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当前共找到 2176 篇文献,本页显示第 261 - 280 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
261 2026-02-02
DPCDI: an artificial intelligent-derived indicator interpreting the diagnostic, stratification, and therapeutic implications of druggability programmed cell death in heart failure
2025, Frontiers in genetics IF:2.8Q2
研究论文 本文开发了一种名为DPCDI的人工智能衍生指标,用于解释心力衰竭中可药物化程序性细胞死亡的诊断、分层和治疗意义 通过整合机器学习框架(Lasso和随机森林算法)识别了15个关键基因构建DPCDI,并结合非负矩阵因子分析、单细胞RNA测序、孟德尔随机化分析和实验验证,为心力衰竭提供了全面的诊断、风险分层和靶向治疗开发框架 NA 开发一个指标以解释心力衰竭中可药物化程序性细胞死亡的诊断、分层和治疗意义 心力衰竭患者和HF小鼠模型 机器学习 心血管疾病 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析, 分子对接 Lasso, 随机森林, 非负矩阵因子分析 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
262 2026-02-02
High glucose-induced PLCG1 histone acetylation to promote ferroptosis by LAMP2A/HSPA8 in a diabetic nephropathy model
2025, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1
研究论文 本研究探讨了高血糖诱导的PLCG1组蛋白乙酰化通过LAMP2A/HSPA8信号通路促进铁死亡,从而在糖尿病肾病模型中加速疾病进展 首次揭示了PLCG1通过组蛋白乙酰化调控LAMP2A/HSPA8信号通路,促进线粒体氧化应激和铁死亡,在糖尿病肾病中的新作用机制 研究主要基于小鼠模型和细胞实验,缺乏大规模临床样本验证;单细胞RNA测序数据的分析深度可能有限 探究PLCG1在糖尿病肾病中的分子机制及其与铁死亡的关系 糖尿病肾病小鼠模型(C57BL/6小鼠)和高糖诱导的NRK-52E细胞 分子生物学与病理学 糖尿病肾病 单细胞RNA测序、生物信息学分析、组蛋白乙酰化检测、蛋白质印迹 NA RNA测序数据、蛋白质表达数据、临床生化指标 糖尿病肾病患者与正常对照组、小鼠模型、NRK-52E细胞系 NA 单细胞RNA测序 NA NA
263 2026-01-30
TGF-β-driven T-cell exclusion in ovarian cancer: single-cell and spatial transcriptomic views of immune low-response states
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 本文综述了单细胞RNA和ATAC测序以及空间转录组学在揭示卵巢癌中TGF-β驱动的T细胞排斥和免疫低反应状态方面的进展,并评估了相关的转化机会 整合单细胞和空间转录组学数据,解析TGF-β信号相关的成纤维细胞、肿瘤和免疫程序,提出基于TGF-β信息的精准免疫治疗策略 存在部位特异性异质性、检测标准化有限以及预测指标稀缺等挑战,限制了临床实施 评估TGF-β驱动的免疫低反应状态在卵巢癌中的作用,并探索精准免疫治疗策略 上皮性卵巢癌(EOC)中的TGF-β信号、成纤维细胞、肿瘤细胞和免疫细胞 数字病理学 卵巢癌 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学 NA 转录组数据, 表观遗传数据, 空间数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 NA NA
264 2026-01-30
Multi-omics exploration of chaperone-mediated immune-proteostasis crosstalk in vascular dementia and identification of diagnostic biomarkers
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过整合多组学数据和机器学习算法,探索了分子伴侣系统在血管性痴呆中的调控网络和诊断潜力 首次将HSP90AA1-HSPA1B-DNAJB1网络识别为通过蛋白质稳态和免疫重编程双重机制驱动血管性痴呆发病的关键因素,其诊断性能显著优于传统生物标志物 需要更大规模的队列研究来验证其临床转化潜力 阐明血管性痴呆的分子机制并识别诊断性生物标志物 血管性痴呆患者的额叶、颞叶皮质和白质样本,以及双侧颈总动脉狭窄小鼠模型 机器学习 血管性痴呆 转录组学,单细胞转录组学,免疫微环境分析 LASSO, SVM-RFE, Random Forest 转录组数据,单细胞转录组数据 人类样本:额叶和颞叶皮质(n=15),白质(n=8);小鼠模型:双侧颈总动脉狭窄模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
265 2026-01-29
β-cell heterogeneity and molecular plasticity in type 2 diabetes: multi-omics perspectives and the role of gut microbiota
2025, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
综述 本文综述了利用多组学技术揭示2型糖尿病中β细胞的异质性与分子可塑性,并探讨了肠道微生物群在其中的作用及潜在治疗策略 整合单细胞转录组学、表观基因组学、空间转录组学等多组学视角与肠道微生物组研究,提出了理解β细胞功能失调与微生物群介导代谢调控的综合框架 作为一篇综述文章,主要整合现有证据而非提出新的原始数据,且微生物群与β细胞功能间的因果机制仍需更多实验验证 阐明2型糖尿病中β细胞的异质性、分子可塑性及其与肠道微生物群的相互作用,以寻找潜在治疗靶点 胰腺β细胞、胰岛其他内分泌细胞、免疫细胞、基质细胞、胰腺外分泌部分以及肠道微生物群 数字病理学 2型糖尿病 单细胞转录组学、表观基因组学、空间转录组学、多组学整合分析 NA 转录组数据、表观基因组数据、空间基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
266 2026-01-29
Single-cell analysis of microglial activation after traumatic brain injury reveals immune signaling pathways linked to mitochondrial dysfunction and brain aging
2025, Frontiers in aging neuroscience IF:4.1Q2
研究论文 本研究利用单细胞转录组学绘制了创伤性脑损伤后小胶质细胞动态响应的图谱,并验证了与线粒体功能障碍和脑衰老相关的关键免疫信号通路 首次整合多个组织和时间点,提供了创伤性脑损伤后小胶质细胞-髓系细胞相互作用的单细胞转录组图谱,并将小胶质细胞信号与线粒体功能障碍和神经炎症联系起来 研究主要基于公开数据集和体外模型验证,缺乏体内功能验证,且样本量有限 绘制创伤性脑损伤后小胶质细胞的动态响应图谱,并验证关键信号通路 小鼠的皮质、海马体和血液样本中的髓系细胞(包括单核细胞、巨噬细胞和小胶质细胞) 数字病理学 创伤性脑损伤 单细胞转录组学,qPCR NA 转录组数据 35只小鼠(11个血液样本,12个皮质样本,12个海马体样本) NA 单细胞RNA-seq NA NA
267 2026-01-29
A novel prognostic model based on epithelial cell progression genes identifies OAS1 as a suppressor of bladder cancer aggressiveness
2025, Frontiers in molecular biosciences IF:3.9Q2
研究论文 本研究基于上皮细胞肿瘤进展相关基因构建了一个新的膀胱癌预后模型,并发现OAS1是抑制膀胱癌侵袭性的关键基因 利用单细胞RNA测序数据识别上皮细胞亚群及其恶性进展轨迹,并基于此构建了一个四基因特征的预后模型,同时通过体外实验验证了关键基因OAS1的功能 模型验证依赖于公共数据库的回顾性数据,需要在前瞻性临床队列中进一步验证;体外实验未能完全模拟体内肿瘤微环境的复杂性 识别驱动膀胱癌进展的关键上皮细胞来源特征基因,构建可靠的预后模型,并探索关键基因OAS1的生物学功能 膀胱癌患者(来自TCGA和GEO数据库)及膀胱癌细胞系 数字病理学 膀胱癌 单细胞RNA测序,批量RNA测序,LASSO Cox回归,CCK-8,Transwell,伤口愈合实验 LASSO Cox回归模型 单细胞RNA-seq数据,批量RNA-seq数据,临床数据 TCGA膀胱癌队列及独立GEO验证队列(具体样本数未明确说明) NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
268 2026-01-29
A robust ammonia metabolism gene signature identified by machine learning predicts prognosis and immunotherapy response in clear cell renal cell carcinoma
2025, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过机器学习方法,识别了一个与氨代谢相关的基因特征,用于预测透明细胞肾细胞癌的预后和免疫治疗反应 首次利用机器学习整合多组学数据,构建了氨代谢风险评分模型,并验证了其在预测预后和免疫治疗反应中的有效性,同时通过体外实验验证了关键基因CSAD的功能 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步的前瞻性临床研究验证模型的普适性 开发一个能够预测透明细胞肾细胞癌患者预后和免疫治疗反应的生物标志物 透明细胞肾细胞癌患者 机器学习 肾细胞癌 RNA-seq, scRNA-seq, WGCNA, TMB分析 随机森林, LASSO, 多元Cox回归 RNA-seq数据, 多组学数据 TCGA数据库中的患者数据,以及外部验证队列和免疫治疗队列 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
269 2026-01-29
Berberine suppresses hepatocellular carcinoma progression by blocking IL-4-JAK1-STAT6-mediated M2 polarization of macrophage
2025, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1
研究论文 本研究揭示了小檗碱通过阻断IL-4-JAK1-STAT6信号轴抑制巨噬细胞M2极化,从而抑制肝细胞癌进展的机制 首次阐明小檗碱通过直接结合JAK1蛋白的FERM结构域并稳定该蛋白,进而抑制IL-4诱导的巨噬细胞M2极化,并与抗PD-L1抗体联合治疗显示出协同抗肿瘤效应 研究主要基于H22荷瘤小鼠模型和体外实验,缺乏临床患者样本验证;联合治疗策略的长期安全性和疗效需进一步评估 探究小檗碱是否通过调节肿瘤炎症微环境抑制肝细胞癌进展 肝细胞癌(HCC)、肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)、H22肿瘤细胞系、荷瘤小鼠模型 肿瘤免疫学 肝细胞癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、分子对接、蛋白质稳定性测定、流式细胞术 NA 基因表达数据、蛋白质互作数据、细胞表型数据 H22荷瘤小鼠模型(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
270 2026-01-29
Integrative transcriptomic analysis reveals microglial metabolic-inflammatory crosstalk of HK2-HSPA5-TNF axis after intracerebral hemorrhage
2025, Frontiers in bioinformatics IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过整合转录组学数据,揭示了脑出血后小胶质细胞中HK2-HSPA5-TNF轴介导的代谢-炎症相互作用 首次通过整合bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq和空间转录组学数据,系统揭示了脑出血后小胶质细胞中葡萄糖代谢与炎症反应之间的时空动态调控网络 研究主要基于转录组学数据,缺乏蛋白质水平的功能验证;动物模型与人类组织的直接可比性有待进一步确认 探究脑出血后葡萄糖代谢失调如何促进神经炎症的发病机制 脑出血后的小胶质细胞代谢-炎症调控网络 生物信息学 脑血管疾病 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 加权基因共表达网络分析, 伪时间轨迹重建, 细胞间通讯推断 转录组数据 人类血肿周围组织和小鼠脑出血模型 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
271 2026-01-29
SpaLLM: a general framework for spatial domain identification with large language models
2025, Frontiers in bioinformatics IF:2.8Q2
研究论文 提出SpaLLM框架,通过整合大语言模型生成的基因描述嵌入与空间转录组学数据,改进空间域识别 首次将大语言模型生成的基因功能描述嵌入整合到空间转录组学分析中,利用预计算的GenePT嵌入创建生物学信息丰富的基因表示,从而增强空间域识别的准确性 未在摘要中明确提及具体局限性 改进空间转录组学中的空间域识别方法 空间转录组学数据,包括基因表达矩阵和空间坐标 空间转录组学 NA 空间转录组学技术 大语言模型 基因表达矩阵、空间坐标、基因功能描述文本 12个基于测序的Visium切片和一个独立的基于成像的osmFISH数据集 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 基于测序的Visium切片
272 2026-01-29
High-dimensional co-expression network analysis reveals persistent TRH gene expression throughout axolotl telencephalon regeneration
2025, Frontiers in bioinformatics IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过高维加权基因共表达网络分析,结合空间转录组学,揭示了蝾螈端脑再生过程中基因共表达的动态图谱,并识别了包括TRH在内的关键枢纽基因 整合hdWGCNA、空间转录组学和蛋白质-蛋白质相互作用网络,首次在蝾螈端脑再生中系统识别了枢纽基因,并发现了TRH基因在多个阶段的持续表达模式 研究主要为描述性分析,未进行实验验证枢纽基因的功能机制 识别蝾螈端脑再生过程中的枢纽基因并定位其细胞位置,以阐明脑再生的分子基础 蝾螈(Ambystoma mexicanum)的端脑再生过程 生物信息学 NA 高维加权基因共表达网络分析(hdWGCNA)、空间转录组学、蛋白质-蛋白质相互作用网络分析 NA 时空转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
273 2026-01-29
Integrated multi-omics and single-cell analysis identify SERPINE1 as a key mediator of the inflammatory tumor microenvironment in PDAC
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过整合多组学与单细胞分析,揭示了SERPINE1是胰腺导管腺癌(PDAC)炎症性肿瘤微环境的关键调控因子 首次通过整合多组学与单细胞分析,系统性地将SERPINE1确立为PDAC炎症驱动基质重塑和免疫逃逸的核心协调者,并发现其作为药物靶点的新潜力 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,体内功能验证和临床转化研究有待进一步开展 阐明PDAC炎症性肿瘤微环境中的关键调控因子及其在免疫抑制和肿瘤进展中的作用 胰腺导管腺癌(PDAC)肿瘤微环境中的细胞与分子 生物信息学,单细胞组学 胰腺癌 单细胞RNA测序,多组学分析,分子对接,CRISPR基因敲除 NA 基因组,转录组,单细胞转录组数据 来自TCGA、GEO、ArrayExpress数据库的多队列数据集,以及IMvigor210队列 NA 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq NA NA
274 2026-01-29
From multi-omics to functional validation: the PTMRS stratifies TME and positions PDGFRB in CRC biology
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究构建了一个基于翻译后修饰相关基因的风险特征模型(PTMRS),用于结直肠癌的预后分层,并通过实验验证了PDGFRβ在肿瘤微环境中的关键作用 首次整合多种翻译后修饰信号构建结直肠癌风险模型,并通过单细胞RNA测序和细胞通讯分析揭示了PTMRS与肿瘤微环境的关联,实验验证了PDGFRβ在成纤维细胞中的促癌功能 需要在体内模型和前瞻性临床队列中进一步验证 开发结直肠癌的精准预后分层工具并探索其生物学机制 结直肠癌患者样本、人类结肠成纤维细胞和结直肠癌细胞 生物信息学 结直肠癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、细胞通讯分析(CellChat)、体外功能实验 Cox偏最小二乘框架 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 TCGA和GTEx数据集中的结直肠癌样本,多个独立队列和免疫治疗数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
275 2026-01-29
P2RY13+ dendritic cells correlate with enhanced antigen presentation and lymphocyte activation in lung adenocarcinoma
2025, Frontiers in medicine IF:3.1Q1
研究论文 本研究通过整合多组学数据,揭示了P2RY13在肺腺癌肿瘤微环境中的特异性表达于树突状细胞,并阐明了其通过增强抗原呈递和T细胞激活来促进抗肿瘤免疫的作用机制 首次在单细胞分辨率下确定了P2RY13在肺腺癌肿瘤微环境中的特异性细胞表达谱(树突状细胞),并系统性地将其表达与免疫浸润、细胞间通讯及预后关联起来 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,缺乏实验验证来证实P2RY13在树突状细胞中的功能机制 探究P2RY13在肺腺癌肿瘤微环境中的细胞特异性表达、功能及其与免疫调节和预后的关系 肺腺癌患者肿瘤组织及正常组织的转录组和临床数据 生物信息学 肺腺癌 单细胞RNA测序,转录组分析,生物信息学算法 Seurat, CIBERSORT, MCP-counter, quanTIseq, TIMER, ESTIMATE, CellChat, AUCell, UCell, AddModuleScore, GSVA, JASMINE, singscore, ssGSEA, viper 转录组数据,单细胞RNA测序数据,临床数据 来自TCGA、GEO(GSE68465和GSE31210)和单细胞数据集(GSE131907)的样本,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
276 2026-01-29
Cellular senescence in age-related cardiovascular disease: past and future
2025, Frontiers in aging IF:3.3Q2
综述 本文综述了细胞衰老在年龄相关心血管疾病中的作用,并提出了一个以衰老相关分泌表型为核心、解释少数衰老细胞如何系统性影响心血管微环境的统一框架 超越对通路的简单罗列,提出了一个以少数衰老细胞如何重编程心血管微环境为核心、整合关键调控网络的统一框架,并前瞻性地讨论了靶向衰老的治疗策略 机制复杂性高,动物模型和体外系统存在局限性 阐明细胞衰老在年龄相关心血管疾病发生发展中的作用机制,并探讨靶向衰老作为延缓心血管衰老和治疗相关疾病的新策略 衰老细胞及其分泌表型对主要心血管细胞类型(心肌细胞、内皮细胞、成纤维细胞、平滑肌细胞)的影响 NA 心血管疾病 单细胞测序 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
277 2026-01-29
JAK-centric explainable few-shot gene-expression diagnosis framework for alopecia via MultiPLIER priors and relation-style set-to-set comparison
2025, Frontiers in molecular biosciences IF:3.9Q2
研究论文 本文开发了一个基于JAK-STAT信号通路的可解释少样本基因表达诊断框架,用于区分斑秃和雄激素性脱发 提出了一种结合生物学先验知识(MultiPLIER潜在变量)和关系式集合比较的少样本深度学习分类器,增强了小样本条件下的诊断鲁棒性和机制可解释性 研究样本量有限,且框架在更广泛疾病类型中的应用仍需验证 开发可解释的AI框架,用于小样本转录组诊断,以区分斑秃和雄激素性脱发 斑秃和雄激素性脱发患者的头皮样本 机器学习 脱发疾病 RNA-seq 少样本深度学习分类器(Relation-style set-to-set comparator) 基因表达数据 未明确指定具体样本数量,但涉及独立AA/AGA/健康头皮样本 NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
278 2026-01-29
Spatiotemporal dynamics of spermatogenesis: insights from high-resolution spatial transcriptomics and pseudotime trajectories in mouse testes
2025, Frontiers in reproductive health IF:2.3Q3
研究论文 本研究利用高分辨率空间转录组学技术揭示了小鼠睾丸中精子发生的时空动态过程 采用Salus-STS高分辨率空间转录组学(约1微米分辨率)结合Salus Cellbins算法,首次在单细胞水平上解析了睾丸的空间转录组特征,克服了传统空间转录组学分辨率不足的问题 研究仅基于小鼠模型,未直接验证人类样本;高分辨率技术可能受限于样本处理和成本 探究精子发生的分子基础和时空动态,以增进对男性生殖生物学的理解 小鼠睾丸组织 空间转录组学 男性不育 空间转录组学,单细胞RNA测序 NA 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据 NA NA 空间转录组学,单细胞RNA-seq Salus-STS Salus-STS高分辨率空间转录组学(约1微米分辨率)
279 2026-01-25
Decoding HSP90AA1-driven inflammatory signaling in the uveal melanoma microenvironment: an integrated analysis at single-cell resolution
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过整合计算生物学筛选与单细胞分辨率分析,解码了HSP90AA1作为葡萄膜黑色素瘤炎症和免疫微环境关键调节因子的作用 首次在单细胞分辨率下系统解析了HSP90AA1在葡萄膜黑色素瘤微环境中的表达谱和功能,揭示了其通过调控NF-κB、STAT3等炎症信号通路影响肿瘤进展的新机制 研究主要基于体外实验和动物模型,临床样本验证相对有限,且未深入探讨HSP90AA1抑制剂的具体治疗策略 识别和验证介导葡萄膜黑色素瘤炎症与免疫信号转导的关键分子调节因子,并探索其作为治疗靶点的潜力 葡萄膜黑色素瘤肿瘤微环境中的细胞群体,特别是恶性细胞、CD8+ T细胞和巨噬细胞 数字病理学 葡萄膜黑色素瘤 单细胞RNA测序,siRNA敲低,体外功能实验,体内异种移植模型 网络计算筛选模型 单细胞RNA测序数据 未明确说明具体样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
280 2026-01-25
Integrative analysis of bulk and single-cell transcriptomics identifies factors related to immunosuppressive microenvironment to predict unfavorable prognosis in inflammatory breast cancer
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过整合分析bulk和单细胞转录组数据,识别了与免疫抑制微环境相关的因子,以预测炎性乳腺癌的不良预后 结合bulk和单细胞转录组学分析,揭示了GZMB和SPP1作为炎性乳腺癌中免疫抑制相关预后生物标志物的潜在作用,并明确了浆细胞样树突状细胞在重塑免疫抑制微环境中的关键角色 免疫组化分析的样本量极小,可能影响结果的可靠性 探究炎性乳腺癌肿瘤微环境的异质性及细胞间通讯,识别与免疫抑制微环境和不良预后相关的生物标志物 炎性乳腺癌和非炎性乳腺癌样本 数字病理学 乳腺癌 单细胞转录组测序, 免疫组化 WGCNA 转录组数据, 图像数据 未明确具体样本数量,但提及免疫组化分析基于极小的样本量 NA 单细胞RNA-seq NA NA
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