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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
81 2026-01-25
A review of omics studies in sarcopenia: from molecular mechanisms to hepatic-gut-muscle interactions in chronic liver disease comorbidity
2025, Frontiers in cellular and infection microbiology IF:4.6Q1
综述 本文综述了肌少症的组学研究,从分子机制到慢性肝病共病中的肝-肠-肌肉相互作用,并提出了一个双层的“共性-特异性”框架 提出了一个双层的“共性-特异性”框架来解释肌少症的病理机制,并针对慢性肝病共病背景提出了“多弱信号协同累积”假说 目前组学研究结果多为相关性,对临床转化构成挑战,未来需要从静态分析转向动态机制解析 系统梳理肌少症的分子机制,并特别关注其在慢性肝病共病背景下的病理网络扰动 肌少症,以及慢性肝病相关的肌少症 NA 老年病 多组学技术 NA NA 整合了10项肌少症组学研究和6项慢性肝病相关肌少症研究 NA 单细胞多组学,空间转录组学 NA NA
82 2026-01-25
BMP4 dose dictates lineage specification bias in human periodontal ligament stem cells
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology IF:4.3Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和体外功能实验,系统探究了BMP4剂量如何调控人牙周膜干细胞向成骨和肌腱谱系的分化 首次在单细胞水平揭示了BMP4剂量依赖性调控人牙周膜干细胞谱系分化的双相动力学机制,并明确了BMP受体在成骨和肌腱分化中的特异性作用 研究主要基于体外实验,缺乏体内验证;样本量相对有限;未探讨其他可能影响分化的协同因子 探究BMP4剂量对人牙周膜干细胞谱系分化的调控机制,以优化基于PDLSC的牙周再生治疗策略 人牙周膜干细胞 单细胞转录组学 牙周疾病 单细胞RNA测序,体外功能实验 NA 单细胞转录组数据,体外实验数据 未明确具体样本数量,但涉及人牙周膜干细胞亚群分析 NA 单细胞RNA-seq NA NA
83 2026-01-25
Growth Hormone Alleviates Atherosclerosis Through Regulating the Activity of PI3K/AKT Pathway: Insights From Single-Cell Sequence and Mechanism Exploration
2025, International journal of genomics IF:2.6Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,探讨了生长激素通过调节PI3K/AKT通路活性缓解动脉粥样硬化的机制 结合单细胞RNA测序数据与机制探索,首次系统揭示了生长激素通过PI3K/AKT通路在动脉粥样硬化中的保护作用 研究主要基于小鼠模型,临床转化需进一步验证;体外实验使用ox-LDL模拟损伤,可能与体内复杂环境存在差异 探究生长激素对动脉粥样硬化的影响及其分子机制 小鼠动脉血管平滑肌细胞、C57BL/6和ApoE-/-小鼠模型 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序, RNA测序, 液相色谱-质谱联用, 蛋白质印迹分析 NA 单细胞RNA测序数据, 代谢组学数据, 基因表达数据 小鼠动脉组织样本(包括健康与动脉粥样硬化组织),具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
84 2026-01-24
Heterogeneity analysis and prognostic model construction of HPV negative oral squamous cell carcinoma T cells using ScRNA-seq and bulk-RNA analysis
2025-Jan-23, Functional & integrative genomics IF:3.9Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和bulk RNA-seq数据,分析了HPV阴性口腔鳞状细胞癌中T细胞的异质性,并构建了一个基于T细胞相关基因的预后风险模型 首次在HPV阴性口腔鳞状细胞癌中结合单细胞和bulk转录组数据系统分析T细胞异质性,并构建了基于T细胞相关基因的预后模型,为预测患者生存和免疫浸润水平提供了新见解 样本量相对有限(14个肿瘤样本和6个正常样本),模型需要在更大的独立队列中进行验证 评估HPV阴性口腔鳞状细胞癌中T细胞标记基因的表达谱,构建预后风险模型,并研究风险评分与免疫治疗反应的相关性 HPV阴性口腔鳞状细胞癌患者 数字病理学 口腔鳞状细胞癌 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq, qRT-PCR 预后风险模型 单细胞转录组数据, bulk转录组数据 14个HPV阴性OSCC样本和6个正常样本,共28,000个细胞 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
85 2026-01-24
Unraveling the potential mechanism and prognostic value of pentose phosphate pathway in hepatocellular carcinoma: a comprehensive analysis integrating bulk transcriptomics and single-cell sequencing data
2025-Jan-11, Functional & integrative genomics IF:3.9Q1
研究论文 本研究整合了批量转录组学和单细胞测序数据,构建了一个基于戊糖磷酸途径相关基因的模型,用于肝细胞癌患者的风险评估和预后预测 首次整合批量转录组学和单细胞测序数据,构建了一个与戊糖磷酸途径相关的十基因特征模型,并验证了其在预测肝细胞癌预后和免疫治疗反应方面的价值 研究主要基于回顾性数据,需要前瞻性临床研究进一步验证模型的预测能力 构建一个基于戊糖磷酸途径相关基因的模型,用于肝细胞癌患者的风险评估、预后预测和个体化治疗指导 肝细胞癌患者 数字病理学 肝细胞癌 RNA-seq, 微阵列, 单细胞RNA测序 惩罚性Cox回归模型, LASSO回归 转录组数据, 单细胞测序数据 来自TCGA, GEO和ICGC数据库的多个队列数据 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
86 2026-01-24
Pig jejunal single-cell RNA landscapes revealing breed-specific immunology differentiation at various domestication stages
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了野猪、金华猪和杜洛克猪空肠组织的免疫细胞图谱,揭示了不同驯化阶段猪品种间免疫功能的差异和进化 首次在单细胞分辨率下构建了猪空肠组织的免疫细胞图谱,开发了免疫细胞评估系统,并识别了与驯化相关的品种特异性基因模式 研究仅关注空肠组织,可能未全面反映整个肠道的免疫变化;样本量相对有限,未来可扩展至更多品种和部位 探究猪在驯化过程中肠道免疫功能的进化变化和细胞异质性 野猪、中国地方品种(金华猪)和集约化品种(杜洛克猪)的空肠组织 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞RNA测序数据 26,246个细胞,来自三个猪品种的空肠组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
87 2026-01-24
Hydrogen improves the efficacy of tetrandrine in the treatment of silicosis by inhibiting vascular endothelial mesenchymal transition caused by oxidative stress
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology IF:4.3Q2
研究论文 本研究探讨了氢气如何通过抑制氧化应激诱导的血管内皮间质转化,来提高汉防己甲素治疗矽肺的疗效 首次提出氢气通过抑制凋亡肺泡巨噬细胞释放淀粉样前体蛋白及其与血管内皮细胞CD74的相互作用,来缓解肺血管狭窄,从而提高治疗药物在肺组织中的浓度 研究基于小鼠模型,结论在人体中的有效性尚需进一步验证 探究汉防己甲素在肺组织中浓度低的原因,并提出联合氢气吸入的治疗方案以提高矽肺治疗效果 矽肺小鼠模型 数字病理学 肺病 单细胞RNA测序 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
88 2026-01-24
Downregulation of OPCML is associated with activation of AKT signaling and aggressive phenotypes in glioblastoma cells
2025, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 本研究探讨了OPCML在胶质母细胞瘤中的下调与AKT信号通路激活及侵袭性表型的关系 首次在单细胞分辨率下定位OPCML在胶质母细胞瘤中的表达,并揭示其通过调节PI3K-AKT-mTOR信号通路影响肿瘤侵袭性 研究主要基于细胞系实验,缺乏体内模型验证;临床相关性分析依赖于公共数据库,可能存在样本偏差 阐明OPCML在胶质母细胞瘤生物学中的作用及其临床意义 胶质母细胞瘤细胞系(U87和U251)及公共数据库中的患者数据 生物信息学与分子生物学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序、微阵列、Western blotting、siRNA敲低、细胞功能实验 NA 基因表达数据、蛋白质相互作用数据、临床数据 两个批量微阵列队列、单细胞RNA测序数据、TCGA和HPA数据库中的患者样本 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
89 2026-01-24
Integrative bulk and single-cell transcriptomic analysis reveals COL1A2-driven ECM remodeling and focal adhesion signaling associated with the transition from non-muscle-invasive to muscle-invasive bladder cancer
2025, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过整合分析bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据,揭示了COL1A2驱动的细胞外基质重塑和黏着斑信号在膀胱癌从非肌层浸润向肌层浸润转变过程中的关键作用 首次整合bulk和单细胞转录组数据,系统揭示了COL1A2介导的基质CAFs与EMT上皮细胞间的细胞通讯轴在膀胱癌进展中的机制 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,缺乏体内动物模型验证 探究COL1A2在膀胱癌进展中的作用机制及其作为预后生物标志物的潜力 膀胱癌(非肌层浸润型和肌层浸润型) 生物信息学 膀胱癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 蛋白质-蛋白质相互作用分析, ssGSEA, 细胞通讯分析 Cox回归模型, Kaplan-Meier生存分析 转录组数据 TCGA和GEO数据库中的膀胱癌样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
90 2026-01-24
Metabolic reprogramming-driven stratification and therapeutic targeting in lung adenocarcinoma: implications for prognosis and personalized treatment
2025, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 本研究开发了一种基于代谢相关基因的预后评分系统(MRPs),用于肺腺癌(LUAD)患者的风险分层和个性化治疗指导 提出了一个新颖的代谢相关预后评分系统(MRPs),该系统超越了传统的临床病理参数,能够捕获LUAD的代谢和免疫异质性,并识别出WARS2作为关键功能驱动因子和治疗靶点 研究主要基于回顾性转录组和临床数据,需要进一步的前瞻性临床验证来确认MRPs系统的临床应用价值 开发一个基于代谢相关基因的预后评分系统,并研究其在肺腺癌中的生物学、免疫学和治疗学意义 肺腺癌(LUAD)患者 数字病理学 肺癌 RNA-seq, 单细胞RNA测序, qPCR, Western blot, 免疫组织化学 LASSO-Cox回归模型 转录组数据, 临床数据 来自TCGA和GEO数据库的肺腺癌患者队列(具体样本数量未在摘要中明确说明) NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
91 2026-01-24
Metabolic reprogramming in the post-metastatic tumor microenvironment: multi-omics insights into determinants of immunotherapy response
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 本文综述了转移后肿瘤微环境中代谢重编程如何决定免疫治疗反应,并探讨了多组学技术在此领域的应用前景 系统整合了代谢重编程(糖酵解、脂代谢、铁死亡、铜死亡、色氨酸代谢轴)与免疫抑制微环境的关联,并强调了多组学技术(代谢组学、蛋白质组学、单细胞测序、空间组学)在解码这些复杂相互作用、发现生物标志物和治疗靶点方面的突破性作用 NA 探讨转移后肿瘤微环境(TIME)中代谢重编程如何调控免疫应答并影响免疫治疗疗效,旨在为克服治疗耐药性和开发个性化疗法提供见解 转移性肿瘤的肿瘤免疫微环境(TIME)及其代谢与免疫相互作用网络 肿瘤生物学与免疫学 转移性癌症 多组学技术(代谢组学、蛋白质组学、单细胞测序、空间组学) NA 多组学数据 NA NA 单细胞测序, 空间转录组学 NA NA
92 2026-01-24
Decidual stromal cells drive CD16+ macrophages towards an immunoregulatory phenotype via extracellular matrix-adhesion molecule interaction during early pregnancy
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究探讨了在早期妊娠中,蜕膜基质细胞通过细胞外基质-黏附分子相互作用调控CD16+巨噬细胞向免疫调节表型分化的机制 首次揭示了蜕膜基质细胞通过细胞外基质成分(如胶原IV、骨桥蛋白和透明质酸)与其受体相互作用,驱动CD16+巨噬细胞向免疫调节表型分化,并发现复发性流产患者中此调控链减弱 研究主要基于体外共培养系统和单细胞测序数据分析,体内验证和临床样本量可能有限,且具体分子机制细节需进一步探索 研究早期妊娠中蜕膜基质细胞与CD16+巨噬细胞通过细胞外基质-黏附分子相互作用的调控机制及其在复发性流产中的病理意义 蜕膜基质细胞、CD16+巨噬细胞、复发性流产患者 生殖免疫学 复发性流产 单细胞测序、共培养系统、组织与细胞水平分析 NA 单细胞测序数据、组织样本、细胞培养数据 包括子宫内膜和蜕膜组织样本,以及复发性流产患者样本,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
93 2026-01-24
Identify GDPD3 as a key regulator of epithelial-mesenchymal transition and prostate adenocarcinoma progression via the LPA/LPAR1/AKT axis: transcriptomic and experimental study
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和Bulk RNA测序数据,识别GDPD3作为前列腺腺癌进展的关键调控因子,并通过LPA/LPAR1/AKT轴促进上皮-间质转化 首次将GDPD3与前列腺腺癌的LPA/LPAR1/AKT信号轴联系起来,并开发了一个21基因预后模型 研究主要基于体外细胞实验(DU145细胞),缺乏体内模型验证,且临床样本验证有限 探索前列腺腺癌进展的分子机制并识别潜在治疗靶点 前列腺腺癌(PRAD) 数字病理学 前列腺癌 单细胞RNA测序,Bulk RNA测序,免疫组织化学,qPCR,体外敲低实验 预后模型(基于Cox回归和LASSO分析) RNA测序数据,临床数据,图像数据 来自GEO的单细胞RNA-seq数据和来自TCGA的Bulk RNA-seq数据,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq,Bulk RNA-seq NA NA
94 2026-01-24
Single-cell sequencing reveals the tumor immune microenvironment in thyroid cancer: a narrow review
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 本文综述了利用单细胞RNA测序技术揭示甲状腺癌肿瘤免疫微环境的研究进展 通过单细胞测序技术,首次系统描绘了从PTC到PDTC再到ATC这一分化依赖的肿瘤免疫微环境重塑轨迹,揭示了传统批量分析中常被掩盖的细胞异质性、免疫互作和空间组织特征 本文为综述性文章,未涉及原始数据生成或新模型开发,主要基于现有研究进行总结和分析 阐明甲状腺癌肿瘤免疫微环境的特征及其在肿瘤进展和治疗反应中的作用 甲状腺癌的肿瘤免疫微环境,重点关注乳头状甲状腺癌(PTC)、低分化甲状腺癌(PDTC)和间变性甲状腺癌(ATC) 数字病理学 甲状腺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
95 2026-01-24
Glutamate enhances the production of inflammatory cytokines IL-6 and IL-11, as well as chemokines CXCL2, CXCL3, and CXCL8 in keloid fibroblasts
2025, Frontiers in molecular biosciences IF:3.9Q2
研究论文 本研究通过转录组学和代谢组学分析,揭示了谷氨酸代谢在促进瘢痕疙瘩成纤维细胞炎症功能中的关键作用 首次结合单细胞RNA测序和代谢组学,发现谷氨酸受体GRIN2D在瘢痕疙瘩成纤维细胞中特异性高表达,并证实谷氨酸能增强炎症因子和趋化因子的产生 研究主要基于体外细胞实验,缺乏体内动物模型验证;样本量可能有限,未明确具体数量 探究谷氨酸代谢在瘢痕疙瘩发病机制中的作用 人类瘢痕疙瘩组织与正常皮肤组织,以及体外培养的人成纤维细胞 数字病理学 皮肤瘢痕疙瘩 RNA测序(RNA-seq)、代谢组学、单细胞RNA测序、免疫组织化学、免疫荧光、定量RT-PCR、ELISA NA 基因表达数据、代谢物数据、图像数据 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
96 2026-01-23
LST1: a novel biomarker for efferocytosis in the co-occurrence of type 2 diabetes mellitus and clear cell renal cell carcinoma
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析,识别出LST1是2型糖尿病与肾透明细胞癌共病的关键调控基因,并验证了其在巨噬细胞介导的胞葬作用及免疫调控中的核心作用 首次发现LST1作为T2DM与ccRCC共病的关键调控因子,揭示了其在连接两种疾病的免疫调控通路中的新作用,为研究糖尿病与恶性肿瘤共存的免疫机制提供了新框架 研究主要基于公共数据库的单细胞转录组数据,虽然进行了体内外验证,但样本来源和数量可能有限,且具体分子机制有待进一步深入探索 识别T2DM与ccRCC共病的共同分子通路和新型生物标志物 2型糖尿病和肾透明细胞癌的共病模型 生物信息学 肾透明细胞癌, 2型糖尿病 单细胞转录组测序, 机器学习算法, GSEA算法, 体内外实验验证 机器学习算法(未指定具体模型) 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
97 2026-01-23
High-resolution single-cell RNA sequencing using canFam4 reveals novel immune subsets and checkpoint programs in healthy dogs
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究利用10x Genomics平台和canFam4基因组,构建了健康小型犬外周血白细胞的单细胞转录组图谱,揭示了新的免疫亚群和检查点程序 首次使用canFam4基因组进行高分辨率单细胞RNA测序,在健康犬中识别出51个独特的免疫亚群,包括在canFam3.1研究中未被充分代表的细胞类型,并揭示了免疫检查点机制 研究仅基于六只健康小型犬,样本量有限,可能无法完全代表所有犬种或健康状况 旨在通过单细胞RNA测序高分辨率解析健康犬的免疫异质性,并识别新的免疫亚群和功能特征 六只健康小型犬的外周血白细胞 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 六只健康小型犬 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Genomics平台用于单细胞RNA测序
98 2026-01-23
scVAR: integrating genomics and transcriptomics from single-cell RNA-seq -insights from leukemia case studies
2025, Frontiers in genetics IF:2.8Q2
研究论文 本文介绍了scVAR,一种利用变分自编码器从单细胞RNA测序数据中学习和整合遗传变异的计算框架,应用于白血病案例研究 开发了基于交叉注意力融合层的编码器-解码器架构,将转录组和变异信息整合到统一潜在表示中,增强了在噪声和稀疏条件下检测细微细胞差异的能力 由于使用3' scRNA-seq,变异检测仅限于捕获区域 整合单细胞RNA测序中的基因组和转录组信息,以更好地表征细胞状态和疾病过程 急性髓系白血病(AML)和急性淋巴细胞白血病(ALL) 机器学习 白血病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 变分自编码器(VAE) 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
99 2026-01-23
Correction: High-resolution single-cell RNA sequencing using canFam4 reveals novel immune subsets and checkpoint programs in healthy dogs
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
correction 本文是对先前发表的一篇关于使用canFam4进行高分辨率单细胞RNA测序以揭示健康犬类新型免疫亚群和检查点程序的研究文章的更正 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
100 2026-01-22
Lyz1-Expressing Alveolar Type II Cells Contribute to Lung Regeneration
2025, Journal of respiratory biology and translational medicine
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序识别并表征了一个表达Lyz1的肺泡II型细胞亚群,揭示了其在肺损伤后肺泡再生中的关键作用 首次发现并定义了表达Lyz1的AT2细胞作为一个先前未被识别的肺泡祖细胞群,扩展了肺泡再生的范式 NA 探究异质性肺泡II型细胞在肺修复中的贡献 小鼠肺组织中的肺泡II型细胞亚群 单细胞生物学 肺损伤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
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