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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 661 | 2025-11-28 |
Multiscale Cell-Cell Interactive Spatial Transcriptomics Analysis
2025-Jan-03, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5743704/v1
PMID:39801521
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研究论文 | 提出多尺度细胞-细胞交互空间转录组学分析方法,整合多尺度拓扑表示与空间深度学习技术 | 首次在空间转录组学分析中考虑多尺度细胞-细胞相互作用,结合多尺度拓扑表示与先进空间深度学习技术 | NA | 改进空间转录组数据分析方法,更好地识别空间域和细胞间相互作用 | 空间转录组数据集 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 空间深度学习 | 空间基因表达数据 | 37个基准空间转录组数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 662 | 2025-11-28 |
SLC16A3 is a Prognostic Marker and Affects Immune Regulation in Bladder Cancer
2025, Combinatorial chemistry & high throughput screening
IF:1.6Q3
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研究论文 | 本研究系统分析了SLC16A3在膀胱癌中的表达及其与预后的关系,探讨了其通过调节代谢和m6A甲基化影响免疫浸润的机制 | 首次系统分析SLC16A3在膀胱癌中的预后价值和免疫调节功能,建立了可靠的预后模型 | 研究主要基于公共数据库和回顾性分析,需要进一步实验验证 | 探讨SLC16A3在膀胱癌中的预后价值和免疫调节机制 | 膀胱癌患者和膀胱癌细胞 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 单细胞测序,逆转录定量PCR,免疫组织化学,生物信息学分析 | 预后模型 | 基因表达数据,临床数据,单细胞测序数据 | 412例膀胱癌患者和3,115个膀胱癌细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 663 | 2025-11-28 |
Single-cell transcriptomics profiling reveals cellular origins and molecular drivers underlying melanoma brain metastasis
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0336502
PMID:41284647
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了黑色素瘤脑转移的细胞起源和分子驱动机制 | 首次识别出与脑转移相关的肿瘤细胞亚群MBMATCs,并开发了能够预测脑转移风险的MBM-Index生物标志物 | 样本量相对有限(26个黑色素瘤样本),需要在更大队列中进一步验证 | 探索黑色素瘤脑转移的细胞起源和分子机制 | 黑色素瘤患者肿瘤样本 | 单细胞组学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序,单核RNA测序,批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 26个黑色素瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序,单核RNA测序 | NA | NA |
| 664 | 2025-11-28 |
Integrative Bulk and Single-Cell Transcriptome Analyses Reveal Mitochondrial Metabolism-Related Biomarkers in IgA Nephropathy with Experimental Validation
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S565202
PMID:41287774
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研究论文 | 通过整合批量转录组和单细胞RNA测序分析,鉴定IgA肾病中线粒体代谢相关生物标志物CYP27B1和PCK1 | 首次整合批量转录组和单细胞RNA测序分析揭示IgA肾病中线粒体代谢相关生物标志物,并确定近端肾小管细胞为关键细胞类型 | 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步实验验证机制 | 确定线粒体代谢相关生物标志物在IgA肾病中的作用 | IgA肾病患者的转录组数据 | 生物信息学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序, 机器学习算法, 逆转录定量PCR | 机器学习算法 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 665 | 2025-11-28 |
Elevated ITGAV Expression in Seropositive Rheumatoid Arthritis: Diagnostic Potential and Immunopathological Insights
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S540469
PMID:41287769
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研究论文 | 本研究探讨整合素αV(ITGAV)在血清阳性类风湿关节炎中的表达及其作为诊断生物标志物的潜力 | 首次系统评估ITGAV在类风湿关节炎中的诊断价值,并通过单细胞转录组分析揭示其在炎症免疫细胞亚群中的特异性表达 | 需要未来纵向和功能研究验证其在个性化疾病管理中的作用 | 研究ITGAV作为类风湿关节炎潜在诊断生物标志物的价值 | 类风湿关节炎患者、骨关节炎患者和健康对照者的外周血样本 | 生物医学研究 | 类风湿关节炎 | ELISA, 单细胞RNA测序, 转录组分析, ROC曲线分析 | NA | 血液样本, 转录组数据, 临床参数 | 类风湿关节炎患者、骨关节炎患者和健康对照者的外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 666 | 2025-11-27 |
Dermal fibroblast cultures recapitulate differences between deermice and mice in their responses to a Toll-like receptor agonist
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1666789
PMID:41262241
|
研究论文 | 本研究通过体外培养真皮成纤维细胞,比较了白足鼠与小鼠对TLR2激动剂的免疫反应差异 | 首次在真皮成纤维细胞培养模型中揭示白足鼠与小鼠在TLR激动剂反应、内源性逆转录病毒激活和细胞自主免疫方面的种属差异 | 研究仅关注真皮成纤维细胞,未涉及其他免疫细胞类型;体外培养环境可能与体内实际情况存在差异 | 评估哺乳动物免疫反应的种属差异,建立适用于实验室和野外研究的体外模型 | 白足鼠(Peromyscus leucopus)和小鼠(Mus musculus)的原代真皮成纤维细胞 | 单细胞组学 | 传染病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两种啮齿类动物的原代真皮成纤维细胞培养物 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 667 | 2025-11-27 |
CDK1 may promote breast cancer progression through AKT activation and immune modulation
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1591706
PMID:41278293
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学和实验分析全面评估CDK1在乳腺癌中的表达、预后价值及生物学功能 | 首次系统揭示CDK1通过AKT激活和免疫调节促进乳腺癌进展的多重致癌机制 | 研究主要基于TCGA数据库和单一细胞系验证,需要更多临床样本和体内实验进一步证实 | 评估CDK1在乳腺癌中的临床意义和分子机制 | 乳腺癌组织和MDA-MB-231细胞系 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 转录组分析,单细胞RNA测序,shRNA敲低,Western blotting,CCK-8检测 | NA | 转录组数据,单细胞RNA测序数据,临床数据 | TCGA乳腺癌数据集和TISCH2单细胞数据库 | NA | 单细胞RNA测序,转录组测序 | NA | NA |
| 668 | 2025-11-27 |
T cell-driven sustained inflammation and immune dysregulation mimicking immunosenescence for up to three years post-COVID-19
2025, Immunity & inflammation
DOI:10.1007/s44466-025-00012-2
PMID:41278460
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研究论文 | 通过三年纵向研究揭示COVID-19康复者长期免疫失调特征,发现Th17细胞是慢性炎症的关键驱动因素 | 首次通过三年纵向追踪发现免疫衰老样特征持续存在,并鉴定出两种功能相反的Th17细胞亚群 | 样本量较小(47例患者),缺乏健康对照组比较 | 阐明COVID-19康复者长期免疫恢复轨迹及其与持续症状的关系 | 47名COVID-19康复患者 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序,多重细胞因子分析 | NA | 单细胞转录组数据,细胞因子数据 | 47名COVID-19患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 669 | 2025-11-27 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Therapeutic Effects of Electroacupuncture at BL23 on Hyperuricemia-Induced Nephritis
2025, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/ijog/2494933
PMID:41278550
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示电针刺激BL23穴对高尿酸血症诱导的肾炎的治疗效果 | 首次结合单细胞RNA测序技术系统阐明电针BL23穴通过抑制NLRP3炎症小体和IL-6/JAK/STAT3信号通路发挥肾脏保护作用的分子机制 | 研究仅使用小鼠模型,尚未在人体临床试验中验证 | 探究电针BL23穴对高尿酸血症及其诱导的肾脏炎症和功能障碍的治疗作用 | 高尿酸血症诱导的肾炎小鼠模型 | 单细胞测序 | 高尿酸血症肾病 | 单细胞RNA测序, Western blot | 动物模型 | 单细胞转录组数据, 蛋白质印迹数据 | 未明确样本数量的小鼠肾脏组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 670 | 2025-11-27 |
Microglial TREM2 and cognitive impairment: insights from Alzheimer's disease with implications for spinal cord injury and AI-assisted therapeutics
2025, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2025.1705069
PMID:41280332
|
综述 | 探讨小胶质细胞TREM2在阿尔茨海默病和脊髓损伤认知障碍中的作用及人工智能辅助治疗的潜力 | 首次系统提出TREM2可能连接脊髓损伤引起的神经炎症与认知缺陷,并引入人工智能方法加速相关研究 | TREM2在脊髓损伤中与高级认知功能的关系尚未经过系统实验验证 | 研究TREM2在神经退行性疾病和创伤性中枢神经系统疾病认知障碍中的作用机制 | 阿尔茨海默病和脊髓损伤患者的小胶质细胞及TREM2受体 | 自然语言处理 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组学、神经影像学、人工智能分析 | NA | 临床数据、转录组数据、影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 671 | 2025-11-27 |
Transcriptome analysis of classical blood cells reveals downregulation of pro-inflammatory genes in the classical monocytes of long COVID patients
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1710783
PMID:41280901
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析长新冠患者经典单核细胞的转录组特征 | 首次在长新冠患者经典单核细胞中发现促炎基因下调及单核细胞分化受损现象 | 样本量有限(88例),需更大规模研究验证 | 探索长新冠的免疫学发病机制 | 长新冠患者和康复对照者的外周血单个核细胞 | 单细胞转录组学 | 长新冠 | 单细胞RNA测序,Luminex细胞因子检测 | NA | 单细胞转录组数据,细胞因子数据 | 88例(44例长新冠患者,44例匹配康复者) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 672 | 2025-11-27 |
Neutrophil gene expression in COVID-19 patients with acute respiratory distress syndrome
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1620745
PMID:41280914
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研究论文 | 本研究通过RNA测序分析探讨了COVID-19相关ARDS患者中性粒细胞基因表达与临床病程的关系 | 首次结合bulk RNA测序和单细胞RNA测序分析COVID-19相关ARDS患者的中性粒细胞转录组特征 | 样本量较小(28例患者和16例对照),单细胞测序仅包含5例患者 | 探索COVID-19相关ARDS患者中性粒细胞基因表达与临床病程的关联 | COVID-19相关ARDS患者和健康对照者的外周血样本 | 生物信息学 | COVID-19 | RNA测序,单细胞RNA测序,聚类分析 | 聚类分析 | 基因表达数据 | 28例COVID-19相关ARDS患者,16例健康对照,5例患者进行单细胞测序 | NA | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 673 | 2025-11-27 |
Integrated Analysis of Single-Cell RNA Sequencing and Machine Learning Reveals a T Cell-Specific PANoptosis Signature Predicting Prognosis and Immunotherapy in Prostate Cancer
2025, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/8889021
PMID:41281377
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和机器学习方法,建立了一个T细胞特异性PAN凋亡特征来预测前列腺癌的预后和免疫治疗效果 | 首次结合单细胞RNA测序和10种机器学习算法构建T细胞特异性PAN凋亡特征,用于前列腺癌预后预测和免疫治疗反应评估 | 研究基于公开数据集GSE185344,需要进一步实验验证和更大样本量的临床验证 | 建立前列腺癌预后预测模型并评估免疫治疗反应 | 前列腺癌患者和癌细胞系 | 机器学习 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序,机器学习算法 | 集成学习模型(10种算法) | 基因表达数据 | GSE185344数据集,4个独立免疫治疗队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 674 | 2025-11-27 |
Prognostic value and immune infiltration of anoikis-related genes in osteosarcoma
2025, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2025.1669470
PMID:41282023
|
研究论文 | 基于单细胞RNA测序和失巢凋亡相关基因构建骨肉瘤预后预测模型并分析免疫浸润特征 | 首次结合单细胞RNA测序和失巢凋亡相关基因构建骨肉瘤预后模型,并验证模型在免疫治疗预测中的价值 | NA | 开发骨肉瘤预后预测模型并探索其与免疫治疗的关系 | 骨肉瘤患者和骨肉瘤细胞 | 生物信息学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 免疫组化 | LASSO回归模型 | 基因表达数据 | TARGET数据库数据集和两个验证集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 675 | 2025-11-27 |
KSRV: a Kernel PCA-Based framework for inferring spatial RNA velocity at single-cell resolution
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1695803
PMID:41282470
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研究论文 | 提出了一种基于核主成分分析的空间RNA速度推断计算框架KSRV | 首次将核主成分分析用于整合单细胞RNA测序和空间转录组数据,实现单细胞分辨率的空间RNA速度推断 | 未提及方法在更复杂组织或疾病模型中的验证 | 开发计算框架以推断空间分辨组织中的RNA速度 | 小鼠大脑和小鼠器官发生过程 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 核主成分分析(Kernel PCA) | 基因表达数据,空间位置数据 | 未明确说明具体样本数量 | 10x Genomics,Vizgen | 空间转录组学,单分子荧光原位杂交 | 10x Visium,MERFISH | 10x Visium空间转录组平台,MERFISH单分子成像技术 |
| 676 | 2025-11-27 |
Deciphering the role of Hat1 in spermatogenesis: Chromatin organization and beyond
2025, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.20240
PMID:41282984
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研究论文 | 本研究通过多学科方法揭示了组蛋白乙酰转移酶Hat1在小鼠精子发生过程中的动态表达模式及其在染色质组织中的阶段特异性功能 | 首次系统阐明了Hat1在精子发生不同阶段的特异性表达定位及其在染色质组织中的动态功能转换 | 需要进一步的功能验证实验来确认Hat1的具体作用机制 | 探究Hat1在小鼠睾丸中的时空表达模式及其在精子发生过程中染色质组织的具体作用 | 小鼠睾丸组织及雄性生殖细胞 | 表观遗传学 | 男性不育 | RT-qPCR, Western blot, 免疫荧光定位, 生物信息学分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 3周龄和8周龄小鼠睾丸组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基于单细胞测序数据集GSE214315 |
| 677 | 2025-11-26 |
Correction: Unveiling the NEFH+ malignant cell subtype: insights from single-cell RNA sequencing in prostate cancer progression and tumor microenvironment interactions
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1718125
PMID:41280907
|
correction | 对前列腺癌研究中关于NEFH+恶性细胞亚型的文章进行更正 | NA | NA | NA | NA | NA | prostate cancer | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 678 | 2025-11-25 |
Single-cell RNA sequencing reveals the role of immunoinflammatory cells in the progression of renal tubulointerstitial fibrosis
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0337092
PMID:41269996
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了免疫炎症细胞在肾小管间质纤维化进展中的作用机制 | 首次利用单细胞RNA测序技术系统描绘了UUO模型中免疫炎症细胞的动态变化及其与成纤维细胞的相互作用网络 | 研究仅基于小鼠模型,需要进一步在人类样本中验证 | 阐明免疫炎症细胞在肾小管间质纤维化进展中的具体作用机制 | 单侧输尿管梗阻模型小鼠的肾脏组织 | 单细胞测序分析 | 慢性肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 不同时间点(3天、7天、14天)的UUO模型小鼠和假手术组小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 679 | 2025-11-25 |
Multi-omics analysis indicates an association between TAPBP and prostate cancer
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0336438
PMID:41270069
|
研究论文 | 通过多组学分析鉴定与前列腺癌相关的关键基因TAPBP | 首次整合蛋白质组、转录组、单细胞测序和多种统计方法系统筛选前列腺癌相关基因 | 研究结果需要进一步实验验证,样本来源和数量未明确说明 | 识别导致前列腺癌发生的关键基因并寻找潜在药物靶点 | 前列腺癌相关基因和蛋白质 | 生物信息学 | 前列腺癌 | PWAS, TWAS, 单细胞测序, 孟德尔随机化, 贝叶斯共定位分析 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 680 | 2025-11-24 |
Mitophagy-associated biomarkers and macrophage involvement in pulmonary arterial hypertension: identification and functional implications
2025, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2025.1673181
PMID:41267791
|
研究论文 | 本研究通过整合转录组分析、单细胞RNA测序和机器学习方法,识别了与肺动脉高压中线粒体自噬相关的生物标志物及其在巨噬细胞中的功能意义 | 首次系统性地识别了五个与肺动脉高压中线粒体自噬相关的巨噬细胞生物标志物,并通过多组学方法验证了其在巨噬细胞分化过程中的表达轨迹 | 研究主要基于动物模型和公共数据库,需要在人类患者中进行进一步验证 | 探索肺动脉高压中线粒体自噬的分子机制并识别相关生物标志物 | 肺动脉高压患者数据、单细胞RNA测序数据、单核rotaline诱导的肺动脉高压大鼠模型 | 生物信息学 | 肺动脉高压 | 微阵列分析、单细胞RNA测序、机器学习、定量PCR、Western blotting、免疫荧光 | 机器学习模型(五种不同算法) | 转录组数据、单细胞RNA测序数据、实验验证数据 | 训练队列和验证队列的人类数据集,以及大鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序, 微阵列分析 | NA | NA |