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当前共找到 2148 篇文献，本页显示第 641 - 660 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 641 | 2025-10-05 |
Single-cell and bulk transcriptomic analyses reveal PANoptosis-associated immune dysregulation of fibroblasts in periodontitis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1671919
PMID:40977731
|
研究论文 | 通过单细胞和批量转录组分析揭示牙周炎中成纤维细胞的PANoptosis相关免疫失调 | 首次在牙周炎中系统研究PANoptosis的作用机制，并整合多种机器学习模型筛选关键基因 | 样本量相对有限，需要进一步功能验证 | 探究PANoptosis在牙周炎发病机制中的作用 | 人牙龈组织和牙龈成纤维细胞，牙周炎模型小鼠 | 单细胞转录组学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序，免疫荧光染色，qPCR，免疫组化 | 113种机器学习模型 | 单细胞转录组数据，批量转录组数据，空间转录组数据 | 牙周炎患者和健康个体的牙龈组织 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学，批量RNA测序 | NA | NA |
| 642 | 2025-10-05 |
Myeloid-specific S100A8/A9 deficiency attenuates atrial fibrillation through prevention of TLR4/NF-kB-mediated immune cell recruitment and inflammation
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1623486
PMID:40977740
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和基因敲除小鼠模型，揭示了髓系细胞来源的S100A8/A9通过TLR4/NF-κB轴促进心房颤动发生发展的分子机制 | 首次阐明髓系细胞特异性S100A8/A9在心房颤动中的致病作用及其通过TLR4/NF-κB信号通路调控免疫细胞募集和炎症反应的机制 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化价值需要进一步验证；NF-κB激活剂HY-18739的药理作用机制需更深入研究 | 探究髓系细胞来源的S100A8/A9在心房颤动发病机制中的作用及其治疗潜力 | 心房颤动患者样本和单核细胞/巨噬细胞特异性S100A9条件性基因敲除小鼠 | 心血管疾病研究 | 心房颤动 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 基因敲除, 电生理检测 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 电生理数据, 组织病理数据 | 未明确具体样本数量，包括AF患者样本和基因敲除小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 643 | 2025-10-05 |
ANXA1 and ARG2 drive T cell proliferation in ischemia-reperfusion injury: integrated bulk and single-cell transcriptomic analysis
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1673163
PMID:40977888
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研究论文 | 通过整合性转录组分析揭示ANXA1和ARG2在缺血再灌注损伤中驱动T细胞增殖的分子机制 | 首次通过整合性转录组分析识别ANXA1和ARG2作为缺血再灌注损伤中T细胞增殖的关键调控因子 | 研究主要基于转录组数据，需要进一步实验验证这些基因的功能机制 | 探究缺血再灌注损伤中T细胞增殖的分子机制 | 缺血再灌注损伤模型中的T细胞 | 生物信息学 | 缺血再灌注损伤 | 单细胞RNA测序, 批量转录组测序, 免疫浸润分析, 分子动力学模拟 | NA | 转录组数据 | 多个器官模型的转录组数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 644 | 2025-10-05 |
Multi-transcriptomics analysis of ferroptosis related genes reveals CAFs exosomal COX4I2 as a novel therapeutic target in osteosarcoma
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1620648
PMID:40977891
|
研究论文 | 通过多转录组学分析发现CAFs外泌体COX4I2是骨肉瘤铁死亡治疗的新靶点 | 首次发现CAFs通过外泌体传递COX4I2蛋白抑制骨肉瘤细胞铁死亡的新机制 | 铁死亡在骨肉瘤中的预后意义和调控机制仍需进一步探索 | 探究铁死亡相关基因在骨肉瘤中的预后价值和调控机制 | 骨肉瘤细胞系143B、癌症相关成纤维细胞(CAFs)、裸鼠 | 生物信息学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序, Western blot, 共聚焦显微镜, 透射电子显微镜 | LASSO回归, SVM, RF, XGBoost, BORUTA | RNA测序数据, 蛋白质数据, 细胞成像数据 | 两个独立GEO队列(GSE21257和GSE39055), 体外细胞实验, 裸鼠体内实验 | NA | 单细胞RNA-seq, 外泌体分析 | NA | NA |
| 645 | 2025-10-05 |
scAGG: Sample-level embedding and classification of Alzheimer's disease from single-nucleus data
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.08.009
PMID:40977903
|
研究论文 | 提出scAGG模型，利用单细胞RNA测序数据进行阿尔茨海默病的样本级分类 | 开发了样本级池化机制来聚合单细胞嵌入，能够从单细胞数据中学习疾病严重程度的细胞排序 | 注意力模型的解释性有限 | 利用单细胞RNA测序数据进行阿尔茨海默病的样本级分类和疾病机制研究 | 阿尔茨海默病患者和健康对照的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 样本级池化模型,注意力模型 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 646 | 2025-10-05 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Cellular Heterogeneity and Microenvironmental Remodeling in Human Ureteral Scar Stricture Tissue
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S540340
PMID:40979497
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了人类输尿管瘢痕狭窄组织的单细胞转录组图谱，揭示了细胞异质性和微环境重塑 | 首次构建了输尿管瘢痕狭窄组织的高分辨率单细胞图谱，揭示了细胞亚群动态变化和细胞间通讯网络 | 样本量较小（3例正常对照和3例患者），需要更大规模研究验证发现 | 揭示输尿管瘢痕狭窄组织的细胞异质性和微环境重塑机制 | 人类输尿管组织（正常对照和瘢痕狭窄患者） | 单细胞转录组学 | 输尿管瘢痕狭窄 | 单细胞RNA测序, 多重免疫荧光, 免疫组织化学 | Seurat, Harmony, Monocle2, CellChat, SCP | 单细胞转录组数据, 图像数据 | 6例样本（3例正常对照，3例患者） | Illumina | 单细胞RNA测序 | Illumina NovaSeq 6000, MobiNova-100 | MobiNova-100单细胞平台，Illumina NovaSeq 6000测序系统 |
| 647 | 2025-10-05 |
Integrative analysis of single-cell and microarray data reveals SPI1-centered macrophage regulatory signatures in ulcerative colitis
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1617834
PMID:40979590
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和微阵列数据分析，揭示了转录因子SPI1在溃疡性结肠炎巨噬细胞极化中的核心调控作用 | 首次构建了以SPI1为中心的巨噬细胞调控网络，并鉴定出IRAK3、IL1RN、CD55和PEA15等关键下游靶基因 | 研究主要基于体外实验，需要进一步的体内验证；样本量相对有限 | 探索溃疡性结肠炎中巨噬细胞极化的分子调控机制 | 溃疡性结肠炎患者的肠道组织巨噬细胞 | 生物信息学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序, 微阵列, 基因调控网络分析, 机器学习算法 | LASSO, RFE-RF, SVM-RFE | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 微阵列 | NA | NA |
| 648 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA sequencing in studies of type 1 diabetes mellitus: modern state-of-the-art and technical peculiarities
2025, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2025.1663728
PMID:40979707
|
综述 | 本文总结了单细胞RNA测序技术在1型糖尿病研究中的应用现状和技术特点 | 系统梳理了scRNA-seq在T1DM研究中的最新进展，重点关注不同免疫细胞亚群间的相互作用和疾病早期特异性基因表达 | 作为综述文章，不涉及原始研究数据的产生和分析 | 探讨scRNA-seq技术在1型糖尿病发病机制研究中的应用价值 | 1型糖尿病患者和模型动物的胰腺细胞、免疫细胞及外周血单核细胞 | 单细胞组学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 649 | 2025-10-05 |
DUX4-stimulated genes define the antiviral response to herpesviruses in human trophoblasts
2025-Jan-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.22.634317
PMID:39896594
|
研究论文 | 本研究通过人类滋养细胞类器官揭示了DUX4及其刺激基因在抗疱疹病毒防御中的关键作用 | 发现疱疹病毒在滋养细胞中不触发干扰素反应，而是特异性诱导DUX4及其下游基因表达，这代表了一种新型抗病毒防御机制 | 研究仅限于七种致畸病毒，且主要关注疱疹病毒亚群 | 探索滋养细胞对致畸病毒的转录反应机制 | 人类滋养细胞类器官 | 转录组学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 人类滋养细胞类器官暴露于七种致畸病毒 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 650 | 2025-10-05 |
DWI-based Biologically Interpretable Radiomic Nomogram for Predicting 1-year Biochemical Recurrence after Radical Prostatectomy: A Deep Learning, Multicenter Study
2025, Current medical imaging
IF:1.1Q3
|
研究论文 | 开发基于DWI的深度学习放射组学列线图预测前列腺癌根治术后1年生化复发 | 首次将深度学习提取的放射组学特征与临床参数结合构建预测模型，并探索放射组学评分与肿瘤微环境的关联 | 回顾性研究设计，样本量有限（n=349），单细胞RNA测序数据仅来自4名患者 | 预测前列腺癌根治术后1年生化复发风险 | 接受前列腺癌根治术的患者 | 医学影像分析 | 前列腺癌 | 扩散加权成像，单细胞RNA测序，深度学习 | 3D U-Net, Cox比例风险回归 | 医学影像，临床数据，基因表达数据 | 349名患者（两个独立队列），4名患者单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序，多参数磁共振成像 | NA | NA |
| 651 | 2025-10-05 |
Multi-omics integration uncovers key transcriptional regulators in triple-negative breast cancer spatial heterogeneity
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1614254
PMID:40969325
|
研究论文 | 通过多组学整合方法构建三阴性乳腺癌空间细胞图谱，揭示关键转录调控因子 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学构建TNBC空间细胞图谱，识别细胞类型特异性转录调控网络 | 研究样本量有限，需要更大规模验证；空间分辨率的限制可能影响细胞互作分析的精确性 | 解析三阴性乳腺癌空间异质性及其调控机制 | 三阴性乳腺癌组织样本 | 空间转录组学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫组织化学验证 | 转录因子调控网络, 受体-配体相互作用分析 | 单细胞基因表达数据, 空间基因表达数据, 组织图像数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 652 | 2025-10-05 |
NADH supplementation improves human oocyte maturation and developmental competence of resulting embryos in controlled ovarian hyperstimulation cycles: a pilot study implicating the CDK2/GAS6 signaling pathway
2025, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2025.1627679
PMID:40969372
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研究论文 | 本研究探讨NADH补充对人类卵母细胞成熟及胚胎发育能力的影响 | 首次研究NADH（NAD+还原形式）对人类卵母细胞成熟的直接影响，并揭示CDK2/GAS6信号通路在此过程中的作用机制 | 初步研究，样本量有限，需要更大规模研究验证 | 评估NADH对人类卵母细胞体外成熟和胚胎发育能力的影响 | 控制性卵巢刺激周期中废弃的GV/MⅠ期人类卵母细胞 | 生殖医学 | 卵巢功能减退 | 单细胞RNA测序，免疫荧光，线粒体表型分析 | NA | 基因表达数据，图像数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 653 | 2025-10-05 |
A Brief Introduction to Genomics and Single-cell Analysis for Psychiatric Disorders
2025, Juntendo medical journal
DOI:10.14789/ejmj.JMJ25-0003-R
PMID:40969821
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综述 | 本文综述了基因组学和单细胞分析在精神疾病研究中的最新进展，特别关注双相情感障碍 | 整合临床基因组数据与细胞类型特异性表达谱，结合类器官或神经元模型的药物筛选 | 直接获取活体人脑组织存在重大限制，主要依赖死后脑组织研究 | 深入理解精神疾病的病理机制，开发创新诊断和治疗策略 | 精神疾病（特别是双相情感障碍和精神分裂症）的病理机制研究 | 基因组学 | 精神疾病 | 单细胞RNA测序，诱导多能干细胞技术 | NA | 基因组数据，基因表达谱 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 654 | 2025-10-05 |
Unlocking hematopoietic stem cell potential: integrative computational approaches for genomic and transcriptomic analysis
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1589823
PMID:40970097
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综述 | 本文综述了计算生物学方法在造血干细胞基因组和转录组分析中的应用 | 整合单细胞RNA测序、染色质免疫沉淀测序、网络推断算法和机器学习等多种计算工具解析造血干细胞异质性 | NA | 解析造血干细胞生物学特性并改善血液疾病治疗 | 造血干细胞 | 计算生物学 | 血液疾病 | 单细胞RNA测序, 染色质免疫沉淀测序, 网络推断算法, 机器学习 | 机器学习模型 | 基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 染色质免疫沉淀测序 | NA | NA |
| 655 | 2025-10-05 |
CD44 as a novel therapeutic target in pulmonary arterial hypertension: Insights from multi-omics integration and molecular docking
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0332817
PMID:40971695
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研究论文 | 本研究通过多组学整合和分子对接分析，探讨CD44在肺动脉高压炎症过程中的作用及治疗潜力 | 首次发现CD44在肺动脉平滑肌细胞中高表达并参与血管炎症和重塑，通过分子对接揭示孕酮与CD44的潜在相互作用 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步实验验证CD44与孕酮相互作用的生物学功能 | 探索CD44在肺动脉高压发病机制中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 特发性肺动脉高压患者和肺动脉细胞 | 生物信息学 | 肺动脉高压 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 分子对接 | NA | 基因表达数据 | 特发性肺动脉高压患者的RNA-seq数据和肺动脉细胞的单细胞RNA-seq数据 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 656 | 2025-10-05 |
Exploratory trajectory inference reveals convergent lineages for CD8 T cells in chronic LCMV infection
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0332406
PMID:40971956
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研究论文 | 提出探索性轨迹推断方法，用于解析单细胞RNA测序数据中的复杂分化轨迹拓扑结构 | 开发了探索性轨迹推断方法，能够识别收敛性分化轨迹，解决了传统方法难以解析复杂分化拓扑的难题 | 方法主要针对单细胞RNA测序数据，在其他数据类型上的适用性需要进一步验证 | 开发新的轨迹推断方法以解析细胞分化过程中的复杂拓扑结构 | 慢性LCMV感染过程中的CD8 T细胞 | 单细胞基因组学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序，RNA速度分析，过继转移实验 | 探索性轨迹推断，基于模拟的轨迹推断 | 单细胞RNA测序数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 657 | 2025-10-05 |
Single Cell Transcriptome Signatures of Sarcoidosis in Lung Immune Cell Populations
2025-Jan-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.20.633917
PMID:39896662
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析肺结节病患者支气管肺泡灌洗细胞中的免疫细胞组成、基因表达模式和细胞间相互作用 | 首次在肺结节病中系统鉴定五种巨噬细胞亚群并揭示其特异性基因表达谱和细胞间通讯变化 | 样本量相对有限（16例患者和14例对照），且仅基于支气管肺泡灌洗细胞分析 | 识别与肺结节病风险和进展相关的细胞特异性分子变化 | 肺结节病患者（包括进展性和非进展性）和健康对照者的支气管肺泡灌洗细胞 | 单细胞组学 | 肺结节病 | 单细胞RNA测序 | Seurat聚类分析，CellChat细胞通讯分析 | 单细胞转录组数据 | 16例肺结节病患者（8例进展性，8例非进展性）和14例健康对照 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | CellRanger预处理流程 |
| 658 | 2025-10-05 |
HMG Box-containing Protein 1 (HBP1) Protects Against Pancreatic Injury in Acute Pancreatitis but Promotes Neoplastic Progression
2025, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101536
PMID:40404099
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研究论文 | 本研究探讨HBP1在急性胰腺炎和胰腺肿瘤进展中的双重作用 | 首次揭示HBP1在胰腺炎中具有保护作用但在KRAS突变背景下促进肿瘤进展的双重功能 | 研究主要基于动物模型和细胞实验，需要更多临床验证 | 阐明HBP1在胰腺炎发生和胰腺肿瘤进展中的功能作用 | 人类胰腺炎样本、小鼠模型、人胰腺导管上皮细胞 | 分子病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组学、多重蛋白检测、组织学分析、免疫染色 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、组织图像、蛋白质数据 | 人类胰腺炎样本和多种基因工程小鼠模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 659 | 2025-10-05 |
Malignant epithelia cells-derived spermine induces APOE+ macrophages to suppress tumor immunity in adenocarcinoma of the esophagogastric junction
2025, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2025.1636699
PMID:40963562
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研究论文 | 本研究揭示了食管胃结合部腺癌中恶性上皮细胞通过精胺诱导APOE+巨噬细胞抑制肿瘤免疫的机制 | 首次发现AEG特异性恶性亚型通过谷氨酰胺-精氨酸-精胺代谢轴驱动肿瘤免疫抑制，阐明精胺-STAT3-APOE轴在代谢-免疫串扰中的作用 | 样本量相对有限（单细胞RNA测序11例，空间转录组4例），需要更大规模验证 | 探究食管胃结合部腺癌进展机制，特别是代谢重编程与免疫微环境的相互作用 | 食管胃结合部腺癌患者的肿瘤组织和配对癌旁正常组织 | 数字病理学 | 食管胃结合部腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 代谢组学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 代谢组数据 | 单细胞RNA测序11例, 空间转录组4例, 代谢组分析26例 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 660 | 2025-10-05 |
Machine learning-based integration develops an immune-derived signature for diagnosing high-altitude pulmonary hypertension
2025, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2025.1603140
PMID:40963580
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据和机器学习方法，开发了一种基于免疫特征的诊断模型用于高原性肺动脉高压 | 首次采用单细胞RNA测序、批量RNA测序和蛋白质组学的多组学整合方法，结合机器学习算法筛选出六基因诊断特征 | 样本量相对有限，外部验证队列的AUC值(0.773)低于训练队列(0.995) | 开发高原性肺动脉高压的微创血液诊断方法 | 高原性肺动脉高压患者和对照组的血液样本 | 机器学习 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,蛋白质组学,定量PCR | 随机森林 | 基因表达数据,蛋白质数据 | 单细胞RNA测序10例,批量RNA测序126例,蛋白质组学42例,训练队列55例,验证队列71例 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,蛋白质组学 | NA | NA |