单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 2188 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2026-09-02 |
Consensus representation of multiple cell-cell graphs from gene signaling pathways for cell type annotation
2025-01-23, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-025-02128-8
PMID:39849579
|
研究论文 | 提出scMCGraph，一个整合基因表达与通路活性进行细胞类型注释的计算框架 | 利用多个通路特异性视图构建共识图，并以此重建多个视图，从而引入通路信息改善细胞间图学习，提升跨数据集的预测性能 | 未在摘要中明确提及局限性 | 提升单细胞RNA测序数据中细胞类型注释的准确性和鲁棒性 | 多样化的单细胞RNA测序数据集，包括跨平台、跨时间、跨样本和临床数据集 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 图神经网络（基于共识图） | 基因表达数据和通路活性数据 | 未在摘要中指明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 82 | 2026-09-02 |
Unveiling cell-type-specific microRNA networks through alternative polyadenylation in glioblastoma
2025-01-21, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-024-02104-8
PMID:39838429
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据，分析了胶质母细胞瘤中不同细胞类型（尤其是肿瘤细胞和少突胶质前体细胞）的替代性多聚腺苷酸化（APA）事件，揭示了APA如何调控microRNA结合位点并影响细胞状态转换和基因调控网络 | 首次揭示了APA事件与基因表达变化之间的独立性，并构建了microRNA-转录因子-靶基因网络，提供了针对GBM复杂分子互作的新视角 | 基于单细胞RNA测序数据，可能受到数据噪声和覆盖度限制，且未对发现的机制进行实验验证 | 探索替代性多聚腺苷酸化在胶质母细胞瘤中调节microRNA结合及转录后调控的作用，以理解细胞状态转变和疾病进展 | 胶质母细胞瘤样本中的肿瘤细胞和少突胶质前体细胞 | 生物信息学, 单细胞转录组学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序，APA分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 未在摘要中提供具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 83 | 2026-09-02 |
Tokay gecko tail regeneration involves temporally collinear expression of HOXC genes and early expression of satellite cell markers
2025-01-08, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-024-02111-9
PMID:39780185
|
研究论文 | 本研究通过转录组学、单细胞测序和原位杂交技术，探究大壁虎尾再生过程中的基因表达模式，发现其再生机制与胚胎发育不同，依赖于常驻干细胞激活和预先存在的位置信息。 | 首次在大壁虎尾再生中发现HOXC基因的时间共线性表达，早期激活卫星细胞标记，且未观察到顶端生长区，表明其再生机制类似干细胞激活而非发育样过程。 | 论文未提供明确局限性信息，需查阅全文以获取。 | 阐明大壁虎尾再生的分子机制，比较其与胚胎尾发育的异同。 | 大壁虎（Gekko gecko）的再生尾和胚胎尾组织。 | 再生生物学, 转录组学, 单细胞测序 | NA | 转录组学, 单细胞测序, 原位杂交 | NA | 转录组数据, 单细胞测序数据, 原位杂交图像 | 七个再生阶段和三个胚胎尾芽发育阶段的样本。 | NA | 单细胞RNA测序, 原位杂交 | NA | NA |
| 84 | 2026-09-02 |
Expression Cloning of Antibodies from Single Human B Cells
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4188-0_5
PMID:39424722
|
研究论文 | 本文描述了一种从单个人类B细胞中表达克隆抗体的方法，用于表征B细胞淋巴瘤的抗体反应性 | 提出了一种无偏见的单细胞水平人类抗体库表征策略，通过从原代人类B细胞生成重组单克隆抗体 | 文中未提及局限，但基于协议描述，可能受限于单细胞分离和RT-PCR扩增的效率 | 描述一种从单个人类B细胞生成重组单克隆抗体的方法，以表征B细胞淋巴瘤的抗体反应性 | 单个人类B细胞，包括来自B细胞淋巴瘤的细胞 | 分子生物学 | B细胞淋巴瘤 | RT-PCR | NA | 序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 85 | 2026-09-02 |
Single Cell VDJ Sequencing of Normal and Malignant B and T Cells
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4188-0_14
PMID:39424731
|
研究论文 | 本文详细介绍了利用10x Genomics的Chromium和BD Biosciences的Rhapsody系统进行单细胞B和T细胞受体库测序的方法，涵盖正常和恶性细胞分析 | 提供针对B和T细胞受体库测序的详细实验和分析流程，适应高细胞数（高达60,000细胞）并扩展至表面分子、ATAC-seq及抗原特异性检测 | 未提及 | 阐述单细胞B和T细胞受体库测序方法，以支持肿瘤研究中克隆组成分析 | 正常和恶性B和T细胞 | 单细胞测序 | 淋巴瘤和白血病 | 单细胞B和T细胞受体库测序 | NA | 单细胞转录组和受体库数据 | NA | 10x Genomics, BD Biosciences | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium, BD Rhapsody | 10x Chromium系统和BD Rhapsody系统，用于单细胞B和T细胞受体库测序 |
| 86 | 2026-09-02 |
Repetitive Trans-spinal Magnetic Stimulation Suppresses Microglia to Engulf Synapse and Promotes Nerve Repairment via cGAS-STING Signaling Pathway after Spinal Cord Injury
2025, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.114428
PMID:41208875
|
研究论文 | 本研究探讨了重复经脊髓磁刺激通过cGAS-STING信号通路抑制小胶质细胞吞噬突触，促进脊髓损伤后神经修复的机制 | 首次揭示rTSMS通过抑制cGAS-STING通路减少小胶质细胞对突触的吞噬，从而促进神经功能恢复，并利用单细胞RNA测序鉴定小胶质细胞为关键靶细胞 | 研究主要基于大鼠模型，结果可能不完全适用于人类；具体分子机制仍需进一步深入探索 | 阐明rTSMS在脊髓损伤后调节小胶质细胞吞噬突触的机制，及其促进神经修复的作用 | 大鼠脊髓损伤模型中的小胶质细胞和神经突触 | 神经科学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序, 蛋白质印迹, 免疫荧光染色 | 大鼠模型 | 基因表达数据, 图像 | 大鼠样本，具体数量未提供 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 87 | 2026-09-02 |
DPP7 promotes fatty acid β-oxidation in tumor-associated macrophages and determines immunosuppressive microenvironment in colorectal cancer
2025, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.117909
PMID:41208881
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序等技术揭示DPP7在结直肠癌肿瘤相关巨噬细胞中促进脂肪酸β氧化，塑造免疫抑制微环境，并影响免疫治疗疗效的机制 | 首次鉴定DPP7为TAMs的关键基因，阐明其通过结合CPT1A减少泛素化降解，增强脂肪酸氧化，驱动M2极化和免疫抑制微环境的新机制，并证实靶向DPP7可增强抗PD-1免疫治疗疗效 | 研究主要基于体外和动物模型，临床样本验证有限，DPP7靶向治疗的临床转化应用仍需进一步探索 | 旨在探索结直肠癌肿瘤相关巨噬细胞中增强免疫治疗疗效的关键基因及其机制 | 结直肠癌患者样本、肿瘤相关巨噬细胞、小鼠皮下移植瘤模型及肝转移模型 | 机器学习和数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、质谱流式细胞术、多重免疫荧光、RNA测序、液相色谱-串联质谱蛋白质组学、靶向脂质代谢组学 | NA | 基因表达数据、蛋白质组学数据、代谢组学数据、图像数据 | 多个临床队列样本及动物模型样本（具体数量未提供） | 10x Genomics, Illumina, Fluidigm | 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq, Fluidigm CyTOF | 10x Chromium单细胞3'转录组测序，Illumina NovaSeq平台进行测序，Fluidigm CyTOF用于质谱流式细胞术分析 |
| 88 | 2026-09-02 |
TTC36-Mediated Tumor Suppression via YBX3/SPRED1 Axis Paradoxically Reduces Sorafenib Sensitivity in Hepatocellular Carcinoma
2025, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.115727
PMID:41208883
|
研究论文 | 本研究揭示了TTC36通过YBX3/SPRED1轴抑制肝细胞癌，但同时通过PI3K/Akt补偿性激活降低索拉非尼敏感性，并提出联合Akt抑制剂的个性化治疗策略 | 首次阐明TTC36作为肿瘤抑制因子通过直接结合YBX3并保护其免受蛋白酶体降解，从而上调SPRED1抑制Ras/MAPK信号通路；同时发现TTC36高表达导致索拉非尼耐药，并验证了MK-2206联合治疗可逆转耐药 | 研究主要基于细胞和动物模型，缺乏大规模临床队列验证；未深入探讨TTC36在免疫微环境中的作用；索拉非尼耐药机制局限于PI3K/Akt通路，可能忽略其他耐药因素 | 探究TTC36在肝细胞癌中的抑癌功能、分子机制及其对索拉非尼治疗敏感性的影响 | 肝细胞癌组织和细胞系，以及动物模型 | 数字病理学、机器学习 | 肝细胞癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 质谱分析, 分子对接, RNA pull-down, 双荧光素酶报告基因检测 | NA | RNA测序数据, 单细胞RNA测序数据, 蛋白质组学数据, 临床数据 | NA | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 89 | 2026-09-02 |
Targeting FTL regulates ferroptosis and remodels lymph node metastasis microenvironment in esophageal squamous cell carcinoma
2025, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.112017
PMID:41281761
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和功能实验探讨了FTL基因在食管鳞状细胞癌淋巴结转移微环境中的调控作用，揭示其通过铁死亡机制促进肿瘤进展和转移 | 首次发现FTL作为食管鳞癌和转移微环境中铁死亡通路的关键靶基因，阐明其通过NRF2通路和NCOA4蛋白抑制铁死亡并重塑转移微环境，并验证Brusatol的潜在治疗作用 | 摘要未提及具体研究限制，可能需要更多临床样本或动物模型验证 | 探究FTL在食管鳞状细胞癌淋巴结转移中的作用机制及其作为治疗靶点的潜力 | 食管鳞状细胞癌患者样本及其淋巴结转移组织 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未详细说明，但涉及食管鳞癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 90 | 2026-09-02 |
Bringing p53 Back: A Prion-Powered Attack on Retinoblastoma
2025, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.113116
PMID:41079924
|
研究论文 | 本文报道了一种基于朊病毒样自组装肽前药（Pri-MP）的策略，通过靶向HDMX恢复p53功能，用于视网膜母细胞瘤的治疗，并在原位小鼠模型中验证了其疗效和安全性 | 利用朊病毒样自组装肽前药和Au(I)介导的可逆组装，特异性地靶向视网膜母细胞瘤细胞中的巨胞饮作用，实现p53的恢复，这是一种创新的药物递送和肿瘤靶向方法 | 研究尚处于临床前阶段，需要进一步的临床研究来验证其在人体中的有效性和安全性 | 开发一种更安全、更选择性强的视网膜母细胞瘤治疗方法，通过恢复p53功能来增强肿瘤控制并保留视力 | 视网膜母细胞瘤细胞及原位小鼠模型 | 数字病理学 | 视网膜母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明，涉及细胞系和原位小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 91 | 2026-09-02 |
TGF-βI/FERMT2/COL6A1 Reciprocal Loop Drives Tumor-Stroma Crosstalk and Promotes Peritoneal Metastasis in Gastric Cancer
2025, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.119895
PMID:41079932
|
研究论文 | 本研究揭示了TGF-βI/FERMT2/COL6A1正反馈环在胃癌腹膜转移中驱动肿瘤-基质串扰的关键作用 | 首次发现FERMT2在CAFs中通过ceRNA机制调控COL6A1转录，并形成TGF-βI/FERMT2/COL6A1正反馈环促进胃癌腹膜转移，提出了新的治疗靶点 | 摘要中未明确提及研究的局限性 | 阐明胃癌腹膜转移中肿瘤细胞与基质成纤维细胞相互作用的分子调控机制，探索潜在治疗靶点 | 胃癌组织样本、胃癌相关成纤维细胞（GCAFs）、胃癌细胞系以及体内模型 | 癌症生物学 | 胃癌 | RNA-seq、单细胞RNA测序、蛋白质组学、功能实验、体内模型 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据、图像数据 | 未明确说明样本数量，涉及胃癌组织、细胞系和动物模型 | NA | 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 92 | 2026-09-01 |
Congestion Enriches Intra-hepatic Macrophages Through Reverse Zonation of CXCL9 in Liver Sinusoidal Endothelial Cells
2025, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101475
PMID:39923846
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组和单细胞测序技术，揭示了在充血性肝病中，肝窦内皮细胞沿门静脉-中央静脉轴反向表达趋化因子CXCL9，导致肝内巨噬细胞富集，进而促进充血性纤维化和门静脉高压的病理过程 | 首次发现肝窦内皮细胞在中央静脉周围区域作为主要来源表达CXCL9，并证实其通过β-catenin和缺氧诱导因子-1α调控转录，揭示了门静脉-中央静脉轴的区域特异性在巨噬细胞募集中的关键作用 | 本研究主要基于肝组织样本和动物模型，未涵盖不同病因和病程的更大规模队列，且体内实验结果可能不完全反映人类疾病的复杂性 | 探究充血性肝病中肝窦免疫细胞的空间分布变化及其与纤维化和门静脉高压的关系 | 充血性肝病（CH）、Fontan相关肝病（FALD）患者及对照组肝组织，以及经部分下腔静脉结扎（pIVCL）模拟CH的小鼠 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 成像质谱流式（IMC）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、RNA原位杂交（RNAish） | NA | 基因表达数据、图像数据 | 未明确，但包括CH和FALD患者及对照组，以及pIVCL小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 93 | 2026-09-01 |
Spatial proteomics and transcriptomics characterization of tissue and multiple cancer types including decalcified marrow
2025-Jan, Cancer biomarkers : section A of Disease markers
IF:2.2Q3
DOI:10.1177/18758592241308757
PMID:40109220
|
研究论文 | 本文通过优化空间蛋白质组学和转录组学技术，对多种癌症组织及脱钙骨髓样本进行表征，验证了 PhenoCycler-Fusion 和 Xenium 平台在多种肿瘤类型上的有效性 | 提出并应用了分子和蛋白质友好的骨髓脱钙协议，实现了对脱钙骨髓样本的空间蛋白质组学和转录组学分析，同时建立了系统的质量评估方法 | 缺乏系统性方法以确保组织质量、标记物完整性和数据重现性，且脱钙协议可能影响某些样本类型 | 优化空间生物学技术方法，解决多种组织和肿瘤类型的前分析挑战，包括开发脱钙协议以保存核酸用于空间分析 | 多癌种组织微阵列（TMA）和脱钙处理后的骨髓核心样本 | 空间生物学 | 多种癌症（类型未具体列出） | 空间蛋白质组学（PhenoCycler高多重免疫组化）和空间转录组学（Xenium） | NA | 空间蛋白质表达数据和空间基因表达数据 | 多癌种组织微阵列（TMA）包含多种肿瘤类型，另包括骨髓核心样本（具体数量未提供） | 10x Genomics, Akoya Biosciences | 空间蛋白质组学, 空间转录组学 | PhenoCycler-Fusion, Xenium | PhenoCycler高多重免疫组化（IHC）用于空间蛋白质组学，Xenium平台用于空间转录组学 |
| 94 | 2026-09-01 |
Stratifin Is Necessary for Spasmolytic Polypeptide-Expressing Metaplasia Development After Acute Gastric Injury
2025, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101521
PMID:40280276
|
研究论文 | 本研究探讨了Stratifin在急性胃损伤后主细胞转分化为痉挛性多肽表达化生（SPEM）过程中的必要性及其机制。 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了急性损伤后主细胞转分化的初始特征，并证明了SFN通过调节EGFR/ERK信号通路对SPEM发展至关重要。 | 研究主要基于小鼠模型，人类胃组织中SFN的作用仍需进一步验证。 | 阐明SFN在急性胃损伤后主细胞转分化为SPEM过程中的作用及机制。 | 小鼠胃主细胞和SPEM细胞。 | 分子生物学 | 胃疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了Mist1CreERT2; LSL-tdTomato小鼠和Mist1CreERT2; Sfnflox/flox小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 95 | 2026-09-01 |
HMG Box-containing Protein 1 (HBP1) Protects Against Pancreatic Injury in Acute Pancreatitis but Promotes Neoplastic Progression
2025, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101536
PMID:40404099
|
研究论文 | 本研究探讨了HMG盒转录因子1（HBP1）在急性胰腺炎和胰腺癌前病变中的作用，发现HBP1在胰腺炎中起保护作用但在KRAS突变时促进肿瘤进展 | 首次揭示HBP1在急性胰腺炎中的保护作用及其在KRAS突变背景下促进胰腺上皮内瘤变进展的双重角色 | 研究未提供具体局限性信息 | 阐明HBP1在急性胰腺炎发生和进展中的功能作用及其对胰腺癌前病变的影响 | 人类胰腺炎样本、蛙皮素诱导的急性胰腺炎小鼠模型、胰腺特异性HBP1敲除小鼠、人胰腺导管上皮细胞 | 数字病理学 | 胰腺炎、胰腺导管腺癌 | 空间转录组学、多重蛋白检测、组织学分析、免疫染色 | 基因敲除小鼠模型、细胞模型 | 基因表达数据、蛋白质表达数据、组织图像 | 未明确说明样本数量 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 96 | 2026-09-01 |
MFAP4 Deficiency Attenuates Liver Fibrosis by Regulating Hepatic Stellate Cell Fate Through Inhibition of the FAK/PI3K/NFκB Signaling Pathway
2025, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101548
PMID:40449846
|
研究论文 | 该研究揭示了MFAP4通过调控肝星状细胞命运进而影响肝纤维化的机制，为肝纤维化治疗提供了新靶点 | 首次阐明MFAP4通过整合素αvβ3依赖性FAK/PI3K/NFκB信号通路调控肝星状细胞活化和凋亡抵抗的机制，并发现MFAP4介导的正反馈环路 | 研究基于小鼠模型和细胞实验，尚未在人类样本中验证，且未探讨长期抑制MFAP4的潜在副作用 | 探究MFAP4在肝纤维化中的具体作用机制及其对肝星状细胞命运的影响 | 肝星状细胞（HSCs）、MFAP4、整合素αvβ3、FAK/PI3K/NFκB信号通路 | 分子生物学 | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序、组织病理学、双免疫荧光、流式细胞术、Transwell共培养、蛋白质印迹、定量PCR | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、图像、细胞实验数据 | 小鼠模型（CCl4和TAA诱导）、LX-2细胞系 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 97 | 2026-09-01 |
A Reflux Linked GATA Factor Fulcrum Dictates Lineage Commitment Through GPRC5B During the Esophageal Dysplastic Transition
2025, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101552
PMID:40490196
|
研究论文 | 本研究探讨了GATA家族转录因子在食管腺癌发展过程中，通过GPRC5B调节Barrett食管化生-不典型增生转变的机制 | 首次发现GATA因子“支点”通过GPRC5B介导细胞命运决定，并利用空间转录组学和组织芯片识别了高级别不典型增生的新特征 | 未提及明确限制 | 阐明GATA家族成员在Barrett食管向不典型增生转变过程中的致癌机制 | 食管细胞系、病变来源的成体干细胞、TCGA数据、空间转录组和组织芯片 | 数字病理学 | 食管腺癌 | RNA测序、CRISPR基因编辑、空间转录组学、器官芯片 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据、图像 | 未提供具体样本数量 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组平台 |
| 98 | 2026-09-01 |
Regulatory TCRαβ+ Double Negative T Cells Suppress γδ T Cells and Alleviate Colitis
2025, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101553
PMID:40505772
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和过继转移实验，揭示了调节性TCRαβ+双阴性T细胞在结肠炎中通过抑制γδ T细胞反应缓解炎症的作用机制 | 首次阐明了调节性DNT细胞在结肠炎中通过与CD103+ γδ T细胞间的E-cadherin和NKG2D依赖性相互作用发挥免疫抑制功能，并验证了异体DNT细胞过继转移的治疗潜力 | 研究主要基于小鼠模型，结论需进一步在人源样本中验证；DNT细胞亚群的异质性和长期安全性未充分探讨 | 探究调节性TCRαβ+双阴性T细胞在结肠炎中的免疫调节作用及其治疗潜力 | 小鼠结肠炎模型中的调节性TCRαβ+双阴性T细胞和γδ T细胞 | 免疫学 | 炎症性肠病（结肠炎） | 单细胞RNA测序，过继转移 | NA | 单细胞转录组数据（基因表达谱） | 小鼠结肠炎模型及过继转移实验中的小鼠样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 用于单细胞RNA测序，具体配置未在摘要中详述 |
| 99 | 2026-09-01 |
Hepatocyte Apolipoprotein J Accelerates Injury-induced Liver Fibrosis by Activation Signal Transducer and Activator of Transcription 3 Through Ranbp2 Mediated-SUMOylation
2025, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101556
PMID:40545037
|
研究论文 | 该研究探讨了肝细胞中载脂蛋白J通过RanBP2介导的SUMO化修饰激活STAT3信号通路，进而加速损伤诱导的肝纤维化进程 | 首次揭示了ApoJ通过RanBP2介导的STAT3 K679位点SUMO化修饰促进其核转位，激活STAT3通路，从而介导肝细胞与肝星状细胞间旁分泌信号，加速肝纤维化的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，未详细探讨该机制在人类肝纤维化中的保守性及临床干预的可行性 | 明确肝细胞ApoJ如何调控STAT3通路，进而促进肝纤维化的发展，并评估靶向该信号轴的潜在治疗策略 | 肝细胞、肝星状细胞、ApoJ肝细胞特异性敲除和过表达小鼠模型、肝硬化患者及健康对照的单细胞RNA测序数据 | 分子生物学 | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序、基因敲除与过表达模型构建、SUMO化分析、免疫组化、细胞培养等 | 小鼠模型 | 基因表达数据、组织学图像、细胞培养数据 | 涉及多种肝纤维化小鼠模型及肝硬化患者和健康对照的单细胞RNA测序数据集 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 100 | 2026-09-01 |
Histopathologic Evaluation and Single-cell Spatial Transcriptomics of the Colon Reveal Cellular and Molecular Abnormalities Linked to J-Pouch Failure in Patients With Inflammatory Bowel Disease
2025, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101563
PMID:40571096
|
研究论文 | 本研究通过回顾性病例对照研究，结合组织病理学评估和单细胞空间转录组学，揭示了与炎症性肠病患者J型贮袋失败相关的细胞和分子异常 | 首次将单细胞空间转录组学应用于结肠切除标本，以识别与贮袋失败相关的免疫细胞浸润和分子通路，并验证CD68免疫组化作为预测标志物 | 研究为回顾性设计，样本来源单一医疗中心，且空间转录组学分析仅对患者子集进行，可能限制结果的普适性 | 识别与贮袋失败相关的组织病理学特征，并探究其分子机制，以改善回肠贮袋-肛管吻合术（IPAA）的患者预后 | 2000年至2010年间在芝加哥大学医学中心接受IPAA的417例溃疡性结肠炎患者 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞空间转录组学、免疫组化 | NA | 组织病理图像、空间转录组数据 | 417例患者（其中部分子集进行空间转录组学分析） | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |