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当前共找到 2188 篇文献，本页显示第 2061 - 2080 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2061 | 2025-10-07 |
Analysis and Validation of Autophagy-Related Gene Biomarkers and Immune Cell Infiltration Characteristic in Bronchopulmonary Dysplasia by Integrating Bioinformatics and Machine Learning
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S495132
PMID:39839185
|
研究论文 | 通过整合生物信息学和机器学习方法，分析与验证支气管肺发育不良中自噬相关基因生物标志物及免疫细胞浸润特征 | 首次对BPD中自噬相关基因和免疫浸润进行生物信息学分析，并采用三种机器学习算法识别枢纽基因 | 研究基于单一数据集GSE8586，样本来源有限 | 筛选和验证支气管肺发育不良的特征基因 | 支气管肺发育不良患者基因表达数据和高压氧大鼠模型 | 生物信息学 | 支气管肺发育不良 | 基因表达分析，单细胞测序，免疫组织化学 | Lasso，MCC，Degree，MCODE | 基因表达数据 | GSE8586数据集样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2062 | 2025-10-07 |
Differential transcriptomic profiling of lipid metabolism and collagen remodeling in fast- and slow-twitch skeletal muscles in aging
2025-Jan-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202402294R
PMID:39831549
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研究论文 | 本研究通过比较分析老年小鼠快慢肌纤维的转录组差异，揭示了衰老过程中脂质代谢和胶原重塑的分子变化 | 首次整合小鼠bulk RNA测序和人类单细胞RNA测序数据，进行跨物种比较分析衰老对快慢肌纤维的影响 | 仅使用20月龄小鼠模型，缺乏更广泛的年龄阶段数据；样本量未明确说明 | 探究衰老过程中快慢肌纤维的转录组差异及其分子机制 | 老年小鼠的快慢骨骼肌纤维和人类单细胞RNA测序数据 | 转录组学 | 老年疾病 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2063 | 2025-10-07 |
Fibrocyte enrichment and myofibroblastic adaptation causes nucleus pulposus fibrosis and associates with disc degeneration severity
2025-Jan-20, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-024-00372-2
PMID:39828732
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研究论文 | 本研究通过整合分析多个单细胞RNA测序数据集，揭示了髓核纤维化与椎间盘退变严重程度相关的细胞机制 | 首次发现髓核纤维化与髓系来源的纤维细胞富集相关，并证实这些细胞通过转化为肌成纤维细胞表型促进椎间盘退变 | 研究主要基于单细胞测序数据和动物模型，需要进一步验证在人类患者中的临床相关性 | 探究椎间盘退变过程中髓核纤维化的细胞机制和关键细胞类型 | 人类退变性髓核标本和损伤诱导的小鼠椎间盘退变模型 | 单细胞基因组学 | 椎间盘退变疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个单细胞RNA测序数据集（具体样本数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2064 | 2025-10-07 |
TLR7/8/9 agonists and low-dose cisplatin synergistically promotes tertiary lymphatic structure formation and antitumor immunity
2025-Jan-19, NPJ vaccines
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41541-024-01055-z
PMID:39827246
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研究论文 | 本研究开发了一种新型联合疗法，通过低剂量顺铂与TLR7/8/9激动剂CR108协同促进三级淋巴结构形成和抗肿瘤免疫 | 首次发现低剂量顺铂与TLR7/8/9激动剂CR108联合使用可协同促进三级淋巴结构形成，并揭示其作为功能性抗肿瘤效应T细胞储备库的新机制 | 研究仅限于小鼠模型（4T1和B16肿瘤），尚未在人体临床试验中验证 | 开发新型原位疫苗接种联合疗法以增强抗肿瘤免疫反应 | 小鼠肿瘤模型（4T1和B16肿瘤细胞系） | 免疫治疗 | 肿瘤 | 单细胞测序分析 | NA | 单细胞测序数据、血清细胞因子检测数据 | 小鼠肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2065 | 2025-10-07 |
ERG mediates the differentiation of hepatic progenitor cells towards immunosuppressive PDGFRα+ cancer-associated fibroblasts during hepatocarcinogenesis
2025-Jan-18, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-07270-9
PMID:39827226
|
研究论文 | 本研究揭示肝祖细胞通过TLR4/MAPK/ERG通路分化为免疫抑制性PDGFRα+癌症相关成纤维细胞的机制 | 首次发现ERG转录因子介导肝祖细胞向PDGFRα+ CAFs的分化过程，并阐明其在肝癌免疫抑制微环境形成中的关键作用 | 研究主要基于大鼠原发肝癌模型，人类临床样本验证相对有限 | 探究肝癌中癌症相关成纤维细胞的起源及其在免疫抑制微环境形成中的作用机制 | 肝祖细胞、PDGFRα+癌症相关成纤维细胞、肿瘤相关巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 肝癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | 大鼠原发肝癌模型不同时间点样本 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 2066 | 2025-10-07 |
Inferring single-cell and spatial microRNA activity from transcriptomics data
2025-Jan-18, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-07454-9
PMID:39827321
|
研究论文 | 本研究开发了一种名为miTEA-HiRes的方法，用于从单细胞和空间转录组学数据中推断miRNA活性 | 开发了首个能够从单细胞转录组学、细胞类型特异性单细胞群体和空间转录组学数据中高分辨率评估miRNA活性的计算方法 | 方法依赖于转录组学数据推断miRNA活性，可能无法完全捕获转录后调控的复杂性 | 开发计算工具来评估不同细胞类型和空间位置中miRNA的调控活性 | 单细胞转录组数据、细胞类型特异性群体、空间转录组数据 | 生物信息学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 计算方法/统计模型 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2067 | 2025-10-07 |
Analysis of cellular NO-GC expression in the murine heart and lineage determination in angiotensin II-induced fibrosis
2025-Jan-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.111615
PMID:39829679
|
研究论文 | 分析小鼠心脏中NO-GC的细胞表达及其在血管紧张素II诱导纤维化中的谱系决定作用 | 首次系统描述NO-GC在健康和纤维化心肌中的细胞特异性表达模式，并通过谱系追踪确定表达NO-GC的活化成纤维细胞来源 | 研究仅限于小鼠模型，未在人类样本中验证 | 探究NO-GC在心脏纤维化过程中的细胞表达和功能作用 | 小鼠心脏组织 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,谱系追踪 | NA | 基因表达数据,组织学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2068 | 2025-10-07 |
Potent human antibodies against SpA5 identified by high-throughput single-cell sequencing of phase I clinical volunteers' B cells
2025-Jan-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.111627
PMID:39834865
|
研究论文 | 通过高通量单细胞测序技术从临床试验志愿者B细胞中筛选出针对SpA5蛋白的高效人类抗体 | 首次结合高通量单细胞RNA和VDJ测序技术从疫苗接种者记忆B细胞中快速筛选高效抗体 | 研究样本量相对有限，仅包含64名志愿者 | 筛选能够预防耐药菌感染的高效人类抗体 | 64名接种重组五组分疫苗的临床试验志愿者的记忆B细胞 | 免疫学 | 细菌感染 | 单细胞RNA测序,单细胞VDJ测序,Alphafold2,分子对接 | NA | 单细胞转录组数据,VDJ序列数据 | 64名志愿者，676个抗原结合IgG1克隆型 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞VDJ测序 | NA | NA |
| 2069 | 2025-10-07 |
The role of cell cycle-related genes in the tumorigenesis of adrenal and thyroid neuroendocrine tumors
2025-Jan-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e41457
PMID:39834406
|
综述 | 本文综述了细胞周期相关基因在肾上腺和甲状腺神经内分泌肿瘤发生中的作用及当前单细胞RNA测序研究进展 | 系统总结了神经母细胞瘤、甲状腺髓样癌和嗜铬细胞瘤中差异表达的细胞周期相关基因及其作为治疗靶点和肿瘤分型标志物的潜力 | 关于这些肿瘤调控机制的信息仍然有限，需要进一步研究探索 | 理解肾上腺和甲状腺神经内分泌肿瘤的分子机制，包括肿瘤发生、进展和转移 | 肾上腺和甲状腺神经内分泌肿瘤（神经母细胞瘤、甲状腺髓样癌、嗜铬细胞瘤） | 数字病理学 | 神经内分泌肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2070 | 2025-10-07 |
Integrative Analyses of Single-Cell RNA-Sequencing and Bulk RNA-Sequencing Reveal Prognostic Markers of Peripheral Blood Mononuclear Cells in Patients with Cardiogenic Shock Receiving Venous-Arterial Extracorporeal Membrane Oxygenation Support Collected before Venous-Arterial Extracorporeal Membrane Oxygenation Establishment
2025-Jan-14, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.4c07339
PMID:39829552
|
研究论文 | 通过整合单细胞和批量RNA测序分析，揭示心源性休克患者VA-ECMO治疗前外周血单核细胞中与预后相关的生物标志物 | 首次结合单细胞和批量RNA测序数据，鉴定出HSPA1B在B细胞和NK/NKT细胞中的表达与VA-ECMO患者不良预后相关 | 数据来源于公共数据库，样本量有限，需要更多临床样本验证 | 探索心源性休克患者VA-ECMO治疗前外周血单核细胞变化与预后的关系 | 接受静脉-动脉体外膜肺氧合支持的心源性休克患者 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | Seurat, limma | 基因表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 2071 | 2025-10-07 |
Comprehensive Analysis of m6A-Related Programmed Cell Death Genes Unveils a Novel Prognostic Model for Lung Adenocarcinoma
2025-Jan, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70255
PMID:39828988
|
研究论文 | 本研究通过整合bulk RNA和单细胞测序数据，开发了一个基于m6A相关程序性细胞死亡基因的肺腺癌预后模型 | 首次整合m6A修饰与程序性细胞死亡基因构建肺腺癌预后模型，并实验验证RCN1作为潜在致癌基因 | 需要进一步实验验证模型的临床应用价值 | 开发肺腺癌预后预测模型和个性化治疗策略 | 肺腺癌患者 | 生物信息学 | 肺腺癌 | bulk RNA测序, 单细胞测序 | CoxBoost, SuperPC | RNA测序数据 | 多个验证数据集 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 2072 | 2025-01-20 |
Unlocking the potential of spatial transcriptomics with custom microfluidic chips
2025-Jan-14, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2771-9
PMID:39826037
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2073 | 2025-10-07 |
Targeting MXD1 sensitises pancreatic cancer to trametinib
2025-Jan-16, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-333408
PMID:39819860
|
研究论文 | 本研究揭示了胰腺导管腺癌对trametinib耐药的分子机制，并发现MXD1可作为克服耐药性的潜在治疗靶点 | 首次发现trametinib治疗通过诱导MXD1表达激活转座元件转录和病毒模拟反应，导致耐药性产生 | NA | 阐明PDAC对trametinib耐药的机制并识别相关可成药靶点 | 胰腺导管腺癌(PDAC) | NA | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, ATAC-seq, CUT&Tag | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 患者来源异种移植模型和原代细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 2074 | 2025-10-07 |
Encompassing view of spatial and single-cell RNA sequencing renews the role of the microvasculature in human atherosclerosis
2025-Jan, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-024-00582-1
PMID:39715784
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据，构建了人类动脉粥样硬化斑块的高分辨率图谱 | 首次结合多研究单细胞RNA测序与12例不同阶段人类标本的空间转录组数据，揭示微血管系统在动脉粥样硬化中的新作用机制 | 样本量相对有限（12例人类标本），需要更大规模研究验证发现 | 揭示人类动脉粥样硬化中细胞类型特异性表达变化和空间受限的细胞间通讯 | 人类动脉粥样硬化斑块标本 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | 12例不同阶段人类动脉粥样硬化标本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2075 | 2025-10-07 |
PerturbDB for unraveling gene functions and regulatory networks
2025-Jan-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae777
PMID:39265120
|
研究论文 | 开发了PerturbDB平台，用于整合和分析Perturb-Seq数据集以揭示基因功能和调控网络 | 首个用户友好的Perturb-Seq数据整合平台，通过基因聚类和化学扰动整合识别潜在抑制剂 | 平台依赖现有公开数据集，未提及对新数据类型的扩展支持 | 构建基因功能研究和调控网络解析的平台工具 | 基因功能、调控网络、癌症相关基因 | 生物信息学 | 癌症 | Perturb-Seq, 单细胞RNA测序, CRISPR基因编辑 | Mixscape算法 | 单细胞转录组数据 | 4,518,521个单细胞转录组，涉及10,194个基因在19种细胞系中的敲低实验 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2076 | 2025-10-07 |
MAPbrain: a multi-omics atlas of the primate brain
2025-Jan-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae911
PMID:39420633
|
研究论文 | 介绍了一个名为MAPbrain的灵长类大脑多组学图谱平台 | 开发了首个整合转录组学、表观基因组学和空间转录组学数据的灵长类大脑多组学图谱 | 未明确说明数据整合和分析方法的具体技术限制 | 理解基因如何影响大脑发育及神经系统疾病机制 | 灵长类大脑发育过程 | 生物信息学 | 神经系统疾病 | 多组学技术 | NA | 转录组学、表观基因组学、空间转录组学数据 | 2100万大脑细胞，来自38个关键脑区和436个亚区，涵盖胚胎和成年阶段，包含人类和非人灵长类的164个时间点 | NA | 多组学整合分析 | MAPbrain | 在线交互式多组学分析平台，支持用户数据上传和整合分析 |
| 2077 | 2025-10-07 |
scTWAS Atlas: an integrative knowledgebase of single-cell transcriptome-wide association studies
2025-Jan-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae931
PMID:39420631
|
研究论文 | 介绍scTWAS Atlas知识库，这是一个整合单细胞转录组全关联研究数据的综合性数据库 | 开发首个整合文献整理和数据分析的scTWAS综合知识库，提供交互式知识图谱和多组学水平调控网络 | 当前版本仅涵盖34个性状、30种细胞类型和9种细胞条件，覆盖范围有待扩展 | 构建单细胞转录组全关联研究的综合知识库，解决细胞类型异质性解释难题 | 基因-性状关联、细胞类型特异性调控网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组全关联研究(scTWAS)、单细胞表达数量性状位点(sc-eQTL)分析 | NA | 基因表达数据、关联分析数据、多组学数据 | 2,765,211个关联，涵盖34个性状、30种细胞类型、9种细胞条件和16,470个基因 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2078 | 2025-10-07 |
CancerSCEM 2.0: an updated data resource of single-cell expression map across various human cancers
2025-Jan-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae954
PMID:39460627
|
研究论文 | 介绍单细胞表达图谱数据库CancerSCEM 2.0的更新内容与功能增强 | 新增拷贝数变异评估、转录因子富集、伪时间轨迹构建、生物特征评分等功能，并首次引入单细胞水平癌症代谢图谱 | 未提及具体的技术验证或数据质量评估细节 | 构建和优化人类癌症单细胞表达图谱数据库 | 127个研究项目中的1466个单细胞RNA测序数据集，涵盖74种癌症类型 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 1466个数据集，涵盖肿瘤、匹配正常组织和外周血样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2079 | 2025-10-07 |
ncPlantDB: a plant ncRNA database with potential ncPEP information and cell type-specific interaction
2025-Jan-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae1017
PMID:39470718
|
研究论文 | 介绍了一个整合植物非编码RNA和ncRNA编码肽数据的综合数据库ncPlantDB | 首个提供植物ncRNA编码肽信息和细胞类型特异性相互作用网络的综合数据库 | NA | 构建一个包含ncPEP信息和细胞类型特异性相互作用的植物ncRNA数据库 | 43种植物物种的非编码RNA和ncRNA编码肽 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, Ribo-seq分析, 文献挖掘 | NA | 基因组数据, 序列数据, 相互作用数据 | 包含353,140个ncRNAs, 3,799个ncPEPs和4,647,071个相互作用 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2080 | 2025-10-07 |
scLTdb: a comprehensive single-cell lineage tracing database
2025-Jan-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae913
PMID:39470724
|
研究论文 | 开发了一个全面的单细胞谱系追踪数据库scLTdb，包含109个经过人工整理和标准化分析的数据集 | 首次构建了专门针对单细胞谱系追踪技术的综合数据库，提供交互式分析模块和细胞命运相关基因特征识别功能 | NA | 构建单细胞谱系追踪数据库以促进对细胞命运决定和谱系分化的理解 | 单细胞谱系追踪数据集 | 生物信息学 | NA | 单细胞谱系追踪技术 | NA | 单细胞测序数据 | 109个数据集 | NA | 单细胞谱系追踪 | NA | NA |