单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 2148 篇文献，本页显示第 241 - 260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2025-12-21 |
Targeting PSMB5-induced PANoptosis in bladder cancer: multi-omics insights and TCM candidate discovery
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1656682
PMID:41409300
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了PSMB5在膀胱癌PANoptosis中的关键作用，并构建了基于PANoptosis相关基因的预后模型 | 首次将PANoptosis概念应用于膀胱癌研究，结合机器学习、单细胞测序和孟德尔随机化分析识别PSMB5为关键靶点，并探索了中药候选化合物 | 研究主要基于TCGA数据库的回顾性分析，需要更多前瞻性临床数据验证；体外实验尚未完全阐明PSMB5的具体作用机制 | 阐明PANoptosis相关基因在膀胱癌中的作用机制、预后价值及治疗潜力 | 膀胱癌患者样本（来自TCGA数据库）及膀胱癌细胞系 | 生物信息学与计算生物学 | 膀胱癌 | 多组学分析、单细胞测序、机器学习、孟德尔随机化分析、分子对接 | LASSO回归模型、机器学习模型 | 基因表达数据、单细胞测序数据、临床数据 | TCGA数据库中的膀胱癌样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 242 | 2025-12-21 |
Single-cell transcriptome profile during the antibody decline phase following inactivated COVID-19 vaccination
2025, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2025.1715387
PMID:41409547
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序技术，分析了灭活COVID-19疫苗接种后抗体下降阶段的转录组特征，以解释个体间抗体反应的差异 | 首次在灭活COVID-19疫苗接种后的抗体下降阶段应用单细胞转录组测序，揭示了HLA基因（尤其是HLA-B）在PBMC细胞类型中的显著变异，以及高滴度组中MHC-I信号增强的细胞间通讯机制 | 样本量相对较小（仅15个样本），且仅针对灭活疫苗BBIBP-CorV，可能不适用于其他类型疫苗或更广泛人群 | 探究灭活COVID-19疫苗接种后抗体下降阶段个体间抗体反应差异的转录组基础 | 65名健康志愿者的外周血单个核细胞（PBMC），其中15个样本根据抗体滴度（低、中、高）被选中进行单细胞RNA测序 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 65名健康志愿者，其中15个PBMC样本用于单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 243 | 2025-12-21 |
APOE ε4 allele drives female-specific Alzheimer's disease progression via vascular dysfunction and tau spreading
2025, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2025.1683204
PMID:41409615
|
研究论文 | 本研究揭示了APOE ε4等位基因通过血管功能障碍和tau蛋白扩散驱动女性特异性阿尔茨海默病进展的分子网络 | 首次系统揭示了APOE ε4在女性AD患者中通过内皮功能障碍驱动tau病理的性别特异性分子机制，并提出了血管扩张剂长春胺作为靶向治疗候选药物 | 研究主要基于Mayo Clinic队列的转录组数据，需要在更大队列和不同人群中验证；动物模型为AAV-hTau注射的APP/PS1小鼠，可能无法完全模拟人类AD的复杂性 | 阐明APOE ε4等位基因在女性阿尔茨海默病患者中导致认知障碍加重的生物学机制 | 阿尔茨海默病患者（特别是女性APOE ε4携带者）的脑组织样本、tauopathy小鼠模型 | 生物信息学与神经科学 | 阿尔茨海默病 | RNA-seq, 加权基因共表达网络分析, 单细胞RNA-seq, 孟德尔随机化, 机器学习 | 机器学习（未指定具体模型）, 动物模型 | RNA-seq数据, 单细胞RNA-seq数据 | 277个颞叶皮层样本（Mayo Clinic队列） | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 244 | 2025-12-21 |
Histone Methyltransferase SETD1B Maintains Cancer Stem Cell Niche by Regulating the Crosstalk between CD24 and Surface Adhesion Molecules in Hepatocellular Carcinoma
2025, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.112943
PMID:40860182
|
研究论文 | 本研究揭示了组蛋白甲基转移酶SETD1B通过调控CD24与表面粘附分子的相互作用来维持肝癌干细胞生态位，并发现雷公藤甲素可作为靶向SETD1B的潜在治疗药物 | 首次发现MAZ/SETD1B/CD24信号级联是调控肝癌干细胞干性的关键机制，并鉴定出雷公藤甲素能通过降解SETD1B靶向肝癌干细胞 | 未明确说明动物模型的具体类型及体内实验的样本量，药物作用机制仍需进一步验证 | 开发靶向肝癌干细胞的新治疗策略以改善肝细胞癌患者临床预后 | 肝细胞癌、肝癌干细胞 | 单细胞组学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、空间RNA测序、TCGA数据分析 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、患者来源细胞系 | 基于公共数据库（TCGA、scRNA-seq、空间RNA-seq）的患者标本数据及患者来源肝癌细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 245 | 2025-12-20 |
Identification of prognostic biomarkers for endometrioid endometrial carcinoma based on the miRNA and mRNA co-expression network regulated by estradiol
2025, Clinics (Sao Paulo, Brazil)
DOI:10.1016/j.clinsp.2025.100672
PMID:40319860
|
研究论文 | 本研究通过构建miRNA和mRNA共表达网络，识别了受雌二醇调控的子宫内膜样子宫内膜癌预后生物标志物 | 首次结合TCGA数据库和雌二醇处理的细胞测序数据，构建miRNA-mRNA调控网络，并利用单细胞转录组数据验证基因表达变化 | 样本量相对有限，特别是雌二醇处理组仅3个重复，且依赖公共数据库数据，未进行实验验证 | 识别与雌二醇调控相关的子宫内膜样子宫内膜癌预后生物标志物 | 子宫内膜样子宫内膜癌患者样本和雌二醇处理的子宫内膜癌Ishikawa细胞 | 生物信息学 | 子宫内膜癌 | RNA测序、单细胞转录组测序 | 共表达网络分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络 | RNA表达谱、单细胞转录组数据 | TCGA数据库408例患者样本，雌二醇处理细胞实验9个样本（3个对照组，3个低剂量组，3个高剂量组） | NA | RNA-seq, 单细胞转录组测序 | NA | NA |
| 246 | 2025-12-20 |
Potential function exploration of lncRNAs in idiopathic pulmonary fibrosis: insights from whole transcriptome sequencing data analysis
2025 Jan-Dec, Clinics (Sao Paulo, Brazil)
DOI:10.1016/j.clinsp.2025.100732
PMID:40782499
|
研究论文 | 本研究通过全转录组测序数据分析，探索长链非编码RNA在特发性肺纤维化中的潜在功能 | 结合RNA-seq和单细胞RNA-seq数据，识别与IPF相关的差异表达lncRNAs及其共表达网络，并发现特定lncRNAs在炎症反应通路中的富集 | 样本量较小（12名IPF患者和5名对照），且为诊断性研究，需进一步验证 | 探索lncRNAs在特发性肺纤维化中的功能和作用机制 | 特发性肺纤维化患者和对照的RNA测序数据 | 生物信息学 | 特发性肺纤维化 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | WGCNA | RNA测序数据 | 12名IPF患者和5名对照 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 247 | 2025-12-18 |
Molecular mechanisms related to neutrophils in sepsis using single-cell sequencing combined with Mendelian randomization analysis
2025, Archives of medical science : AMS
IF:3.0Q1
DOI:10.5114/aoms/213752
PMID:41403633
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 248 | 2025-12-20 |
Decoding cardiac metabolic reprogramming through single-cell multi-omics: from mechanisms to therapeutic applications
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1710474
PMID:41403700
|
综述 | 本文综述了单细胞多组学技术如何揭示心脏代谢重编程在心血管疾病中的机制，并探讨了其治疗应用前景 | 系统整合了单细胞转录组学、表观基因组学和空间转录组学等前沿技术，首次在单细胞分辨率下系统解析心脏细胞的代谢异质性、动态变化和细胞间通讯，并连接基础机制与代谢靶向干预策略 | 将研究发现转化为临床实践仍面临挑战，包括技术标准化、数据整合及临床验证等方面的障碍 | 阐明心脏代谢重编程在心血管疾病中的病理机制，并探索基于代谢干预的治疗策略 | 心脏细胞（在生理和病理条件下） | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学，单细胞表观基因组学，空间转录组学 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，单细胞ATAC-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 249 | 2025-12-20 |
Integrative multi-omics analysis identifies a PTM-related immune signature and IRF9 as a driver in ccRCC
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1707375
PMID:41403935
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学分析，在透明细胞肾细胞癌中鉴定了一个与翻译后修饰相关的免疫特征，并发现IRF9作为驱动因子 | 首次构建了一个基于翻译后修饰的五基因预后特征，并实验验证了IRF9在ccRCC中的功能驱动作用 | 研究主要基于回顾性队列和生物信息学分析，需要进一步的前瞻性临床验证 | 开发ccRCC的预后生物标志物并探索其免疫治疗反应预测价值 | 透明细胞肾细胞癌患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 肾癌 | 多组学分析，单细胞RNA-seq，免疫组化，qPCR，功能实验 | 随机生存森林模型 | 基因表达数据，单细胞RNA-seq数据，临床数据 | TCGA-KIRC队列，E-MTAB-1980队列，IMvigor210免疫治疗队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 250 | 2025-12-20 |
Pan-cancer multi-omics analysis of CCT4 in tumor progression and cancer immunity, with focus on lung adenocarcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1714837
PMID:41403933
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析探讨了CCT4在泛癌及肺腺癌中的表达模式、临床意义及其在肿瘤进展和免疫逃逸中的作用 | 首次在泛癌层面整合多组学数据揭示CCT4与免疫浸润的关联，并通过单细胞RNA测序发现CCT亚基在肿瘤上皮细胞中的协同过表达及CCT4在增殖亚群中的特异性富集 | 研究主要基于生物信息学分析，体外实验验证有限，且CCT4的具体分子机制仍需进一步探索 | 阐明CCT4在肿瘤进展和癌症免疫中的作用，特别是在肺腺癌中的功能 | 泛癌数据集及肺腺癌样本，包括肿瘤细胞系 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 转录组学、蛋白质组学、基因组学、表观遗传学、免疫基因组学、单细胞RNA测序 | NA | 多组学数据 | 泛癌数据集及肺腺癌样本，具体数量未明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 251 | 2025-12-20 |
Immune dysregulation in preeclampsia: integrative analysis of peripheral transcriptomes and placental single-cell land-scapes
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1638603
PMID:41403942
|
研究论文 | 本研究通过整合先兆子痫高风险孕妇外周血转录组和胎盘单细胞RNA测序数据，揭示了免疫失调的分子机制并识别了潜在生物标志物 | 首次将外周血转录组与胎盘单细胞图谱整合分析，识别出在两种数据集中均稳定表达的五个候选基因，并揭示了它们在特定免疫细胞中的表达模式 | 未明确说明样本的具体数量，且候选基因名称在摘要中被省略，限制了结果的直接验证 | 探索先兆子痫中免疫失调的分子机制，并识别早期检测和机制研究的生物标志物 | 先兆子痫高风险孕妇的外周血和胎盘组织 | 生物信息学 | 先兆子痫 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），转录组分析 | 机器学习特征选择 | 转录组数据，单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 252 | 2025-12-20 |
Upscaling: efficient generation of human lung organoids from induced pluripotent stem cells using a stirring bioreactor
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1684315
PMID:41404197
|
研究论文 | 本文介绍了一种使用搅拌生物反应器高效生成人肺类器官的方法，并与手动培养方式进行了比较 | 采用配备独特膜搅拌器的搅拌罐生物反应器进行规模化、自动化培养，实现了动物成分自由的生产过程 | NA | 开发高效生成人诱导多能干细胞来源肺类器官的方法，用于疾病模拟和药物反应研究 | 人诱导多能干细胞来源的肺类器官 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 253 | 2025-12-20 |
Deciphering B Cell Heterogeneity and Pathogenic Mechanisms in Osteoporosis Through Single-Cell RNA Sequencing
2025, BioMed research international
IF:2.6Q3
DOI:10.1155/bmri/9979105
PMID:41404455
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了骨质疏松症中B细胞亚群的异质性及其在疾病进展中的作用，并识别出两个关键的信号通路 | 首次在骨质疏松症中利用单细胞RNA测序技术系统性地解析B细胞亚群的异质性，并识别出MIF-(CD74+CXCR4)和LGALS9-CD45这两个新的信号通路作为疾病进展的潜在关键调节因子 | 样本量较小（仅包括3名骨质疏松症患者和1名非骨质疏松症患者），且数据来源于公共数据库，可能限制了结果的普遍性和统计效力 | 探究B细胞亚群在骨质疏松症中的作用及其对骨代谢的影响 | 人类股骨头组织细胞，包括骨质疏松症患者和非骨质疏松症患者的样本 | 数字病理学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 4名患者（3名骨质疏松症患者和1名非骨质疏松症患者）的股骨头组织细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 254 | 2025-12-18 |
Single-cell RNA sequencing reveals cellular diversity and gene expression dynamics in maize root development
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1666531
PMID:41393869
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了玉米根尖发育过程中的细胞多样性和基因表达动态 | 首次在玉米根尖中应用单细胞RNA测序技术，构建了高分辨率的转录图谱，并发现了与拟南芥和水稻不同的激素相关基因表达模式 | 研究仅针对玉米根尖组织，未涵盖整个根系系统；单细胞测序技术本身存在技术噪音和细胞捕获偏差 | 阐明玉米根发育在单细胞分辨率下的分子基础 | 玉米根尖组织 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 伪时间分析、加权基因共表达网络分析 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 255 | 2025-12-18 |
Single-cell RNA-seq reveals breast cancer heterogeneity and identifies TCP1 as a therapeutic target in breast cancer
2025, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.20451
PMID:41394417
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术解析乳腺癌异质性，识别出TCP1作为潜在治疗靶点 | 通过单细胞RNA测序高分辨率解析乳腺癌肿瘤微环境异质性，首次发现KRT17阳性亚群与患者生存相关，并验证TCP1在乳腺癌细胞迁移和侵袭中的关键作用 | 样本量相对有限（68例），且主要基于回顾性分析，需要进一步前瞻性研究验证 | 解析乳腺癌肿瘤异质性并识别新的治疗靶点 | 乳腺癌患者肿瘤样本（68例）及乳腺癌细胞系 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），拷贝数变异推断（inferCNV） | 无监督聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 68例乳腺癌标本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 256 | 2025-12-18 |
Single-cell profiling identifies heterogeneity of the immune microenvironment in healthy, primary and lymph node metastatic BC
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1690992
PMID:41394809
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和免疫组化数据，揭示了乳腺癌及其淋巴结转移灶中肿瘤内皮细胞的异质性，并发现了两种新的肿瘤富集内皮细胞亚型（EC4和EC5）及其与免疫微环境的相互作用 | 首次在乳腺癌中鉴定出两种先前未被表征的、肿瘤富集的内皮细胞亚型（EC4和EC5），揭示了它们亚型特异性的功能适应和预后意义，并阐明了这些新内皮细胞亚群与免疫细胞（特别是CD8+T细胞和巨噬细胞）之间新颖且亚型特异性的通讯机制 | 研究样本量相对有限（约12个样本，98,000个细胞），且主要关注乳腺癌，结论在其他癌症类型中的普适性有待验证 | 阐明乳腺癌及其淋巴结转移灶中肿瘤内皮细胞的异质性、功能及其与肿瘤免疫微环境的相互作用，以发现新的治疗靶点 | 来自原发性乳腺癌肿瘤、ER阳性淋巴结转移灶和健康组织的细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组学，免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据，空间转录组数据，图像数据 | 约12个样本，共98,000个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 257 | 2025-12-18 |
Efferocytosis-induced metabolic shift in bone macrophages drives lactate production and modulates inflammation and osteoclastogenesis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1650465
PMID:41394808
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了骨髓来源巨噬细胞在吞噬凋亡成骨细胞后，其代谢向糖酵解转变并产生乳酸，进而调节骨微环境中的炎症和破骨细胞生成 | 首次在单细胞水平上表征了骨微环境中执行胞葬作用的巨噬细胞亚群，并阐明了其代谢重编程（向糖酵解转变）及产生的乳酸在调节骨稳态中的关键作用 | 研究主要基于体外骨髓来源巨噬细胞模型，体内骨微环境的复杂性和其他细胞类型的相互作用可能未被完全涵盖 | 探究巨噬细胞在清除凋亡成骨细胞（胞葬作用）后发生的代谢改变及其对骨微环境（炎症和骨重塑）的调控作用 | 骨髓来源巨噬细胞、凋亡的成骨细胞、破骨细胞 | 单细胞组学 | 骨代谢疾病 | 单细胞RNA测序，qRT-PCR，代谢组学分析，乳酸ELISA | NA | 单细胞转录组数据，代谢物数据，基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 258 | 2025-12-18 |
Unveiling the novel value of TREM1 in the proneural-mesenchymal transition of glioma via tumor-associated macrophages
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1662351
PMID:41394801
|
研究论文 | 本研究揭示了TREM1在胶质母细胞瘤肿瘤相关巨噬细胞中介导前神经-间质转化（PMT）的关键作用及其作为治疗靶点的潜力 | 首次通过单细胞RNA测序结合TCGA数据分析，将TREM1鉴定为肿瘤相关巨噬细胞中驱动胶质母细胞瘤PMT的关键生物标志物，并阐明了其通过TLR4/PI3K/AKT/mTOR信号通路发挥作用的机制 | 样本量相对较小（7名患者），且体内实验仅使用了腹腔给药模型，需要更大规模的临床验证和更多给药途径的探索 | 探究TREM1在胶质母细胞瘤肿瘤相关巨噬细胞中介导前神经-间质转化的作用机制及治疗潜力 | 胶质母细胞瘤患者样本（肿瘤相关巨噬细胞和恶性细胞） | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, mRNA测序, 共培养系统, 体内给药实验 | LASSO-Cox回归, 加权基因共表达网络分析 | 单细胞RNA测序数据, mRNA测序数据 | 7名胶质母细胞瘤患者的24,366个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 259 | 2025-12-18 |
Integrated multi-omics elucidates PRNP knockdown-mediated chemosensitization to gemcitabine in pancreatic ductal adenocarcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1667835
PMID:41394830
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据，揭示了PRNP基因在胰腺导管腺癌中对吉西他滨耐药的关键调控作用及其通过EMT和铁死亡的双重机制 | 首次系统性地将PRNP基因鉴定为PDAC吉西他滨耐药的关键调控因子，并阐明其通过促进EMT和抑制铁死亡的双重作用机制，同时利用单细胞和空间转录组学揭示了其在化疗后特定CAF亚群中的富集与免疫抑制微环境的关联 | 研究主要基于体外细胞实验和动物模型，临床验证尚不充分，且PRNP靶向治疗策略的实际临床转化效果有待进一步评估 | 系统研究胰腺导管腺癌中吉西他滨耐药的机制并识别新的治疗靶点 | 胰腺导管腺癌（PDAC）细胞系、小鼠模型和临床患者数据 | 生物信息学与多组学整合分析 | 胰腺癌 | 微阵列、转录组学、蛋白质组学、单细胞RNA测序、空间转录组学 | 机器学习算法 | 多组学数据（包括转录组、蛋白质组、单细胞和空间转录组数据） | 涉及胰腺癌细胞系、小鼠模型和临床患者数据，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 260 | 2025-12-18 |
Single-cell transcriptomics reveals pathogen interactions and T cell reprogramming in HIV and Mycobacterium tuberculosis co-infection
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1680538
PMID:41394852
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学揭示了HIV与结核分枝杆菌共感染中病原体相互作用及T细胞重编程的机制 | 通过单细胞RNA测序结合有向无环图推断伪时间轨迹，首次系统描绘了从健康到HIV感染再到共感染的免疫细胞动态变化，并识别了Th1/Th17失衡及MHC-I偏向的T细胞信号重配置 | 研究样本来自未治疗早期状态，可能无法完全反映疾病进展或治疗后的免疫变化，且样本量相对有限 | 探究HIV与结核分枝杆菌共感染中病原体相互作用及宿主免疫重塑的机制 | 健康对照、HIV单感染及HIV-Mtb共感染参与者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | HIV感染与结核病共感染 | 单细胞RNA测序 | 有向无环图 | 单细胞转录组数据 | 健康对照、HIV单感染及HIV-Mtb共感染参与者的外周血单个核细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |