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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 381 | 2025-10-05 |
Blood memory CD8 T cell phenotypes in lung cancer patients predict immune checkpoint treatment responses
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1629802
PMID:40989699
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研究论文 | 通过单细胞测序技术分析肺癌患者外周血CD8+ T细胞表型,建立预测免疫检查点治疗反应的机器学习模型 | 首次在单细胞水平系统分析不同免疫治疗反应组患者的CD8+ T细胞表型特征,并开发出高精度的预测模型 | 研究样本量有限,需要在更大规模队列中验证模型的普适性 | 开发能够预测肺癌患者免疫检查点抑制剂治疗反应的生物标志物 | 非小细胞肺癌患者的外周血CD8+ T细胞 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,TCR repertoire分析 | 机器学习 | 单细胞转录组数据,表面标志物表达数据,TCR序列数据 | 包含长期应答者、新治疗应答者和新治疗无应答者的患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 382 | 2025-10-05 |
Identification of Core SASP-Related Genes TGFBI and ANXA6 for Diagnosing Ulcerative Colitis-Related Colorectal Cancer Through Machine Learning
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S538960
PMID:40989757
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研究论文 | 通过机器学习方法识别溃疡性结肠炎相关结直肠癌的核心SASP相关基因TGFBI和ANXA6作为诊断标志物 | 首次系统筛选SASP相关基因在UCRCC中的作用,并通过113种机器学习算法组合鉴定出核心基因TGFBI和ANXA6 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证仅限于小鼠模型,需要进一步临床验证 | 探索衰老相关分泌表型在溃疡性结肠炎相关结直肠癌精准诊断和发病机制中的作用 | 溃疡性结肠炎和结直肠癌患者基因表达数据及小鼠模型 | 机器学习 | 结直肠癌 | 差异表达基因分析,加权基因共表达网络分析,单细胞RNA测序,机器学习算法 | 10种机器学习算法的113种组合 | 基因表达数据,单细胞测序数据 | UC和CRC数据集,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 383 | 2025-10-05 |
Multi-omics reveals immune features in immune and non-immune cells, an IFN-γ/IFN-α-B2M positive feedback loop, and targeted metabolic therapy in multiple myeloma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1575079
PMID:40990011
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了多发性骨髓瘤中的免疫特征、IFN-γ/IFN-α-B2M正反馈环路及靶向代谢治疗策略 | 识别了新的MM亚群(骨髓瘤激活的造血干细胞和ISG15+ B细胞),发现了IFN-γ/IFN-α-B2M正反馈环路,并通过多组学整合筛选出四种候选药物 | NA | 建立多发性骨髓瘤的多组学图谱,表征驱动免疫逃逸和疾病进展的细胞亚群和信号通路 | 多发性骨髓瘤的免疫和非免疫细胞 | 生物信息学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序, 单细胞代谢分析, 批量RNA测序, 多重免疫荧光, CCK-8检测, 流式细胞术, Western blotting | NA | 单细胞转录组数据, 批量转录组数据, 代谢数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 单细胞代谢分析 | NA | NA |
| 384 | 2025-10-05 |
FCRLs and atypical transcriptional pattern in tumor infiltrating B cells from lung and renal cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1587088
PMID:40990023
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研究论文 | 本研究通过转录组分析揭示了肺癌和肾癌中肿瘤浸润B细胞的功能差异及FCRL4作为功能失调标志物的重要性 | 发现sIgA+ B细胞中FCRL4、PDCD1和RUNX2的过表达特征,以及FCRL4/CD20表达比与生存率的相关性 | 研究主要基于转录组数据分析,缺乏功能性验证实验 | 探究肿瘤浸润B细胞中不同抗体亚型的功能差异及其在肿瘤进展中的作用 | 肺癌和肾癌中的肿瘤浸润B细胞,特别是表面IgA+和IgG+记忆B细胞 | 免疫学 | 肺癌, 肾癌 | 高维流式细胞术, 单细胞RNA测序, 批量转录组分析 | NA | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | TCGA LUAD队列及公共scRNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA测序, 批量转录组测序 | NA | NA |
| 385 | 2025-10-05 |
Glycolysis-Driven Immune Evasion in Microsatellite Instability-High Colorectal Cancer: An Integrated Single-Cell and Spatial Transcriptomics Study
2025, OncoTargets and therapy
IF:2.7Q3
DOI:10.2147/OTT.S538018
PMID:40990035
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和空间转录组学技术,揭示了糖酵解驱动的免疫逃逸机制在微卫星高度不稳定结直肠癌中的作用 | 首次在微卫星高度不稳定结直肠癌中发现糖酵解富集的肿瘤亚群与免疫抑制微环境的共定位关系,并阐明乳酸分泌促进Treg分化和巨噬细胞极化的分子机制 | 研究样本量有限,需要更大规模队列验证;机制研究主要基于相关性分析,缺乏功能性实验验证 | 探究微卫星高度不稳定结直肠癌中肿瘤细胞功能异质性及其在免疫逃逸中的作用 | 微卫星高度不稳定结直肠癌患者 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | 非负矩阵分解, 基因集富集分析 | 基因表达数据, 空间定位数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 386 | 2025-10-05 |
Single-cell transcriptomics reveals predominantly inflammatory endothelial cell responses and suppressed vascular repair in silicosis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1629226
PMID:40969743
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示矽肺病中内皮细胞主要表现为炎症反应且血管修复功能受抑制 | 首次在矽肺病中发现两种功能不同的内皮细胞亚群:炎症型内皮细胞和修复型内皮细胞,并揭示其功能失衡机制 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 探究矽肺病中内皮细胞的功能特性和病理作用 | 二氧化硅暴露小鼠的肺组织内皮细胞 | 单细胞组学 | 矽肺病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 二氧化硅暴露小鼠肺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 387 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA sequencing analysis reveals the heterogeneity and effect of TAMs in colorectal cancer
2025-Jan-01, Biochemistry and cell biology = Biochimie et biologie cellulaire
DOI:10.1139/bcb-2025-0041
PMID:40834430
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析结直肠癌中肿瘤相关巨噬细胞的异质性及其作用 | 首次在结直肠癌中系统揭示肿瘤相关巨噬细胞的异质性及其在肿瘤微环境中的动态轨迹 | 基于公共数据库的回顾性分析,样本来源有限 | 研究结直肠癌肿瘤微环境的异质性及免疫细胞的作用 | 结直肠癌患者的肿瘤组织和正常组织 | 单细胞测序分析 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | Monocle3轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | 27,414个细胞(来自正常组织、肿瘤核心和边界区域) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 388 | 2025-10-05 |
Comprehensive single-cell sequencing reveals the tumor microenvironment and tumor-specific characteristics in trachea squamous cell carcinoma
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1575647
PMID:40874228
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析气管鳞状细胞癌的肿瘤微环境和化疗反应机制 | 首次构建气管鳞状细胞癌的单细胞图谱,揭示化疗引起的T细胞状态转换关键转录调控因子 | 样本量较小(仅7个样本),缺乏独立验证队列 | 研究气管鳞状细胞癌的肿瘤微环境特征和化疗反应机制 | 气管鳞状细胞癌患者组织样本(5个恶性样本和2个非恶性样本) | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 7个TSCC样本(5恶性+2非恶性),70,682个高质量细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 389 | 2025-10-05 |
Cellular heterogeneity in metabolism and associated microbiome of a non-model phytoflagellate
2025-Jan-02, The ISME journal
DOI:10.1093/ismejo/wraf046
PMID:40057978
|
研究论文 | 本研究使用单细胞转录组学分析非模式微真核生物Ochromonas triangulata的代谢异质性和相关微生物组 | 首次在无参考基因组的非模式微真核生物中应用单细胞转录组学,发现了与不同生长阶段相关的第三种转录状态 | 研究对象为实验室培养的单一物种,可能无法完全反映自然环境中的复杂性 | 探索微真核生物的代谢异质性和与细菌群落的相互作用 | 非模式微真核生物Ochromonas triangulata及其共培养的细菌群落 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 单个微真核生物细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | Smart-seq2 | Smart-seq2单细胞全长转录组测序协议 |
| 390 | 2025-10-05 |
Artemisinin derivatives modulate KEAP1-NRF2-xCT pathway to alleviate Sjögren's disease: insights from scRNA-seq and systems biology
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1626230
PMID:40934008
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和系统生物学方法,探讨青蒿素衍生物通过调节KEAP1-NRF2-xCT通路缓解干燥综合征的作用机制 | 首次揭示青蒿素通过抑制KEAP1介导的NRF2泛素化/降解,上调xCT和GPX4表达,从而保护唾液腺上皮细胞免于铁死亡的新机制 | 研究仅使用NOD/Ltj小鼠模型,尚未在人类临床试验中验证 | 探究青蒿素衍生物通过调节铁死亡通路治疗干燥综合征的分子机制 | 干燥综合征患者样本和NOD/Ltj小鼠模型 | 系统生物学 | 干燥综合征 | 单细胞RNA测序, RNA测序, 分子对接, 透射电子显微镜, 蛋白质印迹, 免疫荧光 | NA | 单细胞RNA测序数据, RNA测序数据, 蛋白质表达数据, 组织学图像 | NOD/Ltj小鼠模型和干燥综合征患者样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 391 | 2025-10-05 |
FLT3L combined with GM-CSF induced dendritic cells drive broad tumor-specific CD8+ T cell responses and remodel the tumor microenvironment to enhance anti-tumor efficacy
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1649891
PMID:40977690
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研究论文 | 本研究比较了FLT3L联合GM-CSF诱导的树突状细胞与传统GM/IL4-DCs在抗肿瘤免疫中的功能差异 | 首次系统比较FL/GM-DCs与常规GM/IL4-DCs的功能差异,发现FL/GM-DCs具有独特的亚群分布和更强的交叉抗原呈递能力 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化效果需进一步验证 | 探索新型树突状细胞诱导方法在癌症免疫治疗中的应用潜力 | 小鼠骨髓细胞、树突状细胞、CD8+ T细胞 | 免疫学 | 癌症 | 流式细胞术、单细胞RNA测序、单细胞TCR测序 | NA | 单细胞测序数据、流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞TCR测序 | NA | NA |
| 392 | 2025-10-05 |
The interplay between mesenchymal stem cells and the immune microenvironment in rotator cuff tendon-to-bone healing: current progress and future directions
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1661340
PMID:40977708
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综述 | 本文综述了间充质干细胞与免疫微环境在肩袖肌腱-骨愈合中的相互作用机制及治疗前景 | 聚焦MSC与免疫细胞的双向通讯机制,提出整合单细胞转录组和AI预测的个体化治疗新策略 | 存在MSC异质性、患者免疫反应差异及临床转化障碍等挑战 | 探索MSC通过免疫调节促进肩袖肌腱-骨愈合的机制与治疗策略 | 间充质干细胞与免疫微环境(巨噬细胞、T细胞、NK细胞) | 组织工程与再生医学 | 肩袖损伤 | 单细胞转录组测序, 细胞因子特征分析 | AI算法 | 转录组数据, 细胞因子数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 393 | 2025-10-05 |
Opportunities, challenges, and future perspectives of oncolytic virus therapy for malignant melanoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1653683
PMID:40977706
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综述 | 本文综述溶瘤病毒疗法在恶性黑色素瘤治疗中的机遇、挑战和未来前景 | 系统阐述溶瘤病毒通过诱导免疫原性细胞死亡和激活cGAS-STING通路将'冷'肿瘤转化为'热'肿瘤的创新机制,并展望单细胞RNA测序和CRISPR/Cas系统等前沿技术在个性化溶瘤病毒设计中的应用 | 面临肿瘤异质性、核心机制局限、病毒脱落风险和监管障碍等挑战 | 探讨溶瘤病毒疗法在恶性黑色素瘤治疗中的发展现状和未来方向 | 恶性黑色素瘤 | 肿瘤免疫治疗 | 恶性黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, CRISPR/Cas系统, 人工智能 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 394 | 2025-10-05 |
Single-cell and bulk transcriptomic analyses reveal PANoptosis-associated immune dysregulation of fibroblasts in periodontitis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1671919
PMID:40977731
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研究论文 | 通过单细胞和批量转录组分析揭示牙周炎中成纤维细胞的PANoptosis相关免疫失调 | 首次在牙周炎中系统研究PANoptosis的作用机制,并整合多种机器学习模型筛选关键基因 | 样本量相对有限,需要进一步功能验证 | 探究PANoptosis在牙周炎发病机制中的作用 | 人牙龈组织和牙龈成纤维细胞,牙周炎模型小鼠 | 单细胞转录组学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,免疫荧光染色,qPCR,免疫组化 | 113种机器学习模型 | 单细胞转录组数据,批量转录组数据,空间转录组数据 | 牙周炎患者和健康个体的牙龈组织 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序 | NA | NA |
| 395 | 2025-10-05 |
Myeloid-specific S100A8/A9 deficiency attenuates atrial fibrillation through prevention of TLR4/NF-kB-mediated immune cell recruitment and inflammation
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1623486
PMID:40977740
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和基因敲除小鼠模型,揭示了髓系细胞来源的S100A8/A9通过TLR4/NF-κB轴促进心房颤动发生发展的分子机制 | 首次阐明髓系细胞特异性S100A8/A9在心房颤动中的致病作用及其通过TLR4/NF-κB信号通路调控免疫细胞募集和炎症反应的机制 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化价值需要进一步验证;NF-κB激活剂HY-18739的药理作用机制需更深入研究 | 探究髓系细胞来源的S100A8/A9在心房颤动发病机制中的作用及其治疗潜力 | 心房颤动患者样本和单核细胞/巨噬细胞特异性S100A9条件性基因敲除小鼠 | 心血管疾病研究 | 心房颤动 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 基因敲除, 电生理检测 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 电生理数据, 组织病理数据 | 未明确具体样本数量,包括AF患者样本和基因敲除小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 396 | 2025-10-05 |
ANXA1 and ARG2 drive T cell proliferation in ischemia-reperfusion injury: integrated bulk and single-cell transcriptomic analysis
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1673163
PMID:40977888
|
研究论文 | 通过整合性转录组分析揭示ANXA1和ARG2在缺血再灌注损伤中驱动T细胞增殖的分子机制 | 首次通过整合性转录组分析识别ANXA1和ARG2作为缺血再灌注损伤中T细胞增殖的关键调控因子 | 研究主要基于转录组数据,需要进一步实验验证这些基因的功能机制 | 探究缺血再灌注损伤中T细胞增殖的分子机制 | 缺血再灌注损伤模型中的T细胞 | 生物信息学 | 缺血再灌注损伤 | 单细胞RNA测序, 批量转录组测序, 免疫浸润分析, 分子动力学模拟 | NA | 转录组数据 | 多个器官模型的转录组数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 397 | 2025-10-05 |
Multi-transcriptomics analysis of ferroptosis related genes reveals CAFs exosomal COX4I2 as a novel therapeutic target in osteosarcoma
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1620648
PMID:40977891
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研究论文 | 通过多转录组学分析发现CAFs外泌体COX4I2是骨肉瘤铁死亡治疗的新靶点 | 首次发现CAFs通过外泌体传递COX4I2蛋白抑制骨肉瘤细胞铁死亡的新机制 | 铁死亡在骨肉瘤中的预后意义和调控机制仍需进一步探索 | 探究铁死亡相关基因在骨肉瘤中的预后价值和调控机制 | 骨肉瘤细胞系143B、癌症相关成纤维细胞(CAFs)、裸鼠 | 生物信息学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序, Western blot, 共聚焦显微镜, 透射电子显微镜 | LASSO回归, SVM, RF, XGBoost, BORUTA | RNA测序数据, 蛋白质数据, 细胞成像数据 | 两个独立GEO队列(GSE21257和GSE39055), 体外细胞实验, 裸鼠体内实验 | NA | 单细胞RNA-seq, 外泌体分析 | NA | NA |
| 398 | 2025-10-05 |
scAGG: Sample-level embedding and classification of Alzheimer's disease from single-nucleus data
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.08.009
PMID:40977903
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研究论文 | 提出scAGG模型,利用单细胞RNA测序数据进行阿尔茨海默病的样本级分类 | 开发了样本级池化机制来聚合单细胞嵌入,能够从单细胞数据中学习疾病严重程度的细胞排序 | 注意力模型的解释性有限 | 利用单细胞RNA测序数据进行阿尔茨海默病的样本级分类和疾病机制研究 | 阿尔茨海默病患者和健康对照的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 样本级池化模型,注意力模型 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 399 | 2025-10-05 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Cellular Heterogeneity and Microenvironmental Remodeling in Human Ureteral Scar Stricture Tissue
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S540340
PMID:40979497
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了人类输尿管瘢痕狭窄组织的单细胞转录组图谱,揭示了细胞异质性和微环境重塑 | 首次构建了输尿管瘢痕狭窄组织的高分辨率单细胞图谱,揭示了细胞亚群动态变化和细胞间通讯网络 | 样本量较小(3例正常对照和3例患者),需要更大规模研究验证发现 | 揭示输尿管瘢痕狭窄组织的细胞异质性和微环境重塑机制 | 人类输尿管组织(正常对照和瘢痕狭窄患者) | 单细胞转录组学 | 输尿管瘢痕狭窄 | 单细胞RNA测序, 多重免疫荧光, 免疫组织化学 | Seurat, Harmony, Monocle2, CellChat, SCP | 单细胞转录组数据, 图像数据 | 6例样本(3例正常对照,3例患者) | Illumina | 单细胞RNA测序 | Illumina NovaSeq 6000, MobiNova-100 | MobiNova-100单细胞平台,Illumina NovaSeq 6000测序系统 |
| 400 | 2025-10-05 |
Integrative analysis of single-cell and microarray data reveals SPI1-centered macrophage regulatory signatures in ulcerative colitis
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1617834
PMID:40979590
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和微阵列数据分析,揭示了转录因子SPI1在溃疡性结肠炎巨噬细胞极化中的核心调控作用 | 首次构建了以SPI1为中心的巨噬细胞调控网络,并鉴定出IRAK3、IL1RN、CD55和PEA15等关键下游靶基因 | 研究主要基于体外实验,需要进一步的体内验证;样本量相对有限 | 探索溃疡性结肠炎中巨噬细胞极化的分子调控机制 | 溃疡性结肠炎患者的肠道组织巨噬细胞 | 生物信息学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序, 微阵列, 基因调控网络分析, 机器学习算法 | LASSO, RFE-RF, SVM-RFE | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 微阵列 | NA | NA |