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当前共找到 2151 篇文献，本页显示第 921 - 940 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 921 | 2025-10-06 |
Cross-talk of m6A methylation modification and the tumor microenvironment composition in esophageal cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1572810
PMID:40692788
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析探讨m6A甲基化修饰与食管癌肿瘤微环境组成的相互作用 | 首次在食管癌中系统分析m6A修饰模式与肿瘤微环境特征的关系，并开发了基于主成分分析的m6A评分系统 | 研究主要基于生物信息学分析，需要实验验证来确认机制 | 阐明m6A甲基化修饰在食管癌肿瘤微环境形成和免疫调节中的作用 | 食管癌患者样本和相关的基因表达数据 | 生物信息学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序，共识聚类算法，主成分分析 | 共识聚类算法 | 基因表达数据，临床数据 | 来自TCGA和GEO数据库的食管癌数据集 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 922 | 2025-10-06 |
Integrating GEO Database, Mendelian Randomization, and Molecular Docking to Identify HLA-C as a Potential Therapeutic Target for Periodontitis
2025, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/9163431
PMID:40692979
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研究论文 | 通过整合GEO数据库、孟德尔随机化和分子对接技术，识别HLA-C作为牙周炎的潜在治疗靶点 | 首次结合基因表达数据库、孟德尔随机化分析和分子动力学模拟验证HLA-C在牙周炎中的作用及甲硝唑的潜在治疗价值 | 研究主要基于生物信息学分析，缺乏实验验证 | 探索牙周炎的分子机制并识别关键治疗靶点 | 牙周炎患者基因表达数据 | 生物信息学 | 牙周炎 | 微阵列分析,单细胞RNA测序,分子对接,分子动力学模拟 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA),CIBERSORT,Seurat,CellChat | 基因表达数据 | GSE10334数据集 | NA | 单细胞RNA测序,微阵列 | NA | NA |
| 923 | 2025-10-06 |
Tumor-associated bacteria activate PRDX1-driven glycolysis to promote immune evasion and PD-1 antibody resistance in hepatocellular carcinoma
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1599691
PMID:40693141
|
研究论文 | 本研究揭示了肿瘤相关细菌通过激活PRDX1驱动的糖酵解促进肝细胞癌免疫逃避和PD-1抗体耐药的新机制 | 首次发现肿瘤内细菌通过NF-κB通路诱导PRDX1表达，进而驱动代谢重编程导致PD-1治疗耐药 | 样本量相对有限（29例临床样本），需在更大队列中验证 | 探究细菌感染如何通过重塑肿瘤代谢影响抗PD-1疗法疗效 | 肝细胞癌患者样本和原位肝癌小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 16S rRNA基因测序，单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 基因测序数据，流式细胞数据 | 29例HCC临床样本，12,487个单细胞，每组8只小鼠的动物模型 | NA | 16S rRNA测序，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 924 | 2025-10-06 |
Hepatocellular carcinoma hosts cholinergic neural cells and tumoral hepatocytes harboring targetable muscarinic receptors
2025-Jan, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2024.101245
PMID:39717507
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研究论文 | 本研究鉴定肝细胞癌中存在胆碱能神经细胞和表达靶向性毒蕈碱受体的肿瘤肝细胞 | 首次在人类肝细胞癌中发现密集的DCX+、synaptophysin+、NeuN+、VAChT+神经细胞簇，提出神经元评分新概念，揭示胆碱能极性重构与HCC进展的关联 | 研究主要基于回顾性队列和体外实验，需要前瞻性临床试验验证胆碱能药物的治疗效果 | 探索肝细胞癌中神经支配特征及其在肿瘤发生发展中的作用 | 人类肝细胞癌组织、TCGA数据集、欧洲验证队列、大鼠HCC模型、HCC细胞系 | 癌症生物学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、生物信息学分析、细胞生物学研究、药理学研究 | NA | 组织样本、测序数据、临床数据 | 法国肝脏生物库、TCGA数据集、多个其他数据集、欧洲验证队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 925 | 2025-10-06 |
Cell signaling characterization for spatial transcriptomics (ST) data using network analysis
2025, Complex networks & their applications XIII : proceedings of the thirteenth International Conference on Complex Networks and Their Applications: COMPLEX NETWORKS 2024. Volume 1. International Conference on Complex Networks and Their Appl...
DOI:10.1007/978-3-031-82435-7_32
PMID:40510773
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研究论文 | 开发了一种基于网络分析的空间转录组学细胞通讯方法 | 提出使用低维嵌入构建空间转录组数据的网络模型，能够同时捕捉配体和受体的表达异质性 | 仅在真实ST数据集上验证了三种相互作用，验证范围有限 | 开发空间转录组数据的细胞通讯分析方法 | 空间转录组数据中的配体-受体相互作用 | 空间转录组学 | NA | 网络分析 | 网络模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 926 | 2025-10-06 |
Melanocyte dysfunctions: future and promise of stem cells
2025, American journal of stem cells
IF:1.5Q4
DOI:10.62347/EOIC7075
PMID:40686746
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综述 | 本文综述了黑素细胞干细胞在皮肤色素沉着和相关疾病中的关键作用及其治疗潜力 | 系统整合了单细胞RNA测序、空间转录组学等前沿技术对黑素细胞干细胞生物学特性的最新发现 | 对黑素细胞功能障碍条件下黑素细胞干细胞特性的全面理解仍显不足 | 探讨黑素细胞干细胞在皮肤稳态维持和再生医学中的应用前景 | 人类黑素细胞和黑素细胞干细胞 | 再生医学 | 白癜风 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,基因编辑,全基因组测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 927 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptome Analyses of Four Pain Related Genes in Osteosarcoma
2025, Cancer informatics
IF:2.4Q3
DOI:10.1177/11769351251331508
PMID:40686838
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析研究骨肉瘤中四个疼痛相关基因的表达模式 | 首次在骨肉瘤中利用单细胞RNA测序技术分析ARTN、PSPN、GDNF和NRTN这四个疼痛相关基因在不同细胞类型中的表达差异 | 仅分析了四个特定基因的表达模式，未深入探讨其功能机制 | 研究骨肉瘤中疼痛相关基因在不同细胞类型中的表达特征 | 人类骨肉瘤组织和16个骨肉瘤细胞系 | 单细胞转录组学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类骨肉瘤组织和16个骨肉瘤细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 928 | 2025-10-06 |
Integrated Single-Cell and Spatial Transcriptomic Analysis Identifies ISR-Related Genes Driving Immune Regulation in Parkinson's Disease
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S521744
PMID:40687147
|
研究论文 | 通过整合单细胞和空间转录组分析，识别帕金森病中驱动免疫调控的ISR相关基因 | 首次整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据，系统识别帕金森病中与整合应激反应相关的关键基因及其在免疫调控中的作用 | 使用公开数据库数据，样本来源和数量可能受限；实验验证主要集中于DDIT4基因 | 探究整合应激反应相关基因在帕金森病进展中的作用机制 | 帕金森病患者脑组织样本、PD细胞模型和小鼠模型 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, Lasso回归, 随机森林算法, GSEA, GSVA, CIBERSORT | 机器学习模型 | 转录组数据, 空间表达数据 | 来自GEO数据库的公开转录组数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 929 | 2025-10-06 |
Integrated Analysis of Ferroptosis- and Cellular Senescence-Related Biomarkers in Atherosclerosis Based on Machine Learning and Single-Cell Sequencing Data
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S529581
PMID:40687151
|
研究论文 | 通过机器学习和单细胞测序数据识别与动脉粥样硬化中铁死亡和细胞衰老相关的生物标志物 | 首次整合铁死亡和细胞衰老相关基因，结合WGCNA和多种机器学习算法识别动脉粥样硬化诊断标志物 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证仅限于动物模型 | 识别动脉粥样硬化中铁死亡和细胞衰老相关的关键基因 | 动脉粥样硬化基因表达数据、单细胞RNA测序数据、动物模型 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、生物信息学分析、机器学习 | 八种机器学习算法 | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | 从GEO数据库获取的多个动脉粥样硬化数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 930 | 2025-10-06 |
Leveraging multiple labeled datasets for the automated annotation of single-cell RNA and ATAC data
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.06.043
PMID:40687986
|
研究论文 | 提出JIND-Multi框架，用于在多个标注数据集间转移细胞类型标签，实现单细胞RNA和ATAC数据的自动注释 | 首个能同时处理scRNA-Seq和scATAC-Seq数据的多数据集标签转移框架，无需配对RNA数据即可注释ATAC数据 | 需要同类型标注数据，对罕见细胞类型的适应性未充分验证 | 开发单细胞数据自动注释方法，解决细胞图谱构建中的批次效应和注释一致性问题 | 单细胞RNA测序和ATAC测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | JIND-Multi框架 | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 931 | 2025-10-06 |
dandelionR: Single-cell immune repertoire trajectory analysis in R
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.06.047
PMID:40687995
|
研究论文 | 开发了一个R包dandelionR，用于单细胞免疫组库轨迹分析 | 首个基于R语言的单细胞免疫组库轨迹分析工具，实现了VDJ特征空间构建和基于扩散映射与吸收马尔可夫链的轨迹分析 | 目前仅提供基础功能，可能缺乏Python版本中的一些高级特性 | 开发单细胞RNA测序和免疫组库测序整合分析的R语言工具 | 淋巴细胞发育研究 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞免疫组库测序 | 扩散映射, 吸收马尔可夫链 | 基因表达数据, 免疫受体序列数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, scVDJ-seq | NA | NA |
| 932 | 2025-10-06 |
Integrated multiomics analysis identifies PHLDA1+ fibroblasts as prognostic biomarkers and mediators of biological functions in pancreatic cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1592416
PMID:40688078
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研究论文 | 本研究通过整合多组学分析开发了一个7基因风险模型，识别PHLDA1+成纤维细胞作为胰腺癌的预后生物标志物和生物学功能介质 | 首次构建了基于7个基因的mCAF相关风险模型，并发现PHLDA1在肿瘤-基质相互作用中的关键介导作用 | CAF亚型的预后和功能贡献仍需进一步深入理解 | 研究胰腺癌中癌症相关成纤维细胞亚型的预后价值和功能作用 | 胰腺癌患者和肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序,共培养实验 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序 | NA | NA |
| 933 | 2025-10-06 |
S100A8/A9 in herpes zoster neuralgia: molecular mechanisms and therapeutic perspectives
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1615638
PMID:40688076
|
综述 | 本文系统阐述了S100A8/A9蛋白复合物在带状疱疹神经痛发病机制中的关键作用及治疗前景 | 首次系统揭示S100A8/A9通过TLR4/TNF信号通路调控神经炎症过程，并作为慢性疼痛转化的关键分子标志物 | 当前治疗策略存在局限性，需要更多临床验证 | 探讨S100A8/A9在带状疱疹神经痛发病机制中的作用及治疗潜力 | 带状疱疹相关神经性疼痛的分子机制 | 神经科学 | 带状疱疹神经痛 | 单细胞测序，多组学分析 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序，多组学分析 | NA | NA |
| 934 | 2025-10-06 |
Integrative single-cell and spatial transcriptomics uncover ELK4-mediated mechanisms in NDUFAB1+ tumor cells driving gastric cancer progression, metabolic reprogramming, and immune evasion
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1591123
PMID:40688093
|
研究论文 | 通过整合单细胞和空间转录组学技术，揭示了ELK4介导的NDUFAB1+肿瘤细胞在胃癌进展、代谢重编程和免疫逃逸中的核心机制 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学识别出C1 NDUFAB1+胃癌细胞亚型，并发现其通过PARs信号通路与成纤维细胞和周细胞相互作用 | 研究主要基于体外实验验证，缺乏体内动物模型验证 | 探索胃癌肿瘤异质性及治疗抵抗机制，开发多靶点综合治疗策略 | 胃癌组织和细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 体外实验 | Seurat, Robust Cell Type Decomposition, CellChat, StLearn | 基因表达数据, 空间分布数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 935 | 2025-10-06 |
Key immune regulators in retinal ischemia-reperfusion injury via RNA sequencing
2025, International journal of ophthalmology
IF:1.9Q2
DOI:10.18240/ijo.2025.07.06
PMID:40688775
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研究论文 | 本研究通过RNA测序技术探索视网膜缺血再灌注损伤中的免疫细胞浸润和分子机制 | 结合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq分析，首次系统鉴定RIRI中的关键免疫调节基因及其在特定免疫细胞中的表达 | 研究主要关注急性期RIRI，未涉及慢性阶段的免疫调节机制 | 探索视网膜缺血再灌注损伤的免疫调控机制并识别潜在治疗靶点 | 视网膜缺血再灌注损伤模型 | 生物信息学 | 视网膜疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, qRT-PCR | 差异基因表达分析, 加权基因共表达网络分析, 蛋白质-蛋白质相互作用网络分析 | 基因表达数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 936 | 2025-10-06 |
Acute Communication Between Microglia and Nonparenchymal Immune Cells in the Anti-Aβ Antibody-Injected Cortex
2025-Jan-29, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.1456-24.2024
PMID:39741000
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析抗Aβ抗体注射后大脑皮层中免疫细胞的急性反应 | 首次揭示抗Aβ抗体暴露后24小时内小胶质细胞与非实质免疫细胞之间通过TGFβ信号通路的强烈通讯 | 仅观察急性时间点（24小时和3天），缺乏长期效应数据；样本量有限 | 探究抗Aβ抗体对大脑免疫反应的急性影响 | 14月龄APP转基因雄性和雌性小鼠 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | APP转基因小鼠皮层组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 937 | 2025-10-06 |
Prediction of Gene Regulatory Connections with Joint Single-Cell Foundation Models and Graph-Based Learning
2025-Jan-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.16.628715
PMID:39975293
|
研究论文 | 提出一种结合单细胞基础模型和图学习的基因调控连接预测框架scRegNet | 首次将单细胞基础模型与联合图学习相结合用于基因调控网络推断 | 需要大量已知TF-DNA结合数据，实验获取成本较高且数量有限 | 解决基因调控连接预测问题，推断缺失的调控相互作用 | 基因调控网络和转录因子-DNA结合 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序，ChIP-seq | 基础模型，图学习 | 基因表达数据，调控相互作用数据 | 七个单细胞RNA测序基准数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 938 | 2025-10-06 |
ARTEMIS integrates autoencoders and Schrödinger Bridges to predict continuous dynamics of gene expression, cell population and perturbation from time-series single-cell data
2025-Jan-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.23.634618
PMID:39896674
|
研究论文 | ARTEMIS整合变分自编码器和薛定谔桥模型，从时间序列单细胞数据中预测基因表达、细胞群体和扰动的连续动态 | 将变分自编码器与非平衡扩散薛定谔桥结合，能够重建细胞轨迹、揭示基因表达动态并恢复细胞群体变化 | 基于单细胞测序数据的破坏性特性，只能获得离散时间点的细胞快照 | 解决单细胞测序数据中细胞轨迹重建和动态过程理解的挑战 | 胰腺β细胞分化、斑马鱼胚胎发生和癌细胞上皮间质转化过程 | 单细胞数据分析 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 变分自编码器(VAE), 非平衡扩散薛定谔桥(uDSB), 前向-后向随机微分方程(SDEs) | 单细胞基因表达数据 | 三个scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 939 | 2025-10-06 |
Sexual dimorphism in the mouse bone marrow niche regulates hematopoietic engraftment via sex-specific Kdm5c/Cxcl12 signaling
2025-Jan-21, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI182125
PMID:39836478
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研究论文 | 本研究揭示了小鼠骨髓微环境中通过性别特异性Kdm5c/Cxcl12信号调控造血植入的性二态性机制 | 首次发现雄性骨髓微环境通过Kdm5c介导的性二态性机制增强造血植入能力，并证明靶向Kdm5c可改善雌性骨髓微环境功能 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类临床中得到验证 | 探究骨髓微环境中的性二态性及其对造血植入的调控机制 | 小鼠骨髓微环境中的瘦素受体表达间充质基质细胞(LepR-MSCs) | 造血生物学 | 造血系统疾病 | 单细胞RNA测序，骨髓移植，共培养实验 | MSC特异性Kdm5c敲除小鼠模型 | 基因表达数据，细胞功能数据 | 未明确样本数量的小鼠实验 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 940 | 2025-10-06 |
Combinatorial phenotypic landscape enables bacterial resistance to phage infection
2025-Jan-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.13.632860
PMID:39868116
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研究论文 | 通过细菌单细胞RNA测序研究噬菌体感染过程中细菌异质性防御机制的表达分布 | 首次在单细胞水平揭示细菌通过多个相变基因位点的组合表达形成抗噬菌体表型景观 | 仅研究了一种人类病原共生菌和一种裂解性噬菌体的相互作用 | 探究细菌群体中抗噬菌体防御机制的异质性表达及其组合保护效应 | 人类病原共生菌及其感染的裂解性噬菌体 | 单细胞生物学 | 细菌感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 约50,000个细菌细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |