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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
21 2025-12-15
Macrophage migration inhibitory factor-CD74 axis drives vascular smooth muscle cell-induced M1 macrophage polarization to exacerbate intracranial aneurysm inflammation
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析揭示了颅内动脉瘤中分泌型血管平滑肌细胞通过MIF-CD74轴驱动巨噬细胞M1极化,加剧炎症的新机制 首次提供了颅内动脉瘤的单细胞图谱,并发现sVSMC来源的MIF-CD74轴是驱动巨噬细胞M1极化和动脉瘤炎症的新机制 研究主要基于转录组和体外实验,体内功能验证和临床转化潜力需进一步探索 阐明巨噬细胞迁移抑制因子在颅内动脉瘤炎症中的作用机制 颅内动脉瘤组织、正常动脉组织、分泌型血管平滑肌细胞、巨噬细胞 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序、甲基化测序、转录组分析、体外功能实验 NA RNA测序数据、甲基化数据、单细胞转录组数据 未明确具体样本数量,涉及IA和正常动脉组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
22 2025-12-15
Succinylation heterogeneity in lung adenocarcinoma: from prognostic model to KLK6-driven tumor microenvironment remodeling
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究描绘了肺腺癌中琥珀酰化的全景图,构建了一个基于琥珀酰化的新型预后模型,并发现KLK6是肿瘤进展和免疫抑制的潜在驱动因子 首次在肺腺癌中系统描绘了蛋白质琥珀酰化的全景图及其临床意义,构建了基于7个基因的琥珀酰化预后特征,并利用单细胞和空间转录组学揭示了KLK6通过重塑肿瘤微环境促进肿瘤进展的新机制 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,部分机制结论(如KLK6驱动成纤维细胞分化)仍需更多体内实验验证,临床转化潜力有待前瞻性研究评估 探索肺腺癌中蛋白质琥珀酰化的全景图、临床预后价值及其对肿瘤微环境的影响,并寻找潜在治疗靶点 肺腺癌患者(来自TCGA和GEO数据库的多个队列)、肺腺癌细胞系 生物信息学与计算生物学 肺癌 多组学整合分析、差异表达分析、Cox回归、PCA、LASSO、单细胞RNA测序、空间转录组学、hdWGCNA、体外细胞实验 预后风险模型(基于LASSO和Cox回归) 基因组、转录组、临床数据、单细胞RNA测序数据、空间转录组数据 TCGA队列及7个独立的GEO验证队列(具体样本数未在摘要中明确给出) NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
23 2025-12-15
RNA interference shapes stress responses in Arabidopsis thaliana
2025, Frontiers in plant science IF:4.1Q1
综述 本文综述了RNA干扰在拟南芥应激响应中的调控机制,整合了系统性信号传递、应激响应RNAi机制及AGO蛋白多样性的最新进展 将系统性sRNA信号传递、应激响应RNAi机制和AGO蛋白多样性整合为一个连贯框架,用于理解RNAi驱动的应激适应 NA 理解RNA干扰在植物应激响应中的调控作用与机制 拟南芥中的小RNA(包括miRNA和siRNA)及ARGONAUTE蛋白 自然语言处理 NA 高分辨率sRNA测序、单细胞转录组学 NA NA NA NA 单细胞转录组学 NA NA
24 2025-12-15
Single-cell transcriptome analysis reveals elongation and ossification characteristics of antlers
2025, Frontiers in veterinary science IF:2.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组测序分析了梅花鹿鹿角尖端的间充质和软骨组织,揭示了鹿角快速伸长和骨化的细胞分化轨迹 首次在单细胞分辨率下解析了鹿角尖端间充质和软骨组织的分化轨迹,并鉴定出一种具有多种细胞特征的新型过渡细胞 研究仅基于一只5岁健康雄性梅花鹿的样本,样本量较小,且未涉及不同发育阶段或不同个体的比较 阐明鹿角快速伸长和骨化过程中的细胞分化机制 梅花鹿鹿角尖端的间充质和软骨组织 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 一只5岁健康雄性梅花鹿的鹿角尖端组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
25 2025-12-14
Unraveling atherosclerosis through single-cell RNA sequencing: insights into cellular heterogeneity and disease mechanisms
2025, Einstein (Sao Paulo, Brazil)
综述 本文综述了单细胞RNA测序技术在动脉粥样硬化研究中的应用,以揭示其细胞异质性和疾病机制 利用单细胞RNA测序技术详细分析动脉粥样硬化斑块内的细胞组成,提供更全面和细致的斑块生物学理解 NA 阐明动脉粥样硬化的发病、进展机制及潜在治疗靶点 动脉粥样硬化斑块 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
26 2025-12-14
Identification of locally advanced rectal cancer-related genes based on transcriptome and mendelian randomization analysis with biological validation
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过转录组和孟德尔随机化分析,结合生物验证,识别了局部晚期直肠癌相关的关键基因 结合孟德尔随机化分析与单细胞RNA测序,系统识别并验证了局部晚期直肠癌的致病基因,特别是对SLC19A1的功能进行了体外验证 研究主要基于公共数据库数据,体外验证仅针对单个基因,需要进一步体内实验和临床样本验证 揭示局部晚期直肠癌的分子机制并识别潜在治疗靶点 局部晚期直肠癌患者样本 生物信息学 直肠癌 转录组分析,孟德尔随机化分析,单细胞RNA测序,体外功能实验 NA 基因表达数据,eQTL数据,单细胞RNA测序数据 基于GEO和TCGA数据库的局部晚期直肠癌样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
27 2025-12-14
Anti-HER2/neu TCR-T Cells in Action: linking transcriptional signatures, secretomics, and In Vivo tumor suppression
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过体外细胞毒性实验、单细胞RNA测序、分泌组分析和体内异种移植模型,功能验证了靶向HER2/neu蛋白KIFGSLAFL肽段的特定TCR克隆型,揭示了其抗肿瘤活性和独特的CD4+CD8+ T细胞群体 首次在抗原刺激下鉴定出独特的双阳性(CD4+CD8+)T细胞群体,并系统关联了转录组特征、分泌组学与体内肿瘤抑制效果,为TCR-T细胞治疗提供了新的机制见解 研究主要基于HER2/neu高表达的肿瘤细胞和HLA-A*02限制性模型,可能无法完全代表其他抗原或HLA背景下的情况,且体内实验使用免疫缺陷小鼠模型,未能模拟完整的人类免疫微环境 功能验证靶向HER2/neu的特定TCR克隆型,并阐明其抗肿瘤的分子机制 抗HER2/neu TCR-T细胞 癌症免疫治疗 HER2/neu阳性癌症 单细胞RNA测序, 分泌组分析, 体外细胞毒性实验, 体内异种移植模型 NA 单细胞转录组数据, 分泌蛋白数据, 体内肿瘤生长数据 NA BD Biosciences 单细胞RNA-seq BD Rhapsody BD Rhapsody单细胞分析系统
28 2025-12-14
IgA expressed by glomerular mesangial cells is involved in the pathogenesis of IgA nephropathy
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和荧光原位杂交技术,证实了肾小球系膜细胞表达IgA,并探讨了其在IgA肾病发病机制中的作用 挑战了IgA肾病发病的“多打击假说”,首次证实肾小球系膜细胞是IgA的来源之一,并揭示了SEB通过TLR4通路诱导Gd-IgA1过表达的新机制 研究主要基于体外细胞实验和动物模型,人类临床样本验证有限,且SEB诱导的机制在人体内的直接相关性需进一步探究 探究肾小球系膜细胞表达的IgA是否参与IgA肾病的发病及其初步机制 肾小球系膜细胞、μMT小鼠、条件性敲除IGHA的小鼠、人类肾组织样本 数字病理学 IgA肾病 单细胞RNA测序、荧光原位杂交、基因集富集分析、siRNA干扰 动物模型(小鼠)、细胞培养模型 RNA测序数据、图像数据、实验观测数据 未明确指定具体样本数量,涉及人类肾组织、小鼠模型和培养细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
29 2025-12-14
TFEB-mediated autophagy stimulation as an anabolic strategy for bone: insights from TFEB activation in the osteoblast lineage
2025, Autophagy reports
研究论文 本研究通过在小鼠成骨细胞谱系中特异性激活TFEB,探索了自噬刺激对骨形成和骨骼稳态的促进作用 首次在成骨细胞谱系中特异性激活TFEB,揭示了自噬刺激通过减少细胞凋亡和增强功能来促进骨形成的新机制 研究基于小鼠模型,结果在人类中的适用性尚需验证,且具体分子通路细节有待进一步阐明 探究自噬在骨形成中的作用机制,并评估自噬刺激作为骨质疏松潜在治疗策略的可行性 遗传修饰小鼠模型中的成骨细胞谱系细胞 NA 骨质疏松症 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
30 2025-12-14
Cuproptosis and Immune Microenvironment Interplay in Temporal Lobe Epilepsy: Identification of Key Molecular Signatures and Therapeutic Targets
2025, Journal of inflammation research IF:4.2Q2
研究论文 本研究首次探讨了铜死亡在颞叶癫痫中的作用,揭示了其与免疫微环境的相互作用,并识别了关键分子特征和治疗靶点 首次将铜死亡确立为连接铜失调与颞叶癫痫病理的机制桥梁,提出了基于铜死亡相关基因的疾病亚型分类,并识别了CD44、PDE5A和TUBA1A作为新的治疗靶点 研究主要基于生物信息学分析和动物模型验证,缺乏人类患者样本的直接验证,且铜死亡在癫痫中的具体分子机制仍需进一步探索 探究铜死亡在颞叶癫痫中的分子基础、神经炎症串扰及治疗意义 颞叶癫痫患者和毛果芸香碱诱导的颞叶癫痫小鼠模型 生物信息学 颞叶癫痫 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 加权基因共表达网络分析, 共识聚类, 机器学习算法, Western blot, 免疫组织化学 机器学习算法(10种) RNA-seq数据, 单细胞RNA-seq数据 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
31 2025-12-14
TMOD2 and DOCK4 as Novel Gut Microbiota-Associated Biomarkers for Colorectal Adenoma: Integrated Transcriptomic Analysis and Therapeutic Target Identification
2025, Mediators of inflammation IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过整合转录组学数据和孟德尔随机化分析,鉴定出与结直肠腺瘤风险相关的肠道微生物物种,并确定了TMOD2和DOCK4作为新型生物标志物和潜在治疗靶点 首次将肠道微生物遗传学与转录组学整合,通过孟德尔随机化建立肠道微生物与结直肠腺瘤的因果关系,并利用单细胞RNA测序验证生物标志物在肿瘤微环境不同细胞群中的表达模式 未在独立的大规模临床队列中进行前瞻性验证,药物筛选结果需要进一步的体外和体内实验验证 识别可用于结直肠腺瘤早期检测和治疗的肠道微生物相关分子标志物 结直肠腺瘤患者样本和相关的转录组数据 生物信息学 结直肠癌 单细胞RNA测序, 转录组分析, 孟德尔随机化分析 机器学习算法 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
32 2025-12-14
SLC11A1 protein as a key regulator of iron metabolism, ferroptosis mediator, and putative therapeutic target in nonalcoholic fatty liver disease: an integrated bioinformatics analysis
2025, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1
研究论文 本研究通过整合生物信息学分析,揭示了SLC11A1蛋白作为铁代谢和铁死亡的关键调节因子,是非酒精性脂肪肝病(NAFLD)的潜在生物标志物和治疗靶点 首次通过整合WGCNA、机器学习算法(LASSO)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)和分子对接/动力学模拟,系统鉴定了NAFLD中铁代谢/铁死亡相关的关键调控蛋白(特别是SLC11A1),并预测了已批准药物Resmetirom的潜在靶向作用机制 研究主要基于生物信息学分析和体外验证,缺乏深入的体内功能实验和临床队列验证来证实SLC11A1的因果作用和治疗潜力 深入探索非酒精性脂肪肝病(NAFLD)的新型生物标志物和治疗策略,重点关注铁代谢失调和铁死亡在疾病进展中的作用 非酒精性脂肪肝病(NAFLD)患者的数据集(来自GEO数据库)以及相关的铁代谢/铁死亡相关基因和蛋白 生物信息学 非酒精性脂肪肝病 生物信息学分析(包括差异表达基因分析、WGCNA、LASSO回归)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、分子对接、分子动力学模拟、定量逆转录聚合酶链反应(qRT-PCR) 机器学习算法(LASSO回归) 基因表达数据(来自GEO数据库)、单细胞RNA测序数据、蛋白质结构数据 NA(文中提及使用了GEO数据库中的NAFLD数据集和验证集,但未明确总样本数量) NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、批量RNA测序(推断,来自GEO数据库) NA NA
33 2025-12-14
Redox phenotype confers T cell-exclusion microenvironment and resistance to immunotherapy by suppressing STING/MDA5 expression and interferon signaling in lung cancers harboring KEAP1/STK11 mutations
2025, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 本研究探讨了KEAP1/STK11突变通过调控氧化还原表型抑制STING/MDA5表达和干扰素信号,从而介导免疫逃逸和免疫治疗抵抗的机制 首次将KEAP1/STK11突变驱动的氧化还原表型与STING/MDA5表达抑制及免疫微环境重塑联系起来,揭示了免疫治疗抵抗的新机制 研究主要基于生物信息学分析和回顾性队列,缺乏实验验证;样本来源和数量可能限制结论的普适性 探究KEAP1/STK11突变导致非小细胞肺癌免疫治疗抵抗的分子机制 非小细胞肺癌患者肿瘤样本及免疫检查点抑制剂治疗队列 生物信息学 肺癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA 基因表达数据 TCGA和GSE72094队列的肺癌样本,以及单细胞RNA-seq数据集和免疫治疗队列 NA RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
34 2025-12-14
MRI-based radiomic clustering identifies a glioblastoma subtype enriched for neural stemness and proliferative programs
2025, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过整合术前MRI影像组学特征与多平台转录组学数据,识别出一种与神经干性和增殖程序相关的胶质母细胞瘤高风险亚型 首次将MRI影像组学亚型与单细胞及空间转录组学数据相结合,揭示了影像表型背后的分子机制和细胞群体特征 研究样本量有限,且为回顾性分析,需要进一步的前瞻性验证 探索胶质母细胞瘤影像组学亚型的生物学基础及其与预后的关联 IDH野生型胶质母细胞瘤患者 数字病理 胶质母细胞瘤 MRI影像组学,bulk RNA-seq,单细胞RNA-seq,空间转录组学 无监督聚类 医学影像,转录组数据 未明确指定样本数量 NA bulk RNA-seq,单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
35 2025-12-14
Establishment and transcriptomic characterization of canine organoids from multiple tissues
2025, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
研究论文 本文报道了从两只遗传相关犬只的多个组织中建立并转录组学表征犬类器官样细胞系的研究 首次从两只遗传相关犬只的多个组织中建立并全面表征犬类器官样细胞系,包括子宫内膜、胰腺、膀胱、肾脏、肺和肝脏,并利用scRNA-seq识别器官样特异性转录组特征 仅使用两只遗传相关犬只的样本,样本量较小,可能限制结果的普遍性 建立犬类器官样细胞系平台,以加速药物测试、疾病建模和个性化医学研究,减少对活体动物实验的依赖 犬类器官样细胞系,包括子宫内膜、胰腺、膀胱、肾脏、肺和肝脏组织 数字病理学 NA 免疫组织化学,bulk RNA-seq,scRNA-seq NA 转录组数据,图像数据 两只遗传相关犬只(B816和B818)的六个组织器官样细胞系 NA bulk RNA-seq, scRNA-seq NA NA
36 2025-12-14
Optimised dissociation and multimodal profiling of prostate cancer stroma reveal fibromuscular cell heterogeneity with clinical correlates
2025, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过优化组织解离方案并结合单细胞RNA测序、流式细胞术和免疫荧光等多模态分析,深入表征了前列腺癌基质中纤维肌细胞的异质性及其临床相关性 开发了一种优化的组织解离方案,显著提高了基质细胞的回收率和活性,并首次通过多模态整合分析识别出具有空间分布和预后意义的、临床相关的纤维肌细胞亚群,包括与不良预后相关的周细胞和一种与基质活化相关的新型平滑肌细胞亚群 未在摘要中明确说明研究的局限性 更好地表征前列腺癌肿瘤微环境中作为主要组织驻留基质细胞亚型的成纤维细胞和平滑肌细胞群体 前列腺癌组织中的纤维肌基质细胞(成纤维细胞和平滑肌细胞) 数字病理学 前列腺癌 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 免疫荧光, 组织解离, 体外培养 降维与聚类分析 单细胞转录组数据, 流式细胞计数数据, 免疫组织化学图像 未在摘要中明确说明具体样本数量,但涉及良性和恶性样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
37 2025-12-13
Application of computational algorithms for single-cell RNA-seq and ATAC-seq in neurodegenerative diseases
2025-Jan-15, Briefings in functional genomics IF:2.5Q3
综述 本文综述了整合单细胞RNA测序和ATAC测序数据的计算工具与机器学习方法,及其在神经退行性疾病中的应用 整合scRNA-seq和scATAC-seq数据以关联转录组与染色质可及性,揭示神经退行性疾病的致病机制 面临数据稀疏性和计算需求高的挑战 促进单细胞多组学技术在神经退行性疾病研究中的应用,以阐明病理机制并识别治疗靶点 阿尔茨海默病和帕金森病等神经退行性疾病 机器学习 神经退行性疾病 scRNA-seq, scATAC-seq NA 单细胞转录组和染色质可及性数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq NA NA
38 2025-12-13
TIMP1 Mediates Astrocyte-Dependent Local Immunosuppression in Brain Metastasis Acting on Infiltrating CD8+ T Cells
2025-Jan-13, Cancer discovery IF:29.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了脑转移中星形胶质细胞的异质性,并发现一个分泌TIMP1的星形胶质细胞亚群通过抑制浸润性CD8+ T细胞的抗肿瘤活性介导局部免疫抑制,为症状性脑转移患者的联合免疫治疗提供了新策略 首次利用单细胞RNA测序技术解析脑转移中星形胶质细胞的异质性,并鉴定出通过分泌TIMP1介导局部免疫抑制的pSTAT3+星形胶质细胞亚群及其对CD63+ CD8+ T细胞功能的调控机制 研究主要基于小鼠和人类脑转移模型,临床转化效果需进一步验证;TIMP1作为生物标志物的敏感性和特异性在更大样本中待评估 探究脑转移中星形胶质细胞介导的局部免疫抑制机制,以开发针对症状性脑转移的联合免疫治疗策略 脑转移中的星形胶质细胞和浸润性CD8+ T细胞 单细胞测序与免疫学 脑转移瘤 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
39 2025-12-13
Mechanistic insights into GPAA1-mediated cold tumor phenotype and immune evasion in colorectal cancer: integrative multi-omics analysis and experimental validation
2025, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过整合多组学数据揭示了GPAA1在结直肠癌中的过表达及其通过基因组不稳定性和免疫抑制促进肿瘤进展的机制 首次系统分析了GPAA1在泛癌及结直肠癌中的表达模式,并揭示了其通过诱导基因组不稳定和免疫冷表型促进肿瘤进展的新机制 研究主要基于公共数据库和体外实验,缺乏体内动物模型验证;样本来源多样可能引入批次效应 阐明GPAA1在结直肠癌中的表达模式、功能作用及其与免疫微环境的关系 结直肠癌组织和细胞系 多组学分析 结直肠癌 多组学整合分析、单细胞转录组学、空间转录组学、功能实验(增殖、迁移、侵袭) NA mRNA表达数据、蛋白质表达数据、单细胞转录组数据、空间转录组数据 来自TCGA、GTEx、GEO、HPA等多个公共数据库的结直肠癌样本 NA 单细胞RNA-seq、空间转录组学、bulk RNA-seq NA NA
40 2025-12-13
Case Report: Blood single-cell analysis of a IVB high-grade serous ovarian cancer patient presenting a favorable prognosis
2025, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
病例报告 本文报告了一例IVB期高级别浆液性卵巢癌患者,通过血液单细胞分析揭示其良好预后的潜在分子特征 采用多平台液体活检方法,结合血小板RNA测序、单细胞RNA测序和成像流式细胞术,全面分析血液成分,识别与预后相关的独特分子特征 本研究为单病例报告,样本量有限,结果需要更大规模研究验证 探索IVB期高级别浆液性卵巢癌患者良好预后的潜在驱动因素 一名IVB期高级别浆液性卵巢癌患者 数字病理学 卵巢癌 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,成像流式细胞术 NA RNA测序数据,流式细胞术图像数据 1名患者的术前外周血样本 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
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