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当前共找到 2188 篇文献，本页显示第 241 - 260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2026-05-18 |
Cell-specific transcriptional signatures of vascular cells in Alzheimer's disease: perspectives, pathways, and therapeutic directions
2025-01-29, Molecular neurodegeneration
IF:14.9Q1
DOI:10.1186/s13024-025-00798-0
PMID:39876020
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综述 | 本文综述了阿尔茨海默病中血管细胞的细胞特异性转录特征及其对靶向治疗的意义 | 首次系统整合单细胞和单核转录组研究，揭示脑血管细胞类型和亚型在AD中的转录差异，并强调细胞间通讯失调及多组学整合策略 | 未提及具体局限性 | 总结AD中人类脑血管细胞的单细胞转录组特征及其潜在治疗方向 | 阿尔茨海默病患者的脑血管细胞（内皮细胞、壁细胞、平滑肌细胞、成纤维细胞、周细胞）及神经胶质单元 | 自然语言处理 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序，单核RNA测序 | NA | 文本 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 242 | 2026-05-17 |
scPharm: Identifying Pharmacological Subpopulations of Single Cells for Precision Medicine in Cancers
2025-01, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202412419
PMID:39560158
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研究论文 | 介绍scPharm计算框架，整合药理图谱与单细胞RNA测序数据，识别肿瘤内药物敏感性亚群并优化个性化治疗 | 首次提出通过标准化富集分数将药物反应基因列表与细胞身份基因分布关联，实现单细胞分辨率的药物亚群识别，并预测联合用药策略与毒性评估 | 仅依赖基因集富集分析评估相关性，可能忽略非编码RNA或表观遗传调控对药物反应的影响 | 为癌症精准医学提供单细胞分辨率的治疗异质性解析方法 | 人乳腺癌组织（ER阳性/HER2阳性）、人PC9细胞（经埃罗替尼处理）、小鼠模型 | 机器学习 | 乳腺癌，肺癌 | 单细胞RNA测序 | scPharm计算框架（基于基因集富集分析） | 基因表达数据 | 人乳腺癌组织（具体样本量未提及）、人PC9细胞系、小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 243 | 2026-05-17 |
H. Pylori-Facilitated TERT/Wnt/β-Catenin Triggers Spasmolytic Polypeptide-Expressing Metaplasia and Oxyntic Atrophy
2025-01, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202401227
PMID:39587848
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研究论文 | 本研究揭示了幽门螺杆菌通过CagA蛋白破坏TERT与E3连接酶SYVN1的相互作用，上调TERT水平并激活Wnt/β-Catenin通路，从而诱导主细胞去分化和痉挛性多肽表达化生及胃底腺萎缩的机制 | 首次阐明CagA通过干扰TERT与新型E3连接酶SYVN1的结合来上调TERT蛋白丰度，并证实TERT/Wnt/β-Catenin通路在幽门螺杆菌诱导的SPEM中的关键作用 | 未提及具体局限 | 探究幽门螺杆菌诱导胃黏膜痉挛性多肽表达化生和胃底腺萎缩的分子机制 | 感染cagA阳性幽门螺杆菌的胃黏膜主细胞 | 分子生物学 | 胃癌前病变 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 244 | 2026-05-17 |
Control of Cellular Differentiation Trajectories for Cancer Reversion
2025-01, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202402132
PMID:39661721
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研究论文 | 提出了单细胞布尔网络推断和控制框架BENEIN，用于识别细胞分化轨迹中的主调控因子，并验证了其通过抑制MYB、HDAC2和FOXA2诱导结直肠癌细胞向正常样肠细胞逆转的能力 | 首次将布尔网络控制理论应用于单细胞转录组数据，系统识别分化轨迹中的主调控因子，并实现癌症逆转 | 方法的普适性需在更多组织类型和癌症类型中验证，且实验验证仅限于结直肠癌模型 | 开发计算框架以识别细胞分化轨迹中的主调控因子，并探索通过调控这些因子实现癌症逆转的可能性 | 人小肠单细胞转录组数据及结直肠癌细胞 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 布尔网络 | 基因表达数据 | 人小肠单细胞转录组数据（样本量未明确） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 245 | 2026-05-17 |
Dissecting tumor transcriptional heterogeneity from single-cell RNA-seq data by generalized binary covariance decomposition
2025-Jan, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01997-z
PMID:39747597
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研究论文 | 通过广义二元协方差分解从单细胞RNA测序数据中解析肿瘤转录异质性 | 提出一种新的统计方法广义二元协方差分解（GBCD），能够在强肿瘤间异质性背景下将转录异质性分解为患者特异性、数据集特异性和疾病亚型相关的共享成分，优于现有方法 | 主要依赖胰腺导管腺癌数据验证，方法在其他癌症类型中的通用性尚需进一步评估 | 开发一种统计方法来解析单细胞RNA测序数据中肿瘤转录异质性的可解释成分 | 胰腺导管腺癌肿瘤样本的转录组数据 | 机器学习 | 胰腺导管腺癌 | 单细胞RNA测序 | 广义二元协方差分解 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 246 | 2026-05-17 |
Refining breast cancer genetic risk and biology through multi-ancestry fine-mapping analyses of 192 risk regions
2025-Jan, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-02031-y
PMID:39753771
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研究论文 | 通过多祖先精细定位分析192个风险区域，细化乳腺癌遗传风险与生物学机制 | 首次对已知乳腺癌风险位点进行大规模多祖先精细定位，识别332个独立关联信号（其中131个为新发现），并将50个信号的可信因果变异缩小至单个变异，结合功能基因组学数据鉴定195个潜在易感基因 | 未提及具体局限性 | 精细定位所有已知乳腺癌遗传风险位点，识别因果变异和靶基因 | 女性乳腺癌病例和对照 | 机器学习 | 乳腺癌 | 全基因组关联分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 172,737例女性乳腺癌病例和242,009例对照 | NA | NA | NA | NA |
| 247 | 2026-05-17 |
Blood DNA virome associates with autoimmune diseases and COVID-19
2025-Jan, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-02022-z
PMID:39753770
|
研究论文 | 通过分析6321名日本个体的全基因组测序数据，系统评估了血液DNA病毒组（内源性HHV-6和指环病毒）与自身免疫性疾病及COVID-19的关联 | 首次在人群尺度上系统揭示内源性HHV-6B整合与系统性红斑狼疮及肺泡蛋白沉积症的因果关系，并通过GWAS和长读长测序精确定位整合位点 | 研究人群仅限于日本个体，可能限制结论的普适性；未对病毒组与疾病间的因果机制进行深入验证 | 探究人类血液DNA病毒组（内源性HHV-6和指环病毒）与自身免疫性疾病及COVID-19的病理关联 | 6321名日本个体的全基因组测序数据，包括自身免疫性疾病（银屑病、类风湿关节炎、系统性红斑狼疮、肺泡蛋白沉积症、多发性硬化）和COVID-19患者及健康对照 | 数字病理学 | 自身免疫性疾病、COVID-19 | 全基因组测序、长读长测序、单细胞RNA测序、GWAS、表位作图 | NA | DNA序列、单细胞转录组 | 6321名日本个体 | NA | NA | NA | NA |
| 248 | 2026-05-16 |
Spatial and Single-Cell Transcriptomics Unraveled Spatial Evolution of Papillary Thyroid Cancer
2025-01, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202404491
PMID:39540244
|
研究论文 | 整合单细胞RNA测序和空间转录组学，揭示甲状腺乳头状癌的空间演化机制 | 首次结合单细胞RNA测序与空间转录组学解析甲状腺乳头状癌的空间异质性和演化路径，发现肿瘤细胞通过增强有氧代谢、抑制mRNA翻译及蛋白质合成、以及细胞间相互作用驱动多路径演化，并识别出恶性与转移基因足迹 | 单细胞RNA测序丢失空间信息，空间转录组学分辨率有限，可能遗漏稀有细胞亚型；需要更大样本验证足迹的诊断价值 | 阐释甲状腺乳头状癌的空间异质性、恶性进展和转移机制，提出改进的诊断策略 | 甲状腺乳头状癌肿瘤细胞及其正常甲状腺细胞 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 249 | 2026-05-15 |
Tertiary Lymphoid Structure in Dental Pulp: The Role in Combating Bacterial Infections
2025-01, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202406684
PMID:39465672
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和多重免疫荧光染色揭示了人类牙髓中三级淋巴结构（TLS）在对抗细菌感染中的作用 | 首次在牙髓中发现三级淋巴结构，并鉴定出CCL3可能为TLS形成的关键驱动因子 | TLS在免疫反应中的具体角色及其形成调控分子仍不完全确定 | 研究牙髓中三级淋巴结构在抗细菌感染免疫反应中的形成和功能 | 健康和发炎的人类牙髓组织以及小鼠牙髓炎模型 | 数字病理学 | 牙髓炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类牙髓组织（健康与发炎）和小鼠牙髓炎模型样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于人类牙髓样本的单细胞分析 |
| 250 | 2026-05-15 |
Targeting SLITRK4 Restrains Proliferation and Liver Metastasis in Colorectal Cancer via Regulating PI3K/AKT/NFκB Pathway and Tumor-Associated Macrophage
2025-01, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202400367
PMID:39499724
|
研究论文 | 该研究通过分析结直肠癌患者原发癌旁组织、肿瘤和肝转移灶的转录组，发现SLITRK4是肝转移中上调最显著的基因，并通过体外和体内实验证实其促进肿瘤发生、侵袭、迁移和血管生成，抑制SLITRK4可抑制肿瘤生长和肝转移，机制涉及PI3K/AKT/NFκB通路激活及肿瘤相关巨噬细胞浸润和极化 | 首次发现SLITRK4在结直肠癌肝转移中高表达并通过调控PI3K/AKT/NFκB通路和肿瘤相关巨噬细胞促进转移，并利用脂质聚合物杂化纳米颗粒递送siRNA实现靶向治疗 | 未提及具体局限性 | 探索结直肠癌肝转移的新型驱动因子SLITRK4的功能及潜在治疗靶点 | 结直肠癌患者原发癌旁组织、肿瘤组织和肝转移组织，以及体外细胞模型和体内小鼠模型 | 机器学习 | 结直肠癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据, 单细胞转录组数据 | 人类患者组织样本（原发癌旁、肿瘤和肝转移）和小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 用于单细胞RNA测序 |
| 251 | 2026-05-15 |
Identifying Multiomic Signatures of X-Linked Retinoschisis-Derived Retinal Organoids and Mice Harboring Patient-Specific Mutation Using Spatiotemporal Single-Cell Transcriptomics
2025-01, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202405818
PMID:39503290
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研究论文 | 本研究采用多组学方法，结合单细胞RNA测序和时空转录组学，识别由患者特异性突变引起的X连锁视网膜劈裂症衍生视网膜类器官和小鼠的多组学特征 | 首次利用多模态方法（高吞吐量单细胞RNA测序和时空转录组学）在两种XLRS样模型（基因工程小鼠和患者衍生视网膜类器官）中全面解析疾病特异性转录组特征，并发现慢性内质网应激/eIF2信号通路作为保守疾病通路，为治疗提供新靶点 | 未明确说明研究局限性 | 阐明X连锁视网膜劈裂症（XLRS）的转录组特征和病理机制，探索潜在治疗靶点 | 携带患者特异性p.R209C突变的基因工程Rs1小鼠和患者衍生视网膜类器官 | 数字病理学 | X连锁视网膜劈裂症 | 单细胞RNA测序, 时空转录组学, 蛋白质组学, Western印迹 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 蛋白质组数据 | 基因工程Rs1小鼠和患者衍生视网膜类器官（具体数量未提供） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium Single Cell 3'用于单细胞RNA测序，10x Visium用于空间转录组学 |
| 252 | 2026-05-15 |
PD-1+CD8+ T Cell-Mediated Hepatocyte Pyroptosis Promotes Progression of Murine Autoimmune Liver Disease
2025-01, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202407284
PMID:39494472
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和体外实验，揭示了PD-1+CD8+ T细胞通过颗粒酶B和穿孔素-1诱导肝细胞焦亡，促进自身免疫性肝病进展的机制 | 首次发现PD-1+CD8+ T细胞亚群在自身免疫性肝病中通过GSDMD介导的焦亡途径发挥致病作用，并证明CAR-T细胞清除该细胞群可缓解疾病 | 研究主要基于小鼠模型，结果向人类疾病的转化需要进一步验证；焦亡通路的详细分子机制尚未完全阐明 | 阐明自身免疫性肝病中效应通路的特异性机制，寻找潜在治疗靶点 | dnTGFβRII Aire小鼠模型中的肝脏自身反应性CD8 T细胞及肝细胞 | 数字病理学 | 自身免疫性肝病 | NGS, 单细胞测序, 体外分析 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞测序平台 |
| 253 | 2026-05-15 |
Landscape of the Peripheral Immune Response Induced by Intraoperative Radiotherapy Combined with Surgery in Early Breast Cancer Patients
2025-01, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202308174
PMID:39494578
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和T细胞受体测序，分析早期乳腺癌患者术中放疗联合手术后的外周免疫反应 | 首次全面分析术中放疗联合手术诱导的外周免疫反应，揭示了CD8Teff_GZMK细胞毒性增加、MIF信号通路变化及T细胞克隆扩增等新发现 | 研究样本量较小，且仅关注早期乳腺癌患者，缺乏长期随访数据 | 探究术中放疗联合手术对早期乳腺癌患者外周免疫细胞的影响 | 早期乳腺癌患者的外周血单个核细胞 | 自然语言处理 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序, 流式细胞术, 共培养实验 | NA | 基因表达数据 | 早期乳腺癌患者的外周血样本，具体数量未在摘要中说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 用于单细胞RNA测序和单细胞T细胞受体测序 |
| 254 | 2026-05-12 |
SpatialSNV: A novel method for identifying and analyzing spatially resolved SNVs in tumor microenvironments
2025-01-06, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giaf065
PMID:40515555
|
研究论文 | 开发了一种名为SpatialSNV的新方法，用于识别和分析肿瘤微环境中空间分辨的单核苷酸变异 | 首次利用多种空间转录组平台识别肿瘤切片中的有效SNV，揭示SNV反映区域肿瘤进化轨迹并超越RNA表达变化，发现肿瘤边缘具有独特突变谱，且新SNV随距离递减 | 未明确指出局限性 | 理解肿瘤微环境中SNV的动态及其对肿瘤免疫串扰的影响，并识别潜在治疗靶点 | 肿瘤组织切片中的单核苷酸变异 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | 多种空间转录组平台 | NA |
| 255 | 2026-05-12 |
SeuratExtend: streamlining single-cell RNA-seq analysis through an integrated and intuitive framework
2025-01-06, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giaf076
PMID:40627366
|
研究论文 | SeuratExtend是一个基于Seurat框架的R包，通过集成多种工具和数据库，简化单细胞RNA-seq数据分析流程 | 通过统一R接口集成多个流行Python工具（如scVelo、Palantir、SCENIC），并引入通路水平分析和簇注释的新应用 | 未提及具体局限性 | 为scRNA-seq数据提供集成、直观且用户友好的分析框架 | 肿瘤相关高内皮小静脉和自身炎症性疾病的scRNA-seq数据 | 机器学习 | 癌症, 自身炎症性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 256 | 2026-05-12 |
A framework to mine laser microdissection-based omics data and uncover regulators of pancreatic cancer heterogeneity
2025-01-06, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giaf101
PMID:40910795
|
研究论文 | 提出并验证了一个优化框架，用于对激光显微切割获取的多个空间分辨肿瘤区域进行RNA测序，以揭示胰腺导管腺癌的异质性及其调控机制 | 开发了LMD-seq优化框架，提高了检测低表达基因的灵敏度，优于单细胞RNA-seq方法，特别在识别稀有肿瘤细胞群体和低表达转录程序方面 | 未在标题和摘要中明确说明研究的局限性 | 挖掘基于激光显微切割的组学数据，揭示胰腺癌异质性的调控因子 | 胰腺导管腺癌的多个空间分辨肿瘤区域 | 机器学习 | 胰腺癌 | RNA测序 | NA | 测序数据 | 未在标题和摘要中明确说明样本数量 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 多个空间分辨激光显微切割肿瘤区域的RNA测序 |
| 257 | 2026-05-12 |
AEnet: a practical tool to construct the splicing-associated phenotype atlas at a single cell level
2025-01-06, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giaf110
PMID:40990037
|
research paper | AEnet是一种结合基因表达与可变剪接模式的新型方法，用于在单细胞水平构建剪接相关表型图谱 | 首次将基因表达水平与可变剪接模式整合，提出'细胞亚群'新概念，并识别关键剪接事件及其调控机制 | 单细胞测序数据存在测序深度浅、高丢失率和批次效应等固有局限性 | 开发AEnet工具以剖析细胞异质性并定义细胞亚群 | 肿瘤细胞、泛癌免疫细胞和胚胎细胞 | machine learning | cancer | scRNA-seq | AEnet | gene expression profiles and splicing patterns | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 258 | 2026-05-12 |
GTestimate: improving relative gene expression estimation in scRNA-seq using the Good-Turing estimator
2025-01-06, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giaf084
PMID:41159548
|
研究论文 | 提出了基于Good-Turing估计器的GTestimate方法，改进了scRNA-seq中相对基因表达估计并开发了验证方法cta-seq | 首次将Good-Turing估计器应用于单细胞RNA-seq数据标准化，解决传统方法忽略未观测基因的问题，并开发了细胞靶向PCR扩增方法cta-seq进行验证 | 未提及具体局限性，但依赖Seurat工作流可能限制了与其他工具的兼容性 | 改进单细胞RNA-seq数据中相对基因表达估计的准确性 | 单细胞RNA-seq数据中的相对基因表达估计 | 机器学习 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, PCR扩增 | Good-Turing估计器 | 基因表达数据 | 4个示例数据集 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 259 | 2026-05-12 |
Unsupervised multiscale clustering of single-cell transcriptomes to identify hierarchical structures of cell subtypes
2025-01-06, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giaf111
PMID:41066207
|
研究论文 | 开发一种无监督多尺度聚类方法MSC，用于从单细胞转录组数据中识别细胞亚型的层次结构 | 提出多尺度聚类方法MSC，通过构建稀疏细胞-细胞关联网络，能够在多个分辨率下无监督识别新的细胞类型和亚型，并揭示有生物学意义的细胞层次结构 | 未在摘要中明确提及局限性 | 开发一种能够更精细解析单细胞RNA测序数据中细胞层次结构的无监督聚类方法 | 模拟银标准、金标准数据以及真实疾病单细胞RNA测序数据中的细胞群体 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | MSC（多尺度聚类） | 单细胞转录组数据 | NA（未明确样本数量） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 260 | 2026-05-12 |
Microglia phagocytosis of PNNs mediates PV-positive interneuron dysfunction and associated gamma oscillations in neuroinflammation-induced cognitive impairment in mice
2025-01-01, Neuropharmacology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.neuropharm.2024.110205
PMID:39489286
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研究论文 | 研究揭示小胶质细胞吞噬周神经网介导PV阳性中间神经元功能障碍及γ振荡在神经炎症诱导的小鼠认知损伤中的作用 | 首次发现小胶质细胞通过ApoE介导的周神经网吞噬作用导致PV阳性中间神经元功能障碍和γ振荡异常，从而引发认知损伤，并通过抑制ApoE或过表达Hapln1改善损伤 | 研究仅使用小鼠模型，未在人类样本中验证；长期神经炎症的影响未评估 | 探讨神经炎症引起认知损伤中周神经网与ApoE的关联机制 | C57BL/6J小鼠和CX3CR1-CreERT2小鼠 | 数字病理学 | 认知障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |