单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1543 篇文献，本页显示第 421 - 440 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 421 | 2025-06-24 |
A Monocyte-Driven Prognostic Model for Multiple Myeloma: Multi-Omics and Machine Learning Insights
2025, Blood and lymphatic cancer : targets and therapy
DOI:10.2147/BLCTT.S517354
PMID:40546417
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research paper | 该研究通过多组学分析和机器学习算法，建立了一个与单核细胞相关的多发性骨髓瘤预后模型 | 结合孟德尔随机化分析、流式细胞术和单细胞RNA测序，开发了一个新的单核细胞相关基因预后特征（MGPS）模型，并验证其在预测多发性骨髓瘤患者预后和治疗反应中的价值 | 研究主要基于回顾性数据，需要进一步的前瞻性研究验证MGPS模型的临床适用性 | 探索多发性骨髓瘤的免疫微环境，开发预后模型以优化治疗策略 | 多发性骨髓瘤患者及其骨髓微环境中的单核细胞 | digital pathology | multiple myeloma | scRNA-seq, flow cytometry, Mendelian Randomization | machine learning (10种算法生成的101个预测模型) | genomic data, transcriptome data | 731种免疫细胞表型分析，多组转录组测序数据集 |
| 422 | 2025-06-23 |
Spatial Transcriptomics: Integrating Morphology and Molecular Mechanisms of Kidney Diseases
2025-Jan, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2024.06.012
PMID:39097166
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综述 | 本文综述了当前可用的主要空间转录组学技术及其在肾脏疾病研究中的应用 | 整合形态学和分子生物学，提供对组织生物学和疾病的新理解 | 讨论了这些新兴技术的挑战和前景，但未提及具体的技术限制 | 提高对组织生物学和疾病的理解，并提供潜在的临床见解 | 肾脏疾病 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 空间转录组学(ST) | NA | 分子和形态学数据 | NA |
| 423 | 2024-12-28 |
Advances in Single-Cell Sequencing and Spatial Profiling of Kidney Disease
2025-Jan, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2024.10.010
PMID:39722281
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 424 | 2025-06-22 |
nf-core/marsseq: systematic preprocessing pipeline for MARS-seq experiments
2025, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbaf089
PMID:40438146
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research paper | 介绍了一个用于MARS-seq实验的系统预处理管道nf-core/marsseq，旨在标准化MARS-seq分析并提高其适用性 | 基于nf-core框架改进了MARS-seq2.0管道，简化了执行流程，增加了透明度和可扩展性，并实现了RNA速度估计的自定义工作流程 | 未明确提及具体限制，但暗示了数据格式可能限制了分析的广度 | 标准化MARS-seq分析并提高其适用性，特别是对RNA速度的研究 | MARS-seq实验数据 | 生物信息学 | NA | MARS-seq2.0, RNA速度估计 | NA | scRNA-seq数据 | NA |
| 425 | 2025-06-22 |
ReSort enhances reference-based cell type deconvolution for spatial transcriptomics through regional information integration
2025, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbaf091
PMID:40510374
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research paper | 本文提出了一种名为ReSort的方法，通过整合区域信息增强基于参考的空间转录组细胞类型去卷积分析 | ReSort利用空间转录组的区域级数据减少对参考数据的依赖，缓解批次/平台差异带来的技术问题 | NA | 提高空间转录组数据中细胞类型分布的解析精度 | 空间转录组数据和参考数据 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 空间转录组技术 | ReSort | 基因表达数据 | 小鼠乳腺癌模型 |
| 426 | 2025-06-22 |
Zileuton protects against arachidonic acid/5-lipoxygenase/leukotriene axis-mediated neuroinflammation in experimental traumatic brain injury
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1516836
PMID:40538546
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research paper | 该研究探讨了5-脂氧合酶（5-LOX）在创伤性脑损伤（TBI）中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 首次揭示了5-LOX在TBI中的具体作用机制，并验证了zileuton通过抑制5-LOX减轻神经炎症和脑损伤的效果 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体临床试验中验证 | 探究5-LOX在TBI病理生理学中的作用及其治疗潜力 | 创伤性脑损伤（TBI）小鼠模型 | 神经科学 | 创伤性脑损伤 | RNA-seq分析、RT-PCR、免疫细胞化学、Western blotting、单细胞测序、液相色谱质谱/质谱、酶联免疫吸附试验 | 小鼠TBI模型 | 基因表达数据、蛋白质表达数据、代谢物数据 | 未明确说明样本数量，但使用了假手术组和TBI组的小鼠脑组织样本 |
| 427 | 2025-06-22 |
EPHX2 overexpression deters the advancement of clear cell renal cell carcinoma via lipid metabolism reprogramming
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1541429
PMID:40538850
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研究论文 | 本研究探讨了EPHX2在透明细胞肾细胞癌(ccRCC)进展中的机制作用及其通过脂质代谢重编程抑制肿瘤生长的潜力 | 首次整合机器学习方法分析EPHX2在ccRCC中的作用，并通过实验验证其过表达对肿瘤细胞增殖、迁移和侵袭能力的抑制作用 | 研究主要基于体外实验，缺乏体内动物模型验证 | 阐明EPHX2在ccRCC进展中的机制作用 | 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)细胞系786-O和ACHN | 肿瘤学 | 肾癌 | 转录组分析、慢病毒转染技术 | 机器学习模型 | 转录组数据 | TCGA和GEO数据库中的ccRCC样本数据，以及786-O和ACHN细胞系 |
| 428 | 2025-06-22 |
Single Cell and Transcriptomic Analysis of Regulatory Mechanisms of Key Genes in Systemic Lupus Erythematosus
2025, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S522871
PMID:40539001
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研究论文 | 该研究通过整合单细胞和转录组数据，识别出系统性红斑狼疮（SLE）发病机制中的六个关键基因，并强调了记忆B细胞的核心作用 | 整合单细胞和转录组数据识别关键基因，揭示了记忆B细胞在SLE中的核心作用 | 样本量较小（6名SLE患者和6名对照） | 理解系统性红斑狼疮的发病机制 | 系统性红斑狼疮患者和对照组的血液样本 | 生物信息学 | 系统性红斑狼疮 | scRNA-seq, 转录组分析, ssGSEA, 甲基化分析, PPI网络构建 | NA | 单细胞RNA测序数据, 转录组数据 | 6名SLE患者和6名对照 |
| 429 | 2025-06-22 |
High-expression of BCL10 inhibits cell-mediated immunity within the tumor immune microenvironment
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1616321
PMID:40539049
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研究论文 | 本研究探讨了BCL10在肿瘤免疫微环境中对免疫细胞的影响及其与免疫抑制的关系 | 首次系统研究了BCL10在肿瘤免疫微环境中的作用，揭示了其通过NF-κB信号通路和PD-1上调导致CD8+T细胞耗竭的机制 | 研究主要基于生物信息学分析和小鼠模型，需要进一步人类临床试验验证 | 探究BCL10在肿瘤免疫微环境中的作用及其对免疫细胞功能的影响 | BCL10蛋白、肿瘤免疫微环境中的免疫细胞(CD8+T细胞、CD4+Th1细胞、NK T细胞等) | 肿瘤免疫学 | 宫颈鳞状细胞癌(CESC) | 生物信息学分析(xCELL, CIBERSORT, QUANTISEQ, MCPcounter)、单细胞RNA测序、小鼠模型 | 植入性CESC小鼠模型 | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | TCGA和GTEx数据库中的肿瘤样本、GEO数据库中的单细胞RNA测序数据、小鼠模型 |
| 430 | 2025-06-22 |
Integrated machine learning and single-cell RNA sequencing reveal COL4A2 and CXCL6 as oxidative stress-associated biomarkers in periodontitis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1598642
PMID:40539067
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研究论文 | 本研究通过整合机器学习和单细胞RNA测序技术，揭示了COL4A2和CXCL6作为牙周炎氧化应激相关生物标志物的潜在作用 | 首次结合机器学习和单细胞RNA测序技术鉴定牙周炎氧化应激相关生物标志物，并验证其在特定细胞亚群中的表达模式 | 研究主要基于生物信息学分析和动物模型验证，尚未进行临床样本的大规模验证 | 探索氧化应激与牙周炎发病机制的关联，并寻找潜在的诊断生物标志物和治疗靶点 | 牙周炎患者的牙龈组织转录组数据及大鼠牙周炎模型 | 生物信息学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 加权基因共表达网络分析(WGCNA), 基因集富集分析(GSEA) | 机器学习算法(未指定具体模型) | RNA测序数据 | 未明确说明人类样本数量，包含大鼠模型数据 |
| 431 | 2025-06-22 |
Single-cell sequencing reveals dysregulated cell type perturbations and critical mediator communication remodelling in colorectal cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1557564
PMID:40539065
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研究论文 | 通过单细胞测序技术揭示结直肠癌中细胞类型扰动和关键介质通讯重塑的失调 | 识别了具有增殖和侵袭特征的上皮亚群，以及髓系细胞的终末状态ActMono，并揭示了galectin信号在免疫调节中的关键作用 | 样本量相对较小（41例CRC样本），且仅基于转录组数据进行分析 | 研究结直肠癌的细胞异质性和免疫微环境，识别关键亚群、功能通路和预后生物标志物 | 结直肠癌（CRC）患者 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组测序 | 预后模型（CRS） | 转录组数据 | 41例CRC样本 |
| 432 | 2025-06-22 |
Cellular hierarchy framework based on single-cell and bulk RNA sequencing reveals fatty acid metabolic biomarker MYDGF as a therapeutic target for ccRCC
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1615601
PMID:40539074
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研究论文 | 通过单细胞和批量RNA测序揭示脂肪酸代谢生物标志物MYDGF作为ccRCC治疗靶点的细胞层次框架 | 结合单细胞测序和空间转录组学，重新定义了与ccRCC中脂肪酸代谢增加相关的基因集，并发现MYDGF等四个候选基因与ccRCC进展相关 | 未明确说明样本量是否足够大以覆盖ccRCC的异质性 | 探索脂肪酸代谢重编程对ccRCC异质性和预后的影响 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）患者和恶性上皮细胞 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞测序, 空间转录组学, RNA-seq | 机器学习算法 | RNA测序数据 | 未明确说明具体样本数量 |
| 433 | 2025-06-22 |
Single-cell RNA seq data analysis reveals molecular markers and possible treatment targets for laryngeal squamous cell carcinoma (LSCC): an in-silico approach
2025, In silico pharmacology
DOI:10.1007/s40203-025-00382-w
PMID:40539082
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序数据分析揭示喉鳞状细胞癌的分子标志物和潜在治疗靶点 | 利用单细胞RNA测序技术揭示喉鳞状细胞癌的细胞异质性，并识别出与癌症进展相关的关键基因和通路 | 研究基于计算机模拟方法，需进一步实验验证 | 探索喉鳞状细胞癌的诊断和治疗靶点 | 喉鳞状细胞癌(LSCC) | 数字病理学 | 喉癌 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | GSE252490数据集中的单细胞RNA测序数据 |
| 434 | 2025-06-21 |
High expression of CCL3/CCL4/CCL5/CCR5 promotes exhausted CD8+ T cells terminal differentiation and is associated with poor prognosis in pediatric B-ALL patients
2025 Jan-Dec, International journal of immunopathology and pharmacology
IF:3.0Q2
DOI:10.1177/03946320251346823
PMID:40522146
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research paper | 本研究旨在识别B-ALL细胞与耗竭CD8 T细胞之间差异上调的配体-受体相互作用，并基于CCL3/CCL4/CCL5表达水平开发多变量Cox回归模型预测儿童B-ALL患者的总生存期 | 首次报道了CCL3/CCL4/CCL5-CCR5轴在B-ALL中终末耗竭CD8 T细胞分化中的关键作用，并开发了一个创新的分层模型整合CCL3、CCL4和CCL5通过多Cox回归预测预后 | 研究样本量有限，且模型在成人B-ALL患者中的验证需要进一步扩大样本量 | 探索B-ALL细胞与耗竭CD8 T细胞的相互作用及其对预后的影响，开发预测模型 | 儿童B细胞急性淋巴细胞白血病（B-ALL）患者 | 生物医学 | B细胞急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）、定量实时聚合酶链反应（qRT-PCR） | 多变量Cox回归模型 | RNA测序数据 | 221例儿童B-ALL样本及部分成人B-ALL患者样本 |
| 435 | 2025-06-21 |
Copper Metabolism-Related Genes as Biomarkers in Colon Adenoma and Cancer
2025, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S521512
PMID:40524750
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析探讨铜代谢在结肠腺瘤进展为结直肠癌中的作用，并识别潜在的生物标志物和治疗靶点 | 首次将铜代谢相关基因与结肠腺瘤至结直肠癌的进展关联，并利用多种机器学习算法和单细胞RNA测序技术识别了五个新的生物标志物 | 需要进一步的临床验证来确认这些生物标志物的诊断和治疗价值 | 阐明铜代谢在结肠腺瘤至结直肠癌进展中的作用，并识别潜在的生物标志物和治疗靶点 | 结肠腺瘤和结直肠癌患者样本 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 生物信息学分析、机器学习算法、单样本基因集富集分析(ssGSEA)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、定量聚合酶链反应(qPCR) | 五种机器学习算法 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的结肠腺瘤样本和正常对照样本，以及通过qPCR和HPA数据库验证的患者样本 |
| 436 | 2025-06-21 |
Single-cell sequencing reveals cellular differences and potential mechanisms in congenital pulmonary airway malformation
2025, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2025.1548177
PMID:40529122
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研究论文 | 通过单细胞测序技术分析先天性肺气道畸形(CPAM)病变组织与正常组织的细胞差异，揭示关键细胞类型和功能 | 首次使用单细胞测序技术深入分析CPAM病变组织与正常组织的细胞差异，发现关键细胞类型和功能 | 研究样本量未明确说明，且未进行功能验证实验 | 探究先天性肺气道畸形(CPAM)的病理过程 | CPAM病变组织和正常组织 | 数字病理学 | 肺发育异常 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明 |
| 437 | 2025-06-21 |
Research advances in the study of traditional Chinese medicine formula granules on signaling pathway-mediated disease mechanisms
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1609211
PMID:40529488
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综述 | 本文系统回顾了中药配方颗粒在信号通路介导的疾病机制研究中的进展，并展望了其在现代精准医学中的应用前景 | 整合多组学技术探索复方混合物的超分子协同效应，并强调大规模临床试验在验证其精准医学潜力中的重要性 | 当前研究面临单组分分析、复方混合物协同机制不明确以及转化应用临床证据不足等挑战 | 阐明中药配方颗粒通过调控信号通路治疗复杂疾病的多靶点调控机制 | 中药配方颗粒及其活性代谢物 | 中医药研究 | 炎症、肿瘤、代谢紊乱、纤维化、骨关节炎和骨质疏松等复杂疾病 | 多组学技术（如代谢组学、空间转录组学） | NA | NA | NA |
| 438 | 2025-06-21 |
Cancer-Derived Exosomal LINC01615 Induces M2 Polarization of Tumor-Associated Macrophages via RBMX-EZH2 Axis to Promote Colorectal Cancer Progression
2025, International journal of nanomedicine
IF:6.6Q1
DOI:10.2147/IJN.S499381
PMID:40529536
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研究论文 | 探讨癌症来源的外泌体LINC01615通过RBMX-EZH2轴诱导肿瘤相关巨噬细胞M2极化促进结直肠癌进展的机制 | 首次揭示了外泌体LINC01615通过RBMX-EZH2轴调控巨噬细胞M2极化的分子机制 | 未涉及LINC01615在其他癌症类型中的作用及临床转化潜力 | 阐明外泌体lncRNA在肿瘤微环境调控中的作用机制 | 结直肠癌细胞、肿瘤相关巨噬细胞(TAMs) | 肿瘤微环境 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、RNA免疫沉淀、染色质免疫沉淀、Western blot等 | NA | RNA测序数据、蛋白质印迹数据 | 未明确说明样本数量（涉及体外和体内实验） |
| 439 | 2025-06-21 |
Integrated machine learning and single-cell analysis reveal the prognostic and therapeutic potential of SUMOylation-related genes in ovarian cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1577781
PMID:40534859
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研究论文 | 本研究通过整合机器学习和单细胞分析，揭示了SUMOylation相关基因在卵巢癌中的预后和治疗潜力 | 首次整合机器学习和单细胞RNA测序数据，鉴定出与卵巢癌预后和治疗相关的关键SUMOylation相关基因 | 研究样本主要来自TCGA-OV队列和一家医院的213名患者，可能存在样本选择偏差 | 探索SUMOylation及其调控因子在卵巢癌中的作用，寻找潜在的生物标志物和治疗靶点 | 卵巢癌患者样本和ID8小鼠模型 | 精准医学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序、机器学习 | NA | 多组学数据 | TCGA-OV队列和213名卵巢癌患者样本 |
| 440 | 2025-06-21 |
Cancer-associated fibroblasts in clear cell renal cell carcinoma: functional heterogeneity, tumor microenvironment crosstalk, and therapeutic opportunities
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1617968
PMID:40534854
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research paper | 该研究探讨了透明细胞肾细胞癌（ccRCC）中癌症相关成纤维细胞（CAFs）的功能异质性、肿瘤微环境（TME）的相互作用及治疗机会 | 揭示了CAFs通过代谢重编程和免疫抑制网络促进ccRCC进展的新机制，并探讨了针对CAFs的新型治疗策略 | CAFs的异质性和双重功能角色限制了临床转化，且缺乏特异性生物标志物 | 研究ccRCC中CAFs的功能异质性及其在肿瘤微环境中的作用，探索潜在的治疗策略 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）中的癌症相关成纤维细胞（CAFs） | 肿瘤学 | 肾癌 | 单细胞测序、空间多组学技术 | NA | NA | NA |