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当前共找到 2176 篇文献，本页显示第 661 - 680 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 661 | 2025-11-14 |
Different metabolic paradigms and distribution of regulatory T cells between primary and lymph node metastasis prostate cancer
2025, CytoJournal
IF:2.5Q2
DOI:10.25259/Cytojournal_44_2025
PMID:41216232
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析比较了原发性前列腺癌和淋巴结转移中调节性T细胞的代谢特征和分布差异 | 首次在单细胞水平揭示了前列腺癌原发灶与转移灶中Treg细胞亚群的代谢重编程差异及其与淋巴转移的关系 | 样本量有限，需要更大规模的研究验证结果 | 探究前列腺癌原发灶与淋巴结转移中调节性T细胞的代谢特征和分布差异 | 原发性前列腺癌和淋巴结转移组织样本 | 单细胞测序分析 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学 | NA | 单细胞RNA测序数据，免疫组织化学图像 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 662 | 2025-11-14 |
Development of a novel prognostic prediction model using mitochondrial-related genes and single-cell sequencing data for colorectal carcinoma
2025, Translational gastroenterology and hepatology
IF:3.8Q2
DOI:10.21037/tgh-25-89
PMID:41216283
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于线粒体相关基因和单细胞测序数据的结直肠癌预后预测模型 | 首次结合单细胞RNA测序数据和线粒体基因集构建结直肠癌预后预测模型，识别出5个关键线粒体基因并建立风险评分系统 | 需要在更广泛的患者队列中验证研究结果，样本来源相对有限 | 系统研究线粒体基因在结直肠癌中的预后潜力，开发可靠的风险评分模型 | 结直肠癌患者组织样本 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序，差异基因表达分析，基因集富集分析，通路分析，Cox比例风险回归分析 | Cox回归模型，风险评分模型 | 单细胞RNA测序数据，基因表达数据 | TCGA数据库结直肠癌组织样本，外部验证集GSE17536队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 663 | 2025-11-14 |
Decoding the Prognosis-Related S100A9high Monocyte in Glioblastoma Using Single-Cell and Spatial Transcriptome Sequencing
2025, OncoTargets and therapy
IF:2.7Q3
DOI:10.2147/OTT.S553018
PMID:41216330
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组测序技术揭示了胶质母细胞瘤中S100A9高表达单核细胞的异质性及其与不良预后的关联 | 首次从配体-受体网络角度识别胶质母细胞瘤亚型，并发现S100A9高表达单核细胞这一新型预后不良相关细胞亚群 | 研究样本量有限，需要更大规模验证；机制研究主要基于体外实验 | 解析胶质母细胞瘤中单核细胞的异质性及其在肿瘤微环境中的功能 | 胶质母细胞瘤患者样本中的单核细胞和巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序, 免疫荧光, T细胞共培养实验 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序 | NA | NA |
| 664 | 2025-11-13 |
Single-cell analysis of lung epithelial cells reveals age and cell population-specific responses to SARS-CoV-2 infection in ciliated cells
2025-Jan-21, Clinical and experimental immunology
IF:3.4Q3
DOI:10.1093/cei/uxae118
PMID:39780400
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研究论文 | 通过单细胞分析揭示肺上皮细胞对SARS-CoV-2感染的年龄和细胞群体特异性反应 | 发现两种纤毛细胞亚群(FOXJ1高/低)具有不同感染率和免疫应答特征，并首次揭示儿童与成人肺细胞对病毒感染的差异基因表达 | 研究基于体外气液界面培养模型，可能与体内真实情况存在差异 | 研究先天免疫信号在肺发育和年龄中对SARS-CoV-2感染应答的作用 | 儿童和成人肺组织来源的气道上皮细胞 | 单细胞生物学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | Seurat, scType, Monocle | 单细胞转录组数据 | 儿童和成人肺组织样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 665 | 2025-11-11 |
Correction: Exposing the cellular situation: findings from single-cell RNA sequencing in breast cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1709624
PMID:41208986
|
correction | 对乳腺癌单细胞RNA测序研究文章的更正 | NA | NA | NA | NA | NA | breast cancer | single-cell RNA sequencing | NA | NA | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 666 | 2025-11-10 |
Single-cell sequencing reveals the response mechanisms of vascular endothelial cells to glucocorticoids in diabetic retinopathy
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0334230
PMID:41196918
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研究论文 | 通过单细胞测序技术揭示糖皮质激素在糖尿病视网膜病变中对血管内皮细胞的响应机制 | 首次在单细胞水平系统分析糖皮质激素活性在糖尿病视网膜病变血管内皮细胞中的变化特征 | 基于公共数据库的回顾性分析，需要实验验证 | 探究糖皮质激素在糖尿病视网膜病变发病机制中的作用 | 糖尿病视网膜病变组织中的血管内皮细胞 | 生物信息学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序 | 伪时间分析、转录因子分析、细胞通讯分析 | 单细胞RNA测序数据 | GEO数据库数据集GSE178121 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 667 | 2025-11-10 |
Single-cell transcriptomics in metastatic breast cancer: mapping tumor evolution and therapeutic resistance
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1669741
PMID:41199747
|
综述 | 本文综述单细胞转录组学在转移性乳腺癌研究中的应用，重点阐述其在描绘肿瘤进化、揭示治疗抵抗机制方面的作用 | 采用单细胞转录组学技术高分辨率解析转移性乳腺癌的肿瘤异质性、细胞进化轨迹和治疗抵抗机制，整合空间转录组学和多组学平台提供肿瘤生态系统全景视图 | 存在技术挑战，临床应用的标准化和推广仍需进一步研究 | 探讨单细胞转录组学如何重塑对转移性乳腺癌生物学特性的理解并指导精准治疗 | 转移性乳腺癌肿瘤细胞、肿瘤微环境中的免疫细胞、基质细胞和内皮细胞 | 单细胞组学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 多组学 | NA | NA |
| 668 | 2025-11-10 |
Integrative multi-omics identifies MEIS3 as a diagnostic biomarker and immune modulator in hypertrophic cardiomyopathy
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1675467
PMID:41200169
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学分析鉴定MEIS3作为肥厚型心肌病的诊断生物标志物和免疫调节因子 | 首次发现MEIS3在HCM中作为基质中心免疫调节因子的关键作用，并构建了lncRNA-miRNA-MEIS3调控网络 | 样本量较小（HCM患者n=4，健康对照n=3），需要更大规模研究验证 | 表征转录因子MEIS3在肥厚型心肌病中的临床和免疫学作用 | 肥厚型心肌病患者和健康对照的外周血样本及心肌组织 | 生物信息学 | 心血管疾病 | RNA测序,单细胞RNA测序,机器学习算法 | LASSO,随机森林 | 基因表达数据,单细胞数据 | 7个样本（4例HCM患者，3例健康对照） | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 669 | 2025-11-10 |
Identification and validation of plasma protein biomarkers as therapeutic targets in acute myeloid leukemia: an integrative multi-omics study
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1659811
PMID:41200167
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学方法识别并验证了急性髓系白血病中具有因果作用的新型循环蛋白生物标志物 | 首次提供TNFAIP8、TCL1A、WFDC1和TNFSF8在AML中因果作用的遗传证据，并发现13种靶向这些蛋白的候选药物 | 研究主要基于欧洲人群数据（deCODE、UK Biobank、FinnGen），可能限制结果在其他人群的普适性 | 识别和验证AML中具有因果作用的循环蛋白生物标志物，为靶向治疗开发和疾病监测提供新见解 | 急性髓系白血病患者和健康对照 | 多组学整合分析 | 急性髓系白血病 | 蛋白质组范围孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序、ELISA、药物重定位分析、全表型关联研究 | 孟德尔随机化模型 | 蛋白质定量性状位点数据、全基因组关联研究数据、单细胞RNA测序数据、血浆蛋白水平数据 | 来自deCODE、UK Biobank Pharma Proteomics Project、FinnGen和UK Biobank四个大型队列的数据，包含AML患者和健康对照 | NA | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 基因组关联分析 | NA | NA |
| 670 | 2025-11-10 |
Differential gene expression profiling and machine learning-based discovery of key genetic markers in VTE and CKD
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1654673
PMID:41200172
|
研究论文 | 通过转录组学和机器学习分析识别静脉血栓栓塞和慢性肾脏病共享的关键基因标记 | 首次结合三种机器学习算法(LASSO、SVM-RFE、随机森林)识别VTE和CKD共享的关键基因，并构建诊断列线图 | 研究依赖公共数据集，需要进一步实验验证基因功能机制 | 揭示静脉血栓栓塞和慢性肾脏病之间的遗传特征和分子通路联系 | VTE和CKD患者的基因表达谱数据 | 机器学习 | 静脉血栓栓塞,慢性肾脏病 | 转录组分析,单细胞RNA测序 | LASSO,SVM-RFE,随机森林 | 基因表达数据 | 使用多个数据集(GSE37171和GSE48000)的患者样本 | NA | 单细胞RNA测序,转录组分析 | NA | NA |
| 671 | 2025-11-10 |
Identification of immunogenic cell death signature genes in hepatocellular carcinoma: from single-cell transcriptomics to in vitro mechanistic validation and comprehensive prognostic modeling with hundreds of machine learning algorithms
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1649618
PMID:41200185
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学和多组学数据，识别肝细胞癌中的免疫原性细胞死亡特征基因，并构建预后模型 | 首次在肝细胞癌中系统表征免疫原性细胞死亡特征，整合单细胞和批量转录组数据，并通过数百种机器学习算法优化预后模型 | 研究样本量相对有限，需要前瞻性临床验证 | 开发肝细胞癌免疫治疗的可靠预后生物标志物和精准分层模型 | 肝细胞癌患者样本和HepG2细胞系 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 批量转录组学, 机器学习, 功能验证实验 | 多种机器学习算法, ssGSEA, WGCNA | 单细胞转录组数据, 批量转录组数据 | 7个HCC样本(44,461个细胞), 三个独立队列(TCGA-HCC 371例, GSE14520 242例, ICGC 445例) | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 672 | 2025-11-10 |
CD44 and CLDN3 as immune-metabolic regulators in acute pancreatitis: a multi-modal transcriptomics study and experimental validation
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1665200
PMID:41200201
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研究论文 | 本研究通过多模态转录组学分析和实验验证，揭示了CD44和CLDN3作为急性胰腺炎中免疫代谢调控关键生物标志物的作用 | 首次发现CD44和CLDN3是胰腺腺泡细胞与免疫细胞间免疫代谢失调的关键生物标志物，并揭示了CLDN3在mRNA和蛋白水平表达不一致的现象 | 研究样本量有限，主要基于公共数据集和动物模型验证，需要进一步临床研究确认 | 探索急性胰腺炎中免疫代谢调控的关键分子机制 | 急性胰腺炎小鼠模型和公共转录组数据集 | 生物信息学 | 急性胰腺炎 | 转录组测序，单细胞RNA测序，机器学习算法，免疫组织化学 | 三种机器学习算法，单样本基因集富集分析 | 基因表达数据，单细胞转录组数据 | 多个公共数据集（GSE65146，GSE109227，GSE279876）和动物模型 | NA | 转录组测序，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 673 | 2025-11-10 |
DOCK3 orchestrates metastasis and immune microenvironment in prostate cancer
2025, Frontiers in urology
DOI:10.3389/fruro.2025.1662692
PMID:41200217
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了DOCK3在前列腺癌转移和肿瘤免疫微环境重塑中的关键作用 | 首次系统阐明DOCK3在前列腺癌中协调转移和免疫微环境的双重功能，发现其与肿瘤突变负荷和细胞毒性免疫细胞浸润的显著关联 | 研究主要基于计算分析和现有数据库，缺乏实验验证DOCK3功能机制 | 探究DOCK3在前列腺癌转移和肿瘤免疫微环境中的作用 | 前列腺癌患者样本和细胞 | 生物信息学 | 前列腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 基因组分析 | DESeq2, CIBERSORT, ssGSEA, xCell, WGCNA, Harmony, UMAP | 基因表达数据, 单细胞数据, 基因组数据 | TCGA-PRAD: 499个肿瘤/52个正常样本; GEO单细胞数据: 45,325个细胞 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 674 | 2025-11-09 |
Role of Monocyte/Macrophage-Associated Gene Ccl9 in Acute Myocardial Infarction Analysis: Based on Bulk and Single Cell RNA Sequencing Data
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S516092
PMID:41195292
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据，识别了急性心肌梗死中单核/巨噬细胞相关基因，并重点探讨了Ccl9在调控M2巨噬细胞极化和减轻心肌细胞损伤中的作用 | 首次结合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据系统分析急性心肌梗死中的单核/巨噬细胞相关基因，并通过实验验证Ccl9在M2巨噬细胞极化和心肌保护中的新功能 | 研究主要基于公共数据库数据，动物和细胞实验样本量有限，需要进一步临床验证 | 探索急性心肌梗死中单核/巨噬细胞相关基因的表达特征及其在疾病进展中的作用机制 | 急性心肌梗死患者基因表达数据、AMI小鼠模型、原代小鼠心肌细胞和RAW264.7巨噬细胞系 | 生物信息学 | 心血管疾病 | RNA测序, 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 细胞共培养 | t-SNE, 差异表达分析, 免疫浸润分析 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 三个GEO数据集(GSE163129, GSE158157, GSE23294)及动物实验样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 675 | 2025-11-09 |
Across the space: applications of spatial transcriptomic technology in healthy and diseased muscle
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1656918
PMID:41195339
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综述 | 探讨空间转录组技术在健康和病变肌肉组织中的应用及其对细胞相互作用研究的推动作用 | 系统梳理空间转录组技术在肌肉研究中的创新应用，突破单细胞技术无法保留空间信息的局限 | 作为综述文章，未涉及原始实验数据收集与分析 | 总结空间转录组技术在肌肉组织研究中的应用进展 | 骨骼肌组织中的细胞群体及其空间相互作用 | 空间转录组学 | 肌肉疾病 | 空间转录组技术 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 676 | 2025-11-08 |
Unveiling and verification of mitochondria-related genes as potential diagnostic biomarkers in ulcerative colitis based on bioinformatics analysis and experimental validation
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0336224
PMID:41187148
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证，构建了基于线粒体相关基因的溃疡性结肠炎诊断模型 | 首次系统性地识别线粒体相关差异表达基因作为溃疡性结肠炎的潜在诊断标志物，并验证ACADM和ACADSB基因在疾病中的重要作用 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，需要更多前瞻性研究验证诊断模型的临床适用性 | 构建溃疡性结肠炎的诊断模型，阐明线粒体相关基因在疾病发病机制中的作用 | 溃疡性结肠炎患者和健康对照者 | 生物信息学 | 溃疡性结肠炎 | RNA测序，单细胞RNA测序，生物信息学分析 | 诊断模型 | 基因表达数据 | 465名溃疡性结肠炎患者和154名健康对照 | NA | RNA-seq，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 677 | 2025-11-08 |
Finding differentially expressed genes between cell fates predicted by image-based deep learning
2025, Biophysics and physicobiology
IF:1.6Q4
DOI:10.2142/biophysico.bppb-v22.0022
PMID:41189733
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研究论文 | 开发了一种整合基于图像的深度学习细胞命运预测与单细胞转录组分析的方法，用于发现不同预测命运间的差异表达基因 | 首次将图像基深度学习细胞命运预测与单细胞全转录组分析相结合，在转录组谱未显示明显聚类时仍能检测差异表达基因 | 仅作为原理验证应用于热应激诱导的细胞死亡模型，尚未在其他细胞命运决定过程中验证 | 发现细胞命运决定过程中的早期触发基因 | 哺乳动物细胞系（经历热应激后命运不同的细胞） | 计算机视觉, 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序, 延时成像, 深度学习 | 深度学习模型 | 图像, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 678 | 2025-11-07 |
Identification of Seven in absentia homolog 2 as a potential efferocytosis-related biomarker in diabetic foot ulcers
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0334163
PMID:41183121
|
研究论文 | 本研究鉴定SIAH2作为糖尿病足溃疡中胞葬作用相关的潜在生物标志物，并探讨其在伤口愈合中的作用机制 | 首次发现SIAH2在糖尿病足溃疡中与胞葬作用相关，并揭示其通过调控角质形成细胞迁移、血管生成和细胞间通讯参与伤口愈合过程 | 样本量较小（仅20例患者），缺乏更大规模的验证研究 | 探究糖尿病足溃疡伤口愈合机制，寻找与胞葬作用相关的生物标志物 | II型糖尿病患者的血液和皮肤样本 | 生物医学研究 | 糖尿病足溃疡 | RNA-seq, 单细胞测序, 生物信息学分析, 体外实验 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据, 临床数据 | 20例II型糖尿病患者 | NA | RNA-seq, 单细胞测序 | NA | NA |
| 679 | 2025-11-06 |
Deconvolution and phylogeny inference of diverse variant types integrating bulk DNA-seq with single-cell RNA-seq
2025, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbaf234
PMID:41169710
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研究论文 | 提出TUSV-int框架，整合bulk DNA-seq和单细胞RNA-seq数据进行去卷积和系统发育推断 | 首次整合bulk DNA-seq和scRNA-seq数据，同时处理SNV、CNA和SV多种变异类型 | scDNA-seq数据成本高且技术挑战大，限制了在大规模队列中的常规应用 | 重建克隆谱系树以研究癌症进化 | 癌症基因组数据 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 整数线性规划(ILP) | 系统发育推断模型 | DNA测序数据,RNA测序数据 | NA | NA | bulk DNA-seq,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 680 | 2025-11-06 |
Integrating single-cell transcriptomics and whole-genome CRISPR CAS9 screen identifies a cell cluster associated with tumor dependency in triple-negative breast cancer
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1705923
PMID:41179682
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研究论文 | 本研究整合单细胞转录组学和全基因组CRISPR筛选，识别出三阴性乳腺癌中与肿瘤依赖性相关的细胞亚群 | 首次结合单细胞转录组学与全基因组CRISPR筛选技术，系统识别三阴性乳腺癌肿瘤依赖性相关细胞亚群及其临床意义 | 研究主要基于公共数据库分析，实验验证仅限于体外细胞功能验证 | 识别三阴性乳腺癌的肿瘤依赖性基因和细胞亚群，探索新的治疗靶点 | 三阴性乳腺癌患者样本和细胞系 | 单细胞组学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA-seq, 全基因组CRISPR CAS9筛选, 基因组测序 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 基因组数据 | 多个公共数据库(TCGA-BRCA, METABRIC, DEPMAP)的样本数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 基因组测序 | NA | NA |