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当前共找到 2164 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-03-06 |
Keeping an Eye Out for Autophagy in the Cornea: Sample Preparation for Single-Cell RNA-Sequencing
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/7651_2023_502
PMID:37930627
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研究论文 | 本文描述了利用单细胞RNA测序技术研究角膜缘上皮干细胞群及自噬对其功能影响的样本制备方法 | 开发了针对角膜/角膜缘组织活细胞单细胞悬液的分离协议，并结合自噬缺陷模型进行scRNA-seq分析 | NA | 研究自噬对角膜缘上皮干细胞功能的影响 | 小鼠角膜缘上皮干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 42 | 2026-03-06 |
Characterizing the immune infiltrate in secondary syphilis: implications for transmission and pathology
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1549206
PMID:40201184
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研究论文 | 本研究通过免疫组化、bulk RNA测序和单细胞RNA测序技术，分析了二期梅毒皮肤病变中的免疫浸润特征，并探讨了梅毒螺旋体在皮肤中的免疫逃逸机制 | 首次结合单细胞RNA测序和免疫组化技术，系统描绘了二期梅毒皮肤病变中的免疫细胞组成和细胞间通讯网络，并揭示了表皮TLR-MYD88通路在宿主应答中的关键作用 | 研究样本来源于福尔马林固定石蜡包埋的组织，可能影响RNA质量和单细胞测序的灵敏度；体外实验模型可能无法完全模拟体内复杂的免疫微环境 | 阐明梅毒螺旋体在皮肤感染过程中的免疫逃逸机制和宿主免疫应答特征 | 二期梅毒患者的皮肤活检组织、健康人外周血单个核细胞（PBMCs）、原代角质形成细胞和MyD88敲除角质形成细胞 | 数字病理学 | 梅毒 | 免疫组化（IHC）、bulk RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 图像、转录组数据 | 二期梅毒患者的皮肤活检样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 43 | 2026-03-06 |
Serine supplementation suppresses hypoxia-induced pathological retinal angiogenesis
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.105299
PMID:40303351
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研究论文 | 本研究探讨了丝氨酸补充对抑制缺氧诱导的病理性视网膜血管新生的作用及其机制 | 首次系统性地在氧诱导视网膜病变小鼠模型中，通过多组学分析和单细胞RNA测序，揭示了丝氨酸通过增强线粒体脂肪酸氧化和氧化磷酸化来抑制病理性血管新生的新机制，并鉴定出HMGB1蛋白作为关键介导因子 | 研究主要基于小鼠模型，其在人类疾病中的直接适用性尚需进一步验证；干预时间点和剂量方案有待优化；对丝氨酸代谢下游具体信号通路的解析还不够深入 | 探究丝氨酸代谢在抑制缺氧驱动的病理性视网膜血管新生中的作用及分子机制 | 野生型C57BL/6J小鼠的氧诱导视网膜病变模型 | 数字病理学 | 视网膜病变 | 代谢组学, 脂质组学, 蛋白质组学, 单细胞RNA测序, 蛋白质印迹 | 动物模型 | 多组学数据, 图像, 文本 | 未明确具体数量的小鼠视网膜样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 44 | 2026-03-06 |
Single cell atlas of canine natural killer cells identifies distinct circulating and tissue resident gene profiles
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1571085
PMID:40443661
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，构建了犬类自然杀伤细胞在不同组织中的单细胞图谱，并与人类自然杀伤细胞进行比较，揭示了跨物种的基因表达同源性 | 首次在犬类中系统性地绘制了自然杀伤细胞在血液、肺、肝、脾和胎盘等组织中的单细胞基因表达图谱，并进行了跨物种比较分析 | 研究主要基于基因表达数据，缺乏功能验证实验；样本来源可能有限，未涵盖所有犬类品种或疾病状态 | 旨在表征犬类自然杀伤细胞的异质性、组织特异性基因表达模式，并与人类自然杀伤细胞进行比较，以优化跨物种的自然杀伤细胞免疫治疗 | 犬类和人类的自然杀伤细胞，来源于血液、肺、肝、脾和胎盘等组织 | 单细胞组学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 涉及犬类和人类的多组织样本，具体数量未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 45 | 2026-03-06 |
Perspective on recent developments and challenges in regulatory and systems genomics
2025, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbaf106
PMID:40626041
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综述 | 本文讨论了调控和系统基因组学领域的最新进展与挑战，重点关注顺式调控代码的解码及其在人类疾病中的应用 | 整合了计算基因组学、3D染色质组织分析和序列到功能神经网络，以预测遗传变异对表型的影响，并展望了空间转录组学等新兴技术 | 存在知识空白、技术限制以及计算方法基准测试的挑战 | 解码顺式调控代码，预测遗传变异在生物体、细胞和分子水平上对表型的影响 | 顺式调控元件、3D染色质组织、基因调控网络和人类疾病相关的遗传变异 | 自然语言处理 | NA | 基因组学检测、空间转录组学 | 序列到功能神经网络 | 序列数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 46 | 2026-03-06 |
Comparative transcriptomic analysis of tumor- infiltrating canine natural killer cells and candidate biomarkers from first-in-dog NK immunotherapy trials
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1646849
PMID:41208961
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序比较了犬和人类肿瘤浸润自然杀伤细胞的转录组特征，并评估了犬NK免疫疗法试验中的候选生物标志物 | 首次在犬类中整合血液、组织和肿瘤样本进行单细胞RNA测序分析，建立了犬肉瘤浸润NK细胞特征，并将此特征应用于首次犬免疫疗法临床试验的NK细胞变化背景分析 | 研究样本可能有限，且犬类模型虽与人类相似，但物种间差异仍需谨慎考虑，临床试验的规模和多样性可能不足 | 改善NK细胞在实体癌症中的疗效，并识别跨物种反应的潜在生物标志物 | 犬和人类捐赠者的血液、组织和肿瘤样本中的自然杀伤细胞 | 单细胞转录组学 | 肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 来自犬和人类捐赠者的血液、组织和肿瘤样本，具体数量未在摘要中指定 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 47 | 2026-03-04 |
Inhibition of vascular smooth muscle cell PERK/ATF4 ER stress signaling protects against abdominal aortic aneurysms
2025-Jan-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.183959
PMID:39846252
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研究论文 | 本研究探讨了血管平滑肌细胞中PERK/ATF4内质网应激信号通路在腹主动脉瘤形成中的作用，并验证了靶向抑制该通路对保护VSMC功能和减少AAA扩张的潜在治疗效果 | 首次通过单细胞RNA测序在人AAA组织中识别出PERK/eIF2α/ATF4通路在VSMCs中的激活，并揭示了TNF-α诱导的PERK依赖性ATF4活化导致细胞凋亡的机制，为AAA治疗提供了新的细胞特异性药物靶点 | 研究主要基于动物模型（弹性酶和血管紧张素II诱导的AAA模型），人类组织的验证可能有限，且长期安全性和临床转化效果尚未明确 | 探究腹主动脉瘤形成中血管平滑肌细胞功能障碍和凋亡的分子机制，并开发有效的治疗策略以预防主动脉破裂 | 腹主动脉瘤组织中的血管平滑肌细胞，以及小鼠AAA模型 | 心血管疾病 | 腹主动脉瘤 | 单细胞RNA测序，基因敲除（Eif2ak3fl/fl Myh11-CreERT2），药物抑制 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 人AAA组织样本和小鼠模型，具体数量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 48 | 2026-03-04 |
Experimental and Computational Methods for Allelic Imbalance Analysis from Single-Nucleus RNA-seq Data
2025-Jan-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.13.607784
PMID:39185246
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研究论文 | 本文介绍了一种从单核RNA-seq数据中进行等位基因不平衡分析的实验和计算方法 | 开发了一套新的计算工具，用于处理和分析scRNA-seq和snRNA-seq的等位基因特异性表达，并展示了如何通过实验选择（如RNA来源、读长、测序深度）来提高分析能力 | NA | 改进单细胞水平等位基因不平衡分析的方法，以更好地理解人类基因组变异对RNA表达的影响 | 单核RNA-seq数据，特别是来自94名帕金森病患者的队列 | 自然语言处理 | 帕金森病 | 单核RNA-seq，等位基因特异性表达分析 | NA | RNA-seq数据 | 94名帕金森病患者 | NA | 单核RNA-seq | NA | NA |
| 49 | 2026-03-03 |
Spatial Transcriptomics in Inflammatory Skin Diseases Using GeoMx Digital Spatial Profiling: A Practical Guide for Applications in Dermatology
2025-Jan, JID innovations : skin science from molecules to population health
DOI:10.1016/j.xjidi.2024.100317
PMID:39559817
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研究论文 | 本文提供了使用NanoString GeoMx数字空间分析仪在炎症性皮肤病中进行空间转录组学研究的实用指南 | 提供了制造商指南中未包含的RNA捕获优化方法和潜在问题解决方案，并通过具体疾病案例展示了空间分析策略 | 主要关注GeoMx平台在皮肤病学的应用，可能不直接适用于其他空间转录组技术或其他组织类型 | 为皮肤病研究者提供数字空间分析技术的实用操作指南和优化策略 | 炎症性皮肤病（银屑病、扁平苔藓、盘状红斑狼疮）的组织样本 | 数字病理学 | 皮肤病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx Digital Spatial Profiler | GeoMx数字空间分析仪 |
| 50 | 2026-03-03 |
Network pharmacology, bioinformatics and in vitro/in vivo validation elucidate the anti-lung cancer activities and potential targets of Rhoifolin
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1727729
PMID:41614077
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研究论文 | 本研究通过整合网络药理学、生物信息学及体外/体内实验，系统探讨了Rhoifolin的抗肺癌活性及其潜在分子靶点EPHB2 | 首次将网络药理学、转录组学与机器学习相结合，识别出EPHB2作为Rhoifolin的关键治疗靶点，并通过分子对接、动力学模拟及体内外实验验证了其直接作用机制 | 研究主要基于H358细胞系和小鼠异种移植模型，临床前数据需在更多肺癌模型和临床试验中进一步验证 | 系统研究Rhoifolin的抗肿瘤效应并识别其关键分子靶点，为肺癌治疗提供新策略 | 肺癌细胞系（如H358）及H358异种移植小鼠模型 | 生物信息学 | 肺癌 | 网络药理学、转录组分析、机器学习、RT-qPCR、Western blot、免疫荧光、分子对接、动力学模拟 | 机器学习 | 转录组数据、单细胞RNA测序数据、临床数据 | 体外细胞实验及H358异种移植小鼠模型，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 51 | 2026-03-02 |
Transcriptional determinants of goal-directed learning and representational drift in the parahippocampal cortex
2025-01-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.115175
PMID:39792551
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研究论文 | 本研究通过双光子钙成像和空间转录组学技术，揭示了海马旁皮层在目标导向学习中的转录决定因素和表征漂移机制 | 首次结合双光子钙成像与空间转录组学，识别了IEG定义的网络在刺激-结果关联形成中的作用，并发现脑源性神经营养因子在任务学习中的关键调控功能 | 研究主要聚焦于海马旁皮层，未全面探索其他脑区在表征漂移中的作用，且样本规模可能有限 | 探究目标导向学习中表征漂移的电路和分子机制 | 海马旁皮层的神经元，特别是兴奋性和抑制性亚型 | 神经科学 | NA | 双光子钙成像，空间转录组学 | NA | 钙成像数据，基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 52 | 2026-03-02 |
Highly multiplexed spatial transcriptomics in bacteria
2025-Jan-24, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adr0932
PMID:39847624
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研究论文 | 本文介绍了一种名为bacterial-MERFISH的新方法，通过结合1000倍体积扩展与多重错误鲁棒荧光原位杂交技术，实现了细菌中数千个操纵子的高通量空间解析分析 | 开发了bacterial-MERFISH方法，首次将MERFISH技术应用于细菌，克服了细菌mRNA高密度的挑战，实现了单细菌水平的高通量空间转录组分析 | 未明确提及具体限制，但可能涉及技术复杂性、成本或适用范围 | 研究细菌在复杂环境中的单细胞决策行为，特别是空间结构环境下的异质性 | 细菌，包括对碳饥饿的响应、亚细胞RNA组织以及肠道共生菌在哺乳动物结肠微米级生态位中的适应 | 空间转录组学 | NA | 多重错误鲁棒荧光原位杂交（MERFISH） | NA | 图像 | 未明确指定样本数量，但涉及个体细菌和肠道共生菌的微环境分析 | NA | 空间转录组学 | NA | bacterial-MERFISH（结合1000倍体积扩展与MERFISH） |
| 53 | 2026-03-02 |
Serinc5 Regulates Sequential Chondrocyte Differentiation by Inhibiting Sox9 Function in Pre-Hypertrophic Chondrocytes
2025-01, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.31490
PMID:39568258
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析，揭示了Serinc5作为前肥大软骨细胞标记基因，通过抑制Sox9功能调控软骨细胞从增殖到肥大的顺序分化过程 | 首次将Serinc5鉴定为前肥大软骨细胞的标记基因，并阐明其通过抑制Sox9转录活性来调控软骨细胞分化的新机制 | 研究主要基于体外实验和测序分析，体内功能验证和临床相关性有待进一步探索 | 探究前肥大软骨细胞的分子基础及其在生长板软骨细胞分化中的作用机制 | 生长板软骨细胞，特别是前肥大软骨细胞 | 发育生物学 | NA | scRNA-seq, ChIP-seq, ATAC-seq, 荧光标记, 组织学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 染色质免疫沉淀测序数据, 染色质可及性测序数据, 组织学图像 | 荧光标记的生长板软骨细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq | NA | NA |
| 54 | 2026-03-02 |
Single-Cell RNA-Seq and Histological Analysis Reveals Dynamic Lrig1 Expression During Salivary Gland Development
2025-01, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.31487
PMID:39587709
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和组织学分析，揭示了Lrig1在小鼠颌下腺发育过程中的动态表达模式及其功能 | 首次结合单细胞RNA测序与组织学技术，系统性地研究了Lrig1在唾液腺发育中的时空表达及其调控机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类细胞系实验的生理相关性可能有限 | 探究Lrig1在唾液腺发育和成熟过程中的表达模式及功能 | 小鼠颌下腺及人类唾液腺细胞系 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 免疫荧光染色, RNAscope染色 | NA | 单细胞RNA测序数据, 图像数据 | 不同发育阶段的小鼠颌下腺样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 55 | 2026-03-02 |
Refining breast cancer genetic risk and biology through multi-ancestry fine-mapping analyses of 192 risk regions
2025-Jan, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-02031-y
PMID:39753771
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研究论文 | 本研究通过多祖先精细定位分析，细化了192个乳腺癌风险区域，揭示了新的关联信号和候选易感基因 | 整合多祖先数据，识别了131个先前未报告的关联信号，并将50个信号的因果变异缩小至单个变异，通过功能基因组学数据鉴定了195个假定的易感基因 | 因果变异和目标基因的验证仍需进一步实验，部分关联信号的生物学机制尚未完全阐明 | 精细定位已知的乳腺癌风险位点，以揭示因果变异和目标基因 | 172,737名女性乳腺癌病例和242,009名对照，涵盖非洲、亚洲和欧洲祖先 | 基因组学 | 乳腺癌 | 全基因组关联研究（GWAS），单细胞RNA测序，体外实验 | NA | 基因组关联数据，功能基因组学数据 | 414,746名参与者（172,737例病例和242,009名对照） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 56 | 2026-03-02 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals Biomechanical Loading-Induced Imbalance in Bone and Fat, Leading to Ossification in Lumbar Intervertebral Disc Nucleus Pulposus Degeneration
2025-01, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.31506
PMID:39854079
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了生物力学负荷如何导致腰椎间盘退变中髓核的骨化和骨-脂肪失衡 | 首次在单细胞水平上识别出受生物力学负荷影响的CITED4+METRN+软骨细胞亚群，并揭示了其在椎间盘退变骨化中的关键作用 | 样本量较小（仅5例新鲜组织），且为回顾性分析，需要更大规模的前瞻性研究验证 | 探究生物力学负荷对腰椎间盘退变中髓核骨化的影响机制 | 腰椎间盘退变患者的髓核组织 | 单细胞转录组学 | 椎间盘退变 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 5例新鲜髓核组织（L3-S1节段）及回顾性石蜡包埋样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 57 | 2026-03-02 |
Single-cell analysis of CD14+CD16+ monocytes identifies a subpopulation with an enhanced migratory and inflammatory phenotype
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1475480
PMID:40051633
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析人CD14+CD16+单核细胞，识别出一个具有增强迁移和炎症表型的亚群，并探讨其在神经炎症疾病中的作用 | 首次在CD14+CD16+单核细胞中通过单细胞RNA测序识别出九个异质性簇，并定义了一个具有增强迁移和炎症表型的Group 1单核细胞亚群 | 研究主要基于体外实验和单细胞测序数据，缺乏体内功能验证，且样本来源和数量未明确说明 | 探究CD14+CD16+单核细胞的异质性及其在神经炎症疾病中的潜在作用 | 人CD14+CD16+单核细胞 | 单细胞组学 | 神经炎症疾病，包括HIV相关神经认知障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 58 | 2026-03-02 |
Enhanced resistance to Listeria infection in mice surviving sepsis: the role of lipid metabolism and myeloid cell reprogramming
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1588987
PMID:40520167
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研究论文 | 本研究探讨了败血症存活小鼠通过脂质代谢和髓系细胞重编程增强对李斯特菌感染的抵抗力 | 揭示了败血症存活后髓系细胞的脂质代谢重编程如何增强对细胞内病原体的免疫保护，为败血症幸存者的免疫恢复提供了新机制 | 研究基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需进一步验证；未深入探讨脂质代谢变化的具体分子通路 | 探究败血症存活后免疫系统如何通过脂质代谢和髓系细胞重编程增强对二次感染的抵抗力 | 败血症存活小鼠及其脾脏CD11b+Ly6Chigh髓系细胞 | 免疫学 | 败血症 | 单细胞RNA测序、定量RT-PCR、免疫组化、血清细胞因子检测、血浆脂质组学 | NA | RNA序列数据、脂质组学数据、细胞表型数据 | 小鼠模型（具体数量未在摘要中明确） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 59 | 2026-03-01 |
Multi-omics integration in disease research
2025, Progress in brain research
DOI:10.1016/bs.pbr.2025.08.012
PMID:41314746
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综述 | 本章强调多组学整合在理解阿尔茨海默病、帕金森病和肌萎缩侧索硬化等神经退行性疾病生物学中的价值 | 通过整合基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学数据，结合单细胞测序、空间转录组学和高通量质谱等工具，重建分子网络并实现患者分子亚型分层 | 面临数据异质性和标准化不足等挑战 | 推动神经退行性疾病研究中的个性化策略 | 阿尔茨海默病、帕金森病和肌萎缩侧索硬化（ALS） | 多组学整合 | 神经退行性疾病 | 单细胞测序、空间转录组学、质谱分析 | NA | 基因组、转录组、蛋白质组、代谢组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 60 | 2026-03-01 |
Precision medicine in neurodegenerative diseases: From research to clinical practice
2025, Progress in brain research
DOI:10.1016/bs.pbr.2025.08.006
PMID:41314744
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综述 | 本章概述了精准医学如何重塑神经退行性疾病的理解、诊断和治疗方式 | 整合了遗传、分子、生物标志物、影像技术和数字工具等多维度信息，推动精准医学从研究向临床实践转化 | 面临试验设计、数据整合、不平等获取和监管障碍等挑战 | 探讨精准医学在神经退行性疾病中的应用，旨在改善诊断、治疗和疾病管理 | 阿尔茨海默病、帕金森病、肌萎缩侧索硬化症和亨廷顿病等神经退行性疾病 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞转录组学、影像技术、数字工具 | NA | 遗传数据、分子数据、生物标志物数据、影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |