单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
221	2025-06-06	JARID1D-dependent androgen receptor and JunD signaling activation of osteoclast differentiation inhibits prostate cancer bone metastasis through demethylating H3K4 2025, Theranostics IF:12.4Q1 DOI:10.7150/thno.104135 PMID:39816691	research paper	该研究揭示了JARID1D通过去甲基化H3K4调控雄激素受体和JunD信号通路，抑制前列腺癌骨转移的机制	首次发现JARID1D通过H3K4me3去甲基化活性动态调控AR表达，并揭示其通过MAOA-RANKL通路影响破骨细胞分化的新机制	研究主要基于小鼠模型，尚未在人体临床试验中验证	探究前列腺癌骨转移的表观遗传调控机制	前列腺癌细胞和骨转移过程	肿瘤生物学	前列腺癌	ChIP, 免疫荧光, western blotting, 单细胞测序	小鼠模型	分子生物学数据	NA
222	2025-06-06	Study on DNA Damage Gene in Spermatogonial Stem Cells from Idiopathic Nonobstructive Azoospermia: A Bioinformatics Investigation Based on scRNA-seq Data 2025, Cytogenetic and genome research IF:1.7Q3 DOI:10.1159/000545275 PMID:40101697	研究论文	基于scRNA-seq数据，研究特发性非梗阻性无精子症中精原干细胞DNA损伤基因的生物信息学分析	揭示了睾丸微环境和DNA损伤在调控人类精原干细胞中的可预测机制，并提出了男性不育的潜在治疗靶点	需要进一步研究以确认预测的潜在机制、通路和治疗靶点	探究DNA损伤与男性不育之间的关系，特别是精原干细胞的基因组稳定性机制	特发性非梗阻性无精子症（NOA）和正常睾丸的精原干细胞	生物信息学	男性不育	scRNA-seq, WGCNA分析, LASSO回归, MNC计算算法	NA	单细胞RNA测序数据	特发性非梗阻性无精子症和正常睾丸的scRNA-seq数据集
223	2025-06-06	Bulk and single-cell RNA-sequencing analyses revealed potential key genes and the role of CCL19/CCL21-CCR7 axis in hidradenitis suppurativa 2025, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0322565 PMID:40455785	研究论文	通过批量RNA测序和单细胞RNA测序分析，揭示了化脓性汗腺炎(HS)中潜在的关键基因及CCL19/CCL21-CCR7轴的作用	整合三种机器学习方法并验证独立数据集，成功鉴定出AKR1B10、IGFL2、WNK2、SLAMF7和CCR7作为HS治疗的潜在枢纽基因和治疗靶点	NA	识别HS病变和周围血中的关键基因表达模式、枢纽基因，并分析CCL19/CCL21-CCR7轴的潜在作用	化脓性汗腺炎(HS)病变和周围血	生物信息学	化脓性汗腺炎	批量RNA测序, 单细胞RNA测序	机器学习	RNA测序数据	NA
224	2025-06-06	Targeting myeloid cells in pancreatic ductal adenocarcinoma: from primary tumors to liver metastasis 2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2025.1555036 PMID:40458409	综述	本文探讨了胰腺导管腺癌（PDAC）中原发肿瘤和肝转移中髓系细胞的靶向治疗策略	重点分析了PDAC不同阶段（原发肿瘤、转移前微环境和转移部位）的免疫抑制机制，并探讨了靶向髓系细胞的创新治疗策略	临床数据主要来自晚期疾病患者，与临床前研究主要关注原发肿瘤的情况存在差异	研究PDAC中髓系细胞在肿瘤微环境中的作用及靶向治疗策略	胰腺导管腺癌（PDAC）的原发肿瘤和肝转移	肿瘤免疫学	胰腺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组学	NA	NA	NA
225	2025-06-06	CX3CR1+ Monocytes/Macrophages Promote Regional Immune Injury in Mesangial Proliferative Glomerulonephritis through Crosstalk with Activated Mesangial Cells 2025, Research (Washington, D.C.) DOI:10.34133/research.0716 PMID:40458609	研究论文	本研究探讨了CX3CR1+单核细胞/巨噬细胞通过与激活的系膜细胞相互作用促进系膜增生性肾小球肾炎（MsPGN）区域免疫损伤的机制	揭示了CX3CL1-CX3CR1轴作为MsPGN治疗新靶点的证据，并验证了CX3CL1单克隆抗体quetmolimab的治疗效果	研究主要基于动物模型和临床标本，尚未进行大规模临床试验	探究MsPGN区域免疫损伤的机制并寻找潜在治疗靶点	系膜增生性肾小球肾炎（MsPGN）患者和动物模型	免疫学	肾小球肾炎	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、细胞通讯分析（cellchat analysis）、RNA-seq、Luminex多重免疫分析	动物模型	基因表达数据、蛋白质数据	临床标本和MsPGN动物模型
226	2025-06-06	CD151 Promotes Cancer Progression in Triple-Negative Breast Cancer by Inducing EMT through the MAPK Signaling Pathway 2025, Breast cancer (Dove Medical Press) DOI:10.2147/BCTT.S518760 PMID:40458675	研究论文	本研究探讨了CD151在三阴性乳腺癌（TNBC）中通过MAPK信号通路诱导上皮间质转化（EMT）从而促进癌症进展的机制	揭示了CD151通过与整合素α3β1结合激活MAPK信号通路进而诱导EMT的新机制	研究主要基于体外实验和临床样本分析，缺乏体内动物模型的验证	阐明CD151在TNBC中的促肿瘤作用及其分子机制	TNBC临床样本和细胞系	肿瘤生物学	乳腺癌	免疫组织化学、Western blotting、RNA干扰、单细胞RNA测序、免疫共沉淀	NA	蛋白质表达数据、基因表达数据	TNBC临床样本和细胞系（具体数量未明确说明）
227	2025-06-06	Cellular Heterogeneity and IL-17 Pathway Dynamics Reveal Insights into the Transition from Ulcerative Colitis to Colorectal Cancer Through scRNA-Seq Analysis 2025, Journal of inflammation research IF:4.2Q2 DOI:10.2147/JIR.S505313 PMID:40458692	research paper	通过单细胞RNA测序分析揭示了从溃疡性结肠炎到结直肠癌转变过程中的细胞异质性和IL-17通路动态	揭示了IL-17信号通路、Treg细胞扩增和C-MYC激活在疾病进展中的潜在作用	样本量较小，仅包括一名患者的组织样本	研究溃疡性结肠炎（UC）向结直肠癌（CACRC）转变过程中的分子和细胞变化	UC和CACRC患者的组织样本	digital pathology	colorectal cancer	scRNA-seq	NA	RNA-seq数据	一名患者的正常结肠、UC病变组织和CACRC组织样本
228	2025-06-06	[Donor T cell exhaustion and immune tolerance after allogeneic hematopoietic cell transplantation] 2025, [Rinsho ketsueki] The Japanese journal of clinical hematology DOI:10.11406/rinketsu.66.339 PMID:40467463	研究论文	本文探讨了同种异体造血细胞移植后供体T细胞耗竭与免疫耐受的机制	通过单细胞RNA测序发现钙调磷酸酶抑制剂（CNIs）抑制供体T细胞耗竭，同时诱导效应样耗竭T细胞，这些细胞在慢性GVHD发展中起关键作用	目前主要基于小鼠HCT模型，患者样本数据仍在积累和分析中	研究同种异体造血细胞移植后慢性GVHD的预防机制	供体T细胞	免疫学	血液系统恶性肿瘤	单细胞RNA测序	小鼠HCT模型	RNA测序数据	小鼠模型数据，患者样本数据正在积累
229	2025-06-05	Single-cell profiling transcriptomic reveals cellular heterogeneity and cellular crosstalk in breast cancer lymphatic node, bone, and brain metastases 2025-01-17, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-85531-z PMID:39820531	research paper	该研究通过单细胞转录组分析揭示了乳腺癌淋巴结、骨和脑转移的细胞异质性和细胞间通讯	首次在单细胞水平上比较了原发性乳腺癌与淋巴结、骨和脑转移的差异，并鉴定了与转移相关的恶性上皮细胞亚群和癌症相关成纤维细胞(pCAFs)的作用	样本量较小(原发性乳腺癌n=4，淋巴结转移n=4，脑转移n=3，骨转移n=2)，且数据来源于公共数据库	探究乳腺癌转移至淋巴结、骨和脑的潜在细胞起源和驱动因素	乳腺癌原发灶及淋巴结、骨和脑转移灶的细胞组成	digital pathology	breast cancer	single-cell sequencing, InferCNV算法, CellChat包, 基因集变异分析, 免疫组化染色, 多光谱免疫组化染色	NA	单细胞转录组数据	原发性乳腺癌(n=4)、淋巴结转移(n=4)、脑转移(n=3)和骨转移(n=2)样本
230	2025-06-05	Integrative genetics and multiomics analysis reveal mechanisms and therapeutic targets in vitiligo highlighting JAK STAT pathway regulation of CTSS 2025-01-17, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-86134-4 PMID:39824912	研究论文	该研究通过整合多组学数据，揭示了白癜风发病的遗传和分子机制，并探索了JAK/STAT通路对潜在治疗靶点CTSS的调控作用	整合GWAS、pQTL、eQTL、微阵列和单细胞RNA-seq等多组学数据，首次系统阐明JAK/STAT通路通过调控CTSS参与黑素细胞抗原处理的分子机制	需要进一步实验验证CTSS及相关基因的治疗潜力	阐明白癜风发病机制并寻找潜在治疗靶点	白癜风患者血液和皮肤病变组织	多组学分析	白癜风	GWAS-meta分析、pQTL/eQTL分析、微阵列、单细胞RNA-seq、分子对接	NA	基因组数据、转录组数据、蛋白质组数据	未明确说明样本量（包含GWAS荟萃分析、微阵列和单细胞测序数据）
231	2025-06-05	Big data analytics and scRNA-seq in human aortic aneurysms and dissections: role of endothelial MerTK 2025, Theranostics IF:12.4Q1 DOI:10.7150/thno.103851 PMID:39744231	研究论文	本研究探讨了内皮MerTK在升主动脉瘤和夹层(AAAD)进展中的作用，通过单细胞RNA测序和大数据分析揭示了其机制	首次揭示了内皮MerTK表达抑制在AAAD中的关键作用及其通过影响内皮功能和SMC表型变化促进AAAD发展的新机制	研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本，需要进一步在更大规模的人类队列中验证	阐明内皮MerTK在AAAD发病机制中的作用	升主动脉瘤和夹层(AAAD)患者样本和内皮细胞特异性MerTK缺陷小鼠模型	生物医学研究	心血管疾病	scRNA-seq, RNA-seq, 大数据分析	小鼠基因缺陷模型	基因表达数据	约600,000个交叉分析数据点和小鼠模型
232	2025-06-05	PIM1 instigates endothelial-to-mesenchymal transition to aggravate atherosclerosis 2025, Theranostics IF:12.4Q1 DOI:10.7150/thno.102597 PMID:39744686	研究论文	本文探讨了PIM1在动脉粥样硬化中通过促进内皮-间质转化（EndMT）加剧疾病进程的机制	揭示了PIM1/P-NDRG1(S330)/PTBP1/EndMT轴在动脉粥样硬化中的关键作用，并提出了小分子Max-40279作为潜在治疗策略	研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限	探究PIM1在动脉粥样硬化中促进EndMT的分子机制	内皮细胞、小鼠动脉粥样硬化模型、人类动脉粥样硬化病变组织	心血管疾病	动脉粥样硬化	单细胞测序、定量PCR、Western blotting、免疫组化、免疫共沉淀、H&E染色、油红O染色、Masson三色染色	小鼠动脉粥样硬化模型	基因表达数据、蛋白质数据、组织病理学图像	高脂饮食喂养不同时间的小鼠动脉粥样硬化斑块、人类和小鼠动脉粥样硬化病变组织
233	2025-06-05	Single-Cell RNA Sequencing before and after Light Chain Escape Reveals Intrapatient Multiple Myeloma Subpopulations with Divergent Osteolytic Gene Expression 2025-01-01, Cancer research communications IF:2.0Q3 DOI:10.1158/2767-9764.CRC-24-0170 PMID:39699274	研究论文	通过单细胞RNA测序技术研究多发性骨髓瘤患者在轻链逃逸前后的肿瘤亚群差异及其与溶骨性基因表达的关系	首次使用scRNA-seq技术追踪多发性骨髓瘤患者轻链逃逸现象，揭示了LAMP5过表达与溶骨性病变风险的新关联	研究样本仅来自单一患者，需要在更大队列中验证发现	探究多发性骨髓瘤中轻链逃逸现象的分子机制及其临床意义	多发性骨髓瘤患者的骨髓活检样本	数字病理学	多发性骨髓瘤	单细胞RNA测序(scRNA-seq)，体外药物敏感性测试	NA	RNA测序数据	1名患者的多个时间点骨髓活检样本(诊断时、首次复发、复发/难治阶段)
234	2025-06-05	Research Trends and Dynamics in Single-cell RNA Sequencing for Musculoskeletal Diseases: A Scientometric and Visualization Study 2025, International journal of medical sciences IF:3.2Q1 DOI:10.7150/ijms.104697 PMID:39898252	研究论文	本文通过科学计量和可视化分析，综述了过去15年单细胞RNA测序（scRNA-seq）在肌肉骨骼疾病（MSK）研究中的应用进展	首次对scRNA-seq在MSK疾病研究中的应用趋势进行全面的科学计量和可视化分析，揭示了主要研究方向和未来前景	仅基于Web of Science Core Collection的数据，可能未涵盖所有相关研究	分析scRNA-seq在MSK疾病研究中的发展趋势和关键研究方向	肌肉骨骼疾病（MSK）	生物信息学	肌肉骨骼疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	文献数据	Web of Science Core Collection中2009年1月1日至2024年9月6日的相关文献
235	2025-06-04	Meta-analyses of mouse and human prostate single-cell transcriptomes reveal widespread epithelial plasticity in tissue regression, regeneration, and cancer 2025-Jan-17, Genome medicine IF:10.4Q1 DOI:10.1186/s13073-025-01432-w PMID:39825401	meta-analysis	通过小鼠和人类前列腺单细胞转录组的荟萃分析，揭示了组织退化、再生和癌症中广泛的上皮细胞可塑性	利用随机矩阵理论去噪数据集，建立了正常小鼠和人类前列腺的参考细胞类型分类，并使用最优传输比较了跨物种上皮细胞群的转录组相似性	研究主要基于单细胞转录组数据，可能未涵盖所有细胞状态和功能的复杂性	研究前列腺上皮细胞状态在组织稳态、肿瘤起始和进展中的动态变化	小鼠和人类前列腺组织	digital pathology	prostate cancer	scRNA-seq	NA	transcriptomic data	多个已发表和新生成的小鼠和人类前列腺scRNA-seq数据集
236	2025-06-04	Low fucosylation defines the glycocalyx of progenitor cells and melanocytes in the human limbal stem cell niche 2025-01-14, Stem cell reports IF:5.9Q2 DOI:10.1016/j.stemcr.2024.11.008 PMID:39706176	研究论文	本研究揭示了人类角膜缘干细胞微环境中前体细胞和黑色素细胞糖萼的低岩藻糖基化特征及其在干细胞自我更新和分化中的调控作用	首次发现角膜缘上皮前体细胞和黑色素细胞表面呈现低AAL结合特性，并证实岩藻糖基化调控对体外培养角膜缘上皮细胞增殖潜能的影响	研究主要基于体外实验，尚未在体内模型中验证岩藻糖基化调控的生理意义	探究成人干细胞糖萼的独特组成及其在干细胞功能调控中的作用	人类角膜缘、毛囊上皮和睑板腺导管的分层上皮基底细胞	干细胞生物学	眼科疾病	荧光激活细胞分选术（FACS）结合单细胞转录组学	NA	单细胞转录组数据	人类角膜缘、毛囊和睑板腺组织样本
237	2025-06-04	Omics based technology application in poultry meat research 2025-Jan, Poultry science IF:3.8Q1 DOI:10.1016/j.psj.2024.104643 PMID:39662255	研究论文	本文探讨了组学技术在禽肉研究中的应用，包括基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学和脂质组学，旨在全面了解禽肉品质问题	综合运用多种组学技术和生物信息学方法，深入解析禽肉品质的分子机制，特别是针对鸡胸肌病变的研究	NA	提高禽肉产品的质量和组成	禽肉（特别是鸡肉）的品质和鸡胸肌病变	生物信息学	禽类疾病	基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、脂质组学、质谱分析	NA	分子生物学数据	NA
238	2025-06-04	A novel Tc17 population recruited by tumor cells promotes tumor progression in gastric cancer 2025, Frontiers in oncology IF:3.5Q2 DOI:10.3389/fonc.2025.1592328 PMID:40452847	研究论文	本文研究了胃癌微环境中Tc17细胞的作用及其与肿瘤细胞的相互作用	首次揭示了Tc17细胞在胃癌中的免疫抑制作用及其通过CXCL16-CXCR6轴被肿瘤细胞招募的机制	研究主要基于体外实验，需要进一步的体内实验验证	探索Tc17细胞在胃癌微环境中的角色及其对肿瘤进展的影响	胃癌微环境中的Tc17细胞	肿瘤免疫学	胃癌	单细胞测序、空间转录组学、多色免疫组化染色、SCENIC分析、伪时间分析、细胞间相互作用分析	NA	单细胞测序数据、空间转录组数据	65个胃癌样本的296,879个细胞和10个胃癌样本的空间转录组数据
239	2025-06-04	Metabolic reprogramming signature predicts prognosis and immune landscape in small cell lung cancer: MOCS2 validation and implications for personalized therapy 2025, Frontiers in molecular biosciences IF:3.9Q2 DOI:10.3389/fmolb.2025.1592888 PMID:40452920	研究论文	本研究通过多组学分析揭示了小细胞肺癌(SCLC)中代谢重编程的特征，并开发了一个基于梯度提升机的预后模型，验证了MOCS2在SCLC细胞生物学中的关键作用	首次通过单细胞RNA测序和多组学分析揭示了SCLC中化疗耐药与敏感样本间的代谢重编程差异，并建立了基于代谢特征的预后模型	研究主要基于公共数据集，需要进一步临床样本验证	探索代谢重编程在小细胞肺癌预后和免疫特征中的作用，并开发个性化治疗策略	小细胞肺癌患者样本和细胞系	数字病理学	肺癌	单细胞RNA测序，bulk RNA测序，WGCNA分析	GBM(梯度提升机)	RNA测序数据	来自GSE60052和cBioportal队列的批量RNA测序数据，以及未明确数量的单细胞RNA测序样本
240	2025-06-04	Single-Cell Analysis Reveals Aspirin Restores Intervertebral Disc Integrity via Ferroptosis Regulation 2025, Journal of inflammation research IF:4.2Q2 DOI:10.2147/JIR.S519218 PMID:40453974	研究论文	通过单细胞分析揭示阿司匹林通过调节铁死亡恢复椎间盘完整性	首次使用单细胞RNA测序技术揭示椎间盘退变中的细胞异质性，并发现阿司匹林通过靶向GPX4抑制铁死亡的治疗潜力	研究仅基于四个独立的单细胞测序数据集，样本量可能有限	探索椎间盘退变的分子机制及阿司匹林的治疗效果	椎间盘髓核细胞（NPC）亚群	数字病理学	椎间盘退变	单细胞RNA测序	Harmony算法	单细胞测序数据	四个独立的单细胞测序数据集