单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 1950 篇文献，本页显示第 561 - 580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 561 | 2025-10-06 |
Experimental Framework for Assessing Mouse Retinal Regeneration Through Single-Cell RNA-Sequencing
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4087-6_8
PMID:39240520
|
研究论文 | 本文提出了通过单细胞RNA测序评估小鼠视网膜再生的实验框架 | 开发了经过验证的小鼠视网膜细胞制备实验框架，用于单细胞RNA测序研究视网膜再生 | 研究主要基于小鼠模型，与人类视网膜再生可能存在物种差异 | 研究视网膜再生机制，特别是Müller胶质细胞来源的再生过程 | 小鼠视网膜细胞，特别是Müller胶质细胞 | 单细胞组学 | 视网膜退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 562 | 2025-10-06 |
Revealing Fibrosis Genes as Biomarkers of Ulcerative Colitis: A Bioinformatics Study Based on ScRNA and Bulk RNA Datasets
2025, Endocrine, metabolic & immune disorders drug targets
|
研究论文 | 通过生物信息学分析识别与溃疡性结肠炎相关的成纤维细胞生物标志物 | 结合单细胞RNA和bulk RNA数据集，首次系统识别与溃疡性结肠炎成纤维细胞相关的诊断生物标志物 | 研究基于公共数据集，缺乏实验验证 | 发现溃疡性结肠炎的诊断生物标志物并预测TNFα抑制剂治疗反应 | 溃疡性结肠炎患者 | 生物信息学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | 随机森林，支持向量机，Xgboost，多层感知机，逻辑回归 | RNA测序数据 | 8个bulk RNA数据集和1个单细胞RNA数据集 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 563 | 2025-10-06 |
Apolipoprotein A1-encoding recombinant adenovirus remodels cholesterol metabolism in tumors and the tumor microenvironment to inhibit hepatocellular carcinoma
2025-01, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1016/j.trsl.2024.10.003
PMID:39528003
|
研究论文 | 本研究构建了编码载脂蛋白A1的溶瘤腺病毒Ad5-ApoA1，通过重塑肿瘤和肿瘤微环境中的胆固醇代谢来抑制肝细胞癌 | 首次将ApoA1基因与溶瘤腺病毒结合，通过促进胆固醇外流和调节免疫微环境增强抗肿瘤效果 | 在裸鼠模型中未显示治疗效果，实验模型存在局限性 | 开发新型溶瘤病毒疗法用于肝细胞癌治疗 | 肝细胞癌肿瘤模型和肿瘤微环境 | 肿瘤免疫治疗 | 肝细胞癌 | 流式细胞术、转录组测序、单细胞测序 | NA | 基因表达数据、单细胞数据、流式细胞数据 | 裸鼠、健康免疫NCG小鼠、人源化免疫重建NCG小鼠 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 564 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing of human Langerhans cells identifies altered gene expression profiles in patients with atopic dermatitis
2025-01-24, ImmunoHorizons
DOI:10.1093/immhor/vlae009
PMID:39849992
|
研究论文 | 通过单细胞测序分析特应性皮炎患者朗格汉斯细胞的基因表达谱变化 | 首次在单细胞水平识别出朗格汉斯细胞的4个亚群，并发现其中2个促炎/成熟亚群在AD皮肤中富集 | 样本来源仅限于皮肤活检，未涉及其他组织或更大规模验证 | 探究朗格汉斯细胞在特应性皮炎发病机制中的作用 | 特应性皮炎患者和健康对照者的表皮朗格汉斯细胞和真皮T细胞 | 单细胞生物学 | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 糖分析 | NA | 基因表达数据 | AD患者和健康对照者的皮肤活检样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 565 | 2025-10-06 |
Unraveling pathogenesis and potential biomarkers for autism spectrum disorder associated with HIF1A pathway based on machine learning and experiment validation
2025-01, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2024.106763
PMID:39657846
|
研究论文 | 基于机器学习和实验验证，揭示与HIF1A通路相关的自闭症谱系障碍发病机制及潜在生物标志物 | 首次结合机器学习与实验验证系统研究HIF1A通路在自闭症中的作用，识别出四个新的诊断标志物并阐明IL-6/JUN/HIF1A通路在发病机制中的关键作用 | 研究主要基于动物模型和细胞实验，需要进一步在人类样本中验证 | 探索HIF1A通路在自闭症谱系障碍发病机制中的作用并寻找潜在生物标志物 | 自闭症谱系障碍患者基因数据、ASD小鼠模型、小胶质细胞BV-2细胞系 | 机器学习 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序, Western Blot, qPCR, 免疫荧光 | 机器学习模型 | 基因表达数据, 行为测试数据, 蛋白质数据 | GEO数据库中的ASD相关数据集, 母体免疫激活诱导的ASD小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 566 | 2025-10-06 |
A20 as a Potential Therapeutic Target for COVID-19
2025-01, Immunity, inflammation and disease
DOI:10.1002/iid3.70127
PMID:39853876
|
综述 | 本文探讨A20作为COVID-19潜在治疗靶点的作用机制 | 首次系统阐述A20在COVID-19病理过程中的调控作用，并结合单细胞RNA-seq数据验证其抗感染和抗炎功能 | 文献综述性质，缺乏原始实验验证 | 研究A20在COVID-19发病机制中的调控作用 | COVID-19患者和健康个体的单细胞RNA-seq数据 | 生物信息学 | COVID-19 | 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 来自NCBI GEO数据库的健康个体和不同严重程度COVID-19患者数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 567 | 2025-10-06 |
Deciphering the senescence-based tumoral heterogeneity and characteristics in pancreatic cancer: Results from parallel bulk and single-cell transcriptome data
2025-01, IUBMB life
IF:3.7Q2
DOI:10.1002/iub.70001
PMID:39865528
|
研究论文 | 通过整合分析批量与单细胞RNA测序数据，揭示胰腺癌中基于细胞衰老的肿瘤异质性特征 | 首次在批量和单细胞水平并行分析胰腺癌的衰老相关异质性，识别关键衰老相关基因并验证其功能 | 基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证 | 解析胰腺癌中基于细胞衰老的肿瘤异质性及其特征 | 胰腺癌患者组织样本和胰腺癌细胞 | 生物信息学 | 胰腺癌 | RNA测序, 单细胞RNA测序, ssGSEA算法, infercnv算法 | 无监督聚类分析 | 转录组数据, 单细胞转录组数据 | 来自TCGA-PAAD、PACA-AU、PACA-CA和GSE154778数据集的胰腺癌患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 568 | 2025-10-06 |
An insight into COVID-19 host immunity at single-cell resolution
2025, International reviews of immunology
IF:4.3Q2
DOI:10.1080/08830185.2024.2443420
PMID:39707914
|
综述 | 基于单细胞转录组学研究，系统描述COVID-19感染和疫苗接种过程中宿主免疫细胞的分子行为变化 | 首次在单细胞分辨率下系统总结先天性和适应性免疫细胞在COVID-19感染和疫苗接种过程中的动态变化 | 仅基于过去3-4年发表的研究，未包含最新进展 | 探究SARS-CoV-2感染过程中宿主免疫反应的细胞和分子机制 | 先天性和适应性免疫细胞类型及状态 | 单细胞生物学 | COVID-19 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 569 | 2025-10-06 |
Next-generation deconvolution of the tumor microenvironment with omnideconv
2025, Methods in cell biology
DOI:10.1016/bs.mcb.2025.01.003
PMID:40683686
|
研究论文 | 介绍了一个名为omnideconv的R软件包，用于整合多种肿瘤微环境细胞反卷积方法 | 开发了统一框架整合多种反卷积算法，简化了使用流程并统一了数据语义 | NA | 开发标准化工具来简化肿瘤微环境细胞组成的计算分析 | 乳腺癌肿瘤微环境中的恶性和正常细胞 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | 反卷积算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 570 | 2025-10-06 |
Aging induces T cells with distinct transcriptomic profiles and functions in brain-associated tissues
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1619196
PMID:40534878
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现衰老诱导脑相关组织中CD4+和CD8+T细胞转录组向效应记忆表型转变，并鉴定出具有潜在保护功能的CD153+ CD4+T细胞亚群 | 首次在脑相关组织（脑膜和脉络丛）中系统揭示衰老诱导的T细胞转录组变化，并发现CD153+ CD4+T细胞在衰老大脑中的潜在保护功能 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证；功能机制研究仍需深入 | 探究衰老对非淋巴组织中T细胞转录组和功能特性的影响 | 年轻和年老小鼠脑相关组织（脑膜、脉络丛、海马体）中的CD4+和CD8+T细胞 | 单细胞生物学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），流式细胞术，抗体清除实验 | NA | 单细胞转录组数据，流式细胞数据 | 年轻和年老小鼠的脑相关组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 571 | 2025-10-06 |
Highly multiplexed spatial transcriptomics in bacteria
2025-Jan-24, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adr0932
PMID:39847624
|
研究论文 | 开发了细菌-MERFISH方法，实现细菌中数千个操纵子的高通量空间解析分析 | 将1000倍体积膨胀与多重错误鲁棒荧光原位杂交技术结合，克服了细菌mRNA高密度带来的技术障碍 | NA | 研究细菌在复杂环境中的单细胞决策行为 | 细菌 | 空间转录组学 | NA | MERFISH, 荧光原位杂交 | NA | 空间转录组数据, 图像数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA分析 | NA | 细菌-MERFISH |
| 572 | 2025-10-06 |
Efficacy of CTLA-4 checkpoint therapy is dependent on IL-21 signaling to mediate cytotoxic reprogramming of PD-1+CD8+ T cells
2025-Jan, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-024-02027-0
PMID:39702858
|
研究论文 | 本研究揭示了CTLA-4检查点疗法通过IL-21信号通路介导PD-1+CD8+T细胞的细胞毒性重编程机制 | 首次发现IL-21信号对CTLA-4阻断疗法疗效的关键作用，并揭示了与抗PD-1单药治疗的信号通路差异 | 研究主要基于晚期黑色素瘤患者和小鼠模型，在其他癌症类型中的普适性需要进一步验证 | 阐明CTLA-4检查点抑制剂治疗的作用机制 | 晚期黑色素瘤患者和小鼠B16F10黑色素瘤模型 | 免疫治疗 | 黑色素瘤 | 单细胞转录组测序, T细胞受体谱分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, T细胞受体序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 573 | 2025-10-06 |
Overexpression of CX3CL1-CX3CR1 Signaling in the Stria Vascularis rather than the Basilar Membrane May Be the Trigger for Inflammaging in the Cochlea
2025, ORL; journal for oto-rhino-laryngology and its related specialties
DOI:10.1159/000545134
PMID:40058359
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现CX3CL1-CX3CR1信号通路在耳蜗血管纹基底细胞中的过表达可能是老年性听力损失中炎症衰老的触发因素 | 首次通过单细胞RNA测序揭示CX3CL1-CX3CR1信号通路在耳蜗不同区域的分布差异及其在炎症衰老中的特异性作用 | 仍需进一步的体内干预实验验证研究结论 | 探究CX3CL1-CX3CR1信号通路在耳蜗炎症衰老中的作用机制 | 年轻和老年小鼠的耳蜗组织及BV2细胞系 | 单细胞转录组学 | 老年性听力损失 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光, 实时定量PCR, Western blot, 细胞迁移实验 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据, 蛋白质数据 | 年轻和老年小鼠的耳蜗组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 574 | 2025-10-06 |
Experimental and Computational Methods for Allelic Imbalance Analysis from Single-Nucleus RNA-seq Data
2025-Jan-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.13.607784
PMID:39185246
|
研究论文 | 本文开发了一套用于单细胞和单核RNA测序数据的等位基因特异性表达分析的实验与计算方法 | 发现单核RNA测序中内含子区域读长更适合等位基因失衡分析，并开发了新的计算工具套件 | NA | 改进单细胞水平等位基因特异性表达分析的方法 | 单细胞RNA测序和单核RNA测序数据 | 生物信息学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 等位基因特异性表达分析 | NA | RNA测序数据 | 94名帕金森病患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq | NA | NA |
| 575 | 2025-10-06 |
Tcf21 as a founder transcription factor in specifying Foxd1 cells to the juxtaglomerular cell lineage
2025-Jan-01, American journal of physiology. Renal physiology
DOI:10.1152/ajprenal.00235.2024
PMID:39589156
|
研究论文 | 本研究揭示了转录因子Tcf21在Foxd1阳性基质祖细胞向肾小球旁细胞谱系分化过程中的关键作用 | 首次通过整合单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序分析，揭示了Tcf21在肾脏发育早期阶段对Foxd1细胞向肾小球旁细胞分化的关键调控作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类肾脏发育中的类似机制仍需进一步验证 | 探究Tcf21转录因子在Foxd1阳性基质祖细胞向肾小球旁细胞分化过程中的作用机制 | 小鼠肾脏Foxd1阳性基质祖细胞和肾小球旁细胞 | 发育生物学 | 肾脏发育疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 免疫染色, 原位杂交 | 小鼠基因敲除模型 | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据, 组织图像数据 | 2,054个细胞（来自E12、E18、P5和P30时间点的GFP阳性基质谱系细胞） | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 576 | 2025-10-06 |
Spatial proteomics and transcriptomics characterization of tissue and multiple cancer types including decalcified marrow
2025-Jan, Cancer biomarkers : section A of Disease markers
IF:2.2Q3
DOI:10.1177/18758592241308757
PMID:40109220
|
研究论文 | 本研究优化了空间生物学技术的前处理方法，开发了适用于多种肿瘤类型和脱钙骨髓样本的空间蛋白质组学和转录组学分析方案 | 开发了分子和蛋白质友好的脱钙方案，建立了系统性的组织质量评估方法，实现了空间蛋白质组学和转录组学平台的相互验证 | 未明确说明样本规模和具体的统计验证方法 | 优化空间生物学技术的前处理方法，解决不同组织和肿瘤类型的技术挑战 | 多癌种组织微阵列和脱钙处理的骨髓核心样本 | 空间生物学 | 多癌种 | 空间蛋白质组学, 空间转录组学, 高重免疫组织化学 | 单细胞分析 | 空间蛋白质表达数据, 空间转录组数据 | 多癌种组织微阵列和骨髓核心样本 | 10x Genomics, Akoya Biosciences | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 单细胞分析 | Xenium, PhenoCycler-Fusion | Xenium空间转录组学平台, PhenoCycler-Fusion高重空间蛋白质组学平台 |
| 577 | 2025-10-06 |
Divergent Clinical and Immunologic Outcomes Based on STK11 Co-mutation Status in Resectable KRAS-Mutant Lung Cancers Following Neoadjuvant Immune Checkpoint Blockade
2025-Jan-17, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-2983
PMID:39545922
|
研究论文 | 本研究探讨了可切除KRAS突变肺癌中STK11共突变状态对新辅助免疫检查点阻断治疗后临床和免疫学结果的影响 | 首次在可切除NSCLC新辅助免疫治疗背景下揭示KRAS/STK11共突变的临床意义，并通过单细胞转录组学发现T细胞转录命运的差异 | 样本量有限（7个KRASmut/STK11wt肿瘤和6个KRASmut/STK11mut肿瘤），需要更大规模研究验证 | 评估KRAS和STK11共突变对可切除非小细胞肺癌新辅助免疫治疗疗效的影响 | 可切除的KRAS突变非小细胞肺癌患者 | 癌症免疫学 | 肺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 13个肿瘤样本（7个KRASmut/STK11wt，6个KRASmut/STK11mut） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 578 | 2025-10-06 |
Immunotherapy enhances the risk of tumor oxidative stress and metastasis in lung cancer with radiation pneumonitis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1629170
PMID:40777001
|
研究论文 | 本研究揭示了放射性肺炎通过加剧肿瘤氧化应激和代谢紊乱促进肺癌免疫治疗耐药及转移的新机制 | 首次阐明放射性肺炎与免疫治疗协同作用通过氧化应激途径导致治疗抵抗和转移的生物学机制 | 主要基于小鼠模型，临床验证样本有限 | 探究放射性肺炎对肺癌免疫治疗疗效影响的分子机制 | 肺癌小鼠模型和多中心肺腺癌队列 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多中心肺腺癌队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 579 | 2025-10-06 |
Themis differentially regulates T follicular helper cell differentiation during early and late stages of chronic viral infection
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1638178
PMID:40777021
|
研究论文 | 本研究揭示了Themis在慢性病毒感染期间对滤泡辅助性T细胞分化的双阶段调控作用 | 首次发现Themis在慢性病毒感染早期促进TFH细胞分化，而在晚期抑制其分化的时间依赖性调控机制 | 研究仅限于LCMV病毒感染模型，未在其他慢性病毒感染模型中验证 | 探究Themis在慢性病毒感染期间对CD4⁺ T细胞分化为TFH细胞的调控机制 | 野生型和Themis条件性基因敲除小鼠的CD4⁺ T细胞 | 免疫学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，组织学分析，过继细胞转移 | NA | 基因表达数据，细胞表型数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 580 | 2025-10-06 |
Revolutionizing cervical cancer treatment: single-cell sequencing of TSPAN1+ tumor EPCs and immune checkpoints to assess drug sensitivity and optimize therapy
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1574174
PMID:40777026
|
研究论文 | 通过单细胞测序和多组学分析研究宫颈癌肿瘤微环境中TSPAN1+肿瘤上皮细胞亚型与免疫检查点的相互作用及其对药物敏感性的影响 | 首次在宫颈癌中系统鉴定TSPAN1+肿瘤上皮细胞亚型，并揭示其与免疫检查点的相互作用对治疗反应的调控机制 | 研究样本量有限，需要更大规模验证；机制研究尚需进一步实验证实 | 优化宫颈癌个性化治疗策略 | 宫颈癌肿瘤微环境中的肿瘤上皮细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞测序, 多组学分析 | NA | 单细胞转录组数据, 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞多组学 | NA | NA |