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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2026-05-27 |
Single-cell RNA sequencing reveals common interactions between follicle immune cells and granulosa cells in premature ovarian insufficiency patients†
2025-01-14, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioae157
PMID:39513542
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示早发性卵巢功能不全患者卵泡免疫细胞与颗粒细胞之间的共同相互作用 | 首次在单细胞水平上分析POI、正常卵巢储备和高级母龄女性的卵泡微环境,发现VEGFA-FLT1相互作用的缺失可能与颗粒细胞衰老和炎症相关 | 样本量较小(共9名女性),且仅针对首次穿刺的卵泡,可能无法完全代表整体卵泡微环境 | 探究早发性卵巢功能不全患者的卵泡微环境特征,并寻找潜在治疗靶点 | 早发性卵巢功能不全患者、正常卵巢储备女性及高级母龄女性的卵泡细胞 | 数字病理学 | 早发性卵巢功能不全 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 9名女性(3名POI患者、3名正常卵巢储备者、3名高级母龄者) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 82 | 2026-05-25 |
Blockade of purine metabolism reverses macrophage immunosuppression and enhances anti-tumor immunity in non-small cell lung cancer
2025-01, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy
IF:15.8Q1
DOI:10.1016/j.drup.2024.101175
PMID:39608215
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研究论文 | 本研究揭示了嘌呤代谢阻断可逆转巨噬细胞免疫抑制并增强非小细胞肺癌的抗肿瘤免疫 | 首次发现非小细胞肺癌细胞分泌的CXCL8通过激活嘌呤代谢促进巨噬细胞PD-L1表达,并揭示NLRP3/caspase-1/IL-1β信号通路在嘌呤代谢介导的巨噬细胞免疫抑制中的作用 | NA | 评估巨噬细胞是否通过代谢串扰调节非小细胞肺癌进展并影响免疫治疗疗效 | 非小细胞肺癌组织中的巨噬细胞 | 数字病理学 | 非小细胞肺癌 | 单细胞测序, 流式细胞术, 免疫荧光, 多重检测, ELISA, RNA-seq | NA | 图像, 文本 | 非小细胞肺癌组织样本及C57BL/6J小鼠肿瘤模型 | 10x Genomics, NA | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞测序系统 |
| 83 | 2026-05-23 |
Exploring the role of oxidative stress in carotid atherosclerosis: insights from transcriptomic data and single-cell sequencing combined with machine learning
2025-01-29, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-025-00600-7
PMID:39881407
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研究论文 | 通过转录组数据和单细胞测序结合机器学习,探索氧化应激在颈动脉粥样硬化中的作用 | 首次将氧化应激相关基因与单细胞测序数据结合机器学习模型,揭示驻留样巨噬细胞和泡沫巨噬细胞中IDH1和CD36等基因上调在斑块形成和进展中的关键作用 | 基于生物信息学分析,缺乏实验验证,且样本量可能有限 | 识别与颈动脉粥样硬化斑块形成、进展和稳定相关的关键氧化应激基因及免疫细胞浸润 | 颈动脉粥样硬化斑块组织及单细胞数据 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | 机器学习模型 | 转录组数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 84 | 2026-05-23 |
Uncovering glycolysis-driven molecular subtypes in diabetic nephropathy: a WGCNA and machine learning approach for diagnostic precision
2025-01-21, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-025-00601-6
PMID:39838413
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研究论文 | 利用WGCNA和机器学习方法揭示糖尿病肾病中糖酵解驱动的分子亚型,并提供诊断标志物 | 首次系统分析糖尿病肾病中糖酵解相关基因的表达模式,结合WGCNA和机器学习识别关键基因,并通过单细胞测序验证 | 研究基于公共数据集分析,体外实验仅验证正常对照样本,缺乏体内验证和临床队列验证 | 探究糖酵解相关基因在糖尿病肾病中的作用及其与免疫微环境的关系,构建诊断模型 | 糖尿病肾病患者的肾组织样本及正常对照 | 机器学习 | 糖尿病肾病 | RNA-seq, 单细胞测序, qRT-PCR | 极端梯度提升模型 (XGB) | 基因表达数据 | 来自GSE30122、GSE30528、GSE96804和GSE142153数据集,具体样本量未在摘要中说明 | NA | Bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 85 | 2026-05-23 |
Animal and vegetal materials of mouse oocytes segregate at first zygotic cleavage: a simple mechanism that makes the two-cell blastomeres differ reciprocally from the start
2025-01-17, Molecular human reproduction
IF:3.6Q1
DOI:10.1093/molehr/gaae045
PMID:39786543
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研究论文 | 通过控制小鼠卵母细胞受精位点并分析首次卵裂后子细胞转录组,揭示动物极与植物极物质在首次卵裂时分离,导致两细胞期卵裂球从一开始就彼此不同 | 首次证明哺乳动物卵母细胞首次卵裂沿赤道方向进行,从而将动物极和植物极物质分别分配到两个卵裂球中,挑战了传统认为的经线分裂模型和可变分裂模型 | 仅在小鼠模型中验证,人类卵母细胞的相关机制尚需进一步研究;实验通过ICSI控制受精位点,可能不适用于自然受精情况 | 探究小鼠受精卵首次卵裂后姐妹卵裂球差异的起源机制,区分两种对立模型(平衡分配与可变分配) | 小鼠卵母细胞及受精卵 | 数字病理学 | NA | ICSI, 单细胞转录组分析, 图像分析 | 无监督层次聚类 | 转录组数据, 图像数据 | 小鼠卵母细胞(具体数量未提供) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 86 | 2026-05-23 |
Pro-cumulin addition in a biphasic in vitro oocyte maturation system modulates human oocyte and cumulus cell transcriptomes
2025-01-17, Molecular human reproduction
IF:3.6Q1
DOI:10.1093/molehr/gaaf001
PMID:39862403
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研究论文 | 研究在双相体外卵母细胞成熟系统中添加原-cumulin对人类卵母细胞和卵丘细胞转录组的影响 | 首次在人类双相IVM培养中探究卵母细胞分泌因子原-cumulin对来自小型窦状卵泡的卵母细胞和卵丘细胞转录组的调控作用 | 未来需在蛋白质组学水平评估原-cumulin的效果及胚胎学结果,特别是对部分去颗粒卵母细胞的潜在改善作用 | 阐明原-cumulin添加对人类双相IVM系统中卵母细胞和卵丘细胞转录组的影响 | 人类卵丘-卵母细胞复合体(完全被卵丘细胞包裹或部分去颗粒的) | 数字病理学 | 不育症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 人类卵丘-卵母细胞复合体(具体样本量未提及) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 87 | 2026-05-23 |
Evolutionary convergence of sensory circuits in the pallium of amniotes
2025-01-02, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adp3411
PMID:39946453
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研究论文 | 通过出生日期分析、单细胞RNA和空间转录组学以及数学建模,比较鸟类、蜥蜴和哺乳动物端脑中感觉回路的发育和演化 | 揭示了不同物种间感觉回路神经元的生成时间和脑区差异,发现谷氨酸能神经元转录组进程的早期发育分歧 | NA | 研究羊膜动物端脑中感觉回路的演化关系 | 鸡、壁虎和老鼠的端脑感觉回路 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 三种物种(鸡、壁虎、老鼠) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 88 | 2026-05-22 |
Identification of cancer-associated fibroblast subtypes and prognostic model development in breast cancer: role of the RUNX1/SDC1 axis in promoting invasion and metastasis
2025-01-03, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-024-09950-w
PMID:39753834
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研究论文 | 识别乳腺癌中癌症相关成纤维细胞亚型并构建预后模型,发现RUNX1/SDC1轴在促进侵袭转移中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序揭示乳腺癌中癌症相关成纤维细胞的异质性,并鉴定出RUNX1/SDC1轴在促进肿瘤侵袭和转移中的新机制 | NA | 识别乳腺癌中癌症相关成纤维细胞分子亚型并构建基于CAF的预后模型 | 乳腺癌患者中的癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 89 | 2026-05-21 |
Two-Stage Multi-View Graph Spectral Clustering for Single-Cell RNA-Seq Data
2025, Current genomics
IF:1.8Q3
|
研究论文 | 提出了一种用于单细胞RNA测序数据的两阶段多视图图谱聚类方法,通过构建多视图特征空间并分阶段优化相似图,提升了细胞类型聚类准确性 | 首次将两阶段多视图学习框架应用于scRNA-seq数据聚类,通过加权学习和结构学习分别优化属性图和结构图,克服了单视图特征空间不足的问题 | 未讨论方法在处理视图间差异极大或数据噪声过高时的鲁棒性,且未涉及计算复杂度或可扩展性分析 | 设计一种能充分利用细胞间结构关系信息的多视图聚类方法,提高单细胞RNA-seq数据中细胞类型分布的识别精度 | 来自八个不同规模真实scRNA-seq数据集的细胞样本 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 图谱聚类(结合加权学习和结构学习) | 基因表达数据(单细胞转录组数据) | 八个不同规模的真实scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 90 | 2026-05-20 |
Experimental and Computational Methods for Allelic Imbalance Analysis from Single-Nucleus RNA-seq Data
2025-Jan-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.13.607784
PMID:39185246
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研究论文 | 本研究开发了用于单细胞核RNA-seq数据等位基因失衡分析的实验和计算方法 | 首次证明单细胞核RNA-seq比单细胞RNA-seq更适合等位基因特异性表达分析,并开发了一套完整的计算工具 | 未提及具体局限性 | 优化等位基因失衡分析的实验和计算选择,提升分析效能 | 人脑组织样本(帕金森病队列) | 机器学习 | 帕金森病 | snRNA-seq, scRNA-seq, 等位基因特异性表达分析, eQTL分析 | NA | 基因表达数据 | 94例帕金森病患者样本 | NA | 单细胞核RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 91 | 2026-05-20 |
Specifically blocking αvβ8-mediated TGF-β signaling to reverse immunosuppression by modulating macrophage polarization
2025-Jan-02, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-024-03250-1
PMID:39743547
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研究论文 | 本研究通过开发特异性阻断αvβ8介导的TGF-β信号传导的抗体,揭示了其通过调节巨噬细胞极化逆转免疫抑制的抗肿瘤机制 | 首次阐明抗αvβ8抗体通过直接调控巨噬细胞极化而非仅依赖T细胞来发挥抗肿瘤作用,并发现与PD-1抗体联用可显著增强免疫排斥型肿瘤的敏感性 | αvβ8在不同肿瘤中的表达谱仍存在争议,且抗αvβ8抗体的抗肿瘤机制尚未完全阐明 | 探究特异性阻断αvβ8介导的TGF-β信号对肿瘤免疫微环境的调控作用 | 多种人类肿瘤样本、同源小鼠模型、人外周血单核细胞、巨噬细胞及食蟹猴 | 机器学习和数字病理学交叉领域 | 肿瘤疾病(肺癌、前列腺癌等) | 单细胞RNA测序、冷冻电镜单颗粒分析 | 不适用 | 单细胞转录组数据、冷冻电镜结构数据 | 多种人类肿瘤样本及同源小鼠模型(未明确具体数量) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3'测序平台 |
| 92 | 2026-05-20 |
LRRC45 accelerates bladder cancer development and ferroptosis inhibition via stabilizing NRF2 by competitively KEAP1 interaction
2025-01, Free radical biology & medicine
|
研究论文 | 本研究揭示了LRRC45通过竞争性结合KEAP1稳定NRF2,加速膀胱癌发展并抑制铁死亡 | 首次发现中心体连接蛋白LRRC45在膀胱癌中通过竞争性结合KEAP1抑制NRF2降解,从而促进肿瘤发生并抑制铁死亡,为膀胱癌治疗提供了新靶点 | NA | 探索LRRC45在膀胱癌发展中的作用及其分子机制 | 膀胱癌细胞及临床样本 | 机器学习 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 93 | 2026-05-20 |
Characterization of MAIT cells in glioblastoma reveals a potential immunosuppressive role through a MAIT-neutrophil axis
2025 Jan-Dec, Neuro-oncology advances
IF:3.7Q2
DOI:10.1093/noajnl/vdaf173
PMID:41030524
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研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了MAIT细胞在胶质母细胞瘤中的免疫抑制作用,并发现MAIT-中性粒细胞轴可能成为新的治疗靶点 | 首次系统表征MAIT细胞在胶质母细胞瘤中的免疫抑制功能,发现MAIT17亚型与肿瘤相关中性粒细胞相互作用形成免疫抑制轴 | MAIT细胞在胶质母细胞瘤中的具体分子机制尚未完全阐明,且研究样本量有限 | 探究MAIT细胞在胶质母细胞瘤中的免疫调节作用 | 胶质母细胞瘤患者外周血和肿瘤组织样本中的MAIT细胞及肿瘤相关中性粒细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 流式细胞术, 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, 多重组织成像 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | 20例胶质母细胞瘤组织样本 | NA | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 94 | 2026-05-19 |
Expansion of peripheral cytotoxic CD4+ T cells in Alzheimer's disease: New insights from multi-omics evidence
2025-01, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2024.110976
PMID:39657893
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研究论文 | 通过多组学证据揭示阿尔茨海默病中外周细胞毒性CD4+ T细胞的扩增现象及其机制 | 首次通过单细胞RNA测序结合孟德尔随机化分析,确认CD4-CTLs在阿尔茨海默病患者外周血中显著扩增,并鉴定TBX21和MYBL1为关键转录因子,以及SRGN和ITGB1作为风险基因 | 未明确提及样本量大小及功能验证的体内外模型细节,仅基于现有公共数据集的关联性分析 | 探索阿尔茨海默病中适应性免疫应答的作用,特别是CD4-CTLs的扩增机制及其与认知衰退的关联 | 阿尔茨海默病患者的外周血单核细胞中的CD4细胞毒性T细胞 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 基于公共数据集的阿尔茨海默病患者样本,具体数量未在摘要中说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 具体配置未在摘要中说明 |
| 95 | 2026-05-19 |
Single-cell RNA sequencing unveils dynamic transcriptional profiles during the process of donkey spermatogenesis and maturation
2025-01, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2024.110974
PMID:39694081
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序揭示了驴精子发生和成熟过程中的动态转录谱 | 首次提供驴精子发生和成熟的单细胞分辨率转录图谱,发现CDK1、CETN3和UBE2J1等基因在特定生殖细胞中的表达模式 | NA | 解析驴精子发生和成熟的单细胞转录组特征 | 驴睾丸和附睾组织中的生殖细胞和体细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 96 | 2026-05-19 |
Single-cell RNA sequencing reveals the heterogeneity of myofibroblasts in wound repair
2025-01, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2024.110982
PMID:39706310
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序揭示皮肤伤口愈合过程中肌成纤维细胞的异质性 | 首次通过单细胞RNA测序对皮肤溃疡、瘢痕疙瘩和正常瘢痕中的肌成纤维细胞进行深入分析,发现了11个亚群,并揭示了特定亚群在慢性溃疡中的关键作用 | 研究样本主要来自皮肤溃疡、瘢痕疙瘩和正常瘢痕,可能无法完全代表所有伤口愈合类型;动物模型验证尚需更多临床数据支持 | 探索肌成纤维细胞在不同伤口愈合场景中的异质性及其对伤口修复的影响 | 来自皮肤溃疡、瘢痕疙瘩和正常瘢痕的89148个细胞 | 单细胞组学 | 皮肤溃疡, 瘢痕疙瘩 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 89148个细胞(来自皮肤溃疡、瘢痕疙瘩和正常瘢痕) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 97 | 2026-05-18 |
Cell-specific transcriptional signatures of vascular cells in Alzheimer's disease: perspectives, pathways, and therapeutic directions
2025-01-29, Molecular neurodegeneration
IF:14.9Q1
DOI:10.1186/s13024-025-00798-0
PMID:39876020
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综述 | 本文综述了阿尔茨海默病中血管细胞的细胞特异性转录特征及其对靶向治疗的意义 | 首次系统整合单细胞和单核转录组研究,揭示脑血管细胞类型和亚型在AD中的转录差异,并强调细胞间通讯失调及多组学整合策略 | 未提及具体局限性 | 总结AD中人类脑血管细胞的单细胞转录组特征及其潜在治疗方向 | 阿尔茨海默病患者的脑血管细胞(内皮细胞、壁细胞、平滑肌细胞、成纤维细胞、周细胞)及神经胶质单元 | 自然语言处理 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序,单核RNA测序 | NA | 文本 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 98 | 2026-05-17 |
scPharm: Identifying Pharmacological Subpopulations of Single Cells for Precision Medicine in Cancers
2025-01, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202412419
PMID:39560158
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研究论文 | 介绍scPharm计算框架,整合药理图谱与单细胞RNA测序数据,识别肿瘤内药物敏感性亚群并优化个性化治疗 | 首次提出通过标准化富集分数将药物反应基因列表与细胞身份基因分布关联,实现单细胞分辨率的药物亚群识别,并预测联合用药策略与毒性评估 | 仅依赖基因集富集分析评估相关性,可能忽略非编码RNA或表观遗传调控对药物反应的影响 | 为癌症精准医学提供单细胞分辨率的治疗异质性解析方法 | 人乳腺癌组织(ER阳性/HER2阳性)、人PC9细胞(经埃罗替尼处理)、小鼠模型 | 机器学习 | 乳腺癌,肺癌 | 单细胞RNA测序 | scPharm计算框架(基于基因集富集分析) | 基因表达数据 | 人乳腺癌组织(具体样本量未提及)、人PC9细胞系、小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 99 | 2026-05-17 |
H. Pylori-Facilitated TERT/Wnt/β-Catenin Triggers Spasmolytic Polypeptide-Expressing Metaplasia and Oxyntic Atrophy
2025-01, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202401227
PMID:39587848
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研究论文 | 本研究揭示了幽门螺杆菌通过CagA蛋白破坏TERT与E3连接酶SYVN1的相互作用,上调TERT水平并激活Wnt/β-Catenin通路,从而诱导主细胞去分化和痉挛性多肽表达化生及胃底腺萎缩的机制 | 首次阐明CagA通过干扰TERT与新型E3连接酶SYVN1的结合来上调TERT蛋白丰度,并证实TERT/Wnt/β-Catenin通路在幽门螺杆菌诱导的SPEM中的关键作用 | 未提及具体局限 | 探究幽门螺杆菌诱导胃黏膜痉挛性多肽表达化生和胃底腺萎缩的分子机制 | 感染cagA阳性幽门螺杆菌的胃黏膜主细胞 | 分子生物学 | 胃癌前病变 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 100 | 2026-05-17 |
Control of Cellular Differentiation Trajectories for Cancer Reversion
2025-01, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202402132
PMID:39661721
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研究论文 | 提出了单细胞布尔网络推断和控制框架BENEIN,用于识别细胞分化轨迹中的主调控因子,并验证了其通过抑制MYB、HDAC2和FOXA2诱导结直肠癌细胞向正常样肠细胞逆转的能力 | 首次将布尔网络控制理论应用于单细胞转录组数据,系统识别分化轨迹中的主调控因子,并实现癌症逆转 | 方法的普适性需在更多组织类型和癌症类型中验证,且实验验证仅限于结直肠癌模型 | 开发计算框架以识别细胞分化轨迹中的主调控因子,并探索通过调控这些因子实现癌症逆转的可能性 | 人小肠单细胞转录组数据及结直肠癌细胞 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 布尔网络 | 基因表达数据 | 人小肠单细胞转录组数据(样本量未明确) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |