单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 909 篇文献，本页显示第 881 - 900 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 881 | 2024-12-13 |
SpaInGNN: Enhanced clustering and integration of spatial transcriptomics based on refined graph neural networks
2025-Jan, Methods (San Diego, Calif.)
DOI:10.1016/j.ymeth.2024.11.006
PMID:39542070
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研究论文 | 本文提出了一种基于改进图神经网络的空间转录组学聚类与整合方法SpaInGNN，以提高空间域识别的准确性 | SpaInGNN通过整合空间位置数据、组织学信息和基因表达谱，利用图神经网络生成低维潜在嵌入，并结合组织图像距离和欧几里得距离优化空间位置图，从而提高空间域识别的准确性 | NA | 解决空间转录组学中单细胞水平空间域识别的挑战 | 小鼠嗅球和人类外侧前额叶皮层样本 | 空间转录组学 | NA | 图神经网络 | GNN | 空间位置数据、组织学信息、基因表达谱 | 小鼠嗅球和人类外侧前额叶皮层样本 |
| 882 | 2024-12-12 |
Identification and validation of serum MUC17 as a non-invasive early warning biomarker for screening of gastric intraepithelial neoplasia
2025-Jan, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2024.102207
PMID:39580962
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研究论文 | 本文研究了MUC17作为胃上皮内瘤变的非侵入性早期预警生物标志物的鉴定和验证 | 首次鉴定并验证了MUC17作为胃上皮内瘤变的非侵入性生物标志物，具有高胃癌特异性 | 研究主要基于数据库数据和临床样本的验证，未来需要更大规模的临床试验来进一步验证其有效性 | 寻找和验证胃上皮内瘤变的非侵入性早期预警生物标志物 | MUC17在胃上皮内瘤变中的表达及其作为生物标志物的潜力 | NA | 胃癌 | scRNA-seq, IHC, Elisa | NA | mRNA数据, 基因列表 | 临床患者的血清和组织样本，涵盖不同病理阶段 |
| 883 | 2024-12-12 |
Single-cell analysis combined with transcriptome sequencing identifies autophagy hub genes in macrophages after spinal cord injury
2025-Jan, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2024.110412
PMID:39612968
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和转录组测序联合分析，揭示了脊髓损伤后巨噬细胞中自噬枢纽基因的变化 | 首次通过单细胞RNA测序和转录组测序的联合分析，揭示了脊髓损伤后巨噬细胞中自噬枢纽基因的变化 | 实验仅限于脊髓损伤后的巨噬细胞，未涉及其他细胞类型或疾病模型 | 探索脊髓损伤后巨噬细胞中自噬枢纽基因的变化及其分子机制 | 脊髓损伤后的巨噬细胞 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和转录组测序（RNA-seq） | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 884 | 2024-12-11 |
Left/right asymmetrically expressed ephrin and Flamingo proteins regulate lateralized axon growth in C. elegans
2025-Jan, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2024.09.014
PMID:39341445
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研究论文 | 研究揭示了在C. elegans神经系统中左右不对称表达的ephrin和Flamingo蛋白如何调控轴突生长的分子机制 | 首次发现ephrin蛋白EFN-2和Flamingo蛋白FMI-1在AIY神经元谱系中左右不对称表达，并协同调控轴突生长的左右不对称性 | 研究仅限于C. elegans神经系统，未探讨这些分子不对称性在其他物种中的作用 | 探讨左右不对称分子在神经系统中的表达及其功能后果 | C. elegans神经系统的AIY神经元谱系中的ephrin和Flamingo蛋白 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | C. elegans的AIY神经元谱系 |
| 885 | 2024-12-11 |
Identification of cancer-associated fibrolast subtypes and distinctive role of MFAP5 in CT-detected extramural venous invasion in gastric cancer
2025-Jan, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2024.102188
PMID:39531783
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研究论文 | 研究报告了MFAP5+癌症相关成纤维细胞（CAFs）在胃癌（GC）中通过调节乳酸化修饰促进CT检测到的壁外静脉侵犯（EMVI）的形成 | 首次揭示了MFAP5+ CAFs在胃癌中通过调节乳酸化修饰促进EMVI形成的作用，为胃癌的诊断和治疗提供了新的参考 | 研究样本量较小，仅涉及13名胃癌患者，可能影响结果的普适性 | 探讨癌症相关成纤维细胞在胃癌中的作用及其对壁外静脉侵犯的影响 | 胃癌患者的病理样本和癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞测序、免疫组化、慢病毒敲低 | NA | 基因表达数据、图像 | 13名胃癌患者的病理样本 |
| 886 | 2024-12-11 |
Machine learning-derived natural killer cell signature predicts prognosis and therapeutic response in clear cell renal cell carcinoma
2025-Jan, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2024.102180
PMID:39536695
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研究论文 | 本文通过整合多种机器学习算法，建立了一个与自然杀伤细胞相关的风险模型，用于预测透明细胞肾细胞癌患者的预后和治疗反应 | 本文创新性地整合了十种不同的机器学习算法，建立了包含18个基因的风险模型，能够准确预测透明细胞肾细胞癌患者的预后，并揭示了自然杀伤细胞与其他细胞亚群之间的复杂信号相互作用 | 本文主要基于TCGA和GEO数据库的数据进行分析，未涉及大规模的临床验证 | 研究自然杀伤细胞在透明细胞肾细胞癌中的作用，并建立预测患者预后和治疗反应的风险模型 | 透明细胞肾细胞癌患者的转录组数据、临床数据以及自然杀伤细胞的功能和表达模式 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞测序、qRT-PCR、IHC、CCK8检测、流式细胞术 | Coxboost plus plsRcox | 转录组数据 | TCGA数据库中的透明细胞肾细胞癌转录组数据和临床数据，以及GEO数据库中的单细胞测序数据 |
| 887 | 2024-12-11 |
Pronounced early differentiation underlies zebra finch gonadal germ cell development
2025-Jan, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2024.08.006
PMID:39214328
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术比较了鸡和斑胸草雀的生殖细胞发育差异 | 发现了斑胸草雀中存在两种早期生殖细胞类型，而鸡中只有一种，揭示了鸟类生殖细胞发育策略的多样性 | 研究仅限于鸡和斑胸草雀两种鸟类，其他鸟类的生殖细胞发育情况尚未涉及 | 探讨不同鸟类生殖细胞发育策略的差异，为基因编辑和生殖技术在其他鸟类中的应用提供依据 | 鸡和斑胸草雀的早期胚胎生殖细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 鸡和斑胸草雀的早期胚胎生殖细胞样本 |
| 888 | 2024-12-10 |
Local ablation disrupts immune evasion in pancreatic cancer
2025-Jan-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.217327
PMID:39580047
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研究论文 | 研究局部消融技术在胰腺癌中打破免疫逃逸的作用 | 首次探讨了局部消融技术在胰腺癌中激活宿主免疫系统并克服免疫治疗抵抗的潜力 | 研究主要基于小鼠模型和人类样本，需要进一步的临床试验验证 | 探讨局部消融技术在胰腺癌中的免疫调节作用及其与免疫治疗的协同效应 | 胰腺癌模型、人类胰腺癌样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 局部消融技术 | NA | 空间转录组学、组织学技术 | 小鼠模型、人类样本 |
| 889 | 2024-12-09 |
Granuloma Annulare Exhibits Mixed Immune and Macrophage Polarization Profiles with Spatial Transcriptomics
2025-Jan, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2024.04.024
PMID:38844128
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研究论文 | 研究了环状肉芽肿（GA）的空间转录组学特征，揭示了其免疫和巨噬细胞极化的混合模式 | 首次使用空间转录组学技术分析GA的空间基因表达模式，揭示了GA微环境中T辅助1和T辅助2信号的混合特征以及M1和M2巨噬细胞的极化特性 | 研究样本量较小，仅涉及6名患者，可能影响结果的普遍性 | 通过空间转录组学技术深入理解环状肉芽肿（GA）的空间基因表达模式 | 环状肉芽肿（GA）患者的皮肤组织 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 6名环状肉芽肿（GA）患者 |
| 890 | 2024-12-07 |
Neonatal inflammation impairs developmentally-associated microglia and promotes a highly reactive microglial subset
2025-Jan, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2024.09.019
PMID:39322088
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研究论文 | 研究新生儿炎症对小鼠神经发育障碍模型中脑髓样细胞亚群的影响 | 通过单细胞RNA测序和流式细胞术，识别出表达补体受体C5ar1的特定微胶质细胞亚群，并发现其在炎症途径中高度激活 | NA | 探讨新生儿炎症对神经发育障碍中微胶质细胞发育轨迹的影响 | 小鼠神经发育障碍模型中的脑髓样细胞亚群 | NA | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 891 | 2024-12-05 |
Endothelial Angpt2 Promotes Adipocyte Progenitor Cells Maturation to Increase Visceral Adipose Tissue Accumulation
2025-Jan, Diabetes/metabolism research and reviews
DOI:10.1002/dmrr.70012
PMID:39628006
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研究论文 | 研究探讨了内皮细胞Angpt2在促进脂肪前体细胞成熟和内脏脂肪组织积累中的作用 | 揭示了JAK1/STAT3信号通路激活下内皮细胞分泌的Angpt2通过整合素-α5β1信号促进脂肪前体细胞从MSLN表型向CFD表型转变，从而促进内脏脂肪组织积累的新机制 | 研究样本量较小，且仅限于肥胖和糖尿病患者，可能影响结果的普适性 | 探究内脏脂肪组织积累的具体机制 | 内脏脂肪组织、内皮细胞、脂肪前体细胞 | NA | 肥胖 | 单细胞RNA测序(scRNAseq)、PCR、WB、免疫荧光染色、流式细胞术 | NA | 基因表达数据 | 13个内脏脂肪组织样本，来自5名肥胖和糖尿病患者、9名肥胖患者和1名正常BMI个体 |
| 892 | 2024-11-27 |
Droplet-Based Single-Cell 3' mRNA Sequencing of Marburg Virus-Infected Samples
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4256-6_27
PMID:39585636
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研究论文 | 描述了一种基于液滴的单细胞3' mRNA测序方法，用于研究马尔堡病毒感染的样本 | 使用10× Chromium Next GEM单细胞基因组学技术，首次在体内研究马尔堡病毒感染的非人灵长类血液样本 | 研究在BSL-4实验室进行，操作复杂且需要严格的生物安全措施 | 揭示病毒与宿主相互作用的转录组复杂性 | 马尔堡病毒感染的单细胞样本 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | mRNA | 非人灵长类血液样本 |
| 893 | 2024-11-25 |
The impact of cathepsins on liver hepatocellular carcinoma: Insights from genetic and functional analyses
2025-Jan-30, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2024.149064
PMID:39486661
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研究论文 | 研究探讨了组织蛋白酶E在肝细胞癌中的作用及其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 | 首次系统研究了组织蛋白酶E在肝细胞癌中的作用，并揭示了其在细胞增殖和信号传导中的关键作用 | 研究主要基于体外实验和现有数据库分析，缺乏临床试验验证 | 探讨组织蛋白酶E在肝细胞癌中的作用及其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 | 肝细胞癌及其相关组织蛋白酶E的表达和功能 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA测序、免疫组化分析、siRNA技术 | NA | RNA | 包括HepG2和Huh7细胞系在内的多个样本 |
| 894 | 2024-11-24 |
Using Callus as an Ex Vivo System for Chromatin Analysis
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4228-3_18
PMID:39576610
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综述 | 本文综述了下一代测序技术在表观遗传学研究中的应用，并探讨了使用子叶衍生愈伤组织作为体外系统进行染色质分析的优势 | 本文提出了使用子叶衍生愈伤组织作为简单、易获取且稳健的平台，用于高通量多组学分析 | 本文未提及具体的实验数据或结果，主要集中在方法论的讨论上 | 探讨表观遗传机制的复杂性及其在基因调控中的作用 | DNA甲基化和组蛋白修饰谱 | 表观遗传学 | NA | 下一代测序 | NA | 多组学数据 | NA |
| 895 | 2024-11-22 |
Microglia phagocytosis of PNNs mediates PV-positive interneuron dysfunction and associated gamma oscillations in neuroinflammation-induced cognitive impairment in mice
2025-Jan-01, Neuropharmacology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.neuropharm.2024.110205
PMID:39489286
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研究论文 | 研究探讨了神经炎症通过小胶质细胞吞噬PNNs导致PV阳性中间神经元功能障碍和相关γ振荡，从而引发小鼠认知障碍的机制 | 首次揭示了小胶质细胞吞噬PNNs在神经炎症诱导的认知障碍中的关键作用，并提出ApoE可能介导这一过程 | 研究主要集中在小鼠模型上，结果的普适性有待进一步验证 | 探讨神经炎症导致认知障碍的具体机制 | 小鼠的认知功能、神经振荡、小胶质细胞基因表达 | 神经科学 | 认知障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | C57BL/6J小鼠和CX3CR1-CreERT2小鼠 |
| 896 | 2024-11-20 |
Research progress and the prospect of using single-cell sequencing technology to explore the characteristics of the tumor microenvironment
2025-Jan, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2024.101239
PMID:39552788
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在肿瘤微环境研究中的进展和应用前景 | 本文提出了单细胞多组学测序技术的整合，并探讨了其在生物研究和医学调查中的潜力 | 本文讨论了使用单细胞测序技术探索肿瘤微环境的优缺点 | 解决肿瘤内异质性问题，为精准癌症治疗提供支持 | 肿瘤微环境中的细胞异质性 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序技术 | NA | 基因组和转录组数据 | NA |
| 897 | 2024-11-18 |
Dissection of Gene Expression at the Single-Cell Level: scRNA-seq
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4192-7_9
PMID:39546202
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研究论文 | 本文讨论了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在基因表达研究中的应用 | scRNA-seq技术能够以单细胞分辨率揭示基因表达特征，识别与疾病相关的新细胞类型 | NA | 深入理解基因表达的单细胞分辨率 | 单细胞RNA测序技术及其在基因表达研究中的应用 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 数千到数百万个转录本 |
| 898 | 2024-11-15 |
Analysis of the pluripotent and germline marker gene expression, and the state of X chromosome reactivation of primordial germ cells in pig gonads
2025-Jan-01, Theriogenology
IF:2.4Q1
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研究论文 | 研究分析了猪性腺原始生殖细胞（PGCs）的多能性和性染色体再激活状态 | 首次揭示了猪性腺PGCs的异质性，并鉴定了GDF3作为其特异性表面标记 | NA | 评估猪性腺PGCs的多能性状态、特定基因表达模式和性染色体再激活 | 猪性腺原始生殖细胞（PGCs） | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 899 | 2024-11-09 |
ERP44 could serve as a bridge mediating prognosis and immunity for glioma via single-cell and bulk RNA-sequencing
2025-Jan-15, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2024.148963
PMID:39341519
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研究论文 | 研究探讨了ERP44在胶质瘤中的作用及其对预后和免疫的影响 | 首次整合蛋白质组学、单细胞和批量RNA测序数据，研究ERP44在胶质瘤患者中的潜在功能 | NA | 探讨ERP44在胶质瘤中的作用及其对预后和免疫的影响 | ERP44在胶质瘤中的表达及其对患者预后和免疫的影响 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq)，批量RNA测序，蛋白质组学 | NA | RNA | 使用了TCGA数据集、GSE50161、GSE4290以及qRT-PCR验证的数据 |
| 900 | 2024-11-08 |
High-throughput and multimodal profiling of antigen-specific T cells with a droplet-based cell-cell interaction screening platform
2025-Jan-01, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2024.116815
PMID:39348735
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研究论文 | 开发了一种基于液滴的细胞间相互作用筛选平台DropCCI，用于高通量和多模态分析抗原特异性T细胞 | 提出了DropCCI方法，通过液滴封装DNA条码和抗原负载的抗原呈递细胞，结合点击化学修饰的T细胞，实现了高通量、无污染的多模态分析 | NA | 开发一种新的策略，用于高通量和多模态分析抗原特异性T细胞，以改进T细胞免疫疗法的设计 | 抗原特异性T细胞 | 生物技术 | NA | 点击化学 | NA | 单细胞组学数据 | NA |