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当前共找到 1950 篇文献，本页显示第 621 - 640 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 621 | 2025-10-06 |
Deciphering the role of SEMA4A/MAPK signaling in sepsis: insights from Mendelian randomization, transcriptomic, single-cell sequencing analyses, and vitro experiments
2025, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2025.1606509
PMID:40756031
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研究论文 | 通过孟德尔随机化、转录组学、单细胞测序分析和体外实验，揭示SEMA4A/MAPK信号通路在脓毒症发病机制中的关键作用 | 首次结合孟德尔随机化与多组学分析鉴定脓毒症核心基因，并通过单细胞测序明确其在单核细胞中的特异性表达 | 研究主要基于公共数据库和体外细胞实验，缺乏体内动物模型验证 | 探索脓毒症的新治疗靶点 | 脓毒症患者转录组数据和THP-1人单核细胞 | 生物信息学 | 脓毒症 | 转录组测序,单细胞RNA测序,孟德尔随机化分析,体外实验 | 差异表达分析,富集分析,细胞模型 | 基因表达数据,单细胞测序数据 | 3个独立脓毒症患者转录组数据集 | NA | 单细胞RNA测序,转录组测序 | NA | NA |
| 622 | 2025-10-06 |
To explore the potential of LOXL2 as a biomarker in glioma and construct a genomic integrated clinical prognostic model
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1602475
PMID:40756111
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研究论文 | 本研究探索LOXL2作为胶质瘤生物标志物的潜力并构建基因组整合的临床预后模型 | 首次系统评估LOXL2在胶质瘤中的生物学功能及其与患者预后的潜在关联，构建了基于LOXL2的预后预测模型 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步实验验证LOXL2的具体分子机制 | 为改善胶质瘤诊疗策略提供新的理论基础 | 胶质瘤患者和LOXL2基因 | 生物信息学 | 胶质瘤 | 生物信息学分析，单细胞RNA测序，GO/KEGG通路分析，免疫浸润分析 | COX回归，KM生存分析，列线图，决策曲线分析 | 基因组数据，临床数据，单细胞测序数据 | CCGA探索队列和TCGA验证队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 623 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing using split-pool barcoding reveals transcriptional heterogeneity in Porphyromonas gingivalis with implications for periodontal pathogenesis
2025, Journal of oral microbiology
IF:3.7Q2
DOI:10.1080/20002297.2025.2540827
PMID:40756339
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研究论文 | 本研究首次通过单细胞RNA测序揭示了牙龈卟啉单胞菌的转录异质性 | 首次在单细胞水平绘制牙龈卟啉单胞菌转录图谱，发现具有功能意义的稀有亚群 | 仅使用W83菌株在厌氧条件下培养，未涵盖其他菌株或体内环境 | 探究牙龈卟啉单胞菌在单细胞水平的转录异质性及其与牙周病发病机制的关系 | 牙龈卟啉单胞菌W83菌株 | 单细胞转录组学 | 牙周病 | 单细胞RNA测序 | 聚类分析，差异表达分析 | 单细胞基因表达数据 | 1,942个牙龈卟啉单胞菌细胞 | NA | split-pool barcoding单细胞RNA测序 | NA | split-pool barcoding技术 |
| 624 | 2025-10-06 |
New insights into acute ischemic stroke from the perspective of spatial omics
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.113396
PMID:40756344
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综述 | 从空间单细胞组学角度总结急性缺血性脑卒中后不同细胞类型在时空分布中的生物学功能和相互作用机制 | 首次从空间单细胞组学视角系统阐述急性缺血性脑卒中后中枢驻留细胞与外周免疫细胞亚群在时空分布中的动态互作机制 | NA | 理解急性缺血性脑卒中后复杂细胞间相互作用机制，为精准干预提供理论基础 | 小胶质细胞、星形胶质细胞、少突胶质细胞及其亚群、浸润外周免疫细胞 | 空间转录组学 | 急性缺血性脑卒中 | 空间转录组技术 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 625 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing uncovers intestinal immune alterations and cellular diversity from chronic fluoride exposure in mice
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.116567
PMID:40756359
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示慢性氟暴露对小鼠肠道免疫和细胞多样性的影响 | 首次使用单细胞RNA测序技术系统分析慢性氟暴露对肠道细胞异质性和细胞间通讯的影响 | 研究仅针对小鼠模型，未涉及人类样本验证 | 探究慢性氟暴露对肠道细胞功能和免疫调节的影响机制 | 小鼠回肠组织细胞 | 单细胞组学 | 肠道疾病 | 单细胞RNA测序, 荧光原位杂交, 广谱抗生素处理 | NA | 单细胞转录组数据 | 56周50-ppm氟暴露的小鼠回肠组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 626 | 2025-10-06 |
Analysis of histone modifications in key cellular subpopulations in the context of azoospermia using spermatogenic single-cell RNA-seq data
2025, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2025.1626153
PMID:40756901
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序数据分析非梗阻性无精子症中关键细胞亚群的组蛋白修饰作用 | 首次在单细胞水平揭示NOA患者睾丸组织中特定细胞亚群（如Leydig细胞、PTM细胞和巨噬细胞）的组蛋白修饰相关基因异常表达 | 研究基于公共数据库数据，样本来源有限；未进行实验验证组蛋白修饰的功能机制 | 探究非梗阻性无精子症的分子机制，特别关注组蛋白修饰在疾病进展中的作用 | 非梗阻性无精子症患者和对照组的睾丸组织细胞 | 单细胞转录组学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序 | AUCell, CellChat | 单细胞RNA测序数据 | 来自GEO数据库GSE149512数据集的样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 627 | 2025-10-06 |
Integrated analysis of single-cell and bulk transcriptomic data reveals altered cellular composition and predictive cell types in ectopic endometriosis
2025, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2025.1641982
PMID:40757199
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研究论文 | 通过整合单细胞和批量转录组数据分析，揭示了子宫内膜异位症的细胞组成变化和关键预测细胞类型 | 首次通过整合单细胞和批量转录组数据识别MUC5B+上皮细胞和dStromal晚期间充质细胞作为子宫内膜异位症纤维化和炎症的双重驱动因子 | 依赖公共数据库数据，样本来源可能有限 | 研究子宫内膜异位症的细胞分类和组成，探索其诊断和治疗新方法 | 子宫内膜异位症患者的组织样本 | 生物信息学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序，批量转录组测序，免疫组织化学 | 随机森林 | 基因表达数据，图像数据 | GEO公共数据库中的样本，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 628 | 2025-10-06 |
TIME-CoExpress: Temporal Trajectory Modeling of Dynamic Gene Co-expression Patterns Using Single-Cell Transcriptomics Data
2025-Jan-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.23.634392
PMID:39896591
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研究论文 | 提出一种基于copula的方法来建模单细胞转录组数据中基因共表达模式沿细胞时间轨迹的非线性变化 | 使用数据驱动的平滑函数建模基因共表达的非线性变化，能够处理scRNAseq数据中的过度离散和零膨胀特征 | 仅通过模拟分析和单个数据集验证方法性能，需要更多真实数据验证 | 开发时序轨迹建模方法以识别细胞发育过程中差异共表达的基因组合 | 单细胞转录组数据中的基因共表达模式 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | copula模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 629 | 2025-10-06 |
SeqBMC: Single-cell data processing using iterative block matrix completion algorithm based on matrix factorisation
2025 Jan-Dec, IET systems biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1049/syb2.70003
PMID:39943646
|
研究论文 | 提出基于矩阵分解的迭代块矩阵补全算法SeqBMC，用于处理单细胞RNA测序数据中的缺失值 | 使用基因频率对矩阵分块，通过矩阵分解算法完成分块后的小矩阵，同时保留块矩阵中可能存在的生物零值 | NA | 改进单细胞RNA测序数据中基因表达矩阵的缺失值补全方法 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达矩阵 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 矩阵分解算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 630 | 2025-10-06 |
Analysis of the Relationship Between NLRP3 and Alzheimer's Disease in Oligodendrocytes based on Bioinformatics and In Vitro Experiments
2025, Current Alzheimer research
IF:1.8Q4
|
研究论文 | 通过生物信息学分析和体外实验验证NLRP3在少突胶质细胞中与阿尔茨海默病的关联 | 首次结合生物信息学与分子生物学实验系统研究NLRP3在少突胶质细胞中与AD的关联，并构建了基于五个关键基因的诊断模型 | 研究主要基于公共数据库数据，需要进一步在体实验验证 | 探索NLRP3在少突胶质细胞中与阿尔茨海默病的潜在关联 | 阿尔茨海默病患者与健康对照的基因表达数据，少突胶质细胞 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 生物信息学分析，单细胞转录组学，RT-qPCR，免疫荧光，Western blot | LASSO回归，随机森林，支持向量机 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的AD相关公共数据集 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 631 | 2025-10-06 |
scRSSL: Residual semi-supervised learning with deep generative models to automatically identify cell types
2025 Jan-Dec, IET systems biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1049/syb2.12107
PMID:40261690
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研究论文 | 提出基于残差半监督学习的深度生成模型scRSSL，用于自动识别单细胞转录组数据中的细胞类型 | 首次将残差网络引入半监督生成模型，通过残差神经网络提取单细胞数据的局部特征 | NA | 解决单细胞数据高维度、大样本量、高稀疏性和样本不平衡等挑战，实现准确的细胞类型识别 | 单细胞转录组测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度残差生成模型, 半监督学习 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 632 | 2025-10-06 |
SAE1 May Play a Pro-Carcinogenic Role in Pancreatic Adenocarcinoma: A Comprehensive Study Integrating Multiple Pieces of Evidence
2025 Jan-Dec, IET systems biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1049/syb2.70017
PMID:40302186
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研究论文 | 本研究通过整合多种证据探讨SAE1在胰腺腺癌中的促癌作用 | 首次在胰腺腺癌中系统研究SAE1的作用，整合了mRNA数据、免疫组化、CRISPR修饰细胞系分析和单细胞RNA测序等多种方法 | 未明确说明样本量大小和研究人群特征 | 评估SAE1在胰腺腺癌发生发展中的作用机制 | 胰腺腺癌细胞系和临床样本 | 癌症生物学 | 胰腺癌 | mRNA分析,免疫组化,CRISPR,单细胞RNA测序,ChIP-Seq,分子对接 | 分子对接模型 | mRNA数据,蛋白质表达数据,单细胞测序数据,临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,ChIP-Seq | NA | NA |
| 633 | 2025-10-06 |
Exploring Key Genes of Glutathione Metabolism in Systemic Lupus Erythematosus Based on Mendelian Randomisation, Single-Cell RNA Sequencing and Multiple Machine Learning Approaches
2025 Jan-Dec, IET systems biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1049/syb2.70021
PMID:40458850
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研究论文 | 通过孟德尔随机化、单细胞RNA测序和多种机器学习方法探索系统性红斑狼疮中谷胱甘肽代谢的关键基因 | 首次整合孟德尔随机化、单细胞RNA测序和多种机器学习方法系统性研究谷胱甘肽代谢在系统性红斑狼疮中的作用 | NA | 识别与系统性红斑狼疮相关的关键代谢物和基因，揭示谷胱甘肽通路的作用机制 | 系统性红斑狼疮患者的外周血单个核细胞和单核细胞 | 生物信息学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 机器学习 | LASSO回归, CatBoost, XGBoost, NGBoost | 基因表达数据, 代谢组数据 | 多个数据集（包括训练集、验证集和GSE112087数据集） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 634 | 2025-10-06 |
Machine learning combining external validation to explore the immunopathogenesis of diabetic foot ulcer and predict therapeutic drugs
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0328906
PMID:40749079
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研究论文 | 本研究结合机器学习和单细胞方法探索糖尿病足溃疡的免疫发病机制并预测治疗药物 | 首次通过机器学习算法结合外部验证和单细胞测序识别糖尿病足溃疡的核心基因和潜在治疗药物 | 研究依赖公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 探索糖尿病足溃疡的免疫机制并识别潜在治疗药物 | 糖尿病足溃疡患者 | 机器学习 | 糖尿病足溃疡 | 单细胞测序, 差异表达分析, 加权基因共表达网络分析, 分子对接, 分子动力学模拟 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | GEO数据库数据集，包含外部验证数据集GSE147890 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 635 | 2025-10-06 |
Uncovering the molecular mechanisms of Qingdu Zengye Decoction in the treatment of nasopharyngeal carcinoma: an integrative investigation
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1648294
PMID:40746726
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研究论文 | 通过整合计算药理学、功能实验和单细胞转录组分析揭示清毒增液汤治疗鼻咽癌的分子机制 | 首次结合网络药理学、分子对接和单细胞RNA测序技术系统阐明清毒增液汤在鼻咽癌治疗中的多靶点调控机制 | 未明确说明样本量大小，机制研究主要基于体外实验 | 阐明清毒增液汤治疗鼻咽癌的作用机制 | 鼻咽癌肿瘤细胞和肿瘤微环境 | 计算生物学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序,网络药理学,分子对接,蛋白质印迹,功能实验 | NA | 转录组数据,蛋白质相互作用数据,分子对接数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 636 | 2025-10-06 |
Epiplakin expression is lost in psoriatic skin lesions and is downregulated by IFN-γ in ex vivo skin cultures
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1617737
PMID:40746860
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫荧光分析发现epiplakin在银屑病皮损中特异性下调，并证实IFN-γ是其下调的主要调控因子 | 首次发现epiplakin是plakin家族中唯一在银屑病皮损中特异性下调的成员，并揭示IFN-γ依赖的调控机制 | 研究主要基于外植体皮肤培养和小鼠模型，需要进一步在人体内验证 | 探究epiplakin在炎症性皮肤病银屑病中的表达调控机制 | 人类银屑病皮肤样本、健康皮肤样本、小鼠表皮 | 皮肤病学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光, 细胞因子处理 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | 银屑病和健康皮肤样本（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 637 | 2025-10-06 |
Exploring the prognostic significance and therapeutic potential of SUCLG2 in prostate cancer
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1592779
PMID:40747103
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研究论文 | 本研究构建了基于脂质代谢的前列腺癌风险模型，并探讨了SUCLG2在肿瘤进展和治疗抵抗中的关键作用 | 首次从脂质代谢角度构建16基因风险预后模型，并发现SUCLG2在管腔和基底/中间细胞亚群中的特异性富集 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证仅限于细胞系和部分临床样本 | 开发前列腺癌有效诊断和治疗策略，探索SUCLG2作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 前列腺癌患者样本（497例TCGA数据）和前列腺癌上皮细胞系22Rv1 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 高通量RNA测序、单细胞RNA测序、实时定量PCR、免疫荧光 | Cox比例风险回归、LASSO回归、基因集富集分析 | RNA测序数据、单细胞测序数据、临床样本数据 | 497例前列腺癌样本和22Rv1细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 638 | 2025-10-06 |
Transcriptome combined single-cell sequencing explores molecular mechanisms of ANGPTL4 in sepsis-induced acute lung injury
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0328551
PMID:40743234
|
研究论文 | 本研究通过转录组分析结合单细胞测序探索ANGPTL4在脓毒症诱导的急性肺损伤中的分子机制 | 首次系统分析ANGPTL4在急性肺损伤进展中的时空表达模式和功能网络，并预测其与药物的相互作用 | ANGPTL4与Q9BY76-槲皮素的相互作用需要进一步研究验证 | 探索ANGPTL4在脓毒症诱导的急性肺损伤中的分子机制 | 急性肺损伤患者和小鼠模型 | 单细胞测序 | 急性肺损伤 | 转录组分析, 单细胞测序, 分子对接 | NA | 基因表达数据 | 从GEO数据库获取的急性肺损伤患者数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 639 | 2025-10-06 |
Integrating single-cell regulatory atlas and multi-omics data for differential treatment response and multimodal predictive modeling in CDK 4/6 inhibitor-treated breast cancer
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1585574
PMID:40746611
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研究论文 | 整合单细胞调控图谱和多组学数据，开发CDK4/6抑制剂治疗乳腺癌的差异治疗反应预测模型 | 首次构建肿瘤预后调控子指数(TPRI)作为CDK4/6抑制剂反应预测的新型生物标志物，并通过多组学整合和实验验证 | 甲基化数据整合的样本量有限 | 解码CDK4/6抑制剂耐药机制并开发预测性生物标志物 | HR+/HER2-乳腺癌患者 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA-seq, 多组学分析, qPCR, SCENIC, 逻辑回归 | 逻辑回归, 多模态预测模型 | 基因表达数据, 转录组数据, miRNA数据 | 单细胞数据14个样本, 批量多组学数据1149个样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量多组学 | NA | NA |
| 640 | 2025-10-06 |
"Molecular pigeon" network of lncRNA and miRNA: decoding metabolic reprogramming in patients with lung cancer
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1578927
PMID:40746614
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综述 | 本文综述了lncRNA和miRNA在肺癌患者代谢重编程中的关键作用及其分子调控网络 | 提出'分子信鸽'网络概念，系统阐述lncRNA-miRNA网络通过竞争性内源RNA机制调控肺癌代谢重编程的新机制 | NA | 解析lncRNA和miRNA在肺癌代谢重编程中的调控网络，为肺癌靶向治疗提供新见解 | 肺癌患者中的长链非编码RNA和微小RNA | 分子生物学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |