单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 2168 篇文献，本页显示第 541 - 560 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 541 | 2025-11-22 |
Immune snapshots along the inflammation-to-cancer road in bladder urothelium
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1685237
PMID:41256858
|
综述 | 本文综述了膀胱尿路上皮从炎症到癌症过程中免疫微环境的动态演变过程 | 整合了空间转录组学、单细胞技术和尿液外泌体分析等新技术，提供了炎症-癌症连续过程中的精确免疫快照 | 作为小型综述，可能未涵盖该领域所有最新研究进展 | 阐明膀胱尿路上皮从炎症到癌症过程中的免疫学转变机制 | 膀胱尿路上皮的免疫微环境 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 空间转录组学,单细胞技术,尿液外泌体分析 | NA | 转录组数据,单细胞数据,外泌体数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 542 | 2025-11-22 |
Machine learning-driven exploration of therapeutic targets for atrial fibrillation-joint analysis of single-cell and bulk transcriptomes and experimental validation
2025, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2025.1652467
PMID:41257259
|
研究论文 | 通过机器学习分析心房颤动患者的转录组数据，探索新的治疗靶点和分子机制 | 结合单细胞和批量转录组数据的联合分析，应用三种机器学习算法筛选关键基因，并通过实验验证 | 样本来源仅限于GEO数据库和右心耳组织，需要进一步扩大样本验证 | 探索心房颤动的治疗靶点和诊断生物标志物 | 心房颤动患者的转录组数据和右心耳组织样本 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, RT-qPCR, western blot | LASSO, SVM-RFE, 随机森林, 列线图模型 | 转录组数据, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 543 | 2025-11-22 |
The analysis reveals novel hub genes and pathways associated with Tetralogy of Fallot
2025, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2025.1604939
PMID:41257258
|
研究论文 | 本研究通过整合bulk和单细胞RNA-seq数据，识别了法洛四联症相关的核心基因和通路 | 首次在单细胞分辨率下验证法洛四联症中脂肪酸代谢通路在心肌细胞中的特异性富集 | 样本量有限，仅使用了两个数据集进行验证 | 探索法洛四联症的核心基因和通路，为疾病预防和干预提供潜在靶点 | 法洛四联症患者的心脏组织 | 生物信息学 | 先天性心脏病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, qRT-PCR, 功能富集分析 | NA | 基因表达数据 | 基于两个数据集GSE146220和GSE217772 | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 544 | 2025-11-21 |
Immune Microenvironmental Differences Between Obese and Healthy People in a High-Altitude Hypoxic Environment
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S562386
PMID:41243986
|
研究论文 | 比较肥胖与正常体重个体在高海拔缺氧环境下的免疫微环境差异 | 首次在单细胞水平揭示肥胖个体在高海拔缺氧环境下Treg细胞比例减少的免疫机制 | 探索性研究，样本量有限，需要进一步验证 | 探索肥胖加剧高海拔缺氧反应的发病机制并寻找潜在生物标志物 | 肥胖与正常体重个体及动物模型 | 单细胞组学 | 高原病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 545 | 2025-11-21 |
The Role of Fibroblasts in Atopic Dermatitis: Establishing Proinflammatory Microenvironments and Mediating Cellular Crosstalk
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S558464
PMID:41243996
|
综述 | 本文总结了成纤维细胞在特应性皮炎中通过建立促炎微环境和介导细胞间通讯的作用机制 | 突破传统聚焦免疫细胞和角质形成细胞的研究局限，系统阐述成纤维细胞在AD中的主动免疫调节功能 | NA | 深入理解特应性皮炎的致病机制并为常规治疗反应不佳患者提供新治疗策略 | 特应性皮炎中的成纤维细胞 | NA | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 546 | 2025-11-21 |
1-stearoyl-2-arachidonoyl-driven B Cell metabolic dysregulation in chronic rhinosinusitis with nasal polyps: insights from Mendelian randomization and single-cell RNA sequencing
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1719897
PMID:41244838
|
研究论文 | 通过孟德尔随机化和单细胞RNA测序研究慢性鼻窦炎伴鼻息肉中B细胞代谢失调的机制 | 首次发现HLA-DR+ CD33- B细胞和脂质代谢物1-硬脂酰-2-花生四烯酰在CRSwNP中的风险作用，并揭示代谢影响B细胞亚群塑造免疫微环境的新机制 | NA | 探讨慢性鼻窦炎伴鼻息肉的免疫代谢失调机制 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉患者的免疫细胞和代谢物 | 生物信息学 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 | 单细胞RNA测序,孟德尔随机化,基因集富集分析,机器学习 | 机器学习 | 单细胞RNA测序数据,代谢组数据,基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 547 | 2025-11-21 |
Decoding the immune microenvironment in osteosarcoma: new insights into checkpoints, vaccines, and CAR-T cells
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1702219
PMID:41244900
|
综述 | 本文全面概述骨肉瘤的免疫微环境特征及当前新兴的免疫治疗策略 | 整合单细胞转录组学对骨肉瘤免疫微环境的新见解，系统探讨检查点抑制剂、肿瘤疫苗和CAR-T细胞等联合治疗策略 | 作为综述文章，未提供原始实验数据验证提出的治疗策略 | 改善骨肉瘤患者临床预后的免疫治疗策略研究 | 骨肉瘤及其肿瘤微环境中的免疫细胞 | 肿瘤免疫学 | 骨肉瘤 | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 548 | 2025-11-21 |
Spatial transcriptomics reveals an unexpected impact of tau and tau pathology on the expression of transthyretin
2025, Frontiers in aging neuroscience
IF:4.1Q2
DOI:10.3389/fnagi.2025.1656850
PMID:41245137
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术揭示了tau蛋白对转甲状腺素蛋白(TTR)表达的意外调控作用 | 首次发现tau蛋白对Ttr mRNA和蛋白表达的调控作用，揭示了tau可能通过影响TTR参与Aβ疾病进展的反馈环路 | 研究仅使用小鼠模型，需要在人类样本中进一步验证 | 探究tau蛋白如何改变大脑中mRNA表达 | THY-Tau22转基因小鼠和TauKO基因敲除小鼠 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学，免疫荧光 | NA | 空间转录组数据，免疫荧光图像 | 两种小鼠模型（THY-Tau22和TauKO） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 549 | 2025-11-21 |
Functional analysis of TWIST1 domains regulating smooth muscle cell phenotype
2025, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2025.1659847
PMID:41246007
|
研究论文 | 本研究通过分析TWIST1转录因子的不同结构域和二聚体组成对平滑肌细胞表型的调控机制 | 首次系统解析TWIST1不同结构域和不同二聚体组合对平滑肌细胞表型调控的独立功能 | 研究主要基于体外细胞实验，需要进一步体内验证 | 阐明TWIST1在血管疾病中调控平滑肌细胞表型的分子机制 | 人冠状动脉平滑肌细胞(HCASMCs) | 分子生物学 | 心血管疾病 | RNA测序, 增殖和迁移实验 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 550 | 2025-11-21 |
Cholesterol metabolism shapes immune low-response states in LUAD: a multi-omics cholesterol metabolism signature predicts immunotherapy benefit and identifies DHCR7 as a therapeutic target
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1696360
PMID:41246332
|
研究论文 | 本研究开发了基于胆固醇代谢基因的特征模型，用于预测肺腺癌患者的预后和免疫治疗反应，并鉴定DHCR7作为潜在治疗靶点 | 首次在肺腺癌中建立多组学胆固醇代谢特征模型，发现DHCR7基因与免疫抑制的关联，并验证其作为免疫治疗增敏靶点的潜力 | 研究主要基于回顾性队列分析，需要更多前瞻性研究验证 | 探究胆固醇代谢在肺腺癌免疫微环境中的作用及其对免疫治疗的影响 | 肺腺癌患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 多组学分析，单细胞转录组，免疫组化，流式细胞术，体外和体内实验 | 特征模型 | 基因组数据，转录组数据，单细胞数据，实验数据 | 1,682例肺腺癌样本（包括7个初治队列和3个免疫治疗队列） | NA | 单细胞RNA-seq，多重免疫组化，流式细胞术 | NA | NA |
| 551 | 2025-11-21 |
Single-cell and spatial transcriptomics integration reveals FAM49B promotes tumor-associated macrophages polarization in colorectal cancer via the MK pathway
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1682637
PMID:41246334
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和空间转录组学数据，揭示了FAM49B通过MDK-NCL轴促进结直肠癌中肿瘤相关巨噬细胞极化的机制 | 首次发现FAM49B通过MDK-NCL信号轴调控肿瘤相关巨噬细胞极化，揭示了其在塑造免疫抑制肿瘤微环境中的新功能 | 样本量相对有限（16例患者），需要更大规模的研究验证 | 探究FAM49B在结直肠癌免疫抑制肿瘤微环境形成中的作用机制 | 结直肠癌患者组织样本、恶性上皮细胞、肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、蛋白质组学分析 | CellChat分析、伪时间轨迹分析 | 单细胞RNA-seq数据、空间转录组数据、bulk RNA数据 | 16例结直肠癌患者的33个单细胞RNA-seq样本和2对配对空间转录组样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 552 | 2025-11-21 |
Integrative multi-omics analysis of gastric cancer evolution from precancerous lesions to metastasis identifies a deep learning-based prognostic model
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1680517
PMID:41246350
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和深度学习技术，构建了胃癌从癌前病变到转移的演化图谱和预后模型 | 首次在胃癌中整合多组学数据揭示肿瘤微环境动态重塑过程，并开发基于深度学习的预后预测模型 | 样本量相对有限，仅包含6种组织类型的252,399个细胞 | 解析胃癌进展过程中肿瘤微环境的细胞异质性、空间组织和细胞间通讯 | 胃炎、肠化生、原发肿瘤、癌旁正常组织和转移病灶 | 数字病理 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, WGCNA, 深度学习 | 深度学习模型 | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 临床数据 | 252,399个细胞来自6种组织类型 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 553 | 2025-11-20 |
MetaLigand: A database for predicting non-peptide ligand mediated cell-cell communication
2025-Jan-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.14.633094
PMID:39868215
|
研究论文 | 介绍MetaLigand数据库工具，用于预测非肽配体介导的细胞间通讯 | 整合233种非肽配体的生物合成酶、转运蛋白基因和受体基因数据，结合从头合成和补救合成途径提高预测准确性 | NA | 开发预测非肽配体-受体相互作用和细胞间通讯的工具 | 非肽配体（脂质、氨基酸、碳水化合物、非肽神经递质和激素）及其介导的细胞间通讯 | 生物信息学 | 年龄相关性黄斑变性 | 转录组数据分析，单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 转录组数据，单细胞RNA测序数据，空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 554 | 2025-11-20 |
Plasma Proteome Profiling Identifies Biomarkers and Potential Drug Targets for Non-Small Cell Lung Cancer
2025, International journal of medical sciences
IF:3.2Q1
DOI:10.7150/ijms.107109
PMID:41049426
|
研究论文 | 通过血浆蛋白质组分析和遗传学方法识别非小细胞肺癌的潜在生物标志物和药物靶点 | 首次通过蛋白质组范围的孟德尔随机化分析识别出8种与NSCLC病因有因果关系的血浆蛋白，并进行了多方法验证 | 研究主要基于遗传数据，需要进一步实验验证这些蛋白质在NSCLC发病机制中的具体作用 | 识别非小细胞肺癌的新型生物标志物和潜在药物靶点 | 肺腺癌和肺鳞状细胞癌患者 | 生物信息学 | 肺癌 | 蛋白质组分析、孟德尔随机化、GWAS、scRNA-seq、基因功能分析 | 孟德尔随机化、贝叶斯共定位、SMR、HEIDI | 遗传数据、蛋白质组数据、基因表达数据 | LUAD: 11,273例(GWAS) + 1,590例(FinnGen); LUSC: 7,426例(GWAS) + 1,510例(FinnGen) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 555 | 2025-11-20 |
Immune-related gene signatures of thin endometrium: a transcriptomic and single-cell study
2025, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2025.1626451
PMID:41113715
|
研究论文 | 通过转录组学和单细胞研究揭示薄型子宫内膜的免疫相关基因特征 | 首次整合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，发现薄型子宫内膜中免疫相关基因的差异表达特征 | 样本量有限，需要更大规模研究验证发现 | 识别薄型子宫内膜相关的差异表达基因和免疫特征 | 薄型子宫内膜患者和健康对照者的子宫内膜组织 | 转录组学 | 生殖系统疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, qPCR | NA | 基因表达数据 | 薄型子宫内膜患者和健康对照者的子宫内膜组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 556 | 2025-11-19 |
Distinct causes of three phenotypic hallmarks of hematopoietic aging
2025-Jan-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.14.632900
PMID:39868295
|
研究论文 | 本研究通过实验模型解析NFkappaB活性在造血衰老表型中的作用机制 | 建立了NFkappaB活性升高实验模型，首次揭示造血衰老三大表型由不同调控机制驱动 | 实验模型可能无法完全模拟自然衰老过程 | 解析造血衰老表型的分子机制 | 造血干细胞(HSC)和骨髓微环境 | 单细胞组学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序,表观基因组学,转录组学 | IkappaBminus实验模型 | 单细胞RNA测序数据,表观基因组数据,转录组数据 | 老年小鼠和人类HSC数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 557 | 2025-11-19 |
Single-Cell RNA-Seq Reveals Adventitial Fibroblast Alterations during Mouse Atherosclerosis
2025-Jan-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.05.616802
PMID:39868275
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示小鼠动脉粥样硬化过程中外膜成纤维细胞的动态变化 | 首次在动脉粥样硬化发生过程中对外膜细胞进行单细胞RNA测序分析，并发现SERPINH1基因在成纤维细胞功能中的关键作用 | 研究仅使用雄性Ldlr -/-小鼠模型，样本量较小（每组两个样本，每个样本由三只小鼠混合） | 探究外膜细胞在动脉粥样硬化中的作用机制 | 小鼠主动脉外膜细胞和人类外膜成纤维细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 雄性Ldlr -/-小鼠，每组两个样本（每个样本由三只小鼠混合） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 558 | 2025-11-18 |
Targeting Ferroptosis Restores the Antiviral Activity of CD8+ T Cells During Chronic Hepatitis B Virus Infection
2025, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101612
PMID:40803501
|
研究论文 | 本研究揭示铁死亡是慢性乙型肝炎病毒感染中CD8+ T细胞功能失调的关键机制，并证明靶向铁死亡可恢复其抗病毒活性 | 首次发现HBV特异性CD8+ T细胞在慢性感染中发生铁死亡，并阐明棕榈酸和TGF-β1通过调控CD36和GPX4协同促进该过程的机制 | NA | 探究慢性HBV感染中CD8+ T细胞功能失调的机制及干预策略 | 慢性乙型肝炎患者的CD8+ T细胞，特别是HBV特异性CD8+ T细胞 | 免疫学 | 乙型肝炎 | 流式细胞术, 电子显微镜, 单细胞RNA测序, MHC I四聚体技术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据, 电子显微镜图像 | 慢性乙型肝炎患者的CD8+ T细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 559 | 2025-11-17 |
Single-cell atlas of human penile corpus cavernosum reveals cellular and functional heterogeneity of aging-related erectile dysfunction
2025, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2025.1671482
PMID:41234230
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建人类阴茎海绵体细胞图谱，揭示与衰老相关的勃起功能障碍的细胞和功能异质性 | 首次在单细胞分辨率下揭示衰老阴茎海绵体的细胞异质性和免疫微环境特征，识别了关键细胞亚群和分子特征 | 样本量较小（6例ARED患者），且对照组使用公开数据 | 阐明衰老相关勃起功能障碍的细胞和转录组异质性及免疫微环境 | 人类阴茎组织样本 | 单细胞组学 | 勃起功能障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 6例老年ARED患者（4例轻度ED，2例重度ED）和3例年轻健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 560 | 2025-11-17 |
A spatially resolved single-cell landscape of colorectal cancer liver metastasis reveals a stromal-tumor glycolytic signaling interaction
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1687485
PMID:41234356
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组数据，揭示了结直肠癌肝转移中基质-肿瘤细胞通过HGF-MET-MYC信号轴形成糖酵解代谢生态位的空间机制 | 首次在空间分辨率水平发现高恶性度CRC亚群与基质成纤维细胞的空间共定位，并揭示HGF-MET-MYC信号轴驱动的糖酵解代谢生态位 | 样本数量有限（35个单细胞RNA-seq数据集），主要依赖计算分析需进一步实验验证 | 解析结直肠癌肝转移的分子和空间动态机制 | 结直肠癌原发肿瘤、肝转移灶及匹配正常组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, inferCNV, CytoTRACE, CellChat, NicheNet, 体外共培养, 免疫组织化学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 35个单细胞RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |