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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 661 | 2025-10-05 |
A machine learning-derived immune-related prognostic model identifies PLXNA3 as a functional risk gene in colorectal cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1653794
PMID:40963600
|
研究论文 | 本研究通过机器学习构建了结直肠癌免疫相关预后模型,并鉴定PLXNA3为关键风险基因 | 整合100多种机器学习算法构建预后模型,首次系统揭示PLXNA3在结直肠癌中的免疫相关功能 | NA | 开发结直肠癌预后生物标志物并探索其生物学功能 | 结直肠癌患者转录组和临床数据 | 机器学习 | 结直肠癌 | 转录组测序, 空间转录组学, 单细胞转录组学, 免疫组化 | LASSO, CoxBoost, StepCox | 转录组数据, 临床数据 | TCGA和GEO队列数据 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 662 | 2025-10-05 |
Decoding paraneoplastic neuromyelitis optica: a multi-omics investigation of tumor-driven T and B cell dynamics
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1665688
PMID:40963604
|
综述 | 本文探讨多组学技术如何革新肿瘤相关性视神经脊髓炎谱系疾病中T细胞和B细胞功能动态的研究 | 首次系统整合多组学技术(基因组学、表观基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学)解析肿瘤驱动自身免疫反应的分子机制 | 将研究发现转化为临床应用仍面临重大挑战,需要开发可靠的分子特征来区分肿瘤性和特发性NMOSD | 阐明肿瘤如何通过分子模拟机制触发针对中枢神经系统的自身免疫反应 | 肿瘤相关性视神经脊髓炎谱系疾病患者的T细胞和B细胞 | 生物医学 | 视神经脊髓炎谱系疾病 | 单细胞RNA测序, TCR/BCR测序, 多组学分析 | AI, 机器学习 | 基因组, 表观基因组, 转录组, 蛋白质组, 代谢组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 663 | 2025-10-05 |
Topological data analysis in single cell biology
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1615278
PMID:40963635
|
综述 | 探讨拓扑数据分析在单细胞生物学中的应用及其数学框架 | 将拓扑数据分析这一数学框架引入单细胞生物学,能够捕捉传统方法难以发现的多尺度模式和复杂数据结构 | NA | 探索拓扑数据分析在单细胞生物学中的理论基础和应用前景 | 单细胞转录组学、蛋白质组学和空间生物学数据 | 生物信息学 | NA | 拓扑数据分析 | 持久同调、Mapper算法 | 单细胞多组学数据、空间生物学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞蛋白质组学 | NA | NA |
| 664 | 2025-10-05 |
The prognostic model based on tumor-associated neutrophils contributes to the stromal landscape and influences metabolic reprogramming in colorectal cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1587947
PMID:40963631
|
研究论文 | 基于肿瘤相关中性粒细胞构建结直肠癌预后模型,并分析其对基质景观和代谢重编程的影响 | 首次基于单细胞RNA测序数据识别18个TAN相关基因构建结直肠癌预后模型,并系统分析其与基质浸润、代谢特征和治疗反应的关系 | 研究依赖于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 开发结直肠癌预后分层标志物并探索肿瘤微环境特征 | 结直肠癌患者 | 数字病理 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,RNA测序,LASSO回归 | 预后风险评分模型,列线图 | 基因表达数据 | TCGA和GEO数据库中的结直肠癌样本 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 665 | 2025-10-05 |
Integrating scRNA-seq and GWAS data reveals potentially critical endothelial cells in large artery atherosclerotic stroke
2025, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2025.1646993
PMID:40963808
|
研究论文 | 整合单细胞RNA测序和全基因组关联研究数据,揭示大动脉粥样硬化性卒中中潜在的关键内皮细胞亚型 | 首次整合脑血管分区结构的单细胞RNA测序数据与多种卒中类型的GWAS数据,通过遗传力分区分析卒中风险SNP位点在各类细胞中的富集情况 | 研究中使用的细胞类型和GWAS数据集有限,需要进一步验证关键内皮细胞亚型的功能作用 | 探索卒中的分子机制并确定主要的致病细胞类型 | 脑血管细胞(包括内皮细胞、平滑肌细胞、周细胞和胶质细胞) | 生物信息学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序, 全基因组关联研究, 基因集富集分析, 伪时间轨迹建模, 转录调控网络分析 | CELLEX, Monocle2, SCENIC | 基因表达数据, 基因型数据 | 14个血管细胞簇,三个GWAS数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 666 | 2025-10-05 |
Integrated single-cell and bulk RNA-seq analysis reveals prognostic stemness genes in leiomyosarcoma
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1604413
PMID:40963856
|
研究论文 | 通过整合单细胞和批量RNA-seq数据,识别子宫肉瘤中的预后干性基因 | 首次结合单细胞和批量RNA-seq数据系统分析子宫肉瘤干性特征与预后的关系 | 基于公共数据库的回顾性分析,需要实验验证 | 识别子宫肉瘤的可靠预后标志物和治疗靶点 | 子宫肉瘤患者样本 | 生物信息学 | 子宫肉瘤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 机器学习, Cox回归, Lasso回归 | 基因表达数据, 临床数据 | 来自GEO和TCGA数据库的子宫肉瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 667 | 2025-10-05 |
Case Report: A large granular cell tumor of the cervical esophagus with single cell RNA sequencing analysis
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1580121
PMID:40963874
|
病例报告 | 本研究报道一例大型宫颈食管颗粒细胞瘤病例,通过肌皮游离瓣修复术后缺损,并首次采用单细胞RNA测序分析肿瘤组织 | 首次对食管颗粒细胞瘤进行单细胞RNA测序分析,发现肿瘤中神经样细胞亚群富集及X染色体区域显著拷贝数变异增加 | 单一样本病例报告,结果需要更大样本量验证 | 研究食管颗粒细胞瘤的恶性潜能标志物以指导临床治疗选择 | 宫颈食管颗粒细胞瘤患者及其肿瘤组织 | 数字病理 | 食管肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1例患者(肿瘤及癌旁组织) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 668 | 2025-10-05 |
Integrated Single-Cell and Spatial Transcriptomic Analysis Reveals a Pathological Niche Formed by FAP+ Fibroblasts, Immune, and Endothelial Cells in Psoriatic Lesions
2025, Clinical, cosmetic and investigational dermatology
DOI:10.2147/CCID.S541106
PMID:40963886
|
研究论文 | 通过整合单细胞和空间转录组分析揭示银屑病病变中由FAP+成纤维细胞、免疫细胞和内皮细胞形成的病理生态位 | 发现银屑病病变皮肤特有的CD4+组织驻留记忆T细胞亚群和新型静脉内皮细胞亚群Venous endo2,并首次揭示这些细胞与FAP+成纤维细胞、T细胞和抗原呈递细胞在空间上的共定位形成病理生态位 | NA | 阐明银屑病病变中免疫微环境的细胞和分子相互作用机制 | 银屑病患者的病变皮肤组织 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序 | NA | 基因表达数据,空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序 | NA | NA |
| 669 | 2025-10-05 |
Nociceptive Neurons Promote Myeloid-Derived Suppressor Cell Mobilization to Alleviate Post-Stroke Neuroinflammation
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.119474
PMID:40963921
|
研究论文 | 本研究揭示了伤害性神经元通过释放CGRP调控骨髓免疫反应缓解脑卒中后神经炎症的机制 | 首次发现伤害性神经元在脑梗死后通过CGRP信号促进髓系偏向造血和MDSC动员的神经免疫调控机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限;靶向递送系统的长期安全性需进一步评估 | 探究伤害性神经元在脑卒中后免疫调控中的作用及治疗策略 | MCAO小鼠模型和卒中患者颅骨骨髓样本 | 神经免疫学 | 脑卒中 | 流式细胞术、免疫荧光、单细胞RNA测序、受体敲除、纳米颗粒递送 | NA | 单细胞RNA测序数据、流式细胞数据、免疫荧光图像 | 小鼠模型和人类卒中患者骨髓样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 670 | 2025-10-05 |
Dimeric CCK2R radiotheranostic tracers synergize with mTOR inhibition for enhanced tumor therapy
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.117021
PMID:40963930
|
研究论文 | 本研究开发了一种新型二聚体CCK2R靶向放射性示踪剂,并探索其与mTOR抑制剂联合使用的放射增敏治疗效果 | 首次开发二聚体CCK2R靶向放射性示踪剂,并发现其与mTOR抑制剂联合使用可通过抑制谷胱甘肽介导的解毒作用和增加氧化应激来增强治疗效果 | NA | 开发新型放射性诊疗剂并探索其与mTOR抑制剂联合治疗CCK2R阳性肿瘤的协同效应 | 神经内分泌肿瘤,特别是甲状腺髓样癌和小细胞肺癌 | 放射性诊疗 | 甲状腺髓样癌,小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 分子影像数据,基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 671 | 2025-10-05 |
Bioinformatics Analysis and Experimental Validation of Lactylation Related Genes in Lung Adenocarcinoma
2025, Cancer management and research
IF:2.5Q3
DOI:10.2147/CMAR.S533289
PMID:40964497
|
研究论文 | 通过生物信息学分析和实验验证研究乳酸化修饰在肺腺癌中的作用 | 首次系统研究乳酸化修饰在肺腺癌中的表达水平及其预后价值,鉴定出5个乳酸化相关风险基因 | 样本量有限,需要更多临床样本验证,机制研究不够深入 | 探讨乳酸化修饰在肺腺癌中的表达特征及其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 | 肺腺癌组织和细胞系 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 免疫组织化学,免疫荧光,Western blot,单细胞RNA测序,多组学分析 | COX回归分析,差异表达分析 | 基因表达数据,蛋白质表达数据,单细胞测序数据 | TCGA数据库365例样本,组织芯片,H1299细胞系 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 672 | 2025-10-05 |
Research Progress of Natural Killer Cells in Hashimoto's Thyroiditis
2025, ImmunoTargets and therapy
IF:6.2Q1
DOI:10.2147/ITT.S545646
PMID:40964505
|
综述 | 本文综述了自然杀伤细胞在桥本甲状腺炎发病机制中的双重作用及最新研究进展 | 整合单细胞RNA测序技术揭示NK细胞功能异质性,阐明NK细胞通过不同机制在疾病不同阶段发挥促炎或调节作用 | NA | 探讨自然杀伤细胞在桥本甲状腺炎发病机制中的作用及潜在治疗靶点 | 桥本甲状腺炎患者及自然杀伤细胞 | 自然语言处理 | 桥本甲状腺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 673 | 2025-10-05 |
Characterisation of macrophages in healthy and diseased livers in mice: identification of necrotic lesion-associated macrophages
2025, eGastroenterology
DOI:10.1136/egastro-2025-100189
PMID:40212045
|
研究论文 | 本研究通过多重免疫荧光染色和单细胞RNA测序技术,系统表征了小鼠健康与疾病肝脏中巨噬细胞的异质性和空间分布 | 首次识别并表征了坏死病灶相关巨噬细胞亚群,发现其表达促进死亡细胞碎片清除的特定蛋白 | 研究仅限于小鼠模型,未在人类样本中验证 | 探究肝脏巨噬细胞在健康和疾病状态下的异质性、空间分布及功能 | 小鼠肝脏组织中的库普弗细胞和单核来源巨噬细胞 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | 顺序多重免疫荧光染色, 单细胞RNA测序, 图像分析 | NA | 图像, 基因表达数据 | 小鼠肝脏样本(健康和损伤模型) | NA | 单细胞RNA测序, 免疫荧光染色 | NA | NA |
| 674 | 2025-10-05 |
New insights into liver injury and regeneration from single-cell transcriptomics
2025, eGastroenterology
DOI:10.1136/egastro-2025-100202
PMID:40735115
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综述 | 本文总结了单细胞转录组学在急性肝损伤和再生研究中的最新进展与应用 | 整合单细胞RNA测序与空间转录组学技术,揭示肝损伤修复界面中的胎儿样和迁移性肝细胞、不同活化状态的肝星状细胞以及区域特异性内皮细胞反应 | NA | 探讨单细胞转录组学在急性肝损伤和再生研究中的应用与进展 | 肝细胞、肝星状细胞、内皮细胞、巨噬细胞等肝脏细胞 | 单细胞组学 | 急性肝损伤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 675 | 2025-10-05 |
Role of endothelial cell markers in prognosis of hepatocellular carcinoma: Integrating bioinformatics analysis and experimental validation
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0331580
PMID:40956822
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研究论文 | 本研究通过整合生物信息学分析和实验验证,识别了肝细胞癌中内皮细胞特异性标志物并构建了预后多基因特征 | 首次在单细胞水平系统研究肝细胞癌中内皮细胞的作用,并开发了基于内皮细胞标志物的预后预测模型 | 样本量相对有限,需要更多独立队列验证模型的普适性 | 识别肝细胞癌中内皮细胞特异性标志物并构建预后预测模型 | 肝细胞癌患者样本和内皮细胞 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,Lasso-Cox回归分析,免疫组织化学,Western blotting | Lasso-Cox回归模型 | 单细胞转录组数据,临床预后数据,蛋白质表达数据 | 12个肝细胞癌样本用于scRNA-seq分析,TCGA和ICGC队列用于验证 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 676 | 2025-10-05 |
Molecular mechanism of LncRNA MALAT1 in regulating hepatocellular carcinoma progression via the miR-383-5p/PRKAG1 axis and its role in the tumor immune microenvironment
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1613596
PMID:40958861
|
研究论文 | 本研究揭示lncRNA MALAT1通过miR-383-5p/PRKAG1轴调控肝细胞癌进展的分子机制及其在肿瘤免疫微环境中的作用 | 首次系统阐明MALAT1通过竞争性结合miR-383-5p上调PRKAG1表达的新机制,并发现PRKAG1通过调控免疫细胞浸润和细胞间通讯促进肝癌进展 | NA | 探究MALAT1-PRKAG1轴在肝细胞癌发病机制中的作用及临床意义 | 肝细胞癌组织和细胞系 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 多组学分析、生物信息学分析、单细胞RNA测序、CIBERSORT分析、GO/KEGG富集分析 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 677 | 2025-10-05 |
Personalised immunotherapy strategies informed by single cell profiling in thyroid cancer: a mini review
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1651088
PMID:40959084
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综述 | 本文综述了单细胞分析技术如何指导甲状腺癌个性化免疫治疗策略的发展 | 整合单细胞生物学、免疫学和内分泌肿瘤学,识别诊断盲点,发现药物再利用机会,为个性化免疫治疗绘制路线图 | NA | 通过单细胞分析技术改进甲状腺癌免疫治疗策略 | 甲状腺癌肿瘤微环境中的肿瘤细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,CITE-seq | NA | 转录组数据,蛋白质表达数据 | 超过150,000个肿瘤和免疫细胞 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,单细胞多组学 | NA | NA |
| 678 | 2025-10-05 |
A multi-omic analysis reveals a predictive value of tertiary lymphoid structures in improving the prognosis of colorectal cancer patients with BRAF mutation
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1662573
PMID:40959083
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析探讨三级淋巴结构对BRAF突变结直肠癌患者预后的预测价值 | 首次系统评估三级淋巴结构在抵消BRAF突变不良预后影响中的作用,并构建了10基因预后模型 | 样本量相对有限,需要更多前瞻性研究验证 | 研究三级淋巴结构能否改善BRAF突变结直肠癌患者的预后 | 结直肠癌患者,特别是BRAF突变患者 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, LASSO回归, Cox回归, 免疫浸润分析 | 预后特征模型 | 基因表达数据, 临床病理数据 | 200例结直肠癌患者组织样本,多个公共数据库数据 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 679 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA-seq reveals a repair pattern in cystic lesions in steroid induced osteonecrosis of the femoral head
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1626337
PMID:40959091
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了类固醇诱导的股骨头坏死中囊性病变的细胞异质性和修复机制 | 首次在SIONFH囊性病变中鉴定出8种细胞类型,并将软骨细胞分为5个亚群,发现CLIC3+表达的肥大软骨细胞群在骨矿化和成骨分化中的关键作用 | 样本量较小(仅3例患者),需要更大规模研究验证发现 | 探究类固醇诱导的股骨头坏死中囊性病变的转录组景观和修复机制 | 类固醇诱导的股骨头坏死患者的囊性病变组织 | 单细胞基因组学 | 股骨头坏死 | 单细胞RNA测序,组织学分析 | NA | 单细胞转录组数据,组织学图像 | 3例SIONFH患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 680 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA sequencing and proteomics uncover SIRPα-CD47 immune checkpoint and glycolysis-driven immune evasion in cardiac myxoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1652645
PMID:40959090
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和蛋白质组学揭示心脏粘液瘤中SIRPα-CD47免疫检查点和糖酵解驱动的免疫逃逸机制 | 首次在心脏粘液瘤中发现ap-CAF细胞通过趋化因子招募免疫细胞形成免疫微环境,证实肿瘤细胞来源于间充质干细胞,并揭示糖酵解通路激活和SIRPα-CD47免疫检查点在免疫逃逸中的关键作用 | 研究样本量有限,作为罕见疾病研究可能缺乏大规模验证 | 探究心脏粘液瘤的肿瘤微环境组成、细胞生长机制和免疫逃逸策略 | 心脏粘液瘤组织样本 | 单细胞组学 | 心脏肿瘤 | 单细胞RNA测序,蛋白质组学,Western blot,类器官模型 | 伪时间轨迹分析 | 单细胞转录组数据,蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |