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当前共找到 1942 篇文献，本页显示第 361 - 380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2025-10-05 |
Spatial and single-cell transcriptomics capture two distinct cell states in soybean defense response to Phakopsora pachyrhizi infection
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1637176
PMID:41019740
|
研究论文 | 本研究通过空间和单细胞转录组技术揭示大豆对亚洲大豆锈病病原体感染的两种不同细胞状态及其空间分布模式 | 首次结合空间转录组和单核转录组技术揭示植物免疫反应的空间协调性，发现感染区域与周边区域存在不同的防御反应状态 | 仅针对大豆-Phakopsora pachyrhizi互作系统，其他植物-病原体系统的普适性有待验证 | 解析植物对病原体感染的空间防御反应机制 | 大豆植株及其对Phakopsora pachyrhizi病原体感染的响应 | 植物生物学 | 植物病害 | 空间转录组学, 单核RNA测序, 基因共表达网络分析 | NA | 空间转录组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 362 | 2025-10-05 |
Dissecting and validation the biomarker of heart failure progression in patients with atherosclerosis by single-cell sequencing, bioinformatics, and machine learning
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1587274
PMID:41019764
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和转录组数据，结合机器学习方法鉴定动脉粥样硬化向心力衰竭进展的早期生物标志物 | 首次整合单细胞RNA测序和批量转录组数据，结合三种机器学习算法鉴定CD48作为AS向HF进展的潜在生物标志物 | 研究基于公共数据库数据，需要实验验证；样本来源和数量有限 | 识别动脉粥样硬化向心力衰竭进展的早期生物标志物及潜在机制 | 动脉粥样硬化患者向心力衰竭进展的转录组数据 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 机器学习 | LASSO, Random Forest, SVM-RFE | 基因表达数据 | 多个GEO数据集(GSE28829, GSE57345等)，包含2828个心脏相关基因 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 人类细胞图谱(HCL)平台 |
| 363 | 2025-10-06 |
Identification of prognostic biomarkers for hepatocellular carcinoma based on the m6A RNA modification
2025 Jan-Dec, International journal of immunopathology and pharmacology
IF:3.0Q2
DOI:10.1177/03946320251370847
PMID:41013996
|
研究论文 | 本研究通过分析m6A RNA修饰识别肝细胞癌的预后生物标志物 | 基于m6A调节因子的转录谱识别了四种肝细胞癌分子亚型，并建立了稳健的风险预测模型 | NA | 识别肝细胞癌的预后生物标志物 | 肝细胞癌患者数据和肝癌细胞系（Huh7、Hep 3B、Hep G2）及正常肝细胞 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | RNA测序、单细胞RNA测序、qRT-PCR | 风险模型 | RNA测序数据、临床数据、单细胞RNA测序数据 | 来自TCGA-LIHC和ICGC-LIRI-JP数据库的样本及三种肝癌细胞系 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | NA | NA |
| 364 | 2025-10-05 |
Multi-omics analysis of parthanatos related molecular subgroup and prognostic model development in stomach adenocarcinoma
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0332988
PMID:41004487
|
研究论文 | 通过多组学分析研究胃腺癌中parthanatos相关分子亚型并开发预后模型 | 首次系统研究parthanatos相关基因在胃腺癌中的作用，建立了基于PRG的新型预后特征，并通过单细胞RNA测序和体外实验验证关键基因COL8A1的功能 | 研究主要基于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 探索parthanatos相关基因在胃腺癌中的分子特征和预后价值 | 胃腺癌患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 胃腺癌 | 多组学分析，转录组学，基因组学，单细胞RNA测序，western blot，集落形成，CCK-8，Transwell实验 | 机器学习算法，无监督聚类 | 转录组数据，基因组数据，临床数据，单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，多组学分析 | NA | NA |
| 365 | 2025-10-05 |
Integration of Single-Cell RNA and Bulk RNA Sequencing Reveals Cellular Heterogeneity and Identifies Survival-Associated Regulatory Networks in Glioblastoma
2025 Jan-Dec, IET systems biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1049/syb2.70025
PMID:40804738
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和bulk RNA测序揭示胶质母细胞瘤细胞异质性并识别与生存相关的调控网络 | 首次结合单细胞和bulk转录组数据识别生存相关细胞状态，发现超级增强子调控网络在胶质母细胞瘤中的关键作用 | NA | 识别胶质母细胞瘤预后生物标志物和治疗靶点 | 胶质母细胞瘤肿瘤微环境中的细胞异质性 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | Scissor算法,WGCNA分析,CellChat分析 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 366 | 2025-10-05 |
ScLineageAtlas: a comprehensive single-cell genomics database for characterizing cellular clones in cancer
2025-Jan-18, Database : the journal of biological databases and curation
DOI:10.1093/database/baaf046
PMID:40996711
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研究论文 | 开发了一个综合性单细胞基因组学数据库ScLineageAtlas，用于表征多种癌症类型中的细胞克隆 | 整合了24个处理过的单细胞RNA测序数据集，涵盖13种不同癌症类型，并提供细胞克隆的空间可视化分析 | 目前仅包含24个数据集，样本规模相对有限 | 构建一个用户友好的细胞克隆数据分析平台，促进对肿瘤异质性、分化轨迹和进化的理解 | 多种癌症类型中的细胞克隆 | 单细胞基因组学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 24个处理过的单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 367 | 2025-10-05 |
Single-cell splicing QTL analysis in pancreatic islets
2025, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2025.1657895
PMID:41000275
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析胰腺胰岛中的剪接数量性状位点 | 首次在单细胞水平识别胰腺胰岛α和β细胞中的剪接QTL，发现了批量分析中未观察到的CDC42基因变异 | 样本量有限，统计功效有待提升 | 探索遗传变异对单细胞水平选择性剪接的调控机制 | 胰腺胰岛α细胞和β细胞 | 单细胞基因组学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序, 基因分型, 异构体定量分析 | sQTLseeker2 | 单细胞RNA测序数据 | 8个全长单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 368 | 2025-10-05 |
Novel diagnostic biomarkers associated with macrophage-microglia in spinal cord injury
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1634014
PMID:41000385
|
研究论文 | 本研究通过机器学习算法识别脊髓损伤中与巨噬细胞-小胶质细胞相关的诊断生物标志物 | 首次结合单细胞RNA测序和多种机器学习算法识别脊髓损伤中巨噬细胞-小胶质细胞相关的关键枢纽基因 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证仅限于体外模型 | 探索脊髓损伤中巨噬细胞-小胶质细胞相关的诊断生物标志物 | 脊髓损伤相关的基因表达数据和巨噬细胞-小胶质细胞 | 生物信息学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序, qPCR, 机器学习算法 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | GEO数据库中的脊髓损伤相关数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 369 | 2025-10-05 |
Integrated analysis of single-cell and bulk transcriptomics reveals the prognostic value and underlying mechanisms of crotonylation in ovarian cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1596080
PMID:41000388
|
研究论文 | 通过整合单细胞和批量转录组学分析，揭示巴豆酰化在卵巢癌中的预后价值及潜在机制 | 首次系统研究巴豆酰化在卵巢癌微环境中的作用，并构建基于巴豆酰化的预后模型 | 未在独立队列中进行实验验证 | 开发基于巴豆酰化的卵巢癌预后模型并探索其治疗潜力 | 卵巢癌患者 | 生物信息学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序，批量转录组测序 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 370 | 2025-10-05 |
Integrating single-cell omics and materials science for uveal melanoma: from mechanistic insights to precision therapeutics
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1661889
PMID:41001023
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综述 | 整合单细胞组学与材料科学前沿技术，推动葡萄膜黑色素瘤从机制研究到精准治疗的发展 | 首次系统整合单细胞多组学技术与智能生物材料在葡萄膜黑色素瘤治疗中的应用，提出跨学科协同治疗新范式 | NA | 探讨单细胞组学与材料科学协同推动葡萄膜黑色素瘤精准治疗的策略与前景 | 葡萄膜黑色素瘤的肿瘤异质性、免疫微环境及分子驱动机制 | 数字病理 | 葡萄膜黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学, CRISPR-Cas9基因编辑 | NA | 单细胞组学数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 371 | 2025-10-05 |
Single-cell profiling transcriptomic reveals cellular heterogeneity and cellular crosstalk in breast cancer lymphatic node, bone, and brain metastases
2025-01-17, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-85531-z
PMID:39820531
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示乳腺癌淋巴结、骨和脑转移中的细胞异质性和细胞间通讯 | 首次在单细胞水平系统比较乳腺癌原发灶与淋巴结、骨和脑转移灶的微环境差异，发现pCAFs在转移中的主导作用及恶性上皮细胞亚群的分化轨迹 | 样本量较小（原发灶n=4，淋巴结转移n=4，脑转移n=3，骨转移n=2），数据来源于公共数据库 | 探索乳腺癌转移过程中的细胞异质性和细胞间相互作用机制 | 乳腺癌患者组织样本（原发灶和转移灶） | 单细胞组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，免疫组化染色，多光谱免疫组化染色 | InferCNV，CellChat，基因集变异分析 | 单细胞转录组数据，图像数据 | 13例样本（4例原发灶，4例淋巴结转移，3例脑转移，2例骨转移） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 372 | 2025-10-05 |
Cross-species analyses of thymic mimetic cells reveal evolutionarily ancient origins and both conserved and species-specific elements
2025-Jan-14, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.11.025
PMID:39731911
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研究论文 | 通过跨物种分析揭示胸腺模拟细胞的进化起源和物种特异性特征 | 首次对人类和斑马鱼胸腺模拟细胞进行单细胞RNA测序分析，并与小鼠数据整合比较 | 主要使用儿科供体样本，成人样本代表性可能不足 | 探索胸腺模拟细胞的进化保守性和物种特异性特征 | 人类、小鼠和斑马鱼的胸腺模拟细胞 | 单细胞生物学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序，成像分析 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | 人类儿科供体的纯化模拟细胞区室 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 373 | 2025-10-05 |
AEnet: a practical tool to construct the splicing-associated phenotype atlas at a single cell level
2025-Jan-06, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giaf110
PMID:40990037
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研究论文 | 开发了一种结合基因表达和可变剪接模式的单细胞分析方法AEnet，用于构建剪接相关表型图谱 | 首次将基因表达水平与可变剪接模式相结合来定义细胞亚群，并识别关键剪接事件及其调控机制 | 单细胞测序技术固有的测序深度浅、高丢失率和批次效应等限制 | 开发单细胞水平剪接相关表型图谱构建工具 | 肿瘤细胞、泛癌免疫细胞和胚胎细胞 | 生物信息学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | 神经网络 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 374 | 2025-10-05 |
Loss of PI5P4Kα Slows the Progression of a Pten Mutant Basal Cell Model of Prostate Cancer
2025-01-02, Molecular cancer research : MCR
IF:4.1Q2
DOI:10.1158/1541-7786.MCR-24-0290
PMID:39382632
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研究论文 | 本研究开发了基底细胞特异性基因工程小鼠模型，发现PI5P4Kα缺失可减缓Pten突变前列腺癌模型的肿瘤进展 | 首次揭示了PI5P4Kα在前列腺基底细胞中的富集特性及其在Pten突变癌症模型中的肿瘤抑制作用 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类患者中验证 | 探究PI5P4Kα在前列腺基底细胞癌症进展中的作用机制 | 基因工程小鼠模型和LNCaP前列腺癌细胞 | 癌症生物学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序，谱系追踪，转录组通路分析 | 基因工程小鼠模型 | 基因表达数据，组织病理学数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 375 | 2025-10-05 |
The immune checkpoint TIM-3/HMGB-1 axis in myocardial infarction
2025, NPJ cardiovascular health
DOI:10.1038/s44325-025-00061-x
PMID:40978514
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研究论文 | 本研究揭示了心肌梗死后免疫检查点TIM-3/HMGB-1轴在心脏炎症中的关键作用 | 首次系统研究TIM-3通路在心肌梗死中的作用，发现TIM-3/HMGB-1相互作用是心脏炎症的新靶点 | 样本量相对有限，机制研究主要基于体外实验 | 探究免疫检查点TIM-3通路在心肌梗死后的作用机制 | 人类血清、外周血单核细胞和心脏组织 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | RNA测序数据, 蛋白质表达数据 | 血清样本357例，PBMCs样本76例（38例患者+38例对照） | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 376 | 2025-10-05 |
Understanding and mitigating the impact of ambient mRNA contamination in single-cell RNA-sequencing analysis
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0332440
PMID:40991648
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研究论文 | 本研究探讨了环境mRNA污染对单细胞RNA测序分析的影响，并评估了两种校正方法的有效性 | 首次系统评估环境mRNA污染对差异基因表达和通路富集分析的影响，并比较两种校正方法的性能 | 仅使用了两个独立数据集，可能无法代表所有单细胞RNA测序场景 | 理解和减轻环境mRNA污染对单细胞RNA测序分析的影响 | 登革热患者外周血单个核细胞和人类胎儿肝组织样本 | 单细胞转录组学 | 传染病 | 单细胞RNA测序 | CellBender, SoupX | 单细胞转录组数据 | 10个PBMC样本和42个人类胎儿肝组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 液滴式单细胞RNA测序平台 |
| 377 | 2025-10-05 |
The role of microglia and complement C5/C5a in the pathogenesis of rhegmatogenous retinal detachment with choroidal detachment
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.08.019
PMID:40994539
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析孔源性视网膜脱离伴脉络膜脱离的细胞和分子特征，探讨小胶质细胞和补体C5/C5a通路在疾病发病机制中的作用 | 首次使用单细胞RNA测序技术揭示RRDCD独特的细胞景观，发现小胶质细胞与树突状细胞间增强的连接性以及补体C5-C5AR1相互作用的上调 | 样本量相对有限，研究主要基于体外实验，需要进一步体内验证 | 识别区分RRDCD与典型RRD的细胞和分子特征，研究小胶质细胞和补体C5/C5a通路在疾病发病机制中的作用 | 孔源性视网膜脱离伴脉络膜脱离患者的玻璃体样本，原代视网膜小胶质细胞，RF/6A内皮细胞和ARPE-19上皮细胞 | 单细胞组学 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序，体外共培养实验 | NA | 单细胞转录组数据 | RRD和RRDCD患者的玻璃体样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 378 | 2025-10-05 |
CD226 identifies effector CD8+ T cells during tuberculosis and costimulates recognition of Mycobacterium tuberculosis-infected macrophages
2025-Jan-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.22.634303
PMID:39896604
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别CD226作为结核病中效应CD8+T细胞的关键标志物，并证实其参与识别结核分枝杆菌感染巨噬细胞的共刺激过程 | 首次发现CD226是区分结核病中效应性和耗竭性CD8+T细胞谱系的最显著差异表达基因，并证明其对于CD8+T细胞识别结核分枝杆菌感染巨噬细胞的关键作用 | 研究仅使用C57BL/6J小鼠模型，未在人类样本中验证 | 探究慢性结核感染期间肺实质CD8+T细胞的多样性变化及其识别机制 | C57BL/6J小鼠的肺实质CD8+T细胞和结核分枝杆菌感染的巨噬细胞 | 免疫学 | 结核病 | 单细胞RNA测序, IFNγ-eYFP报告基因系统 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞术数据 | 感染6周和41周的C57BL/6J小鼠肺组织细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 379 | 2025-10-05 |
Deciphering the toxic effects of polystyrene nanoparticles on erythropoiesis at single-cell resolution
2025-Jan-18, Zoological research
IF:4.0Q1
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探究了聚苯乙烯纳米颗粒对斑马鱼胚胎红细胞生成的毒性影响 | 首次在单细胞分辨率下系统评估聚苯乙烯纳米颗粒对斑马鱼红细胞生成的影响 | 研究仅针对斑马鱼胚胎，未涉及其他生物或发育阶段 | 评估聚苯乙烯纳米颗粒对水生生物造血过程的毒性效应 | 斑马鱼胚胎 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 380 | 2025-10-05 |
High expression of CCL3/CCL4/CCL5/CCR5 promotes exhausted CD8+ T cells terminal differentiation and is associated with poor prognosis in pediatric B-ALL patients
2025 Jan-Dec, International journal of immunopathology and pharmacology
IF:3.0Q2
DOI:10.1177/03946320251346823
PMID:40522146
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现CCL3/CCL4/CCL5-CCR5轴在B-ALL细胞与终末耗竭CD8+T细胞相互作用中上调，并建立多变量Cox回归模型预测儿科B-ALL患者预后 | 首次报道CCL3/CCL4/CCL5-CCR5轴在B-ALL终末耗竭CD8+T细胞分化中的关键作用，并开发整合这些标志物的预后预测模型 | 研究样本量有限，需要更大规模验证；机制研究不够深入 | 识别B-ALL细胞与耗竭CD8+T细胞间差异上调的配体-受体相互作用，开发儿科B-ALL患者生存预测模型 | 儿科B细胞急性淋巴细胞白血病患者，特别是其B-ALL细胞和耗竭CD8+T细胞 | 生物信息学 | B细胞急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序，定量实时聚合酶链反应，多变量Cox回归分析 | 多变量Cox回归模型 | 单细胞RNA测序数据，转录组数据，临床预后数据 | 221例儿科B-ALL样本，另包含本中心成人B-ALL患者数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |