本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 441 | 2025-10-05 |
Enhanced resistance to Listeria infection in mice surviving sepsis: the role of lipid metabolism and myeloid cell reprogramming
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1588987
PMID:40520167
|
研究论文 | 本研究探讨脓毒症存活小鼠通过脂质代谢重编程和髓系细胞重塑增强对李斯特菌感染的抵抗力 | 首次揭示脓毒症存活可通过髓系细胞脂质代谢重编程增强对胞内病原体的免疫防御 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证 | 探究脓毒症存活后免疫系统重塑机制及其对二次感染的防御能力 | 脓毒症存活小鼠及其髓系细胞 | 免疫学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序,定量RT-PCR,免疫组织化学,血清细胞因子检测,血浆脂质组学 | NA | 基因表达数据,脂质组学数据,细胞表型数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 442 | 2025-10-05 |
Hepatocyte Apolipoprotein J Accelerates Injury-induced Liver Fibrosis by Activation Signal Transducer and Activator of Transcription 3 Through Ranbp2 Mediated-SUMOylation
2025, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101556
PMID:40545037
|
研究论文 | 本研究揭示肝细胞载脂蛋白J通过Ranbp2介导的STAT3 SUMO化促进损伤诱导的肝纤维化 | 首次阐明ApoJ通过RanBP2介导STAT3在K679位点的SUMO化修饰,促进其核转位激活STAT3通路的新机制 | 主要基于小鼠模型研究,临床转化价值需进一步验证 | 探究肝细胞ApoJ如何通过STAT3通路调控肝星状细胞活化的旁分泌信号 | 肝细胞、肝星状细胞、小鼠模型、肝硬化患者样本 | 分子生物学 | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序、基因敲除、基因过表达、细胞培养 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | 肝硬化患者和健康对照的单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 443 | 2025-10-05 |
Histopathologic Evaluation and Single-cell Spatial Transcriptomics of the Colon Reveal Cellular and Molecular Abnormalities Linked to J-Pouch Failure in Patients With Inflammatory Bowel Disease
2025, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101563
PMID:40571096
|
研究论文 | 本研究通过组织病理学评估和单细胞空间转录组学分析结肠标本,揭示了与炎症性肠病患者J型储袋失败相关的细胞和分子异常 | 首次结合传统组织病理学特征与单细胞空间转录组学技术,系统分析IPAA失败的风险因素和分子机制 | 回顾性研究设计,样本来自单一医疗中心,可能限制结果的普适性 | 识别与回肠储袋-肛管吻合术失败相关的组织病理学特征和分子机制 | 417名接受IPAA手术的炎症性肠病患者 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞空间转录组学,免疫组织化学 | NA | 组织病理图像,基因表达数据 | 417名患者,部分患者进行空间转录组学分析 | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 444 | 2025-10-05 |
YBX1/CD36 positive feedback loop-mediated lipid accumulation drives metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease
2025, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.105798
PMID:40083711
|
研究论文 | 本研究揭示了YBX1/CD36正反馈环路通过促进肝脏脂质积累驱动代谢功能障碍相关脂肪性肝病的新机制 | 首次发现YBX1与CD36之间形成正反馈环路,该环路通过增强CD36表达和膜定位促进肝脏脂质积累 | 研究主要基于小鼠模型和原代肝细胞,需要进一步在人类临床试验中验证 | 探究MASLD的发病机制及YBX1在该疾病中的作用 | 小鼠模型、原代肝细胞、人类肝脏样本 | 分子生物学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | 单细胞测序、透射电子显微镜、生物学和组织学分析 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、组织学图像、电子显微镜图像 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 445 | 2025-10-05 |
Analysis of head and neck cancer scRNA-seq data identified PRDM6 promotes tumor progression by modulating immune gene expression
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1596916
PMID:40936897
|
研究论文 | 通过分析头颈癌单细胞RNA测序数据,发现PRDM6通过调节免疫基因表达促进肿瘤进展 | 首次发现PRDM6在促进肿瘤细胞增殖中的新作用,并揭示HPV病毒癌蛋白通过上调PRDM6表达与HPV阳性头颈癌相关 | NA | 探索头颈鳞状细胞癌中转录因子-免疫应答基因网络对肿瘤进展的影响 | 头颈鳞状细胞癌患者样本 | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序 | IRIS3 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 446 | 2025-10-05 |
MAIT Cells with High PFN1 Expression Mediate Immune Activation and Metabolic Reprogramming in Psoriasis
2025, Clinical, cosmetic and investigational dermatology
DOI:10.2147/CCID.S535795
PMID:40948612
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和遗传分析揭示了MAIT细胞及其高表达基因PFN1在银屑病免疫激活和代谢重编程中的关键作用 | 首次整合单细胞RNA测序与孟德尔随机化分析,发现PFN1高表达的MAIT细胞在银屑病中介导免疫激活和代谢重编程 | 样本量较小(3例银屑病患者和2例对照),且PFN1表达与银屑病风险缺乏显著的遗传共定位证据 | 探索银屑病的细胞和分子机制,特别关注MAIT细胞的作用 | 银屑病患者和健康对照的皮肤组织样本 | 单细胞基因组学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序, 基因表达谱分析, 孟德尔随机化分析, 富集分析 | 细胞分化轨迹分析, 细胞间通讯分析 | 单细胞RNA测序数据, 批量RNA测序数据, 遗传数据 | 5例样本(3例银屑病,2例对照) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 447 | 2025-10-05 |
Enhancing natural killer cell anti-tumour activity through macrophage manipulation
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1656925
PMID:40948757
|
综述 | 本文探讨通过调控肿瘤相关巨噬细胞来增强自然杀伤细胞抗肿瘤活性的策略 | 系统阐述巨噬细胞与NK细胞相互作用的双重调控机制及其在肿瘤免疫治疗中的转化潜力 | NA | 探索通过巨噬细胞干预增强NK细胞抗肿瘤功能的治疗策略 | 肿瘤微环境中的巨噬细胞和自然杀伤细胞 | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,蛋白质组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 448 | 2025-10-05 |
Multi-omics approach to personalised treatment: insights into thrombus-derived exosome regulation in cardiomyocyte ferritinophagy
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1607355
PMID:40948766
|
研究论文 | 本研究首次揭示血栓来源外泌体通过FENDRR-m6A-NCOA4调控轴介导心肌细胞铁蛋白自噬在1型心肌梗死中的关键作用 | 首次发现血栓来源外泌体通过lncRNA FENDRR与P53协同调控m6A修饰,揭示铁蛋白自噬与免疫炎症反应的关联机制 | 铁蛋白自噬在T1MI中的具体作用机制仍需进一步阐明 | 系统分析铁蛋白自噬在1型心肌梗死中的作用机制及其与免疫炎症反应的潜在联系 | 1型心肌梗死患者冠状动脉血栓来源外泌体及心肌细胞 | 多组学分析 | 心血管疾病 | 转录组测序,单细胞RNA测序,RIP,FISH,ChIP,m6A甲基化实验,生物信息学分析 | 心肌细胞模型 | 转录组数据,单细胞RNA测序数据 | 1型心肌梗死患者冠状动脉血栓样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 449 | 2025-10-05 |
Dissecting the immune evasion and therapeutic resistance mechanisms in EGFR/TP53 co-mutated non-small cell lung cancer: implications for targeted and immunotherapy strategies
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1652213
PMID:40948762
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示EGFR/TP53共突变非小细胞肺癌的免疫逃逸和治疗抵抗机制 | 首次在单细胞层面发现EGFR/TP53共突变NSCLC中两种恶性上皮细胞亚群的协同作用机制,并揭示STAT1/ETS1转录调控网络的核心作用 | 样本量较小(仅4例进行单细胞测序),需要在更大患者队列和功能研究中进一步验证 | 探究EGFR/TP53共突变非小细胞肺癌的分子机制及治疗策略 | 40例住院NSCLC患者的福尔马林固定石蜡包埋肿瘤样本 | 数字病理 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 下一代测序 | NA | 基因表达数据, 突变数据 | 40例NSCLC患者,其中4例EGFR/TP53共突变样本进行单细胞测序 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Genomics平台 | 10x Genomics单细胞转录组测序平台 |
| 450 | 2025-10-05 |
Integrative transcriptomic and machine learning analyses identify HDAC9 as a key regulator of mitochondrial dysfunction and senescence-associated inflammation in diabetic nephropathy
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1627173
PMID:40948769
|
研究论文 | 通过整合转录组学和机器学习分析,鉴定HDAC9作为糖尿病肾病中线粒体功能障碍和衰老相关炎症的关键调控因子 | 首次通过整合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据,结合多种机器学习方法系统鉴定糖尿病肾病中线粒体功能障碍和衰老相关的关键基因 | 研究主要基于体外细胞模型验证,缺乏体内动物实验验证;样本来源和数量可能有限 | 探索糖尿病肾病中线粒体功能障碍和衰老相关炎症的分子机制,并寻找潜在治疗靶点 | 糖尿病肾病患者的肾脏组织样本和高糖诱导的HK-2肾小管上皮细胞 | 机器学习 | 糖尿病肾病 | RNA-seq, scRNA-seq, 加权基因共表达网络分析, 机器学习, siRNA基因敲低 | 支持向量机(SVM), 多种机器学习方法 | 转录组数据, 单细胞RNA-seq数据 | 糖尿病肾病和正常肾脏组织的bulk RNA-seq数据,包含2,176个差异表达基因 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 451 | 2025-10-05 |
Research trends and hotspots in the tumor microenvironment of ovarian cancer: a bibliometrics and visualization study from 2005 to 2024
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1605695
PMID:40948776
|
文献计量学研究 | 对2005-2024年卵巢癌肿瘤微环境研究趋势和热点进行文献计量学与可视化分析 | 首次系统分析卵巢癌肿瘤微环境研究领域的演进历程和热点方向 | 仅基于Web of Science数据库的1720篇文献,可能存在收录偏差 | 探索卵巢癌肿瘤微环境研究的发展趋势和重点领域 | 卵巢癌肿瘤微环境相关研究文献 | 文献计量学 | 卵巢癌 | 文献计量分析、可视化分析 | NA | 文献数据 | 1720篇相关文章 | NA | NA | NA | NA |
| 452 | 2025-10-05 |
Single-cell profiling delineates the tumor microenvironment and immunological networks in patient-derived uterine leiomyosarcoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1653096
PMID:40948800
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序描绘了子宫平滑肌肉瘤的肿瘤微环境和免疫网络特征 | 首次构建了子宫平滑肌肉瘤的单细胞图谱,识别了转移易感细胞亚群(U11-EDARADD)和以耗竭CD8+T细胞、M2巨噬细胞和N2中性粒细胞为主的免疫抑制微环境 | 样本量较小,仅分析了初治患者的转移病灶,需要更大规模验证 | 解析子宫平滑肌肉瘤的肿瘤微环境特征和免疫抑制机制 | 子宫平滑肌肉瘤患者的转移病灶(盆腔、直肠、腹膜、膀胱)和正常子宫肌层组织 | 数字病理学 | 子宫癌 | 单细胞RNA测序, 多重免疫荧光, 拷贝数变异分析 | NA | 单细胞转录组数据, 免疫荧光图像数据 | 1例初治ULSA患者的多个转移病灶和5例正常对照 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 453 | 2025-10-05 |
Deciphering the role of myofibroblasts in microvascular invasion of hepatocellular carcinoma
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1596181
PMID:40949143
|
研究论文 | 通过单细胞分析揭示肌成纤维细胞在肝细胞癌微血管侵袭中的作用机制 | 首次在单细胞水平系统解析肌成纤维细胞在肝细胞癌微血管侵袭中的关键作用,发现MF2细胞亚群与血管生成密切相关 | 研究主要基于公共数据库数据,实验验证部分仅限于细胞系水平 | 探究肝细胞癌微血管侵袭的细胞群体和分子网络机制 | 肝细胞癌患者样本和细胞系 | 单细胞分析 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,RNA测序,细胞功能实验 | Seurat,DAVID,CellChat,Monocle 2 | 单细胞RNA测序数据,RNA测序数据 | 来自公共数据库的肝细胞癌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 454 | 2025-10-05 |
Integrating microarray data and single-cell RNA-seq reveals correlation between kit and nmyc in mouse spermatogonia stem cell population
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1634347
PMID:40950403
|
研究论文 | 本研究通过整合微阵列数据和单细胞RNA测序技术,揭示了小鼠精原干细胞中Kit基因与Nmyc之间的相关性及其在精子发生中的关键作用 | 首次结合微阵列数据和单细胞RNA测序技术系统分析小鼠精原干细胞中Kit基因与Nmyc的共表达关系及其在分化过程中的动态表达模式 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证;需要进一步整合基因编辑技术进行功能验证 | 阐明精原干细胞中Kit基因的调控机制及其在精子发生过程中的作用 | 小鼠精原干细胞 | 单细胞测序分析 | 男性不育症 | 微阵列, 单细胞RNA测序, 免疫细胞化学, 基因本体富集分析, WGCNA, 蛋白质相互作用网络分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 小鼠睾丸样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 455 | 2025-10-05 |
Comprehensive analysis of the papillary thyroid carcinoma identifies CSGALNACT1 as a proliferation driver and prognostic biomarker
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1638348
PMID:40950406
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序数据构建甲状腺乳头状癌高分辨率细胞图谱,鉴定CSGALNACT1作为增殖驱动因子和预后生物标志物 | 首次整合多个单细胞RNA测序数据集构建PTC高分辨率细胞图谱,发现29个细胞亚群并鉴定CSGALNACT1作为关键预后基因 | 研究样本量相对有限(20个人类甲状腺样本),需要更大规模验证 | 解析甲状腺乳头状癌的细胞异质性并确定预后决定因素 | 人类甲状腺组织样本,包括健康和肿瘤组织 | 单细胞转录组学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO回归模型,Cox风险比例模型 | 单细胞RNA测序数据 | 20个人类甲状腺样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 456 | 2025-10-05 |
Identification of Novel Biomarkers Associated with Corticosteroid Resistance in Asthma by Bioinformatics Analysis and Experimental Validation
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S527640
PMID:40951447
|
研究论文 | 通过生物信息学分析和实验验证识别与哮喘皮质类固醇抵抗相关的新型生物标志物 | 首次发现TNS1、ABCC4和TNFRSF21三个关键基因与香烟烟雾诱导的哮喘皮质类固醇抵抗相关,并揭示TNS1通过促进巨噬细胞M2极化参与该过程 | 研究样本量有限,机制研究仍需进一步深入验证 | 探索与香烟烟雾诱导的哮喘皮质类固醇抵抗相关的潜在生物标志物和治疗靶点 | 哮喘患者、哮喘小鼠模型、Raw264.7细胞系 | 生物信息学 | 哮喘 | 差异基因表达分析、WGCNA、GO/KEGG富集分析、ROC分析、CIBERSORT免疫细胞浸润分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两个GEO数据集(GSE230048和GSE13896)、哮喘患者和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 457 | 2025-10-05 |
Analysis and validation of characteristic genes in RNA sequencing datasets from heart failure patients based on multiple algorithms
2025, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2025.1559429
PMID:40933310
|
研究论文 | 通过整合多算法分析心力衰竭患者的转录组数据,识别关键基因并验证其在心肌细胞脂肪酸代谢中的作用 | 首次结合RRA和WGCNA算法识别心力衰竭关键基因,并通过单细胞RNA测序发现SMCO4和CSDC2在心肌细胞中的特异性表达及代谢调控功能 | 研究样本量有限,验证仅在心肌肥厚模型中进行,需要更多临床样本验证 | 识别心力衰竭心肌组织的核心致病机制 | 心力衰竭患者心肌组织样本和肥大心肌细胞模型 | 生物信息学 | 心血管疾病 | RNA测序, RT-qPCR, 单细胞RNA测序 | Robust Rank Aggregation, WGCNA, PCA, UMAP | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 5个研究的转录组数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 458 | 2025-10-05 |
Integrative Analysis Reveals a Key Role for CDKN1A in Impaired Wound Healing in Diabetic Patients
2025, Clinical, cosmetic and investigational dermatology
DOI:10.2147/CCID.S534876
PMID:40933395
|
研究论文 | 本研究通过整合分析揭示了CDKN1A在糖尿病足溃疡伤口愈合障碍中的关键作用 | 首次结合单细胞RNA测序和孟德尔随机化方法系统阐明CDKN1A在糖尿病伤口愈合中的分子机制 | NA | 研究CDKN1A在糖尿病伤口愈合中的作用机制 | 糖尿病足溃疡组织 | 生物医学 | 糖尿病足溃疡 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 转录因子分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 459 | 2025-10-05 |
Decoding the hypoxic tumor microenvironment in colorectal cancer for prognostic modeling and therapeutic target discovery
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1651749
PMID:40933995
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序数据解码结直肠癌缺氧肿瘤微环境,构建预后模型并发现治疗靶点 | 首次在单细胞水平系统解析结直肠癌缺氧微环境的细胞异质性,构建八基因预后特征模型,并鉴定GIPC2作为新的潜在治疗靶点 | 样本量相对有限(15个单细胞样本),需要更多独立队列验证预后模型的普适性 | 解析结直肠癌缺氧肿瘤微环境的细胞异质性及其对预后的影响,发现新的治疗靶点 | 结直肠癌患者肿瘤样本和细胞系 | 单细胞转录组学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,WGCNA,CellChat,SCENIC,GRNBoost2,Cox回归,Lasso回归,体外功能验证 | 预后风险模型,基因共表达网络 | 单细胞RNA测序数据,批量RNA测序数据 | 单细胞数据15个样本,TCGA队列606例,验证队列579例,体外实验2个细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 460 | 2025-10-05 |
Integration of single-cell and bulk RNA sequencing to identify unique tumor stem cells and construct novel prognostic markers for assessing ESCA prognosis and drug sensitivity
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1649877
PMID:40936684
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk RNA测序数据,识别食管癌肿瘤干细胞特征并构建预后标志物模型 | 首次结合单细胞和bulk RNA测序构建食管癌肿瘤干细胞标志物特征模型,并鉴定TSPO作为潜在治疗靶点 | 未明确说明样本来源和数量,功能验证主要基于细胞系和小鼠模型 | 识别食管癌肿瘤干细胞特征基因,构建预后评估模型并探索药物敏感性 | 食管癌(ESCA)肿瘤干细胞 | 生物信息学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, qRT-PCR, Western blotting, 免疫组化, 细胞增殖实验 | Lasso-Cox回归模型, Kaplan-Meier生存分析, ROC曲线分析 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |