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当前共找到 2151 篇文献，本页显示第 821 - 840 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 821 | 2025-10-06 |
PCLDA: An interpretable cell annotation tool for single-cell RNA-sequencing data based on simple statistical methods
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.07.019
PMID:40778314
|
研究论文 | 提出了一种基于简单统计方法的可解释单细胞RNA测序数据细胞注释工具PCLDA | 在保持原始假设、计算效率和可解释性的同时，通过两个新颖的增强模块显著提升了性能和鲁棒性 | NA | 开发准确、一致且可解释的单细胞RNA测序数据细胞类型注释方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | PCA, LDA | 基因表达数据 | 22个公共scRNA-seq数据集和35个不同的评估场景 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 822 | 2025-10-06 |
Connecting genomic results for psychiatric disorders to human brain cell types and regions reveals convergence with functional connectivity
2025-01-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-55611-1
PMID:39755698
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研究论文 | 通过整合基因组关联研究与单细胞转录组图谱，识别精神疾病相关的关键脑细胞类型和脑区 | 首次将基因组关联研究结果与成人脑单细胞转录组图谱及功能磁共振连接性数据相结合，揭示精神疾病的细胞类型和脑区特异性 | 研究基于现有基因组关联研究数据，可能受样本量和人群特异性的限制 | 识别精神疾病和脑功能特征相关的关键脑细胞类型和脑区 | 精神分裂症、双相情感障碍、重度抑郁症患者及智力、教育程度、神经质相关人群 | 生物信息学 | 精神疾病 | 全基因组关联研究(GWAS), 单细胞RNA测序, 功能磁共振成像 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 神经影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 功能磁共振成像 | NA | NA |
| 823 | 2025-10-06 |
Insulin signaling regulates R2 retrotransposon expression to orchestrate transgenerational rDNA copy number maintenance
2025-01-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-55725-6
PMID:39755735
|
研究论文 | 本研究揭示了胰岛素信号通路通过调控R2逆转录转座子表达来维持跨代核糖体DNA拷贝数稳定的机制 | 首次发现胰岛素受体作为R2表达的主要抑制因子，并阐明胰岛素通路整合rDNA拷贝数监测与环境感知的新机制 | 研究主要基于果蝇模型，在哺乳动物中的保守性仍需验证 | 探究生殖细胞中核糖体DNA拷贝数维持的调控机制 | 黑腹果蝇雄性生殖干细胞 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 824 | 2025-10-06 |
Comprehensive analysis of pyroptosis-related genes in psoriasis and targeted gene editing of CASP1 and CASP5 using lipid nanoparticles to alleviate skin inflammation
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1639869
PMID:40771724
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研究论文 | 通过生物信息学分析焦亡相关基因在银屑病中的作用，并利用脂质纳米颗粒递送CRISPR-Cas9靶向编辑CASP1和CASP5基因以缓解皮肤炎症 | 首次系统分析焦亡相关基因在银屑病中的表达特征，并开发基于脂质纳米颗粒的基因编辑治疗策略 | 研究主要基于公共数据集和动物模型，需要进一步临床验证 | 探讨焦亡在银屑病发病机制中的作用并开发基因治疗新策略 | 银屑病患者数据、IMQ诱导的银屑病小鼠模型、角质形成细胞 | 生物信息学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序、CRISPR-Cas9基因编辑、生物信息学分析 | 机器学习算法、风险评分模型 | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 公共数据集中的银屑病患者样本、IMQ诱导的银屑病小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 825 | 2025-10-06 |
WISP1 drives esophageal squamous cell carcinoma progression via modulation of cancer-associated fibroblasts and immune microenvironment
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1586790
PMID:40771797
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研究论文 | 本研究探讨WISP1通过调控癌症相关成纤维细胞和免疫微环境促进食管鳞状细胞癌进展的机制 | 首次深入揭示WISP1在ESCC中通过调控CAFs功能和ECM重塑影响肿瘤进展的多重作用机制 | 研究主要基于公共数据库数据和体外实验，缺乏体内实验验证 | 探究WISP1在食管鳞状细胞癌中的表达特征、临床意义及其作用机制 | 食管鳞状细胞癌患者数据、癌症相关成纤维细胞和癌细胞系 | 生物信息学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序、生物信息学分析、细胞培养实验 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、临床数据 | 从公共数据库获取的ESCC患者数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 826 | 2025-10-06 |
Autonomic nervous system development-related signature as a novel predictive biomarker for immunotherapy in pan-cancers
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1611890
PMID:40771813
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研究论文 | 开发基于自主神经系统发育相关特征的泛癌免疫治疗预测模型 | 首次将自主神经系统发育相关特征作为免疫治疗预测生物标志物，构建了跨癌种的预测模型 | 需要进一步临床验证，样本来源多样可能影响模型泛化能力 | 开发新的免疫治疗预测生物标志物以提高治疗反应预测准确性 | 多种癌症类型的单细胞和批量RNA测序数据，临床样本 | 机器学习 | 泛癌研究 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序，RT-PCR，免疫组化 | 随机森林，多种机器学习方法 | RNA测序数据，基因表达数据 | 34个单细胞RNA测序数据集和8个批量RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | NA |
| 827 | 2025-10-06 |
Machine learning analysis of ARVC informed by sodium channel protein-based interactome networks
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1611342
PMID:40771922
|
研究论文 | 本研究通过机器学习分析结合钠通道蛋白互作网络，识别并验证了山柰酚作为治疗致心律失常性右室心肌病的潜在化合物 | 首次将机器学习模型与基于单细胞RNA测序的蛋白质互作网络相结合，用于预测ARVC治疗化合物 | 研究主要基于大鼠模型和心脏类器官验证，尚未进行临床前动物模型或临床试验 | 识别治疗致心律失常性右室心肌病的新型化合物 | ARVC大鼠模型、心脏类器官、钠通道蛋白SCN5A | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, Western blotting, ELISA, MEA, Masson染色 | 机器学习模型 | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质互作网络数据 | ARVC大鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 828 | 2025-10-06 |
Deciphering the tumor ecosystem dynamics undergoing immunochemotherapy therapy across multiple cancer types unveils the immunosuppressive role of S100A4 in fibroblasts by promoting PD-L1 expression in tumor cells
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1613296
PMID:40772225
|
研究论文 | 通过跨癌种单细胞测序揭示S100A4在成纤维细胞中通过促进肿瘤细胞PD-L1表达介导免疫抑制和治疗抵抗的作用机制 | 构建首个跨癌种单细胞图谱，发现CAFs分泌的S100A4是驱动PD-L1上调的保守介质 | 需要在更大队列和机制研究中进一步验证 | 解析新辅助治疗期间肿瘤生态系统动态变化，识别免疫抑制和治疗抵抗的关键介质 | 五种实体瘤（食管鳞癌、食管胃结合部癌、结直肠癌、宫颈癌、三阴性乳腺癌） | 数字病理 | 多癌种 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, Western blot | 非负矩阵分解 | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 | 五种癌症类型的单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 829 | 2025-10-06 |
Identification of therapeutic targets for Alzheimer's Disease Treatment using bioinformatics and machine learning
2025-01-31, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-88134-w
PMID:39890844
|
研究论文 | 通过生物信息学和机器学习方法识别阿尔茨海默病的潜在治疗靶点 | 整合多种生物信息学方法和机器学习算法识别出五个与AD相关的枢纽基因，其中PLCB1具有最高诊断价值 | NA | 识别阿尔茨海默病的潜在治疗靶点 | 阿尔茨海默病相关基因 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 差异基因表达分析、加权基因共表达网络分析、Mfuzz聚类、单细胞RNA测序 | LASSO回归、SVM-RFE、随机森林 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 830 | 2025-10-06 |
GPX4 expression changes in proximal tubule cells highlight the role of ferroptosis in IgAN
2025-01-31, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-87228-9
PMID:39890853
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和微阵列数据分析，探讨了氧化应激在IgA肾病中的作用机制，重点关注近端肾小管细胞中铁死亡的调控 | 首次在IgA肾病中发现近端肾小管细胞中铁死亡活动的显著改变，并确定GPX4作为关键调控因子 | 研究主要基于生物信息学分析，需要更多实验验证 | 探究氧化应激在IgA肾病中的作用机制及细胞组织损伤保护机制 | IgA肾病患者的肾脏组织样本 | 生物信息学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序, 微阵列, 免疫组织化学 | 基因集变异分析(GSVA), 富集分析 | 基因表达数据, 组织图像 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 微阵列分析 | NA | NA |
| 831 | 2025-10-06 |
TRα1 mutant suppresses KLF9 to cause endometrial metaplasia with ectopic IL-33 expression leading to uterine fibrosis and infertility
2025-01-31, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-86848-5
PMID:39890871
|
研究论文 | 本研究通过小鼠模型揭示了TRα1突变通过抑制KLF9导致子宫内膜化生和异位IL-33表达，进而引发子宫纤维化和不孕的分子机制 | 首次发现TRα1突变通过抑制KLF9导致子宫内膜鳞状化生，并鉴定IL-33是驱动子宫纤维化和不孕的关键因子 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类患者中验证 | 阐明甲状腺激素受体突变导致女性不孕的分子机制 | 表达突变TRα1的Thra1转基因小鼠 | 生殖医学 | 不孕症 | RNA-seq, 激光捕获显微切割, 空间转录组学 | 转基因小鼠模型 | 基因表达数据, 组织学图像 | 未明确说明 | NA | 空间转录组学, RNA测序 | NA | NA |
| 832 | 2025-10-06 |
A cell atlas of the human fallopian tube throughout the menstrual cycle and menopause
2025-01-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-55440-2
PMID:39753552
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研究论文 | 通过单细胞RNA和ATAC测序构建了人类健康输卵管在月经周期和绝经期间的全面细胞图谱 | 首次系统揭示了输卵管在月经周期和绝经期间细胞类型频率、基因表达、转录因子活性和细胞间通讯的重大变化 | 仅关注健康输卵管组织，未涉及病理状态下的变化 | 构建人类输卵管在生殖周期不同阶段的细胞图谱 | 人类输卵管组织 | 单细胞组学 | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | 85,107个绝经前细胞和46,111个绝经后细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 833 | 2025-10-06 |
Deeper response predicts better outcomes in high-risk-smoldering-myeloma: results of the I-PRISM phase II clinical trial
2025-01-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-55308-5
PMID:39753553
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研究论文 | 评估伊沙佐米、来那度胺和地塞米松联合治疗高危冒烟型骨髓瘤的II期临床试验结果 | 首次证明深度治疗反应与高危冒烟型骨髓瘤患者长期预后显著相关 | 单臂研究设计，样本量较小（55例患者） | 评估早期治疗干预对高危冒烟型骨髓瘤患者长期预后的影响 | 55例高危冒烟型骨髓瘤患者 | 临床医学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床数据，基因表达数据 | 55例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 834 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics of healthy and fibrotic human liver at single-cell resolution
2025-01-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-55325-4
PMID:39747812
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组技术绘制了健康与纤维化人类肝脏的单细胞分辨率空间图谱 | 首次在单细胞分辨率下描述人类肝脏的空间组织结构，并揭示纤维化过程中的细胞空间重塑 | NA | 探索人类肝脏在健康和纤维化状态下的空间细胞组织和基因表达特征 | 人类肝脏组织（健康和纤维化样本） | 空间转录组学 | 肝纤维化 | MERFISH, snRNA-seq | NA | 空间转录组数据，单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序，单核RNA测序 | NA | 多重错误稳健荧光原位杂交(MERFISH)，单核RNA测序(snRNA-seq) |
| 835 | 2025-10-06 |
Isolation of Mouse Bone Marrow Niche Cells for Single-Cell Sequencing
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/7651_2025_630
PMID:40397275
|
方法论文 | 介绍从小鼠股骨和胫骨中分离骨髓微环境细胞用于单细胞RNA测序的方法 | 通过荧光激活细胞分选技术实现高质量骨髓微环境细胞的分离，确保高活性和纯度 | NA | 开发骨髓微环境细胞分离方法以支持单细胞测序研究 | 小鼠骨髓微环境细胞 | 单细胞生物学 | NA | 荧光激活细胞分选，单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 836 | 2025-10-06 |
Integrated Bioinformatics and Experimental Validation Reveal Macrophage Polarization-Related Biomarkers for Osteoarthritis Diagnosis
2025, Journal of multidisciplinary healthcare
IF:2.7Q2
DOI:10.2147/JMDH.S537507
PMID:40765736
|
研究论文 | 通过生物信息学分析和实验验证构建与巨噬细胞极化相关的骨关节炎诊断模型 | 首次整合WGCNA、差异表达分析和多种机器学习算法识别巨噬细胞极化相关关键基因，并构建骨关节炎诊断模型 | 需要进一步的临床研究和实验评估来验证研究结果 | 识别骨关节炎中巨噬细胞极化相关关键基因并构建诊断模型 | 骨关节炎患者的滑膜组织和基因表达数据 | 生物信息学 | 骨关节炎 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, RT-qPCR, IHC | LASSO, 随机森林, SVM-RFE | 基因表达数据 | 15例临床样本(OA:10, 对照:5)用于RT-qPCR，11例样本(OA:6, 对照:5)用于IHC | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 837 | 2025-10-06 |
The novel diagnostic markers for systemic lupus erythematosus and periodontal disease
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1614044
PMID:40766309
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析识别系统性红斑狼疮和牙周病的共同诊断标志物 | 首次通过WGCNA和机器学习方法识别出LY96和TMEM140作为SLE和PD的共同诊断标志物 | 研究主要基于公共数据库的微阵列数据，需要进一步实验验证 | 探索系统性红斑狼疮和牙周病的共同遗传标志物及其诊断治疗价值 | 系统性红斑狼疮和牙周病患者基因表达数据 | 生物信息学 | 系统性红斑狼疮,牙周病 | 微阵列分析,单细胞RNA测序,免疫组织化学 | 随机森林 | 基因表达数据 | 多个GEO数据集(GSE61635,GSE16134,GSE10334,GSE50772) | NA | 单细胞RNA测序,微阵列 | NA | NA |
| 838 | 2025-10-06 |
Integrating proteomics and machine learning reveals characteristics and risks of lymph node-independent distant metastasis in colorectal cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1622528
PMID:40766310
|
研究论文 | 本研究通过整合蛋白质组学和机器学习方法，揭示了结直肠癌中不依赖淋巴结转移的远处转移特征和风险 | 首次开发了淋巴结非依赖性转移基因特征来预测I-II期结直肠癌患者的同步远处转移风险，并发现ITGA11在早期转移中的关键作用 | 样本量相对较小（12例患者），需要在更大规模队列中进一步验证 | 探索结直肠癌中不依赖淋巴结转移的远处转移的生物学特征和预测方法 | 结直肠癌患者组织样本和SW480细胞系 | 机器学习 | 结直肠癌 | 数据非依赖性采集质谱、单细胞RNA测序、免疫组织化学、伤口愈合实验、transwell实验 | 机器学习模型 | 蛋白质组数据、转录组数据、单细胞数据 | 12例结直肠癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, 质谱分析 | NA | NA |
| 839 | 2025-10-06 |
Single-cell and multi-omics analysis reveals the role of stem cells in prognosis and immunotherapy of lung adenocarcinoma patients
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1634830
PMID:40766320
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研究论文 | 通过单细胞和多组学分析构建基于干细胞的预后模型，用于预测肺腺癌患者的生存和免疫治疗反应 | 首次通过单细胞RNA测序识别干细胞群体，结合多组学数据和多种机器学习算法构建干细胞预后模型，能够预测免疫治疗反应和肿瘤免疫微环境特征 | 模型验证主要依赖回顾性队列，需要在前瞻性研究中进一步验证 | 研究干细胞在肺腺癌预后和免疫治疗中的作用 | 肺腺癌患者 | 机器学习 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, 多组学分析, 机器学习 | CoxBoost+Enet, 多种机器学习算法 | 基因表达数据, 突变数据, 拷贝数变异数据 | 7个独立肺腺癌队列和免疫治疗数据集，外加内部医院队列 | NA | 单细胞RNA测序, 多组学分析 | NA | NA |
| 840 | 2025-10-06 |
Inferring Metabolic Flux from Gene Expression Data Using METAFlux
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4566-6_10
PMID:40779111
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研究论文 | 开发了一种名为METAFlux的计算方法，用于从基因表达数据推断代谢通量 | 首次将通量平衡分析(FBA)应用于从bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据推断代谢反应活性 | 依赖于代谢组学技术的当前限制，可能无法完全表征肿瘤代谢组 | 解决肿瘤代谢重编程研究的计算分析缺口 | 恶性肿瘤细胞和肿瘤微环境中的细胞 | 计算生物学 | 癌症 | 通量平衡分析(FBA), RNA测序 | METAFlux | 基因表达数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |