制铁死亡的新机制 | 研究样本量有限，机制验证仍需进一步深入 | 探究椎间盘退变的细胞异质性及阿司匹林的治疗机制 | 椎间盘髓核细胞亚群 | 单细胞分析 | 椎间盘退变 | 单细胞RNA测序，分子对接，体外实验，体内实验 | Harmony算法 | 单细胞RNA测序数据 | 四个独立单细胞测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 985 | 2025-10-06 |
To Explore the Key Subgroup and Their Immune Microenvironment During the Formation of Coronary Plaque With scRNA-seq
2025, Cardiology research and practice
IF:1.8Q3
DOI:10.1155/crp/3221767
PMID:40454289
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术探索冠状动脉斑块形成过程中的关键NK细胞亚群及其免疫微环境 | 首次发现C1 RACK1+ NK细胞亚群在冠状动脉斑块形成中的关键作用，并系统分析其在伪时间轨迹、细胞相互作用和转录因子调控中的表达特征 | 样本量较小（15例），需要更大规模研究验证发现 | 探索冠状动脉斑块形成过程中的关键细胞亚群及其免疫微环境机制 | 冠状动脉斑块组织中的NK细胞亚群 | 单细胞组学 | 冠状动脉疾病 | 单细胞RNA测序, CytoTRACE, monocle, slingshot, CellChat, SCENIC | NA | 单细胞转录组数据 | 15例个体标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 986 | 2025-10-06 |
Bulk integrated single-cell-spatial transcriptomics reveals the impact of preoperative chemotherapy on cancer-associated fibroblasts and tumor cells in colorectal cancer, and construction of related predictive models using machine learning
2025-01, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2024.167535
PMID:39374811
|
研究论文 | 本研究通过整合多种转录组数据揭示了术前化疗对结直肠癌中成纤维细胞和上皮细胞的影响，并构建了机器学习预测模型 | 首次整合bulk、单细胞和空间转录组数据系统研究术前化疗对结直肠癌微环境的影响，并构建了优于89个已发表模型的预测模型 | 研究样本量相对有限（22个独立队列），需要进一步实验验证 | 探究术前化疗对结直肠癌中成纤维细胞和上皮细胞生物学功能的影响 | 结直肠癌患者样本中的成纤维细胞和上皮细胞 | 生物信息学 | 结直肠癌 | bulk转录组测序, 单细胞转录组测序, 空间转录组测序 | 机器学习 | 转录组数据 | 22个独立结直肠癌队列 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组 | NA | NA |
| 987 | 2025-10-06 |
Lifting the curse from high-dimensional data: automated projection pursuit clustering for a variety of biological data modalities
2025-Jan-06, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giaf052
PMID:40440093
|
研究论文 | 提出一种自动化投影追踪聚类方法，用于缓解高维生物数据中的维度灾难问题 | 通过顺序投影将高维数据降维表示，有效克服传统聚类算法在高维空间性能下降的问题 | NA | 开发适用于多种生物数据模态的无监督聚类方法 | 高维生物数据，包括转录组学、蛋白质组学和单细胞组学数据 | 机器学习 | NA | 无监督聚类，投影追踪 | 自动化投影追踪(APP) | 高维生物数据 | NA | NA | 流式细胞术,质谱流式细胞术,单细胞RNA测序,多重成像,T细胞受体谱分析 | NA | NA |
| 988 | 2025-10-06 |
A glutamine metabolism gene signature with prognostic and predictive value for colorectal cancer survival and immunotherapy response
2025, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2025.1599141
PMID:40443528
|
研究论文 | 本研究构建了基于谷氨酰胺代谢基因的GLMscore评分系统，用于结直肠癌预后预测和免疫治疗反应评估 | 首次整合多组学数据构建谷氨酰胺代谢相关基因评分系统，并系统评估其在肿瘤微环境、免疫治疗反应和微生物组方面的预测价值 | 研究基于回顾性数据，需要前瞻性研究进一步验证GLMscore的临床实用性 | 开发结直肠癌预后预测和免疫治疗反应评估的生物标志物 | 结直肠癌患者 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, 16S rRNA基因测序, 组织成像分析 | 基因特征评分模型 | 基因表达数据, 微生物组数据, 病理图像数据 | 多个队列的结直肠癌患者样本（包括训练队列和验证队列） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 微生物组测序 | NA | NA |
| 989 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA-seq uncovers lineage-specific regulatory alterations of fibroblasts and endothelial cells in ligamentum flavum hypertrophy
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1569296
PMID:40443657
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示黄韧带肥厚中成纤维细胞和内皮细胞的谱系特异性调控改变 | 首次在黄韧带肥厚中鉴定出五种不同的成纤维细胞亚群，并发现间充质成纤维细胞亚群在肥厚黄韧带中显著增加 | 未明确说明样本数量和研究人群特征，功能验证可能不足 | 建立黄韧带的单细胞图谱，识别腰椎管狭窄症药物治疗的高优先级靶点 | 黄韧带组织中的成纤维细胞和内皮细胞 | 单细胞基因组学 | 腰椎管狭窄症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 990 | 2025-10-06 |
TSPAN4+ fibroblasts coordinate metastatic niche assembly through migrasome-driven metabolic reprogramming and stromal-immune crosstalk in pancreatic adenocarcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1594879
PMID:40443671
|
研究论文 | 本研究揭示了TSPAN4+成纤维细胞通过迁移体驱动的代谢重编程和基质-免疫串扰协调胰腺癌转移生态位组装的关键机制 | 首次发现TSPAN4+成纤维细胞作为胰腺癌转移的关键调节因子，通过迁移体介导的代谢重编程和基质-免疫细胞相互作用促进转移生态位形成 | 研究主要基于胰腺癌组织分析，需要进一步验证其他癌症类型中的普适性 | 探索迁移体相关成纤维细胞在胰腺癌转移中的作用机制，为靶向肿瘤微环境的治疗策略提供新思路 | 胰腺癌组织和肿瘤微环境中的细胞成分 | 单细胞生物学, 空间转录组学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, siRNA转染, qRT-PCR | Seurat, Monocle, CellCall, CellChat, RCTD, MISTy | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 功能实验数据 | 来自GEO和TCGA数据库的胰腺癌组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 991 | 2025-10-06 |
Single cell atlas of canine natural killer cells identifies distinct circulating and tissue resident gene profiles
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1571085
PMID:40443661
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建犬类自然杀伤细胞图谱，识别循环和组织驻留基因特征的差异 | 首次在犬类中系统比较不同组织自然杀伤细胞的基因表达特征，并与人类进行跨物种比较 | 样本来源仅限于血液、肺、肝、脾和胎盘组织 | 表征犬类和人类自然杀伤细胞的基因表达差异，包括个体发育、异质性、激活模式和组织驻留特征 | 犬类和人类的自然杀伤细胞 | 单细胞组学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个组织样本（血液、肺、肝、脾、胎盘） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 992 | 2025-10-06 |
Optimizing single cell RNA sequencing of stem cells. A streamlined workflow for enhanced sensitivity and reproducibility in hematopoietic studies. The use of human umbilical cord blood-derived hematopoietic stem and progenitor cells
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1590889
PMID:40443736
|
研究论文 | 本文优化了造血干细胞单细胞RNA测序流程，比较了CD34+和CD133+造血干/祖细胞的转录组差异 | 开发了针对有限细胞数量的造血干细胞单细胞RNA测序优化流程，并首次对CD34+和CD133+造血干/祖细胞进行系统转录组比较 | 研究使用的细胞数量有限，仅来源于人类脐带血 | 优化单细胞RNA测序流程并比较不同造血干/祖细胞亚群的转录组特征 | 人类脐带血来源的CD34+Lin-CD45+和CD133+Lin-CD45+造血干/祖细胞 | 单细胞测序 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), FACS细胞分选 | UMAP降维分析 | 单细胞转录组数据 | 人类脐带血来源的有限数量造血干细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 993 | 2025-10-06 |
Integrated single-cell and transcriptome sequencing data reveal the value of IL1RAP in gastric cancer microenvironment and prognosis
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1584619
PMID:40444099
|
研究论文 | 通过整合单细胞和转录组测序数据揭示IL1RAP在胃癌微环境及预后中的关键作用 | 首次系统整合单细胞与转录组数据揭示IL1RAP在胃癌免疫微环境中的调控机制及其免疫治疗预测价值 | 研究基于公共数据库数据，需进一步实验验证机制 | 探究IL1RAP在胃癌肿瘤微环境中的作用及预后价值 | 胃癌患者样本数据 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞测序,转录组测序,机器学习 | 多种机器学习算法 | 转录组数据,单细胞数据 | 胃癌患者公共数据库样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 994 | 2025-10-06 |
Exploring the level of metabolic reprogramming and the role of prognostic factor SF3A3 in hepatocellular carcinoma through integrated single-cell landscape analysis
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0323559
PMID:40424306
|
研究论文 | 通过整合单细胞景观分析探索肝细胞癌中代谢重编程水平及预后因子SF3A3的作用 | 首次通过单细胞RNA测序揭示HCC代谢重编程异质性，发现SF3A3作为新型诊断和独立预后生物标志物 | 使用公共数据库数据，缺乏实验验证样本 | 研究肝细胞癌代谢重编程异质性并识别新的治疗靶点 | 肝细胞癌细胞及肿瘤微环境中的单核吞噬细胞、上皮细胞、内皮细胞、NK/T细胞、B细胞等 | 单细胞分析 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，拷贝数变异分析，基因本体富集分析，伪时序分析 | 诊断模型 | 单细胞RNA测序数据 | 公共数据库中的单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 995 | 2025-10-06 |
Identification of biomarkers associated with inflammatory response in Parkinson's disease by bioinformatics and machine learning
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0320257
PMID:40435035
|
研究论文 | 通过生物信息学和机器学习方法筛选与帕金森病炎症反应相关的生物标志物基因 | 结合LASSO、SVM-RFE和随机森林三种机器学习算法筛选生物标志物，并进行了单细胞转录组数据分析 | NA | 筛选与帕金森病炎症反应相关的生物标志物基因 | 帕金森病患者相关基因表达数据 | 机器学习 | 帕金森病 | 生物信息学分析，机器学习 | LASSO, SVM-RFE, Random Forest | 基因表达数据，单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | NA |
| 996 | 2025-10-06 |
Intercellular communication between FAP+ fibroblasts and SPP1+ macrophages in prostate cancer via multi-omics
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1560998
PMID:40438108
|
研究论文 | 通过多组学技术揭示前列腺癌中FAP+成纤维细胞与SPP1+巨噬细胞间的细胞通讯机制 | 首次整合单细胞RNA测序、空间转录组学和批量RNA测序系统揭示FAP+成纤维细胞与SPP1+巨噬细胞在前列腺癌中的特异性相互作用网络 | 样本量相对有限（23个前列腺样本），需要更大规模验证 | 探索前列腺癌肿瘤微环境中细胞间通讯机制，寻找新的治疗靶点 | 前列腺癌肿瘤微环境中的FAP+成纤维细胞和SPP1+巨噬细胞 | 数字病理 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序, 免疫组织化学, 免疫荧光染色 | NA | RNA测序数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 23个前列腺样本的23,519个单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 997 | 2025-10-06 |
Unraveling the immune evasion mechanisms in the tumor microenvironment of head and neck squamous cell carcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1597202
PMID:40438103
|
综述 | 系统阐述头颈部鳞状细胞癌肿瘤微环境中免疫逃逸机制及其治疗策略 | 提出HNSCC免疫逃逸的'三位一体'调控网络新框架，包含代谢重编程、基质细胞驱动和表观遗传重塑三大机制，并首次提出'谱系可塑性驱动免疫适应'新范式 | 对特定免疫逃逸通路理解仍不完整，缺乏个性化治疗策略 | 解析HNSCC肿瘤微环境中的免疫逃逸机制并探索免疫治疗新策略 | 头颈部鳞状细胞癌肿瘤微环境 | 肿瘤免疫学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞测序、空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | NA | NA |
| 998 | 2025-10-06 |
Tumor-infiltrating immune cell signature score reveals prognostic biomarkers and therapeutic targets for colorectal cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1583327
PMID:40438100
|
研究论文 | 本研究通过整合结直肠癌转录组数据构建了肿瘤浸润免疫细胞特征评分模型，用于预后预测和免疫治疗反应评估 | 开发了基于五个关键TIIC-RNA的预后模型，在TCGA-CRC和外部验证数据集中表现优于22个现有预后模型 | 需要进一步评估TIIC特征评分的临床实用性，并在不同人群和治疗环境中验证其相关性 | 探索肿瘤浸润免疫细胞相关基因在结直肠癌中的预后价值，发现新的生物标志物和治疗靶点 | 结直肠癌患者 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序，转录组分析，机器学习 | 随机生存森林，LASSO回归，Cox比例风险回归 | 转录组数据，单细胞RNA测序数据 | TCGA-CRC数据集和外部验证数据集 | NA | 单细胞RNA测序，转录组测序 | NA | NA |
| 999 | 2025-10-06 |
Construction of a stromal cell-related prognostic signature based on a 101-combination machine learning framework for predicting prognosis and immunotherapy response in triple-negative breast cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1544348
PMID:40438115
|
研究论文 | 基于101种机器学习组合框架构建基质细胞相关预后特征，用于预测三阴性乳腺癌的预后和免疫治疗反应 | 首次整合10种机器学习算法和101种模型组合，开发基于myCAF、VSMC和周细胞标记基因的预后特征 | 研究基于回顾性数据，需要前瞻性研究进一步验证 | 识别基质细胞标记基因并开发预后特征，预测TNBC生存结局和免疫治疗反应 | 三阴性乳腺癌患者和细胞系 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，qRT-PCR，免疫组化，RNA干扰，CCK-8检测，凋亡检测，伤口愈合检测 | 101种机器学习组合框架 | 单细胞转录组数据，批量转录组数据 | 来自GEO数据库的单细胞RNA测序数据集和独立验证队列GSE91061 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1000 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome conservation in a multispecies comparative analysis of fresh and cryopreserved insulinoma cell lines
2025, Veterinary oncology (London, England)
DOI:10.1186/s44356-025-00025-4
PMID:40438246
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序对多种胰岛素瘤细胞系进行跨物种比较分析，并评估冷冻保存对单细胞转录组的影响 | 首次在胰岛素瘤中进行跨物种单细胞转录组比较分析，并系统评估冷冻保存对胰岛素瘤细胞转录组的影响 | 研究仅使用细胞系而非原代肿瘤组织，可能无法完全反映体内肿瘤的复杂性 | 理解胰岛素瘤的单细胞转录组景观，评估冷冻保存对转录组的影响 | 犬类和人类胰岛素瘤细胞系（canINS, CM, INS-1和MIN6） | 单细胞转录组学 | 胰岛素瘤 | 单细胞RNA测序 | Seurat | 单细胞转录组数据 | 四种胰岛素瘤细胞系的新鲜和冷冻保存样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |