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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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661 | 2025-05-02 |
Spatially segregated APOE+ macrophages restrict immunotherapy efficacy in clear cell renal cell carcinoma
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.109097
PMID:40303328
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research paper | 该研究揭示了APOE+巨噬细胞在透明细胞肾细胞癌(ccRCC)中促进免疫抑制和对免疫检查点阻断(ICB)疗法抵抗的关键作用 | 发现了APOE+巨噬细胞在ICB抵抗性ccRCC中的空间分布特征及其通过TGF-β信号塑造免疫抑制微环境的机制 | 研究主要基于单中心队列,需要更大规模的多中心验证 | 探索ccRCC免疫治疗抵抗的微环境机制 | 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)患者样本和细胞系 | 肿瘤免疫学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序,多重免疫荧光,Western blot,流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据,临床样本数据 | 超过2000个样本,包括230名接受ICB治疗的晚期ccRCC患者的真实世界队列 |
662 | 2025-05-02 |
Single-nucleus RNA sequencing and spatial transcriptomics reveal an immunosuppressive tumor microenvironment related to metastatic dissemination during pancreatic cancer liver metastasis
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.108925
PMID:40303346
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research paper | 该研究通过单核RNA测序和空间转录组学揭示了胰腺癌肝转移过程中与转移扩散相关的免疫抑制性肿瘤微环境 | 首次揭示了转移扩散细胞在肝转移过程中EMT相关基因的显著上调,以及SPP1通路在免疫抑制微环境中的关键作用,并发现CITED4作为PDAC肝转移的关键生物标志物 | 研究样本量相对有限,且主要关注肝转移,未涉及其他转移途径 | 探究胰腺导管腺癌(PDAC)肝转移过程中免疫微环境的作用机制 | PDAC的原发肿瘤(PT)和肝转移(LM)组织 | digital pathology | pancreatic cancer | single-nucleus RNA sequencing, spatial transcriptomics, multiplexed immunofluorescence staining, immunohistochemistry (IHC), transwell assay, scratch wound healing assay | prognostic models | RNA sequencing data, spatial transcriptomics data, immunofluorescence images | 62,326个细胞 |
663 | 2025-05-02 |
Modulation of brain immune microenvironment and cellular dynamics in systemic inflammation
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.107061
PMID:40303348
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研究论文 | 本研究探讨了系统性炎症中脑免疫微环境和细胞动力学的调控机制,特别是在脓毒症相关脑病(SAE)中的作用 | 开发了DeconvCellLink R包来研究神经炎症相关的细胞相互作用网络,并构建了系统性炎症反应期间脑细胞网络的动态变化图谱 | 人类和动物模型之间的脑细胞变化存在差异,可能影响研究结果的普适性 | 揭示脓毒症相关脑病的发病机制,特别是脑微环境中细胞通讯网络的作用 | 人类和小鼠模型中的髓系细胞、胶质细胞及其在脑免疫微环境中的相互作用 | 神经免疫学 | 脓毒症相关脑病 | 批量转录组学和单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 人类和小鼠模型的转录组数据 |
664 | 2025-05-02 |
Magnetic sculpture-like tumor cell vaccines enable targeted in situ immune activation and potent antitumor effects
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.107162
PMID:40303352
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研究论文 | 开发了一种新型的全细胞疫苗平台,结合了免疫原性、结构完整性和肿瘤靶向能力 | 通过高浓度FeCl处理肿瘤细胞,诱导快速形态固定,赋予细胞磁性,实现定向导航至肿瘤并增强免疫激活 | NA | 开发一种新型的全细胞疫苗平台,用于靶向、患者特异性的抗肿瘤治疗 | 肿瘤细胞和黑色素瘤小鼠模型 | 免疫治疗 | 黑色素瘤 | 空间转录组分析 | NA | NA | 黑色素瘤小鼠模型 |
665 | 2025-05-02 |
PD-1 activation mitigates lupus nephritis by suppressing hyperactive and heterogeneous PD-1+CD8+ T cells
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.107418
PMID:40303350
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研究论文 | 本文研究了PD-1表达的CD8 T细胞在狼疮性肾炎(LN)中的作用,并探索了PD-L1 Fc融合蛋白作为治疗策略的潜力 | 揭示了PD-1+CD8+ T细胞在LN中的过度活跃和克隆扩增特性,并证明了PD-L1 Fc治疗能有效减轻肾脏病理 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化需要进一步验证 | 探索PD-1+CD8+ T细胞在LN中的作用及PD-1/PD-L1通路作为治疗靶点的潜力 | LN患者和NZB/W F1小鼠 | 免疫学 | 狼疮性肾炎 | scRNA-seq, RNA-seq, q-PCR, 流式细胞术, Western blot | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据 | LN患者和NZB/W F1小鼠样本 |
666 | 2025-05-02 |
Serine supplementation suppresses hypoxia-induced pathological retinal angiogenesis
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.105299
PMID:40303351
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研究论文 | 探讨丝氨酸补充在抑制缺氧诱导的病理性视网膜血管生成中的作用 | 首次发现丝氨酸补充通过增强视网膜线粒体代谢和脂质利用,抑制失控的血管生成关键驱动因素 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类临床试验中验证 | 研究丝氨酸代谢在抑制缺氧驱动的视网膜新生血管中的作用 | 氧诱导视网膜病变(OIR)小鼠模型 | 眼科 | 视网膜病变 | 代谢组学、脂质组学、蛋白质组学、单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 生物分子数据(代谢物、脂质、蛋白质、RNA) | 野生型C57BL/6J OIR幼鼠 |
667 | 2025-05-02 |
Identification of disulfidptosis in esophageal squamous cell carcinoma based on single-cell and bulk RNA-seq data to predict prognosis and treatment response
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1567793
PMID:40303412
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research paper | 通过单细胞和批量RNA-seq数据识别食管鳞状细胞癌中的二硫键死亡现象,以预测预后和治疗反应 | 首次在食管鳞状细胞癌中识别与二硫键死亡相关的基因分子亚型,并构建预后模型和潜在治疗靶点 | 研究依赖于公开数据集,可能受限于样本量和数据质量 | 识别食管鳞状细胞癌中与二硫键死亡相关的分子亚型,构建预后模型并探索治疗靶点 | 食管鳞状细胞癌患者 | digital pathology | esophageal squamous cell carcinoma | RNA-seq, single-cell sequencing | LASSO-Cox regression | RNA-seq data, single-cell data | GSE53625和TCGA-ESCC队列数据,以及GSE160269单细胞测序数据集 |
668 | 2025-05-02 |
Heterogenous cancer-associated fibroblasts related tumor microenvironment marked by CD10/KLF4/TIAM1 were identified in pancreatic adenocarcinoma by integrated transcriptomics
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1557698
PMID:40303408
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研究论文 | 本研究通过整合转录组学方法,识别了胰腺导管腺癌(PDAC)中与异质性癌症相关成纤维细胞(CAFs)相关的肿瘤微环境(TME)亚型 | 首次识别了三种不同的CAF相关TME亚型(iCAF-rich、myCAF-rich和PSC-rich),并发现这些亚型具有独特的基因表达谱和预后相关性 | 研究主要基于转录组数据,需要进一步实验验证CAF亚型的功能机制 | 探索PDAC肿瘤微环境中CAF亚型的组成、比例及其临床意义 | 胰腺导管腺癌(PDAC)的肿瘤微环境和癌症相关成纤维细胞(CAFs) | 肿瘤微环境研究 | 胰腺癌 | 整合转录组学、多重免疫组化、空间转录组学 | NA | 转录组数据、空间转录组数据 | 未明确说明样本数量,但涉及多例PDAC患者样本 |
669 | 2025-05-02 |
Decoding immune cell dynamics in ischemic stroke: insights from single-cell RNA sequencing analysis
2025, Frontiers in aging neuroscience
IF:4.1Q2
DOI:10.3389/fnagi.2025.1549518
PMID:40303468
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research paper | 通过单细胞RNA测序分析解码缺血性中风中的免疫细胞动态 | 利用单细胞RNA测序技术揭示缺血性中风中的细胞类型和分子生物学过程,并预测细胞命运决定 | 样本量相对较小,仅分析了5,582个单细胞 | 研究缺血性中风的病理机制,特别是炎症过程中的吞噬作用 | 健康对照和缺血性中风患者的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | UMAP, iTALK | 基因表达数据 | 5,582个单细胞(来自健康对照和缺血性中风患者) |
670 | 2025-05-02 |
Heterogeneity of Renal Endothelial Cells, Interact with Neighboring Cells, and Endothelial Injury in Chronic Kidney Disease: Mechanisms and Therapeutic Implications
2025, International journal of medical sciences
IF:3.2Q1
DOI:10.7150/ijms.108299
PMID:40303495
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综述 | 本文综述了慢性肾脏病(CKD)中肾内皮细胞的异质性及其与邻近细胞的相互作用,以及内皮损伤的机制和治疗策略 | 利用单细胞测序技术深入探讨了肾内皮细胞的异质性及其微环境影响,并讨论了新兴的治疗方法如抗炎治疗、基因治疗和生活方式调整 | 综述性质的文章,未涉及具体实验数据或样本研究 | 探讨慢性肾脏病中内皮细胞异质性、内皮损伤机制及治疗策略 | 肾内皮细胞及其与邻近细胞的相互作用 | NA | 慢性肾脏病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
671 | 2025-05-02 |
Comprehensive Characterization of the Oxidative Stress Profiles in Neonatal Necrotizing Enterocolitis
2025, International journal of medical sciences
IF:3.2Q1
DOI:10.7150/ijms.109008
PMID:40303487
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研究论文 | 本研究旨在描述坏死性小肠结肠炎(NEC)中氧化应激(OS)的特征,识别相关枢纽基因及机制,并探索潜在治疗药物 | 整合bulk-RNA测序和单细胞RNA测序数据集,系统阐明NEC和非NEC组织中不同细胞群OS功能差异,并发现10种潜在治疗药物及4种巨噬细胞亚型 | 枢纽基因具体名称未在摘要中列出,可能影响结果解读 | 探究NEC发病机制中氧化应激的免疫环境及治疗方法 | 坏死性小肠结肠炎(NEC)小鼠模型及人类组织样本 | 生物医学 | 坏死性小肠结肠炎 | bulk-RNA测序, 单细胞RNA测序, 差异分析, 基因集富集分析, 免疫浸润分析, RT-qPCR, 免疫荧光染色 | NEC小鼠模型 | RNA测序数据 | 未明确说明样本数量(含小鼠模型和人类组织) |
672 | 2025-05-02 |
Integrative analysis of m6A-SNPs and single-cell RNA sequencing reveals key drivers of endocrine combined with CDK4/6 inhibitor therapy resistance in ER+ breast cancer
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1590363
PMID:40303916
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research paper | 该研究通过整合m6A-SNPs和单细胞RNA测序数据,探索了ER+乳腺癌对内分泌联合CDK4/6抑制剂治疗耐药的关键驱动因素 | 首次结合m6A-SNPs和单细胞RNA测序技术,揭示了FILIP1L和TOM1L1在ER+乳腺癌耐药性发展中的动态表达变化及其在PI3K-Akt和Wnt信号通路中的作用 | 研究样本量有限,且仅针对ER+乳腺癌,未涵盖其他亚型 | 探索ER+乳腺癌对内分泌联合CDK4/6抑制剂治疗耐药的分子机制 | ER+乳腺癌患者 | digital pathology | breast cancer | single-cell RNA sequencing, pseudotime trajectory analysis | NA | RNA-seq | 未明确提及具体样本数量 |
673 | 2025-05-01 |
Acute Communication Between Microglia and Nonparenchymal Immune Cells in the Anti-Aβ Antibody-Injected Cortex
2025-Jan-29, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.1456-24.2024
PMID:39741000
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research paper | 研究抗Aβ抗体对大脑免疫反应的急性影响 | 首次通过单细胞测序技术揭示了抗Aβ抗体注射后大脑中细胞间的急性通讯变化,特别是小胶质细胞与非实质免疫细胞之间的TGFβ信号通路 | 研究仅观察了24小时和3天两个时间点,未能涵盖更长期的免疫反应变化 | 理解抗Aβ抗体治疗阿尔茨海默病时大脑的免疫反应机制 | 14个月大的APP转基因小鼠(雄性和雌性)的大脑皮层 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞测序 | APP转基因小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据 | 未明确说明具体样本数量,使用雄性和雌性APP转基因小鼠 |
674 | 2025-05-01 |
Spatially resolved transcriptomics of benign and malignant peripheral nerve sheath tumors
2025-Jan-23, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf016
PMID:39847441
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术分析了良性和恶性外周神经鞘瘤的空间和生物学异质性 | 首次将空间转录组学应用于外周神经鞘瘤研究,提供了细胞组成和分化状态的空间信息 | 样本量较小,属于初步研究 | 确定外周神经鞘瘤的空间和生物学异质性 | 良性和恶性外周神经鞘瘤组织 | 数字病理学 | 外周神经鞘瘤 | 空间转录组学 | 空间聚类和加权相关网络分析 | 转录组数据 | 福尔马林固定石蜡包埋的病变外周神经组织 |
675 | 2025-05-01 |
Animal and vegetal materials of mouse oocytes segregate at first zygotic cleavage: a simple mechanism that makes the two-cell blastomeres differ reciprocally from the start
2025-Jan-17, Molecular human reproduction
IF:3.6Q1
DOI:10.1093/molehr/gaae045
PMID:39786543
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研究论文 | 本研究探讨了小鼠受精卵第一次分裂时动物极和植物极物质的分离机制,揭示了两细胞期姐妹分裂球从一开始就存在差异的简单机制 | 首次通过实验证实哺乳动物受精卵第一次分裂时会分离动物极和植物极物质,挑战了现有两种对立模型 | 研究仅在小鼠模型中进行,人类胚胎中是否适用仍需验证 | 探究两细胞期胚胎分裂球差异性的起源机制 | 小鼠受精卵及其两细胞期分裂球 | 发育生物学 | NA | ICSI(卵胞浆内单精子注射)、单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据、图像数据 | 不同受精位点(动物极、植物极、赤道)的小鼠卵母细胞 |
676 | 2025-05-01 |
FGFR2 directs inhibition of WNT signaling to regulate anterior fontanelle closure during skull development
2025-Jan-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204264
PMID:39775862
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研究论文 | 本研究探讨了FGFR2如何通过调节WNT信号通路影响颅骨发育中前囟闭合的机制 | 揭示了FGF-WNT信号回路在颅骨缝合形成中的新作用机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 阐明FGFR2在颅骨发育中调控前囟闭合的分子机制 | 小鼠颅骨前囟细胞和额骨成骨前沿细胞 | 发育生物学 | 颅骨畸形(如Apert、Pfeiffer和Crouzon综合征) | 小鼠遗传学和单细胞转录组学 | 小鼠遗传模型 | 基因表达数据 | NA |
677 | 2025-05-01 |
Transcriptional dynamics during karyogamy in rice zygotes
2025-Jan-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204497
PMID:39777484
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了水稻合子中核配过程中的基因表达动态 | 首次在植物合子中系统研究了核配过程中的转录动态,并发现了父本等位基因转录的起始时间 | 仅研究了水稻这一种植物,结果是否适用于其他植物尚不清楚 | 揭示植物合子中核配过程的转录调控机制 | 水稻合子 | 植物发育生物学 | NA | 单细胞转录组分析,RNA测序 | NA | 转录组数据 | 6个早期发育阶段的水稻合子(15分钟、30分钟、1小时、2小时、4小时和6小时) |
678 | 2025-05-01 |
[WWP1 plays a positive role in ameloblast differentiation and enamel formation in mice]
2025-Jan-09, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
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研究论文 | 研究WWP1在小鼠成釉细胞分化和釉质形成中的积极作用 | 首次揭示了WWP1在成釉细胞分化和釉质形成中的关键作用,并提供了WWP1敲除小鼠的详细表型分析 | 研究仅在小鼠模型中进行,未涉及人类样本 | 探究WWP1在小鼠釉质发育中的作用 | 小鼠成釉细胞和釉质 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序、免疫组化、显微CT、扫描电镜、能量色散谱、免疫荧光、Western blot | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、影像数据、蛋白质数据 | P1和P7阶段每组3只小鼠,P14、P28、2M和3M阶段每组6只小鼠 |
679 | 2025-05-01 |
[Advances in tooth development studies based on single-cell RNA sequencing]
2025-Jan-09, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
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review | 总结了单细胞RNA测序在牙齿发育研究中的最新进展 | 利用单细胞RNA测序技术深入解析牙齿发育过程中的细胞异质性和发育轨迹 | 未提及具体实验数据或样本量,可能缺乏实证支持 | 探索牙齿发育的分子机制及其在修复和再生中的应用 | 牙齿发育过程中的上皮和间充质细胞 | 生物医学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
680 | 2025-05-01 |
Tumor-initiating cells escape tumor immunity via CCL8 from tumor-associated macrophages in mice
2025-Jan-07, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI180893
PMID:39774471
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研究论文 | 本研究揭示了肿瘤起始细胞(TICs)通过肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)中的CCL8逃避免疫清除的机制 | 首次阐明了TICs通过GAS6/AXL/MERTK信号通路与调节性TAMs相互作用并分泌CCL8来逃避免疫清除的具体机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性有待进一步验证 | 探究肿瘤起始细胞逃避免疫清除的分子机制 | 肿瘤起始细胞(TICs)和调节性肿瘤相关巨噬细胞(Reg-TAMs) | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq)、双重组酶谱系追踪、化学抑制剂、条件性双敲除小鼠模型 | 小鼠肿瘤模型 | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量(使用小鼠模型) |