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当前共找到 2188 篇文献，本页显示第 481 - 500 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 481 | 2026-01-01 |
TMEM106A mediates atherosclerosis progression through macrophage-centered immune responses and chemokine signaling
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1681645
PMID:41459498
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研究论文 | 本研究揭示了跨膜蛋白TMEM106A通过调控巨噬细胞介导的免疫反应和趋化因子信号通路，促进动脉粥样硬化进展 | 首次系统性地将TMEM106A鉴定为动脉粥样硬化的关键介质，并通过多组学分析和实验验证阐明了其在巨噬细胞中的特异性功能和分子机制 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系，人类样本验证有限；TMEM106A的具体下游信号网络仍需进一步探索 | 阐明TMEM106A在动脉粥样硬化发病机制中的作用及其临床相关性 | 动脉粥样硬化患者样本、ApoE-/-小鼠模型、RAW264.7巨噬细胞系 | 生物信息学与分子生物学 | 心血管疾病 | 转录组学分析、单细胞RNA-seq、免疫浸润分析、细胞间通讯分析、基因沉默 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 多个公共数据集（GSE43292, GSE100927, GSE28829, GSE159677）及ApoE-/-小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 482 | 2026-01-01 |
Integrative bulk and single-cell transcriptome analyses reveal integrated stress response-related biomarkers in periodontitis with experimental validation
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1705047
PMID:41459503
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研究论文 | 本研究通过整合批量与单细胞转录组分析，揭示了牙周炎中与整合应激反应相关的生物标志物 | 首次整合批量与单细胞RNA测序数据，识别出BTG2、DERL3、FOS、HSPA13和YOD1作为牙周炎的新型生物标志物，并确定T细胞为关键细胞类型 | 研究主要基于公共数据库的转录组数据，实验验证仅限于RT-qPCR，缺乏更深入的体内功能验证 | 探究整合应激反应相关生物标志物在牙周炎发病机制中的作用 | 牙周炎相关的转录组数据及候选生物标志物 | 生物信息学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序, RT-qPCR | 机器学习 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 483 | 2026-01-01 |
Macrophage polarization: molecular mechanisms, disease implications, and targeted therapeutic strategies
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1732718
PMID:41459510
|
综述 | 本文综述了巨噬细胞极化的分子机制、疾病意义及靶向治疗策略 | 超越经典的M1/M2二分法，强调极化状态的连续性和动态性，并整合代谢重编程、表观遗传机制及新兴治疗策略 | 临床转化面临脱靶效应、递送效率低、微环境依赖性等挑战 | 探讨巨噬细胞极化的分子基础及其在疾病中的作用，并综述靶向治疗策略 | 巨噬细胞 | NA | NA | 单细胞组学、空间转录组学、计算建模、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 484 | 2026-01-01 |
Single-cell and bulk transcriptomics reveal a CD8+ T-cell gene signature predicting prognosis in diffuse large B-cell lymphoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1685541
PMID:41459519
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组数据，建立了一个CD8⁺ T细胞相关的预后特征，用于预测弥漫性大B细胞淋巴瘤患者的生存和CAR-T疗法疗效 | 首次结合单细胞RNA测序和批量转录组数据分析DLBCL中CD8⁺ T细胞的异质性，并构建了一个基于CD8⁺ T细胞基因的预后模型，该模型能有效分层患者风险并预测CAR-T治疗反应 | 研究样本量相对有限（单细胞数据来自29个样本），且为回顾性分析，需要进一步的前瞻性验证 | 揭示DLBCL中CD8⁺ T细胞的异质性，并开发一个预后基因特征以预测患者生存和治疗反应 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤患者样本中的CD8⁺ T细胞 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | LASSO回归, 多变量Cox分析 | 转录组数据 | 单细胞数据来自29个样本（28名个体），包括DLBCL和反应性淋巴结/扁桃体样本；批量RNA-seq数据集未指定具体样本数 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 485 | 2026-01-01 |
Identification and validation of biomarkers related to centrosome replication in ulcerative colitis based on bulk transcriptome, single-cell RNA sequencing and experiments
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1627926
PMID:41459538
|
研究论文 | 本研究通过整合批量转录组、单细胞RNA测序和实验验证，识别并验证了与溃疡性结肠炎中中心体复制相关的六个生物标志物 | 首次结合批量转录组、单细胞RNA测序和多种机器学习算法，系统性地识别并验证了与中心体扩增相关的基因在溃疡性结肠炎中的生物标志物作用 | 研究主要依赖于公共数据库数据，样本来源可能有限；实验验证部分可能未涵盖所有已识别的生物标志物 | 探究中心体扩增相关基因在溃疡性结肠炎进展中的相关性并识别潜在生物标志物 | 溃疡性结肠炎患者样本与对照样本 | 生物信息学 | 溃疡性结肠炎 | 批量转录组测序, 单细胞RNA测序, RT-qPCR, Western blot, 免疫组织化学 | 多种机器学习算法 | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 486 | 2026-01-01 |
Macrophage activation of the TREM2-DAP12-SYK pathway shapes the adipose tissue microenvironment in obesity and unveils the therapeutic potential of natural compounds egcg and SMRR
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1694985
PMID:41459526
|
研究论文 | 本研究通过整合批量转录组学和单细胞RNA-seq数据，揭示了肥胖中脂肪组织微环境的巨噬细胞异质性，并发现TREM2-DAP12-SYK通路在肥胖相关巨噬细胞状态中的关键作用，同时评估了天然化合物EGCG和SMRR的治疗潜力 | 整合批量与单细胞转录组数据识别BMI相关基因模块和巨噬细胞调控程序，揭示TREM2-DAP12-SYK轴在肥胖相关巨噬细胞状态中的核心功能障碍，并首次评估天然化合物EGCG和SMRR通过重新激活该通路缓解肥胖的疗效 | 研究主要基于转录组数据，功能验证和机制细节需进一步实验确认，且动物模型结果向人类转化的有效性有待验证 | 阐明肥胖中脂肪组织免疫代谢失衡的关键驱动因素，并开发靶向干预策略 | 人类脂肪组织样本（批量转录组n=434，单细胞RNA-seq 24个样本）和高脂饮食诱导的肥胖小鼠模型 | 数字病理学 | 肥胖 | 批量转录组学，单细胞RNA-seq | 细胞特异性网络，亚型特异性基因调控网络，伪时间轨迹分析，细胞间通讯分析，分子对接 | 转录组数据 | 批量转录组434个样本，单细胞RNA-seq 24个脂肪组织样本共194,608个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 487 | 2026-01-01 |
Deep learning-aided inter-species-comparison reveals shared and distinct molecular patterns in cynomolgus monkey and humans following non-specific T cell activation
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1603716
PMID:41459534
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学数据和深度学习技术，比较了食蟹猴与人类在非特异性T细胞激活后的免疫反应分子模式 | 开发了一个整合变分自编码器、细胞间通讯、差异基因表达和通路富集分析的跨物种时间序列分析计算框架 | 仅使用了两个生物学重复，样本量较小；研究仅关注了PBMCs，未涉及组织特异性免疫反应 | 比较食蟹猴与人类在免疫激活后的共享和差异分子特征，以改进临床前动物模型向人类条件的转化 | 食蟹猴和健康人类的外周血单个核细胞 | 单细胞转录组学 | 免疫系统疾病 | 单细胞RNA测序 | 变分自编码器 | 单细胞转录组数据 | 两个物种各两个生物学重复，在基线、刺激后0小时、6小时和24小时四个时间点采样 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 488 | 2026-01-01 |
Construction of a prognostic model for colorectal cancer liver metastasis based on single-cell transcriptomics and regulation of the MIF pathway
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1588514
PMID:41127012
|
研究论文 | 本研究基于单细胞转录组学数据，构建了结直肠癌肝转移的预后模型，并探讨了MIF通路在转移过程中的调控作用 | 结合单细胞转录组学与批量RNA-seq数据，识别了结直肠癌肝转移过程中上皮细胞的关键基因表达变化，并构建了一个新的预后风险模型 | 研究数据主要来源于公共数据库（GEO和TCGA），需要进一步的独立队列和实验验证来确认模型的普适性 | 构建结直肠癌肝转移的预后模型并阐明MIF通路在转移中的作用机制 | 结直肠癌患者样本（含肝转移） | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | 预后风险模型 | 转录组数据 | 来自GEO和TCGA数据库的结直肠癌样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 489 | 2026-01-01 |
Correction: Construction of a prognostic model for colorectal cancer liver metastasis based on single-cell transcriptomics and regulation of the MIF pathway
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1731870
PMID:41473439
|
correction | 本文是对一篇关于基于单细胞转录组学构建结直肠癌肝转移预后模型及调控MIF通路研究的文章的更正 | NA | NA | NA | NA | NA | 结直肠癌肝转移 | 单细胞转录组学 | 预后模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 490 | 2025-12-31 |
FastCCC: A permutation-free framework for scalable, robust, and reference-based cell-cell communication analysis in single cell transcriptomics studies
2025-Jan-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.27.635115
PMID:39975391
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为FastCCC的无置换框架，用于单细胞转录组学研究中的细胞间通讯分析，该框架具有可扩展性、鲁棒性，并支持基于参考的分析 | 提出了首个无置换的CCC分析框架，利用快速傅里叶变换卷积解析计算p值；引入了模块化代数运算框架以捕获广泛的CCC模式；构建了首个涵盖19种组织类型、450多种细胞类型、约1600万细胞的人类CCC参考面板 | 未明确提及具体限制，但暗示现有CCC方法在分析复杂数据集时存在能力不足 | 开发一种可扩展、鲁棒且支持参考的单细胞转录组学细胞间通讯分析方法 | 单细胞转录组数据中的细胞间通讯 | 单细胞转录组学 | COVID-19 | 单细胞RNA-seq | 基于快速傅里叶变换的卷积模型 | 单细胞转录组数据 | 约1600万细胞（参考面板） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 491 | 2025-12-30 |
Under pressure: integrated endothelial cell response to hydrostatic and shear stresses
2025-Jan-01, Vascular biology (Bristol, England)
DOI:10.1530/VB-25-0015
PMID:41378902
|
研究论文 | 本研究通过体外模型探讨了静水压力如何影响内皮细胞对血流的响应，揭示了压力与剪切应力在内皮细胞机械转导中的协同作用 | 开发了体外模型以研究静水压力对内皮细胞血流响应的调节作用，并发现压力以剂量依赖方式调节剪切应力诱导的信号通路 | 研究主要基于体外模型，可能无法完全模拟体内复杂的血管环境 | 探究静水压力与剪切应力在内皮细胞机械转导中的相互作用及其对血管发育的影响 | 人内皮细胞及早期小鼠胚胎血管发育过程 | 细胞生物学 | 心血管疾病 | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | 转录组数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 492 | 2025-12-30 |
Integrated analysis of single-cell and bulk RNA-seq reveals MAGEA3/6-associated immune subtypes and key immune genes in gastric cancer
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0338705
PMID:41452900
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA-seq和bulk RNA-seq数据，揭示了MAGEA3/6表达与胃癌免疫亚型的关系，并识别了关键的免疫相关基因 | 首次将单细胞和bulk RNA-seq数据整合分析，鉴定出MAGEA3/6作为胃癌免疫亚型分类的关键上皮特异性基因，并发现BCL11B和PAEP等新的免疫调控靶点 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，缺乏实验验证和前瞻性临床队列验证 | 探究胃癌免疫微环境中上皮特异性基因与免疫浸润的关系，并识别潜在的免疫治疗靶点 | 胃癌组织样本 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | WGCNA, 生存分析模型 | 基因表达数据 | GSE112302单细胞数据集和TCGA-STAD队列数据 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 493 | 2025-12-29 |
SUMOylation of TRIM28 is positively modulated by the BTB/POZ domain of Kaiso
2025-Jan-23, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-025-10257-0
PMID:39847191
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研究论文 | 本文研究了Kaiso蛋白的BTB/POZ结构域在促进TRIM28蛋白SUMO化修饰中的关键作用 | 发现Kaiso的BTB/POZ结构域（而非其SIMs或近源同源物ZBTB4）足以有效促进TRIM28的超SUMO化，这类似于KRAB结构域的功能 | 未在单个TRIM28结构域中观察到Kaiso介导的SUMO化，表明TRIM28结构完整性对该过程的重要性，但具体机制仍需进一步阐明 | 探究Kaiso蛋白中哪些结构元件对TRIM28的超SUMO化是必需的 | TRIM28蛋白和Kaiso蛋白的结构域及其相互作用 | 分子生物学 | NA | 单细胞测序 | NA | 测序数据 | 小鼠胚胎单细胞测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 494 | 2025-12-29 |
Single-cell transcriptomics reveals immune remodeling of the murine lung microenvironment following chronic house dust mite exposure
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1652539
PMID:41445736
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了慢性屋尘螨暴露后小鼠肺部免疫微环境的重塑过程，并阐明了IL-1β信号通路在其中的关键作用 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘了慢性屋尘螨暴露诱导的肺部免疫细胞动态变化，并明确了IL-1β信号在调控中性粒细胞和Th17反应中的特异性作用，同时揭示了内毒素含量对免疫表型的调节效应 | 研究主要基于小鼠模型，其结论在人类中的适用性需进一步验证；同时使用了不同内毒素含量的屋尘螨提取物进行测序和验证，可能引入实验条件的不一致性 | 探究慢性屋尘螨暴露如何重塑肺部免疫微环境，并阐明IL-1β在其中的作用机制 | C57BL/6背景的野生型和Il1b缺陷型小鼠的肺部免疫细胞 | 单细胞组学 | 哮喘/慢性气道炎症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、RT-qPCR、ELISA、免疫荧光、组织病理学分析 | NA | 单细胞转录组数据、基因表达数据、蛋白表达数据、组织图像数据 | 野生型和Il1b缺陷型小鼠（具体数量未明确说明），经过5周慢性屋尘螨暴露处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 495 | 2025-12-29 |
Adrenomedullin orchestrates treatment resistance in hepatocellular carcinoma via immune microenvironment remodeling
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1721263
PMID:41450464
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据与临床注释，揭示了肝细胞癌中一种由肾上腺髓质素驱动的TACE耐药细胞亚型，并验证了其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 | 首次通过多维分析方法识别出TACE耐药的恶性细胞亚群，并确定肾上腺髓质素为调控该耐药表型的关键驱动因子 | 研究主要基于计算分析和体外/小鼠模型验证，缺乏大规模临床队列的直接验证 | 解析肝细胞癌治疗耐药的分子机制，寻找克服TACE和索拉非尼耐药的新策略 | 肝细胞癌患者样本、Huh7细胞系及小鼠异种移植模型 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, Western免疫印迹, qRT-PCR | scPAS, hdWGCNA, SCENIC | 单细胞RNA测序数据, 批量转录组数据, 临床注释 | 整合了四个单细胞RNA测序队列及TCGA-LIHC数据库和GEO存储库的数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 496 | 2025-12-29 |
Sertoli cells as a hub in testicular development and male reproductive
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1693878
PMID:41450735
|
综述 | 本文综述了Sertoli细胞在睾丸发育和男性生殖中的核心作用，强调了单细胞转录组学如何重塑我们对睾丸细胞结构和功能多样性的理解 | 利用单细胞转录组学技术重新定义了睾丸的细胞结构和功能多样性，突出了Sertoli细胞在协调多种细胞谱系发育中的关键调控作用 | 作为一篇综述文章，主要基于现有文献总结，未涉及新的实验数据或模型验证 | 探讨Sertoli细胞在睾丸发育和男性生殖中的核心调控作用及其功能障碍的病理后果 | 哺乳动物睾丸中的Sertoli细胞、生殖细胞、Leydig细胞、管周肌样细胞和睾丸巨噬细胞 | 生殖生物学 | 男性生殖障碍 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 497 | 2025-12-29 |
Sidedness matters: single-cell perspectives on left- and right-sided colorectal cancer
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1720996
PMID:41450739
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序研究在揭示左、右侧结直肠癌分子机制和肿瘤微环境差异方面的应用 | 强调了肿瘤侧性（左、右侧）在结直肠癌中的重要性，并利用单细胞RNA测序技术揭示了其作为不同多细胞生态系统的差异 | 作为一篇综述文章，主要基于现有研究进行综合，未提出新的原始数据或实验验证 | 探讨左、右侧结直肠癌在细胞和分子水平上的差异，以指导侧性特异性治疗策略 | 结直肠癌（CRC），特别是左侧结直肠癌（LCRC）和右侧结直肠癌（RCRC） | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 498 | 2025-12-29 |
Multi-Omics Integration Identifies FGF1 as a Diagnostic Biomarker and RAS-MAPK-Driven Pathogenic Factor in Osteoarthritis
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S553461
PMID:41450747
|
研究论文 | 本研究通过多组学整合分析，鉴定出FGF1作为骨关节炎的诊断生物标志物，并揭示了其通过激活RAS-MAPK通路在疾病发病机制中的关键作用 | 首次通过整合GWAS、eQTL、转录组等多组学数据，结合机器学习、孟德尔随机化和单细胞测序技术，系统性地将FGF1鉴定为骨关节炎的诊断生物标志物和致病因子，并阐明了其通过RAS-MAPK通路介导软骨破坏的具体机制 | 孟德尔随机化分析仅提供了提示性的因果证据，需要进一步的功能实验验证；研究主要基于公共数据库和体外/体内实验，缺乏大规模临床队列的独立验证 | 识别骨关节炎的潜在治疗靶点并探索相关的机制通路 | 骨关节炎相关的基因、通路和软骨细胞 | 生物信息学与多组学整合分析 | 骨关节炎 | GWAS, eQTL分析, 差异表达分析, WGCNA, PPI网络分析, 机器学习, 孟德尔随机化, 单细胞测序, 体外实验, 体内实验 | 机器学习算法 | 基因组、转录组、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 499 | 2025-12-29 |
Rank Aggregation Methods and Tools in Genomic Data Analysis
2025, Current genomics
IF:1.8Q3
|
综述 | 本文综述了基因组数据分析中的排序聚合方法及其工具，重点介绍了针对基因组学研究复杂性定制的技术及其应用 | 系统性地概述了针对基因组数据异质性、混合质量排序等挑战而专门设计的排序聚合方法，并指出了在单细胞组学和空间转录组学等新兴领域中的应用前景 | 作为一篇综述文章，未提出新的算法或模型，主要侧重于现有方法的总结和未来方向的展望 | 为研究人员提供基因组数据整合中排序聚合方法的背景知识，以有效应对数据整合的复杂性 | 基因组数据，特别是来自基因表达分析、荟萃分析、基因优先排序和生物标志物发现等领域的排序数据 | 机器学习 | NA | 排序聚合 | NA | 排序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 500 | 2025-12-29 |
COL8A1 as a pro-inflammatory mediator bridges immune evasion and therapy resistance in glioma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1727298
PMID:41451204
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和机器学习方法，鉴定出COL8A1作为胶质瘤中连接免疫逃逸和治疗抵抗的关键促炎介质 | 首次将COL8A1确定为胶质瘤炎症信号网络的核心枢纽，并系统揭示了其与免疫微环境、治疗抵抗和预后的多重关联 | 研究主要基于计算分析和体外验证，缺乏体内动物模型实验和临床样本的深入机制验证 | 探索胶质瘤中炎症信号在肿瘤进展和治疗反应中的作用，寻找新的治疗靶点和预后标志物 | 胶质瘤细胞、肿瘤微环境中的免疫细胞和基质细胞 | 生物信息学与计算生物学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、微阵列分析、机器学习算法 | CoxBoost、LASSO、随机生存森林 | 基因表达数据、生存数据、突变数据 | 18个样本中的93,027个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |