单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 1950 篇文献，本页显示第 781 - 800 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 781 | 2025-10-06 |
Conserved patterns of transcriptional dysregulation, heterogeneity, and cell states in clear cell kidney cancer
2025-01-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.115169
PMID:39792555
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学分析肾透明细胞癌的转录调控模式和细胞状态异质性 | 首次在肾透明细胞癌中系统识别保守的转录失调模式、上游调控因子及与转移潜能相关的14q染色体缺失的亚克隆转录后果 | 样本量相对有限（75例多区域活检），未涉及其他癌症类型的比较分析 | 解析肾透明细胞癌中肿瘤和基质细胞组分的转录程序及其与肿瘤异质性的关系 | 肾透明细胞癌肿瘤组织和正常肾脏组织 | 单细胞转录组学 | 肾癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 75例多区域活检样本（来自肾肿瘤和正常肾脏） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 782 | 2025-10-06 |
Targeting mitophagy in diabetic retinopathy: novel insights into SQSTM1/BNIP3L pathway regulated by luteolin
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1593213
PMID:40635752
|
研究论文 | 本研究探讨了木犀草素通过SQSTM1/BNIP3L通路激活线粒体自噬对糖尿病视网膜病变的保护作用 | 首次揭示木犀草素通过SQSTM1/BNIP3L通路激活线粒体自噬的新机制，并发现单核细胞活性与VISFATIN信号通路在DR进展中的新联系 | 木犀草素的确切分子机制仍未完全阐明 | 探索木犀草素治疗糖尿病视网膜病变的局部和全身免疫机制 | 糖尿病视网膜病变患者的PBMC和视网膜组织 | 生物医学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序,分子对接模拟,DCFDA测定,H&E染色,PAS染色,ELISA,免疫荧光,免疫组化,Western blotting | NA | 单细胞RNA测序数据,分子对接数据,蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 783 | 2025-10-06 |
Integrated single-cell and bulk RNA dequencing to identify and validate prognostic genes related to T Cell senescence in acute myeloid leukemia
2025, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2025.1606284
PMID:40635996
|
研究论文 | 通过整合单细胞和bulk RNA测序数据，识别并验证与急性髓系白血病中T细胞衰老相关的预后基因 | 首次结合单细胞RNA测序和bulk RNA测序数据，系统分析T细胞衰老相关基因在AML预后中的作用 | 研究依赖于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 探索T细胞衰老相关基因在急性髓系白血病进展中的作用并构建预后模型 | 急性髓系白血病患者和T细胞 | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, RT-qPCR | 风险模型, UMAP, 回归分析 | 基因表达数据, 生存数据 | TCGA-LAML队列和多个GEO数据集 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 784 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome and multi-omics integration reveal ferroptosis-driven immune microenvironment remodeling in knee osteoarthritis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1608378
PMID:40636124
|
研究论文 | 通过单细胞转录组和多组学整合分析，揭示铁死亡驱动的免疫微环境重塑在膝骨关节炎中的作用 | 首次在单细胞分辨率下探索铁死亡与免疫功能障碍的相互作用，并鉴定出铁死亡活跃的稳态软骨细胞作为FGF介导滑膜炎和ECM重塑的关键枢纽 | 样本量相对有限（单细胞数据n=11，批量RNA-seq队列样本数较少），需要更大规模验证 | 解析膝骨关节炎中铁死亡驱动的免疫重塑机制并鉴定诊断生物标志物 | 膝骨关节炎患者的软骨细胞和免疫微环境 | 生物信息学 | 膝骨关节炎 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 生物信息学分析 | LASSO-SVM诊断模型 | 基因表达数据 | 单细胞数据11个样本，批量RNA-seq队列：GSE114007（20例KOA/18例对照），GSE246425（8例KOA/4例对照） | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 785 | 2025-10-06 |
Investigating the role of tumor cell heterogeneity and angiogenesis genes in the prognosis of multiple myeloma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1610833
PMID:40636123
|
研究论文 | 本研究通过整合转录组和单细胞RNA测序数据，探讨肿瘤细胞异质性和血管生成相关基因在多发性骨髓瘤预后中的作用 | 首次发现C1亚群中CREB3L2高表达与血管生成抑制及肿瘤细胞增殖迁移的关联，并构建了基于血管生成和转录因子的预后模型 | 研究依赖于公共数据库的回顾性数据，缺乏前瞻性验证 | 探索肿瘤细胞异质性和血管生成相关基因对多发性骨髓瘤预后的影响 | 多发性骨髓瘤患者 | 生物信息学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, CNV分析, 转录因子分析, 细胞通讯分析, 免疫浸润分析 | 预后预测模型 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 786 | 2025-10-06 |
A bibliometric analysis of studies related to the nuclear factor kappa B signaling pathway in knee osteoarthritis between 2004 and 2023
2025, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2025.1572161
PMID:40636390
|
文献计量分析 | 对2004-2023年间核因子κB信号通路在膝骨关节炎研究中发表文献进行文献计量分析 | 首次系统分析NF-κB信号通路在膝骨关节炎领域的研究趋势和热点演变 | 缺乏实时可视化NF-κB活性的体内成像技术 | 识别NF-κB信号通路在膝骨关节炎研究中的主要领域和趋势 | 752篇相关研究文献 | 文献计量学 | 膝骨关节炎 | 文献计量分析 | NA | 文献数据 | 752篇研究文献 | NA | 单细胞转录组, 空间转录组 | NA | NA |
| 787 | 2025-10-06 |
Delineation of single-cell Altas provides new insights for development of coronary artery lesions in Kawasaki disease: bad and good signaling molecules
2025, Frontiers in pediatrics
IF:2.1Q2
DOI:10.3389/fped.2025.1596643
PMID:40636515
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析川崎病冠状动脉病变患者的免疫细胞图谱，揭示疾病发展的分子机制 | 首次在单细胞水平系统描绘川崎病冠状动脉病变患者的免疫细胞图谱，发现SPI1和MT2A的表达异常与B细胞发育紊乱相关 | 样本量较小（仅12个样本），缺乏独立验证队列 | 探索川崎病冠状动脉病变发展的分子机制 | 川崎病患者的周围血单核细胞 | 单细胞组学 | 川崎病 | 单细胞RNA测序 | 伪时间分析，细胞通讯分析 | 单细胞RNA测序数据 | 12个样本（3组KD非CAL患者治疗前后，3组KD CAL患者治疗前后） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 788 | 2025-10-06 |
Identification of Shared Biomarkers in Chronic Kidney Disease and Diabetic Nephropathy Using Single-Cell Sequencing
2025, Diabetes, metabolic syndrome and obesity : targets and therapy
DOI:10.2147/DMSO.S514319
PMID:40636753
|
研究论文 | 通过单细胞测序技术识别慢性肾脏病和糖尿病肾病的共享生物标志物 | 首次在单细胞水平系统比较CKD和DN的共享生物标志物，发现MX1、IRF7、STAT1和ISG15在两种疾病中的共同表达特征 | 样本量较小（仅9例），仅使用血液样本而未包含肾脏组织样本 | 识别慢性肾脏病和糖尿病肾病的共享生物标志物，探索其诊断和治疗潜力 | 人类血液样本中的免疫细胞 | 单细胞组学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | 差异表达分析，蛋白质相互作用网络分析 | 单细胞转录组数据 | 9例人类血液样本（3例对照，3例CKD，3例DN） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 789 | 2025-10-06 |
SeuratExtend: streamlining single-cell RNA-seq analysis through an integrated and intuitive framework
2025-Jan-06, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giaf076
PMID:40627366
|
研究论文 | 介绍SeuratExtend——一个基于Seurat框架构建的综合性R软件包，通过整合关键工具和数据库来简化单细胞RNA测序数据分析 | 在广泛采用的Seurat框架基础上构建，通过统一R接口整合多种Python工具和数据库，提供优化的可视化功能和精心设计的配色方案 | NA | 开发一个集成化、直观的单细胞RNA测序数据分析框架 | 单细胞RNA测序数据分析工具和数据库 | 生物信息学 | 肿瘤相关疾病，自身炎症性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 790 | 2025-10-06 |
Molecular insights into glioblastoma progression: role of CHCHD2P9 in tumor heterogeneity and prognosis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1581850
PMID:40630954
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现CHCHD2P9是胶质母细胞瘤终末亚群的关键标志物，其高表达与不良预后相关 | 首次发现CHCHD2P9在胶质瘤进展中的关键作用，并建立基于CHCHD2P9的风险预后模型 | 未明确说明样本具体数量，机制研究可能不够深入 | 探究胶质母细胞瘤异质性及预后相关分子机制 | 胶质母细胞瘤亚群细胞 | 数字病理学 | 脑癌/胶质瘤 | 单细胞RNA测序, 细胞实验, 流式细胞术 | 风险预后模型 | 单细胞RNA测序数据, 实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 791 | 2025-10-06 |
Immunogenic cell death-related biomarkers in heart failure probed by transcriptome and single-cell sequencing
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1560903
PMID:40630963
|
研究论文 | 本研究通过转录组和单细胞测序识别并验证了心力衰竭中三个免疫原性细胞死亡相关生物标志物 | 首次系统识别并验证了心力衰竭中CD163、FPR1和VSIG4这三个免疫原性细胞死亡相关生物标志物 | 研究主要基于公共数据库数据，需要更多实验验证 | 识别心力衰竭中免疫原性细胞死亡相关生物标志物并探索其机制 | 心力衰竭患者和动物模型 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, 实时定量PCR | 机器学习, 加权基因共表达网络分析 | 基因表达数据 | 多个GEO数据集(GSE57338、GSE3586、GSE5406、GSE183852) | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 792 | 2025-10-06 |
Taurine-mediated metabolic immune crosstalk indicates and promotes immunosuppression with anti-PD-1 resistance in bladder cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1618439
PMID:40630945
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和批量转录组分析，揭示了膀胱癌中牛磺酸代谢失调如何重塑肿瘤微环境并驱动免疫抑制 | 开发了牛磺酸代谢失调指数(TMs)作为预后生物标志物，揭示了牛磺酸代谢通过Notch信号和EGFR通路促进免疫抑制的新机制 | 研究主要基于计算分析和体外共培养验证，需要进一步的体内实验验证 | 阐明牛磺酸代谢在膀胱癌免疫抑制中的作用机制，为免疫治疗提供新靶点 | 膀胱癌患者样本和肿瘤微环境中的各类细胞 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量转录组分析, 共培养系统 | 机器学习, 生存模型 | 基因表达数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 | TCGA队列患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 793 | 2025-10-06 |
Single-nuclei RNA-sequencing fails to detect molecular dysregulation in the preeclamptic placenta
2025-01, Placenta
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.placenta.2024.12.011
PMID:39733647
|
研究论文 | 本研究比较单细胞RNA测序和单核RNA测序在检测先兆子痫胎盘分子失调方面的效果 | 首次系统比较scRNA-seq和snRNA-seq在胎盘研究中的敏感性差异，发现单核测序无法检测疾病相关应激和炎症信号 | 样本量相对较小，仅针对早发型先兆子痫进行研究 | 评估单核RNA测序在检测先兆子痫胎盘分子失调方面的有效性 | 人类胎盘组织 | 单细胞基因组学 | 先兆子痫 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 45,836个细胞和27,078个核，来自10例早发型先兆子痫和5例对照 | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq | NA | NA |
| 794 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomic and m6A methylation analyses reveal platelet-mediated immune regulatory mechanisms in sepsis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1607732
PMID:40625751
|
研究论文 | 通过单细胞转录组和m6A甲基化分析揭示脓毒症中血小板介导的免疫调节机制 | 首次整合单细胞RNA测序与m6A甲基化测序数据，系统揭示脓毒症进程中血小板功能重塑的m6A依赖性调控机制，并鉴定出关键靶基因RPA1 | 研究基于公共数据集GSE167363，样本来源和数量可能受限，需要进一步实验验证 | 探究脓毒症中免疫细胞组成变化、细胞间通讯特征及m6A修饰的潜在调控机制 | 脓毒症患者的外周血单个核细胞，包括健康对照、存活者和非存活者 | 单细胞生物学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序, m6A甲基化测序 | NA | 单细胞转录组数据, 表观遗传学数据 | GSE167363数据集中的脓毒症患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 甲基化测序 | NA | NA |
| 795 | 2025-10-06 |
Perspective on recent developments and challenges in regulatory and systems genomics
2025, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbaf106
PMID:40626041
|
观点文章 | 讨论调控和系统基因组学领域的最新进展与挑战，重点关注顺式调控元件的解码方法 | 整合3D染色质组织研究与序列到功能神经网络，提出构建跨细胞类型和个体的通用顺式调控模型策略 | 存在知识空白、技术限制和计算方法基准测试的挑战 | 解码顺式调控代码，预测遗传变异对表型结果的影响 | 顺式调控元件、基因调控网络、遗传变异 | 基因组学 | 人类疾病 | 空间转录组学、基因组学分析 | 序列到功能神经网络 | 基因组序列数据、3D染色质结构数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 796 | 2025-10-06 |
CYLD as a key regulator of myocardial infarction-to-heart failure transition revealed by multi-omics integration
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1592985
PMID:40626177
|
研究论文 | 通过多组学整合分析识别CYLD作为心肌梗死向心力衰竭转变的关键调控基因 | 首次通过多组学整合分析揭示CYLD在心肌梗死向心力衰竭转变中的关键调控作用 | 研究基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证 | 探索心肌梗死向心力衰竭转变的分子机制 | 心肌梗死和心力衰竭患者基因表达数据 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 基因表达分析, 单细胞转录组测序, 机器学习 | 随机森林, WGCNA, Limma | 基因表达数据 | 5个GEO数据集(GSE59867, GSE62646, GSE168281, GSE267644, GSE269269) | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 797 | 2025-10-06 |
Reduced Thioredoxin Regulates IL-1β Secretion via NLRP3 of IL-1β+ Alveolar Macrophages in COPD
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S513004
PMID:40620599
|
研究论文 | 本研究探讨了慢性阻塞性肺疾病中还原型硫氧还蛋白通过调节NLRP3炎症小体活性影响IL-1β+肺泡巨噬细胞分泌IL-1β的机制 | 首次在单细胞水平揭示COPD中IL-1β+肺泡巨噬细胞的TRX氧化还原状态异常通过TXNIP-NLRP3轴调控IL-1β分泌的新机制 | 研究主要基于动物模型和细胞系验证，需要进一步在人类原代细胞中确认 | 探究COPD中硫氧还蛋白的变化及其在IL-1β释放中的作用 | COPD肺组织、肺泡巨噬细胞、COPD小鼠模型、THP-1细胞系 | 生物医学研究 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序, 蛋白质活性分析, 分子动力学模拟, 免疫共沉淀 | Monocle2, 分子动力学模型 | 基因表达数据, 蛋白质数据 | GEO数据库中的COPD肺组织scRNA-seq数据、小鼠模型和THP-1细胞模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 798 | 2025-10-06 |
Electroacupuncture at ST36 Treatment Suppresses the Microglial Pyroptosis Through Activating α7nAChR in a Rat Model of Asphyxial Cardiac Arrest
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S525373
PMID:40620602
|
研究论文 | 本研究探讨电针足三里穴通过激活α7nAChR抑制小胶质细胞焦亡在心脏骤停大鼠模型中的神经保护作用 | 首次揭示电针足三里穴通过α7nAChR依赖途径抑制小胶质细胞焦亡的神经保护新机制 | 研究仅使用大鼠模型，临床转化价值需进一步验证 | 探究电针足三里穴对心脏骤停后全脑缺血损伤的神经保护作用及机制 | 窒息性心脏骤停大鼠模型和原代小胶质细胞氧糖剥夺/再灌注模型 | 神经科学 | 心脏骤停 | 单细胞RNA测序，免疫荧光，流式细胞术，ELISA，组织病理染色 | 动物疾病模型，细胞模型 | 基因表达数据，行为学数据，细胞学数据，蛋白质数据 | 大鼠模型和原代细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 799 | 2025-10-06 |
Unveiling PANoptosis in Acute Kidney Injury: An Integrative Multi-Dimensional Approach to Identify Key Biomarkers
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S525222
PMID:40620603
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和转录组数据识别急性肾损伤中PANoptosis关键生物标志物 | 首次在AKI中系统研究PANoptosis，整合单细胞和转录组数据结合机器学习算法识别关键基因 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证相对有限 | 阐明PANoptosis在急性肾损伤中的作用机制并识别关键生物标志物 | 急性肾损伤患者和动物模型的细胞及组织样本 | 生物信息学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 机器学习算法, Western blot, 免疫组织化学 | 机器学习算法 | 基因表达数据, 单细胞数据, 转录组数据 | 未明确具体样本数量，包含AKI患者和动物模型样本 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 800 | 2025-10-06 |
Integrating single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq and network pharmacology reveals protective effect of salidroside in peritoneal dialysis-associated peritoneal fibrosis
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1558366
PMID:40620673
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、批量RNA测序和网络药理学方法，揭示了红景天苷对腹膜透析相关腹膜纤维化的保护作用及其作用机制 | 首次将单细胞RNA测序、批量RNA测序与网络药理学相结合，系统研究红景天苷在腹膜透析相关腹膜纤维化中的治疗潜力，并鉴定出四个关键治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化价值需进一步验证；机制研究深度有限 | 探究红景天苷对腹膜透析相关腹膜纤维化的保护作用及分子机制 | 腹膜纤维化小鼠模型和相关的分子靶点 | 生物信息学 | 腹膜纤维化 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 网络药理学分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |