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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 881 | 2025-10-06 |
Deciphering spatially confined immune evasion niches in osteosarcoma with 3-D spatial transcriptomics: a literature review
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1640645
PMID:40740859
|
文献综述 | 通过三维空间转录组学技术解析骨肉瘤中空间受限的免疫逃逸生态位 | 首次系统整合三维空间转录组学技术揭示骨肉瘤中多层次免疫逃逸微环境的空间组织结构 | NA | 阐明骨肉瘤免疫逃逸机制并探索空间指导的联合治疗策略 | 骨肉瘤肿瘤微环境及其空间组织结构 | 空间转录组学 | 骨肉瘤 | 三维空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | 基于条形码的转录本捕获与体积重建技术 |
| 882 | 2025-10-06 |
Natural killer cell as a potential predictive biomarker for early immune checkpoint inhibitor-associated cardiovascular adverse events: a retrospective cohort study
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1556373
PMID:40740863
|
研究论文 | 本研究探讨外周免疫细胞对免疫检查点抑制剂相关心血管不良事件的预测价值 | 首次发现基线NK细胞比例可作为早期免疫检查点抑制剂相关心血管不良事件的潜在预测生物标志物 | 回顾性研究设计,样本量有限,需要更大规模的前瞻性研究验证 | 评估外周免疫细胞在预测早期免疫检查点抑制剂相关心血管不良事件中的价值 | 接受免疫检查点抑制剂治疗的癌症患者 | 生物医学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,倾向评分匹配,受试者工作特征曲线分析 | 逻辑回归模型 | 单细胞RNA测序数据,临床数据 | 203名患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 883 | 2025-10-06 |
Multi-Omics Analysis Combined with Machine Learning Identified FABP4 in Smooth Muscle Cells as a Pathogenic Factor in Atherosclerosis
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S519114
PMID:40740974
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析和机器学习方法,识别出平滑肌细胞中的FABP4作为动脉粥样硬化的致病因子 | 首次结合单细胞RNA测序和机器学习技术鉴定出与动脉粥样硬化相关的Scissor+平滑肌细胞亚群,并发现FABP4作为关键致病因子 | 研究主要基于公共数据库和体外实验,需要进一步体内实验验证 | 探索平滑肌细胞在动脉粥样硬化发病机制中的作用并寻找治疗靶点 | 平滑肌细胞(SMCs),特别是与动脉粥样硬化相关的Scissor+ SMCs亚群 | 生物信息学,机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,机器学习,qRT-PCR,药物预测 | LASSO回归,随机森林,支持向量机 | 基因表达数据,单细胞测序数据 | 475个Scissor+ SMCs和1363个Scissor- SMCs,来自多个公共数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 884 | 2025-10-06 |
High fat diet-induced loss of pituitary plasticity in aging female mice with ablated leptin signaling in somatotropes
2025, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2025.1617109
PMID:40741169
|
研究论文 | 本研究探讨高脂饮食对缺乏生长激素细胞瘦素受体的老年雌性小鼠垂体转录组功能的影响 | 首次揭示高脂饮食通过下调翻译调控通路和减少多潜能细胞表达来损害垂体可塑性 | 研究仅限于小鼠模型,未在人类中验证;样本量相对有限 | 研究高脂饮食对缺乏生长激素细胞瘦素受体的老年雌性小鼠垂体功能的影响 | 10月龄缺乏生长激素细胞瘦素受体的雌性小鼠及其同窝对照小鼠 | 单细胞转录组学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序,代谢笼监测,葡萄糖耐量测试 | NA | 单细胞转录组数据,血清激素数据 | 老年雌性突变小鼠和对照小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 885 | 2025-10-06 |
Generating Neuroimmune Assembloids Using Human Induced Pluripotent Stem Cell (iPSC)-Derived Cortical Organoids and Microglia
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/7651_2024_554
PMID:38976205
|
研究论文 | 开发了一种利用人诱导多能干细胞衍生的皮质类器官和小胶质细胞生成神经免疫组装体的新方法 | 首次将小胶质细胞整合到皮质类器官中形成神经免疫组装体,确保小胶质细胞的长期存活和成熟 | 未明确说明组装体的长期稳定性和功能验证的充分性 | 建立包含免疫细胞的脑类器官模型以研究神经系统疾病 | 人诱导多能干细胞衍生的皮质类器官和小胶质细胞 | 干细胞与类器官技术 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序,免疫染色,冷冻切片 | 类器官模型 | 单细胞转录组数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 886 | 2025-10-06 |
Unveiling the Immune Landscape of Delirium through Single-Cell RNA Sequencing and Machine Learning: Towards Precision Diagnosis and Therapy
2025-Jan, Psychogeriatrics : the official journal of the Japanese Psychogeriatric Society
IF:1.7Q3
DOI:10.1111/psyg.13233
PMID:39814058
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和机器学习揭示谵妄免疫景观,探索PI3K-Akt信号通路基因作为生物标志物的潜力 | 首次结合单细胞RNA测序和机器学习方法系统分析术后谵妄的免疫分子机制 | 样本量相对有限(30例患者和30例对照),需要更大规模研究验证 | 识别术后谵妄的预测和诊断生物标志物 | 术后谵妄患者和健康对照者的外周血样本 | 机器学习 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, RT-qPCR | 六种机器学习模型 | 基因表达数据 | 60个样本(30例患者和30例对照) | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 887 | 2025-10-06 |
High cGAS-STING expression associates with improved efficacy of neoadjuvant chemo-immunotherapy in head and neck squamous cell carcinoma
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1584061
PMID:40735041
|
研究论文 | 本研究探讨cGAS-STING表达水平与头颈鳞癌新辅助化疗免疫疗法疗效的关联 | 首次在头颈鳞癌患者中证实cGAS-STING表达与NACI疗效的正相关性,并揭示其通过增强T细胞活化和肿瘤-T细胞相互作用发挥作用的机制 | 样本量较小(38例患者),需更大规模研究验证 | 评估cGAS和STING表达作为头颈鳞癌新辅助化疗免疫疗法疗效预测生物标志物的潜力 | 头颈鳞癌患者 | 癌症免疫学 | 头颈鳞癌 | 免疫组织化学, bulk RNA-seq, scRNA-seq | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 单细胞数据 | 38例头颈鳞癌患者 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 888 | 2025-10-06 |
PM2.5 Induces Cell-Specific Transcriptomic Alterations in the Lungs of Juvenile Mice
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S514437
PMID:40735270
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了PM2.5暴露对幼年小鼠肺部不同细胞类型的特异性转录组影响 | 首次在幼年动物模型中系统揭示PM2.5对肺部不同细胞类型的特异性转录调控机制 | 研究仅基于小鼠模型,需在人类样本中进一步验证 | 探究PM2.5对幼年肺部细胞类型特异性分子机制的影响 | 幼年小鼠肺部细胞 | 单细胞生物学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序,基因本体论分析,KEGG通路分析,苏木精-伊红染色 | NA | 单细胞转录组数据,组织病理学图像 | 幼年小鼠肺部细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 889 | 2025-10-06 |
Disulfidptosis-Related Genes as Novel Biomarkers and Therapeutic Targets in Dilated Cardiomyopathy
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S525114
PMID:40735269
|
研究论文 | 本研究通过分析扩张型心肌病中双硫死亡相关基因的表达特征,建立了诊断模型并验证了核心基因的病理作用 | 首次将双硫死亡机制与扩张型心肌病关联,发现19个差异表达基因并建立高精度诊断模型 | 研究样本量有限,机制研究仍需进一步深入验证 | 探索双硫死亡相关基因在扩张型心肌病中的生物标志物和治疗靶点价值 | 扩张型心肌病患者和健康对照的基因表达数据,DCM小鼠模型 | 生物信息学 | 扩张型心肌病 | RNA-seq,单细胞RNA-seq,机器学习 | 支持向量机(SVM) | 基因表达数据 | 多个GEO数据集,包含DCM患者和健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 890 | 2025-07-31 |
Editorial: Single-cell sequencing of the immune microenvironment in cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1660831
PMID:40735316
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 891 | 2025-10-06 |
Targeting the KLF5/PI3K/AKT axis as a therapeutic strategy to overcome neoadjuvant chemoresistance in colorectal cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1593639
PMID:40735324
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了KLF5/PI3K/AKT轴在结直肠癌新辅助化疗耐药中的关键作用 | 首次在单细胞水平系统解析结直肠癌化疗耐药机制,并建立KLF5调控网络风险评分模型用于预后预测 | NA | 探索结直肠癌新辅助化疗耐药机制并寻找有效治疗策略 | 结直肠癌患者样本和动物模型 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, InferCNV, 差异表达基因分析, 通路富集分析, 细胞通讯分析, SCENIC, 高通量药物筛选 | 风险评分模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 892 | 2025-10-06 |
An integrated approach for analyzing spatially resolved multi-omics datasets from the same tissue section
2025, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2025.1614288
PMID:40735471
|
研究论文 | 开发了一种在相同组织切片上整合空间转录组学和空间蛋白质组学分析的实验与计算框架 | 首次在相同组织切片上实现空间转录组和空间蛋白质组的整合分析,确保组织形态和空间背景的一致性 | 仅在人肺癌样本中进行了验证,尚未在其他疾病类型中测试 | 开发空间多组学整合分析方法,研究肿瘤免疫微环境 | 人肺癌组织样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, H&E染色 | Weave软件 | 空间转录组数据, 空间蛋白质组数据, 图像数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 893 | 2025-10-06 |
Collection of Growing Bovine Oocytes and Library Preparation for Single-Cell RNA Sequencing
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4658-8_4
PMID:40736790
|
研究论文 | 本文详细介绍了用于单细胞RNA测序分析的生长中牛卵母细胞收集和文库制备的详细实验方案 | 提供了针对牛卵母细胞的单细胞RNA测序标准化实验流程 | NA | 建立牛卵母细胞单细胞RNA测序的实验方法 | 生长中的牛卵母细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 894 | 2025-10-06 |
Promising Nanoparticles-Based Oral Therapy for Effective Inhibition of Hepatocellular Carcinoma with Portal Vein Tumor Thrombus
2025-01-29, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.4c05798
PMID:39808085
|
研究论文 | 开发基于碳酸钙@聚多巴胺纳米颗粒的口服给药系统,用于治疗肝细胞癌合并门静脉癌栓 | 利用门静脉独特解剖结构和单细胞RNA测序技术开发口服纳米颗粒系统,将门静脉阻塞挑战转化为药物递送优势 | NA | 开发针对肝细胞癌合并门静脉癌栓的有效口服治疗方法 | 肝细胞癌合并门静脉癌栓患者 | 纳米医学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 895 | 2025-10-06 |
Mapping the spatial atlas of the human bone tissue integrating spatial and single-cell transcriptomics
2025-Jan-11, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae1298
PMID:39817519
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研究论文 | 通过整合空间和单细胞转录组学技术,构建了人类骨组织的高分辨率空间图谱 | 首次整合空间和单细胞转录组学绘制人类骨骼和骨髓的高分辨率图谱,发现了骨形成特化微环境和从骨小梁辐射的细胞组成空间梯度 | 研究仅基于股骨组织样本,未涵盖其他骨骼部位 | 揭示骨组织微环境中细胞的空间组织和相互作用 | 人类骨组织和骨髓细胞 | 空间转录组学 | 骨相关疾病 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 股骨组织样本 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 896 | 2025-10-06 |
Deciphering the cellular and molecular landscape of pulmonary fibrosis through single-cell sequencing and machine learning
2025-Jan-02, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-06031-8
PMID:39748378
|
研究论文 | 本研究结合单细胞测序和机器学习技术解析肺纤维化的细胞和分子机制 | 发现肺纤维化中激活的B细胞、CD4 T细胞、巨噬细胞和特定成纤维细胞亚群的显著富集,并鉴定出TMEM52B、PHACTR1和BLVRB等关键基因标志物 | NA | 提高肺纤维化的诊断准确性并发现潜在治疗靶点 | 肺纤维化患者的肺组织样本和博来霉素诱导的小鼠肺纤维化模型 | 机器学习 | 肺纤维化 | 单细胞测序,机器学习,基因敲低,基因敲除 | 机器学习诊断模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 897 | 2025-10-06 |
Reduced T-Cell stemness underlies Th17 expansion and graft dysfunction in kidney transplant recipients
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1588941
PMID:40584830
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析肾移植受者免疫机制,发现T细胞干性降低与Th17细胞扩增及移植物功能障碍相关 | 首次将CD4+ T细胞干性特征与肾移植后Th17极化及移植物功能障碍联系起来,并识别出S100A4等关键生物标志物 | 样本量相对较小(单细胞测序n=20),需要在更大队列中验证发现 | 阐明肾移植受者移植物功能稳定与功能障碍的免疫机制差异 | 肾移植受者外周血单个核细胞 | 单细胞基因组学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 加权基因共表达网络分析 | Monocle, iTalk, WGCNA | RNA测序数据 | 单细胞测序20例(正常功能10例,功能障碍10例),批量验证队列192例 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 898 | 2025-10-06 |
Single cell transcriptomic analysis reveals transcriptome differences of different cells between eosinophilic chronic rhinosinusitis with nasal polyps and non-eosinophilic chronic rhinosinusitis with nasal polyps
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0328241
PMID:40720416
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析比较嗜酸性和非嗜酸性慢性鼻窦炎伴鼻息肉的细胞差异 | 首次在单细胞水平系统揭示两种鼻息肉亚型的细胞组成、代谢特征和免疫细胞功能差异 | 样本量较小(3例健康对照+6例患者),需更大队列验证 | 探索嗜酸性和非嗜酸性慢性鼻窦炎伴鼻息肉的发病机制差异 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉患者(包括嗜酸性和非嗜酸性亚型)的鼻腔组织细胞 | 生物信息学 | 慢性鼻窦炎 | 单细胞RNA测序 | 聚类分析、功能富集分析 | 单细胞转录组数据 | 9例样本(3健康对照+3 eCRSwNP+3 neCRSwNP) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 899 | 2025-10-06 |
Single-Cell Data and Weighted Correlation Network Analysis Revealed the Regulatory Mechanisms of Macrophages in Carotid Plaques
2025, Journal of immunology research
IF:3.5Q2
DOI:10.1155/jimr/9987367
PMID:40727388
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研究论文 | 通过单细胞数据和加权基因相关网络分析揭示颈动脉斑块中巨噬细胞的调控机制 | 在单细胞水平识别影响颈动脉斑块进展的潜在生物标志物,并研究其在免疫调节、程序性细胞死亡和炎症因子调控中的作用 | NA | 探索颈动脉斑块形成机制,重点关注巨噬细胞异质性 | 颈动脉斑块中的巨噬细胞和血管平滑肌细胞 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序, bulk RNA-seq, WGCNA, 随机森林, LASSO回归, qRT-PCR, Western blot, ssGSEA | 随机森林, LASSO回归 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 900 | 2025-10-06 |
Identifying and Diagnosing Lytic Cell Death Genes in Atherosclerosis Using Machine Learning and Bioinformatics
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S520039
PMID:40727462
|
研究论文 | 本研究结合机器学习和生物信息学方法,识别和诊断动脉粥样硬化中的裂解性细胞死亡基因 | 首次将人工神经网络模型应用于动脉粥样硬化中裂解性细胞死亡基因的诊断,并识别出CYBB作为潜在生物标志物 | 数据来源于公共数据库GEO,缺乏独立验证队列 | 研究裂解性细胞死亡在动脉粥样硬化中的作用机制和诊断价值 | 动脉粥样硬化患者基因表达数据和单细胞测序数据 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞测序,生物信息学分析,机器学习 | 人工神经网络(ANN) | 基因表达数据,单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |