单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
761	2025-01-12	Identification of cancer cell-intrinsic biomarkers associated with tumor progression and characterization of SFTA3 as a tumor suppressor in lung adenocarcinomas 2025-Jan-08, BMC cancer IF:3.4Q2 DOI:10.1186/s12885-024-13395-z PMID:39780110	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序数据识别了与肺腺癌进展相关的癌症细胞内在基因特征，并全面分析了SFTA3在肺腺癌中的作用	构建了一个包含八个基因的预后模型，并首次揭示了SFTA3在肺腺癌中的肿瘤抑制作用及其潜在诊断价值	研究主要基于单细胞RNA测序数据，样本量有限，且未进行大规模临床验证	识别与肺腺癌进展相关的癌症细胞内在生物标志物，并探讨SFTA3在肺腺癌中的作用	肺腺癌患者及其血清样本	数字病理学	肺癌	单细胞RNA测序	预后模型	RNA测序数据	未明确提及具体样本数量
762	2025-01-12	Tokay gecko tail regeneration involves temporally collinear expression of HOXC genes and early expression of satellite cell markers 2025-Jan-08, BMC biology IF:4.4Q1 DOI:10.1186/s12915-024-02111-9 PMID:39780185	研究论文	本研究探讨了托卡壁虎尾部再生过程中的基因表达模式，并与胚胎尾部发育进行了比较	揭示了托卡壁虎尾部再生过程中HOXC基因的时间共线性表达及卫星细胞标记物的早期表达，与胚胎发育模式不同	研究仅限于托卡壁虎，未涉及其他蜥蜴物种的尾部再生机制	探究托卡壁虎尾部再生的分子机制及其与胚胎发育的差异	托卡壁虎的尾部再生和胚胎尾部发育	发育生物学	NA	转录组学、单细胞测序、原位杂交	NA	基因表达数据	托卡壁虎尾部再生的七个阶段和胚胎尾部发育的三个阶段
763	2025-01-12	Role and mechanism of LINC02390 and its potential target genes, CLECL1 and CD69, in immune microenvironment of lung adenocarcinoma 2025, Technology and health care : official journal of the European Society for Engineering and Medicine IF:1.4Q3 DOI:10.3233/THC-241452 PMID:39269874	研究论文	本文探讨了LINC02390及其潜在靶基因CLECL1和CD69在肺腺癌免疫微环境中的作用和机制	首次发现LINC02390及其靶基因CLECL1和CD69与肺腺癌患者预后及免疫微环境的关系	研究主要基于生物信息学分析，需要进一步的实验验证	寻找能预测肺腺癌预后的生物标志物，并探索其在免疫微环境中的作用	肺腺癌患者及其相关基因表达	生物信息学	肺腺癌	生存分析、GO和KEGG分析、单细胞测序、免疫组化染色	NA	基因表达数据、临床组织样本	在线数据库cbioportal和TIMER中的基因突变数据，单细胞测序数据集GSE111894，临床组织样本
764	2025-01-12	Tertiary Lymphoid Structure in Dental Pulp: The Role in Combating Bacterial Infections 2025-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202406684 PMID:39465672	研究论文	本研究探讨了牙髓中三级淋巴结构（TLS）在对抗细菌感染中的作用	首次在牙髓中揭示了TLS的形成及其在感染反应中的功能，并识别了可能驱动TLS形成的关键分子CCL3	研究中使用的样本量未明确说明，且主要基于单细胞RNA测序和免疫荧光染色，可能限制了结果的广泛适用性	研究牙髓中TLS的形成及其在免疫反应中的作用	健康和发炎的人牙髓样本及小鼠牙髓炎模型	免疫学	牙髓炎	单细胞RNA测序，多重免疫荧光染色	NA	RNA序列数据，图像数据	未明确说明
765	2025-01-12	Targeting SLITRK4 Restrains Proliferation and Liver Metastasis in Colorectal Cancer via Regulating PI3K/AKT/NFκB Pathway and Tumor-Associated Macrophage 2025-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202400367 PMID:39499724	研究论文	本文研究了SLITRK4在结直肠癌（CRC）肝转移中的作用及其通过调节PI3K/AKT/NFκB通路和肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）的机制	首次发现SLITRK4在CRC肝转移中的关键作用，并通过系统性siRNA递送的脂质-聚合物杂化纳米颗粒（NPs）验证了其治疗潜力	研究主要依赖于体外和体内模型，尚未进行大规模临床试验	探索CRC肝转移的新驱动因素及其治疗策略	结直肠癌患者及其肝转移组织	癌症研究	结直肠癌	转录组分析、单细胞RNA测序、脂质-聚合物杂化纳米颗粒	体外和体内模型	RNA测序数据、细胞培养数据	人类患者的原发癌旁组织、结直肠肿瘤和转移组织
766	2025-01-12	Identifying Multiomic Signatures of X-Linked Retinoschisis-Derived Retinal Organoids and Mice Harboring Patient-Specific Mutation Using Spatiotemporal Single-Cell Transcriptomics 2025-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202405818 PMID:39503290	研究论文	本文通过多组学方法结合单细胞RNA测序和时空转录组学，揭示了X连锁视网膜劈裂症（XLRS）的转录组特征，并验证了潜在的治疗靶点	首次结合高吞吐量单细胞RNA测序和时空转录组学，解析XLRS特异性转录组特征，并验证了慢性内质网应激/eIF2α信号通路的治疗潜力	研究仅限于两种XLRS样模型（基因工程小鼠和患者来源的视网膜类器官），未涉及其他XLRS突变模型	解析XLRS的分子病理机制并探索潜在治疗靶点	基因工程小鼠和患者来源的视网膜类器官	数字病理	视网膜疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、时空转录组学（ST）、蛋白质组学分析	NA	转录组数据、蛋白质数据	两种XLRS样模型（基因工程小鼠和患者来源的视网膜类器官）
767	2025-01-12	Advances on the Role of Lung Macrophages in the Pathogenesis of Chronic Obstructive Pulmonary Disease in the Era of Single-Cell Genomics 2025, International journal of medical sciences IF:3.2Q1 DOI:10.7150/ijms.100160 PMID:39781522	综述	本文综述了肺巨噬细胞在慢性阻塞性肺疾病（COPD）发病机制中的作用，特别是在单细胞基因组学时代的新发现	利用单细胞RNA测序技术揭示了COPD中巨噬细胞的分子异质性，提供了对巨噬细胞在COPD中作用的新见解	文章主要基于已有文献综述，缺乏新的实验数据支持	探讨肺巨噬细胞在COPD发病机制中的复杂作用	肺巨噬细胞及其在COPD中的亚群	单细胞基因组学	慢性阻塞性肺疾病	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	NA
768	2025-01-12	Construction and validation of prognosis and treatment outcome models based on plasma membrane tension characteristics in bladder cancer 2025, PeerJ IF:2.3Q2 DOI:10.7717/peerj.18816 PMID:39790460	研究论文	本研究基于膀胱癌患者的血浆膜张力相关基因（MTRGs）构建并验证了预后和治疗结果模型	首次揭示了MTRGs在膀胱癌肿瘤微环境中的预后意义及其与免疫浸润模式的相关性，并发现DCBLD2作为潜在的治疗靶点	研究主要依赖于TCGA和GEO数据库的数据，可能受到数据质量和样本量的限制	探讨MTRGs在膀胱癌中的具体机制及其对预后的影响	膀胱癌患者	数字病理学	膀胱癌	转录组分析、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、qRT-PCR、伤口愈合实验、Transwell实验	LASSO回归、Cox回归分析	转录组数据、临床数据、突变数据	来自TCGA和GEO数据库的膀胱癌患者数据
769	2025-01-12	PD-1+CD8+ T Cell-Mediated Hepatocyte Pyroptosis Promotes Progression of Murine Autoimmune Liver Disease 2025-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202407284 PMID:39494472	研究论文	本文探讨了自身免疫性肝病中效应途径的具体机制，通过单细胞测序和体外分析，识别了肝脏中PD-1+CD8+ T细胞的一个特定致病亚群，并揭示了其通过GSDMD介导的细胞焦亡促进疾病进展的机制	本文首次识别了肝脏中PD-1+CD8+ T细胞的一个特定致病亚群，并揭示了其通过GSDMD介导的细胞焦亡促进疾病进展的机制，为自身免疫性肝病的治疗提供了新的潜在靶点	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类患者中进行验证	探讨自身免疫性肝病中效应途径的具体机制，并寻找潜在的治疗靶点	dnTGFβRII Aire小鼠模型中的PD-1+CD8+ T细胞	免疫学	自身免疫性肝病	单细胞测序，体外分析	小鼠模型	单细胞数据，体外实验数据	dnTGFβRII Aire小鼠模型
770	2025-01-12	Landscape of the Peripheral Immune Response Induced by Intraoperative Radiotherapy Combined with Surgery in Early Breast Cancer Patients 2025-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202308174 PMID:39494578	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和单细胞T细胞受体测序，分析了早期乳腺癌患者在接受术中放疗（IORT）联合手术前后的外周血单核细胞（PBMCs）的免疫反应	首次全面分析了IORT联合手术对早期乳腺癌患者外周血免疫细胞的影响，揭示了IORT对T细胞、单核吞噬细胞和浆细胞比例的调节作用，以及其对CD8Teff_GZMK细胞毒性评分和T细胞克隆扩增的显著影响	研究样本量有限，且仅针对早期乳腺癌患者，未涉及其他类型癌症或晚期患者	探讨IORT联合手术对早期乳腺癌患者外周血免疫反应的影响	早期乳腺癌患者的外周血单核细胞（PBMCs）	数字病理学	乳腺癌	单细胞RNA测序，单细胞T细胞受体测序，流式细胞术	NA	单细胞RNA测序数据，流式细胞术数据	早期乳腺癌患者的外周血单核细胞样本
771	2025-01-12	Are oligodendrocytes bystanders or drivers of Parkinson's disease pathology? 2025-Jan, PLoS biology IF:7.8Q1 DOI:10.1371/journal.pbio.3002977 PMID:39777410	评论	本文探讨了少突胶质细胞在帕金森病病理中的潜在作用，强调了其在疾病早期阶段的重要性	提出了少突胶质细胞在帕金森病早期阶段可能扮演重要角色的新观点，挑战了传统上认为帕金森病仅是神经元疾病的观点	目前对少突胶质细胞在帕金森病中的实际功能角色仍高度推测性，需要更多科学研究来深入理解	探讨少突胶质细胞在帕金森病病理中的作用，以寻找有效的疾病修饰疗法	少突胶质细胞	神经科学	帕金森病	单细胞转录组学	NA	NA	NA
772	2025-01-12	Inhibition of Abdominal Aortic Aneurysm Progression Through the CXCL12/CXCR4 Axis via MiR206-3p Sponge 2025-Jan, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2 DOI:10.1111/jcmm.70328 PMID:39779470	研究论文	本文研究了通过MiR206-3p海绵抑制CXCL12/CXCR4轴对腹主动脉瘤（AAA）进展的影响	提出MiR206-3p海绵作为一种创新治疗策略，通过抑制CXCL12/CXCR4信号通路来减缓AAA的进展和破裂风险	研究主要基于小鼠模型，人类样本的研究仍需进一步验证	探讨CXCL12/CXCR4信号通路在AAA发展中的具体作用及其作为治疗靶点的潜力	腹主动脉瘤（AAA）小鼠模型和人类AAA患者	生物医学	心血管疾病	单细胞RNA测序分析、血清ELISA、体内外实验	小鼠模型	RNA测序数据、血清数据	人类AAA患者和小鼠模型
773	2025-01-11	Single-Cell RNA-seq Reveals Increased and Activated Post-Capillary Venule Endothelial Cells in Erythrodermic Psoriasis 2025-Jan-09, Inflammation IF:4.5Q2 DOI:10.1007/s10753-024-02216-x PMID:39786459	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序等技术，揭示了红皮病型银屑病（EP）中毛细血管后微静脉内皮细胞的增加和激活现象	首次在EP中观察到毛细血管后微静脉内皮细胞的显著增加和激活，并揭示了其与白细胞之间的增强相互作用	研究主要基于人类和小鼠样本，可能需要在更大样本量和更多物种中验证	探讨红皮病型银屑病的病理机制，特别是血管内皮细胞的作用	红皮病型银屑病（EP）患者和健康对照的血管内皮细胞	生物医学	银屑病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、免疫荧光、流式细胞术	NA	RNA测序数据、图像数据	人类和小鼠样本
774	2025-01-11	Lessons learned from spatial transcriptomic analyses in clear-cell renal cell carcinoma 2025-Jan-09, Nature reviews. Urology DOI:10.1038/s41585-024-00980-x PMID:39789293	研究论文	本文探讨了空间转录组学在透明细胞肾细胞癌（ccRCC）中的应用及其对肿瘤微环境异质性的洞察	首次使用空间转录组学技术研究ccRCC，揭示了肿瘤细胞、成纤维细胞、表达IL-2的巨噬细胞和透明化区域之间的空间相互作用	目前仅研究了ccRCC这一种肾细胞癌亚型，未涉及其他亚型	探索空间转录组学在ccRCC中的应用，揭示肿瘤微环境的异质性	透明细胞肾细胞癌（ccRCC）	数字病理学	肾细胞癌	空间转录组学	NA	空间转录组数据	NA
775	2025-01-11	Lipid metabolism-related genes are involved in the formation of macrophage extracellular traps in allergic airway inflammation 2025-Jan-09, Genes and immunity IF:5.0Q2 DOI:10.1038/s41435-025-00319-5 PMID:39789299	研究论文	本研究探讨了脂质代谢相关基因在过敏性气道炎症中巨噬细胞外陷阱（METs）形成中的作用	首次揭示了脂质代谢基因ABCA1、SLC44A2和C3在METs形成中的关键作用，并提出了ABCA1作为哮喘治疗潜在靶点的可能性	研究主要基于生物信息学分析和体外实验，缺乏更多体内实验验证	探究脂质代谢是否参与巨噬细胞外陷阱（METs）的形成	巨噬细胞外陷阱（METs）和脂质代谢相关基因	生物信息学	哮喘	加权基因共表达网络分析（WGCNA）、LASSO回归、免疫浸润分析、单细胞转录组分析、免疫荧光（IF）、SYTOX Green染色、Western blot	NA	基因表达数据	多个GEO数据集（GSE40885、GSE42606、GSE27066、GSE137268、GSE256534）和Tabula Muris数据库数据
776	2025-01-11	Tigulixostat Alleviates Hyperuricemic Nephropathy by Promoting M2 Macrophage Polarization 2025, Journal of inflammation research IF:4.2Q2 DOI:10.2147/JIR.S500101 PMID:39780982	研究论文	本文研究了Tigulixostat通过促进M2巨噬细胞极化来缓解高尿酸血症肾病的效果	发现Tigulixostat比现有的别嘌呤醇更有效地降低血清尿酸水平，并改善肾脏结果，且不引起肝损伤	研究仅限于Uox-KO小鼠模型，尚未在人体中进行验证	探索Tigulixostat对尿酸水平和高尿酸血症肾病的影响	Uox-KO小鼠	生物医学	高尿酸血症肾病	单细胞RNA测序、空间代谢组学、血浆代谢组学、流式细胞术	Uox-KO小鼠模型	RNA测序数据、代谢组学数据、流式细胞数据	Uox-KO小鼠
777	2025-01-11	KLRD1 (CD94): A Prognostic Biomarker and Therapeutic Candidate in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma 2025, Journal of Cancer IF:3.3Q2 DOI:10.7150/jca.104762 PMID:39781341	研究论文	本文探讨了KLRD1（CD94）在头颈部鳞状细胞癌（HNSC）中的预后价值和作为免疫治疗靶点的潜力	首次全面分析了KLRD1在多种癌症中的表达模式及其与患者预后的关系，并探索了其在NK细胞和耗竭CD8+ T细胞中的表达及其在抗肿瘤免疫反应中的作用	研究主要依赖于公共数据库的数据，缺乏实验验证	研究KLRD1在癌症中的表达模式、预后价值及其作为免疫治疗靶点的潜力	头颈部鳞状细胞癌（HNSC）患者	生物信息学	头颈部鳞状细胞癌	单细胞RNA测序、功能富集分析、免疫浸润分析	NA	基因表达数据、单细胞RNA测序数据	来自TCGA、GTEx和GEO数据库的多组学数据
778	2025-01-11	Single-cell analysis unveils cell subtypes of acral melanoma cells at the early and late differentiation stages 2025, Journal of Cancer IF:3.3Q2 DOI:10.7150/jca.102045 PMID:39781353	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了肢端黑色素瘤在早期和晚期分化阶段的细胞亚型	首次识别了C3 ID2+和C4 PCLAF+黑色素瘤细胞作为肢端黑色素瘤进化中的早期和晚期亚群，并揭示了C4 PCLAF+细胞在肢端黑色素瘤增殖中的关键作用	研究样本量较小，仅涉及六名黑色素瘤患者的样本	探索肢端黑色素瘤的细胞异质性及其在肿瘤进展中的作用	肢端黑色素瘤细胞	数字病理学	黑色素瘤	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA序列数据	六名黑色素瘤患者的样本
779	2025-01-11	Elucidating the Role of Estrogen Effects in Leukemia: Insights from Single-Cell RNA Sequencing and Mendelian Randomization 2025, Journal of Cancer IF:3.3Q2 DOI:10.7150/jca.100610 PMID:39781360	研究论文	本研究通过整合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和孟德尔随机化（MR）方法，探讨了雌激素及其受体与白血病及其相关蛋白之间的关系	首次将单细胞RNA测序与孟德尔随机化方法结合，为理解雌激素与白血病之间的分子关系提供了新视角	scRNA-seq和MR方法之间存在不一致性，表明需要更大的队列和更高的测序深度来进一步阐明这些相互作用的复杂性	探讨雌激素效应在白血病中的作用及其潜在抗肿瘤效果	白血病及其相关蛋白	生物信息学	白血病	单细胞RNA测序（scRNA-seq），孟德尔随机化（MR）	NA	RNA测序数据	14个BMMC单核细胞亚群
780	2025-01-11	TAGLN-RhoA/ROCK2-SLC2A3-mediated Mechano-metabolic Axis Promotes Skin Fibrosis 2025, International journal of biological sciences IF:8.2Q1 DOI:10.7150/ijbs.104484 PMID:39781462	研究论文	本文探讨了TAGLN-RhoA/ROCK2-SLC2A3介导的机械代谢轴在皮肤纤维化中的作用及其潜在机制	揭示了TAGLN通过RhoA/ROCK2通路调控SLC2A3表达，影响成纤维细胞的糖酵解和运动能力，为皮肤纤维化疾病提供了新的治疗靶点	研究主要基于体外实验和动物模型，尚未在人体临床试验中验证	研究TAGLN在皮肤纤维化发病机制中的作用	皮肤纤维化疾病中的成纤维细胞	生物医学	皮肤纤维化	RNA-seq, 免疫荧光, Transwell, 伤口愈合实验, 胶原凝胶收缩实验	NA	基因表达数据, 细胞实验数据	NA