单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
41	2024-12-11	Left/right asymmetrically expressed ephrin and Flamingo proteins regulate lateralized axon growth in C. elegans 2025-Jan, Developmental biology IF:2.5Q2 DOI:10.1016/j.ydbio.2024.09.014 PMID:39341445	研究论文	研究揭示了在C. elegans神经系统中左右不对称表达的ephrin和Flamingo蛋白如何调控轴突生长的分子机制	首次发现ephrin蛋白EFN-2和Flamingo蛋白FMI-1在AIY神经元谱系中左右不对称表达，并协同调控轴突生长的左右不对称性	研究仅限于C. elegans神经系统，未探讨这些分子不对称性在其他物种中的作用	探讨左右不对称分子在神经系统中的表达及其功能后果	C. elegans神经系统的AIY神经元谱系中的ephrin和Flamingo蛋白	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	C. elegans的AIY神经元谱系
42	2024-12-11	Identification of cancer-associated fibrolast subtypes and distinctive role of MFAP5 in CT-detected extramural venous invasion in gastric cancer 2025-Jan, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2024.102188 PMID:39531783	研究论文	研究报告了MFAP5+癌症相关成纤维细胞（CAFs）在胃癌（GC）中通过调节乳酸化修饰促进CT检测到的壁外静脉侵犯（EMVI）的形成	首次揭示了MFAP5+ CAFs在胃癌中通过调节乳酸化修饰促进EMVI形成的作用，为胃癌的诊断和治疗提供了新的参考	研究样本量较小，仅涉及13名胃癌患者，可能影响结果的普适性	探讨癌症相关成纤维细胞在胃癌中的作用及其对壁外静脉侵犯的影响	胃癌患者的病理样本和癌症相关成纤维细胞	数字病理学	胃癌	单细胞测序、免疫组化、慢病毒敲低	NA	基因表达数据、图像	13名胃癌患者的病理样本
43	2024-12-11	Machine learning-derived natural killer cell signature predicts prognosis and therapeutic response in clear cell renal cell carcinoma 2025-Jan, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2024.102180 PMID:39536695	研究论文	本文通过整合多种机器学习算法，建立了一个与自然杀伤细胞相关的风险模型，用于预测透明细胞肾细胞癌患者的预后和治疗反应	本文创新性地整合了十种不同的机器学习算法，建立了包含18个基因的风险模型，能够准确预测透明细胞肾细胞癌患者的预后，并揭示了自然杀伤细胞与其他细胞亚群之间的复杂信号相互作用	本文主要基于TCGA和GEO数据库的数据进行分析，未涉及大规模的临床验证	研究自然杀伤细胞在透明细胞肾细胞癌中的作用，并建立预测患者预后和治疗反应的风险模型	透明细胞肾细胞癌患者的转录组数据、临床数据以及自然杀伤细胞的功能和表达模式	数字病理学	肾细胞癌	单细胞测序、qRT-PCR、IHC、CCK8检测、流式细胞术	Coxboost plus plsRcox	转录组数据	TCGA数据库中的透明细胞肾细胞癌转录组数据和临床数据，以及GEO数据库中的单细胞测序数据
44	2024-12-11	Pronounced early differentiation underlies zebra finch gonadal germ cell development 2025-Jan, Developmental biology IF:2.5Q2 DOI:10.1016/j.ydbio.2024.08.006 PMID:39214328	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术比较了鸡和斑胸草雀的生殖细胞发育差异	发现了斑胸草雀中存在两种早期生殖细胞类型，而鸡中只有一种，揭示了鸟类生殖细胞发育策略的多样性	研究仅限于鸡和斑胸草雀两种鸟类，其他鸟类的生殖细胞发育情况尚未涉及	探讨不同鸟类生殖细胞发育策略的差异，为基因编辑和生殖技术在其他鸟类中的应用提供依据	鸡和斑胸草雀的早期胚胎生殖细胞	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	鸡和斑胸草雀的早期胚胎生殖细胞样本
45	2024-12-10	Local ablation disrupts immune evasion in pancreatic cancer 2025-Jan-28, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2024.217327 PMID:39580047	研究论文	研究局部消融技术在胰腺癌中打破免疫逃逸的作用	首次探讨了局部消融技术在胰腺癌中激活宿主免疫系统并克服免疫治疗抵抗的潜力	研究主要基于小鼠模型和人类样本，需要进一步的临床试验验证	探讨局部消融技术在胰腺癌中的免疫调节作用及其与免疫治疗的协同效应	胰腺癌模型、人类胰腺癌样本	数字病理学	胰腺癌	局部消融技术	NA	空间转录组学、组织学技术	小鼠模型、人类样本
46	2024-12-09	Granuloma Annulare Exhibits Mixed Immune and Macrophage Polarization Profiles with Spatial Transcriptomics 2025-Jan, The Journal of investigative dermatology IF:5.7Q1 DOI:10.1016/j.jid.2024.04.024 PMID:38844128	研究论文	研究了环状肉芽肿（GA）的空间转录组学特征，揭示了其免疫和巨噬细胞极化的混合模式	首次使用空间转录组学技术分析GA的空间基因表达模式，揭示了GA微环境中T辅助1和T辅助2信号的混合特征以及M1和M2巨噬细胞的极化特性	研究样本量较小，仅涉及6名患者，可能影响结果的普遍性	通过空间转录组学技术深入理解环状肉芽肿（GA）的空间基因表达模式	环状肉芽肿（GA）患者的皮肤组织	数字病理学	皮肤疾病	空间转录组学	NA	基因表达数据	6名环状肉芽肿（GA）患者
47	2024-12-07	Neonatal inflammation impairs developmentally-associated microglia and promotes a highly reactive microglial subset 2025-Jan, Brain, behavior, and immunity DOI:10.1016/j.bbi.2024.09.019 PMID:39322088	研究论文	研究新生儿炎症对小鼠神经发育障碍模型中脑髓样细胞亚群的影响	通过单细胞RNA测序和流式细胞术，识别出表达补体受体C5ar1的特定微胶质细胞亚群，并发现其在炎症途径中高度激活	NA	探讨新生儿炎症对神经发育障碍中微胶质细胞发育轨迹的影响	小鼠神经发育障碍模型中的脑髓样细胞亚群	NA	神经发育障碍	单细胞RNA测序、流式细胞术	NA	RNA	小鼠模型
48	2024-12-05	Endothelial Angpt2 Promotes Adipocyte Progenitor Cells Maturation to Increase Visceral Adipose Tissue Accumulation 2025-Jan, Diabetes/metabolism research and reviews DOI:10.1002/dmrr.70012 PMID:39628006	研究论文	研究探讨了内皮细胞Angpt2在促进脂肪前体细胞成熟和内脏脂肪组织积累中的作用	揭示了JAK1/STAT3信号通路激活下内皮细胞分泌的Angpt2通过整合素-α5β1信号促进脂肪前体细胞从MSLN表型向CFD表型转变，从而促进内脏脂肪组织积累的新机制	研究样本量较小，且仅限于肥胖和糖尿病患者，可能影响结果的普适性	探究内脏脂肪组织积累的具体机制	内脏脂肪组织、内皮细胞、脂肪前体细胞	NA	肥胖	单细胞RNA测序(scRNAseq)、PCR、WB、免疫荧光染色、流式细胞术	NA	基因表达数据	13个内脏脂肪组织样本，来自5名肥胖和糖尿病患者、9名肥胖患者和1名正常BMI个体
49	2024-11-27	Droplet-Based Single-Cell 3' mRNA Sequencing of Marburg Virus-Infected Samples 2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) DOI:10.1007/978-1-0716-4256-6_27 PMID:39585636	研究论文	描述了一种基于液滴的单细胞3' mRNA测序方法，用于研究马尔堡病毒感染的样本	使用10× Chromium Next GEM单细胞基因组学技术，首次在体内研究马尔堡病毒感染的非人灵长类血液样本	研究在BSL-4实验室进行，操作复杂且需要严格的生物安全措施	揭示病毒与宿主相互作用的转录组复杂性	马尔堡病毒感染的单细胞样本	基因组学	NA	单细胞RNA测序	NA	mRNA	非人灵长类血液样本
50	2024-11-25	The impact of cathepsins on liver hepatocellular carcinoma: Insights from genetic and functional analyses 2025-Jan-30, Gene IF:2.6Q2 DOI:10.1016/j.gene.2024.149064 PMID:39486661	研究论文	研究探讨了组织蛋白酶E在肝细胞癌中的作用及其作为预后标志物和治疗靶点的潜力	首次系统研究了组织蛋白酶E在肝细胞癌中的作用，并揭示了其在细胞增殖和信号传导中的关键作用	研究主要基于体外实验和现有数据库分析，缺乏临床试验验证	探讨组织蛋白酶E在肝细胞癌中的作用及其作为预后标志物和治疗靶点的潜力	肝细胞癌及其相关组织蛋白酶E的表达和功能	数字病理学	肝癌	RNA测序、免疫组化分析、siRNA技术	NA	RNA	包括HepG2和Huh7细胞系在内的多个样本
51	2024-11-24	Using Callus as an Ex Vivo System for Chromatin Analysis 2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) DOI:10.1007/978-1-0716-4228-3_18 PMID:39576610	综述	本文综述了下一代测序技术在表观遗传学研究中的应用，并探讨了使用子叶衍生愈伤组织作为体外系统进行染色质分析的优势	本文提出了使用子叶衍生愈伤组织作为简单、易获取且稳健的平台，用于高通量多组学分析	本文未提及具体的实验数据或结果，主要集中在方法论的讨论上	探讨表观遗传机制的复杂性及其在基因调控中的作用	DNA甲基化和组蛋白修饰谱	表观遗传学	NA	下一代测序	NA	多组学数据	NA
52	2024-11-22	Microglia phagocytosis of PNNs mediates PV-positive interneuron dysfunction and associated gamma oscillations in neuroinflammation-induced cognitive impairment in mice 2025-Jan-01, Neuropharmacology IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.neuropharm.2024.110205 PMID:39489286	研究论文	研究探讨了神经炎症通过小胶质细胞吞噬PNNs导致PV阳性中间神经元功能障碍和相关γ振荡，从而引发小鼠认知障碍的机制	首次揭示了小胶质细胞吞噬PNNs在神经炎症诱导的认知障碍中的关键作用，并提出ApoE可能介导这一过程	研究主要集中在小鼠模型上，结果的普适性有待进一步验证	探讨神经炎症导致认知障碍的具体机制	小鼠的认知功能、神经振荡、小胶质细胞基因表达	神经科学	认知障碍	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	C57BL/6J小鼠和CX3CR1-CreERT2小鼠
53	2024-11-21	Spatial Transcriptomics in Inflammatory Skin Diseases Using GeoMx Digital Spatial Profiling: A Practical Guide for Applications in Dermatology 2025-Jan, JID innovations : skin science from molecules to population health DOI:10.1016/j.xjidi.2024.100317 PMID:39559817	研究论文	本文讨论了使用NanoString的GeoMx数字空间分析仪进行炎症性皮肤病空间转录组分析的技术和用户体验	提供了制造商指南中未包含的优化RNA捕获方法和潜在陷阱	NA	提供一个框架，帮助其他皮肤生物学研究人员使用数字空间分析技术	炎症性皮肤病，包括银屑病、扁平苔藓和盘状红斑狼疮	数字病理学	皮肤病	GeoMx数字空间分析	NA	转录组数据	具体样本数量未提及
54	2024-11-20	Research progress and the prospect of using single-cell sequencing technology to explore the characteristics of the tumor microenvironment 2025-Jan, Genes & diseases IF:6.9Q1 DOI:10.1016/j.gendis.2024.101239 PMID:39552788	综述	本文综述了单细胞测序技术在肿瘤微环境研究中的进展和应用前景	本文提出了单细胞多组学测序技术的整合，并探讨了其在生物研究和医学调查中的潜力	本文讨论了使用单细胞测序技术探索肿瘤微环境的优缺点	解决肿瘤内异质性问题，为精准癌症治疗提供支持	肿瘤微环境中的细胞异质性	数字病理学	NA	单细胞测序技术	NA	基因组和转录组数据	NA
55	2024-11-18	Dissection of Gene Expression at the Single-Cell Level: scRNA-seq 2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) DOI:10.1007/978-1-0716-4192-7_9 PMID:39546202	研究论文	本文讨论了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在基因表达研究中的应用	scRNA-seq技术能够以单细胞分辨率揭示基因表达特征，识别与疾病相关的新细胞类型	NA	深入理解基因表达的单细胞分辨率	单细胞RNA测序技术及其在基因表达研究中的应用	基因组学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	数千到数百万个转录本
56	2024-11-15	Analysis of the pluripotent and germline marker gene expression, and the state of X chromosome reactivation of primordial germ cells in pig gonads 2025-Jan-01, Theriogenology IF:2.4Q1 DOI:10.1016/j.theriogenology.2024.10.008 PMID:39413538	研究论文	研究分析了猪性腺原始生殖细胞（PGCs）的多能性和性染色体再激活状态	首次揭示了猪性腺PGCs的异质性，并鉴定了GDF3作为其特异性表面标记	NA	评估猪性腺PGCs的多能性状态、特定基因表达模式和性染色体再激活	猪性腺原始生殖细胞（PGCs）	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	NA
57	2024-11-09	ERP44 could serve as a bridge mediating prognosis and immunity for glioma via single-cell and bulk RNA-sequencing 2025-Jan-15, Gene IF:2.6Q2 DOI:10.1016/j.gene.2024.148963 PMID:39341519	研究论文	研究探讨了ERP44在胶质瘤中的作用及其对预后和免疫的影响	首次整合蛋白质组学、单细胞和批量RNA测序数据，研究ERP44在胶质瘤患者中的潜在功能	NA	探讨ERP44在胶质瘤中的作用及其对预后和免疫的影响	ERP44在胶质瘤中的表达及其对患者预后和免疫的影响	数字病理学	脑肿瘤	单细胞RNA测序 (scRNA-seq)，批量RNA测序，蛋白质组学	NA	RNA	使用了TCGA数据集、GSE50161、GSE4290以及qRT-PCR验证的数据
58	2024-11-08	High-throughput and multimodal profiling of antigen-specific T cells with a droplet-based cell-cell interaction screening platform 2025-Jan-01, Biosensors & bioelectronics IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.bios.2024.116815 PMID:39348735	研究论文	开发了一种基于液滴的细胞间相互作用筛选平台DropCCI，用于高通量和多模态分析抗原特异性T细胞	提出了DropCCI方法，通过液滴封装DNA条码和抗原负载的抗原呈递细胞，结合点击化学修饰的T细胞，实现了高通量、无污染的多模态分析	NA	开发一种新的策略，用于高通量和多模态分析抗原特异性T细胞，以改进T细胞免疫疗法的设计	抗原特异性T细胞	生物技术	NA	点击化学	NA	单细胞组学数据	NA
59	2024-10-24	High-throughput single-cell sequencing of activated sludge microbiome 2025-Jan, Environmental science and ecotechnology IF:14.0Q1 DOI:10.1016/j.ese.2024.100493 PMID:39430728	研究论文	研究通过高通量单细胞测序技术分析了活性污泥微生物群落，揭示了微生物群落中的基因组异质性和潜在的新物种	首次应用高通量单细胞测序技术分析活性污泥微生物群落，揭示了微生物暗物质的存在，并发现了大量的抗生素抗性基因、质粒片段和噬菌体基因组	研究主要集中在活性污泥微生物群落，未涉及其他环境中的微生物群落	探索活性污泥微生物群落的基因组异质性，揭示微生物暗物质和水平基因转移过程	活性污泥微生物群落	生物技术	NA	单细胞测序	NA	基因组	15,110个单细胞
60	2024-10-21	Expression Cloning of Antibodies from Single Human B Cells 2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) DOI:10.1007/978-1-0716-4188-0_5 PMID:39424722	研究论文	本文描述了一种从单个人类B细胞中克隆抗体的策略	该方法能够在单细胞水平上无偏差地表征人类抗体库，并通过RT-PCR技术生成重组单克隆抗体	NA	研究B细胞淋巴瘤的克隆进化和抗体反应性	人类B细胞及其抗体反应性	NA	淋巴瘤	RT-PCR	NA	NA	单个人类B细胞