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当前共找到 2148 篇文献，本页显示第 2081 - 2100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2081 | 2025-01-03 |
Clonal Tracking in the Mouse Brain with Single-Cell RNA-Seq
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4310-5_6
PMID:39745638
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研究论文 | 本文介绍了一种利用单细胞RNA测序技术在小鼠大脑中进行克隆追踪的方法 | 与传统基于稀疏荧光标记的方法相比，使用遗传条形码和单细胞RNA测序的克隆追踪方法具有超过100倍的吞吐量，并且使用的老鼠数量减少了10倍以上 | NA | 开发一种高吞吐量的克隆追踪方法，用于研究哺乳动物大脑中的细胞谱系关系 | 小鼠大脑中的细胞 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 2周大的小鼠脑组织 | NA | NA | NA | NA |
| 2082 | 2025-01-03 |
LINNAEUS: Simultaneous Single-Cell Lineage Tracing and Cell Type Identification
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4310-5_12
PMID:39745644
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研究论文 | 本文介绍了一种名为LINNAEUS的策略，用于在数千个单细胞中同时进行谱系追踪和转录组分析 | LINNAEUS结合了单细胞RNA测序和谱系条码的计算分析，能够重建生物体范围内的单细胞谱系树 | NA | 理解细胞类型在发育、再生和疾病等过程中的起源 | 单细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 数千个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 2083 | 2025-01-03 |
Paired Single-Cell Transcriptome and DNA Barcode Detection in Zebrafish Using ScarTrace
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4310-5_11
PMID:39745643
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研究论文 | 本文介绍了一种基于CRISPR/Cas9的遗传谱系追踪方法ScarTrace，用于在斑马鱼胚胎发育过程中对单细胞进行DNA条形码标记，并通过单细胞cDNA扩增和基因组DNA嵌套PCR分别捕获转录组和条形码序列 | ScarTrace方法结合了CRISPR/Cas9技术和单细胞转录组分析，能够在斑马鱼胚胎发育过程中对单细胞进行独特的DNA条形码标记，并实现克隆追踪和谱系树重建 | 该方法目前仅应用于斑马鱼模型，尚未在其他生物体中进行验证 | 研究斑马鱼胚胎发育过程中的细胞命运决定 | 斑马鱼胚胎和成体组织中的单细胞 | 遗传学 | NA | CRISPR/Cas9, 单细胞cDNA扩增, 基因组DNA嵌套PCR | NA | DNA序列, 转录组数据 | 斑马鱼胚胎和成体组织中的单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 2084 | 2025-01-03 |
GEMLI: Gene Expression Memory-Based Lineage Inference from Single-Cell RNA-Sequencing Datasets
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4310-5_19
PMID:39745651
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研究论文 | 本文介绍了一种基于基因表达记忆的细胞谱系推断工具GEMLI，该工具仅需单细胞RNA测序数据即可预测细胞谱系 | GEMLI通过基因表达记忆现象预测细胞谱系，无需依赖遗传标记或物理细胞分离，极大地简化并扩展了谱系注释 | NA | 开发一种仅需单细胞RNA测序数据即可预测细胞谱系的工具 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达矩阵 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2085 | 2024-12-30 |
Mouse Tail-Skin Dissociation and Preparation of Live Single-Cell Suspension for Downstream Analysis of Melanocytes
2025-Jan, Pigment cell & melanoma research
IF:3.9Q2
DOI:10.1111/pcmr.13216
PMID:39625901
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研究论文 | 本文开发了一种从小鼠尾皮中高效分离高质量活单细胞的方法，用于下游的黑色素细胞及其相互作用细胞的研究 | 开发了一种新的两阶段酶解步骤，结合碎片去除和活细胞富集，从小鼠尾皮中高效生成高活性的单细胞悬液 | 该方法主要针对小鼠尾皮，可能不适用于其他类型的皮肤组织 | 研究小鼠尾皮中黑色素细胞及其相互作用细胞的单细胞转录组分析 | 小鼠尾皮中的角质形成细胞、黑色素细胞和成纤维细胞 | 单细胞测序 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2086 | 2024-12-29 |
CXC chemokine receptor 4 - mediated immune modulation and tumor microenvironment heterogeneity in gastric cancer: Utilizing multi-omics approaches to identify potential therapeutic targets
2025 Jan-Feb, BioFactors (Oxford, England)
DOI:10.1002/biof.2130
PMID:39431668
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研究论文 | 本研究通过多组学方法探讨了CXCR4在胃癌中的免疫调节功能及肿瘤微环境异质性 | 首次全面揭示了CXCR4在胃癌肿瘤微环境中的免疫调节作用及其与T细胞耗竭的关系 | 研究主要基于体外实验，缺乏体内实验验证 | 探索CXCR4在胃癌中的免疫调节功能及肿瘤微环境异质性，寻找潜在治疗靶点 | 胃癌细胞系AGS和SNU-1 | 肿瘤免疫学 | 胃癌 | 空间转录组学、单细胞RNA测序、ELISA、PCR、CCK8实验、细胞划痕实验、集落形成实验 | NA | 基因表达数据、细胞实验数据 | 两种胃癌细胞系（AGS和SNU-1） | NA | NA | NA | NA |
| 2087 | 2024-12-29 |
Construction of mitochondrial quality regulation genes-related prognostic model based on bulk-RNA-seq analysis in multiple myeloma
2025 Jan-Feb, BioFactors (Oxford, England)
DOI:10.1002/biof.2135
PMID:39446019
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研究论文 | 本文基于批量RNA测序分析，构建了与线粒体质量调控基因相关的多发性骨髓瘤预后模型 | 开发了一个与线粒体质量调控基因相关的预后模型，并利用多种生物信息学工具进行综合分析 | NA | 构建多发性骨髓瘤患者的线粒体质量调控基因相关预后模型 | 多发性骨髓瘤患者 | 生物信息学 | 多发性骨髓瘤 | 批量RNA测序、单细胞RNA测序、突变分析、免疫浸润分析 | RiskScore模型 | RNA测序数据、突变数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2088 | 2024-12-29 |
Navigating the immune landscape with plasma cells: A pan-cancer signature for precision immunotherapy
2025 Jan-Feb, BioFactors (Oxford, England)
DOI:10.1002/biof.2142
PMID:39495620
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研究论文 | 本研究通过泛癌单细胞RNA测序分析，发现了一种新的浆细胞特征Plasma cell.Sig，能够显著预测患者对免疫治疗的反应 | 发现了一种新的浆细胞特征Plasma cell.Sig，并通过机器学习算法验证了其在预测免疫治疗反应中的优越性 | 未提及具体的研究局限性 | 提高对肿瘤微环境中内在和外在免疫景观的理解，并为更精确的生物标志物引导的免疫治疗方法铺平道路 | 癌症患者 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | RNA测序数据 | 多个队列的癌症患者 | NA | NA | NA | NA |
| 2089 | 2024-12-28 |
The contribution of the novel CLTC-VMP1 fusion gene to autophagy regulation and energy metabolism in cisplatin-resistant osteosarcoma
2025-Jan-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00302.2024
PMID:39466176
|
研究论文 | 本研究探讨了CLTC-VMP1基因融合在骨肉瘤化疗耐药机制中的作用及其通过调节自噬和凋亡平衡介导能量代谢重编程的分子机制 | 首次发现CLTC-VMP1基因融合在骨肉瘤化疗耐药中的关键作用，并通过单细胞转录组分析揭示了肿瘤细胞的异质性 | 研究主要基于细胞系和小鼠模型，尚未在临床样本中进行验证 | 探索CLTC-VMP1基因融合在骨肉瘤化疗耐药机制中的作用 | 骨肉瘤细胞系和小鼠模型 | 分子生物学 | 骨肉瘤 | 单细胞转录组分析、慢病毒载体 | NA | 转录组数据 | 人类骨肉瘤细胞系和小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 2090 | 2024-12-26 |
Profiling cell identity and tissue architecture with single-cell and spatial transcriptomics
2025-Jan, Nature reviews. Molecular cell biology
DOI:10.1038/s41580-024-00768-2
PMID:39169166
|
综述 | 本文综述了单细胞转录组学和空间转录组学在细胞身份和组织结构分析中的最新进展、挑战和前景 | 讨论了深度学习（包括基础模型）在单细胞和空间转录组数据分析中的应用，并展望了这些技术在生物研究和临床转化中的未来 | 未具体提及研究的局限性 | 探讨单细胞和空间转录组学在细胞状态和多细胞邻域识别与表征中的应用 | 健康与疾病组织中的细胞多样性和基因表达动态 | 生物信息学 | 肿瘤生物学 | 单细胞转录组学、空间转录组学 | 深度学习、基础模型 | 转录组数据 | 数百至数百万个细胞的靶向转录组和全转录组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 2091 | 2024-12-26 |
Trem2/Tyrobp Signaling Protects Against Aortic Dissection and Rupture by Inhibiting Macrophage Activation in Mice
2025-Jan, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.124.321429
PMID:39508103
|
研究论文 | 本研究探讨了Trem2/Tyrobp信号通路在小鼠主动脉夹层（AD）发展中的作用，发现其通过抑制巨噬细胞激活来保护主动脉免受夹层和破裂 | 首次揭示了Trem2/Tyrobp信号通路在主动脉夹层中的保护作用，并提出了通过增强该信号通路来预防和治疗主动脉夹层的新策略 | 研究主要基于小鼠模型，未来需要进一步研究Trem2/Tyrobp在人类主动脉夹层中的作用 | 探讨Trem2/Tyrobp信号通路在主动脉夹层发展中的作用及其潜在机制 | 小鼠主动脉夹层模型 | 心血管疾病 | 主动脉夹层 | 转录组分析、单细胞RNA测序、免疫荧光染色、定量实时聚合酶链反应 | Tyrobp敲除小鼠、Trem2敲除小鼠 | 基因表达数据、RNA测序数据 | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 2092 | 2024-12-25 |
The role of the haematopoietic stem cell niche in development and ageing
2025-Jan, Nature reviews. Molecular cell biology
DOI:10.1038/s41580-024-00770-8
PMID:39256623
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综述 | 本文综述了造血干细胞（HSC）及其前体细胞（HSPC）在发育和衰老过程中与骨髓微环境（niche）的相互作用 | 本文通过单细胞转录组学和显微镜技术，揭示了HSC在发育过程中与不同niche的相互作用，并探讨了这些相互作用在衰老过程中的变化及其对造血疾病的影响 | 本文主要为综述性质，未提供具体实验数据或模型 | 探讨HSC与niche在发育和衰老过程中的相互作用，为改善自体HSC疗法和移植提供理论基础 | 造血干细胞（HSC）及其前体细胞（HSPC）与骨髓微环境（niche）的相互作用 | NA | NA | 单细胞转录组学、显微镜技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2093 | 2024-12-24 |
Exploring the Role of Ccn3 in Type III Cell of Mice Taste Buds
2025-Jan, Journal of neurochemistry
IF:4.2Q2
DOI:10.1111/jnc.16291
PMID:39709613
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研究论文 | 研究探讨了Ccn3在鼠味蕾III型细胞中的表达和功能 | 首次通过单细胞RNA测序发现Ccn3在鼠味蕾III型细胞中高表达，并通过多种实验方法验证了其表达模式 | Ccn3敲除对味觉反应没有显著影响，其具体功能仍需进一步研究 | 探索Ccn3在鼠味蕾细胞中的表达和功能 | 鼠味蕾的III型细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序、逆转录聚合酶链反应（RT-PCR）、原位杂交、免疫组织化学（IHC） | NA | RNA | 鼠味蕾细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 2094 | 2024-12-23 |
Integrating scRNA-seq and Visium HD for the analysis of the tumor microenvironment in the progression of colorectal cancer
2025-Jan-03, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.113752
PMID:39642568
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研究论文 | 本文通过整合单细胞RNA测序和Visium HD空间转录组技术，分析了结直肠癌进展过程中肿瘤微环境的变化 | 本文首次结合高分辨率空间转录组学技术，深入研究了结直肠癌肿瘤微环境的动态变化，并发现了NOTUM+上皮细胞和IGHG1/3+浆细胞在正常组织与腺瘤交界处的聚集现象 | 本文主要基于数据分析，缺乏实验验证，且样本量未明确说明 | 研究结直肠癌进展过程中肿瘤微环境的变化 | 结直肠癌的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序，Visium HD空间转录组 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2095 | 2024-12-23 |
The prognostic significance and potential mechanism of PFDN4 in hepatocellular carcinoma
2025-Jan-03, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.113761
PMID:39644788
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研究论文 | 本研究探讨了PFDN4在肝细胞癌中的表达及其对预后的影响和潜在机制 | 首次系统研究了PFDN4在肝细胞癌中的表达及其对肿瘤进展的影响，并揭示了其通过MAPK/ERK信号通路调控肝细胞癌行为的机制 | 研究主要基于数据库分析和体外实验，缺乏更大规模的临床样本验证 | 探讨PFDN4在肝细胞癌中的表达及其对预后的影响和潜在机制 | PFDN4在肝细胞癌中的表达及其对肿瘤进展的影响 | NA | 肝细胞癌 | CCK-8, EdU, 伤口愈合, Transwell, 蛋白质印迹, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | 多个数据库和临床样本, 稳定敲低和过表达PFDN4的肝细胞癌细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 2096 | 2024-12-23 |
An Integrative analysis of single-cell RNA-seq, transcriptome and Mendelian randomization for the Identification and validation of NAD+ Metabolism-Related biomarkers in ulcerative colitis
2025-Jan-03, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.113765
PMID:39647286
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、转录组数据和孟德尔随机化分析，识别和验证了与烟酰胺腺嘌呤二核苷酸（NAD+）代谢相关的生物标志物在溃疡性结肠炎中的作用 | 首次通过多组学数据整合和孟德尔随机化分析，识别并验证了NAD+代谢相关基因在溃疡性结肠炎中的生物标志物作用 | 研究依赖于现有数据集，可能存在样本偏倚和外部验证不足的问题 | 探索NAD+代谢相关基因在溃疡性结肠炎中的潜在作用，并验证其作为生物标志物的可行性 | NAD+代谢相关基因在溃疡性结肠炎中的表达模式及其作为生物标志物的潜力 | 数字病理学 | 消化系统疾病 | 单细胞RNA测序、转录组分析、孟德尔随机化分析、实时定量聚合酶链反应 | 机器学习 | 基因表达数据 | 使用了GSE87466、GSE75214和GSE224758等多个数据集，样本数量未明确提及 | NA | NA | NA | NA |
| 2097 | 2024-12-23 |
MSR1 in lung squamous cell carcinoma: Prognostic and immunological values in pan-cancer and single-cell analyses and a cohort study
2025-Jan-03, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.113811
PMID:39667048
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研究论文 | 研究探讨了巨噬细胞清道夫受体1（MSR1）在肺鳞状细胞癌（LUSC）中的预后和免疫学价值 | 首次系统分析了MSR1在泛癌和单细胞水平上的表达及其与免疫细胞浸润的关系，并验证了其在LUSC中的预后和诊断潜力 | 研究主要基于数据库分析和队列研究，缺乏体内实验验证 | 探讨MSR1在LUSC中的预后和免疫学价值，并评估其作为诊断和预后标志物的潜力 | MSR1在肺鳞状细胞癌中的表达、预后价值及其与免疫细胞浸润的关系 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 49,566名UK Biobank参与者 | NA | NA | NA | NA |
| 2098 | 2024-12-23 |
Transcriptomic heterogeneity of non-beta islet cells is associated with type 2 diabetes development in mouse models
2025-Jan, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-024-06301-6
PMID:39508880
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研究论文 | 本研究探讨了非β细胞在胰腺胰岛中早期2型糖尿病发病机制中的作用 | 揭示了非β细胞在不同糖尿病易感性小鼠模型中的转录异质性，并发现这种异质性与人类2型糖尿病的发展相关 | 研究主要基于小鼠模型和人类胰岛数据，可能无法完全反映人类2型糖尿病的复杂性 | 理解非β细胞在胰腺胰岛中早期2型糖尿病发病机制中的作用 | 肥胖小鼠模型和人类胰岛中的非β细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 来自肥胖小鼠和人类胰岛的单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 2099 | 2024-12-23 |
Osteoarthritis year in review 2024: Genetics, genomics, and epigenetics
2025-Jan, Osteoarthritis and cartilage
IF:7.2Q1
DOI:10.1016/j.joca.2024.10.014
PMID:39537019
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综述 | 本文综述了过去12个月在骨关节炎遗传学、基因组学和表观遗传学领域的进展 | 本文介绍了功能基因组学研究的增加，并确定了26个与骨关节炎病理相关的新基因，以及单细胞转录组学和两种新的组学技术（表观转录组学和线粒体基因组学）的应用 | 本文仅关注使用全基因组组学技术的人类材料研究 | 总结过去一年在骨关节炎遗传学、基因组学和表观遗传学领域的最新进展 | 骨关节炎的遗传学、基因组学和表观遗传学研究 | 基因组学 | 骨关节炎 | 全基因组组学技术、单细胞转录组学、表观转录组学、线粒体基因组学 | NA | 基因组数据 | 涉及多种骨关节炎相关组织的人类材料 | NA | NA | NA | NA |
| 2100 | 2024-12-23 |
GraCEImpute: A novel graph clustering autoencoder approach for imputation of single-cell RNA-seq data
2025-Jan, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2024.109400
PMID:39561511
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研究论文 | 本文提出了一种基于图聚类自编码器（GCAE）的新方法GraCEImpute，用于单细胞RNA测序数据中的缺失数据插补 | GraCEImpute模型在插补单细胞RNA测序数据中的缺失值方面优于现有方法，并显著提高了下游分析的质量 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中由于技术限制导致的高丢失率问题 | 单细胞RNA测序数据中的缺失数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 图聚类自编码器（GCAE） | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |