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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-04-12 |
Single-cell analysis of CD14+CD16+ monocytes identifies a subpopulation with an enhanced migratory and inflammatory phenotype
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1475480
PMID:40051633
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析人类CD14+CD16+单核细胞,识别出一个具有增强迁移和炎症表型的亚群,该亚群可能对神经炎症疾病有重要贡献 | 首次在CD14+CD16+单核细胞中通过单细胞RNA测序识别出具有独特迁移和炎症特征的亚群(Group 1单核细胞),并关联其与神经炎症疾病的潜在机制 | 研究主要基于体外实验和单细胞测序数据,缺乏体内验证和临床样本的直接证据 | 探究CD14+CD16+单核细胞的异质性及其在神经炎症疾病中的作用 | 人类CD14+CD16+单核细胞 | 数字病理学 | 神经炎症疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 62 | 2026-04-11 |
Mapping epidermal and dermal cellular senescence in human skin aging
2025-Jan, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.14358
PMID:39370688
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术,绘制了人类皮肤老化过程中表皮和真皮细胞衰老的图谱,并探讨了衰老细胞在光老化和时序老化中的作用 | 开发了皮肤特异性细胞衰老基因集SenSkin™,并通过单细胞和空间分析揭示了衰老细胞在皮肤中的聚集趋势及其对色素沉着和胶原合成的影响 | NA | 通过细胞衰老的视角表征与年龄相关的皮肤功能障碍 | 人类皮肤中的表皮细胞(如黑色素细胞)和真皮细胞(如网状真皮成纤维细胞) | 数字病理学 | 皮肤老化 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | RNA测序数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 63 | 2026-04-11 |
RARS1 inhibits ENO1 ubiquitination and degradation to protect against ferroptosis in hepatocellular carcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1686597
PMID:41451236
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研究论文 | 本研究探讨了RARS1基因在肝细胞癌进展中的作用,揭示了其通过调控ENO1泛素化与降解来抑制铁死亡,并作为潜在的治疗靶点 | 首次将RARS1与ENO1的泛素化降解及铁死亡抑制联系起来,并基于AR-DEGs对LIHC进行分子亚型分类,识别了AH.6809作为潜在RARS1抑制剂 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,缺乏体内模型验证,且临床转化潜力需进一步评估 | 探究RARS1在肝细胞癌进展中的功能机制及其作为治疗靶点的潜力 | 肝细胞癌患者数据、LIHC细胞系 | 生物信息学与分子生物学 | 肝细胞癌 | 差异表达分析、Cox回归分析、非负矩阵分解、转录组学、单细胞测序、空间转录组学、分子生物学技术 | NA | 转录组数据、单细胞数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 64 | 2026-04-10 |
Single-cell transcriptomic analysis identified resistant MDSCs and a stress-tolerant gene co-expression network as common MDSC features across multiple disease settings
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1565211
PMID:40264770
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析,识别了在多种疾病环境中常见的耐药性MDSCs和一个应激耐受基因共表达网络,作为MDSC的共同特征 | 首次结合炎症信号和细胞应激(血清饥饿)诱导出具有保留MDSC特征的细胞群(耐药性MDSCs),并识别了一个特异性于这些细胞的应激耐受基因共表达模块 | 研究主要基于体外诱导模型和已发表的转录组数据集,可能未完全反映体内复杂环境 | 识别跨多个疾病环境的MDSC共同分子特征,以帮助细胞分类 | 人源单核细胞性MDSCs(M-MDSCs)和免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 癌症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 65 | 2026-04-10 |
Regulatory T cell therapies: from patient data to biological insights
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1675114
PMID:41246323
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综述 | 本文综述了调节性T细胞(Treg)疗法在治疗自身免疫性疾病、炎症性疾病、移植物抗宿主病和促进器官移植耐受方面的应用,并探讨了如何从临床样本和数据中学习以优化Treg疗法 | 整合了临床样本数据与先进的多组学监测技术(如单细胞多组学分析、表观遗传分析和空间转录组学),以优化Treg疗法作为“活体药物” | NA | 优化调节性T细胞疗法,以建立跨多种临床环境的免疫耐受 | 调节性T细胞(Treg),包括多克隆、抗原特异性、转化型、TCR工程化和CAR工程化Treg | 自然语言处理 | 自身免疫性疾病、炎症性疾病、移植物抗宿主病 | 单细胞多组学分析、表观遗传分析、空间转录组学 | NA | 临床样本数据 | NA | NA | 单细胞多组学、空间转录组学 | NA | NA |
| 66 | 2026-04-09 |
Derivation of a Human Brain Organoid with Microglia Development
2025-01-17, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/67491
PMID:39895643
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研究论文 | 本文开发了一种包含小胶质细胞发育的人类大脑类器官模型,用于研究早期神经免疫相互作用 | 通过将iPSC分化的高度纯化造血祖细胞整合到胚胎体中,成功构建了同时包含小胶质细胞和神经元的大脑类器官,克服了现有方法在细胞数量和质量上的不一致问题 | 未明确说明类器官中微胶质细胞与神经元相互作用的长期稳定性及模型在模拟特定神经疾病方面的验证程度 | 建立包含微胶质细胞的人类大脑类器官模型,以研究早期神经免疫相互作用及神经炎症疾病 | 人类诱导多能干细胞(iPSC)衍生的造血祖细胞和大脑类器官 | 数字病理学 | 神经炎症疾病 | 单细胞RNA测序(sc-RNA-seq)、免疫染色 | 3D类器官模型 | 基因表达数据、图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 67 | 2026-04-07 |
Insulin signaling regulates R2 retrotransposon expression to orchestrate transgenerational rDNA copy number maintenance
2025-01-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-55725-6
PMID:39755735
|
研究论文 | 本研究揭示了胰岛素信号通路通过调控R2反转录转座子表达,在果蝇生殖系中协调跨代核糖体DNA拷贝数维持的机制 | 首次发现胰岛素受体作为R2表达的主要抑制因子,并揭示了饮食调控通过胰岛素通路影响rDNA拷贝数扩张的跨代遗传机制 | 研究主要基于果蝇模型,在哺乳动物系统中的普适性仍需验证 | 探究生殖系中核糖体DNA拷贝数维持的调控机制 | 果蝇雄性生殖干细胞及其核糖体DNA | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 68 | 2026-04-07 |
Optimized methods for scRNA-seq and snRNA-seq of skeletal muscle stored in nucleic acid stabilizing preservative
2025-Jan-04, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-07445-2
PMID:39755918
|
研究论文 | 本文开发了一种从保存在Allprotect® Tissue Reagent中的人类骨骼肌组织中获取高质量细胞和细胞核的优化方法,用于单细胞RNA测序和单核RNA测序 | 开发了一种从存档组织(特别是保存在核酸稳定保存剂中的骨骼肌)中获取高质量单细胞基因组材料的新协议,解决了新鲜起始材料需求的障碍 | 流式细胞分选虽然能富集更高质量的细胞和细胞核,但会导致总体输入材料减少 | 优化单细胞RNA测序和单核RNA测序方法,以从存档组织中获取高质量基因组材料 | 人类骨骼肌组织 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 69 | 2026-04-06 |
Transcriptome and DNA methylation profiling during the NSN to SN transition in mouse oocytes
2025-Jan-03, BMC molecular and cell biology
IF:2.4Q4
DOI:10.1186/s12860-024-00527-3
PMID:39754059
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组和DNA甲基化分析,表征了小鼠卵母细胞从非环绕核仁到环绕核仁阶段的转录组和DNA甲基化变化 | 开发了一种基于转录组数据的分类器,可用于推断单细胞或批量RNA-seq数据中的染色质状态,并识别了与异常染色质修饰组合相关的晚期甲基化区域 | 研究仅基于小鼠模型,可能不直接适用于其他物种,且单细胞技术可能存在技术变异 | 探究小鼠卵母细胞在NSN到SN过渡期间的转录组和DNA甲基化动态变化 | 小鼠卵母细胞,特别是GV期卵母细胞,根据核染色分为NSN和SN阶段 | 表观遗传学 | NA | 单细胞M&T-seq(scM&T-seq)、scRNA-seq、sc-bisulphite-seq(scBS-seq)、Hoechst染色、染色质免疫沉淀测序(ChIP-seq) | 分类器(基于转录组数据) | 单细胞转录组数据、DNA甲基化数据、染色质修饰数据 | 未明确指定样本数量,但涉及多个已发表数据集的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq、单细胞DNA甲基化测序 | NA | NA |
| 70 | 2026-04-06 |
CD206+ Trem2+ macrophage accumulation in the murine knee joint after injury is associated with protection against post-traumatic osteoarthritis in MRL/MpJ mice
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0312587
PMID:39752388
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,探讨了小鼠膝关节损伤后免疫细胞变化与创伤后骨关节炎(PTOA)易感性之间的关系 | 首次在PTOA易感性和抵抗性小鼠模型中,通过单细胞RNA测序揭示了CD206+ Trem2+巨噬细胞在关节损伤后的积累与保护作用 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证,且样本量相对较小 | 探究创伤后骨关节炎(PTOA)发展或缓解的分子机制 | PTOA易感的C57BL/6J(B6)小鼠和PTOA抵抗的MRL/MpJ(MRL)小鼠的滑膜关节 | 单细胞转录组学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 两种小鼠品系(B6和MRL)的膝关节样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 71 | 2026-04-06 |
Dissecting the molecular mechanisms of T cell infiltration in psoriatic lesions via cell-cell communication and regulatory network analysis
2025, Open life sciences
IF:1.7Q3
DOI:10.1515/biol-2025-1231
PMID:41883387
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和细胞间通讯分析,揭示了银屑病皮损中T细胞浸润的分子机制,并发现姜黄素类似物CuE通过抑制IL-6-STAT3-MDK信号轴缓解症状 | 首次结合单细胞RNA测序、假时间分析、细胞间通讯分析和调控网络分析,系统解析了银屑病中成纤维细胞通过MDK信号介导T细胞募集的机制,并验证了CuE通过靶向该信号轴的治疗潜力 | 研究主要基于小鼠模型和体外分析,人体组织样本的验证可能有限;信号通路的上下游调控细节有待进一步阐明 | 阐明银屑病皮损中T细胞浸润的细胞间通讯机制和调控网络,并探索潜在的治疗靶点 | 银屑病皮肤组织(小鼠模型及可能的人体样本)、T细胞、成纤维细胞、内皮细胞、黑色素细胞 | 单细胞组学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 72 | 2026-04-04 |
A single-cell compendium of human cerebrospinal fluid identifies disease-associated immune cell populations
2025-Jan-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI177793
PMID:39744938
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研究论文 | 本研究通过整合公开数据集和自身研究,构建了一个包含139名受试者的单细胞转录组学图谱,涵盖脑脊液和血液样本,用于识别与神经系统疾病相关的免疫细胞群体 | 首次构建了一个全面的脑脊液免疫细胞单细胞转录组学参考图谱,识别了MS患者中特有的AREG+树突状细胞新亚群,并阐明了不同疾病间免疫细胞频率和分布的差异 | 研究依赖于公开数据集和自身样本的整合,可能存在批次效应或样本选择偏差,且疾病范围虽广但每种疾病的样本量可能有限 | 通过单细胞转录组学分析脑脊液免疫细胞,以阐明神经系统疾病的病理生理机制 | 人类脑脊液和血液样本中的免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 多发性硬化症、阿尔茨海默病、帕金森病、COVID-19、自身免疫性脑炎等神经系统疾病 | 单细胞RNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 139名受试者,包括135个脑脊液样本和58个血液样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 73 | 2026-04-04 |
Stratifin Is Necessary for Spasmolytic Polypeptide-Expressing Metaplasia Development After Acute Gastric Injury
2025, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101521
PMID:40280276
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研究论文 | 本文研究了Stratifin(SFN)在急性胃损伤后主细胞向SPEM转分化过程中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了SFN在急性损伤后主细胞转分化中的关键调控作用,并发现其通过调节EGFR/ERK信号通路影响SPEM发育 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中验证;机制研究仍待深入 | 探究SFN在急性胃损伤后主细胞转分化和SPEM发育中的功能 | Mist1CreERT2; LSL-tdTomato小鼠和Mist1CreERT2; Sfnflox/flox小鼠模型中的主细胞和SPEM细胞 | 数字病理学 | 胃部疾病 | 单细胞RNA测序,免疫染色 | NA | RNA测序数据,图像数据 | 小鼠模型中的胃组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 74 | 2026-04-02 |
Single-Cell RNA-Sequencing Analysis Provides Insights into IgA Nephropathy
2025-01-29, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15020191
PMID:40001494
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在IgA肾病研究中的应用进展 | 利用scRNA-seq技术揭示了IgA肾病中免疫特征的全景,包括外周血B细胞和Th细胞活化、细胞毒性T细胞耗竭、肾脏浸润细胞亚型,以及系膜细胞和内皮细胞在肾损伤早期的关键作用 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在IgA肾病研究中的进展,以理解其复杂分子机制并开发生物标志物和特异性治疗策略 | IgA肾病(IgAN) | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 75 | 2026-04-02 |
Integrated single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq analysis to investigate key adipogenesis genes in adipose-derived stem cells
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0335152
PMID:41325391
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA-seq和bulk RNA-seq数据,探索了脂肪来源干细胞(ADSCs)在脂肪生成过程中的关键基因及其阶段特异性调控网络 | 整合了bulk和单细胞RNA-seq数据,识别了脂肪生成早期和晚期的阶段特异性调控基因,并构建了包含mRNA、miRNA和lncRNA的ceRNA调控网络 | 研究主要基于转录组数据,未涉及蛋白质水平或功能验证,且样本来源和数量可能有限 | 探究ADSCs脂肪生成过程中的关键调控基因和阶段特异性转录调控网络 | 脂肪来源干细胞(ADSCs) | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, qPCR | NA | RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 76 | 2026-04-01 |
Deciphering the Complexities of Pulmonary Hypertension: The Emergent Role of Single-Cell Omics
2025-Jan, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2024-0145PS
PMID:39141563
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综述 | 本文综述了单细胞组学技术在肺动脉高压研究中的应用,探讨其如何推动对该疾病复杂性的理解 | 利用单细胞转录组学技术,超越传统批量分析的局限,揭示肺动脉高压中细胞亚型的相互作用和转化,为精准医疗提供新靶点 | 单细胞RNA测序分辨率需提升以捕获更精细的细胞变化,处理人体组织样本存在物流障碍,且需整合多种组学方法以全面理解疾病分子机制 | 探讨单细胞组学技术在肺动脉高压研究中的角色,以促进疾病理解、靶向药物开发和生物标志物发现 | 肺动脉高压中的细胞生态系统,包括内皮细胞、平滑肌细胞、周细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 77 | 2026-03-29 |
SwarmMAP: Swarm Learning for Decentralized Cell Type Annotation in Single Cell Sequencing Data
2025-Jan-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.13.632775
PMID:39868099
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研究论文 | 本文开发了一种名为SwarmMAP的基于群体学习(Swarm Learning)的机器学习方法,用于在单细胞测序数据中以去中心化的方式自动进行细胞类型注释 | 首次将群体学习应用于单细胞测序数据的细胞类型注释,实现了在无需交换原始数据的情况下进行去中心化模型训练,解决了数据隐私和可扩展性问题 | 摘要中未明确提及具体的研究局限性 | 开发一种标准化、自动化且保护隐私的跨数据集细胞类型注释方法 | 人类心脏、肺和乳腺组织的单细胞转录组数据 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 基于Swarm Learning的机器学习模型 | 单细胞转录组数据 | 摘要中未提供具体样本数量,涉及多个数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 78 | 2026-03-28 |
Decreased miR-486-5p is involved in lipopolysaccharide-induced HTR-8/SVneo cell dysfunction by promoting SMAD2 expression
2025-01-01, Reproduction (Cambridge, England)
DOI:10.1530/REP-23-0502
PMID:39475824
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研究论文 | 本研究探讨了miR-486-5p/Smad2通路在脂多糖诱导的绒毛外滋养细胞功能障碍及早期妊娠丢失发病机制中的作用 | 揭示了miR-486-5p通过靶向SMAD2调控绒毛外滋养细胞侵袭和TNFα产生的新机制,并利用单细胞RNA测序数据验证了SMAD2在复发性流产患者中的表达变化 | 研究主要基于细胞系HTR-8/SVneo和动物模型,人类样本验证有限,且未深入探讨其他潜在靶点或通路 | 阐明miR-486-5p在早期妊娠丢失发病机制中的具体作用及其分子通路 | 绒毛外滋养细胞(EVT)系HTR-8/SVneo、LPS诱导的早期妊娠丢失模型、人类蜕膜单细胞RNA测序数据 | 生殖医学 | 早期妊娠丢失 | 单细胞RNA测序、转录组分析、细胞功能实验 | NA | 基因表达数据、细胞实验数据 | 细胞系实验及公共数据库(GEO)中的人类样本数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 79 | 2026-03-28 |
Modeling reproductive and pregnancy-associated tissues using organ-on-chip platforms: challenges, limitations, and the high throughput data frontier
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1568389
PMID:40236940
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综述 | 本文综述了使用器官芯片平台建模生殖和妊娠相关组织的挑战、局限性以及高通量数据前沿 | 探讨了器官芯片技术在生殖和妊娠领域应用的创新点,包括克服现有平台限制的新方法,如空间转录组学和成像流式细胞术 | 描述了器官芯片平台的局限性,如细胞数量少、上清液体积低、制造材料限制以及分子和生化检测的不足 | 旨在评估器官芯片技术在生殖和妊娠相关生理病理建模及药物评估中的应用潜力和挑战 | 生殖和妊娠相关的器官芯片平台 | 生物医学工程 | NA | 空间转录组学、成像流式细胞术、外泌体分析 | NA | 图像、分子数据 | NA | NA | 器官芯片、微生理系统 | NA | NA |
| 80 | 2026-03-25 |
High fat diet-induced loss of pituitary plasticity in aging female mice with ablated leptin signaling in somatotropes
2025, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2025.1617109
PMID:40741169
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研究论文 | 本研究探讨高脂饮食对缺乏生长激素细胞中瘦素受体的老年雌性小鼠垂体转录组功能的影响 | 首次揭示高脂饮食通过下调翻译调控通路和减少多潜能细胞表达,损害老年小鼠垂体可塑性,尤其在瘦素受体缺失突变体中更显著 | 研究仅基于小鼠模型,未涉及人类样本;样本量相对较小;未深入探讨高脂饮食诱导的氧化应激具体分子机制 | 探究高脂饮食如何影响缺乏生长激素细胞瘦素受体的老年雌性小鼠垂体转录组功能 | 10月龄缺乏生长激素细胞瘦素受体的雌性突变小鼠及其同窝对照小鼠 | 单细胞转录组学 | 肥胖相关代谢疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、生物信息学分析、葡萄糖耐量测试、代谢笼监测 | NA | 单细胞转录组数据、血清激素和细胞因子数据 | 老年雌性突变小鼠和对照小鼠,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |