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当前共找到 2164 篇文献，本页显示第 581 - 600 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 581 | 2025-11-06 |
The effects of cryopreservation on PBMCs transcriptome profile
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1690316
PMID:41181136
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研究论文 | 本研究评估了优化冷冻保存程序对外周血单个核细胞转录组特征的影响 | 首次使用单细胞RNA测序技术系统评估长期冷冻保存对PBMC转录组的影响 | 仅评估了6个月和12个月两个时间点，未涵盖更短或更长的保存时间 | 评估优化冷冻保存程序对PBMC细胞活性和转录组特征的影响 | 外周血单个核细胞 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序，流式细胞术，台盼蓝染色，碘化丙啶染色 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 冷冻保存6个月和12个月的PBMC样本，与新鲜细胞对比 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 582 | 2025-11-06 |
B cell subpopulations and their role in the pathogenesis of primary Sjögren's syndrome: insights from single-cell RNA sequencing
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1665086
PMID:41181153
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析原发性干燥综合征患者B细胞亚群及其在疾病发病机制中的作用 | 首次在pSS中通过单细胞RNA测序系统鉴定B细胞亚群，揭示I型干扰素信号通路、BCR克隆性改变和异常基因使用在发病机制中的关键作用 | 样本量较小（3例pSS患者和3例健康对照），需要在更大队列中验证发现 | 探讨B细胞在原发性干燥综合征发病机制中的潜在作用 | 原发性干燥综合征患者和健康对照者的外周血单个核细胞 | 单细胞转录组学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序，qRT-PCR，GO和KEGG通路富集分析，转录因子分析，拟时序分析，细胞通讯分析，BCR repertoire分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 单细胞测序：3例pSS患者和3例健康对照；qRT-PCR验证：22例pSS患者和22例健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 583 | 2025-11-06 |
Comprehensive analysis of single-cell and bulk transcriptomes reveals key B-cell genes and immune microenvironment regulation in bladder cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1600254
PMID:41181151
|
研究论文 | 通过单细胞和批量转录组分析揭示膀胱癌中B细胞关键基因及免疫微环境调控机制 | 首次结合单细胞RNA测序和批量RNA测序系统鉴定膀胱癌B细胞亚型的关键预后基因 | 样本量有限（8例患者肿瘤样本和4例正常样本） | 探索膀胱癌B细胞关键基因及其在肿瘤免疫微环境中的调控作用 | 膀胱癌患者的肿瘤组织和正常组织 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 体外实验验证 | 多组学分析 | 转录组数据 | 8例膀胱癌患者肿瘤样本和4例正常样本，共84,967个细胞（其中10,967个B细胞） | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 584 | 2025-11-06 |
Lactylation-Related Gene CALM1 Promotes Aortic Dissection via Immune Microenvironment Remodeling: Insights from Bioinformatics and Clinical Evidence
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S539938
PMID:41181366
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和临床证据揭示了乳酰化相关基因CALM1通过免疫微环境重塑促进主动脉夹层发生 | 首次系统研究乳酰化相关基因在主动脉夹层中的作用，发现CALM1可作为AD诊断的潜在生物标志物 | 仅验证了CALM1在临床样本中的表达差异，PARP1和PTBP1未显示显著差异 | 探讨乳酰化相关基因在主动脉夹层发病机制中的作用 | 主动脉夹层患者和健康个体的主动脉组织 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞测序，生物信息学分析 | NA | 基因表达数据，单细胞测序数据 | 两个AD相关数据集(GSE 52093和GSE 98770)及临床样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 585 | 2025-11-06 |
Gastric metastasis of renal cell carcinoma: features, mechanisms, and insights from existing literature
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1656858
PMID:41181710
|
综述 | 本文综述肾细胞癌胃转移的临床特征、分子机制及治疗策略 | 整合多组学与单细胞测序技术解析器官特异性转移机制 | 基于回顾性病例系列数据，缺乏前瞻性研究验证 | 探讨肾细胞癌胃转移的病理机制与临床管理策略 | 肾细胞癌胃转移患者 | 肿瘤学 | 肾细胞癌 | 单细胞测序、多组学分析 | NA | 临床病例数据 | 多中心病例系列（发病率0.2%-0.8%） | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 586 | 2025-11-05 |
Combined statistical-biophysical modeling links ion channel genes to physiology of cortical neuron types
2025-Jan-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.02.530774
PMID:39803528
|
研究论文 | 开发了一种结合统计和生物物理模型的混合方法，从基因表达模式预测皮层神经元类型的电生理活动 | 首次将统计模型与基于Hodgkin-Huxley的生物物理模型相结合，通过可解释的稀疏线性回归模型将离子通道基因表达与生物物理模型参数直接关联 | 面临数学模型与实验数据不匹配的挑战，模型验证依赖于多模态Patch-seq数据的质量和完整性 | 建立基因表达与皮层神经元类型生理特性之间的联系机制 | 多种皮层细胞类型的神经元 | 计算神经科学 | NA | 单细胞转录组学, Patch-seq, 模拟推理 | Hodgkin-Huxley模型, 稀疏线性回归模型 | 多模态电生理和基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 587 | 2025-11-04 |
Construction of a prognostic prediction model for concurrent radiotherapy in cervical cancer using GEO and TCGA databases with preliminary validation analysis
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0334281
PMID:41171827
|
研究论文 | 利用GEO和TCGA数据库构建宫颈癌同步放疗预后预测模型并进行初步验证分析 | 首次整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，识别出MPP5、SNX7、LSM12和GALNT3四个与放疗敏感性相关的关键基因并构建预后预测模型 | 研究样本量相对有限，需要更大规模的前瞻性研究进一步验证模型的临床适用性 | 开发宫颈癌同步放疗的预后预测模型，识别可靠的预后标志物 | 宫颈癌患者和相关的基因表达数据 | 生物信息学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 免疫组织化学 | Cox回归模型 | 基因表达数据, 临床数据 | 144例宫颈癌样本（来自TCGA数据库）和两个GEO数据集（GSE236738和GSE56363） | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 588 | 2025-11-04 |
In-Silico discovery of Pediatric Acute-Myeloid-Leukemia (pAML) causing druggable molecular signatures highlighting their pathogenetic processes and therapeutic agents through single-cell RNA-Seq profile analysis
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0335410
PMID:41171828
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析发现儿童急性髓系白血病的可靶向分子特征及其治疗药物 | 首次通过整合单细胞RNA测序数据识别pAML关键细胞类型和核心基因，并系统筛选潜在治疗药物 | 研究基于计算模拟和体外数据分析，需要进一步实验验证 | 发现儿童急性髓系白血病的致病分子特征和替代治疗药物 | 儿童急性髓系白血病患者和健康对照组的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 白血病 | 单细胞RNA测序，分子对接，分子动力学模拟 | PPI网络分析，调控网络分析，GSEA分析 | 单细胞RNA测序数据 | 两个数据集(GSE154109和GSE235923) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 589 | 2025-11-03 |
Integrated single-cell and bulk RNA sequencing analysis reveals ACACA as a potential prognostic and immunotherapeutic biomarker across cancers
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1599223
PMID:41169354
|
研究论文 | 通过整合单细胞和bulk RNA测序分析，揭示ACACA作为跨癌种潜在预后和免疫治疗生物标志物 | 首次在多癌种水平系统研究ACACA的表达模式及其与免疫微环境的关联 | 研究主要基于公共数据库数据，实验验证仅限于肺癌和肉瘤细胞 | 探索ACACA在癌症中的多组学特征和免疫学意义 | 多种癌症类型（重点关注肺癌和肉瘤） | 生物信息学 | 多癌种（重点关注肺癌和肉瘤） | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,转录组学,蛋白质组学 | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据,临床数据 | TCGA、CPTAC、HPA和GEO数据库中的多癌种样本 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 590 | 2025-11-03 |
ADAM8 in macrophages exacerbates sepsis-induced cardiomyopathy by impeding efferocytosis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1654688
PMID:41169382
|
研究论文 | 本研究揭示了ADAM8在巨噬细胞中通过阻碍胞葬作用加剧脓毒症诱发的心肌病 | 首次发现ADAM8在脓毒症心肌病中调控巨噬细胞胞葬作用的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类临床样本中验证 | 探究ADAM8在脓毒症诱发心肌病中的具体作用机制 | 小鼠模型和RAW264.7巨噬细胞系 | 分子生物学 | 脓毒症心肌病 | 单细胞转录组测序，RNA转录组测序，免疫荧光 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据，蛋白质表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 591 | 2025-11-03 |
Multi-omics analysis and evidence of IL1R1 as a potential biomarker for diabetes-associated intervertebral disc degeneration
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1692185
PMID:41169383
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析鉴定IL1R1作为糖尿病相关椎间盘退变的潜在生物标志物 | 首次将IL1R1确立为连接2型糖尿病和椎间盘退变的关键分子桥梁，揭示了中性粒细胞介导的炎症机制 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步实验验证 | 探索2型糖尿病与椎间盘退变之间的共享分子机制 | 人类T2DM和IDD转录组数据集、糖尿病小鼠髓核组织 | 生物信息学 | 糖尿病相关椎间盘退变 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, 分子对接 | LASSO, 随机森林, 人工神经网络 | 转录组数据, 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 592 | 2025-11-03 |
Comprehensive analyses of single-cell and bulk RNA-seq reveal the biological and prognostic roles of BMP4 in pancreatic adenocarcinoma
2025, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2025.1686938
PMID:41169612
|
研究论文 | 通过单细胞和bulk RNA-seq综合分析BMP4在胰腺腺癌中的生物学功能和预后作用 | 首次系统揭示BMP4在胰腺癌中的代谢调控功能及其作为独立预后因子的价值 | BMP4对免疫细胞浸润的影响有限，其预后作用主要独立于免疫调节机制 | 探究BMP4在胰腺腺癌中的生物学功能和临床预后意义 | 胰腺腺癌患者样本和细胞 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 593 | 2025-11-03 |
Opportunities and challenges in the application of spatiotemporal transcriptomics in plant research
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1684057
PMID:41169728
|
综述 | 探讨时空转录组学技术在植物研究中的应用机遇与挑战 | 系统阐述空间转录组技术如何整合高通量转录组学与高分辨率组织成像，突破传统转录组学局限 | NA | 为系统揭示生命过程的时空调控提供理论和方法学支持 | 植物组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据，组织图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 594 | 2025-11-03 |
Research advances of the establishment and characterization of Helicobacter pylori infection animal models
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1683366
PMID:41170432
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综述 | 本文综述了幽门螺杆菌感染动物模型的建立与表征研究进展 | 探讨了空间转录组学在该领域的潜在应用，并系统总结了模型建立的关键要素 | 综述性文章，不包含原始实验数据 | 支持临床前研究，建立稳定可重复的动物模型以模拟人类感染和疾病进展 | 幽门螺杆菌感染动物模型 | NA | 胃部疾病 | 空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 595 | 2025-11-03 |
Multiplets in scRNA-seq data: Extent of the problem and efficacy of methods for removal
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0333687
PMID:41166377
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研究论文 | 评估单细胞RNA测序数据中多重捕获问题的普遍程度及现有检测方法的有效性 | 通过细胞哈希数据确定真实多重捕获率的下限，揭示常用启发式估计系统性低估问题，并提出改进的泊松模型 | 大多数数据集缺乏多重标记技术验证，研究者只能依赖有限的工具和启发式方法 | 评估单细胞RNA测序中多重捕获问题的严重性和现有检测方法的效能 | 公共可用的单细胞RNA测序数据集 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，细胞哈希技术 | 泊松模型 | 单细胞RNA测序数据 | 多个公共数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 液滴式单细胞RNA测序 |
| 596 | 2025-11-02 |
GTestimate: improving relative gene expression estimation in scRNA-seq using the Good-Turing estimator
2025-Jan-06, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giaf084
PMID:41159548
|
研究论文 | 提出基于Good-Turing估计器的单细胞RNA测序标准化方法GTestimate，用于改进基因相对表达量估计 | 首次将Good-Turing估计器应用于单细胞RNA测序标准化，并开发了新型细胞靶向PCR扩增方法(cta-seq)进行验证 | 未明确说明方法在特定细胞类型或实验条件下的适用性限制 | 改进单细胞RNA测序中的技术变异问题，提高基因相对表达量估计的准确性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, PCR扩增 | Good-Turing估计器 | 基因表达数据 | 4个示例数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 597 | 2025-11-02 |
Unsupervised multiscale clustering of single-cell transcriptomes to identify hierarchical structures of cell subtypes
2025-Jan-06, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giaf111
PMID:41066207
|
研究论文 | 开发了一种用于单细胞转录组数据的多尺度聚类方法，以识别细胞亚型的层次结构 | 提出构建稀疏细胞-细胞相关性网络的无监督多尺度聚类方法，能够在多个分辨率下识别新的细胞类型和亚型 | NA | 改进单细胞RNA测序数据中的细胞聚类方法，以揭示更精细的细胞景观结构 | 单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 多尺度聚类 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 598 | 2025-11-02 |
Integrated machine learning-based establishment of a prognostic model in multicenter cohorts for acute myeloid leukemia
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1649594
PMID:41164126
|
研究论文 | 本研究通过整合机器学习方法建立了急性髓系白血病的预后模型MLAPS | 使用10种机器学习算法的101个模型开发预后特征，并通过实验验证CD69在AML恶性进展中的作用 | NA | 评估白血病细胞相关基因的功能和预后意义 | 急性髓系白血病患者 | 机器学习 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | 集成机器学习模型 | 基因表达数据 | 多个独立队列验证 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 599 | 2025-11-02 |
Integrative modeling of malignant epithelial programs in EGFR-mutant LUAD via single-cell transcriptomics and multi-algorithm machine learning
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1661679
PMID:41164195
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研究论文 | 通过单细胞转录组学和多算法机器学习整合建模EGFR突变肺腺癌中的恶性上皮程序 | 在单细胞水平解析EGFR突变上皮细胞的恶性程序，开发了EGFRmERS预后评分系统并验证其优于现有模型，首次将PERP鉴定为关键功能基因 | 使用公开数据库数据，样本来源可能受限；功能验证仅限于体外实验 | 表征EGFR突变肺腺癌中恶性上皮细胞特征，开发预后预测模型 | EGFR突变肺腺癌患者样本中的恶性上皮细胞 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序，qRT-PCR，Transwell迁移/侵袭实验，集落形成实验 | inferCNV，k-means聚类，Monocle2，十种机器学习算法 | 单细胞转录组数据，批量转录组数据 | 多个独立队列的EGFR突变肺腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 600 | 2025-11-02 |
Integrative multi-omics reveals energy metabolism-related prognostic signatures and immunogenetic landscapes in lung adenocarcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1679464
PMID:41164190
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研究论文 | 本研究通过整合多组学方法开发了能量代谢相关预后模型，用于评估肺腺癌预后并揭示相关免疫遗传通路 | 首次结合孟德尔随机化和机器学习方法构建能量代谢相关基因的预后模型，并通过单细胞RNA测序揭示其在肿瘤微环境中的细胞特异性表达 | 研究样本量有限，需要更大规模的前瞻性研究验证模型的临床适用性 | 探索能量代谢相关基因在肺腺癌中的预后价值和免疫遗传机制 | 肺腺癌患者和细胞系 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 多组学整合分析, 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序, RT-qPCR | 随机生存森林机器学习算法 | 基因组数据, 转录组数据, 临床数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |