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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
41 2025-12-13
Integrated Multi-Omic Analysis Reveals Causal Relationships and Causal Mechanisms of Peripheral Lymphocyte-Driven Remodeling in the Intrahepatic Immune Microenvironment of Early-Stage MAFLD
2025, Journal of inflammation research IF:4.2Q2
研究论文 本研究通过整合孟德尔随机化、批量RNA测序和单细胞RNA测序分析,揭示了外周淋巴细胞通过Cd5介导的炎症通路和Vcam1-Itgb1粘附通路驱动早期MAFLD肝内免疫微环境重塑的因果关系和机制 首次利用孟德尔随机化建立了外周淋巴细胞与MAFLD风险的单向因果关系,并通过单细胞RNA测序在MAFLD模型中鉴定出新的Itgb1⁺Cd5⁺Cd4⁺T细胞亚群及其与肝内Vcam1highMmp12⁺Kupffer细胞的相互作用机制 研究主要基于小鼠模型和公共数据集,需要在更大规模的人类队列中进行验证;因果关系推断依赖于孟德尔随机化假设 探究外周血细胞指标与早期MAFLD肝内免疫微环境重塑之间的因果关系和潜在机制 代谢功能障碍相关脂肪肝病(MAFLD)患者和小鼠模型 单细胞组学 代谢功能障碍相关脂肪肝病 孟德尔随机化分析,批量RNA测序,单细胞RNA测序 NA 基因组数据,转录组数据,单细胞转录组数据 小鼠模型和人类公共单细胞RNA测序数据集 NA 单细胞RNA测序,批量RNA测序 NA NA
42 2025-12-13
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Microglial Heterogeneity and Functional States After Cerebral Ischemia-Reperfusion Injury
2025, Journal of inflammation research IF:4.2Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了脑缺血再灌注损伤后小胶质细胞的异质性和功能状态 识别了七个转录特征不同的小胶质细胞亚群,并发现ATF3作为核心调控因子,将CH25H介导的代谢变化与细胞因子驱动的神经炎症联系起来 研究基于大鼠模型,结果向人类转化需进一步验证 分析缺血性卒中中小胶质细胞的异质性、激活轨迹和代谢状态,以发现治疗靶点 缺血性和对照大鼠的脑组织 单细胞组学 缺血性卒中 单细胞RNA测序, RT-qPCR, Western blot, 免疫组织化学 NA 单细胞RNA测序数据 未明确具体数量,但涉及缺血性和对照大鼠的脑组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
43 2025-12-12
Deciphering the Complexities of Pulmonary Hypertension: The Emergent Role of Single-Cell Omics
2025-Jan, American journal of respiratory cell and molecular biology IF:5.9Q1
综述 本文综述了单细胞组学技术在肺动脉高压研究中的应用,探讨了其如何推动对该疾病复杂性的理解 强调了单细胞转录组学在揭示肺动脉高压中细胞生态系统、识别新型治疗靶点以及通过连接组分析阐明细胞相互作用方面的创新作用 面临单细胞RNA测序分辨率需提升、人体组织样本处理存在物流障碍以及需要整合多种组学方法以全面理解疾病分子基础的挑战 探讨单细胞组学技术在肺动脉高压研究中的角色,以促进精准医疗目标的实现 肺动脉高压中的细胞类型,包括内皮细胞、平滑肌细胞、周细胞和免疫细胞 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
44 2025-12-11
Bypassing cisplatin resistance in Nrf2 hyperactivated head and neck cancer through effective PI3Kinase targeting
2025-Jan-16, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究评估了PI3K抑制剂在绕过Nrf2介导的顺铂耐药性中的疗效,通过体外和体内实验验证了gedatolisib在头颈鳞状细胞癌模型中的抗肿瘤活性 首次揭示PI3K-AKT-mTOR通路在Nrf2驱动的顺铂耐药头颈鳞状细胞癌中的关键作用,并证明PI3K抑制剂gedatolisib能通过激活自噬、衰老和破坏脂肪酸代谢来恢复耐药细胞对顺铂的敏感性 研究主要基于临床前模型(包括免疫缺陷和人源化小鼠模型),尚未进行临床试验验证 评估PI3K抑制剂在克服头颈鳞状细胞癌中Nrf2介导的顺铂耐药性的疗效 头颈鳞状细胞癌(HNSCC)细胞系和动物模型 肿瘤学 头颈鳞状细胞癌 转录组学、代谢组学、信号通路分析、shRNA筛选、空间转录组学 动物模型(皮下、原位和转移性异种移植模型) 基因表达数据、代谢数据、信号通路数据 未明确指定具体样本数量,涉及多种体外和体内模型 NA NA NA NA
45 2025-12-11
MEF2C is a Potential Prognostic Biomarker and is Correlated with Immune Infiltrates in Lung Adenocarcinoma
2025, Current medicinal chemistry IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过生物信息学分析和实验验证,探讨了MEF2C在肺腺癌中的表达、预后价值及其与免疫浸润的关联 首次系统性地研究了MEF2C在泛癌及肺腺癌中的表达模式,并揭示了其与免疫细胞浸润、免疫检查点基因、肿瘤突变负荷及药物敏感性的相关性 研究主要基于TCGA数据库的生物信息学分析,实验验证部分相对有限,需要更多体内外实验进一步证实 探究MEF2C在肺腺癌中的生物学功能、预后价值及其作为免疫治疗靶点的潜力 肺腺癌患者样本、肺腺癌细胞系 生物信息学 肺腺癌 生物信息学分析、单细胞测序、qRT-PCR NA 基因表达数据、临床数据、单细胞测序数据 TCGA数据库中的肺腺癌样本及多种癌症样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
46 2025-12-11
Multiple Machine Learning Models, Molecular Subtyping and Singlecell Analysis Identify PANoptosis-related Core Genes and their Association with Subtypes in Crohn's Disease
2025, Current medicinal chemistry IF:3.5Q2
研究论文 本研究首次构建了克罗恩病(CD)的PANoptosis特征,并探讨了其与疾病亚型及免疫机制的关系 首次将PANoptosis与克罗恩病关联,并利用多种机器学习算法和单细胞分析构建了PANoptosis特征基因签名 未明确说明样本来源的具体平台细节,且研究基于现有数据集,可能需要进一步实验验证 探究PANoptosis在克罗恩病中的作用机制及其与疾病亚型的关联 克罗恩病患者的数据集 机器学习 克罗恩病 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) LASSO, SVM, 随机森林, 决策树, 高斯混合模型 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
47 2025-12-11
Analyzing and Validating the Role of Genes Related to Glucagon-like Peptide-1 Signaling in the Prognosis of Pancreatic Cancer
2025, Current medicinal chemistry IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过分析GLP-1信号相关基因在胰腺癌中的表达和突变,开发了一个基于3个基因的RiskScore模型,用于评估胰腺癌预后,并验证了其预测准确性 首次将GLP-1信号通路基因与胰腺癌预后模型结合,开发了一个独立的RiskScore模型,并通过单细胞RNA-seq和免疫浸润分析揭示了其生物学机制 研究基于公共数据库的回顾性数据,需要前瞻性临床研究进一步验证模型的普适性和临床应用价值 开发一个可靠的基于GLP-1信号的预后工具,以指导胰腺癌的治疗 胰腺癌患者 生物信息学 胰腺癌 bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq (scRNA-seq) LASSO回归, Cox回归, RiskScore模型, nomogram模型 RNA-seq数据 来自UCSCXena和GEO数据库的胰腺癌患者样本,包括GSE156405队列用于单细胞分析 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
48 2025-12-11
Machine Learning-based Gene Biomarker Identification for Improving Prognosis and Therapy in Hepatocellular Carcinoma
2025, Current medicinal chemistry IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过整合基因表达数据、机器学习算法、肿瘤微环境分析和药物敏感性分析,识别了肝细胞癌(HCC)的七个关键基因生物标志物,并开发了HCC预后相关指数(HPRI)以改善预后和治疗指导 结合101种统计模型的机器学习算法筛选关键基因,并首次开发基于这些基因的HPRI指数,同时通过单细胞测序分析揭示基因在恶性细胞和成纤维细胞中的表达模式 研究依赖于公开数据库(ICGC、GEO、TCGA)的回顾性数据,未进行前瞻性临床验证,且样本异质性可能影响结果的普适性 识别肝细胞癌的分子生物标志物以改善预后预测和治疗指导 肝细胞癌患者及其基因表达数据 机器学习 肝细胞癌 单细胞测序分析、Cox回归分析、差异表达分析 机器学习算法(包括101种统计模型) 基因表达数据和临床病理信息 多个队列(来自ICGC、GEO、TCGA数据库),具体样本数量未明确说明 NA 单细胞测序 NA NA
49 2025-12-11
Single-Cell RNA Analysis Reveals Aberrant Expression of Immune-Related Genes and Transcriptional Regulation of NK Cells in Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2025, Critical reviews in immunology IF:0.8Q4
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序数据分析,揭示了慢性阻塞性肺疾病(COPD)中自然杀伤(NK)细胞的异常表达及其转录调控机制 首次结合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,系统分析了COPD患者肺组织中NK细胞的免疫相关基因表达谱,并识别出EGR1、JUN和FOS等关键转录因子,提出了钙信号和TGF-β/Smad通路可能参与调控的新机制 研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证;样本来源和数量未明确说明;机制推测需要进一步功能实验证实 探究慢性阻塞性肺疾病(COPD)中NK细胞的免疫相关基因表达特征及其转录调控机制 COPD患者的肺组织样本(通过支气管镜活检获取) 生物信息学 慢性阻塞性肺疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq),批量RNA测序(bulk RNA-seq) 生物信息学分析流程(包括AUCell包、基因集富集分析、PPI网络分析等) RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq NA NA
50 2025-12-11
Metabolic reprogramming and M2 macrophage depletion define the microenvironment of adenomyosis
2025, Frontiers in endocrinology IF:3.9Q2
研究论文 本研究通过分析转录组数据,揭示了子宫腺肌症患者子宫内膜中代谢重编程和M2巨噬细胞减少的微环境特征,并确定了硫酸角质素生物合成失调的核心作用 首次将硫酸角质素生物合成失调与M2巨噬细胞减少及免疫代谢失衡联系起来,为子宫腺肌症的发病机制提供了新的分子机制见解 研究主要基于公开数据集和体外验证,样本量相对有限,且缺乏体内功能实验验证 阐明子宫腺肌症患者子宫内膜的代谢重编程和免疫失调机制,并识别潜在的治疗靶点或诊断标志物 子宫腺肌症患者的子宫内膜组织样本 数字病理学 子宫腺肌症 微阵列、bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq、RT-qPCR、免疫荧光染色 NA 转录组数据、单细胞数据 微阵列数据:3例腺肌症 vs 5例对照;bulk RNA-seq数据:6例腺肌症 vs 15例对照;单细胞RNA-seq数据:63名捐赠者的子宫内膜样本 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
51 2025-12-11
TREM2 Deficiency Regulates Macrophage Apoptosis and Repair in Radiation-Induced Skin Injury
2025, Research (Washington, D.C.)
研究论文 本研究揭示了TREM2在辐射诱导皮肤损伤中调控巨噬细胞凋亡与修复的新机制 首次发现辐射通过ROS-NRF2-ADAM17轴导致TREM2蛋白脱落,并鉴定出ROS-NRF2-ADAM17-TREM2-ERK这一新的调控级联通路 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体组织中进行验证 阐明TREM2在辐射诱导皮肤损伤中调控巨噬细胞功能的分子机制 巨噬细胞、辐射诱导皮肤损伤小鼠模型 单细胞组学 皮肤损伤 单细胞RNA测序 条件性基因敲除小鼠模型 单细胞转录组数据 未明确说明具体样本数量 NA 单细胞RNA-seq NA NA
52 2025-12-11
Telomere Length and Clear Cell Renal Cell Carcinoma: Unraveling Causal Mechanisms Through Integrative Genetic and Single-Cell Transcriptomic Analysis
2025, Mediators of inflammation IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过整合遗传流行病学和单细胞转录组学,探讨了端粒长度与透明细胞肾细胞癌风险之间的因果关系及其分子机制 首次采用多队列遗传学方法结合单细胞RNA测序,系统揭示了端粒长度与ccRCC风险的因果关联,并发现了近端肾小管细胞中端粒酶相关基因的复杂衰老动态 研究主要基于欧洲人群的遗传数据,可能限制了结果在其他人群中的普适性;单细胞测序样本量相对较小 探究端粒长度与透明细胞肾细胞癌发病风险之间的因果关系及潜在分子机制 透明细胞肾细胞癌患者及健康对照人群 生物信息学 肾癌 孟德尔随机化分析、多变量MR、共定位分析、单细胞RNA测序 逆方差加权法、多变量MR模型 遗传数据、单细胞转录组数据 发现队列472,174人(UK Biobank),验证队列438,351人(GWAS Catalog) NA 单细胞RNA-seq NA NA
53 2025-12-11
Changes in Nucleus Pulposus Cell Atlas and the Role of SPP1 During Intervertebral Disc Degeneration: Single-Cell Sequencing Analysis
2025, Mediators of inflammation IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了椎间盘退变过程中髓核细胞的异质性变化,并发现SPP1在退变中的关键作用 首次在同一患者的椎间盘退变不同阶段应用单细胞测序技术,识别了六个髓核亚群和免疫细胞,并验证了SPP1作为退变关键分子的功能 研究样本可能有限,且动物和体外模型可能无法完全模拟人类椎间盘退变的复杂性 阐明椎间盘退变过程中髓核细胞的异质性及其分子机制 人类髓核细胞、大鼠椎间盘退变模型及体外人类髓核细胞退化模型 单细胞测序 椎间盘退变 单细胞RNA测序 Seurat包用于无监督聚类,UMAP用于可视化 基因表达谱数据 未明确指定样本数量,但涉及同一患者不同退变阶段的髓核样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
54 2025-12-11
Yang-deficiency constitution drives poor outcomes in clear cell renal cell carcinoma by modulating the tumour immune microenvironment
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究探讨了中医阳虚体质如何通过调节肿瘤免疫微环境影响肾透明细胞癌的预后 首次将中医体质学说(阳虚体质)与肾透明细胞癌的免疫微环境及预后联系起来,并整合了多组学数据与机器学习方法,提出了一个基于体质的生物标志物发现和中药筛选框架 研究样本量有限,特别是阳虚体质分类的个体数量较少;单细胞RNA-seq数据仅来自少数样本;需要进一步的体内外实验验证 阐明阳虚体质对肾透明细胞癌免疫景观和临床结局的影响,并识别新的预后生物标志物和潜在的中药治疗剂 肾透明细胞癌患者、中医阳虚体质分类个体、外周血单个核细胞、肿瘤组织 生物信息学, 计算生物学 肾透明细胞癌 转录组测序, 单细胞RNA测序, 差异表达分析, WGCNA, 机器学习生存建模, ESTIMATE, CIBERSORT, CellChat, GSVA, 分子对接 机器学习生存模型 转录组数据, 单细胞RNA-seq数据 12名阳虚体质分类个体, 530名肾透明细胞癌患者, 1个PBMC样本, 2个ccRCC肿瘤样本 NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
55 2025-12-11
Deciphering the let-7c-5p/RRM2 axis in lung adenocarcinoma: expression, prognosis, and immune landscape implications
2025, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 本研究探讨了RRM2在肺腺癌中的表达模式、临床意义及调控机制,并揭示了let-7c-5p/RRM2轴在肿瘤进展和免疫微环境中的作用 首次系统性地阐明了let-7c-5p作为RRM2上游调控因子在肺腺癌中的作用,并揭示了RRM2与免疫细胞浸润的相关性 研究主要基于公共数据库和体外实验,缺乏体内实验验证,且临床样本的多样性可能受限 阐明RRM2在肺腺癌中的表达模式、临床意义、调控机制及其在肿瘤免疫微环境中的作用 肺腺癌组织、正常肺组织、肺腺癌细胞系 生物信息学 肺癌 单细胞RNA测序、体外细胞实验、生物信息学分析 NA 基因表达数据、临床数据、单细胞RNA测序数据 基于公共数据库(如TCGA)的肺腺癌和正常组织样本,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
56 2025-12-11
Integrated Genomic and Functional Characterization of Palmitoylation in Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2025, Human mutation IF:3.3Q2
研究论文 本研究通过整合多组学数据与机器学习算法,构建了基于棕榈酰化相关基因的预后模型,揭示了其在透明细胞肾细胞癌预后分层和免疫治疗预测中的价值,并实验验证了关键基因ZDHHC18的促癌功能 首次系统性地将棕榈酰化修饰与ccRCC的预后和免疫治疗反应相关联,并整合101种机器学习算法构建稳健的预后模型,同时通过单细胞测序解析肿瘤微环境异质性 研究主要基于公共数据集,需要更多独立队列验证;实验验证仅针对ZDHHC18基因,其他模型基因的功能有待进一步探索 探究棕榈酰化修饰在透明细胞肾细胞癌中的预后价值和免疫治疗预测作用 透明细胞肾细胞癌患者的多组学数据、肿瘤细胞系(786-O和Caki-1) 生物信息学 肾细胞癌 单细胞RNA测序、基因组分析(TMB、CNV)、机器学习算法整合 集成101种机器学习算法的预后模型 基因组数据、转录组数据、单细胞测序数据 多个公共ccRCC数据集(具体样本数未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
57 2025-12-11
TLR4 Induces PANoptosis in Annulus Fibrosus Cells by Activating NLRP12 in Intervertebral Disc Degeneration
2025, Journal of inflammation research IF:4.2Q2
研究论文 本研究揭示了TLR4通过激活NLRP12诱导纤维环细胞发生PANoptosis,从而推动椎间盘退变进程 首次在纤维环细胞中鉴定出PANoptosis的发生,并阐明了TLR4-NLRP12轴在这一过程中的调控作用 研究主要基于细胞和动物模型,其结论在人体中的普适性有待进一步验证 探究TLR4-NLRP12轴如何调控纤维环细胞的PANoptosis并影响椎间盘退变进展 纤维环细胞、大鼠椎间盘退变模型 单细胞组学 椎间盘退变 单细胞RNA测序、Western blot、TUNEL染色、流式细胞术、X射线成像、组织学分析 NA 单细胞转录组数据、蛋白质印迹数据、成像数据、流式数据 健康与退变的纤维环组织(用于scRNA-seq)、体外培养的纤维环细胞、大鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
58 2025-12-11
Acetylcholine in the gingival epithelium drives the pathogenesis of periodontitis
2025, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
研究论文 本研究揭示了乙酰胆碱在牙周炎发病机制中的复杂作用,并提出了一个新的“神经-上皮-免疫轴”概念 首次利用单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了牙龈上皮在牙周炎状态下神经信号通路的功能重编程,并明确了乙酰胆碱在牙周炎中兼具保护上皮屏障和驱动炎症破坏的双重作用 研究主要基于体外细胞实验和动物模型,其在人体内的直接作用和临床转化效果仍需进一步验证 探究神经递质乙酰胆碱在牙周炎发病机制中的作用 人类牙龈样本、人类口腔角质形成细胞(HOKs)、小鼠牙周炎模型 单细胞组学 牙周炎 单细胞RNA测序(scRNA-seq),空间转录组学 NA 单细胞转录组数据,空间转录组数据 205,334个细胞(来自40个人类牙龈样本),46,230个25 μm²空间转录组点 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
59 2025-12-11
Multi-omics integration analysis based on plasma circulating proteins reveals potential therapeutic targets for ulcerative colitis
2025, Frontiers in molecular biosciences IF:3.9Q2
研究论文 本研究通过整合多组学数据,识别了溃疡性结肠炎的潜在诊断和治疗生物标志物 结合孟德尔随机化、差异表达分析和多种机器学习算法,系统筛选核心枢纽基因,并构建了诊断模型和调控网络 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步实验验证核心基因的生物学功能 识别溃疡性结肠炎的诊断和治疗生物标志物 溃疡性结肠炎患者数据和小鼠模型 生物信息学 溃疡性结肠炎 孟德尔随机化、差异表达分析、机器学习算法、单细胞RNA测序、RT-qPCR 机器学习算法(未指定具体类型)、列线图模型 基因表达数据、蛋白质数据、单细胞测序数据 未明确指定样本数量,涉及公共数据库数据和DSS诱导的UC小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
60 2025-12-11
Prognostic model for lung adenocarcinoma based on experimental drug-resistant cell lines and clinical patients
2025, Frontiers in molecular biosciences IF:3.9Q2
研究论文 本研究通过整合体外耐药细胞系数据和临床患者信息,构建了一个基于免疫微环境特征和体外耐药机制的肺腺癌预后模型 首次将体外实验建立的EGFR-TKIs耐药细胞系(厄洛替尼、吉非替尼、奥希替尼耐药)的RNA测序数据与TCGA-LUAD临床数据相结合,构建了一个3基因(PPP1R3G, CREG2, LYPD3)风险评分模型,并利用单细胞RNA-seq数据解析了EGFR突变型与野生型肿瘤的表达模式 模型仅在公开数据集(TCGA)和体外细胞系中进行验证,缺乏大规模前瞻性临床队列的独立验证 开发一个整合免疫微环境特征和体外耐药机制的预后模型,以预测肺腺癌患者对EGFR-TKIs的治疗反应和生存结局,并指导个体化治疗策略 肺腺癌(LUAD)患者、HCC827肺腺癌细胞系及其EGFR-TKIs(厄洛替尼、吉非替尼、奥希替尼)耐药衍生株 生物信息学与计算生物学 肺癌 RNA测序、单细胞RNA测序、RT-PCR、LASSO-COX回归分析、基因集变异分析(GSVA) LASSO-COX比例风险模型、列线图(Nomogram) 基因表达数据、临床数据 TCGA-LUAD数据集中的肺腺癌患者样本、HCC827细胞系及其耐药衍生株(厄洛替尼耐药、吉非替尼耐药、奥希替尼耐药)、单细胞RNA-seq数据集GSE241934 NA RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
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