单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1334 篇文献，本页显示第 361 - 380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2025-05-17 |
Comprehensive sequencing of the lung neuroimmune landscape in response to asthmatic induction
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1518771
PMID:40181989
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研究论文 | 本研究通过RNA测序技术探索了哮喘诱导对肺神经免疫转录组的影响 | 首次全面测序了哮喘诱导后肺神经免疫景观的变化，并揭示了特定神经元簇和空间分布模式 | 研究仅在小鼠模型中进行，未涉及人类样本 | 探究哮喘诱导如何改变肺神经免疫转录组 | 小鼠的迷走神经节(结状/颈静脉神经节)和肺组织 | 神经免疫学 | 哮喘 | 标准RNA测序、单核RNA测序、空间RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 未明确说明样本数量，使用naïve小鼠和经链格孢属诱导的哮喘小鼠 |
| 362 | 2025-05-17 |
Temporal and spatial distribution of histone acetylation in mouse molar development
2025, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.19215
PMID:40183048
|
研究论文 | 本研究通过小鼠磨牙模型，揭示了组蛋白乙酰化修饰在牙齿发育过程中的时空分布及其作用机制 | 首次系统地描绘了组蛋白H3和H4及其乙酰化位点在牙齿形成过程中的分布模式，并鉴定了关键组蛋白乙酰转移酶和去乙酰化酶 | 研究仅基于小鼠模型，人类牙齿发育中的组蛋白乙酰化机制仍需进一步验证 | 揭示组蛋白乙酰化修饰与牙齿发育之间的关联 | 小鼠磨牙发育过程中的组蛋白乙酰化修饰 | 发育生物学 | NA | scRNA-seq, 免疫组织化学 | NA | 基因表达数据, 组织切片图像 | 小鼠磨牙发育不同阶段的样本 |
| 363 | 2025-05-17 |
Characterizing macrophage diversity in colorectal malignancies through single-cell genomics
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1526668
PMID:40191203
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review | 本文综述了单细胞基因组学在结直肠恶性肿瘤中巨噬细胞多样性研究中的应用 | 通过单细胞RNA测序技术揭示肿瘤相关巨噬细胞的异质性及其潜在功能分类 | 缺乏对巨噬细胞多样性命名和分子特征的统一解释 | 探讨结直肠恶性肿瘤中巨噬细胞多样性的特征及其在肿瘤微环境中的作用 | 结直肠恶性肿瘤中的肿瘤相关巨噬细胞 | 单细胞基因组学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 364 | 2025-05-17 |
Successful cryopreservation of marine invertebrates immune cells enables long-term studies of common octopus, Octopus vulgaris Cuvier 1797, hemocyte immune functions
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1543587
PMID:40191212
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研究论文 | 本文研究了普通章鱼血细胞的冷冻保存技术，以支持其免疫功能的长期研究 | 首次展示了冷冻保存的章鱼血细胞的功能性结果，并确定了最佳的冷冻保存介质和程序 | 研究仅针对普通章鱼，未涵盖其他软体动物物种 | 开发冷冻保存技术以支持章鱼免疫细胞的长期功能研究 | 普通章鱼（Octopus vulgaris）的血细胞 | 细胞生物学 | NA | 冷冻保存技术，单细胞测序 | NA | 细胞功能数据，基因表达数据 | 冷冻保存15周后的章鱼血细胞样本 |
| 365 | 2025-05-17 |
Molecular biology of the deadliest cancer - glioblastoma: what do we know?
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1530305
PMID:40191211
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review | 本文综述了胶质母细胞瘤的分子生物学特性及其微环境，强调了其生物特性和分子通讯模式 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了胶质母细胞瘤微环境的新见解，提出了个性化多免疫疗法的必要性 | NA | 总结当前关于胶质母细胞瘤及其微环境的知识，探讨个性化治疗的可能性 | 胶质母细胞瘤细胞及其微环境 | 分子生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | NA |
| 366 | 2025-05-17 |
Single-cell transcriptomics reveals immunosuppressive microenvironment and highlights tumor-promoting macrophage cells in Glioblastoma
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0312764
PMID:40193323
|
research paper | 通过单细胞转录组学揭示胶质母细胞瘤中的免疫抑制微环境，并突出肿瘤促进性巨噬细胞的作用 | 鉴定了五种不同的肿瘤相关巨噬细胞亚型，并发现TAM_MRC1亚型具有明显的M2极化特征，同时发现了一种具有耗竭表型的NK细胞亚型CD56dim_DNAJB1 | 样本量相对较小（24名患者的48个肿瘤片段），可能影响结果的普遍性 | 揭示胶质母细胞瘤微环境中的细胞异质性和复杂性，为免疫治疗提供潜在靶点 | 胶质母细胞瘤患者的肿瘤组织 | digital pathology | 胶质母细胞瘤 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 24名患者的48个肿瘤片段 |
| 367 | 2025-05-17 |
Single-cell analysis reveals potential therapeutic markers of peripheral blood mononuclear cells from bladder cancer patients
2025, Brazilian journal of medical and biological research = Revista brasileira de pesquisas medicas e biologicas
DOI:10.1590/1414-431X2025e14002
PMID:40367012
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析膀胱癌患者外周血单个核细胞，揭示潜在的治疗标志物 | 首次在膀胱癌患者外周血单个核细胞中鉴定出LAG-3和TIM-3等新型潜在免疫检查点抑制剂靶点，并发现多个与肿瘤进展相关的细胞亚群及其特征基因 | 样本量相对较小（仅包括患者和一名健康供体），且未进行功能验证实验 | 探索膀胱癌免疫治疗的潜在新靶点和生物标志物 | 膀胱癌患者和健康供体的外周血单个核细胞 | 单细胞转录组学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 44,022个细胞（来自膀胱癌患者和一名健康供体的外周血单个核细胞样本） |
| 368 | 2025-05-17 |
The CD38+HLA-DR+ T cells with activation and exhaustion characteristics as predictors of severity and mortality in COVID-19 patients
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1577803
PMID:40370439
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研究论文 | 该研究通过流式细胞术和单细胞RNA测序技术，分析了COVID-19患者外周免疫细胞的特征，发现CD38+HLA-DR+ T细胞的扩增与疾病严重程度和死亡率相关 | 首次将CD38+HLA-DR+ T细胞确定为COVID-19预后的新型生物标志物，并揭示了其独特的激活-耗竭表型及对NAD+代谢的影响 | 样本来源仅限于外周血，未评估组织中的免疫细胞特征；研究人群的多样性可能有限 | 寻找COVID-19的新型治疗靶点和早期预测生物标志物 | 健康人、细菌性肺炎患者和COVID-19患者的外周免疫细胞 | 免疫学 | COVID-19 | 流式细胞术、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 细胞表型数据、基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量，但包括健康人、细菌性肺炎患者和COVID-19患者三类人群 |
| 369 | 2025-05-17 |
Single-cell transcriptome reveals potential mechanisms for gout in children
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1577109
PMID:40370447
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探索了儿童痛风的分子机制 | 揭示了CD14+单核细胞和DN T细胞在儿童痛风中的关键作用，以及与成人痛风的异同 | 样本来源仅限于外周血，未涉及痛风关节组织 | 探索儿童痛风的分子机制 | 儿童痛风患者和健康对照的外周血样本 | 生物医学 | 痛风 | scRNA-seq | NA | RNA测序数据 | 儿童痛风患者和健康对照的外周血样本（具体数量未说明） |
| 370 | 2025-05-17 |
Exploration the role of pro-inflammatory fibroblasts and related markers in periodontitis: combing with scRNA-seq and bulk-seq data
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1537046
PMID:40370461
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量转录组数据分析，探索了促炎性牙龈成纤维细胞（PIGFs）在牙周炎中的作用及其相关分子机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别出与牙周炎发展密切相关的促炎性牙龈成纤维细胞亚群，并发现MME和TSPAN11两个基因作为潜在治疗靶点 | 研究样本量有限，且未在更大人群中验证MME和TSPAN11的临床效果 | 探索促炎性牙龈成纤维细胞在牙周炎发病机制中的作用及其分子机制 | 牙龈成纤维细胞（GFs）及其亚群促炎性牙龈成纤维细胞（PIGFs） | 数字病理学 | 牙周炎 | scRNA-seq, bulk-seq, qPCR, 免疫荧光染色 | 多种机器学习算法 | RNA测序数据 | 来自正常和牙周炎患者的scRNA-seq数据 |
| 371 | 2025-05-17 |
Unraveling the role of histone acetylation in sepsis biomarker discovery
2025, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2025.1582181
PMID:40370519
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研究论文 | 本研究通过转录组和单细胞RNA测序数据，结合机器学习算法，发现了与组蛋白乙酰化相关的脓毒症生物标志物 | 首次将组蛋白乙酰化与脓毒症生物标志物发现联系起来，并利用多种机器学习算法和孟德尔随机化方法进行验证 | 研究样本量未明确说明，且需要进一步临床验证 | 发现脓毒症早期诊断和预后的有效生物标志物 | 脓毒症患者（具体样本信息未提供） | 生物信息学 | 脓毒症 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 孟德尔随机化 | LASSO, SVM-RFE, Boruta | 基因表达数据 | NA |
| 372 | 2025-05-17 |
Resveratrol targeting MDM2/P53/PUMA axis to inhibit colonocyte apoptosis in DSS-induced ulcerative colitis mice
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1572906
PMID:40371345
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research paper | 该研究探讨了白藜芦醇通过调节MDM2/P53/PUMA轴抑制结肠细胞凋亡，从而治疗DSS诱导的溃疡性结肠炎的潜力 | 揭示了白藜芦醇通过MDM2/P53/PUMA轴抑制结肠细胞凋亡的新机制，并验证了MDM2作为溃疡性结肠炎治疗靶点的潜力 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，尚未在人体中进行验证 | 研究白藜芦醇在溃疡性结肠炎治疗中的作用机制和疗效 | DSS诱导的溃疡性结肠炎小鼠模型和体外培养的结肠细胞 | 生物医学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞测序、免疫荧光染色、腺相关病毒系统 | 小鼠溃疡性结肠炎模型 | 实验数据 | 未明确说明样本数量 |
| 373 | 2025-05-16 |
Identification and validation of m6A RNA methylation and ferroptosis-related biomarkers in sepsis: transcriptome combined with single-cell RNA sequencing
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1543517
PMID:40124361
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research paper | 该研究通过转录组和单细胞RNA测序技术，识别并验证了与脓毒症相关的m6A RNA甲基化和铁死亡相关生物标志物 | 首次结合m6A RNA甲基化和铁死亡相关基因，利用机器学习方法和单细胞分析技术识别脓毒症生物标志物，并探索其免疫浸润和治疗潜力 | 研究主要基于公共数据库和有限临床样本，需要更大规模的临床验证 | 识别和验证脓毒症的潜在生物标志物，并探索其分子机制和治疗潜力 | 脓毒症患者和对照组的转录组数据及临床样本 | 生物信息学 | 脓毒症 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, WGCNA, RT-qPCR | 机器学习方法（未指定具体模型） | RNA-seq数据, 单细胞数据 | 公共数据库中的转录组数据集和临床样本（未明确数量） |
| 374 | 2025-05-16 |
Integrative analysis of single-cell and bulk RNA sequencing reveals the oncogenic role of ANXA5 in gastric cancer and its association with drug resistance
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1562395
PMID:40124374
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研究论文 | 通过整合单细胞和批量RNA测序数据，揭示了ANXA5在胃癌中的致癌作用及其与耐药性的关联 | 识别了MUC5AC+恶性上皮细胞簇在胃癌侵袭和上皮-间质转化中的关键作用，并建立了包含ANXA5和GABARAPL2的预后模型 | 研究依赖于公开数据库的数据，可能受到样本选择和测序技术的限制 | 探索胃癌进展的分子机制及耐药性基础 | 胃癌组织和相关细胞群 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 预后模型 | RNA测序数据 | 来自TCGA、GEO和OMIX001073数据库的多个数据集 |
| 375 | 2025-05-16 |
TGF-β-mediated activation of fibroblasts in cervical cancer: implications for tumor microenvironment and prognosis
2025, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.19072
PMID:40124621
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研究论文 | 本研究探讨了TGF-β信号在宫颈癌相关成纤维细胞中的作用及其与免疫细胞的相互作用，旨在阐明其对宫颈癌进展的影响 | 通过单细胞RNA测序数据分析了宫颈癌患者的肿瘤微环境，并构建了一个基于三个基因（ITGA5、SHF和SNRPN）的预后模型，该模型在多个数据集中表现出良好的预测能力 | 研究主要基于生物信息学分析和体外细胞实验，缺乏体内实验验证 | 阐明TGF-β信号在宫颈癌相关成纤维细胞中的作用及其对肿瘤微环境和预后的影响 | 宫颈癌患者的肿瘤微环境，特别是成纤维细胞和免疫细胞 | 肿瘤生物学 | 宫颈癌 | scRNA-seq, WGCNA, qRT-PCR, CCK-8, 划痕实验 | 预后基因模型（基于ITGA5、SHF和SNRPN） | 单细胞RNA测序数据, TCGA-CESC数据集 | NA |
| 376 | 2025-05-16 |
AQP1 Affects Necroptosis by Targeting RIPK1 in Endothelial Cells of Atherosclerosis
2025, Vascular health and risk management
IF:2.6Q2
DOI:10.2147/VHRM.S487327
PMID:40129682
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研究论文 | 本研究探讨了AQP1通过靶向RIPK1影响内皮细胞坏死性凋亡在动脉粥样硬化中的作用 | 首次揭示了AQP1通过抑制RIPK3和MLKL的表达来抑制动脉粥样硬化中的坏死性凋亡 | 研究主要基于体外实验和测序分析，缺乏体内实验验证 | 探究AQP1是否通过结合RIPK1并降低RIPK3和MLKL的表达来影响动脉粥样硬化中的坏死性凋亡 | 动脉粥样硬化患者和正常人的股动脉和主动脉样本，以及ox-LDL处理的内皮细胞 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞测序、空间转录组学、WGCNA、ssGSEA、Western Blot | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据 | 动脉粥样硬化组织和正常组织的样本，具体数量未明确说明 |
| 377 | 2025-05-16 |
Hypoxia-associated genes as predictors of outcomes in gastric cancer: a genomic approach
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1553477
PMID:40129974
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研究论文 | 研究缺氧相关基因在胃腺癌中的作用并构建预后模型 | 构建了一个基于五个H1特异性转录因子的新型预后模型，用于预测胃腺癌患者的总体生存率 | 研究依赖于公共数据库的数据，可能受到样本量和数据质量的限制 | 研究缺氧相关基因对胃腺癌的影响并开发预后模型 | 胃腺癌(STAD)患者和细胞系 | 基因组学 | 胃癌 | scRNA-seq, WGCNA, GO-BP/KEGG富集分析, LassoCox算法, qRT-PCR | LassoCox | RNA表达数据和临床数据 | 来自TCGA和GEO数据库的胃腺癌样本，以及GSE183904中的原发胃癌样本 |
| 378 | 2025-05-16 |
Interleukin-27-polarized HIV-resistant M2 macrophages are a novel subtype of macrophages that express distinct antiviral gene profiles in individual cells: implication for the antiviral effect via different mechanisms in the individual cell-dependent manner
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1550699
PMID:40129989
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research paper | 该研究探讨了IL-27极化的HIV抗性M2巨噬细胞的生物学功能和基因表达谱，揭示了其作为一种新型巨噬细胞亚型的特性 | 发现IL-27极化的巨噬细胞（27-Mac）是一种新型的M2巨噬细胞亚型，具有独特的抗HIV机制和基因表达谱 | 研究仅使用健康供体的单核细胞，未考虑HIV感染者或免疫缺陷患者的样本 | 研究IL-27极化的巨噬细胞（27-Mac）的生物学特性和抗HIV机制 | IL-27极化的巨噬细胞（27-Mac）和M2d巨噬细胞亚型 | 免疫学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、p24抗原捕获试验、过氧化氢测定、吞噬试验、IsoPlexis系统 | NA | 基因表达数据、细胞功能数据 | 健康供体的单核细胞 |
| 379 | 2025-05-16 |
Myosin 1f and Proline-rich 13 are transcriptionally upregulated yet functionally redundant in CD4+ T cells during blood-stage Plasmodium infection
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0320375
PMID:40132035
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研究论文 | 研究在实验性疟疾中，CD4+ T细胞分化为效应和记忆亚群时，Myo1f和Prr13基因的转录上调及其功能冗余性 | 首次在T辅助细胞中鉴定并研究了Myo1f和Prr13基因的功能，尽管这些基因在转录水平上上调，但在效应和记忆CD4+ T细胞反应中功能冗余 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类疟疾中进行验证 | 探究CD4+ T细胞在疟疾感染期间分化为效应和记忆亚群的分子机制 | CD4+ T细胞，特别是Plasmodium chabaudi chabaudi AS感染的小鼠模型中的T细胞 | 免疫学 | 疟疾 | scRNA-seq, 条件性基因敲除 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型中的CD4+ T细胞 |
| 380 | 2025-05-16 |
Single-cell and transcriptome analyses revealed CTHRC1 a potential therapeutic target mediating invasion and tumor microenvironment in TNBC: experimental validation
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1534981
PMID:40134434
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研究论文 | 研究CTHRC1在三阴性乳腺癌（TNBC）肿瘤微环境中的关键作用及其作为潜在治疗靶点的可能性 | 首次系统性地分析了CTHRC1在TNBC中的表达特征及其与侵袭性基因、肿瘤免疫细胞浸润和免疫治疗的关系 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证部分相对有限 | 探究CTHRC1在TNBC肿瘤微环境中的作用机制及其治疗潜力 | 三阴性乳腺癌（TNBC）患者样本及相关基因数据 | 肿瘤生物学 | 乳腺癌 | RNA转录组分析、单细胞测序、多重免疫荧光分析 | NA | RNA-seq数据、单细胞测序数据 | 来自TCGA和GEO数据库的TNBC患者样本数据 |