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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 621 | 2025-10-05 |
Loss of PI5P4Kα Slows the Progression of a Pten Mutant Basal Cell Model of Prostate Cancer
2025-01-02, Molecular cancer research : MCR
IF:4.1Q2
DOI:10.1158/1541-7786.MCR-24-0290
PMID:39382632
|
研究论文 | 本研究开发了基底细胞特异性基因工程小鼠模型,发现PI5P4Kα缺失可减缓Pten突变前列腺癌模型的肿瘤进展 | 首次揭示了PI5P4Kα在前列腺基底细胞中的富集特性及其在Pten突变癌症模型中的肿瘤抑制作用 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类患者中验证 | 探究PI5P4Kα在前列腺基底细胞癌症进展中的作用机制 | 基因工程小鼠模型和LNCaP前列腺癌细胞 | 癌症生物学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序,谱系追踪,转录组通路分析 | 基因工程小鼠模型 | 基因表达数据,组织病理学数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 622 | 2025-10-05 |
The immune checkpoint TIM-3/HMGB-1 axis in myocardial infarction
2025, NPJ cardiovascular health
DOI:10.1038/s44325-025-00061-x
PMID:40978514
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研究论文 | 本研究揭示了心肌梗死后免疫检查点TIM-3/HMGB-1轴在心脏炎症中的关键作用 | 首次系统研究TIM-3通路在心肌梗死中的作用,发现TIM-3/HMGB-1相互作用是心脏炎症的新靶点 | 样本量相对有限,机制研究主要基于体外实验 | 探究免疫检查点TIM-3通路在心肌梗死后的作用机制 | 人类血清、外周血单核细胞和心脏组织 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | RNA测序数据, 蛋白质表达数据 | 血清样本357例,PBMCs样本76例(38例患者+38例对照) | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 623 | 2025-10-05 |
Understanding and mitigating the impact of ambient mRNA contamination in single-cell RNA-sequencing analysis
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0332440
PMID:40991648
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研究论文 | 本研究探讨了环境mRNA污染对单细胞RNA测序分析的影响,并评估了两种校正方法的有效性 | 首次系统评估环境mRNA污染对差异基因表达和通路富集分析的影响,并比较两种校正方法的性能 | 仅使用了两个独立数据集,可能无法代表所有单细胞RNA测序场景 | 理解和减轻环境mRNA污染对单细胞RNA测序分析的影响 | 登革热患者外周血单个核细胞和人类胎儿肝组织样本 | 单细胞转录组学 | 传染病 | 单细胞RNA测序 | CellBender, SoupX | 单细胞转录组数据 | 10个PBMC样本和42个人类胎儿肝组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 液滴式单细胞RNA测序平台 |
| 624 | 2025-10-05 |
The role of microglia and complement C5/C5a in the pathogenesis of rhegmatogenous retinal detachment with choroidal detachment
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.08.019
PMID:40994539
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析孔源性视网膜脱离伴脉络膜脱离的细胞和分子特征,探讨小胶质细胞和补体C5/C5a通路在疾病发病机制中的作用 | 首次使用单细胞RNA测序技术揭示RRDCD独特的细胞景观,发现小胶质细胞与树突状细胞间增强的连接性以及补体C5-C5AR1相互作用的上调 | 样本量相对有限,研究主要基于体外实验,需要进一步体内验证 | 识别区分RRDCD与典型RRD的细胞和分子特征,研究小胶质细胞和补体C5/C5a通路在疾病发病机制中的作用 | 孔源性视网膜脱离伴脉络膜脱离患者的玻璃体样本,原代视网膜小胶质细胞,RF/6A内皮细胞和ARPE-19上皮细胞 | 单细胞组学 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序,体外共培养实验 | NA | 单细胞转录组数据 | RRD和RRDCD患者的玻璃体样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 625 | 2025-10-05 |
CD226 identifies effector CD8+ T cells during tuberculosis and costimulates recognition of Mycobacterium tuberculosis-infected macrophages
2025-Jan-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.22.634303
PMID:39896604
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别CD226作为结核病中效应CD8+T细胞的关键标志物,并证实其参与识别结核分枝杆菌感染巨噬细胞的共刺激过程 | 首次发现CD226是区分结核病中效应性和耗竭性CD8+T细胞谱系的最显著差异表达基因,并证明其对于CD8+T细胞识别结核分枝杆菌感染巨噬细胞的关键作用 | 研究仅使用C57BL/6J小鼠模型,未在人类样本中验证 | 探究慢性结核感染期间肺实质CD8+T细胞的多样性变化及其识别机制 | C57BL/6J小鼠的肺实质CD8+T细胞和结核分枝杆菌感染的巨噬细胞 | 免疫学 | 结核病 | 单细胞RNA测序, IFNγ-eYFP报告基因系统 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞术数据 | 感染6周和41周的C57BL/6J小鼠肺组织细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 626 | 2025-10-05 |
Deciphering the toxic effects of polystyrene nanoparticles on erythropoiesis at single-cell resolution
2025-Jan-18, Zoological research
IF:4.0Q1
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探究了聚苯乙烯纳米颗粒对斑马鱼胚胎红细胞生成的毒性影响 | 首次在单细胞分辨率下系统评估聚苯乙烯纳米颗粒对斑马鱼红细胞生成的影响 | 研究仅针对斑马鱼胚胎,未涉及其他生物或发育阶段 | 评估聚苯乙烯纳米颗粒对水生生物造血过程的毒性效应 | 斑马鱼胚胎 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 627 | 2025-10-05 |
High expression of CCL3/CCL4/CCL5/CCR5 promotes exhausted CD8+ T cells terminal differentiation and is associated with poor prognosis in pediatric B-ALL patients
2025 Jan-Dec, International journal of immunopathology and pharmacology
IF:3.0Q2
DOI:10.1177/03946320251346823
PMID:40522146
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现CCL3/CCL4/CCL5-CCR5轴在B-ALL细胞与终末耗竭CD8+T细胞相互作用中上调,并建立多变量Cox回归模型预测儿科B-ALL患者预后 | 首次报道CCL3/CCL4/CCL5-CCR5轴在B-ALL终末耗竭CD8+T细胞分化中的关键作用,并开发整合这些标志物的预后预测模型 | 研究样本量有限,需要更大规模验证;机制研究不够深入 | 识别B-ALL细胞与耗竭CD8+T细胞间差异上调的配体-受体相互作用,开发儿科B-ALL患者生存预测模型 | 儿科B细胞急性淋巴细胞白血病患者,特别是其B-ALL细胞和耗竭CD8+T细胞 | 生物信息学 | B细胞急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序,定量实时聚合酶链反应,多变量Cox回归分析 | 多变量Cox回归模型 | 单细胞RNA测序数据,转录组数据,临床预后数据 | 221例儿科B-ALL样本,另包含本中心成人B-ALL患者数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 628 | 2025-10-05 |
Blood memory CD8 T cell phenotypes in lung cancer patients predict immune checkpoint treatment responses
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1629802
PMID:40989699
|
研究论文 | 通过单细胞测序技术分析肺癌患者外周血CD8+ T细胞表型,建立预测免疫检查点治疗反应的机器学习模型 | 首次在单细胞水平系统分析不同免疫治疗反应组患者的CD8+ T细胞表型特征,并开发出高精度的预测模型 | 研究样本量有限,需要在更大规模队列中验证模型的普适性 | 开发能够预测肺癌患者免疫检查点抑制剂治疗反应的生物标志物 | 非小细胞肺癌患者的外周血CD8+ T细胞 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,TCR repertoire分析 | 机器学习 | 单细胞转录组数据,表面标志物表达数据,TCR序列数据 | 包含长期应答者、新治疗应答者和新治疗无应答者的患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 629 | 2025-10-05 |
Identification of Core SASP-Related Genes TGFBI and ANXA6 for Diagnosing Ulcerative Colitis-Related Colorectal Cancer Through Machine Learning
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S538960
PMID:40989757
|
研究论文 | 通过机器学习方法识别溃疡性结肠炎相关结直肠癌的核心SASP相关基因TGFBI和ANXA6作为诊断标志物 | 首次系统筛选SASP相关基因在UCRCC中的作用,并通过113种机器学习算法组合鉴定出核心基因TGFBI和ANXA6 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证仅限于小鼠模型,需要进一步临床验证 | 探索衰老相关分泌表型在溃疡性结肠炎相关结直肠癌精准诊断和发病机制中的作用 | 溃疡性结肠炎和结直肠癌患者基因表达数据及小鼠模型 | 机器学习 | 结直肠癌 | 差异表达基因分析,加权基因共表达网络分析,单细胞RNA测序,机器学习算法 | 10种机器学习算法的113种组合 | 基因表达数据,单细胞测序数据 | UC和CRC数据集,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 630 | 2025-10-05 |
Multi-omics reveals immune features in immune and non-immune cells, an IFN-γ/IFN-α-B2M positive feedback loop, and targeted metabolic therapy in multiple myeloma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1575079
PMID:40990011
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了多发性骨髓瘤中的免疫特征、IFN-γ/IFN-α-B2M正反馈环路及靶向代谢治疗策略 | 识别了新的MM亚群(骨髓瘤激活的造血干细胞和ISG15+ B细胞),发现了IFN-γ/IFN-α-B2M正反馈环路,并通过多组学整合筛选出四种候选药物 | NA | 建立多发性骨髓瘤的多组学图谱,表征驱动免疫逃逸和疾病进展的细胞亚群和信号通路 | 多发性骨髓瘤的免疫和非免疫细胞 | 生物信息学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序, 单细胞代谢分析, 批量RNA测序, 多重免疫荧光, CCK-8检测, 流式细胞术, Western blotting | NA | 单细胞转录组数据, 批量转录组数据, 代谢数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 单细胞代谢分析 | NA | NA |
| 631 | 2025-10-05 |
FCRLs and atypical transcriptional pattern in tumor infiltrating B cells from lung and renal cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1587088
PMID:40990023
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研究论文 | 本研究通过转录组分析揭示了肺癌和肾癌中肿瘤浸润B细胞的功能差异及FCRL4作为功能失调标志物的重要性 | 发现sIgA+ B细胞中FCRL4、PDCD1和RUNX2的过表达特征,以及FCRL4/CD20表达比与生存率的相关性 | 研究主要基于转录组数据分析,缺乏功能性验证实验 | 探究肿瘤浸润B细胞中不同抗体亚型的功能差异及其在肿瘤进展中的作用 | 肺癌和肾癌中的肿瘤浸润B细胞,特别是表面IgA+和IgG+记忆B细胞 | 免疫学 | 肺癌, 肾癌 | 高维流式细胞术, 单细胞RNA测序, 批量转录组分析 | NA | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | TCGA LUAD队列及公共scRNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA测序, 批量转录组测序 | NA | NA |
| 632 | 2025-10-05 |
Glycolysis-Driven Immune Evasion in Microsatellite Instability-High Colorectal Cancer: An Integrated Single-Cell and Spatial Transcriptomics Study
2025, OncoTargets and therapy
IF:2.7Q3
DOI:10.2147/OTT.S538018
PMID:40990035
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和空间转录组学技术,揭示了糖酵解驱动的免疫逃逸机制在微卫星高度不稳定结直肠癌中的作用 | 首次在微卫星高度不稳定结直肠癌中发现糖酵解富集的肿瘤亚群与免疫抑制微环境的共定位关系,并阐明乳酸分泌促进Treg分化和巨噬细胞极化的分子机制 | 研究样本量有限,需要更大规模队列验证;机制研究主要基于相关性分析,缺乏功能性实验验证 | 探究微卫星高度不稳定结直肠癌中肿瘤细胞功能异质性及其在免疫逃逸中的作用 | 微卫星高度不稳定结直肠癌患者 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | 非负矩阵分解, 基因集富集分析 | 基因表达数据, 空间定位数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 633 | 2025-10-05 |
Single-cell transcriptomics reveals predominantly inflammatory endothelial cell responses and suppressed vascular repair in silicosis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1629226
PMID:40969743
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示矽肺病中内皮细胞主要表现为炎症反应且血管修复功能受抑制 | 首次在矽肺病中发现两种功能不同的内皮细胞亚群:炎症型内皮细胞和修复型内皮细胞,并揭示其功能失衡机制 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 探究矽肺病中内皮细胞的功能特性和病理作用 | 二氧化硅暴露小鼠的肺组织内皮细胞 | 单细胞组学 | 矽肺病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 二氧化硅暴露小鼠肺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 634 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA sequencing analysis reveals the heterogeneity and effect of TAMs in colorectal cancer
2025-Jan-01, Biochemistry and cell biology = Biochimie et biologie cellulaire
DOI:10.1139/bcb-2025-0041
PMID:40834430
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析结直肠癌中肿瘤相关巨噬细胞的异质性及其作用 | 首次在结直肠癌中系统揭示肿瘤相关巨噬细胞的异质性及其在肿瘤微环境中的动态轨迹 | 基于公共数据库的回顾性分析,样本来源有限 | 研究结直肠癌肿瘤微环境的异质性及免疫细胞的作用 | 结直肠癌患者的肿瘤组织和正常组织 | 单细胞测序分析 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | Monocle3轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | 27,414个细胞(来自正常组织、肿瘤核心和边界区域) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 635 | 2025-10-05 |
Comprehensive single-cell sequencing reveals the tumor microenvironment and tumor-specific characteristics in trachea squamous cell carcinoma
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1575647
PMID:40874228
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析气管鳞状细胞癌的肿瘤微环境和化疗反应机制 | 首次构建气管鳞状细胞癌的单细胞图谱,揭示化疗引起的T细胞状态转换关键转录调控因子 | 样本量较小(仅7个样本),缺乏独立验证队列 | 研究气管鳞状细胞癌的肿瘤微环境特征和化疗反应机制 | 气管鳞状细胞癌患者组织样本(5个恶性样本和2个非恶性样本) | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 7个TSCC样本(5恶性+2非恶性),70,682个高质量细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 636 | 2025-10-05 |
Cellular heterogeneity in metabolism and associated microbiome of a non-model phytoflagellate
2025-Jan-02, The ISME journal
DOI:10.1093/ismejo/wraf046
PMID:40057978
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研究论文 | 本研究使用单细胞转录组学分析非模式微真核生物Ochromonas triangulata的代谢异质性和相关微生物组 | 首次在无参考基因组的非模式微真核生物中应用单细胞转录组学,发现了与不同生长阶段相关的第三种转录状态 | 研究对象为实验室培养的单一物种,可能无法完全反映自然环境中的复杂性 | 探索微真核生物的代谢异质性和与细菌群落的相互作用 | 非模式微真核生物Ochromonas triangulata及其共培养的细菌群落 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 单个微真核生物细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | Smart-seq2 | Smart-seq2单细胞全长转录组测序协议 |
| 637 | 2025-10-05 |
Artemisinin derivatives modulate KEAP1-NRF2-xCT pathway to alleviate Sjögren's disease: insights from scRNA-seq and systems biology
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1626230
PMID:40934008
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和系统生物学方法,探讨青蒿素衍生物通过调节KEAP1-NRF2-xCT通路缓解干燥综合征的作用机制 | 首次揭示青蒿素通过抑制KEAP1介导的NRF2泛素化/降解,上调xCT和GPX4表达,从而保护唾液腺上皮细胞免于铁死亡的新机制 | 研究仅使用NOD/Ltj小鼠模型,尚未在人类临床试验中验证 | 探究青蒿素衍生物通过调节铁死亡通路治疗干燥综合征的分子机制 | 干燥综合征患者样本和NOD/Ltj小鼠模型 | 系统生物学 | 干燥综合征 | 单细胞RNA测序, RNA测序, 分子对接, 透射电子显微镜, 蛋白质印迹, 免疫荧光 | NA | 单细胞RNA测序数据, RNA测序数据, 蛋白质表达数据, 组织学图像 | NOD/Ltj小鼠模型和干燥综合征患者样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 638 | 2025-10-05 |
FLT3L combined with GM-CSF induced dendritic cells drive broad tumor-specific CD8+ T cell responses and remodel the tumor microenvironment to enhance anti-tumor efficacy
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1649891
PMID:40977690
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研究论文 | 本研究比较了FLT3L联合GM-CSF诱导的树突状细胞与传统GM/IL4-DCs在抗肿瘤免疫中的功能差异 | 首次系统比较FL/GM-DCs与常规GM/IL4-DCs的功能差异,发现FL/GM-DCs具有独特的亚群分布和更强的交叉抗原呈递能力 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化效果需进一步验证 | 探索新型树突状细胞诱导方法在癌症免疫治疗中的应用潜力 | 小鼠骨髓细胞、树突状细胞、CD8+ T细胞 | 免疫学 | 癌症 | 流式细胞术、单细胞RNA测序、单细胞TCR测序 | NA | 单细胞测序数据、流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞TCR测序 | NA | NA |
| 639 | 2025-10-05 |
The interplay between mesenchymal stem cells and the immune microenvironment in rotator cuff tendon-to-bone healing: current progress and future directions
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1661340
PMID:40977708
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综述 | 本文综述了间充质干细胞与免疫微环境在肩袖肌腱-骨愈合中的相互作用机制及治疗前景 | 聚焦MSC与免疫细胞的双向通讯机制,提出整合单细胞转录组和AI预测的个体化治疗新策略 | 存在MSC异质性、患者免疫反应差异及临床转化障碍等挑战 | 探索MSC通过免疫调节促进肩袖肌腱-骨愈合的机制与治疗策略 | 间充质干细胞与免疫微环境(巨噬细胞、T细胞、NK细胞) | 组织工程与再生医学 | 肩袖损伤 | 单细胞转录组测序, 细胞因子特征分析 | AI算法 | 转录组数据, 细胞因子数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 640 | 2025-10-05 |
Opportunities, challenges, and future perspectives of oncolytic virus therapy for malignant melanoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1653683
PMID:40977706
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综述 | 本文综述溶瘤病毒疗法在恶性黑色素瘤治疗中的机遇、挑战和未来前景 | 系统阐述溶瘤病毒通过诱导免疫原性细胞死亡和激活cGAS-STING通路将'冷'肿瘤转化为'热'肿瘤的创新机制,并展望单细胞RNA测序和CRISPR/Cas系统等前沿技术在个性化溶瘤病毒设计中的应用 | 面临肿瘤异质性、核心机制局限、病毒脱落风险和监管障碍等挑战 | 探讨溶瘤病毒疗法在恶性黑色素瘤治疗中的发展现状和未来方向 | 恶性黑色素瘤 | 肿瘤免疫治疗 | 恶性黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, CRISPR/Cas系统, 人工智能 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |