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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 941 | 2025-10-06 |
TSLP pretreatment inhibits M1 macrophage polarization and attenuates LPS-induced iNKT cell-dependent acute lung injury
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1583235
PMID:40486522
|
研究论文 | 本研究探讨TSLP预处理通过抑制M1巨噬细胞极化和iNKT细胞依赖途径减轻LPS诱导的急性肺损伤 | 首次揭示TSLP在脓毒症相关ARDS中的保护作用机制,发现其通过调控iNKT细胞和巨噬细胞极化发挥作用 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化价值需进一步验证;机制研究尚未完全阐明所有信号通路 | 探究TSLP在脓毒症相关急性呼吸窘迫综合征中的作用机制 | 野生型小鼠、Jα18-/-基因敲除小鼠、骨髓源性巨噬细胞 | 免疫学 | 急性肺损伤/ARDS | 转录组测序、单细胞转录组测序、流式细胞术 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | 小鼠模型和体外细胞实验 | NA | 单细胞转录组测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 942 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptomic Profiling Reveals KRAS/TP53-Driven Neutrophil Reprogramming in Luad: A Multi-Gene Prognostic Model and Therapeutic Targeting of RHOV
2025, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2025.062584
PMID:40486872
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了KRAS/TP53突变驱动的中性粒细胞重编程在肺腺癌中的作用,并开发了五基因预后模型 | 首次系统揭示KRAS/TP53突变通过OSM/CALCR/IL-1信号通路驱动中性粒细胞异质性重编程,建立首个中性粒细胞中心的五基因预后特征 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证仅限于细胞系模型,缺乏体内动物实验验证 | 阐明KRAS/TP53突变对肿瘤微环境异质性的影响,开发肺腺癌预后预测模型 | 肺腺癌患者样本、A549/H1299肺癌细胞系 | 生物信息学、癌症生物学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序、转录组分析、siRNA敲低、CCK8检测、伤口愈合实验、transwell实验 | hdWGCNA、Cox回归、LASSO回归、预后列线图 | 单细胞RNA测序数据、转录组数据、临床数据 | TCGA-LUAD队列、IMvigor210免疫治疗队列、GSE78220数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 943 | 2025-10-06 |
Topology entropy: Enhancing graph partitioning for TAD identification and single-cell clustering
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.04.037
PMID:40487196
|
研究论文 | 本文提出拓扑熵概念用于量化生物图复杂度,并开发了TEC-O和TEC-U两种图分区方法 | 首次将拓扑熵应用于生物图复杂度量化,证明最小化熵等价于最优图分区,开发了针对有序和无序生物图的专用方法 | NA | 开发能够捕捉生物图复杂结构的有效度量方法 | Hi-C接触图谱中的拓扑关联域和单细胞测序数据中的细胞聚类 | 生物信息学 | NA | 图分区算法 | TEC-O, TEC-U | Hi-C接触图谱,单细胞测序数据 | 5个细胞系的Hi-C数据和10个单细胞测序数据集 | NA | Hi-C,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 944 | 2025-10-06 |
Exploring the anti-gastric cancer mechanisms of Diosgenin through integrated network analysis, bioinformatics, single-cell sequencing, and cell experiments
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1600960
PMID:40487391
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研究论文 | 本研究通过整合网络分析、生物信息学、单细胞测序和细胞实验,系统探索薯蓣皂苷元抗胃癌的作用机制 | 首次采用多方法策略(网络分析、生物信息学、单细胞RNA测序、孟德尔随机化和细胞实验)系统研究薯蓣皂苷元的抗胃癌机制 | NA | 全面研究薯蓣皂苷元抗胃癌的作用机制 | 胃癌细胞 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 加权基因共表达网络分析, 孟德尔随机化, 蛋白质印迹分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据, 蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 945 | 2025-10-06 |
Single-cell and transcriptomic analyses reveal the role of PCDH17 in the non-inflammatory tumor microenvironment of pancreatic cancer
2025, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2025.1559909
PMID:40487760
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研究论文 | 本研究通过单细胞和转录组分析揭示了PCDH17在胰腺癌非炎症性肿瘤微环境中的作用机制 | 首次系统阐明PCDH17在胰腺癌内皮细胞中的表达特征及其与炎症基因和免疫细胞浸润的关联 | PCDH17调控肿瘤微环境的具体分子机制仍需进一步验证 | 探究PCDH17在胰腺癌肿瘤微环境调控中的作用机制 | 胰腺癌组织样本和单细胞测序数据 | 单细胞分析 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,免疫荧光 | NA | 单细胞测序数据,转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 946 | 2025-10-06 |
Utilizing Multi-omics analysis to elucidate the role of mitochondrial gene defects in Gastric cancer progression
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0325520
PMID:40489463
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示线粒体自噬相关基因在胃癌进展中的作用 | 首次结合bulk RNA-seq和单细胞RNA测序数据,识别出8个线粒体自噬相关预后基因并构建风险评分模型 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析,需要进一步实验验证 | 阐明线粒体自噬相关基因在胃癌进展中的作用机制 | 胃癌组织和细胞 | 生物信息学 | 胃癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 生物信息学分析 | LASSO-Cox回归, 风险评分模型 | 基因表达数据 | TCGA和GEO数据库中的胃癌样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 947 | 2025-10-06 |
Integration of Bulk and Single-Cell Transcriptomics Reveals BCL2L14 as a Novel IGKC+ T Cell-Associated Therapeutic Target in Breast Cancer
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S523147
PMID:40491783
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk转录组数据,发现BCL2L14是乳腺癌中新型IGKC+ T细胞亚群的关键调控因子和潜在治疗靶点 | 首次识别出IGKC+ T细胞亚群,并确定BCL2L14作为该亚群中驱动乳腺癌进展的关键基因 | 研究主要基于转录组数据分析,需要更多实验验证BCL2L14的临床转化价值 | 识别乳腺癌肿瘤微环境中的新型T细胞亚群及相关生物标志物,为靶向治疗提供新策略 | 乳腺癌患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,机器学习算法,体外功能验证 | 预后风险模型,列线图 | 转录组数据 | 多个乳腺癌队列样本 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 948 | 2025-10-06 |
GSDMD is a novel predictive biomarker for immunotherapy response: in the pan-cancer and single cell landscapes
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1570901
PMID:40491921
|
研究论文 | 本研究通过泛癌分析和单细胞测序揭示了GSDMD作为免疫治疗反应预测生物标志物的潜力 | 首次在泛癌水平和单细胞景观中系统评估GSDMD作为免疫治疗预测生物标志物的价值,并发现PARPi通过增强GSDMD介导的焦亡发挥抗肿瘤作用 | 研究主要基于生物信息学分析,需要更多实验验证GSDMD的临床预测价值 | 探索GSDMD作为免疫治疗反应预测生物标志物的潜力 | 多种肿瘤类型和免疫细胞 | 生物信息学 | 泛癌 | 单细胞RNA测序, 类器官功能实验 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | TCGA数据集中的多种肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 949 | 2025-10-06 |
A telomere-associated molecular landscape reveals immunological, microbial, and therapeutic heterogeneity in colorectal cancer
2025, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2025.1615533
PMID:40492114
|
研究论文 | 本研究开发了一种名为TELscore的端粒评分系统,用于揭示结直肠癌中免疫、微生物和治疗异质性 | 首次整合转录组和瘤内微生物组数据构建端粒评分系统,全面表征了结直肠癌中端粒生物学与免疫微环境、微生物生态和治疗反应的关联 | 基于公共数据库的回顾性分析,需要前瞻性研究验证临床实用性 | 开发端粒相关分子标志物用于结直肠癌患者分层和精准治疗 | 结直肠癌患者队列 | 数字病理 | 结直肠癌 | 转录组测序, 16S rRNA测序, 单细胞RNA测序, 免疫组化, 全切片图像分析 | NA | 转录组数据, 微生物组数据, 病理图像, 单细胞数据 | 多个独立结直肠癌队列 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 微生物组测序 | NA | NA |
| 950 | 2025-10-06 |
Unveiling fatty acid subtypes: immunometabolic interplay and therapeutic opportunities in gastric cancer
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1570873
PMID:40492126
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于脂肪酸代谢基因的预测模型,用于评估胃癌患者的预后和治疗指导 | 首次通过整合脂肪酸代谢相关基因构建胃癌预后预测模型,并结合单细胞RNA测序和代谢组学验证基因表达特征 | 模型在不同验证数据集中的AUC值存在差异(0.508-0.86),需要进一步临床验证 | 开发基于脂肪酸代谢基因的预测特征来评估胃癌患者预后 | 胃癌患者 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序,代谢组学,转录组学,随机森林模型,Cox回归分析 | 随机森林,Cox比例风险模型 | 基因表达数据,代谢物数据 | 多个胃癌数据集的患者样本 | NA | 单细胞RNA测序,代谢组学,转录组学 | NA | NA |
| 951 | 2025-10-06 |
Fibroblast Heterogeneity in Hepatocellular Carcinoma and Identification of Prognostic Markers Based on Single-cell Transcriptome Analysis
2025, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示肝细胞癌中成纤维细胞的异质性及其预后标志物 | 首次在单细胞水平系统揭示HCC成纤维细胞的转录调控机制,发现染色体6p拷贝数缺失与CEBPD、FOSB转录因子的预后价值 | 样本来源单一数据库,功能验证实验有限 | 探索肝细胞癌中成纤维细胞的复杂作用及转录调控机制 | 肝细胞癌组织中的成纤维细胞及其他肿瘤微环境细胞 | 单细胞转录组学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,qRT-PCR,Transwell实验 | Seurat,inferCNV,CellChat,Monocle 2,SCENIC | 单细胞转录组数据 | GSE149614数据库中的非肿瘤肝组织和原发肿瘤组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 952 | 2025-10-06 |
Ferroptosis in idiopathic pulmonary fibrosis: mechanisms, impact, and therapeutic opportunities
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1567994
PMID:40469306
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综述 | 本文系统阐述了铁死亡在特发性肺纤维化中的机制、影响及治疗机遇 | 首次整合单细胞RNA测序定义的细胞异质性与铁死亡机制,提出精准抗纤维化治疗新框架 | 铁死亡在IPF中的具体分子调控网络仍需进一步实验验证 | 探讨铁死亡在特发性肺纤维化发病机制中的作用及靶向治疗策略 | 肺泡上皮细胞、巨噬细胞、成纤维细胞亚群 | 病理机制研究 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序、分子谱分析 | NA | 文献数据、分子机制数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 953 | 2025-10-06 |
Toward precision oncology in LUAD: a prognostic model using single-cell sequencing and WGCNA based on a disulfidptosis relative gene signature
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1581915
PMID:40469299
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研究论文 | 本研究基于双硫死亡相关基因构建了肺腺癌预后模型,并探讨了KCNK1的致癌作用 | 首次结合单细胞测序和WGCNA分析双硫死亡相关基因在肺腺癌中的预后价值,并发现KCNK1作为潜在治疗靶点 | 研究主要基于生物信息学分析,需要进一步实验验证 | 开发肺腺癌预后预测模型并探索新的治疗靶点 | 肺腺癌患者和肿瘤细胞 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, WGCNA, LASSO回归, Cox回归, ssGSEA | 预后风险模型 | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | TCGA肺腺癌数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 954 | 2025-10-06 |
Exploring the landscape of Parkinson's disease transcriptomics: a quantitative review of research progress and future directions
2025, Frontiers in aging neuroscience
IF:4.1Q2
DOI:10.3389/fnagi.2025.1505374
PMID:40469842
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综述 | 本研究通过文献计量分析揭示了帕金森病转录组学领域的研究格局和新兴趋势 | 首次对2011-2025年帕金森病转录组学研究进行全面文献计量分析,识别了单细胞和空间转录组学技术进步驱动的研究热潮 | 存在数据异质性和生物标志物验证高失败率等挑战 | 探索帕金森病转录组学领域的研究进展和未来方向 | 帕金森病转录组学研究文献 | 生物信息学 | 帕金森病 | 文献计量分析 | NA | 文献数据 | 208篇研究文章 | NA | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 955 | 2025-10-06 |
Expression and potential regulatory mechanism of cellular senescence-related genes in Alzheimer's disease based on single-cell and bulk RNA datasets
2025, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2025.1595847
PMID:40470298
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk RNA测序数据,识别了阿尔茨海默病中细胞衰老相关基因的表达模式和潜在调控机制 | 首次通过整合单细胞和bulk RNA测序数据系统分析AD中细胞衰老相关基因的调控网络,并识别了关键细胞亚型和潜在治疗靶点 | 研究结果需要进一步实验验证,样本来源和数量未明确说明 | 阐明细胞衰老在阿尔茨海默病发病机制中的关键作用 | 阿尔茨海默病患者脑组织细胞 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,基因富集分析 | UMAP聚类分析 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 956 | 2025-10-06 |
Biological and prognostic insights into the prostaglandin D2 signaling axis in lung adenocarcinoma
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1562261
PMID:40474982
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA数据分析揭示了肺腺癌肿瘤微环境中前列腺素D2信号轴的作用机制及其临床意义 | 首次系统性地揭示了前列腺素D2在肺腺癌肿瘤微环境中的细胞间通讯机制,并发现其与免疫细胞浸润和患者预后的关联 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证相对有限,需要进一步的功能性实验证实信号轴的具体作用机制 | 探索肺腺癌肿瘤微环境中代谢物介导的细胞间通讯机制,特别关注前列腺素D2信号轴 | 肺腺癌肿瘤微环境中的各种细胞类型,包括成纤维细胞、浆细胞样树突状细胞、肥大细胞、NK/T细胞和内皮细胞 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 荧光原位杂交, ESTIMATE算法, ssGSEA算法 | MEBOCOST, Seurat | 单细胞RNA测序数据, 批量RNA测序数据 | TCGA-LUAD数据集和两个GEO数据集,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 957 | 2025-10-06 |
Single-cell and bulk transcriptome analyses reveal elevated amino acid metabolism promoting tumor-directed immune evasion in colorectal cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1575829
PMID:40475762
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研究论文 | 通过单细胞和批量转录组分析揭示结直肠癌中氨基酸代谢升高促进肿瘤导向的免疫逃逸 | 开发了基于AUCell算法的氨基酸代谢评分系统,首次系统揭示了肿瘤细胞氨基酸代谢与免疫检查点抑制剂耐药性的关联机制 | 样本量相对有限,需要更大规模队列验证;机制研究主要基于体外实验,缺乏体内验证 | 探究结直肠癌中肿瘤细胞代谢异质性对肿瘤免疫微环境的影响 | 结直肠癌患者肿瘤组织中的上皮细胞和肿瘤浸润免疫细胞 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,批量转录组分析,体外共培养实验 | LASSO回归,Cox回归,机器学习风险评分模型 | 基因表达数据 | 17例接受PD-1阻断治疗的CRC患者的46,374个上皮细胞,另加23例CRC患者的单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA测序,批量转录组测序 | NA | NA |
| 958 | 2025-10-06 |
Expression of PSMD14 in lung adenocarcinoma and its impact on immune cell infiltration and prognosis: a comprehensive analysis based on RNA and single-cell RNA sequencing
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1560693
PMID:40475775
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研究论文 | 通过RNA测序和单细胞RNA测序综合分析PSMD14在肺腺癌中的表达及其对免疫细胞浸润和预后的影响 | 首次系统揭示PSMD14在肺腺癌中高表达并与JAMM家族成员正相关,发现其与免疫细胞浸润和免疫检查点分子的关联 | 未明确PSMD14影响免疫细胞浸润的具体分子机制 | 探索PSMD14在肺腺癌中的表达特征及其对肿瘤免疫和临床预后的影响 | 肺腺癌患者组织和细胞 | 生物信息学 | 肺癌 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 免疫组织化学 | NA | RNA测序数据, 单细胞RNA测序数据, 临床数据 | 肺腺癌患者组织样本 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 959 | 2025-10-06 |
Metabolic profiles in laryngeal cancer defined two distinct molecular subtypes with divergent prognoses
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1512502
PMID:40475768
|
研究论文 | 通过多组学分析定义了喉癌的两种代谢相关分子亚型,并开发了诊断和预后预测模型 | 首次基于代谢特征对喉癌进行分子分型,并整合转录组、突变、甲基化和单细胞RNA测序数据进行综合验证 | 样本量相对有限,需要更大规模的前瞻性研究验证 | 识别喉癌的代谢相关分子亚型并开发诊断预后模型 | 喉癌患者 | 生物信息学 | 喉癌 | 转录组测序, 突变分析, 甲基化分析, 单细胞RNA测序 | LASSO Cox回归, 随机森林 | 基因表达数据, 突变数据, 甲基化数据, 单细胞数据 | TCGA数据集114例患者,外加三个独立批量RNA数据集和一个单细胞RNA测序数据集验证 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 960 | 2025-10-06 |
Tumor-infiltrating lymphocytes in cancer immunotherapy: from chemotactic recruitment to translational modeling
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1601773
PMID:40475782
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综述 | 本文系统探讨肿瘤浸润淋巴细胞在癌症免疫治疗中的作用机制、临床价值及转化前景 | 整合TIL表型功能多样性、临床转化挑战及新兴技术应用,提供个性化免疫治疗综合框架 | 未涉及具体临床试验数据,主要基于现有研究进行理论整合 | 阐明肿瘤浸润淋巴细胞在肿瘤免疫微环境中的作用及免疫治疗应用策略 | 肿瘤浸润淋巴细胞(CD8+T细胞、CD4+T细胞、调节性T细胞、B细胞、NK细胞)及肿瘤微环境 | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 单细胞测序、新抗原预测、生物材料平台 | NA | 文献资料 | NA | NA | NA | NA | NA |