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当前共找到 2176 篇文献，本页显示第 2101 - 2120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2101 | 2025-01-06 |
Macrophage HERC6 Promotes NAFLD: Integrated Analyses of Mendelian Randomization and Single-Cell Transcriptome
2025-Jan-01, Combinatorial chemistry & high throughput screening
IF:1.6Q3
|
研究论文 | 本研究探讨了HERC6相关免疫反应与非酒精性脂肪肝病（NAFLD）之间的关系，并筛选了新型治疗药物 | 结合孟德尔随机化和单细胞转录组分析，揭示了HERC6在NAFLD中的关键作用，并筛选出潜在治疗药物 | 研究主要依赖于公开数据集，可能受限于数据的质量和样本量 | 探索HERC6相关免疫反应与NAFLD的关系，并筛选治疗药物 | NAFLD患者及肥胖患者的肝脏样本 | 生物信息学 | 非酒精性脂肪肝病 | 孟德尔随机化、单细胞RNA测序、药物敏感性评估 | NA | RNA测序数据 | 公开数据集GSE168933和GSE83452中的肝脏样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2102 | 2025-01-05 |
Spatial transcriptomics in bone mechanomics: Exploring the mechanoregulation of fracture healing in the era of spatial omics
2025-Jan-03, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adp8496
PMID:39742473
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于空间转录组学的“力学组学”平台，用于探索骨折愈合中的机械调控机制 | 该平台整合了时间序列的体内微计算机断层扫描、空间转录组学和微有限元分析，能够在空间上解析细胞分子特征与其局部体内机械环境的关系 | NA | 研究骨折愈合过程中细胞对局部机械应力的转录组反应 | 骨折部位的细胞 | 数字病理学 | 骨折 | 空间转录组学、微计算机断层扫描、微有限元分析 | NA | 空间转录组数据、图像数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2103 | 2025-01-05 |
A joint analysis of single cell transcriptomics and proteomics using transformer
2025-Jan-02, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-024-00484-9
PMID:39743530
|
研究论文 | 本文提出了一种基于Transformer编码器层的深度学习框架scTEL，用于从单细胞RNA测序数据预测未观察到的蛋白质表达 | scTEL模型通过计算方式显著降低了蛋白质表达测序的实验成本，并提供了一个统一框架来整合多个CITE-seq数据集 | 未提及具体局限性 | 揭示细胞异质性，降低蛋白质表达测序的实验成本 | 单细胞RNA和蛋白质表达数据 | 机器学习 | NA | CITE-seq, scRNA-seq | Transformer | RNA和蛋白质表达数据 | 公共CITE-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 2104 | 2025-01-02 |
Single-cell sequencing analysis reveals cetuximab resistance mechanism and salvage strategy in colorectal cancer
2025-Jan, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70151
PMID:39739554
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2105 | 2025-01-05 |
CircMVP promotes METTL3 activation mediated CTNNB1 m6A modification in the inhibition of colorectal cancer in B7-H3 dependence antitumor immunity
2025, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.105324
PMID:39744434
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研究论文 | 本研究探讨了环状RNA circMVP在结直肠癌（CRC）中通过促进METTL3激活介导的CTNNB1 m6A修饰，抑制B7-H3依赖的抗肿瘤免疫反应的机制 | 揭示了circMVP通过METTL3介导的m6A修饰调控β-catenin表达，进而影响B7-H3依赖的抗肿瘤免疫反应的新机制 | 研究主要基于体外实验和动物模型，临床样本的验证仍需进一步扩大 | 阐明circRNA与结直肠癌抗肿瘤免疫抑制之间的调控关系 | 结直肠癌患者样本和细胞系 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | qRT-PCR、RNA pull-down、单细胞RNA测序、EMSA、RNA免疫沉淀、染色质免疫沉淀、多核糖体分析 | NA | RNA测序数据、临床样本数据 | 结直肠癌患者样本和细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 2106 | 2025-01-05 |
Genetically Predicted Immune Cell Traits Mediate the Causal Association Between Plasma Metabolites and Colorectal Cancer
2025, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.101011
PMID:39744475
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研究论文 | 本研究通过两步两样本孟德尔随机化方法，评估了1400种血浆代谢物、731种免疫细胞特征与结直肠癌之间的因果关系，并探讨了免疫细胞特征在其中的中介作用 | 首次使用两步两样本孟德尔随机化方法，结合单细胞RNA测序技术，揭示了血浆代谢物通过特定免疫细胞特征影响结直肠癌的因果机制 | 研究依赖于GWAS汇总数据，可能受到混杂因素的影响，且样本量虽大但具体样本类型未明确说明 | 探讨血浆代谢物与结直肠癌之间的因果关系，以及免疫细胞特征在其中的中介作用 | 1400种血浆代谢物、731种免疫细胞特征与结直肠癌 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 两步两样本孟德尔随机化(MR)、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因组关联研究(GWAS)汇总数据、单细胞RNA测序数据 | NA（未明确说明具体样本数量，但涉及1400种血浆代谢物和731种免疫细胞特征） | NA | NA | NA | NA |
| 2107 | 2025-01-05 |
Mitochondrial Gene Scoring System: Predicting Prognosis and Precision Therapy for TACE Non-Response in Hepatocellular Carcinoma Patients
2025, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.103946
PMID:39744494
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研究论文 | 本文开发了两个独立的线粒体评分系统，用于预测肝细胞癌（HCC）患者的预后和经动脉化疗栓塞（TACE）无反应的可能性 | 开发了两个独立的线粒体评分系统（RPS和RDS），用于预测HCC患者的预后和TACE无反应的可能性，并探索了TACE无反应患者的替代疗法 | 未提及具体样本量，可能限制了结果的普遍性 | 预测HCC患者的预后和TACE无反应的可能性，并探索替代疗法 | 肝细胞癌（HCC）患者 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | LASSO Cox回归分析、LASSO逻辑回归分析 | 基因数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2108 | 2025-01-05 |
Cell-type-specific regulators landscape and regulatory mechanisms underlying pyroptosis in uterine corpus endometrial carcinoma
2025, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.100547
PMID:39744500
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，研究了子宫体子宫内膜癌（UCEC）中与细胞焦亡相关基因的景观及其调控机制 | 首次在UCEC组织中通过单细胞RNA测序揭示了细胞焦亡相关基因的表达模式，并验证了其在肿瘤组织中的异常病理特征 | 研究主要依赖于单细胞RNA测序数据，可能受到样本量和数据质量的限制 | 探讨UCEC中细胞焦亡相关基因的表达模式及其在肿瘤发生和发展中的作用 | 6089个UCEC组织细胞 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq），RNA测序，定量实时PCR，免疫组织化学 | NA | RNA测序数据，病理图像 | 6089个UCEC组织细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 2109 | 2025-01-05 |
The cellular signaling crosstalk between memory B cells and tumor cells in nasopharyngeal carcinoma cannot be overlooked: Their involvement in tumor progression and treatment strategy is significant
2025, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.101420
PMID:39744570
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学分析探讨了鼻咽癌中B细胞亚群的分子生物标志物和预后因素，并研究了其潜在机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术全面分析了鼻咽癌中B细胞亚群的多样性及其与肿瘤细胞的相互作用，揭示了C4 CD86+记忆B细胞在肿瘤进展中的关键作用 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据，缺乏体内实验验证，且样本量有限，可能影响结果的普适性 | 探讨鼻咽癌中B细胞亚群的分子机制及其在肿瘤进展和治疗中的作用 | 鼻咽癌患者肿瘤和血液样本中的B细胞亚群 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序 | PCA, Monocle, Slingshot, CellChat, LASSO回归, Cox回归 | 单细胞RNA测序数据 | 鼻咽癌患者的肿瘤和血液样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2110 | 2025-01-05 |
Unveiling the Prognostic Power and Immune Landscape of MyD88 in Breast Cancer: an Integrative Bioinformatics and IHC Approach
2025, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.103403
PMID:39744584
|
研究论文 | 本研究结合生物信息学和免疫组织化学方法，探讨了MyD88在乳腺癌中的预后意义和免疫学影响 | 首次整合bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq和IHC技术，全面分析MyD88在乳腺癌中的表达及其与免疫景观的关联 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步的实验验证来确认MyD88的机制和治疗潜力 | 探索MyD88在乳腺癌中的预后价值和免疫学作用 | 乳腺癌患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 免疫组织化学(IHC) | NA | RNA-seq数据, 单细胞RNA-seq数据, 免疫组织化学图像 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2111 | 2025-01-03 |
A specific inflammatory suppression fibroblast subpopulation characterized by MHCII expression in human dilated cardiomyopathy
2025-Jan, Molecular and cellular biochemistry
IF:3.5Q3
DOI:10.1007/s11010-024-04939-9
PMID:38462549
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，识别了人类扩张型心肌病（DCM）中一种特定的抗原呈递成纤维细胞亚群，并探讨了其在炎症抑制中的作用 | 首次识别并描述了DCM中一种特定的抗原呈递成纤维细胞亚群（apFB），并揭示了其在炎症抑制中的关键作用 | 研究样本量较小，仅包括4个健康供体和6个DCM患者的心脏组织 | 探讨扩张型心肌病（DCM）中成纤维细胞的异质性及其与免疫细胞的相互作用 | 人类左心室组织，包括健康供体和DCM患者的心脏组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（ScRNA-Seq） | NA | RNA测序数据 | 10个心脏组织（4个健康供体和6个DCM患者） | NA | NA | NA | NA |
| 2112 | 2025-01-03 |
The heterogeneity of cellular metabolism in the tumour microenvironment of hepatocellular carcinoma with portal vein tumour thrombus
2025-Jan, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13738
PMID:39189673
|
研究论文 | 本研究通过多组学组合全面分析了肝细胞癌（HCC）、门静脉癌栓（PVTT）和正常肝样本的代谢异质性 | 首次在多组学水平上描绘了HCC和PVTT中非恶性细胞的代谢异质性景观，并确定了PVTT形成和发展的代谢特征 | NA | 研究肝细胞癌及其门静脉癌栓的代谢异质性 | 肝细胞癌（HCC）、门静脉癌栓（PVTT）和正常肝样本 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、荧光多重免疫组化 | NA | RNA测序数据、空间转录组数据、免疫组化数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2113 | 2025-01-03 |
Bayesian Phylogenetic Lineage Reconstruction with Loss of Heterozygosity Mutations Derived from Single-Cell RNA Sequencing
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4310-5_1
PMID:39745633
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于单细胞RNA测序的贝叶斯方法，用于从推断的杂合性缺失（LOH）事件重建细胞谱系 | 使用单细胞RNA测序数据，结合贝叶斯方法重建细胞谱系，并标注细胞表型和发育时间点 | 该方法目前仅应用于特定小鼠模型，尚未广泛验证 | 研究细胞谱系重建方法，以了解细胞发育历史 | Emx1+皮质投射神经元和胶质细胞谱系 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 贝叶斯模型 | RNA测序数据 | C57Bl/6J (B6) 和 CAST/EiJ (CA) 杂交F1小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 2114 | 2025-01-03 |
Lineage Recording in Human Brain Organoids with iTracer
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4310-5_5
PMID:39745637
|
研究论文 | 本文详细介绍了iTracer在人类大脑类器官中记录细胞谱系的应用协议 | iTracer结合了报告基因条形码和可诱导的CRISPR-Cas9标记，与单细胞和空间转录组学兼容，用于探索大脑类器官发育过程中的克隆性和谱系动态 | NA | 研究人类器官发育过程中的细胞谱系关系 | 人类大脑类器官 | 生物医学工程 | NA | iTracer, 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 单细胞和空间转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2115 | 2025-01-03 |
Clonal Tracking in the Mouse Brain with Single-Cell RNA-Seq
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4310-5_6
PMID:39745638
|
研究论文 | 本文介绍了一种利用单细胞RNA测序技术在小鼠大脑中进行克隆追踪的方法 | 与传统基于稀疏荧光标记的方法相比，使用遗传条形码和单细胞RNA测序的克隆追踪方法具有超过100倍的吞吐量，并且使用的老鼠数量减少了10倍以上 | NA | 开发一种高吞吐量的克隆追踪方法，用于研究哺乳动物大脑中的细胞谱系关系 | 小鼠大脑中的细胞 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 2周大的小鼠脑组织 | NA | NA | NA | NA |
| 2116 | 2025-01-03 |
LINNAEUS: Simultaneous Single-Cell Lineage Tracing and Cell Type Identification
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4310-5_12
PMID:39745644
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为LINNAEUS的策略，用于在数千个单细胞中同时进行谱系追踪和转录组分析 | LINNAEUS结合了单细胞RNA测序和谱系条码的计算分析，能够重建生物体范围内的单细胞谱系树 | NA | 理解细胞类型在发育、再生和疾病等过程中的起源 | 单细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 数千个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 2117 | 2025-01-03 |
Paired Single-Cell Transcriptome and DNA Barcode Detection in Zebrafish Using ScarTrace
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4310-5_11
PMID:39745643
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于CRISPR/Cas9的遗传谱系追踪方法ScarTrace，用于在斑马鱼胚胎发育过程中对单细胞进行DNA条形码标记，并通过单细胞cDNA扩增和基因组DNA嵌套PCR分别捕获转录组和条形码序列 | ScarTrace方法结合了CRISPR/Cas9技术和单细胞转录组分析，能够在斑马鱼胚胎发育过程中对单细胞进行独特的DNA条形码标记，并实现克隆追踪和谱系树重建 | 该方法目前仅应用于斑马鱼模型，尚未在其他生物体中进行验证 | 研究斑马鱼胚胎发育过程中的细胞命运决定 | 斑马鱼胚胎和成体组织中的单细胞 | 遗传学 | NA | CRISPR/Cas9, 单细胞cDNA扩增, 基因组DNA嵌套PCR | NA | DNA序列, 转录组数据 | 斑马鱼胚胎和成体组织中的单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 2118 | 2025-01-03 |
GEMLI: Gene Expression Memory-Based Lineage Inference from Single-Cell RNA-Sequencing Datasets
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4310-5_19
PMID:39745651
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于基因表达记忆的细胞谱系推断工具GEMLI，该工具仅需单细胞RNA测序数据即可预测细胞谱系 | GEMLI通过基因表达记忆现象预测细胞谱系，无需依赖遗传标记或物理细胞分离，极大地简化并扩展了谱系注释 | NA | 开发一种仅需单细胞RNA测序数据即可预测细胞谱系的工具 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达矩阵 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2119 | 2024-12-30 |
Mouse Tail-Skin Dissociation and Preparation of Live Single-Cell Suspension for Downstream Analysis of Melanocytes
2025-Jan, Pigment cell & melanoma research
IF:3.9Q2
DOI:10.1111/pcmr.13216
PMID:39625901
|
研究论文 | 本文开发了一种从小鼠尾皮中高效分离高质量活单细胞的方法，用于下游的黑色素细胞及其相互作用细胞的研究 | 开发了一种新的两阶段酶解步骤，结合碎片去除和活细胞富集，从小鼠尾皮中高效生成高活性的单细胞悬液 | 该方法主要针对小鼠尾皮，可能不适用于其他类型的皮肤组织 | 研究小鼠尾皮中黑色素细胞及其相互作用细胞的单细胞转录组分析 | 小鼠尾皮中的角质形成细胞、黑色素细胞和成纤维细胞 | 单细胞测序 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2120 | 2024-12-29 |
CXC chemokine receptor 4 - mediated immune modulation and tumor microenvironment heterogeneity in gastric cancer: Utilizing multi-omics approaches to identify potential therapeutic targets
2025 Jan-Feb, BioFactors (Oxford, England)
DOI:10.1002/biof.2130
PMID:39431668
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研究论文 | 本研究通过多组学方法探讨了CXCR4在胃癌中的免疫调节功能及肿瘤微环境异质性 | 首次全面揭示了CXCR4在胃癌肿瘤微环境中的免疫调节作用及其与T细胞耗竭的关系 | 研究主要基于体外实验，缺乏体内实验验证 | 探索CXCR4在胃癌中的免疫调节功能及肿瘤微环境异质性，寻找潜在治疗靶点 | 胃癌细胞系AGS和SNU-1 | 肿瘤免疫学 | 胃癌 | 空间转录组学、单细胞RNA测序、ELISA、PCR、CCK8实验、细胞划痕实验、集落形成实验 | NA | 基因表达数据、细胞实验数据 | 两种胃癌细胞系（AGS和SNU-1） | NA | NA | NA | NA |