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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 341 | 2025-10-05 |
Macrophage-TREM2 promotes cardiac repair by restricting the infiltration of CD8+ T cells via CXCL16-CXCR6 axis after myocardial infarction
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.118014
PMID:41041054
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研究论文 | 本研究揭示了巨噬细胞TREM2通过CXCL16-CXCR6轴限制CD8+ T细胞浸润并促进淋巴管生成,从而促进心肌梗死后心脏修复的机制 | 首次阐明TREM2通过调控PI3K-AKT信号通路影响CXCL16分泌,进而限制CD8+ T细胞浸润的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性尚需进一步验证 | 探究巨噬细胞TREM2在心肌梗死后心脏修复中的作用机制 | 心肌梗死小鼠模型、巨噬细胞、CD8+ T细胞 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞测序、ELISA、Transwell、Western Blot、KEGG分析 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞测序数据、蛋白质印迹数据、细胞迁移数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 342 | 2025-10-05 |
Luminal Stem-like Cells in High-Risk/Locally Advanced Prostate Cancer Promote Resistance to Hormonal Therapy
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.112496
PMID:41041045
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和患者来源类器官模型,揭示了高危/局部晚期前列腺癌中管腔干细胞样细胞在激素治疗后存活并主导肿瘤上皮细胞组成的现象 | 首次在高危/局部晚期前列腺癌中鉴定出SOX9高转录活性的管腔干细胞样细胞亚群,并发现其在激素治疗后成为主导上皮细胞成分 | 样本量较小(仅9例患者),需要更大规模研究验证 | 探究高危/局部晚期前列腺癌患者激素治疗后残留肿瘤的分子特征及高复发率原因 | 高危/局部晚期前列腺癌患者肿瘤样本 | 单细胞生物学 | 前列腺癌 | 单细胞测序,患者来源类器官培养,药物筛选 | 患者来源类器官模型 | 单细胞转录组数据 | 9例高危/局部晚期前列腺癌患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 343 | 2025-10-05 |
Kazald1 attenuates chondrocyte fibrosis to potentiate hyaline cartilage regeneration by interfering with the pro-fibrotic TGF-β signaling
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.113604
PMID:41041066
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序发现Kazald1是维持软骨稳态的关键分子,并验证其重组蛋白通过干扰TGF-β信号通路抑制软骨细胞纤维化,促进透明软骨再生 | 首次发现Kazald1在软骨纤维化中的关键作用,阐明其通过形成TGFBR1二聚体阻断促纤维化信号通路的分子机制 | 研究主要基于大鼠模型和人类软骨外植体,尚未进行临床验证 | 探索软骨纤维化的分子机制并开发促进透明软骨再生的治疗方法 | 大鼠软骨细胞、人类软骨外植体、大鼠骨软骨损伤模型 | 组织工程与再生医学 | 软骨损伤与骨关节炎 | 单细胞测序, 蛋白质表达与纯化, 体外细胞培养, 动物模型 | NA | 单细胞测序数据, 蛋白质结构数据, 组织学数据 | 大鼠软骨组织、人类软骨外植体(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 344 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals endothelial cell heterogeneity and Sox18-mediated EndMT in abdominal aortic aneurysm
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.110254
PMID:41041074
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示腹主动脉瘤中内皮细胞的异质性及Sox18介导的内皮-间质转化机制 | 首次在单细胞水平系统揭示腹主动脉瘤中内皮细胞的四个亚群及其转录特征,发现Sox18介导的内皮-间质转化新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 探究腹主动脉瘤中内皮细胞异质性及内皮-间质转化的分子机制 | 腹主动脉瘤小鼠模型及人类主动脉瘤样本 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | AngⅡ和盐诱导的AAA小鼠模型及公共人类AAA数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 345 | 2025-10-05 |
Xrcc6 coordinates cardiomyocyte repair and immune regulation in myocardial ischemia-reperfusion injury: Fisetin as a therapeutic modulator
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1653738
PMID:41041340
|
研究论文 | 本研究揭示了Xrcc6在心肌缺血再灌注损伤中的双重调控作用,并发现黄酮类化合物非瑟酮通过靶向Xrcc6发挥心脏保护作用 | 首次整合bulk和单细胞RNA测序发现Xrcc6在心肌修复和免疫调节中的双重功能,并验证非瑟酮作为Xrcc6靶向治疗剂的潜力 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化价值需进一步验证 | 阐明Xrcc6在心肌缺血再灌注损伤中的作用机制,探索非瑟酮的心脏保护效应 | 心肌细胞亚型、巨噬细胞极化、DNA损伤修复机制 | 计算生物学 | 心血管疾病 | bulk RNA测序,单细胞RNA测序,hdWGCNA,轨迹推断,细胞通讯分析,分子对接,分子动力学模拟 | NA | 基因表达数据,单细胞转录组数据 | 小鼠心肌缺血再灌注损伤模型 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 346 | 2025-10-05 |
Immunotherapy strategies targeting tumor-associated macrophages and their mechanisms of action in tumor progression
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1680455
PMID:41041337
|
综述 | 本文综述了肿瘤相关巨噬细胞在肿瘤微环境中的作用及其作为免疫治疗靶点的研究进展 | 系统总结了单细胞测序技术揭示的TAMs功能多样性和异质性,及其在肿瘤免疫治疗中的靶向潜力 | NA | 探讨靶向肿瘤相关巨噬细胞的免疫治疗策略及其作用机制 | 肿瘤相关巨噬细胞及其在肿瘤微环境中的相互作用 | 肿瘤免疫学 | 实体肿瘤 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 347 | 2025-10-05 |
Novel cuproptosis-related genes C1QBP and PFKP identified as prognostic and therapeutic targets in lung adenocarcinoma
2025, Open life sciences
IF:1.7Q3
DOI:10.1515/biol-2025-1142
PMID:41041346
|
研究论文 | 通过分析肺腺癌基因组数据鉴定出铜死亡相关基因C1QBP和PFKP作为预后标志物和治疗靶点 | 首次发现C1QBP和PFKP基因在肺腺癌铜死亡调控中的关键作用,并建立四基因风险预测模型 | 研究样本主要来自TCGA数据库,需要进一步实验验证 | 鉴定肺腺癌中铜死亡相关的预后标志物和治疗靶点 | 肺腺癌患者组织和细胞系 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞测序、微阵列分析、功能实验 | 四基因风险模型 | 基因组数据、单细胞测序数据、微阵列数据 | 566例TCGA样本加上肺腺癌特异性数据集 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 348 | 2025-10-05 |
Molecular signatures of alveolar type II cell differentiation in acute respiratory distress syndrome
2025, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2025.1649108
PMID:41041455
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示了急性呼吸窘迫综合征中肺泡II型细胞分化的分子特征 | 首次发现AT2细胞在ARDS中存在两种不同分化轨迹:纤维化程序和上皮修复程序 | 研究主要基于小鼠模型和有限的患者样本,需要更大规模临床验证 | 探究ARDS中AT2细胞分化轨迹及其对疾病进展的影响 | 小鼠ARDS模型和ARDS患者的支气管肺泡灌洗液样本 | 单细胞组学 | 急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞RNA测序, 微阵列, 通路富集分析 | 轨迹分析 | 转录组数据, 蛋白质数据 | 小鼠ARDS模型和患者BALF样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 微阵列 | NA | NA |
| 349 | 2025-10-05 |
Dissecting tumor transcriptional heterogeneity from single-cell RNA-seq data by generalized binary covariance decomposition
2025-Jan, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01997-z
PMID:39747597
|
研究论文 | 提出一种名为广义二元协方差分解的统计方法,用于从单细胞RNA测序数据中解析肿瘤转录异质性 | 开发了能够将肿瘤转录异质性分解为患者特异性、数据集特异性和疾病亚型相关共享成分的新统计方法 | 方法在强肿瘤间异质性存在时的性能优势需进一步验证 | 解析肿瘤转录异质性并识别与癌症进展相关的共享表达模式 | 胰腺导管腺癌单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | 广义二元协方差分解 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 350 | 2025-10-05 |
Integrative Analysis of TLS-Associated Gene Signatures, Immune Infiltration and Drug Sensitivity in Pancreatic Cancer
2025 Jan-Dec, IET systems biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1049/syb2.70038
PMID:41016829
|
研究论文 | 本研究通过整合分析胰腺癌中三级淋巴结构相关基因特征、免疫浸润和药物敏感性,开发个性化治疗策略 | 首次系统鉴定9个TLS相关基因并建立TLS评分系统,结合单细胞RNA-seq揭示基因在免疫细胞中的分布,证明TLS评分可预测化疗药物敏感性 | 研究样本量有限,需要在更大队列中验证;机制研究尚不深入 | 开发胰腺癌个性化化疗选择策略 | 胰腺腺癌患者和细胞系 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA-seq, RT-qPCR, 生物信息学分析 | NA | 基因表达数据, 临床数据, 单细胞测序数据 | 胰腺癌患者队列和Mia PaCa2、Jurkat细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 351 | 2025-10-05 |
The Single-Cell Triaptosis Regulatory Pattern in the Immune Microenvironment of Keloids
2025, Clinical, cosmetic and investigational dermatology
DOI:10.2147/CCID.S536776
PMID:41024856
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序数据研究瘢痕疙瘩免疫微环境中三凋亡调控模式的作用 | 首次揭示三凋亡调控模式在瘢痕疙瘩免疫微环境中的作用,并鉴定ELMO2为关键致病基因 | NA | 探究三凋亡在瘢痕疙瘩免疫微环境形成中的调控机制 | 瘢痕疙瘩组织中的成纤维细胞和免疫细胞亚群 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光染色 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 公共数据库样本+自有瘢痕疙瘩样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 352 | 2025-10-05 |
Practical approaches to advanced molecular biology techniques
2025, Methods in cell biology
DOI:10.1016/bs.mcb.2025.02.022
PMID:41033726
|
研究论文 | 本章详细介绍了多种先进分子生物学技术的实验方案和应用 | 系统整合了包括CRISPR-Cas9、单细胞RNA测序等前沿分子生物学技术的实用操作指南 | NA | 为分子生物学研究提供先进技术的实践指导 | 分子生物学技术及其在细胞过程研究中的应用 | 分子生物学 | NA | CRISPR-Cas9, Real-Time PCR, 流式细胞术, ChIP-Seq, scRNA-Seq, 质谱分析, FISH | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 染色质免疫沉淀测序, 质谱蛋白质组学 | NA | NA |
| 353 | 2025-10-05 |
Mechanism of enhancing chemotherapy efficacy in pancreatic ductal adenocarcinoma with paricalcitol and hydroxychloroquine
2025-Jan-21, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101881
PMID:39730001
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研究论文 | 本研究探讨帕立骨化醇和羟氯喹联合治疗增强胰腺导管腺癌化疗效果的分子机制 | 首次揭示帕立骨化醇和羟氯喹联合吉西他滨通过调节自噬和ER应激通路增强胰腺癌化疗敏感性的机制 | 研究样本量有限,需要更大规模的临床试验验证 | 阐明帕立骨化醇和羟氯喹联合治疗增强胰腺导管腺癌对吉西他滨化疗敏感性的分子机制 | 胰腺导管腺癌细胞、原位小鼠模型、患者来源异种移植模型和临床试验患者样本 | 肿瘤学研究 | 胰腺癌 | 蛋白质组学分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质组数据、细胞表型数据 | 体外细胞模型、动物模型和临床试验配对活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 354 | 2025-10-05 |
Function value of basement membrane-related genes in odontogenic keratocyst by bioinformatics analysis
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1658125
PMID:41018070
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研究论文 | 通过生物信息学分析基底膜相关基因在牙源性角化囊肿中的功能价值 | 首次通过单细胞RNA测序定位SPARC基因在牙源性角化囊肿基质成纤维细胞中的特异性高表达,并揭示其与免疫微环境的相互作用 | 样本量较小(12例OKC和4例正常对照),需要更大规模研究验证 | 探讨基底膜相关基因在牙源性角化囊肿发病机制中的作用 | 牙源性角化囊肿组织和正常口腔黏膜组织 | 生物信息学 | 牙源性角化囊肿 | 转录组测序,单细胞RNA测序,免疫组织化学,免疫荧光 | 生物信息学分析 | 基因表达数据,单细胞测序数据 | 12例非综合征性牙源性角化囊肿和4例正常口腔黏膜样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 355 | 2025-10-05 |
GADD45G as a novel prognostic biomarker and therapeutic target in glioma: integrative analysis of bulk and single-cell RNA sequencing
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1608710
PMID:41018072
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研究论文 | 本研究通过整合分析bulk和单细胞RNA测序数据,探讨GADD45G在胶质瘤中的预后价值及其作为治疗靶点的潜力 | 首次系统性地整合多组学数据揭示GADD45G在胶质瘤中的预后价值,并通过单细胞分辨率分析其在胶质母细胞瘤细胞亚群中的表达模式 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析,需要进一步实验验证GADD45G的具体作用机制 | 探索GADD45G在胶质瘤中的预后意义和治疗潜力 | 胶质瘤患者样本和胶质瘤细胞系 | 生物信息学 | 胶质瘤 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, Western blot | Cox回归模型, Kaplan-Meier生存分析, Spearman相关分析 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 来自TCGA、TARGET、GTEx、CGGA和GEO等多个数据库的胶质瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 356 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA profiling of colorectal granular-type laterally spreading tumor uncovers progression trajectory toward carcinoma and transcriptional signatures favoring lateral morphogenesis
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1552841
PMID:41018078
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究结直肠颗粒型侧向发育型肿瘤的转录特征及其向癌变的进展轨迹 | 首次在单细胞水平揭示LST-Gs的化生分化特征及其与肿瘤进展的关联,发现Arp2/3复合物在高度分化细胞中的显著上调 | 样本量有限,研究主要关注转录组层面,缺乏功能性验证实验 | 阐明结直肠颗粒型侧向发育型肿瘤的形态发生机制和向癌发展的进化轨迹 | 结直肠颗粒型侧向发育型肿瘤、突起型腺瘤和正常黏膜组织 | 单细胞测序 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确指定具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 357 | 2025-10-05 |
Predicting the prognosis of hepatocellular carcinoma based on genes related to polyamine metabolism
2025, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.19985
PMID:41018906
|
研究论文 | 基于多胺代谢相关基因构建肝细胞癌预后预测模型 | 首次基于多胺代谢相关基因对肝细胞癌进行分子分型并构建预后预测模型 | 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 开发肝细胞癌预后预测模型并探索潜在治疗靶点 | 肝细胞癌患者和HuH-7细胞系 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | RNA测序, 单细胞RNA测序, CCK8实验, 伤口愈合实验, Transwell实验 | Cox回归, Lasso回归, 列线图 | 基因表达数据, 临床数据 | 公共数据库中的肝细胞癌样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 358 | 2025-10-05 |
Characterization of cancer-related fibroblasts in bladder cancer and construction of CAFs-based bladder cancer classification: insights from single-cell and multi-omics analysis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1580986
PMID:41019085
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研究论文 | 通过单细胞和多组学分析表征膀胱癌中癌症相关成纤维细胞并构建基于CAFs的膀胱癌分类 | 首次系统鉴定膀胱癌中10个不同的CAF亚群,并建立基于pCAFs的膀胱癌分子分型系统 | 样本量有限,需要进一步实验验证各亚型的临床适用性 | 探索膀胱癌中癌症相关成纤维细胞的异质性及其在肿瘤微环境中的作用 | 膀胱癌组织和其中的癌症相关成纤维细胞 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 机器学习算法 | 机器学习算法 | 单细胞RNA测序数据, 批量RNA测序数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 359 | 2025-10-05 |
PLK2 as a key regulator of glycolysis and immune dysregulation in polycystic ovary syndrome
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1610713
PMID:41019094
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序分析,发现PLK2是多囊卵巢综合征中糖酵解和免疫失调的关键调控因子 | 首次将PLK2确立为PCOS中内皮细胞糖酵解的核心调控基因,并揭示其通过NF-κB和IL-17信号通路促进慢性炎症和卵巢纤维化的机制 | 研究主要基于动物模型和生物信息学分析,需要进一步临床验证 | 阐明多囊卵巢综合征中卵巢基质细胞糖酵解失调的分子机制 | 多囊卵巢综合征患者和DHEA诱导的PCOS大鼠模型 | 生物信息学 | 多囊卵巢综合征 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 免疫浸润分析, 功能富集分析 | Seurat, CellChat, CIBERSORT, ESTIMATE, ssGSEA | 基因表达数据 | 三个独立的批量RNA-seq数据集和DHEA诱导的PCOS大鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 360 | 2025-10-05 |
A splicing-based multitissue association study of joint transcriptomes identified susceptibility genes for osteoarthritis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1590008
PMID:41019096
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研究论文 | 通过跨组织和单组织转录组关联分析结合单细胞测序技术,鉴定骨关节炎易感基因LTBP1及其在软骨细胞分化中的调控作用 | 首次整合跨组织/单组织TWAS分析与单细胞测序数据,系统揭示LTBP1基因通过TGF-β和Notch信号通路参与骨关节炎发病的新机制 | 未明确说明样本规模及具体测序平台技术细节 | 鉴定骨关节炎的易感基因并阐明其功能机制 | 骨关节炎相关遗传位点及LTBP1基因 | 生物信息学 | 骨关节炎 | 单细胞测序, 转录组关联分析(TWAS), 全基因组关联研究(GWAS) | UTMOST, FUSION, MAGMA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |