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当前共找到 2164 篇文献，本页显示第 641 - 660 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 641 | 2025-10-05 |
Molecular signatures of alveolar type II cell differentiation in acute respiratory distress syndrome
2025, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2025.1649108
PMID:41041455
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示了急性呼吸窘迫综合征中肺泡II型细胞分化的分子特征 | 首次发现AT2细胞在ARDS中存在两种不同分化轨迹：纤维化程序和上皮修复程序 | 研究主要基于小鼠模型和有限的患者样本，需要更大规模临床验证 | 探究ARDS中AT2细胞分化轨迹及其对疾病进展的影响 | 小鼠ARDS模型和ARDS患者的支气管肺泡灌洗液样本 | 单细胞组学 | 急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞RNA测序, 微阵列, 通路富集分析 | 轨迹分析 | 转录组数据, 蛋白质数据 | 小鼠ARDS模型和患者BALF样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 微阵列 | NA | NA |
| 642 | 2025-10-05 |
Dissecting tumor transcriptional heterogeneity from single-cell RNA-seq data by generalized binary covariance decomposition
2025-Jan, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01997-z
PMID:39747597
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研究论文 | 提出一种名为广义二元协方差分解的统计方法，用于从单细胞RNA测序数据中解析肿瘤转录异质性 | 开发了能够将肿瘤转录异质性分解为患者特异性、数据集特异性和疾病亚型相关共享成分的新统计方法 | 方法在强肿瘤间异质性存在时的性能优势需进一步验证 | 解析肿瘤转录异质性并识别与癌症进展相关的共享表达模式 | 胰腺导管腺癌单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | 广义二元协方差分解 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 643 | 2025-10-05 |
Integrative Analysis of TLS-Associated Gene Signatures, Immune Infiltration and Drug Sensitivity in Pancreatic Cancer
2025 Jan-Dec, IET systems biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1049/syb2.70038
PMID:41016829
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研究论文 | 本研究通过整合分析胰腺癌中三级淋巴结构相关基因特征、免疫浸润和药物敏感性，开发个性化治疗策略 | 首次系统鉴定9个TLS相关基因并建立TLS评分系统，结合单细胞RNA-seq揭示基因在免疫细胞中的分布，证明TLS评分可预测化疗药物敏感性 | 研究样本量有限，需要在更大队列中验证；机制研究尚不深入 | 开发胰腺癌个性化化疗选择策略 | 胰腺腺癌患者和细胞系 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA-seq, RT-qPCR, 生物信息学分析 | NA | 基因表达数据, 临床数据, 单细胞测序数据 | 胰腺癌患者队列和Mia PaCa2、Jurkat细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 644 | 2025-10-05 |
The Single-Cell Triaptosis Regulatory Pattern in the Immune Microenvironment of Keloids
2025, Clinical, cosmetic and investigational dermatology
DOI:10.2147/CCID.S536776
PMID:41024856
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序数据研究瘢痕疙瘩免疫微环境中三凋亡调控模式的作用 | 首次揭示三凋亡调控模式在瘢痕疙瘩免疫微环境中的作用，并鉴定ELMO2为关键致病基因 | NA | 探究三凋亡在瘢痕疙瘩免疫微环境形成中的调控机制 | 瘢痕疙瘩组织中的成纤维细胞和免疫细胞亚群 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光染色 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 公共数据库样本+自有瘢痕疙瘩样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 645 | 2025-10-05 |
Practical approaches to advanced molecular biology techniques
2025, Methods in cell biology
DOI:10.1016/bs.mcb.2025.02.022
PMID:41033726
|
研究论文 | 本章详细介绍了多种先进分子生物学技术的实验方案和应用 | 系统整合了包括CRISPR-Cas9、单细胞RNA测序等前沿分子生物学技术的实用操作指南 | NA | 为分子生物学研究提供先进技术的实践指导 | 分子生物学技术及其在细胞过程研究中的应用 | 分子生物学 | NA | CRISPR-Cas9, Real-Time PCR, 流式细胞术, ChIP-Seq, scRNA-Seq, 质谱分析, FISH | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 染色质免疫沉淀测序, 质谱蛋白质组学 | NA | NA |
| 646 | 2025-10-05 |
Mechanism of enhancing chemotherapy efficacy in pancreatic ductal adenocarcinoma with paricalcitol and hydroxychloroquine
2025-Jan-21, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101881
PMID:39730001
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研究论文 | 本研究探讨帕立骨化醇和羟氯喹联合治疗增强胰腺导管腺癌化疗效果的分子机制 | 首次揭示帕立骨化醇和羟氯喹联合吉西他滨通过调节自噬和ER应激通路增强胰腺癌化疗敏感性的机制 | 研究样本量有限，需要更大规模的临床试验验证 | 阐明帕立骨化醇和羟氯喹联合治疗增强胰腺导管腺癌对吉西他滨化疗敏感性的分子机制 | 胰腺导管腺癌细胞、原位小鼠模型、患者来源异种移植模型和临床试验患者样本 | 肿瘤学研究 | 胰腺癌 | 蛋白质组学分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质组数据、细胞表型数据 | 体外细胞模型、动物模型和临床试验配对活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 647 | 2025-10-05 |
Function value of basement membrane-related genes in odontogenic keratocyst by bioinformatics analysis
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1658125
PMID:41018070
|
研究论文 | 通过生物信息学分析基底膜相关基因在牙源性角化囊肿中的功能价值 | 首次通过单细胞RNA测序定位SPARC基因在牙源性角化囊肿基质成纤维细胞中的特异性高表达，并揭示其与免疫微环境的相互作用 | 样本量较小（12例OKC和4例正常对照），需要更大规模研究验证 | 探讨基底膜相关基因在牙源性角化囊肿发病机制中的作用 | 牙源性角化囊肿组织和正常口腔黏膜组织 | 生物信息学 | 牙源性角化囊肿 | 转录组测序，单细胞RNA测序，免疫组织化学，免疫荧光 | 生物信息学分析 | 基因表达数据，单细胞测序数据 | 12例非综合征性牙源性角化囊肿和4例正常口腔黏膜样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 648 | 2025-10-05 |
GADD45G as a novel prognostic biomarker and therapeutic target in glioma: integrative analysis of bulk and single-cell RNA sequencing
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1608710
PMID:41018072
|
研究论文 | 本研究通过整合分析bulk和单细胞RNA测序数据，探讨GADD45G在胶质瘤中的预后价值及其作为治疗靶点的潜力 | 首次系统性地整合多组学数据揭示GADD45G在胶质瘤中的预后价值，并通过单细胞分辨率分析其在胶质母细胞瘤细胞亚群中的表达模式 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证GADD45G的具体作用机制 | 探索GADD45G在胶质瘤中的预后意义和治疗潜力 | 胶质瘤患者样本和胶质瘤细胞系 | 生物信息学 | 胶质瘤 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, Western blot | Cox回归模型, Kaplan-Meier生存分析, Spearman相关分析 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 来自TCGA、TARGET、GTEx、CGGA和GEO等多个数据库的胶质瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 649 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA profiling of colorectal granular-type laterally spreading tumor uncovers progression trajectory toward carcinoma and transcriptional signatures favoring lateral morphogenesis
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1552841
PMID:41018078
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究结直肠颗粒型侧向发育型肿瘤的转录特征及其向癌变的进展轨迹 | 首次在单细胞水平揭示LST-Gs的化生分化特征及其与肿瘤进展的关联，发现Arp2/3复合物在高度分化细胞中的显著上调 | 样本量有限，研究主要关注转录组层面，缺乏功能性验证实验 | 阐明结直肠颗粒型侧向发育型肿瘤的形态发生机制和向癌发展的进化轨迹 | 结直肠颗粒型侧向发育型肿瘤、突起型腺瘤和正常黏膜组织 | 单细胞测序 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确指定具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 650 | 2025-10-05 |
Predicting the prognosis of hepatocellular carcinoma based on genes related to polyamine metabolism
2025, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.19985
PMID:41018906
|
研究论文 | 基于多胺代谢相关基因构建肝细胞癌预后预测模型 | 首次基于多胺代谢相关基因对肝细胞癌进行分子分型并构建预后预测模型 | 研究主要基于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 开发肝细胞癌预后预测模型并探索潜在治疗靶点 | 肝细胞癌患者和HuH-7细胞系 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | RNA测序, 单细胞RNA测序, CCK8实验, 伤口愈合实验, Transwell实验 | Cox回归, Lasso回归, 列线图 | 基因表达数据, 临床数据 | 公共数据库中的肝细胞癌样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 651 | 2025-10-05 |
Characterization of cancer-related fibroblasts in bladder cancer and construction of CAFs-based bladder cancer classification: insights from single-cell and multi-omics analysis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1580986
PMID:41019085
|
研究论文 | 通过单细胞和多组学分析表征膀胱癌中癌症相关成纤维细胞并构建基于CAFs的膀胱癌分类 | 首次系统鉴定膀胱癌中10个不同的CAF亚群，并建立基于pCAFs的膀胱癌分子分型系统 | 样本量有限，需要进一步实验验证各亚型的临床适用性 | 探索膀胱癌中癌症相关成纤维细胞的异质性及其在肿瘤微环境中的作用 | 膀胱癌组织和其中的癌症相关成纤维细胞 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 机器学习算法 | 机器学习算法 | 单细胞RNA测序数据, 批量RNA测序数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 652 | 2025-10-05 |
PLK2 as a key regulator of glycolysis and immune dysregulation in polycystic ovary syndrome
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1610713
PMID:41019094
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序分析，发现PLK2是多囊卵巢综合征中糖酵解和免疫失调的关键调控因子 | 首次将PLK2确立为PCOS中内皮细胞糖酵解的核心调控基因，并揭示其通过NF-κB和IL-17信号通路促进慢性炎症和卵巢纤维化的机制 | 研究主要基于动物模型和生物信息学分析，需要进一步临床验证 | 阐明多囊卵巢综合征中卵巢基质细胞糖酵解失调的分子机制 | 多囊卵巢综合征患者和DHEA诱导的PCOS大鼠模型 | 生物信息学 | 多囊卵巢综合征 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 免疫浸润分析, 功能富集分析 | Seurat, CellChat, CIBERSORT, ESTIMATE, ssGSEA | 基因表达数据 | 三个独立的批量RNA-seq数据集和DHEA诱导的PCOS大鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 653 | 2025-10-05 |
A splicing-based multitissue association study of joint transcriptomes identified susceptibility genes for osteoarthritis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1590008
PMID:41019096
|
研究论文 | 通过跨组织和单组织转录组关联分析结合单细胞测序技术，鉴定骨关节炎易感基因LTBP1及其在软骨细胞分化中的调控作用 | 首次整合跨组织/单组织TWAS分析与单细胞测序数据，系统揭示LTBP1基因通过TGF-β和Notch信号通路参与骨关节炎发病的新机制 | 未明确说明样本规模及具体测序平台技术细节 | 鉴定骨关节炎的易感基因并阐明其功能机制 | 骨关节炎相关遗传位点及LTBP1基因 | 生物信息学 | 骨关节炎 | 单细胞测序, 转录组关联分析(TWAS), 全基因组关联研究(GWAS) | UTMOST, FUSION, MAGMA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 654 | 2025-10-05 |
Spatial and single-cell transcriptomics capture two distinct cell states in soybean defense response to Phakopsora pachyrhizi infection
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1637176
PMID:41019740
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研究论文 | 本研究通过空间和单细胞转录组技术揭示大豆对亚洲大豆锈病病原体感染的两种不同细胞状态及其空间分布模式 | 首次结合空间转录组和单核转录组技术揭示植物免疫反应的空间协调性，发现感染区域与周边区域存在不同的防御反应状态 | 仅针对大豆-Phakopsora pachyrhizi互作系统，其他植物-病原体系统的普适性有待验证 | 解析植物对病原体感染的空间防御反应机制 | 大豆植株及其对Phakopsora pachyrhizi病原体感染的响应 | 植物生物学 | 植物病害 | 空间转录组学, 单核RNA测序, 基因共表达网络分析 | NA | 空间转录组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 655 | 2025-10-05 |
Dissecting and validation the biomarker of heart failure progression in patients with atherosclerosis by single-cell sequencing, bioinformatics, and machine learning
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1587274
PMID:41019764
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和转录组数据，结合机器学习方法鉴定动脉粥样硬化向心力衰竭进展的早期生物标志物 | 首次整合单细胞RNA测序和批量转录组数据，结合三种机器学习算法鉴定CD48作为AS向HF进展的潜在生物标志物 | 研究基于公共数据库数据，需要实验验证；样本来源和数量有限 | 识别动脉粥样硬化向心力衰竭进展的早期生物标志物及潜在机制 | 动脉粥样硬化患者向心力衰竭进展的转录组数据 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 机器学习 | LASSO, Random Forest, SVM-RFE | 基因表达数据 | 多个GEO数据集(GSE28829, GSE57345等)，包含2828个心脏相关基因 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 人类细胞图谱(HCL)平台 |
| 656 | 2025-10-06 |
Identification of prognostic biomarkers for hepatocellular carcinoma based on the m6A RNA modification
2025 Jan-Dec, International journal of immunopathology and pharmacology
IF:3.0Q2
DOI:10.1177/03946320251370847
PMID:41013996
|
研究论文 | 本研究通过分析m6A RNA修饰识别肝细胞癌的预后生物标志物 | 基于m6A调节因子的转录谱识别了四种肝细胞癌分子亚型，并建立了稳健的风险预测模型 | NA | 识别肝细胞癌的预后生物标志物 | 肝细胞癌患者数据和肝癌细胞系（Huh7、Hep 3B、Hep G2）及正常肝细胞 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | RNA测序、单细胞RNA测序、qRT-PCR | 风险模型 | RNA测序数据、临床数据、单细胞RNA测序数据 | 来自TCGA-LIHC和ICGC-LIRI-JP数据库的样本及三种肝癌细胞系 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | NA | NA |
| 657 | 2025-10-05 |
Multi-omics analysis of parthanatos related molecular subgroup and prognostic model development in stomach adenocarcinoma
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0332988
PMID:41004487
|
研究论文 | 通过多组学分析研究胃腺癌中parthanatos相关分子亚型并开发预后模型 | 首次系统研究parthanatos相关基因在胃腺癌中的作用，建立了基于PRG的新型预后特征，并通过单细胞RNA测序和体外实验验证关键基因COL8A1的功能 | 研究主要基于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 探索parthanatos相关基因在胃腺癌中的分子特征和预后价值 | 胃腺癌患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 胃腺癌 | 多组学分析，转录组学，基因组学，单细胞RNA测序，western blot，集落形成，CCK-8，Transwell实验 | 机器学习算法，无监督聚类 | 转录组数据，基因组数据，临床数据，单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，多组学分析 | NA | NA |
| 658 | 2025-10-05 |
Integration of Single-Cell RNA and Bulk RNA Sequencing Reveals Cellular Heterogeneity and Identifies Survival-Associated Regulatory Networks in Glioblastoma
2025 Jan-Dec, IET systems biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1049/syb2.70025
PMID:40804738
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和bulk RNA测序揭示胶质母细胞瘤细胞异质性并识别与生存相关的调控网络 | 首次结合单细胞和bulk转录组数据识别生存相关细胞状态，发现超级增强子调控网络在胶质母细胞瘤中的关键作用 | NA | 识别胶质母细胞瘤预后生物标志物和治疗靶点 | 胶质母细胞瘤肿瘤微环境中的细胞异质性 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | Scissor算法,WGCNA分析,CellChat分析 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 659 | 2025-10-05 |
Single-cell splicing QTL analysis in pancreatic islets
2025, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2025.1657895
PMID:41000275
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析胰腺胰岛中的剪接数量性状位点 | 首次在单细胞水平识别胰腺胰岛α和β细胞中的剪接QTL，发现了批量分析中未观察到的CDC42基因变异 | 样本量有限，统计功效有待提升 | 探索遗传变异对单细胞水平选择性剪接的调控机制 | 胰腺胰岛α细胞和β细胞 | 单细胞基因组学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序, 基因分型, 异构体定量分析 | sQTLseeker2 | 单细胞RNA测序数据 | 8个全长单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 660 | 2025-10-05 |
Novel diagnostic biomarkers associated with macrophage-microglia in spinal cord injury
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1634014
PMID:41000385
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研究论文 | 本研究通过机器学习算法识别脊髓损伤中与巨噬细胞-小胶质细胞相关的诊断生物标志物 | 首次结合单细胞RNA测序和多种机器学习算法识别脊髓损伤中巨噬细胞-小胶质细胞相关的关键枢纽基因 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证仅限于体外模型 | 探索脊髓损伤中巨噬细胞-小胶质细胞相关的诊断生物标志物 | 脊髓损伤相关的基因表达数据和巨噬细胞-小胶质细胞 | 生物信息学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序, qPCR, 机器学习算法 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | GEO数据库中的脊髓损伤相关数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |