单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 2148 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-02-02 |
Network pharmacology, bioinformatics and in vitro/in vivo validation elucidate the anti-lung cancer activities and potential targets of Rhoifolin
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1727729
PMID:41614077
|
研究论文 | 本研究通过整合网络药理学、生物信息学及体外/体内实验验证，系统探究了Rhoifolin的抗肺癌活性及其潜在靶点EPHB2 | 首次采用网络药理学、转录组学结合机器学习方法，识别出Rhoifolin在肺癌中的关键靶点EPHB2，并通过分子对接、动力学模拟及体内外实验验证其作用机制 | 研究主要基于细胞系和异种移植小鼠模型，缺乏临床样本的直接验证，且未深入探讨EPHB2下游信号通路的具体调控网络 | 系统研究Rhoifolin的抗肿瘤效应并鉴定其关键分子靶点，为肺癌治疗提供新策略 | 肺癌细胞系（如H358）及H358异种移植小鼠模型 | 生物信息学 | 肺癌 | 网络药理学、转录组分析、机器学习、RT-qPCR、Western blot、免疫荧光、分子对接、动力学模拟 | 机器学习 | 转录组数据、单细胞RNA测序数据、临床生存数据 | 体外实验使用肺癌细胞系，体内实验使用H358异种移植小鼠模型，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 42 | 2026-01-30 |
Distinct myeloid-derived suppressor cell populations in human glioblastoma
2025-Jan-17, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abm5214
PMID:39818911
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析，揭示了人胶质母细胞瘤中两种不同的髓源性抑制细胞群体及其与肿瘤细胞的相互作用 | 首次在IDH野生型胶质母细胞瘤中鉴定出两种不同的MDSC群体，并阐明了它们在肿瘤代谢和免疫抑制中的空间定位与互作机制 | 研究样本量相对较小（33例胶质瘤），且主要聚焦于IDH野生型亚型，可能未完全覆盖所有胶质瘤异质性 | 探究胶质瘤相关髓系细胞在肿瘤生长和免疫逃逸中的作用 | 人胶质瘤中的免疫细胞和肿瘤细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | RNA测序数据, 空间转录组数据 | 33例胶质瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 43 | 2026-01-30 |
TGF-β-driven T-cell exclusion in ovarian cancer: single-cell and spatial transcriptomic views of immune low-response states
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1698088
PMID:41181126
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA和ATAC测序以及空间转录组学在揭示卵巢癌中TGF-β驱动的T细胞排斥和免疫低反应状态方面的进展，并评估了相关的转化机会 | 整合单细胞和空间转录组学数据，解析TGF-β信号相关的成纤维细胞、肿瘤和免疫程序，提出基于TGF-β信息的精准免疫治疗策略 | 存在部位特异性异质性、检测标准化有限以及预测指标稀缺等挑战，限制了临床实施 | 评估TGF-β驱动的免疫低反应状态在卵巢癌中的作用，并探索精准免疫治疗策略 | 上皮性卵巢癌（EOC）中的TGF-β信号、成纤维细胞、肿瘤细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 表观遗传数据, 空间数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 44 | 2026-01-30 |
Multi-omics exploration of chaperone-mediated immune-proteostasis crosstalk in vascular dementia and identification of diagnostic biomarkers
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1615540
PMID:40808948
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据和机器学习算法，探索了分子伴侣系统在血管性痴呆中的调控网络和诊断潜力 | 首次将HSP90AA1-HSPA1B-DNAJB1网络识别为通过蛋白质稳态和免疫重编程双重机制驱动血管性痴呆发病的关键因素，其诊断性能显著优于传统生物标志物 | 需要更大规模的队列研究来验证其临床转化潜力 | 阐明血管性痴呆的分子机制并识别诊断性生物标志物 | 血管性痴呆患者的额叶、颞叶皮质和白质样本，以及双侧颈总动脉狭窄小鼠模型 | 机器学习 | 血管性痴呆 | 转录组学，单细胞转录组学，免疫微环境分析 | LASSO, SVM-RFE, Random Forest | 转录组数据，单细胞转录组数据 | 人类样本：额叶和颞叶皮质（n=15），白质（n=8）；小鼠模型：双侧颈总动脉狭窄模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 45 | 2026-01-29 |
β-cell heterogeneity and molecular plasticity in type 2 diabetes: multi-omics perspectives and the role of gut microbiota
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1698296
PMID:41584842
|
综述 | 本文综述了利用多组学技术揭示2型糖尿病中β细胞的异质性与分子可塑性，并探讨了肠道微生物群在其中的作用及潜在治疗策略 | 整合单细胞转录组学、表观基因组学、空间转录组学等多组学视角与肠道微生物组研究，提出了理解β细胞功能失调与微生物群介导代谢调控的综合框架 | 作为一篇综述文章，主要整合现有证据而非提出新的原始数据，且微生物群与β细胞功能间的因果机制仍需更多实验验证 | 阐明2型糖尿病中β细胞的异质性、分子可塑性及其与肠道微生物群的相互作用，以寻找潜在治疗靶点 | 胰腺β细胞、胰岛其他内分泌细胞、免疫细胞、基质细胞、胰腺外分泌部分以及肠道微生物群 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | 单细胞转录组学、表观基因组学、空间转录组学、多组学整合分析 | NA | 转录组数据、表观基因组数据、空间基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 46 | 2026-01-29 |
Single-cell analysis of microglial activation after traumatic brain injury reveals immune signaling pathways linked to mitochondrial dysfunction and brain aging
2025, Frontiers in aging neuroscience
IF:4.1Q2
DOI:10.3389/fnagi.2025.1657523
PMID:41583003
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学绘制了创伤性脑损伤后小胶质细胞动态响应的图谱，并验证了与线粒体功能障碍和脑衰老相关的关键免疫信号通路 | 首次整合多个组织和时间点，提供了创伤性脑损伤后小胶质细胞-髓系细胞相互作用的单细胞转录组图谱，并将小胶质细胞信号与线粒体功能障碍和神经炎症联系起来 | 研究主要基于公开数据集和体外模型验证，缺乏体内功能验证，且样本量有限 | 绘制创伤性脑损伤后小胶质细胞的动态响应图谱，并验证关键信号通路 | 小鼠的皮质、海马体和血液样本中的髓系细胞（包括单核细胞、巨噬细胞和小胶质细胞） | 数字病理学 | 创伤性脑损伤 | 单细胞转录组学，qPCR | NA | 转录组数据 | 35只小鼠（11个血液样本，12个皮质样本，12个海马体样本） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 47 | 2026-01-29 |
ULMnet: inferring physical cell-cell communication networks from scRNAseq data using univariate linear models
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1722504
PMID:41583424
|
研究论文 | 本研究开发了一种名为ULMnet的计算方法，利用单变量线性模型从单细胞RNA测序数据中推断物理细胞间通信网络 | 通过识别scRNAseq中的多重体（尤其是双联体）来推断物理细胞间相互作用，克服了传统方法因组织解离而无法捕获直接接触的局限性 | 方法在预测已知成分的双联体时灵敏度约为56%，虽然精度高（~99%），但灵敏度相对较低，可能漏检部分多重体 | 开发一种计算工具，从scRNAseq数据中推断物理细胞间通信网络，以揭示组织中的直接细胞相互作用 | 单细胞RNA测序数据，包括细胞对、部分解离组织以及健康和癌症组织的常规scRNAseq数据集 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | 单变量线性模型 | 单细胞RNA测序数据 | 多个数据集，包括细胞对、部分解离组织以及健康和癌症组织的scRNAseq数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 48 | 2026-01-29 |
Liquid-liquid phase separation-driven molecular subtyping and prognostic modeling in colorectal cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1741979
PMID:41583431
|
研究论文 | 本文通过构建与液-液相分离相关的预后模型，对结直肠癌患者进行风险分层并指导个体化治疗策略 | 首次将液-液相分离相关基因应用于结直肠癌的分子亚型分型和预后建模，揭示了LLPS在结直肠癌进展中的作用 | 研究主要基于公共数据集，需要进一步实验验证LLPS机制在结直肠癌中的具体作用 | 探究液-液相分离在结直肠癌进展中的作用并构建预后模型 | 结直肠癌患者样本 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 基因表达分析，空间转录组学分析，加权基因共表达网络分析 | Cox回归，LASSO回归，逐步AIC算法 | 基因表达数据，空间转录组数据 | 566个结直肠癌样本和19个正常对照（来自GSE39582数据集），以及COAD、READ和GSE17536验证队列 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 49 | 2026-01-29 |
Advances in the identification of novel cell signatures in benign prostatic hyperplasia and prostate cancer using single-cell RNA sequencing
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1684895
PMID:41583437
|
综述 | 本文综述了利用单细胞RNA测序技术在良性前列腺增生和前列腺癌中识别新型细胞亚群和分子标志物的最新进展 | 整合单细胞RNA测序技术解析BPH和PCa中共享的细胞异质性和分子机制，为精准诊断和治疗提供新见解 | 作为综述文章，未涉及原始实验数据，主要依赖已有研究进行总结，可能受限于当前scRNA-seq技术的分辨率和样本量 | 探讨BPH和PCa的分子发病机制，识别新型细胞亚群和生物标志物以改善临床管理 | 良性前列腺增生和前列腺癌中的前列腺细胞及免疫细胞亚群 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 50 | 2026-01-29 |
Cuproptosis-driven reprogramming of fibroblast communication by GK is associated with the immune microenvironment in diabetic foot ulcers
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1687806
PMID:41583446
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了铜死亡相关基因GK在糖尿病足溃疡成纤维细胞-免疫细胞通讯重塑及免疫微环境调控中的关键作用 | 首次将铜死亡与糖尿病足溃疡的成纤维细胞通讯及免疫微环境联系起来，并鉴定GK作为新型诊断生物标志物 | 研究主要基于生物信息学分析和动物模型验证，缺乏临床样本的直接功能验证 | 探究铜死亡在糖尿病足溃疡免疫微环境调控中的作用机制 | 糖尿病足溃疡患者的皮肤组织及SD大鼠伤口模型 | 生物信息学 | 糖尿病足溃疡 | 单细胞RNA测序, 机器学习, PCR, Western blot | LASSO, SVM-RFE, Random Forest | 单细胞转录组数据, 批量转录组数据 | 33,095个细胞（质量控制后25,198个），9只SD大鼠（正常/伤口/糖尿病伤口各3只） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 51 | 2026-01-29 |
The role of 5-methylcytosine regulator-related genes in diagnostic and immune regulatory functions in atherosclerosis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1636323
PMID:41583468
|
研究论文 | 本研究通过分析动脉粥样硬化(AS)中5-甲基胞嘧啶(m5C)RNA修饰及其调控基因的作用，识别了五个潜在的诊断生物标志物，并揭示了m5C调节因子NSUN3在巨噬细胞功能中的关键作用 | 首次系统性地将m5C RNA修饰调控基因与动脉粥样硬化的诊断和免疫调节功能联系起来，并识别了五个新的潜在诊断生物标志物 | 研究主要基于公共微阵列数据库，需要进一步实验验证生物标志物的临床实用性 | 阐明m5C修饰及其相关基因在动脉粥样硬化中的作用，并识别潜在的诊断生物标志物 | 动脉粥样硬化患者样本数据、人类髓系白血病单核细胞(THP-1)以及巨噬细胞 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 微阵列分析、LASSO逻辑回归、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、qRT-PCR | LASSO逻辑回归模型、WGCNA | 基因表达数据 | 多个GEO数据集(GSE90074、GSE27034、GSE59421、GSE159677)，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序、微阵列 | NA | NA |
| 52 | 2026-01-29 |
PANoptosis in urological diseases: molecular mechanisms, pathological roles, and emerging therapeutic opportunities
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1729348
PMID:41583472
|
综述 | 本文综述了PANoptosis在泌尿系统疾病中的分子机制、病理作用及新兴治疗机会 | 首次系统阐述PANoptosis作为一种整合性炎症程序性细胞死亡通路在泌尿系统疾病中的双重作用及作为治疗靶点的潜力 | NA | 探讨PANoptosis在泌尿系统疾病发病机制中的角色及作为诊断和治疗靶点的可能性 | 泌尿系统疾病，包括急慢性肾损伤、前列腺癌、肾癌和睾丸疾病 | NA | 泌尿系统疾病 | 单细胞测序、空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 53 | 2026-01-29 |
A novel prognostic model based on epithelial cell progression genes identifies OAS1 as a suppressor of bladder cancer aggressiveness
2025, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2025.1716130
PMID:41584451
|
研究论文 | 本研究基于上皮细胞肿瘤进展相关基因构建了一个新的膀胱癌预后模型，并发现OAS1是抑制膀胱癌侵袭性的关键基因 | 利用单细胞RNA测序数据识别上皮细胞亚群及其恶性进展轨迹，并基于此构建了一个四基因特征的预后模型，同时通过体外实验验证了关键基因OAS1的功能 | 模型验证依赖于公共数据库的回顾性数据，需要在前瞻性临床队列中进一步验证；体外实验未能完全模拟体内肿瘤微环境的复杂性 | 识别驱动膀胱癌进展的关键上皮细胞来源特征基因，构建可靠的预后模型，并探索关键基因OAS1的生物学功能 | 膀胱癌患者（来自TCGA和GEO数据库）及膀胱癌细胞系 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序，LASSO Cox回归，CCK-8，Transwell，伤口愈合实验 | LASSO Cox回归模型 | 单细胞RNA-seq数据，批量RNA-seq数据，临床数据 | TCGA膀胱癌队列及独立GEO验证队列（具体样本数未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 54 | 2026-01-29 |
A robust ammonia metabolism gene signature identified by machine learning predicts prognosis and immunotherapy response in clear cell renal cell carcinoma
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1709096
PMID:41584585
|
研究论文 | 本研究通过机器学习方法，识别了一个与氨代谢相关的基因特征，用于预测透明细胞肾细胞癌的预后和免疫治疗反应 | 首次利用机器学习整合多组学数据，构建了氨代谢风险评分模型，并验证了其在预测预后和免疫治疗反应中的有效性，同时通过体外实验验证了关键基因CSAD的功能 | 研究主要基于公共数据库数据，需要进一步的前瞻性临床研究验证模型的普适性 | 开发一个能够预测透明细胞肾细胞癌患者预后和免疫治疗反应的生物标志物 | 透明细胞肾细胞癌患者 | 机器学习 | 肾细胞癌 | RNA-seq, scRNA-seq, WGCNA, TMB分析 | 随机森林, LASSO, 多元Cox回归 | RNA-seq数据, 多组学数据 | TCGA数据库中的患者数据，以及外部验证队列和免疫治疗队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 55 | 2026-01-29 |
Berberine suppresses hepatocellular carcinoma progression by blocking IL-4-JAK1-STAT6-mediated M2 polarization of macrophage
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1734201
PMID:41585886
|
研究论文 | 本研究揭示了小檗碱通过阻断IL-4-JAK1-STAT6信号轴抑制巨噬细胞M2极化，从而抑制肝细胞癌进展的机制 | 首次阐明小檗碱通过直接结合JAK1蛋白的FERM结构域并稳定该蛋白，进而抑制IL-4诱导的巨噬细胞M2极化，并与抗PD-L1抗体联合治疗显示出协同抗肿瘤效应 | 研究主要基于H22荷瘤小鼠模型和体外实验，缺乏临床患者样本验证；联合治疗策略的长期安全性和疗效需进一步评估 | 探究小檗碱是否通过调节肿瘤炎症微环境抑制肝细胞癌进展 | 肝细胞癌（HCC）、肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）、H22肿瘤细胞系、荷瘤小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、分子对接、蛋白质稳定性测定、流式细胞术 | NA | 基因表达数据、蛋白质互作数据、细胞表型数据 | H22荷瘤小鼠模型（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 56 | 2026-01-29 |
Integrative transcriptomic analysis reveals microglial metabolic-inflammatory crosstalk of HK2-HSPA5-TNF axis after intracerebral hemorrhage
2025, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2025.1740715
PMID:41601478
|
研究论文 | 本研究通过整合转录组学数据，揭示了脑出血后小胶质细胞中HK2-HSPA5-TNF轴介导的代谢-炎症相互作用 | 首次通过整合bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq和空间转录组学数据，系统揭示了脑出血后小胶质细胞中葡萄糖代谢与炎症反应之间的时空动态调控网络 | 研究主要基于转录组学数据，缺乏蛋白质水平的功能验证；动物模型与人类组织的直接可比性有待进一步确认 | 探究脑出血后葡萄糖代谢失调如何促进神经炎症的发病机制 | 脑出血后的小胶质细胞代谢-炎症调控网络 | 生物信息学 | 脑血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 加权基因共表达网络分析, 伪时间轨迹重建, 细胞间通讯推断 | 转录组数据 | 人类血肿周围组织和小鼠脑出血模型 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 57 | 2026-01-29 |
SpaLLM: a general framework for spatial domain identification with large language models
2025, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2025.1713975
PMID:41601479
|
研究论文 | 提出SpaLLM框架，通过整合大语言模型生成的基因描述嵌入与空间转录组学数据，改进空间域识别 | 首次将大语言模型生成的基因功能描述嵌入整合到空间转录组学分析中，利用预计算的GenePT嵌入创建生物学信息丰富的基因表示，从而增强空间域识别的准确性 | 未在摘要中明确提及具体局限性 | 改进空间转录组学中的空间域识别方法 | 空间转录组学数据，包括基因表达矩阵和空间坐标 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学技术 | 大语言模型 | 基因表达矩阵、空间坐标、基因功能描述文本 | 12个基于测序的Visium切片和一个独立的基于成像的osmFISH数据集 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 基于测序的Visium切片 |
| 58 | 2026-01-29 |
High-dimensional co-expression network analysis reveals persistent TRH gene expression throughout axolotl telencephalon regeneration
2025, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2025.1697212
PMID:41601481
|
研究论文 | 本研究通过高维加权基因共表达网络分析，结合空间转录组学，揭示了蝾螈端脑再生过程中基因共表达的动态图谱，并识别了包括TRH在内的关键枢纽基因 | 整合hdWGCNA、空间转录组学和蛋白质-蛋白质相互作用网络，首次在蝾螈端脑再生中系统识别了枢纽基因，并发现了TRH基因在多个阶段的持续表达模式 | 研究主要为描述性分析，未进行实验验证枢纽基因的功能机制 | 识别蝾螈端脑再生过程中的枢纽基因并定位其细胞位置，以阐明脑再生的分子基础 | 蝾螈（Ambystoma mexicanum）的端脑再生过程 | 生物信息学 | NA | 高维加权基因共表达网络分析（hdWGCNA）、空间转录组学、蛋白质-蛋白质相互作用网络分析 | NA | 时空转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 59 | 2026-01-29 |
Integrated multi-omics and single-cell analysis identify SERPINE1 as a key mediator of the inflammatory tumor microenvironment in PDAC
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1716878
PMID:41601623
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学与单细胞分析，揭示了SERPINE1是胰腺导管腺癌（PDAC）炎症性肿瘤微环境的关键调控因子 | 首次通过整合多组学与单细胞分析，系统性地将SERPINE1确立为PDAC炎症驱动基质重塑和免疫逃逸的核心协调者，并发现其作为药物靶点的新潜力 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验，体内功能验证和临床转化研究有待进一步开展 | 阐明PDAC炎症性肿瘤微环境中的关键调控因子及其在免疫抑制和肿瘤进展中的作用 | 胰腺导管腺癌（PDAC）肿瘤微环境中的细胞与分子 | 生物信息学，单细胞组学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序，多组学分析，分子对接，CRISPR基因敲除 | NA | 基因组，转录组，单细胞转录组数据 | 来自TCGA、GEO、ArrayExpress数据库的多队列数据集，以及IMvigor210队列 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 60 | 2026-01-29 |
Single-cell transcriptomics reveals a novel mechanism of RDH16 regulating immune infiltration in hepatocellular carcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1689987
PMID:41601632
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据与批量转录组数据集，揭示了RDH16在肝细胞癌中调节免疫浸润的新机制 | 首次将单细胞转录组学与孟德尔随机化分析结合，识别RDH16作为免疫调节生物标志物，并发现其与CD163⁺ M2巨噬细胞浸润的负相关关系 | 研究未直接验证RDH16在体内对免疫微环境的具体调控机制，且功能实验未显示其对肿瘤细胞增殖、迁移或侵袭的直接影响 | 探究肝细胞癌中肿瘤异质性及免疫微环境，识别可操作的生物标志物和免疫调节机制以改善患者预后 | 肝细胞癌组织与非肿瘤肝组织，重点关注RDH16基因表达及其与临床病理特征和免疫浸润的关联 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，批量转录组测序，孟德尔随机化分析 | NA | 转录组数据 | 未明确指定样本数量，但涉及肝细胞癌组织与非肿瘤肝组织的比较 | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |