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当前共找到 2151 篇文献，本页显示第 961 - 980 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 961 | 2025-10-06 |
Deep topic modeling of spatial transcriptomics in the rheumatoid arthritis synovium identifies distinct classes of ectopic lymphoid structures
2025-Jan-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.08.631928
PMID:39829741
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研究论文 | 开发DeepTopics方法分析类风湿关节炎滑膜空间转录组数据，识别异位淋巴结构的细胞组成和微环境特征 | 提出基于狄利克雷变分自编码器的无参考解卷积方法DeepTopics，首次在类风湿关节炎滑膜中发现两种不同的异位淋巴结构细胞模式 | 仅分析6名患者的8个滑膜组织样本，样本量有限 | 研究类风湿关节炎滑膜中细胞类型相互作用和微环境对细胞状态的影响 | 类风湿关节炎患者的滑膜组织和异位淋巴结构 | 空间转录组学 | 类风湿关节炎 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | 狄利克雷变分自编码器 | 空间转录组数据 | 6名患者的8个滑膜组织样本 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 962 | 2025-10-06 |
scProAtlas: an atlas of multiplexed single-cell spatial proteomics imaging in human tissues
2025-Jan-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae990
PMID:39526396
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研究论文 | 构建了一个名为scProAtlas的多重单细胞空间蛋白质组学成像图谱数据库 | 开发了首个整合多种空间蛋白质组学技术的综合性功能注释知识库，包含近1,750万个细胞的详细空间信息 | 与空间转录组学相比，空间蛋白质组学检测的蛋白质数量有限 | 帮助用户全面理解不同组织类型在单细胞分辨率和多尺度下的空间背景 | 人类组织中的细胞空间分布 | 数字病理学 | NA | 空间蛋白质组学成像 | NA | 空间蛋白质组学图像数据 | 17,468,394个细胞，来自15种组织的945个感兴趣区域 | NA | 空间蛋白质组学成像 | NA | 八种空间蛋白质成像技术 |
| 963 | 2025-10-06 |
Spatial Expression of Long Non-Coding RNAs in Human Brains of Alzheimer's Disease
2025-Jan-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.27.620550
PMID:39554066
|
研究论文 | 通过空间转录组学分析阿尔茨海默病患者大脑中长链非编码RNA的空间表达模式 | 首次系统绘制人类大脑中lncRNA的空间表达图谱，发现lncRNA比mRNA具有更强的亚区域特异性表达 | 样本量相对有限（78个脑切片，21名参与者），仅分析前额叶皮层区域 | 探索长链非编码RNA在阿尔茨海默病发病机制中的空间表达和功能作用 | ROSMAP研究参与者的78个死后大脑切片 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | 网络分析，统计建模 | 空间转录组数据 | 78个脑切片来自21名ROSMAP参与者 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 964 | 2025-10-06 |
Characterizing the immune infiltrate in secondary syphilis: implications for transmission and pathology
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1549206
PMID:40201184
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研究论文 | 本研究通过免疫组织化学和单细胞RNA测序分析二期梅毒皮肤病变的免疫浸润特征 | 首次揭示表皮TLR通过MYD88感知梅毒螺旋体的机制，以及病原体在皮肤中逃避免疫反应的策略 | 研究样本仅限于皮肤活检和体外细胞实验，未涵盖其他组织或临床阶段 | 阐明梅毒螺旋体在皮肤中的免疫逃避机制和宿主免疫反应特征 | 二期梅毒患者的皮肤活检组织、健康人PBMCs、原代和MyD88敲除角质形成细胞 | 数字病理学 | 梅毒 | 免疫组织化学, bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 转录组数据 | 二期梅毒皮肤活检样本、健康人PBMCs、原代角质形成细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 965 | 2025-10-06 |
FlyPhoneDB2: A computational framework for analyzing cell-cell communication in Drosophila scRNA-seq data integrating AlphaFold-multimer predictions
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.06.032
PMID:40677242
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研究论文 | 介绍FlyPhoneDB2计算框架，用于分析果蝇单细胞RNA测序数据中的细胞间通讯，整合了AlphaFold-multimer预测 | 显著扩展了配体-受体对知识库，整合哺乳动物物种注释和AlphaFold-Multimer结构预测，优化算法性能并增加新功能 | 原始FlyPhoneDB受限于可用配体-受体对数量较少 | 开发改进的计算工具来分析细胞间通讯 | 果蝇单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序，AlphaFold-Multimer预测 | 计算框架 | 单细胞RNA测序数据 | 果蝇全身单核RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 966 | 2025-10-06 |
Medulloblastoma: biology and immunotherapy
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1602930
PMID:40677711
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综述 | 本文综述了髓母细胞瘤的生物学特征及免疫治疗最新进展 | 整合单细胞转录组学对髓母细胞瘤亚型的新发现，系统探讨肿瘤微环境与免疫治疗的关联机制 | NA | 探讨髓母细胞瘤生物学特性与免疫治疗策略的协同应用 | 髓母细胞瘤及其肿瘤微环境组分 | NA | 髓母细胞瘤 | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 967 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomic analysis of 4NQO-induced tongue cancer revealed cellular lineage diversity and evolutionary trajectory
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1592044
PMID:40678065
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研究论文 | 通过空间转录组学分析4NQO诱导的舌癌，揭示细胞谱系多样性和进化轨迹 | 首次结合人工智能算法和空间转录组学技术系统描绘4NQO诱导舌癌的空间时间演化过程，识别出13个细胞亚群和肿瘤侵袭相关开关基因 | 基于化学诱导的舌癌模型，与人类自发舌癌可能存在差异 | 阐明化学诱导舌癌的细胞谱系多样性和肿瘤进化轨迹 | 4NQO诱导的舌癌组织 | 空间转录组学 | 舌癌 | 空间转录组测序, AI算法 | AI分类器 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 968 | 2025-10-06 |
FN1 from cancer-associated fibroblasts orchestrates pancreatic cancer metastasis via integrin-PI3K/AKT signaling
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1595523
PMID:40678072
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研究论文 | 本研究揭示了癌症相关成纤维细胞中FN1通过整合素-PI3K/AKT信号轴驱动胰腺癌转移的分子机制 | 首次发现FN1在转移性CAF亚群中高表达，并通过整合素受体激活PI3K/AKT通路，同时证明其双重作用：直接促进肿瘤侵袭和间接形成免疫抑制微环境 | 研究主要基于体外实验和生物信息学分析，缺乏体内动物模型验证 | 阐明癌症相关成纤维细胞在胰腺导管腺癌转移中的具体分子机制 | 胰腺导管腺癌(PDAC)、癌症相关成纤维细胞(CAFs) | 癌症生物学 | 胰腺癌 | 转录组测序、单细胞测序、Western blotting、qRT-PCR、Transwell迁移实验 | NA | 基因表达数据、单细胞数据、临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、转录组测序 | NA | NA |
| 969 | 2025-10-06 |
Cooling Blood and Detoxicating Formula Treats Psoriasis Through RHCG-Related Mechanisms
2025, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/ijog/5132158
PMID:40678620
|
研究论文 | 本研究探讨凉血解毒方通过RHCG相关机制治疗银屑病的潜力 | 首次结合网络药理学、单细胞RNA测序和空间转录组学技术系统揭示凉血解毒方治疗银屑病的作用机制，并发现RHCG是关键作用靶点 | 需要进一步的临床验证和机制研究 | 探索凉血解毒方治疗银屑病的治疗潜力和作用机制 | 银屑病实验模型 | 生物医学 | 银屑病 | 网络药理学,单细胞RNA测序,空间转录组学,分子对接 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 970 | 2025-10-06 |
Evaluating transcriptional tumour microenvironment response to immunotherapy using microarray analysis: From harvesting tumours to data analysis
2025, Methods in cell biology
DOI:10.1016/bs.mcb.2025.01.004
PMID:40683680
|
研究论文 | 本文介绍了一种使用微阵列转录组分析评估肿瘤对免疫治疗反应的实验方案 | 提供了一种在不需要单细胞RNA测序详细程度的情况下，经济有效地评估肿瘤微环境对免疫治疗转录反应的方法 | 该方法分辨率低于单细胞RNA测序，仅适用于研究广泛的转录反应 | 评估肿瘤微环境对免疫治疗的转录反应 | 肿瘤组织和肿瘤微环境 | 生物信息学 | 肿瘤 | 微阵列转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 微阵列分析 | NA | NA |
| 971 | 2025-10-06 |
Guidelines for the assessment of high endothelial venule functionality and health
2025, Methods in cell biology
DOI:10.1016/bs.mcb.2025.02.001
PMID:40683671
|
指南 | 本文开发了评估高内皮微静脉在应激条件下功能状态的操作指南 | 首次建立了系统性评估HEV在炎症和淋巴结转移等应激条件下功能变化的标准化方法 | 未提及具体验证数据或临床应用范围 | 建立高内皮微静脉功能评估的共识指南 | 高内皮微静脉 | 病理学 | 炎症性疾病 | 免疫荧光染色，单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质表达数据，RNA表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 972 | 2025-10-06 |
Multimodal hierarchical classification of CITE-seq data delineates immune cell states across lineages and tissues
2025-Jan-27, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2024.100938
PMID:39814026
|
研究论文 | 开发了一种名为MMoCHi的多模态分层分类方法，用于准确注释CITE-seq数据中的免疫细胞状态 | 提出不依赖参考图谱的基于标记物的多模态分类方法，能够整合跨谱系、样本或模态的细胞类型注释 | NA | 开发能够整合多模态单细胞数据的准确细胞类型分类方法 | 免疫细胞，特别是T淋巴细胞亚群和跨组织人类免疫细胞 | 生物信息学 | NA | CITE-seq, 单细胞RNA测序 | 分层分类器 | 单细胞转录组数据, 表面蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 表面蛋白质组分析 | NA | NA |
| 973 | 2025-10-06 |
CD8 + T cells mediate vaccination-induced lymphatic containment of latent Mycobacterium tuberculosis infection following immunosuppression, while B cells are dispensable
2025-Jan-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.23.634479
PMID:39896630
|
研究论文 | 本研究通过小鼠模型揭示了CD8+T细胞在疫苗接种预防潜伏结核感染再激活中的关键作用 | 首次发现CD8+T细胞在缺乏CD4+T细胞情况下仍能介导疫苗接种对潜伏结核感染的淋巴控制 | 研究基于小鼠模型，结果需要在人类中进一步验证 | 阐明潜伏结核感染免疫控制与再激活的免疫学机制 | 潜伏结核分枝杆菌感染的小鼠模型 | 免疫学 | 结核病 | 空间转录组学、多参数成像、网络分析、生物信息学整合 | NA | 组织病理学图像、转录组数据 | 多种免疫细胞缺陷小鼠品系 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 974 | 2025-10-06 |
Aberrant Activation of Wound-Healing Programs within the Metastatic Niche Facilitates Lung Colonization by Osteosarcoma Cells
2025-Jan-17, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-0049
PMID:39540841
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示骨肉瘤细胞通过诱导肺组织异常伤口愈合程序促进转移灶形成的机制 | 首次发现骨肉瘤细胞通过诱导肺泡上皮损伤激活慢性不愈合的伤口愈合表型，并证实抗纤维化药物尼达尼布可阻断此过程 | 研究主要基于小鼠模型和异种移植模型，人类样本验证有限 | 阐明骨肉瘤肺转移微环境形成的细胞和分子机制，寻找转移特异性治疗靶点 | 骨肉瘤细胞、肺转移微环境中的肿瘤和非肿瘤细胞 | 单细胞组学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 蛋白质表达数据 | 免疫活性小鼠模型、免疫缺陷人源异种移植模型和患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 975 | 2025-10-06 |
Single-cell analysis reveals Mycobacterium tuberculosis ESX-1-mediated accumulation of permissive macrophages in infected mouse lungs
2025-Jan-17, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adq8158
PMID:39813329
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示了结核分枝杆菌ESX-1系统在感染小鼠肺部促进易感巨噬细胞积累的机制 | 首次系统揭示ESX-1系统通过调控肺单核吞噬细胞异质性和免疫逃避特征促进结核分枝杆菌生存的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类相关性需进一步验证 | 探究结核分枝杆菌ESX-1分泌系统对肺单核吞噬细胞招募和分化的影响 | 感染结核分枝杆菌的小鼠和鼠源骨髓衍生巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 结核病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 多个小鼠模型和骨髓衍生巨噬细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 976 | 2025-10-06 |
Exploring the utility of snRNA-seq in profiling human bladder tissue: A comprehensive comparison with scRNA-seq
2025-Jan-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.111628
PMID:39850354
|
研究论文 | 比较单细胞RNA测序和单核RNA测序在人类膀胱组织细胞类型鉴定中的效用 | 首次在人类膀胱组织中系统比较scRNA-seq和snRNA-seq技术的优势与局限 | 研究仅针对人类膀胱组织，结果可能不适用于其他组织类型 | 确定scRNA-seq和snRNA-seq在表征下尿路细胞类型方面的优势和局限性 | 人类膀胱组织 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq | NA | NA |
| 977 | 2025-10-06 |
Single Cell Transcriptomic Profiling of MYBPC3-Associated Hypertrophic Cardiomyopathy Across Species Reveals Conservation of Biological Process But Not Gene Expression
2025-Jan-07, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.124.035780
PMID:39719426
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析比较不同物种中MYBPC3相关肥厚型心肌病的生物学过程 | 首次在猫、人类和小鼠中比较MYBPC3相关肥厚型心肌病的单细胞转录组特征，发现生物学过程保守但驱动基因存在物种差异 | 仅关注MYBPC3相关突变，未涵盖其他HCM相关基因突变 | 阐明不同物种间MYBPC3相关肥厚型心肌病的共同和特异性病理通路 | 携带MYBPC3变异的猫、人类和小鼠心脏组织 | 单细胞生物学 | 肥厚型心肌病 | 单核RNA测序 | 基于模型的单细胞转录组分析算法 | 单细胞RNA测序数据 | 猫、人类和小鼠多个物种的心脏组织样本 | NA | 单核RNA测序 | NA | NA |
| 978 | 2025-10-06 |
CellChat for systematic analysis of cell-cell communication from single-cell transcriptomics
2025-Jan, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01045-4
PMID:39289562
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研究论文 | 介绍用于单细胞转录组数据细胞间通讯系统分析的CellChat v2工具及其使用流程 | 开发了包含扩展配体-受体对数据库、比较功能模块和交互式探索器的CellChat v2更新版本 | 需要基本的R语言和单细胞数据分析知识，处理时间取决于数据集大小 | 系统分析细胞间通讯网络 | 单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组测序 | 基于质量作用定律的简化模型，机器学习方法 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 979 | 2025-10-06 |
Single-Cell Profiling of Lineages and Cell Types in the Vertebrate Brain
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4310-5_15
PMID:39745647
|
研究论文 | 本研究开发了scGESTALTv2技术，结合CRISPR-Cas9谱系追踪和单细胞RNA测序，用于脊椎动物大脑发育过程中的细胞谱系和类型分析 | 开发了scGESTALTv2技术，将累积性CRISPR-Cas9编辑与单细胞转录组分析相结合，实现单细胞分辨率的可扩展谱系追踪 | NA | 研究脊椎动物大脑发育过程中的细胞谱系关系和细胞类型鉴定 | 斑马鱼发育中的大脑细胞 | 单细胞生物学 | NA | CRISPR-Cas9基因编辑, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 数千个脑细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 基于液滴的单细胞RNA测序 |
| 980 | 2025-10-06 |
Single-cell analysis of CD14+CD16+ monocytes identifies a subpopulation with an enhanced migratory and inflammatory phenotype
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1475480
PMID:40051633
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析CD14+CD16+单核细胞，发现具有增强迁移和炎症表型的亚群 | 首次在CD14+CD16+单核细胞中识别出具有独特炎症特征的Group 1亚群，并发现其与神经炎症疾病的潜在关联 | 研究主要基于体外实验，需要进一步体内验证；样本来源和数量未明确说明 | 探索CD14+CD16+单核细胞的异质性及其在神经炎症疾病中的作用 | 人类CD14+CD16+单核细胞 | 单细胞生物学 | 神经炎症疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |