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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 461 | 2025-11-17 |
Unraveling porcine dendritic-cell diversity: welcome tDC and DC3
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1639553
PMID:41235223
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研究论文 | 本研究通过流式细胞术和RNA测序技术揭示了猪树突状细胞的新型亚群tDC和DC3 | 首次在猪血液中鉴定出与人类和小鼠对应的过渡型树突状细胞(tDC)和DC3亚群 | tDC和DC3的核心功能尚未完全阐明,需要进一步功能验证 | 解析猪树突状细胞的异质性和亚群分类 | 猪树突状细胞 | 免疫学 | NA | 流式细胞术,RNA-seq,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 462 | 2025-11-17 |
Single-cell/spatial integration reveals an MES2-like glioblastoma program orchestrated by immune communication and regulatory networks
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1699134
PMID:41235227
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研究论文 | 通过整合单细胞和空间转录组数据揭示了胶质母细胞瘤中由免疫通讯和调控网络协调的MES2样程序 | 首次整合单细胞RNA-seq、空间转录组和bulk数据系统解析胶质母细胞瘤间质程序,发现MES2样状态的空间分布特征和调控网络 | 样本量相对有限,功能验证主要在U251细胞系中进行,需要更多体内实验验证 | 解析胶质母细胞瘤间质程序的空间分布、临床意义和分子机制 | 胶质母细胞瘤患者样本和U251细胞系 | 数字病理 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组, bulk RNA-seq, 细胞功能实验 | 图神经网络(GNN), WGCNA, hdWGCNA, 贝叶斯反卷积 | 单细胞转录组, 空间转录组, bulk转录组 | TCGA队列157例, CGGA队列共225例, GBM组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 空间转录组 | 10x Visium | Visium空间转录组技术 |
| 463 | 2025-11-17 |
Integrative single-cell and spatial transcriptomics analysis reveals FLAD1 as a regulator of the immune microenvironment in hepatocellular carcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1680101
PMID:41235234
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和空间转录组学分析,揭示FLAD1作为肝细胞癌免疫微环境调节因子的作用 | 首次整合单细胞和空间转录组学技术系统分析线粒体相关基因在肝细胞癌中的作用,发现FLAD1与肿瘤免疫微环境的结构性排斥相关 | NA | 探索线粒体相关基因在肝细胞癌进展中的作用及其与免疫微环境的关联 | 肝细胞癌组织样本 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序,DNA甲基化分析,Western blotting | 九种机器学习算法的92种组合建模 | 基因表达数据,空间转录组数据,DNA甲基化数据,蛋白质印迹数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序 | NA | NA |
| 464 | 2025-11-17 |
The role of the MYL12A liquid-liquid phase separation in neutrophil improves the prognosis of acute respiratory distress syndrome: a multi-omics analysis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1662680
PMID:41235230
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了MYL12A液-液相分离在急性呼吸窘迫综合征中性粒细胞中的保护作用机制 | 首次发现MYL12A通过磷酸化依赖性相分离动态调控中性粒细胞迁移,并证明LLPS评分可作为ARDS预后生物标志物 | 研究样本量有限,需要更大规模临床队列验证 | 探究液-液相分离在急性呼吸窘迫综合征发病机制中的作用及临床意义 | 急性呼吸窘迫综合征患者的中性粒细胞及fMLP刺激的中性粒细胞 | 多组学分析 | 急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞转录组测序,蛋白质组学,免疫荧光,Western blotting,功能实验 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质组数据,临床队列数据 | 来自GEO数据库的单细胞转录组数据集(GSE157789)和蛋白质组数据集(GSE32707/GSE76293),以及临床队列样本 | NA | 单细胞RNA-seq,蛋白质组学 | NA | NA |
| 465 | 2025-11-17 |
Integration of bulk and single-cell transcriptomic data reveals a novel signature related to liver metastasis and basement membrane in pancreatic cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1671956
PMID:41235257
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk转录组数据,构建了一个与胰腺癌肝转移和基底膜相关的预后模型 | 首次整合单细胞和bulk转录组数据识别胰腺癌肝转移和基底膜相关基因,并构建包含COL7A1等六个标志基因的创新预后模型 | 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步实验验证;样本来源有限,需要更大规模的前瞻性研究验证 | 构建胰腺癌肝转移和基底膜相关基因的预后模型,并验证其与免疫微环境和治疗疗效的关联 | 胰腺癌患者样本数据,包括TCGA、ICGC和GEO数据库的转录组、突变和临床数据 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,WGCNA分析,机器学习算法,多变量Cox回归分析 | 预后模型,机器学习算法,Cox回归模型 | 转录组数据,突变数据,临床数据 | TCGA-PAAD队列(训练集)和PACA-AU队列(验证集) | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 466 | 2025-11-17 |
The single-cell revolution in transplantation: high-resolution mapping of graft rejection, tolerance, and injury
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1670683
PMID:41235239
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综述 | 系统总结单细胞测序技术在移植生物学中的应用及其对移植排斥、免疫耐受和损伤机制的高分辨率解析 | 首次系统阐述单细胞技术如何将移植医学从形态学诊断推向分子内表型分析的新时代,揭示传统方法无法发现的细胞亚群和致病通路 | 临床转化仍面临挑战 | 阐明决定移植物命运的机制 | 实体器官和胰岛移植 | 数字病理学 | 移植相关疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 467 | 2025-11-17 |
Integrating scRNA-seq and machine learning identifies MNAT1 as a therapeutic target in OSCC
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1663487
PMID:41235252
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和机器学习技术,构建了口腔鳞状细胞癌的预后模型并鉴定MNAT1为治疗靶点 | 首次构建基于T细胞相关泛素化基因的预后风险模型,并发现MNAT1在OSCC恶性进展中的关键作用 | 研究主要基于计算分析和体外实验,缺乏体内实验验证 | 开发口腔鳞状细胞癌的预后预测模型和寻找治疗靶点 | 口腔鳞状细胞癌患者和Cal27细胞系 | 机器学习 | 口腔癌 | 单细胞RNA测序, WGCNA, LASSO算法, Spearman相关分析, 集落形成实验, Transwell实验 | 预后风险模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 468 | 2025-11-17 |
Multiomic Landscape Uncovers TRMT112 as a Central Driver of HPV-Positive Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2025, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/5308441
PMID:41235342
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示TRMT112作为HPV阳性头颈鳞状细胞癌的核心驱动因子 | 首次整合单细胞RNA测序、bulk RNA测序和空间转录组数据,发现TRMT112是HPV+HNSCC的关键风险基因并与免疫排斥微环境形成相关 | 基于公共数据库的回顾性分析,需要进一步实验验证机制 | 解析HPV阳性头颈鳞状细胞癌的分子机制和免疫景观 | 头颈鳞状细胞癌患者样本 | 生物信息学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 空间转录组, 机器学习算法 | 高维加权基因共表达网络分析, 基因非负矩阵分解, 101种机器学习算法 | 基因表达数据, 空间转录组数据 | TCGA-HNSC和GSE65858队列患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 空间转录组 | NA | NA |
| 469 | 2025-11-17 |
Glucokinase Regulatory Protein (GCKR) Links Metabolic Reprogramming With Immune Exclusion: Insights From a Pan-Cancer Analysis and Gastric Cancer Validation
2025, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/4240223
PMID:41235343
|
研究论文 | 通过泛癌分析和胃癌验证揭示了GCKR在代谢重编程与免疫排斥中的关键作用 | 首次系统描绘GCKR在泛癌中的表达和突变图谱,并发现其通过代谢重编程影响肿瘤免疫微环境的新机制 | 研究主要聚焦于胃癌验证,其他癌症类型的功能验证相对有限 | 探究GCKR在癌症中的遗传和功能作用及其与免疫微环境的关联 | 泛癌数据集和胃癌样本 | 生物信息学 | 胃癌 | 多组学分析、空间转录组学、单细胞分析 | NA | 基因组数据、转录组数据、单细胞数据 | 泛癌数据集和胃癌验证样本 | NA | 空间转录组学, 单细胞分析 | NA | NA |
| 470 | 2025-11-17 |
Comprehensive Analysis of the PANoptosis-Related Genes in Stroke Based on Single-Cell RNA-Seq and Spatial Transcriptomics
2025, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/5828665
PMID:41235394
|
研究论文 | 基于单细胞RNA测序和空间转录组学综合分析脑卒中中的PANoptosis相关基因 | 首次整合单细胞RNA测序、空间转录组学和批量RNA测序数据,系统研究缺血性脑卒中中的PANoptosis分子特征 | 研究样本量有限,需要进一步实验验证TNFRSF1A的功能机制 | 探索PANoptosis在脑缺血再灌注损伤中的作用机制 | 缺血性脑卒中患者的脑组织样本 | 生物信息学 | 脑卒中 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序,Western blot | 多模态交叉分析,高维加权基因共表达网络分析 | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,批量转录组数据 | 多个数据集(包括GSE35338和GSE137482) | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 471 | 2025-11-16 |
Upregulated haptoglobin in classical monocytes serves as a diagnostic and immunological biomarker in myocardial infarction: a cross-sectional multi-omics study
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1707912
PMID:41229424
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研究论文 | 本研究通过多组学分析发现结合珠蛋白(HP)在心肌梗死中显著上调,特别是在经典单核细胞中高表达,具有诊断价值 | 首次发现HP在心肌梗死患者经典单核细胞中特异性高表达,并证实其作为诊断生物标志物的价值 | 横断面研究设计,无法确定因果关系;样本量有限 | 寻找心肌梗死的可靠诊断生物标志物并了解其在免疫微环境中的作用 | 心肌梗死患者 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,qPCR,蛋白质组学,生物信息学分析 | WGCNA,免疫细胞浸润分析 | 基因表达数据,蛋白质组数据,临床样本 | 多个GEO数据集(GSE141512,GSE95368,GSE269269)和TCGA数据,外加独立验证队列(GSE66360等) | NA | 单细胞RNA-seq,蛋白质组学 | NA | NA |
| 472 | 2025-11-16 |
Uterine NK Cell Polarization Associates with Chronic Endometritis and Predisposition to Recurrent Implantation Failure
2025, International journal of women's health
DOI:10.2147/IJWH.S554069
PMID:41230044
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据揭示了子宫自然杀伤细胞极化与慢性子宫内膜炎及复发性种植失败的关联机制 | 首次通过单细胞RNA测序识别出两种功能不同的uNK细胞亚型,并建立了基于uNK2/uNK3特征比值的诊断模型 | 需要在前瞻性临床队列和功能实验中进一步验证临床效用 | 探究子宫内膜免疫微环境中uNK细胞极化与生殖健康障碍的关联机制 | 子宫内膜免疫细胞,特别是子宫自然杀伤细胞亚型 | 单细胞基因组学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | 逻辑回归模型 | 基因表达数据 | 51例子宫内膜样本(18例CE患者和33例正常对照) | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 473 | 2025-11-15 |
Integrative machine learning and multi-omics framework identifies shared biomarkers for rheumatoid arthritis and ulcerative colitis
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0336243
PMID:41212891
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研究论文 | 通过整合机器学习和多组学方法识别类风湿关节炎和溃疡性结肠炎的共享生物标志物 | 开发了包含12种算法和交叉验证的综合机器学习框架,首次系统识别RA和UC的共享生物标志物,并通过单细胞RNA测序验证 | 研究主要基于公共基因表达数据集,需要进一步实验验证生物标志物的临床适用性 | 识别类风湿关节炎和溃疡性结肠炎的共享诊断生物标志物 | 类风湿关节炎和溃疡性结肠炎患者的基因表达数据 | 机器学习 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 机器学习 | 集成学习框架(包含12种算法) | 基因表达数据 | 公共基因表达数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 474 | 2025-11-15 |
Metalloproteinase-9 as a Pyroptosis-Hypoxia Synergy Effector Drives Immune Remodeling in Ischemic Stroke: A Multi-Omics Validated Diagnostic Biomarker and Therapeutic Target
2025, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S550007
PMID:41220599
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研究论文 | 本研究通过多组学分析鉴定基质金属蛋白酶-9(MMP9)作为缺血性脑卒中诊断生物标志物和治疗靶点 | 首次系统探索细胞焦亡与缺氧在缺血性脑卒中中的协同调控作用,并通过多组学验证MMP9的诊断价值 | 研究样本量有限,需要更大规模临床验证 | 探索缺血性脑卒中早期诊断生物标志物和治疗靶点 | 缺血性脑卒中患者外周血样本 | 生物信息学 | 缺血性脑卒中 | 转录组测序,单细胞测序,RT-qPCR,分子对接 | LASSO,支持向量机,随机森林 | 基因表达数据 | 三个独立数据集(GSE66724,GSE58294,GSE16561)和RT-qPCR验证样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 475 | 2025-11-15 |
Intratumoral heterogeneity and potential treatment strategies in small cell lung cancer
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1657441
PMID:41220942
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综述 | 本文综述了小细胞肺癌的分子亚型分类、瘤内异质性、肿瘤可塑性及相关治疗策略的最新研究进展 | 通过基因组学和单细胞测序技术揭示了SCLC存在动态分子亚型及其空间互斥与共存关系,提出了肿瘤可塑性的新视角 | NA | 探讨小细胞肺癌的瘤内异质性特征及潜在治疗策略 | 小细胞肺癌细胞系、动物模型和肿瘤组织 | 肿瘤学 | 肺癌 | 基因组学,单细胞测序 | NA | 基因组数据,单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 476 | 2025-11-15 |
SPP1+ TAM: CD8+ T Cell Crosstalk Associates with Blocking Radiotherapy Efficacy in Lung Cancer
2025, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0851
PMID:41221295
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研究论文 | 本研究揭示了SPP1+肿瘤相关巨噬细胞通过抑制CD8+ T细胞浸润限制肺癌放疗疗效的机制 | 首次发现放疗后上调的SPP1是免疫抑制性巨噬细胞的关键因子,并证明靶向SPP1可增强放疗效果 | NA | 探索肺癌放疗疗效受限的免疫机制并寻找联合治疗策略 | 非小细胞肺癌肿瘤微环境中的巨噬细胞和CD8+ T细胞 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 477 | 2025-11-14 |
Screening of Candidate Inflammatory Markers of Epithelial Cells in Hepatocellular Carcinoma based on Integration Analysis of TCGA/ICGC Databases and Single-cell Sequencing
2025, Recent patents on anti-cancer drug discovery
IF:2.5Q3
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研究论文 | 本研究通过整合分析TCGA/ICGC数据库和单细胞测序数据,筛选肝细胞癌中上皮细胞的炎症标志物并探索潜在治疗药物 | 首次结合TCGA/ICGC数据库和单细胞测序数据系统分析肝细胞癌上皮细胞炎症标志物,并通过虚拟筛选发现NADH和Deferoxamine可与炎症蛋白VIP稳定结合 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证相对有限,需要进一步体内实验确认药物疗效 | 研究肝细胞癌中上皮细胞在炎症刺激下的表达谱,识别潜在治疗药物 | 肝细胞癌患者样本数据、上皮细胞、HCC细胞系 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞测序、转录组分析、虚拟筛选、分子动力学模拟、体外细胞实验 | 预后模型、分子对接模型 | 转录组数据、单细胞测序数据、化合物数据库 | TCGA、ICGC和GEO数据库中的肝细胞癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq、转录组测序 | NA | NA |
| 478 | 2025-11-14 |
Repetitive Trans-spinal Magnetic Stimulation Suppresses Microglia to Engulf Synapse and Promotes Nerve Repairment via cGAS-STING Signaling Pathway after Spinal Cord Injury
2025, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.114428
PMID:41208875
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研究论文 | 本研究探讨重复经脊髓磁刺激通过cGAS-STING信号通路调控小胶质细胞突触吞噬功能促进脊髓损伤后神经修复的机制 | 首次揭示rTSMS通过抑制cGAS-STING通路调控小胶质细胞突触吞噬功能促进神经修复的新机制 | 研究仅使用大鼠模型,未在更高阶物种中验证;机制研究主要聚焦cGAS-STING通路,可能存在其他调控途径 | 探究重复经脊髓磁刺激在脊髓损伤修复中的作用机制 | 脊髓损伤模型大鼠 | 神经科学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序,蛋白质印迹,免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据,组织图像数据 | 研究使用大鼠脊髓损伤模型,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 479 | 2025-11-14 |
DPP7 promotes fatty acid β-oxidation in tumor-associated macrophages and determines immunosuppressive microenvironment in colorectal cancer
2025, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.117909
PMID:41208881
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研究论文 | 本研究揭示DPP7通过增强脂肪酸β-氧化促进肿瘤相关巨噬细胞的M2极化,从而塑造结直肠癌免疫抑制微环境 | 首次发现DPP7通过结合CPT1A减少其泛素化降解,增强脂肪酸氧化代谢重编程,驱动免疫抑制表型 | 研究主要基于临床队列和动物模型,需要进一步验证在人类患者中的治疗潜力 | 探索肿瘤相关巨噬细胞中调控免疫抑制微环境的关键基因及其机制 | 结直肠癌患者样本、肿瘤相关巨噬细胞、骨髓来源巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,飞行时间流式细胞术,液相色谱-串联质谱,靶向脂质代谢组学 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质组数据,代谢组数据,免疫荧光图像 | 华东医院和TCGA数据库的多个临床队列 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,蛋白质组学,代谢组学 | NA | NA |
| 480 | 2025-11-14 |
TTC36-Mediated Tumor Suppression via YBX3/SPRED1 Axis Paradoxically Reduces Sorafenib Sensitivity in Hepatocellular Carcinoma
2025, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.115727
PMID:41208883
|
研究论文 | 本研究揭示了TTC36通过YBX3/SPRED1轴抑制肝细胞癌增殖但意外导致索拉非尼耐药的机制 | 首次发现TTC36通过稳定YBX3上调SPRED1抑制Ras/MAPK信号通路,同时揭示TTC36高表达通过PI3K/Akt过度激活导致索拉非尼耐药的新机制 | 未明确说明样本量具体数值,动物模型细节描述有限 | 探究TTC36在肝细胞癌中的肿瘤抑制功能及其对靶向治疗反应的影响 | 肝细胞癌组织、细胞系和动物模型 | 癌症生物学 | 肝细胞癌 | RNA-seq, scRNA-seq, 质谱分析, 分子对接, RNA pulldown, 双荧光素酶报告基因检测, IHC染色, TUNEL染色 | 动物模型 | 转录组数据, 蛋白质组数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |