单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1329 篇文献，本页显示第 201 - 220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2025-06-08 |
Ferroptosis in idiopathic pulmonary fibrosis: mechanisms, impact, and therapeutic opportunities
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1567994
PMID:40469306
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综述 | 本文综述了铁死亡在特发性肺纤维化(IPF)中的机制、影响及治疗机会 | 整合了铁死亡生物学的最新进展，提出了针对IPF的精准抗纤维化治疗新方向 | IPF的确切病因仍不明确，铁死亡在其中的具体作用机制有待进一步研究 | 探讨铁死亡在IPF发病机制中的作用及潜在治疗策略 | 特发性肺纤维化(IPF)及其相关细胞类型(肺泡上皮细胞、巨噬细胞、成纤维细胞等) | 病理学 | 肺纤维化 | scRNA-seq | NA | NA | NA |
| 202 | 2025-06-08 |
Toward precision oncology in LUAD: a prognostic model using single-cell sequencing and WGCNA based on a disulfidptosis relative gene signature
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1581915
PMID:40469299
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研究论文 | 本研究旨在利用单细胞测序和WGCNA构建一个基于二硫键凋亡相关基因特征的预后模型，以评估其在肺腺癌（LUAD）中的预后价值 | 首次将二硫键凋亡机制与LUAD预后模型相结合，并发现KCNK1作为潜在治疗靶点 | 研究主要基于生物信息学分析，需要更多实验验证 | 开发肺腺癌预后预测模型并探索新的治疗靶点 | 肺腺癌患者和相关的基因特征 | 数字病理学 | 肺癌 | scRNA-seq, WGCNA, ssGSEA, LASSO回归 | 预后模型 | 基因表达数据 | TCGA LUAD数据集中的样本 |
| 203 | 2025-06-08 |
Exploring the landscape of Parkinson's disease transcriptomics: a quantitative review of research progress and future directions
2025, Frontiers in aging neuroscience
IF:4.1Q2
DOI:10.3389/fnagi.2025.1505374
PMID:40469842
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综述 | 本文通过文献计量分析揭示了帕金森病转录组学领域的研究现状和新兴趋势 | 首次对2011年至2025年帕金森病转录组学研究进行全面文献计量分析，揭示了单细胞和空间转录组学技术进步推动的研究活动激增 | 数据异质性和生物标志物验证高失败率等挑战依然存在 | 探索帕金森病转录组学的研究进展和未来方向 | 帕金森病转录组学相关文献 | 生物信息学 | 帕金森病 | 文献计量分析 | NA | 文献数据 | 208篇研究文章 |
| 204 | 2025-06-08 |
Expression and potential regulatory mechanism of cellular senescence-related genes in Alzheimer's disease based on single-cell and bulk RNA datasets
2025, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2025.1595847
PMID:40470298
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research paper | 本研究通过整合单细胞RNA测序和大规模测序数据，识别了阿尔茨海默病中细胞衰老相关基因的调控枢纽，并探索了潜在的分子机制和治疗靶点 | 首次整合单细胞和批量RNA测序数据，系统分析了AD中细胞衰老相关基因的调控网络，并鉴定了特定细胞亚型中的关键基因 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步的实验验证 | 探索细胞衰老在阿尔茨海默病发病机制中的作用并寻找潜在治疗靶点 | 阿尔茨海默病患者脑组织中的不同细胞亚型 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 未明确说明样本数量，但分析了7种细胞亚型 |
| 205 | 2025-06-08 |
Biological and prognostic insights into the prostaglandin D2 signaling axis in lung adenocarcinoma
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1562261
PMID:40474982
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA数据分析，探索了肺腺癌肿瘤微环境中前列腺素D2信号轴的作用及其预后意义 | 首次在肺腺癌中系统性地研究了前列腺素D2信号轴的细胞间通讯机制及其临床意义 | 研究主要基于计算推断，部分结果需要更多实验验证 | 探索肺腺癌肿瘤微环境中代谢物介导的细胞间通讯机制 | 肺腺癌肿瘤微环境中的细胞类型和代谢物 | 肿瘤微环境 | 肺腺癌 | scRNA-seq, RT-qPCR, 免疫荧光 | MEBOCOST, ESTIMATE, ssGSEA | 单细胞RNA数据, 批量RNA数据 | TCGA-LUAD数据集和两个GEO数据集 |
| 206 | 2025-06-08 |
Single-cell and bulk transcriptome analyses reveal elevated amino acid metabolism promoting tumor-directed immune evasion in colorectal cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1575829
PMID:40475762
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研究论文 | 通过单细胞和批量转录组分析，揭示了结直肠癌中氨基酸代谢升高促进肿瘤导向的免疫逃逸 | 开发了一个基于AUCell算法的氨基酸代谢评分，并构建了一个31基因的AA评分和6基因的风险评分，用于预测PD-1阻断治疗的响应和预后 | 样本量相对较小，仅包括17名接受PD-1阻断治疗的CRC患者和23名CRC患者的独立数据集 | 探究结直肠癌中氨基酸代谢与免疫逃逸的关系，并开发预测预后和药物敏感性的工具 | 结直肠癌患者的肿瘤细胞和肿瘤浸润免疫细胞 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、LASSO和Cox回归分析 | AUCell算法、机器学习 | 转录组数据 | 17名接受PD-1阻断治疗的CRC患者的46,374个上皮细胞和23名CRC患者的独立数据集 |
| 207 | 2025-06-08 |
Expression of PSMD14 in lung adenocarcinoma and its impact on immune cell infiltration and prognosis: a comprehensive analysis based on RNA and single-cell RNA sequencing
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1560693
PMID:40475775
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research paper | 本研究探讨了PSMD14在肺腺癌中的表达及其对免疫细胞浸润和预后的影响 | 首次全面分析了PSMD14在肺腺癌中的表达及其与免疫细胞浸润和患者预后的关系，并整合了RNA-seq和单细胞RNA-seq数据 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证部分有限 | 探索PSMD14在肺腺癌中的表达及其对肿瘤免疫和临床结果的影响 | 肺腺癌患者样本及相关的RNA-seq和单细胞RNA-seq数据 | digital pathology | lung cancer | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 免疫组化 | NA | RNA-seq数据, 单细胞RNA-seq数据, 免疫组化图像 | 肺腺癌患者样本及公开数据集中的RNA-seq和单细胞RNA-seq数据 |
| 208 | 2025-06-08 |
Metabolic profiles in laryngeal cancer defined two distinct molecular subtypes with divergent prognoses
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1512502
PMID:40475768
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research paper | 该研究通过综合分析转录组、突变、甲基化和单细胞RNA测序数据，确定了与代谢相关的喉癌亚型，并开发了预后和诊断模型 | 首次通过多组学数据定义了喉癌的两种代谢相关分子亚型，并开发了高性能的诊断和预后预测模型 | 样本量相对有限（114例），且需要更多独立队列验证模型的普适性 | 探索喉癌的代谢相关分子亚型及其对预后的影响 | 喉癌患者 | digital pathology | laryngeal cancer | 转录组测序, 突变分析, 甲基化分析, 单细胞RNA测序 | LASSO Cox回归, Random Forest算法 | 基因组数据, 转录组数据, 甲基化数据 | 114例喉癌患者（来自TCGA数据库） |
| 209 | 2025-06-08 |
Tumor-infiltrating lymphocytes in cancer immunotherapy: from chemotactic recruitment to translational modeling
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1601773
PMID:40475782
|
综述 | 本文综述了肿瘤浸润淋巴细胞（TILs）在癌症免疫治疗中的作用及其研究进展 | 探讨了TILs的表型和功能多样性，以及其在肿瘤微环境中的动态相互作用，并强调了新兴技术在TIL生物学研究中的应用 | 未提及具体临床应用的局限性 | 探讨TILs在癌症免疫治疗中的作用及其研究进展 | 肿瘤浸润淋巴细胞（TILs）及其在肿瘤微环境中的动态相互作用 | 癌症免疫治疗 | 癌症 | 单细胞测序、新抗原预测、生物材料平台 | 3D肿瘤球体、类器官共培养、同源小鼠模型、人源化系统 | NA | NA |
| 210 | 2025-06-08 |
stGuide advances label transfer in spatial transcriptomics through attention-based supervised graph representation learning
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1566675
PMID:40476268
|
research paper | 本文提出了一种基于注意力机制的监督图学习模型stGuide，用于空间转录组学中的跨切片对齐和高效标签转移 | stGuide利用参考注释引导的监督表示，通过注意力机制将查询切片映射到共享嵌入空间，并通过最近邻信息分配点级标签 | NA | 解决空间转录组学数据中的批次效应、不平衡参考注释和组织异质性等问题，实现高效的标签转移 | 人类背外侧前额叶皮层和乳腺癌数据集 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 注意力机制监督图学习 | attention-based supervised graph learning model | 空间转录组数据 | NA |
| 211 | 2025-06-07 |
Unveiling patterns in spatial transcriptomics data: a novel approach utilizing graph attention autoencoder and multiscale deep subspace clustering network
2025-Jan-06, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giae103
PMID:39804726
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研究论文 | 本文提出了一种名为STMSGAL的新框架，用于分析空间转录组数据，结合了图注意力自编码器和多尺度深度子空间聚类 | STMSGAL框架通过构建细胞类型感知的共享最近邻图(ctaSNN)和使用图注意力自编码器及多尺度深度子空间聚类，显著提高了空间转录组数据的分析能力 | NA | 提高空间转录组数据的分析能力，以更好地理解组织结构和生物功能 | 空间转录组数据 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 空间转录组学(ST) | 图注意力自编码器(Graph Attention Autoencoder), 多尺度深度子空间聚类网络(Multiscale Deep Subspace Clustering Network) | 空间转录组数据 | 4个10x Genomics Visium数据集, 1个小鼠视觉皮层STARmap数据集, 2个Stereo-seq小鼠胚胎数据集 |
| 212 | 2025-06-07 |
Characterisation of macrophages in healthy and diseased livers in mice: identification of necrotic lesion-associated macrophages
2025, eGastroenterology
DOI:10.1136/egastro-2025-100189
PMID:40212045
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研究论文 | 本研究通过多重免疫荧光染色、高级图像分析和单细胞RNA测序技术，对小鼠健康和病变肝脏中的巨噬细胞进行了详细表征 | 发现坏死病变相关巨噬细胞亚群，并揭示其在坏死病灶清除中的关键作用 | 研究仅限于小鼠模型，人类肝脏中的情况可能有所不同 | 探究健康和病变肝脏中巨噬细胞的异质性、空间分布及与其他细胞的相互作用 | 小鼠肝脏中的Kupffer细胞和单核来源巨噬细胞 | 免疫学 | 肝病 | 多重免疫荧光染色、高级图像分析、scRNA-seq | 小鼠模型 | 图像数据、基因表达数据 | 未明确说明样本数量，使用健康和ConA处理的小鼠肝脏 |
| 213 | 2025-06-07 |
Exploring Key Genes of Glutathione Metabolism in Systemic Lupus Erythematosus Based on Mendelian Randomisation, Single-Cell RNA Sequencing and Multiple Machine Learning Approaches
2025 Jan-Dec, IET systems biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1049/syb2.70021
PMID:40458850
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研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化、单细胞RNA测序和多种机器学习方法，探索了谷胱甘肽代谢在系统性红斑狼疮中的关键基因 | 结合多组学整合和多种机器学习模型，揭示了谷胱甘肽代谢通路在系统性红斑狼疮中的关键作用，并识别出LAP3基因的重要贡献 | 研究样本量有限，且未进行实验验证 | 探索系统性红斑狼疮的病因及潜在诊断和治疗靶点 | 系统性红斑狼疮患者及谷胱甘肽代谢相关基因 | 生物信息学 | 系统性红斑狼疮 | 孟德尔随机化、单细胞RNA测序、机器学习 | LASSO回归、CatBoost、XGBoost、NGBoost | 多组学数据、scRNA-seq数据 | 1400种血清代谢物及多个数据集验证 |
| 214 | 2025-06-07 |
Single-cell transcriptomics reveals cellular dynamics and chemokine CXCL2-mediated smooth muscle cell proliferation in arterial repair
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1591557
PMID:40463365
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了动脉修复中的细胞动态变化以及趋化因子CXCL2介导的平滑肌细胞增殖机制 | 识别了一个炎症性平滑肌细胞亚群(SMC2)，该亚群主动分泌趋化因子CXCL2，促进平滑肌细胞增殖并介导损伤后的动脉重塑 | 研究主要基于动物模型，结果在人类中的适用性尚需进一步验证 | 探究PCI术后动脉修复的细胞机制及趋化因子CXCL2的作用 | 股动脉损伤模型中的细胞 | 单细胞转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | NA |
| 215 | 2025-06-07 |
Succinylation-related molecular activities in cancer: metabolic adaptations, immune landscape, and prognostic significance in colorectal cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1571446
PMID:40463370
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research paper | 该研究探讨了琥珀酰化在癌症中的分子活动，特别是其在代谢调节、肿瘤免疫微环境和结直肠癌预后中的作用 | 首次系统性地进行了琥珀酰化相关分子活动的泛癌分析，并构建了一个基于琥珀酰化的预后模型，同时发现了PCED1A在结直肠癌中的潜在治疗靶点作用 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证部分仅限于结直肠癌和PCED1A基因 | 探索琥珀酰化在癌症中的分子机制及其临床意义 | 泛癌样本和结直肠癌特异性样本 | 肿瘤生物学 | 结直肠癌 | 转录组分析、单细胞RNA测序、空间转录组分析、免疫组化、Western blotting | 预后模型 | 转录组数据、单细胞数据、空间转录组数据、蛋白质表达数据 | 来自TCGA、GEO、TISCH等多个数据库的泛癌样本和结直肠癌特异性队列 |
| 216 | 2025-06-07 |
Single-cell RNA sequencing identifies two fibroblast subtypes and a Trem2+ macrophage subtype as the possible specific cellular targets in abdominal aortic aneurysms
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1551308
PMID:40463378
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术，识别出两种成纤维细胞亚型和一个Trem2+巨噬细胞亚型，作为腹主动脉瘤可能的特异性细胞靶点 | 首次在腹主动脉瘤中识别出特定的成纤维细胞亚型和巨噬细胞亚型，并揭示了它们在疾病发展中的协同作用 | 研究仅基于小鼠模型，临床治疗效果尚未验证 | 探究腹主动脉瘤发病机制并寻找新的治疗靶点 | 腹主动脉瘤小鼠模型中的细胞组成和功能表型 | 单细胞测序 | 腹主动脉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 小鼠模型样本（具体数量未提及） |
| 217 | 2025-06-07 |
Single-cell transcriptomics in colorectal cancer uncover the potential of metastasis and immune dysregulation of a cell cluster overexpressed PRSS22
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1586428
PMID:40463392
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research paper | 该研究通过单细胞转录组学技术，在结直肠癌中发现了一个过度表达PRSS22的细胞亚群，该亚群具有转移和免疫失调的潜力 | 发现了一个与结直肠癌进展、免疫失调和预后密切相关的细胞亚群，并确定了PRSS22作为其枢纽基因，具有成为新的免疫治疗靶点的潜力 | 样本量相对较小，仅包括25个结直肠癌和10个相邻正常组织样本 | 探究结直肠癌中肿瘤细胞亚群的特征及其生物学意义，寻找新的免疫治疗靶点 | 结直肠癌组织和相邻正常组织 | digital pathology | colorectal cancer | single-cell RNA sequencing | Boruta feature selection algorithm | RNA-seq | 25个结直肠癌样本和10个相邻正常组织样本 |
| 218 | 2025-06-07 |
Unveiling the Therapeutic Potential of Baicalin in Intervertebral Disc Degeneration: Integrative Bulk and Single-Cell Transcriptome Analysis with Experimental Validation of PANoptosis Inhibition
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S519179
PMID:40463856
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研究论文 | 本文通过整合批量转录组和单细胞RNA-seq分析，结合实验验证，探讨了PANoptosis在椎间盘退变中的作用及黄芩素的治疗潜力 | 首次揭示了PANoptosis在椎间盘退变中的关键作用，并验证了黄芩素通过抑制PANoptosis缓解椎间盘退变的新机制 | 研究主要基于动物模型和体外实验，临床样本验证有限 | 探索PANoptosis在椎间盘退变中的作用及黄芩素的治疗机制 | 椎间盘退变(IVDD)及其相关细胞死亡过程 | 生物医学研究 | 椎间盘退变 | 批量转录组分析、单细胞RNA-seq、体外细胞模型、动物模型 | IL-1β诱导的NPC退变模型、穿刺诱导的大鼠IVDD模型 | 转录组数据、临床样本数据 | 多个公开数据集(GSE167199, GSE245147, GSE266883, GSE244889)及实验样本 |
| 219 | 2025-06-07 |
Depletion of Adipose Stroma-Like Cancer-Associated Fibroblasts Potentiates Pancreatic Cancer Immunotherapy
2025-01-01, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-24-0298
PMID:39620946
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研究论文 | 本研究探讨了表达血小板衍生生长因子受体β（Pdgfrb）和脂肪基质细胞（ASC）标记的癌症相关成纤维细胞（CAF）在胰腺导管腺癌小鼠模型中的作用，并发现靶向ASC样CAF可增强免疫检查点阻断疗法的效果 | 揭示了不同CAF亚群对胰腺癌进展和治疗抵抗的独特影响，特别是ASC样CAF的耗竭可增强免疫检查点阻断疗法的抗肿瘤和抗转移效果 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体临床试验中验证 | 探究CAF亚群在胰腺癌进展和免疫治疗抵抗中的作用，并开发新的联合治疗策略 | 胰腺导管腺癌小鼠模型中的CAF亚群 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | 小鼠胰腺导管腺癌模型 | 基因表达数据 | 未明确说明，但涉及雌性和雄性小鼠 |
| 220 | 2025-06-06 |
Adverse effects of progestin-primed ovarian stimulation: combination of clinical study and single-cell analysis
2025-Jan-20, Reproductive biomedicine online
IF:3.7Q1
DOI:10.1016/j.rbmo.2025.104833
PMID:40467355
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研究论文 | 本研究探讨了孕激素促排卵方案(PPOS)与GnRH拮抗剂方案在生殖结局上的差异，并结合临床研究和单细胞分析进行了评估 | 首次结合临床数据和单细胞RNA测序技术(scRNA-seq)评估PPOS方案对生殖结局的影响，并发现mtDNA基因表达升高可能与卵母细胞质量下降相关 | 研究为回顾性队列设计，样本量相对有限(临床907例，单细胞分析16例)，且仅针对卵巢储备正常的年轻患者(<40岁) | 比较PPOS与GnRH拮抗剂方案在体外受精(IVF)周期中的效果差异 | 接受首次IVF周期的不孕症患者(907例临床研究，16例单细胞分析) | 生殖医学 | 不孕症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)，逆概率治疗加权(IPTW) | NA | 临床数据和单细胞基因表达数据 | 临床研究907例(PPOS组299例，GnRH拮抗剂组608例)，单细胞分析16例(每组8例) |