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当前共找到 1950 篇文献，本页显示第 541 - 560 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 541 | 2025-09-06 |
Correction: Single-cell and spatial transcriptomics reveal a stress-induced EMT-like epithelial subset driving immune activation in silica-injured lung
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1671133
PMID:40909286
|
correction | 对先前发表的关于矽肺损伤肺中应激诱导EMT样上皮亚群驱动免疫激活的单细胞与空间转录组学研究进行更正 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 542 | 2025-10-06 |
WITHDRAWN: Retinal Phenotypes and Single-cell Sequencing Analysis of Ush2a Knockout Mice
2025-01-28, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2025.110247
PMID:39884543
|
撤稿文章 | 本文因出版流程错误已被编辑要求撤回 | NA | 因出版流程错误导致文章被撤回，无法获取有效研究内容 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 543 | 2025-10-06 |
Stimulating the regenerative capacity of the human retina with proneural transcription factors in 3D cultures
2025-Jan-21, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2417228122
PMID:39823300
|
研究论文 | 本研究通过在3D培养系统中使用proneural转录因子刺激人类视网膜中Müller胶质细胞的再生能力 | 首次在成人人类视网膜中证明Müller胶质细胞可通过转录因子重编程生成新神经元 | 研究基于体外培养系统，尚未进行体内验证 | 开发视网膜退行性疾病的再生医学治疗方法 | 人类胎儿视网膜组织和成人死后视网膜组织 | 再生医学 | 视网膜退行性疾病 | 慢病毒载体转导，免疫组化，单细胞RNA测序，电生理学 | 3D培养系统 | 基因表达数据，电生理数据，图像数据 | 人类胎儿和成人视网膜组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 544 | 2025-10-06 |
An integrated single-cell and spatial transcriptomic atlas of thyroid cancer progression identifies prognostic fibroblast subpopulations
2025-Jan-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.08.631962
PMID:39829764
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研究论文 | 通过整合单细胞测序和空间转录组学构建甲状腺癌进展图谱，识别与预后相关的成纤维细胞亚群 | 首次结合单细胞测序、空间转录组学和批量RNA测序，系统定义甲状腺癌中基质细胞亚群和肿瘤-基质相互作用 | NA | 解析甲状腺癌进展过程中的基质细胞重组机制 | 甲状腺癌组织样本 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序 | NA | 基因表达数据,空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序 | NA | NA |
| 545 | 2025-10-06 |
Supervised Gromov-Wasserstein Optimal Transport with Metric-Preserving Constraints
2025, SIAM journal on mathematics of data science
IF:1.9Q1
DOI:10.1137/24m1630499
PMID:40893388
|
研究论文 | 提出了一种带度量保持约束的监督Gromov-Wasserstein最优传输方法 | 在Gromov-Wasserstein最优传输中引入无穷大成本张量条目，通过求解最小顶点覆盖问题将高阶约束转化为耦合矩阵约束 | NA | 开发能够控制距离保持程度的监督最优传输方法 | 合成数据集和单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 监督Gromov-Wasserstein最优传输 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 546 | 2025-10-06 |
Machine Learning-Derived Neddylation Gene Signature for Predicting Prognosis and Immunotherapy Benefits in Colorectal Cancer
2025, ImmunoTargets and therapy
IF:6.2Q1
DOI:10.2147/ITT.S532644
PMID:40894303
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于neddylation相关基因的机器学习特征模型，用于预测结直肠癌患者的预后和免疫治疗反应 | 首次结合单细胞RNA测序和多种机器学习算法构建neddylation相关基因特征模型，系统分析neddylation在结直肠癌中的作用 | 需要进一步验证 | 探索neddylation在结直肠癌中的作用并开发预后预测模型 | 结直肠癌患者 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | 十种机器学习算法 | 基因表达数据 | TCGA和GEO数据库中的结直肠癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 547 | 2025-10-06 |
Cellular interactions and Ion channel signatures in atrial fibrillation remodeling: insights from single-cell analysis and machine learning
2025, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2025.1615574
PMID:40894480
|
研究论文 | 通过单细胞分析和机器学习方法研究心房颤动中心脏结构重塑的细胞相互作用和电重塑的离子通道标志物 | 首次结合单细胞RNA测序和机器学习算法系统分析AF的结构和电重塑机制，识别了关键的细胞亚型和离子通道标志基因 | 样本量有限，研究结果需要在更大规模队列中验证 | 阐明心房颤动的结构和电重塑机制，识别潜在的生物标志物和治疗靶点 | 心房颤动患者和窦性心律对照者的心房成纤维细胞 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 机器学习, 差异表达分析, 细胞轨迹分析, 细胞间相互作用分析 | LASSO, SVM | 单细胞RNA测序数据, 微阵列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 548 | 2025-10-06 |
eQTL and multi-omics integration reveal PPIH as a prognostic and immunotherapeutic biomarker
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1647722
PMID:40895540
|
研究论文 | 通过整合多组学数据识别PPIH作为跨癌种的预后和免疫治疗生物标志物 | 首次通过孟德尔随机化整合eQTL和GWAS数据，结合单细胞转录组分析系统鉴定PPIH的泛癌生物标志物潜力 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证仅限于肝癌细胞系 | 系统识别跨癌种的候选生物标志物并评估其临床价值 | 食管腺癌、胃癌、透明细胞肾细胞癌和肝细胞癌等多种恶性肿瘤 | 生物信息学 | 多种癌症 | 孟德尔随机化, 单细胞RNA-seq, 多组学整合分析 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 多组学整合 | NA | NA |
| 549 | 2025-10-06 |
A fusion ORF3a-E subgenomic RNA involved in SARS-CoV-2 infection efficacy by influencing cellular protein synthesis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1619538
PMID:40895568
|
研究论文 | 本研究鉴定了一种SARS-CoV-2的融合ORF3a-E亚基因组RNA，并揭示其通过调控细胞蛋白合成影响病毒感染效能的机制 | 首次发现并表征了SARS-CoV-2中具有双重编码功能的ORF3a-E融合亚基因组RNA及其在病毒生命周期中的关键作用 | 研究主要基于细胞系模型，尚未在动物模型或临床样本中验证 | 探究SARS-CoV-2亚基因组RNA在病毒感染过程中的功能机制 | SARS-CoV-2病毒及其感染的16HBE人支气管上皮细胞系 | 病毒学 | COVID-19 | 单细胞测序 | NA | RNA测序数据 | SARS-CoV-2感染的16HBE细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 550 | 2025-10-06 |
The osteosarcoma immune microenvironment in progression: PLEK as a prognostic biomarker and therapeutic target
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1651858
PMID:40895569
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析发现PLEK是骨肉瘤的预后生物标志物和免疫代谢调控枢纽 | 首次揭示PLEK在骨肉瘤免疫微环境中的核心作用，连接免疫浸润与代谢重编程 | 研究样本量有限，功能验证主要在体外进行 | 鉴定骨肉瘤中的免疫代谢生物标志物 | 骨肉瘤组织和肿瘤免疫微环境 | 生物信息学 | 骨肉瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, qRT-PCR, Western blot, siRNA | CytoHubba算法, 蛋白质相互作用网络 | 转录组数据, 单细胞数据 | TCGA/GTEx数据库和GSE162454单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 551 | 2025-10-06 |
Targeting macrophages and ion homeostasis in T2D: new genes and therapeutic pathways identified
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1514243
PMID:40895573
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和机器学习方法，探索了2型糖尿病患者中巨噬细胞特异性基因表达与异常血单价无机阳离子浓度相关基因的交叉作用 | 首次整合单细胞RNA测序与机器学习识别巨噬细胞中与离子稳态相关的关键基因，并构建了高精度的T2D预测模型 | 样本量相对有限（44例），需要更大规模研究验证发现 | 识别2型糖尿病中巨噬细胞与离子稳态相关的关键基因和潜在治疗靶点 | 2型糖尿病患者的胰岛细胞，特别是巨噬细胞 | 机器学习 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序，机器学习，PPI网络分析，调控网络分析 | GBM | 单细胞RNA测序数据 | 44例（27例非糖尿病患者，17例2型糖尿病患者） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 552 | 2025-10-06 |
Transcriptomic features of immune inflammation and neural plasticity associated with early neurological improvement in acute ischemic stroke patients with large vessel occlusion
2025, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2025.1581758
PMID:40896336
|
研究论文 | 本研究通过外周血mRNA转录组分析揭示了大血管闭塞性急性缺血性卒中患者早期神经功能改善的免疫炎症和神经可塑性相关分子特征 | 首次系统揭示ENI患者外周血转录组特征，发现免疫激活与神经可塑性抑制的动态平衡机制 | 样本量较小（仅20例），回顾性研究设计 | 探究大血管闭塞性急性缺血性卒中患者血管内取栓后早期神经功能改善的分子机制 | 急性缺血性卒中伴大血管闭塞患者 | 生物信息学 | 缺血性卒中 | mRNA转录组测序，生物信息学分析 | NA | RNA测序数据 | 20例患者（13例ENI组，7例非ENI组） | NA | bulk RNA-seq | NA | NA |
| 553 | 2025-10-06 |
Marker genes reveal dynamic features of cell evolving processes
2025, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbaf185
PMID:40896714
|
研究论文 | 通过分析单细胞RNA测序数据揭示细胞演化过程中关键基因的动态特征 | 发现关键基因在细胞分支前后的不同统计特征和表达模式，以及基因调控强度在伪时间轨迹上的变化规律 | 仅分析了四种特定细胞类型的数据集，需要更多验证 | 揭示细胞命运决定过程中基因表达的动态特征 | 小鼠胚胎细胞、小鼠胚胎成纤维细胞、人类骨髓和肠道类器官 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 基因表达数据 | 四个单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 554 | 2025-10-06 |
SEMA3C regulates tumor-associated macrophage phenotype and influences lung cancer cell migration and invasion through VNN1
2025 Jan-Dec, Human & experimental toxicology
IF:2.7Q3
DOI:10.1177/09603271251376577
PMID:40901786
|
研究论文 | 本研究探讨了SEMA3C通过VNN1调控肿瘤相关巨噬细胞表型并影响肺癌细胞迁移和侵袭的机制 | 首次揭示了SEMA3C通过VNN1介导的CAFs与巨噬细胞相互作用调控TAM极化的新机制 | 研究主要基于体外实验，缺乏体内验证；样本来源和数量有限 | 探究肿瘤相关巨噬细胞在肺腺癌细胞侵袭迁移中的作用机制 | 肺腺癌细胞、肿瘤相关巨噬细胞、癌症相关成纤维细胞 | 单细胞分析 | 肺癌 | 单细胞测序, Western blot, Transwell迁移侵袭实验, 免疫荧光染色 | NA | 单细胞测序数据, 实验数据 | GSE131907数据集中的肺腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 555 | 2025-10-06 |
Multi-omics analysis unveils the role of inflammatory cancer-associated fibroblasts in chordoma progression
2025-01, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6369
PMID:39611243
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研究论文 | 通过多组学分析揭示炎症性癌症相关成纤维细胞在脊索瘤进展中的作用 | 首次在脊索瘤中发现并表征了炎症性癌症相关成纤维细胞(iCAF)亚群，揭示了其空间分布特征和促癌机制 | 样本量相对有限，需要更大规模的研究验证 | 探究脊索瘤中癌症相关成纤维细胞的异质性、空间分布和临床意义 | 脊索瘤患者肿瘤样本和正常髓核样本 | 数字病理学 | 脊索瘤 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序,多重定量免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,批量转录组数据,免疫荧光图像 | 7个肿瘤样本和4个正常髓核样本用于scRNA-seq，126例患者用于批量RNA-seq分析，116例患者用于QIF验证 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序,多重定量免疫荧光 | NA | NA |
| 556 | 2025-10-06 |
Exploring the Expanded Role of Astrocytes in Primate Brain Evolution via Changes in Gene Expression
2025, Brain, behavior and evolution
DOI:10.1159/000544004
PMID:39907990
|
综述 | 探讨灵长类大脑进化中星形胶质细胞基因表达变化及其功能扩展 | 聚焦灵长类特异性星形胶质细胞进化，结合新型技术研究基因表达调控机制 | 主要基于现有文献综述，缺乏原始实验数据验证 | 解析星形胶质细胞在灵长类大脑进化中的功能演化和分子机制 | 灵长类星形胶质细胞 | 神经科学 | 阿尔茨海默病,帕金森病 | 单细胞RNA测序,诱导多能干细胞技术 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 557 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptome Sequencing and Analysis Provide a New Approach for the Treatment of Small Cell Neuroendocrine Carcinoma of the Cervix
2025, Neuroendocrinology
IF:3.2Q2
DOI:10.1159/000542833
PMID:39602898
|
研究论文 | 首次通过单细胞转录组测序揭示宫颈小细胞神经内分泌癌的分子特征和肿瘤微环境 | 首次对宫颈小细胞神经内分泌癌进行单细胞转录组测序，揭示其细胞分子图谱和肿瘤进展途径 | 仅分析单个患者肿瘤样本，样本量较小 | 研究宫颈小细胞神经内分泌癌的分子特征、起源和发病机制 | 宫颈小细胞神经内分泌癌患者肿瘤组织和健康宫颈组织 | 单细胞测序 | 宫颈小细胞神经内分泌癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1例SCNECC患者肿瘤样本+1例公共数据库健康宫颈组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 558 | 2025-10-06 |
Central control of dynamic gene circuits governs T cell rest and activation
2025-Jan, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08314-y
PMID:39663454
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研究论文 | 通过CRISPR筛选和单细胞转录组学揭示MED12调控T细胞静息与激活状态转换的动态基因回路 | 发现约90%的IL-2Rα调控因子在不同细胞类型和刺激状态下具有可变效应，其中MED12作为动态协调者通过COMPASS复合物控制组蛋白甲基化 | 研究主要聚焦于CD4 T细胞，未涵盖其他免疫细胞类型 | 阐明T细胞在不同状态下维持身份和响应环境信号的动态基因调控机制 | 原代人CD4 T细胞 | 基因调控网络 | 免疫相关疾病 | CRISPR筛选, 单细胞转录组学, 免疫沉淀-质谱分析 | NA | 基因表达数据, 蛋白质相互作用数据 | 多种原代人CD4 T细胞环境 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 559 | 2025-10-06 |
Cholinergic waves have a modest influence on the transcriptome of retinal ganglion cells
2025-Jan-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.05.627027
PMID:39713433
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析胆碱能波对小鼠视网膜神经节细胞转录组的影响 | 首次在单细胞水平揭示胆碱能波对视网膜神经节细胞转录组的类型特异性调控作用，而非普遍性影响 | 转录组变化幅度相对较小，仅关注出生后第一周特定发育阶段 | 探究β2烟碱型乙酰胆碱受体缺失对单个功能类型视网膜神经节细胞基因表达的影响 | 野生型和β2KO小鼠的视网膜神经节细胞 | 单细胞转录组学 | 视觉系统发育障碍 | 单细胞RNA测序, 原位杂交, 全细胞记录 | NA | 单细胞转录组数据, 电生理数据 | 野生型和β2KO小鼠出生后第一周的视网膜神经节细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 560 | 2025-10-06 |
Toll-like receptor agonists promote the formation of tertiary lymphoid structure and improve anti-glioma immunity
2025-Jan-12, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noae167
PMID:39188155
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研究论文 | 本研究通过颅内给予Toll样受体激动剂成功诱导胶质瘤微环境中三级淋巴结构形成，增强抗胶质瘤免疫反应 | 首次在胶质瘤微环境中成功诱导三级淋巴结构形成，并发现巨噬细胞/小胶质细胞和Th17细胞分别作为“LTo”和“LTi”细胞通过LTα/β-LTβR相互作用促进TLS形成 | 临床研究仅为初步探索性研究，样本量有限，需要更大规模的临床试验验证 | 探索在胶质瘤微环境中诱导三级淋巴结构形成的治疗策略，改善抗胶质瘤免疫治疗效果 | 胶质瘤小鼠模型和初步临床研究患者 | 肿瘤免疫学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序，BCR/TCR测序，染色分析，抗体中和 | NA | 基因表达数据，序列数据，图像数据 | 胶质瘤荷瘤小鼠和初步临床研究患者（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |