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当前共找到 2176 篇文献，本页显示第 241 - 260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 241 | 2026-02-07 |
Dissecting the immune evasion and therapeutic resistance mechanisms in EGFR/TP53 co-mutated non-small cell lung cancer: implications for targeted and immunotherapy strategies
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1652213
PMID:40948762
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了EGFR/TP53共突变非小细胞肺癌中促进免疫逃逸和治疗抵抗的协调转录网络 | 首次在单细胞水平上解析了EGFR/TP53共突变NSCLC的免疫微环境，并发现了由STAT1/ETS1转录程序调控的关键免疫抑制和耐药基因网络 | 样本量较小（仅4个样本用于单细胞分析），需要在更大的患者队列和功能研究中进一步验证 | 探究EGFR/TP53共突变非小细胞肺癌中导致侵袭性亚型和治疗抵抗的分子机制 | 非小细胞肺癌患者的肿瘤样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，靶向二代测序 | NA | RNA测序数据 | 40例NSCLC患者样本（其中4例用于单细胞分析） | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Genomics平台 | NA |
| 242 | 2026-02-07 |
Spatial regulation of ribosomal protein gene expression revealed by spatial transcriptomic analysis in the water fern Ceratopteris richardii
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1728120
PMID:41635689
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术分析水蕨Ceratopteris richardii的孢子体发育，揭示了核糖体蛋白基因在组织间的空间表达调控 | 首次在水蕨中应用空间转录组学技术，并发现核糖体相关功能在几乎所有组织域中普遍富集，且核糖体蛋白基因及其旁系同源物在不同组织间存在差异表达模式 | 研究仅针对水蕨一种植物，且未深入探讨核糖体蛋白基因差异表达的具体功能机制 | 阐明植物发育过程中基因表达的空间调控机制 | 水蕨Ceratopteris richardii的孢子体发育组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 243 | 2026-02-07 |
Comprehensive analysis of IGFL1 in colorectal cancer and its promotion of tumour progression via inhibition of lipophagy
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1719525
PMID:41635856
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证，揭示了IGFL1在结直肠癌中的表达上调及其通过抑制脂噬促进肿瘤进展的机制 | 首次全面阐明IGFL1在结直肠癌中的致癌作用，并发现其通过抑制脂噬这一新机制促进肿瘤进展 | 研究主要基于细胞系实验和公共数据库分析，缺乏体内动物模型验证和更大规模的临床队列验证 | 阐明IGFL1在结直肠癌中的功能作用及其分子机制 | 结直肠癌组织样本、TCGA和GEO数据库数据、结直肠癌细胞系SW620和HCT116 | 生物信息学 | 结直肠癌 | RNA测序、免疫组化、单细胞RNA测序、生物信息学分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据、单细胞测序数据 | TCGA和GEO数据库中的结直肠癌样本、临床组织样本、SW620和HCT116细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 244 | 2026-02-06 |
A multi-omics approach combining causal inference and in vivo validation identifies key protein drivers of alcohol-associated liver disease
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1714502
PMID:41497980
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研究论文 | 本研究通过整合人类遗传学与多组学数据，结合因果推断和体内验证，识别并验证了酒精相关性肝病（ALD）的四个关键因果蛋白驱动因子 | 首次系统性地将孟德尔随机化（MR）因果推断框架与单细胞转录组学和体内小鼠模型验证相结合，以区分ALD的关联性生物标志物与因果驱动因子，并揭示了由促炎性髓系细胞与稳态肝细胞功能平衡调控的新型致病轴 | 研究主要基于欧洲血统人群的遗传和蛋白质组数据，其发现可能无法直接推广到其他人群；体内验证仅在小鼠模型中进行，需要在人类组织或临床试验中进一步确认 | 旨在揭示酒精相关性肝病（ALD）的分子致病机制，并识别潜在的治疗靶点 | 人类血浆蛋白质组数据、ALD全基因组关联研究（GWAS）数据、小鼠ALD模型的肝组织 | 生物信息学，多组学整合分析 | 酒精相关性肝病 | 孟德尔随机化（MR），单细胞RNA测序（scRNA-seq），功能富集分析，汇总数据孟德尔随机化（SMR） | 因果推断模型（两样本MR），小鼠慢性加暴饮乙醇喂养模型 | 蛋白质组数据，遗传关联数据，单细胞转录组数据 | 大规模血浆蛋白质组和ALD GWAS数据（具体样本数未在摘要中提供），以及小鼠模型数据 | NA | 血浆蛋白质组学，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 245 | 2026-02-06 |
A multi-omics features-based approach integrating immunogenicity and inflammation enhances immunotherapy benefit in clear cell renal cell carcinoma
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1596719
PMID:41640425
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研究论文 | 本研究开发了一种基于炎症和免疫特征的多组学机器学习模型，用于预测透明细胞肾细胞癌患者对免疫检查点阻断治疗的响应和生存 | 整合炎症和免疫特征的多组学机器学习模型，相比单一生物标志物（如PD-L1表达、TMB）展现出更优的预测能力，并能将患者分为具有不同治疗响应和预后的亚型 | NA | 预测透明细胞肾细胞癌患者对免疫检查点阻断治疗的响应和生存，以指导精准免疫治疗 | 透明细胞肾细胞癌患者 | 机器学习 | 肾细胞癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 机器学习模型 | 基因组和转录组数据 | 超过1900名自身免疫性肾病患者和超过1000名接受ICB治疗的ccRCC患者 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 246 | 2026-02-06 |
Mechanistic insights into Shenqi Dihuang decoction in the treatment of immunoglobulin a nephropathy
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1714263
PMID:41640677
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研究论文 | 本研究通过网络药理学、机器学习、单细胞RNA测序和体外实验，探讨了参芪地黄汤治疗IgA肾病的潜在分子机制 | 首次通过整合多组学数据和机器学习方法，系统性地揭示了参芪地黄汤治疗IgA肾病的关键靶点FOS、MCL1和CCND1，并构建了相关的分子调控网络 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验，缺乏动物模型或临床试验的验证 | 探索参芪地黄汤治疗IgA肾病的分子作用机制 | IgA肾病（免疫球蛋白A肾病）患者数据及体外细胞模型 | 生物信息学 | 肾病 | 单细胞RNA测序，分子对接，基因集富集分析，免疫细胞浸润分析 | 机器学习特征选择，列线图 | 基因表达数据，单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 247 | 2026-02-05 |
HPV integration in head and neck cancer: downstream splicing events and expression ratios linked with poor outcomes
2025-Jan-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.17.633627
PMID:39896613
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研究论文 | 本研究通过分析头颈鳞状细胞癌的RNA-seq数据，探讨HPV整合对临床预后的影响，并识别相关生物标志物 | 首次基于RNA特征（如HPV-人类融合转录本和HPV基因转录比例）对HPV整合阳性患者进行分类，并揭示其与较差临床结局的关联 | 研究主要依赖RNA数据，DNA整合事件仅来自部分队列，可能未全面覆盖所有整合模式 | 探究HPV整合在头颈癌中的致癌机制及其与临床预后的关系 | 头颈鳞状细胞癌患者样本 | 数字病理学 | 头颈癌 | RNA-seq | NA | RNA序列数据 | 261个HPV相关HNSCC样本（包括bulk和单细胞RNA-seq）及102名HPV阳性参与者的DNA整合事件 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 248 | 2026-02-05 |
The role of mitophagy-related genes in prognosis and immunotherapy of cutaneous melanoma: a comprehensive analysis based on single-cell RNA sequencing and machine learning
2025-Jan-11, Immunologic research
IF:3.3Q3
DOI:10.1007/s12026-025-09593-x
PMID:39799269
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和机器学习方法，阐明了线粒体自噬相关基因在皮肤黑色素瘤预后和免疫治疗中的作用，并开发了一个预测模型 | 首次结合单细胞RNA测序和多种机器学习算法，构建了一个基于线粒体自噬相关基因的皮肤黑色素瘤预后模型，并揭示了其与免疫微环境及治疗响应的关联 | 研究依赖于公开数据库数据，未进行大规模独立临床队列验证，且模型在外部验证中的泛化能力有待进一步确认 | 阐明线粒体自噬相关基因在皮肤黑色素瘤中的作用，并开发预后预测模型 | 皮肤黑色素瘤患者的数据及细胞系 | 机器学习 | 皮肤黑色素瘤 | 单细胞RNA测序，RT-qPCR | 多种机器学习算法（包括但不限于ssGSEA, WGCNA） | 单细胞RNA测序数据，批量转录组数据，临床数据 | 未明确指定样本数量，但使用了公开数据库中的皮肤黑色素瘤数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 249 | 2026-02-05 |
A novel tumor-progressing fibroblast signature derived from single-cell RNA sequencing enables prognostic stratification and reveals RNF11 as a functional regulator in bladder cancer
2025, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2025.1722809
PMID:41624768
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析膀胱癌中的癌症相关成纤维细胞，构建了一个基于四个基因的肿瘤进展成纤维细胞风险评分模型，用于预后分层，并验证了RNF11在膀胱癌进展中的功能调节作用 | 整合单细胞RNA测序与批量转录组学数据，构建了一个新的CAF相关预后模型（TPFR），并首次在膀胱癌中功能验证了RNF11作为肿瘤进展调节因子的作用 | 研究样本量相对有限（单细胞数据来自8名患者），且模型验证主要依赖于回顾性队列，需要在前瞻性临床队列中进一步验证 | 开发一个基于癌症相关成纤维细胞分子特征的预后分层模型，以改善膀胱癌患者的风险预测和精准医疗策略 | 膀胱癌患者、膀胱癌细胞系（T24和5637） | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、shRNA敲低、增殖/迁移/侵袭实验、转录组分析 | 非负矩阵分解共识聚类、LASSO-Cox回归、逐步选择模型 | 单细胞RNA测序数据、批量转录组数据 | 单细胞数据：8名BLCA患者；训练队列：359个TCGA-BLCA样本；验证队列：476个E-MTAB-4321样本；细胞实验：T24和5637膀胱癌细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 250 | 2026-02-05 |
Single-cell transcriptomics reveals mechanisms of Galt gene editing-induced liver injury involving HGF-VEGF-mediated intercellular signaling in mice
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1729321
PMID:41624789
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研究论文 | 本研究通过构建Galt基因编辑小鼠模型，利用单细胞转录组学揭示了Galt基因编辑诱导肝损伤的分子机制，涉及HGF-VEGF介导的细胞间信号传导 | 首次结合CRISPR/Cas9基因编辑技术与单细胞转录组学分析，系统阐明了Galt基因缺陷通过HGF和VEGF信号通路增强导致肝细胞水肿和肝损伤的新机制 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类样本或临床环境中验证，且机制研究仍处于探索阶段，需要进一步功能实验确认 | 阐明Galt基因编辑诱导肝损伤的分子机制，为半乳糖血症的发病机制提供新见解 | Galt基因编辑小鼠（GAL小鼠）模型 | 单细胞转录组学 | 半乳糖血症 | CRISPR/Cas9基因编辑，单细胞RNA-seq，qRT-PCR，Western blotting，H&E染色 | 小鼠疾病模型 | 单细胞转录组数据，基因表达数据，组织病理学图像 | 未明确指定样本数量，但基于GAL小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 251 | 2026-02-05 |
Adiponectin receptor T-cadherin emerges as a novel regulator of adipose stem cell quiescence and adipogenesis
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1734183
PMID:41624791
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA-seq分析揭示了T-cadherin在脂肪干细胞静息和脂肪生成中的调控作用 | 首次将T-cadherin鉴定为脂肪干细胞中一个具有干细胞特性的独特亚群的调控因子，并阐明其通过DPP4维持干细胞状态的新机制 | 研究主要基于体外实验，未在体内模型中验证T-cadherin的功能；样本来源仅限于人类皮下脂肪组织 | 探究脂肪组织细胞和间充质干细胞的异质性，特别是T-cadherin在脂肪干细胞静息和脂肪生成中的调控作用 | 人类皮下脂肪组织来源的间充质干细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA-seq, 慢病毒转导, 长期活细胞成像, 脂肪生成分化实验 | NA | 单细胞RNA-seq数据, 图像数据 | 未明确样本数量的人类皮下脂肪组织来源MSCs | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 252 | 2026-02-05 |
Commentary: Analysis of head and neck cancer scRNA-seq data identified PRDM6 promotes tumor progression by modulating immune gene expression
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1697007
PMID:41624841
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 253 | 2026-02-05 |
Unveiling the IL-1β/CXCL2 axis: a shared therapeutic target in periodontitis and inflammatory bowel disease
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1728773
PMID:41624856
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研究论文 | 本研究通过整合牙周炎和炎症性肠病的转录组数据，揭示了IL-1β/CXCL2轴作为两种疾病共有的炎症治疗靶点 | 首次整合牙周炎和炎症性肠病的批量与单细胞RNA-seq数据，识别出跨疾病的髓系细胞为中心的IL-1β/趋化因子炎症程序，并验证了IL-1β-CXCL2通路作为潜在治疗靶点 | 功能阻断研究尚未进行，需要进一步实验验证治疗因果关系 | 揭示牙周炎与炎症性肠病之间共享的细胞和分子机制，以寻找共同的治疗靶点 | 牙周炎患者和炎症性肠病患者的转录组数据，以及双炎症啮齿动物模型 | 生物信息学 | 牙周炎和炎症性肠病 | 单细胞RNA-seq, 批量转录组分析, 免疫组织化学 | NA | 转录组数据, 单细胞RNA-seq数据, 图像数据 | 两个牙周炎队列（GSE16134和GSE10334），18个炎症性肠病样本的51,322个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 254 | 2026-02-05 |
Commentary: Lactylation-related gene AKR1A1 contributes to osteoporosis via metabolic-immune regulation: evidence from multi-omics integration, single-cell transcriptomics, and in vitro validation
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1752400
PMID:41624851
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 255 | 2026-02-05 |
Decoding thymic development: a single-cell atlas of tree shrew immunity
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1689906
PMID:41624883
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术构建了树鼩出生后胸腺发育的全面细胞图谱，揭示了其免疫系统在物种间的保守性与特异性 | 首次通过单细胞RNA测序构建树鼩胸腺发育的细胞图谱，并识别出如ZNF683基因在CD8aa细胞发育后期表达等物种特异性变异 | 研究主要关注胸腺细胞，可能未全面覆盖树鼩整个免疫系统的复杂性；样本年龄范围可能限制了对发育全阶段的理解 | 解析树鼩作为临床前哺乳动物模型的免疫系统，特别是胸腺发育过程 | 树鼩的出生后胸腺细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未明确指定样本数量，但涉及年轻和年老树鼩的胸腺细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 256 | 2026-02-03 |
A regularized Bayesian Dirichlet-multinomial regression model for integrating single-cell-level omics and patient-level clinical study data
2025-Jan-07, Biometrics
IF:1.4Q2
DOI:10.1093/biomtc/ujaf005
PMID:39887052
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研究论文 | 提出一种正则化贝叶斯狄利克雷-多项式回归框架，用于整合单细胞RNA测序数据与患者临床数据，以探究细胞类型丰度与临床变量之间的关系 | 引入新型分层树结构以识别不同细胞类型水平上的关联，并首次将正则化贝叶斯狄利克雷-多项式回归应用于单细胞与临床数据的整合分析 | 未明确说明模型对数据规模和质量的敏感性，且仅在三类疾病中验证，普适性有待进一步验证 | 开发一种整合单细胞组学数据与患者临床数据的方法，以揭示细胞类型丰度与临床变量之间的关联 | 肺纤维化、COVID-19和非小细胞肺癌患者的单细胞RNA测序数据及临床数据 | 单细胞组学 | 肺纤维化, COVID-19, 非小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序 | 正则化贝叶斯狄利克雷-多项式回归模型 | 单细胞RNA测序数据, 临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 257 | 2026-02-03 |
Lactylation-related gene AKR1A1 contributes to osteoporosis via metabolic-immune regulation: evidence from multi-omics integration, single-cell transcriptomics, and in vitro validation
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1680305
PMID:41246341
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据、单细胞转录组学和体外验证，系统鉴定了与骨质疏松症中赖氨酸乳酰化相关的关键差异表达基因，并探讨了其在代谢-免疫调控轴中的潜在作用 | 首次将乳酰化修饰与骨质疏松症的代谢-免疫调控轴联系起来，并通过多组学整合、单细胞转录组学和体外实验验证，揭示了AKR1A1基因在疾病中的关键作用及其通过SPP1-CD44信号通路介导免疫细胞间通讯的新机制 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，体外实验仅使用了RAW264.7巨噬细胞系，缺乏体内动物模型验证和临床样本的直接验证 | 系统识别骨质疏松症中与赖氨酸乳酰化相关的关键差异表达基因，并探索其在疾病发病机制中的代谢和免疫调控作用 | 骨质疏松症相关的基因表达数据、乳酰化相关基因、RAW264.7巨噬细胞 | 生物信息学 | 骨质疏松症 | 基因表达微阵列、单细胞RNA测序、qPCR、Western blot、免疫共沉淀 | 机器学习模型（113种组合） | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 五个骨质疏松症相关基因表达微阵列数据集和一个单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 258 | 2026-02-02 |
Efficacy of CTLA-4 checkpoint therapy is dependent on IL-21 signaling to mediate cytotoxic reprogramming of PD-1+CD8+ T cells
2025-Jan, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-024-02027-0
PMID:39702858
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研究论文 | 本研究通过免疫分析晚期黑色素瘤患者的PD-1+CD8+ T细胞，揭示了CTLA-4检查点疗法依赖IL-21信号通路介导PD-1+CD8+ T细胞的细胞毒性重编程机制 | 首次发现CTLA-4检查点疗法的疗效依赖于IL-21信号通路，并揭示了其与抗PD-1单药疗法在信号传导上的主要差异 | 研究主要基于晚期黑色素瘤患者样本，可能不适用于其他癌症类型；机制研究部分依赖于小鼠模型，需进一步验证 | 探究抗PD-1和抗CTLA-4检查点疗法的疗效机制，特别关注IL-21信号通路在T细胞重编程中的作用 | 晚期黑色素瘤患者的PD-1+CD8+ T细胞以及B16F10黑色素瘤小鼠模型 | 免疫学 | 黑色素瘤 | 单细胞转录组分析、T细胞受体库分析、免疫分析 | NA | 转录组数据、免疫数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 259 | 2026-02-02 |
The expression of mercaptopyruvate sulfurtransferase serves as a potential biomarker for prognostic stratification and immunotherapy in certain cancers
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1686443
PMID:41613530
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和临床样本验证，探讨了MPST基因在多种癌症中的表达、预后分层和免疫治疗潜力 | 首次对MPST基因进行全面的泛癌分析，结合单细胞测序数据揭示其在肿瘤免疫微环境中的功能状态 | 研究主要基于公共数据库和初步临床验证，需要更多实验和前瞻性研究来确认MPST作为生物标志物的临床适用性 | 评估MPST基因在癌症诊断、预后和免疫反应中的潜在影响 | 多种癌症类型，包括肺腺癌等 | 生物信息学 | 多种癌症 | 生物信息学分析，免疫组化染色，单细胞测序 | NA | 基因表达数据，DNA甲基化数据，蛋白质相互作用网络，临床样本图像 | 基于TCGA和HPA数据库的多种癌症样本，以及收集的临床组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 260 | 2026-02-02 |
Spatial transcriptome and single-cell sequencing reveal the role of nucleotide metabolism in breast cancer progression and tumor microenvironment
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1703778
PMID:41613532
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞测序和空间转录组学技术，揭示了核苷酸代谢在乳腺癌进展和肿瘤微环境中的作用 | 整合五种单细胞富集评分方法对乳腺癌细胞群进行综合分析，并利用空间转录组学数据映射单细胞簇，以区分肿瘤细胞亚型 | NA | 探索核苷酸代谢在乳腺癌细胞中的复杂性及其与肿瘤微环境的相互作用 | 乳腺癌细胞及其与肿瘤微环境的相互作用 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序, 空间转录组学 | 机器学习算法 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |