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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-06-06 |
Emerging technologies and current challenges in intratumoral microbiota research
2025, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2025.1685862
PMID:41552720
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综述 | 系统总结瘤内微生物研究中的新兴技术与当前挑战,涵盖检测方法、功能解析及临床转化 | 整合单细胞RNA测序、空间转录组学、类器官共培养及人工智能等多技术手段,提出从描述性分析向机制研究和临床转化跨越的路径 | 瘤内微生物低生物量导致检测易受环境污染,分析流程标准化不足,跨研究比较困难 | 阐述瘤内微生物研究的技术进展和挑战,推动精准肿瘤学中微生物导向策略的发展 | 肿瘤微环境中的瘤内微生物 | 机器学习 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 优化厌氧培养, 基因组解析分析, 酶水平分析, 类器官共培养 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 62 | 2026-06-06 |
Integration of single cell and bulk transcriptomic analyses identifies FAM189A2 as a key prognostic gene in lung cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1701806
PMID:41567189
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研究论文 | 通过整合单细胞和批量转录组分析,识别出FAM189A2作为肺癌关键预后基因 | 首次将单细胞RNA测序与TCGA批量转录组数据整合,构建八基因LASSO-Cox风险模型,并发现FAM189A2作为推定肿瘤抑制因子和潜在生物标志物 | 研究基于回顾性公共数据集,FAM189A2的功能仅在体外细胞系中验证,缺乏体内模型和前瞻性临床验证 | 阐明恶性细胞状态与患者预后和治疗脆弱性的关联,开发可行的预后风险分层模型 | 13例原发性肺肿瘤及配对正常肺组织的单细胞RNA测序数据,以及TCGA-LUAD和两个外部验证队列 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | CNN, LSTM, GAN | 图像, 文本, 视频 | 13例肺肿瘤和配对正常组织(48149个细胞)以及三个批量转录组队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 63 | 2026-06-06 |
A review of omics studies in sarcopenia: from molecular mechanisms to hepatic-gut-muscle interactions in chronic liver disease comorbidity
2025, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2025.1710582
PMID:41568005
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综述 | 综述了肌少症的多组学研究,从分子机制到慢性肝病共病中的肝-肠-肌肉相互作用 | 提出“共性-特异性”双层框架,在共性层面识别出蛋白质稳态失衡、线粒体功能障碍、慢性炎症和肠-肌轴失调四大核心病理支柱,在特异性层面提出“弱信号协同积累”假说解释慢性肝病中的肌少症机制 | 目前组学研究大多停留在相关性层面,向临床转化面临挑战 | 系统解析肌少症及其与慢性肝病共病的分子机制,为精准诊疗提供理论基础和发展路线图 | 肌少症及慢性肝病相关肌少症的多组学研究 | 机器学习 | 肌少症,慢性肝病 | 单细胞多组学,空间转录组学 | NA | 组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 64 | 2026-06-06 |
Elucidating the role of SHROOM4 in non-small cell lung cancer: expression patterns, clinical correlations, and potential functions
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1723844
PMID:41573567
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研究论文 | 通过生物信息学分析探索SHROOM4在非小细胞肺癌中的表达模式、临床相关性及潜在功能 | 首次系统研究SHROOM4在非小细胞肺癌中的表达特征及其与肿瘤微环境的关系,发现其与Wnt/Beta-Catenin通路和ANGPTL7/SFTPC的关联 | 基于公共数据库分析,需进一步实验验证SHROOM4在肺癌进展中的具体机制及临床实用性 | 阐明SHROOM4在非小细胞肺癌中的表达模式、临床意义及潜在功能 | SHROOM4基因在非小细胞肺癌(尤其是肺鳞癌)中的表达及其相关机制 | 生物信息学 | 肺癌 | 生物信息学分析、RNA-seq、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 肺鳞癌组织及对应正常组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 65 | 2026-06-06 |
Cuproptosis-driven reprogramming of fibroblast communication by GK is associated with the immune microenvironment in diabetic foot ulcers
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1687806
PMID:41583446
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析,揭示铜死亡相关基因GK在糖尿病足溃疡中通过成纤维细胞重编程免疫微环境的作用 | 首次将铜死亡机制与糖尿病足溃疡的成纤维细胞-免疫细胞通讯联系起来,并鉴定GK为诊断生物标志物 | 功能验证仅基于动物实验和计算预测,缺乏直接的细胞功能实验和人类样本验证 | 探究铜死亡在糖尿病足溃疡成纤维细胞与免疫细胞相互作用中的角色及潜在生物标志物 | 糖尿病足溃疡患者和健康皮肤组织的单细胞RNA测序数据,以及大鼠模型 | 数字病理学 | 糖尿病足溃疡 | scRNA-seq | 机器学习(LASSO, SVM-RFE, 随机森林) | 基因表达数据 | 33,095个细胞(质控后25,198个),9只SD大鼠(每组3只) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 66 | 2026-06-06 |
PANoptosis in urological diseases: molecular mechanisms, pathological roles, and emerging therapeutic opportunities
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1729348
PMID:41583472
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综述 | 本文综述了PANoptosis在泌尿系统疾病中的分子机制、病理作用及新兴治疗策略 | 首次系统阐述了PANoptosis在泌尿系统疾病中的双重作用,既促进组织损伤又驱动抗肿瘤免疫,并提出了多组学生物标志物筛选、纳米材料递送系统和联合疗法等创新治疗方向 | 未提及具体局限性 | 梳理PANoptosis在泌尿系统疾病中的分子机制和调控网络,探讨其作为诊断标志物和治疗靶点的潜力 | 泌尿系统疾病,包括急性/慢性肾损伤、前列腺癌、肾癌和睾丸病变 | 机器学习 | 前列腺癌 | 单细胞测序、空间转录组学 | NA | NA | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序,10x Visium FFPE空间转录组学 |
| 67 | 2026-06-06 |
Single-cell transcriptomics reveals a novel mechanism of RDH16 regulating immune infiltration in hepatocellular carcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1689987
PMID:41601632
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示RDH16在肝细胞癌中调控免疫浸润的新机制 | 整合单细胞RNA测序与批量转录组数据集,全面表征HCC的肿瘤细胞异质性和免疫微环境特征,并首次揭示了RDH16作为免疫调节生物标志物,通过调控CD163⁺ M2巨噬细胞浸润影响肿瘤免疫微环境 | NA | 探索肝细胞癌中免疫调节的可操作生物标志物及机制,以改善患者预后 | 肝细胞癌肿瘤细胞和免疫浸润细胞 | 机器学习 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 68 | 2026-06-06 |
Integrated multi-omic profiling reveals macrophage-driven prognostic signatures in clear cell renal cell carcinoma through machine learning optimization
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1612262
PMID:41601657
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序与机器学习方法,揭示了肾透明细胞癌中肿瘤相关巨噬细胞的异质性及其驱动的预后特征 | 首次通过机器学习优化整合多组学数据,鉴定出五种转录上不同的巨噬细胞亚群,并构建了基于巨噬细胞的预后签名,特别是识别出PRDX1+LA-Mac作为主要病理亚型 | 未提及具体限制,但基于摘要可推测可能包括样本量有限(仅10个肿瘤)及验证队列数量不足 | 描绘肾透明细胞癌中肿瘤相关巨噬细胞的异质性,识别预后巨噬细胞特征,并表征驱动疾病进展的免疫-代谢程序 | 肾透明细胞癌肿瘤组织中的巨噬细胞亚群及其相关免疫和代谢特征 | 机器学习 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | 随机生存森林 | 基因表达数据 | 10个肾透明细胞癌肿瘤样本(scRNA-seq)及TCGA和CPTAC独立队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 69 | 2026-06-06 |
Interleukin-36 upregulates type-I interferon responses in systemic lupus erythematosus by promoting the accumulation of self-nucleic acids
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1727524
PMID:41607774
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研究论文 | 研究揭示白介素-36通过促进自我核酸积累上调系统性红斑狼疮中的I型干扰素反应 | 首次阐明IL-36通过下调RNA酶基因和诱导单核细胞凋亡,促进自我核酸积累,从而激活I型IFN通路的新机制 | 样本量较小(scRNA-seq 5个供体,qPCR 9个供体,流式6个供体),可能限制统计效力 | 探索IL-36在系统性红斑狼疮中过度激活I型IFN反应的分子机制 | 健康人和SLE患者的外周血单核细胞 | 机器学习和单细胞转录组学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、实时定量PCR、流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据、基因表达数据、流式数据 | scRNA-seq: 5个健康供体;qPCR: 9个供体;流式: 6个供体;SLE scRNA-seq数据集: 33例患者和11例对照 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 70 | 2026-06-05 |
SLC12A7 serves as a prognostic and immunotherapeutic biomarker identified by multi-omics analysis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1712579
PMID:41668766
|
研究论文 | 通过多组学分析鉴定SLC12A7作为预后和免疫治疗生物标志物 | 首次系统揭示SLC12A7在多种癌症中的预后价值和免疫治疗潜力,尤其在肝细胞癌中通过体外实验验证其促癌功能 | 未明确说明具体局限性 | 评估SLC12A7在泛癌中的表达模式、预后意义及免疫相关性,并验证其在肝细胞癌中的致癌作用 | 多种癌症组织样本及肝细胞癌细胞系 | 机器学习和生物信息学 | 肝细胞癌,多种癌症 | 转录组测序,单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据,单细胞RNA测序数据 | TCGA、GTEx、cBioPortal、TIMER 2.0和GEO数据库中的多种癌症样本 | NA | NA | NA | NA |
| 71 | 2026-06-04 |
The role of 5-methylcytosine regulator-related genes in diagnostic and immune regulatory functions in atherosclerosis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1636323
PMID:41583468
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研究论文 | 研究5-甲基胞嘧啶调控相关基因在动脉粥样硬化诊断和免疫调节中的作用 | 首次系统分析m5C修饰及其调控基因在AS中的诊断和免疫调控功能,并通过单细胞RNA测序和体外实验验证NSUN3在巨噬细胞功能中的关键作用 | 研究主要基于公开微阵列数据集,样本量有限且缺乏大规模临床验证;ceRNA网络仅通过数据库预测,未进行实验验证 | 探究m5C修饰和相关基因在动脉粥样硬化诊断和免疫调节中的功能 | 动脉粥样硬化患者样本和THP-1巨噬细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 微阵列分析,单细胞RNA测序,实时定量PCR,RNA干扰 | LASSO逻辑回归模型,WGCNA | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | 四个GEO数据集(GSE90074、GSE27034、GSE59421、GSE159677) | NA | 转录组测序 | NA | 来自GEO数据库的微阵列平台相关数据 |
| 72 | 2026-06-02 |
Dynamic Reprogramming of Stromal Pdgfra-expressing cells during WNT-Mediated Transformation of the Intestinal Epithelium
2025-Jan-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.22.634326
PMID:39896606
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研究论文 | 研究WNT介导的肠道上皮转化过程中基质Pdgfra表达细胞的动态重编程 | 首次揭示Pdgfra成纤维细胞在WNT驱动肿瘤发生早期分泌配体促进肠黏膜再生样状态 | 未明确说明 | 探究WNT介导的肠道肿瘤发生过程中基质成纤维细胞的动态变化及与上皮细胞的相互作用 | 小鼠肠道间充质细胞和上皮细胞 | 机器学习 | 肠道肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 73 | 2026-06-02 |
Glucocorticoid receptor inhibits Th2 immune responses by down-regulating Pparg and Gata3 in schistosomiasis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1518586
PMID:40196108
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研究论文 | 本研究探究糖皮质激素受体激活通过下调Pparg和Gata3抑制血吸虫病中Th2免疫反应的机制 | 首次整合RNA测序和单细胞测序揭示GR激活通过下调关键转录因子Gata3和Pparg抑制血吸虫病Th2免疫反应的分子机制 | 需要进一步研究评估靶向GR激活治疗血吸虫病的可行性和安全性 | 探究GR激活对血吸虫病肝脏Th2免疫反应的影响及其分子机制 | 日本血吸虫感染小鼠模型和Th2细胞 | 机器学习和数字病理学 | 血吸虫病 | RNA测序,单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 感染日本血吸虫的小鼠及体外培养的Th2细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 74 | 2026-05-30 |
Single-cell sequencing reveals the features of adaptive immune responses in the liver of a mouse model of dengue fever
2025-01, Animal models and experimental medicine
IF:3.8Q2
DOI:10.1002/ame2.12454
PMID:38988280
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研究论文 | 利用单细胞测序技术揭示登革热小鼠模型肝脏中适应性免疫反应的特征 | 首次通过单细胞测序详细描绘了登革热病毒感染的轻度和重度小鼠模型中肝脏T细胞免疫反应的变化以及巨噬细胞与T细胞之间的免疫相互作用 | 可能仅限于小鼠模型,结果在人体中的适用性有待验证 | 探究严重登革热中与肝损伤相关的适应性免疫反应特征 | 登革热轻度或重度小鼠模型 | 数字病理学 | 传染病(登革热) | 单细胞测序,流式细胞术 | NA | 单细胞基因表达数据 | 小鼠肝脏组织样本(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 75 | 2026-05-30 |
Fam3a-mediated prohormone convertase switch in α-cells regulates pancreatic GLP-1 production in an Nr4a2-Foxa2-dependent manner
2025-01, Metabolism: clinical and experimental
DOI:10.1016/j.metabol.2024.156042
PMID:39362520
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research paper | 本研究揭示了Fam3a通过Nr4a2-Foxa2途径调控α细胞中前激素转化酶开关,从而促进胰腺GLP-1产生的机制 | 首次发现Fam3a缺失可通过Nr4a2-Foxa2-PC1/3依赖方式重编程α细胞前胰高血糖素加工产物从胰高血糖素转向GLP-1,为糖尿病治疗提供新策略 | 研究主要基于小鼠模型,人类α细胞中的相关机制仍需进一步验证 | 探究Fam3a在α细胞功能调控中的作用及分子机制,特别是对GLP-1产生的影响 | 小鼠胰腺α细胞系αTC1.9细胞、人胰岛单细胞RNA测序数据集、Fam3a基因敲除小鼠 | machine learning | geriatric disease | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、转录组分析、双荧光素酶报告基因检测、核转位实验 | NA | 基因表达数据 | 野生型与Fam3a-/-小鼠、α细胞特异性Fam3a敲除小鼠、人类胰岛单细胞RNA测序数据集 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 76 | 2026-05-30 |
Single-cell RNA sequencing uncovers intestinal immune alterations and cellular diversity from chronic fluoride exposure in mice
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.116567
PMID:40756359
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示慢性氟暴露对小鼠肠道免疫细胞和细胞多样性的影响 | 首次在单细胞水平解析慢性氟暴露对肠道细胞异质性和细胞间通信的影响,发现氟暴露通过破坏黏液屏障和肠道菌群稳态激活MHC-II信号通路,引发肠道免疫细胞激活和炎症 | 研究仅在小鼠模型中进行,未在人类样本中验证;氟暴露浓度固定为50 ppm,未探讨不同浓度梯度的影响;仅分析了回肠组织,未覆盖整个肠道 | 探究长期饮用高氟水对肠道细胞组成、功能及肠道免疫系统的影响机制 | 小鼠回肠组织细胞,包括肠上皮细胞、杯状细胞、潘氏细胞、T细胞和B细胞 | 数字病理学 | 氟中毒相关肠道疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠回肠组织样本(氟暴露50周,50 ppm水) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞测序平台 |
| 77 | 2026-05-29 |
Integrated Mendelian Randomization and Single-Cell Transcriptomics Analysis Identifies Critical Blood Biomarkers and Potential Mechanisms in Epilepsy
2025-Jan, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.70172
PMID:39753851
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研究论文 | 通过整合孟德尔随机化和单细胞转录组学分析,识别癫痫的关键血液生物标志物和潜在机制 | 首次通过孟德尔随机化结合单细胞转录组学,系统揭示了癫痫风险相关基因及其对免疫微环境的影响,并建立了抗癫痫药物反应预测模型 | 未提及具体局限性,但可能包括样本量有限、动物模型与人类的差异、以及预测模型需进一步临床验证 | 阐明癫痫的遗传因果因素及其与免疫环境的动态关系 | 癫痫患者外周血样本、癫痫小鼠模型的海马组织 | 自然语言处理 | 癫痫 | 孟德尔随机化、单细胞转录组学、CIBERSORT免疫浸润分析、RNA-seq | 预测模型(具体类型未提及) | 基因表达数据、免疫细胞组成数据 | 未明确说明,但涉及eQTLGen和GWAS数据、癫痫患者外周血样本及小鼠模型 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 78 | 2026-05-28 |
A panoramic view of cell population dynamics in mammalian aging
2025-Jan-17, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adn3949
PMID:39607904
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研究论文 | 通过构建单细胞转录组图谱PanSci,分析了哺乳动物衰老过程中细胞种群动态变化 | 首次构建包含超过2000万个细胞、覆盖多个生命阶段、性别和基因型的综合单细胞转录组图谱,揭示3000多种细胞状态和200多种与衰老相关的细胞群,并识别免疫系统对衰老的调控作用 | 未明确说明局限性 | 阐明哺乳动物衰老过程中与细胞种群动态相关的机制 | 小鼠623个组织的细胞 | 机器学习 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 超过2000万个细胞,来自623个小鼠组织,涵盖不同生命阶段、性别和基因型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 79 | 2026-05-27 |
Microbiota-induced S100A11-RAGE axis underlies immune evasion in right-sided colon adenomas and is a therapeutic target to boost anti-PD1 efficacy
2025-01-17, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-332193
PMID:39251326
|
研究论文 | 本研究揭示了微生物群诱导的S100A11-RAGE轴在右侧结肠腺瘤中参与免疫逃逸,并可作为增强抗PD1疗效的治疗靶点 | 首次通过单细胞和空间转录组学解析右侧结肠腺瘤中杯状细胞功能障碍导致细菌移位,进而激活S100A11-RAGE轴促进免疫逃逸的机制,并发现靶向该轴可提升免疫治疗效果 | 未提及具体局限性信息 | 表征左右侧结肠腺瘤的差异及其在早期结肠肿瘤发生中的作用机制 | 左右侧结肠腺瘤组织、细胞、动物模型及临床标本 | 数字病理学, 机器学习 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据 | 包含单细胞和空间转录组数据集分析,以及细胞、动物实验和临床标本验证 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组学 |
| 80 | 2026-05-27 |
The loss of dNK1/2 and EVT1 cells at the maternal-fetal interface is associated with recurrent miscarriage†
2025-01-14, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioae136
PMID:39303127
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研究论文 | 通过单细胞测序分析复发性流产患者与健康供体的母胎界面细胞,发现dNK1/2和EVT1细胞缺失是该疾病的显著病理特征 | 首次鉴定出表达dNK1和dNK2双标志物的新亚群dNK1/2,并发现其在复发性流产组织中完全缺失;同时将绒毛外滋养细胞分为EVT1和EVT2亚群,揭示EVT1缺失与复发性流产的关联 | 未明确提及研究局限性,可能包括样本量较小或缺乏功能验证实验 | 识别复发性流产组织中细胞特征的异常,为理解该疾病提供新见解 | 复发性流产患者与健康供体的母胎界面组织细胞(包括蜕膜自然杀伤细胞和绒毛外滋养细胞亚群) | 单细胞测序、免疫学、生殖医学 | 复发性流产 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 复发性流产患者和健康供体样本(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |