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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
281 2025-12-14
TFEB-mediated autophagy stimulation as an anabolic strategy for bone: insights from TFEB activation in the osteoblast lineage
2025, Autophagy reports
研究论文 本研究通过在小鼠成骨细胞谱系中特异性激活TFEB,探索了自噬刺激对骨形成和骨骼稳态的促进作用 首次在成骨细胞谱系中特异性激活TFEB,揭示了自噬刺激通过减少细胞凋亡和增强功能来促进骨形成的新机制 研究基于小鼠模型,结果在人类中的适用性尚需验证,且具体分子通路细节有待进一步阐明 探究自噬在骨形成中的作用机制,并评估自噬刺激作为骨质疏松潜在治疗策略的可行性 遗传修饰小鼠模型中的成骨细胞谱系细胞 NA 骨质疏松症 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
282 2025-12-14
Cuproptosis and Immune Microenvironment Interplay in Temporal Lobe Epilepsy: Identification of Key Molecular Signatures and Therapeutic Targets
2025, Journal of inflammation research IF:4.2Q2
研究论文 本研究首次探讨了铜死亡在颞叶癫痫中的作用,揭示了其与免疫微环境的相互作用,并识别了关键分子特征和治疗靶点 首次将铜死亡确立为连接铜失调与颞叶癫痫病理的机制桥梁,提出了基于铜死亡相关基因的疾病亚型分类,并识别了CD44、PDE5A和TUBA1A作为新的治疗靶点 研究主要基于生物信息学分析和动物模型验证,缺乏人类患者样本的直接验证,且铜死亡在癫痫中的具体分子机制仍需进一步探索 探究铜死亡在颞叶癫痫中的分子基础、神经炎症串扰及治疗意义 颞叶癫痫患者和毛果芸香碱诱导的颞叶癫痫小鼠模型 生物信息学 颞叶癫痫 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 加权基因共表达网络分析, 共识聚类, 机器学习算法, Western blot, 免疫组织化学 机器学习算法(10种) RNA-seq数据, 单细胞RNA-seq数据 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
283 2025-12-14
TMOD2 and DOCK4 as Novel Gut Microbiota-Associated Biomarkers for Colorectal Adenoma: Integrated Transcriptomic Analysis and Therapeutic Target Identification
2025, Mediators of inflammation IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过整合转录组学数据和孟德尔随机化分析,鉴定出与结直肠腺瘤风险相关的肠道微生物物种,并确定了TMOD2和DOCK4作为新型生物标志物和潜在治疗靶点 首次将肠道微生物遗传学与转录组学整合,通过孟德尔随机化建立肠道微生物与结直肠腺瘤的因果关系,并利用单细胞RNA测序验证生物标志物在肿瘤微环境不同细胞群中的表达模式 未在独立的大规模临床队列中进行前瞻性验证,药物筛选结果需要进一步的体外和体内实验验证 识别可用于结直肠腺瘤早期检测和治疗的肠道微生物相关分子标志物 结直肠腺瘤患者样本和相关的转录组数据 生物信息学 结直肠癌 单细胞RNA测序, 转录组分析, 孟德尔随机化分析 机器学习算法 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
284 2025-12-14
SLC11A1 protein as a key regulator of iron metabolism, ferroptosis mediator, and putative therapeutic target in nonalcoholic fatty liver disease: an integrated bioinformatics analysis
2025, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1
研究论文 本研究通过整合生物信息学分析,揭示了SLC11A1蛋白作为铁代谢和铁死亡的关键调节因子,是非酒精性脂肪肝病(NAFLD)的潜在生物标志物和治疗靶点 首次通过整合WGCNA、机器学习算法(LASSO)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)和分子对接/动力学模拟,系统鉴定了NAFLD中铁代谢/铁死亡相关的关键调控蛋白(特别是SLC11A1),并预测了已批准药物Resmetirom的潜在靶向作用机制 研究主要基于生物信息学分析和体外验证,缺乏深入的体内功能实验和临床队列验证来证实SLC11A1的因果作用和治疗潜力 深入探索非酒精性脂肪肝病(NAFLD)的新型生物标志物和治疗策略,重点关注铁代谢失调和铁死亡在疾病进展中的作用 非酒精性脂肪肝病(NAFLD)患者的数据集(来自GEO数据库)以及相关的铁代谢/铁死亡相关基因和蛋白 生物信息学 非酒精性脂肪肝病 生物信息学分析(包括差异表达基因分析、WGCNA、LASSO回归)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、分子对接、分子动力学模拟、定量逆转录聚合酶链反应(qRT-PCR) 机器学习算法(LASSO回归) 基因表达数据(来自GEO数据库)、单细胞RNA测序数据、蛋白质结构数据 NA(文中提及使用了GEO数据库中的NAFLD数据集和验证集,但未明确总样本数量) NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、批量RNA测序(推断,来自GEO数据库) NA NA
285 2025-12-14
Redox phenotype confers T cell-exclusion microenvironment and resistance to immunotherapy by suppressing STING/MDA5 expression and interferon signaling in lung cancers harboring KEAP1/STK11 mutations
2025, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 本研究探讨了KEAP1/STK11突变通过调控氧化还原表型抑制STING/MDA5表达和干扰素信号,从而介导免疫逃逸和免疫治疗抵抗的机制 首次将KEAP1/STK11突变驱动的氧化还原表型与STING/MDA5表达抑制及免疫微环境重塑联系起来,揭示了免疫治疗抵抗的新机制 研究主要基于生物信息学分析和回顾性队列,缺乏实验验证;样本来源和数量可能限制结论的普适性 探究KEAP1/STK11突变导致非小细胞肺癌免疫治疗抵抗的分子机制 非小细胞肺癌患者肿瘤样本及免疫检查点抑制剂治疗队列 生物信息学 肺癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA 基因表达数据 TCGA和GSE72094队列的肺癌样本,以及单细胞RNA-seq数据集和免疫治疗队列 NA RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
286 2025-12-14
MRI-based radiomic clustering identifies a glioblastoma subtype enriched for neural stemness and proliferative programs
2025, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过整合术前MRI影像组学特征与多平台转录组学数据,识别出一种与神经干性和增殖程序相关的胶质母细胞瘤高风险亚型 首次将MRI影像组学亚型与单细胞及空间转录组学数据相结合,揭示了影像表型背后的分子机制和细胞群体特征 研究样本量有限,且为回顾性分析,需要进一步的前瞻性验证 探索胶质母细胞瘤影像组学亚型的生物学基础及其与预后的关联 IDH野生型胶质母细胞瘤患者 数字病理 胶质母细胞瘤 MRI影像组学,bulk RNA-seq,单细胞RNA-seq,空间转录组学 无监督聚类 医学影像,转录组数据 未明确指定样本数量 NA bulk RNA-seq,单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
287 2025-12-14
Establishment and transcriptomic characterization of canine organoids from multiple tissues
2025, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
研究论文 本文报道了从两只遗传相关犬只的多个组织中建立并转录组学表征犬类器官样细胞系的研究 首次从两只遗传相关犬只的多个组织中建立并全面表征犬类器官样细胞系,包括子宫内膜、胰腺、膀胱、肾脏、肺和肝脏,并利用scRNA-seq识别器官样特异性转录组特征 仅使用两只遗传相关犬只的样本,样本量较小,可能限制结果的普遍性 建立犬类器官样细胞系平台,以加速药物测试、疾病建模和个性化医学研究,减少对活体动物实验的依赖 犬类器官样细胞系,包括子宫内膜、胰腺、膀胱、肾脏、肺和肝脏组织 数字病理学 NA 免疫组织化学,bulk RNA-seq,scRNA-seq NA 转录组数据,图像数据 两只遗传相关犬只(B816和B818)的六个组织器官样细胞系 NA bulk RNA-seq, scRNA-seq NA NA
288 2025-12-14
Optimised dissociation and multimodal profiling of prostate cancer stroma reveal fibromuscular cell heterogeneity with clinical correlates
2025, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过优化组织解离方案并结合单细胞RNA测序、流式细胞术和免疫荧光等多模态分析,深入表征了前列腺癌基质中纤维肌细胞的异质性及其临床相关性 开发了一种优化的组织解离方案,显著提高了基质细胞的回收率和活性,并首次通过多模态整合分析识别出具有空间分布和预后意义的、临床相关的纤维肌细胞亚群,包括与不良预后相关的周细胞和一种与基质活化相关的新型平滑肌细胞亚群 未在摘要中明确说明研究的局限性 更好地表征前列腺癌肿瘤微环境中作为主要组织驻留基质细胞亚型的成纤维细胞和平滑肌细胞群体 前列腺癌组织中的纤维肌基质细胞(成纤维细胞和平滑肌细胞) 数字病理学 前列腺癌 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 免疫荧光, 组织解离, 体外培养 降维与聚类分析 单细胞转录组数据, 流式细胞计数数据, 免疫组织化学图像 未在摘要中明确说明具体样本数量,但涉及良性和恶性样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
289 2025-12-13
Application of computational algorithms for single-cell RNA-seq and ATAC-seq in neurodegenerative diseases
2025-Jan-15, Briefings in functional genomics IF:2.5Q3
综述 本文综述了整合单细胞RNA测序和ATAC测序数据的计算工具与机器学习方法,及其在神经退行性疾病中的应用 整合scRNA-seq和scATAC-seq数据以关联转录组与染色质可及性,揭示神经退行性疾病的致病机制 面临数据稀疏性和计算需求高的挑战 促进单细胞多组学技术在神经退行性疾病研究中的应用,以阐明病理机制并识别治疗靶点 阿尔茨海默病和帕金森病等神经退行性疾病 机器学习 神经退行性疾病 scRNA-seq, scATAC-seq NA 单细胞转录组和染色质可及性数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq NA NA
290 2025-12-13
TIMP1 Mediates Astrocyte-Dependent Local Immunosuppression in Brain Metastasis Acting on Infiltrating CD8+ T Cells
2025-Jan-13, Cancer discovery IF:29.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了脑转移中星形胶质细胞的异质性,并发现一个分泌TIMP1的星形胶质细胞亚群通过抑制浸润性CD8+ T细胞的抗肿瘤活性介导局部免疫抑制,为症状性脑转移患者的联合免疫治疗提供了新策略 首次利用单细胞RNA测序技术解析脑转移中星形胶质细胞的异质性,并鉴定出通过分泌TIMP1介导局部免疫抑制的pSTAT3+星形胶质细胞亚群及其对CD63+ CD8+ T细胞功能的调控机制 研究主要基于小鼠和人类脑转移模型,临床转化效果需进一步验证;TIMP1作为生物标志物的敏感性和特异性在更大样本中待评估 探究脑转移中星形胶质细胞介导的局部免疫抑制机制,以开发针对症状性脑转移的联合免疫治疗策略 脑转移中的星形胶质细胞和浸润性CD8+ T细胞 单细胞测序与免疫学 脑转移瘤 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
291 2025-12-13
Mechanistic insights into GPAA1-mediated cold tumor phenotype and immune evasion in colorectal cancer: integrative multi-omics analysis and experimental validation
2025, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过整合多组学数据揭示了GPAA1在结直肠癌中的过表达及其通过基因组不稳定性和免疫抑制促进肿瘤进展的机制 首次系统分析了GPAA1在泛癌及结直肠癌中的表达模式,并揭示了其通过诱导基因组不稳定和免疫冷表型促进肿瘤进展的新机制 研究主要基于公共数据库和体外实验,缺乏体内动物模型验证;样本来源多样可能引入批次效应 阐明GPAA1在结直肠癌中的表达模式、功能作用及其与免疫微环境的关系 结直肠癌组织和细胞系 多组学分析 结直肠癌 多组学整合分析、单细胞转录组学、空间转录组学、功能实验(增殖、迁移、侵袭) NA mRNA表达数据、蛋白质表达数据、单细胞转录组数据、空间转录组数据 来自TCGA、GTEx、GEO、HPA等多个公共数据库的结直肠癌样本 NA 单细胞RNA-seq、空间转录组学、bulk RNA-seq NA NA
292 2025-12-13
Case Report: Blood single-cell analysis of a IVB high-grade serous ovarian cancer patient presenting a favorable prognosis
2025, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
病例报告 本文报告了一例IVB期高级别浆液性卵巢癌患者,通过血液单细胞分析揭示其良好预后的潜在分子特征 采用多平台液体活检方法,结合血小板RNA测序、单细胞RNA测序和成像流式细胞术,全面分析血液成分,识别与预后相关的独特分子特征 本研究为单病例报告,样本量有限,结果需要更大规模研究验证 探索IVB期高级别浆液性卵巢癌患者良好预后的潜在驱动因素 一名IVB期高级别浆液性卵巢癌患者 数字病理学 卵巢癌 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,成像流式细胞术 NA RNA测序数据,流式细胞术图像数据 1名患者的术前外周血样本 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
293 2025-12-13
Integrated Multi-Omic Analysis Reveals Causal Relationships and Causal Mechanisms of Peripheral Lymphocyte-Driven Remodeling in the Intrahepatic Immune Microenvironment of Early-Stage MAFLD
2025, Journal of inflammation research IF:4.2Q2
研究论文 本研究通过整合孟德尔随机化、批量RNA测序和单细胞RNA测序分析,揭示了外周淋巴细胞通过Cd5介导的炎症通路和Vcam1-Itgb1粘附通路驱动早期MAFLD肝内免疫微环境重塑的因果关系和机制 首次利用孟德尔随机化建立了外周淋巴细胞与MAFLD风险的单向因果关系,并通过单细胞RNA测序在MAFLD模型中鉴定出新的Itgb1⁺Cd5⁺Cd4⁺T细胞亚群及其与肝内Vcam1highMmp12⁺Kupffer细胞的相互作用机制 研究主要基于小鼠模型和公共数据集,需要在更大规模的人类队列中进行验证;因果关系推断依赖于孟德尔随机化假设 探究外周血细胞指标与早期MAFLD肝内免疫微环境重塑之间的因果关系和潜在机制 代谢功能障碍相关脂肪肝病(MAFLD)患者和小鼠模型 单细胞组学 代谢功能障碍相关脂肪肝病 孟德尔随机化分析,批量RNA测序,单细胞RNA测序 NA 基因组数据,转录组数据,单细胞转录组数据 小鼠模型和人类公共单细胞RNA测序数据集 NA 单细胞RNA测序,批量RNA测序 NA NA
294 2025-12-13
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Microglial Heterogeneity and Functional States After Cerebral Ischemia-Reperfusion Injury
2025, Journal of inflammation research IF:4.2Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了脑缺血再灌注损伤后小胶质细胞的异质性和功能状态 识别了七个转录特征不同的小胶质细胞亚群,并发现ATF3作为核心调控因子,将CH25H介导的代谢变化与细胞因子驱动的神经炎症联系起来 研究基于大鼠模型,结果向人类转化需进一步验证 分析缺血性卒中中小胶质细胞的异质性、激活轨迹和代谢状态,以发现治疗靶点 缺血性和对照大鼠的脑组织 单细胞组学 缺血性卒中 单细胞RNA测序, RT-qPCR, Western blot, 免疫组织化学 NA 单细胞RNA测序数据 未明确具体数量,但涉及缺血性和对照大鼠的脑组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
295 2025-12-12
Deciphering the Complexities of Pulmonary Hypertension: The Emergent Role of Single-Cell Omics
2025-Jan, American journal of respiratory cell and molecular biology IF:5.9Q1
综述 本文综述了单细胞组学技术在肺动脉高压研究中的应用,探讨了其如何推动对该疾病复杂性的理解 强调了单细胞转录组学在揭示肺动脉高压中细胞生态系统、识别新型治疗靶点以及通过连接组分析阐明细胞相互作用方面的创新作用 面临单细胞RNA测序分辨率需提升、人体组织样本处理存在物流障碍以及需要整合多种组学方法以全面理解疾病分子基础的挑战 探讨单细胞组学技术在肺动脉高压研究中的角色,以促进精准医疗目标的实现 肺动脉高压中的细胞类型,包括内皮细胞、平滑肌细胞、周细胞和免疫细胞 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
296 2025-12-11
Bypassing cisplatin resistance in Nrf2 hyperactivated head and neck cancer through effective PI3Kinase targeting
2025-Jan-16, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究评估了PI3K抑制剂在绕过Nrf2介导的顺铂耐药性中的疗效,通过体外和体内实验验证了gedatolisib在头颈鳞状细胞癌模型中的抗肿瘤活性 首次揭示PI3K-AKT-mTOR通路在Nrf2驱动的顺铂耐药头颈鳞状细胞癌中的关键作用,并证明PI3K抑制剂gedatolisib能通过激活自噬、衰老和破坏脂肪酸代谢来恢复耐药细胞对顺铂的敏感性 研究主要基于临床前模型(包括免疫缺陷和人源化小鼠模型),尚未进行临床试验验证 评估PI3K抑制剂在克服头颈鳞状细胞癌中Nrf2介导的顺铂耐药性的疗效 头颈鳞状细胞癌(HNSCC)细胞系和动物模型 肿瘤学 头颈鳞状细胞癌 转录组学、代谢组学、信号通路分析、shRNA筛选、空间转录组学 动物模型(皮下、原位和转移性异种移植模型) 基因表达数据、代谢数据、信号通路数据 未明确指定具体样本数量,涉及多种体外和体内模型 NA NA NA NA
297 2025-12-11
MEF2C is a Potential Prognostic Biomarker and is Correlated with Immune Infiltrates in Lung Adenocarcinoma
2025, Current medicinal chemistry IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过生物信息学分析和实验验证,探讨了MEF2C在肺腺癌中的表达、预后价值及其与免疫浸润的关联 首次系统性地研究了MEF2C在泛癌及肺腺癌中的表达模式,并揭示了其与免疫细胞浸润、免疫检查点基因、肿瘤突变负荷及药物敏感性的相关性 研究主要基于TCGA数据库的生物信息学分析,实验验证部分相对有限,需要更多体内外实验进一步证实 探究MEF2C在肺腺癌中的生物学功能、预后价值及其作为免疫治疗靶点的潜力 肺腺癌患者样本、肺腺癌细胞系 生物信息学 肺腺癌 生物信息学分析、单细胞测序、qRT-PCR NA 基因表达数据、临床数据、单细胞测序数据 TCGA数据库中的肺腺癌样本及多种癌症样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
298 2025-12-11
Multiple Machine Learning Models, Molecular Subtyping and Singlecell Analysis Identify PANoptosis-related Core Genes and their Association with Subtypes in Crohn's Disease
2025, Current medicinal chemistry IF:3.5Q2
研究论文 本研究首次构建了克罗恩病(CD)的PANoptosis特征,并探讨了其与疾病亚型及免疫机制的关系 首次将PANoptosis与克罗恩病关联,并利用多种机器学习算法和单细胞分析构建了PANoptosis特征基因签名 未明确说明样本来源的具体平台细节,且研究基于现有数据集,可能需要进一步实验验证 探究PANoptosis在克罗恩病中的作用机制及其与疾病亚型的关联 克罗恩病患者的数据集 机器学习 克罗恩病 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) LASSO, SVM, 随机森林, 决策树, 高斯混合模型 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
299 2025-12-11
Analyzing and Validating the Role of Genes Related to Glucagon-like Peptide-1 Signaling in the Prognosis of Pancreatic Cancer
2025, Current medicinal chemistry IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过分析GLP-1信号相关基因在胰腺癌中的表达和突变,开发了一个基于3个基因的RiskScore模型,用于评估胰腺癌预后,并验证了其预测准确性 首次将GLP-1信号通路基因与胰腺癌预后模型结合,开发了一个独立的RiskScore模型,并通过单细胞RNA-seq和免疫浸润分析揭示了其生物学机制 研究基于公共数据库的回顾性数据,需要前瞻性临床研究进一步验证模型的普适性和临床应用价值 开发一个可靠的基于GLP-1信号的预后工具,以指导胰腺癌的治疗 胰腺癌患者 生物信息学 胰腺癌 bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq (scRNA-seq) LASSO回归, Cox回归, RiskScore模型, nomogram模型 RNA-seq数据 来自UCSCXena和GEO数据库的胰腺癌患者样本,包括GSE156405队列用于单细胞分析 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
300 2025-12-11
Machine Learning-based Gene Biomarker Identification for Improving Prognosis and Therapy in Hepatocellular Carcinoma
2025, Current medicinal chemistry IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过整合基因表达数据、机器学习算法、肿瘤微环境分析和药物敏感性分析,识别了肝细胞癌(HCC)的七个关键基因生物标志物,并开发了HCC预后相关指数(HPRI)以改善预后和治疗指导 结合101种统计模型的机器学习算法筛选关键基因,并首次开发基于这些基因的HPRI指数,同时通过单细胞测序分析揭示基因在恶性细胞和成纤维细胞中的表达模式 研究依赖于公开数据库(ICGC、GEO、TCGA)的回顾性数据,未进行前瞻性临床验证,且样本异质性可能影响结果的普适性 识别肝细胞癌的分子生物标志物以改善预后预测和治疗指导 肝细胞癌患者及其基因表达数据 机器学习 肝细胞癌 单细胞测序分析、Cox回归分析、差异表达分析 机器学习算法(包括101种统计模型) 基因表达数据和临床病理信息 多个队列(来自ICGC、GEO、TCGA数据库),具体样本数量未明确说明 NA 单细胞测序 NA NA
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