单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 2148 篇文献，本页显示第 2061 - 2080 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2061 | 2025-01-06 |
Macrophage HERC6 Promotes NAFLD: Integrated Analyses of Mendelian Randomization and Single-Cell Transcriptome
2025-Jan-01, Combinatorial chemistry & high throughput screening
IF:1.6Q3
|
研究论文 | 本研究探讨了HERC6相关免疫反应与非酒精性脂肪肝病（NAFLD）之间的关系，并筛选了新型治疗药物 | 结合孟德尔随机化和单细胞转录组分析，揭示了HERC6在NAFLD中的关键作用，并筛选出潜在治疗药物 | 研究主要依赖于公开数据集，可能受限于数据的质量和样本量 | 探索HERC6相关免疫反应与NAFLD的关系，并筛选治疗药物 | NAFLD患者及肥胖患者的肝脏样本 | 生物信息学 | 非酒精性脂肪肝病 | 孟德尔随机化、单细胞RNA测序、药物敏感性评估 | NA | RNA测序数据 | 公开数据集GSE168933和GSE83452中的肝脏样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2062 | 2025-01-05 |
Spatial transcriptomics in bone mechanomics: Exploring the mechanoregulation of fracture healing in the era of spatial omics
2025-Jan-03, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adp8496
PMID:39742473
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于空间转录组学的“力学组学”平台，用于探索骨折愈合中的机械调控机制 | 该平台整合了时间序列的体内微计算机断层扫描、空间转录组学和微有限元分析，能够在空间上解析细胞分子特征与其局部体内机械环境的关系 | NA | 研究骨折愈合过程中细胞对局部机械应力的转录组反应 | 骨折部位的细胞 | 数字病理学 | 骨折 | 空间转录组学、微计算机断层扫描、微有限元分析 | NA | 空间转录组数据、图像数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2063 | 2025-01-05 |
A joint analysis of single cell transcriptomics and proteomics using transformer
2025-Jan-02, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-024-00484-9
PMID:39743530
|
研究论文 | 本文提出了一种基于Transformer编码器层的深度学习框架scTEL，用于从单细胞RNA测序数据预测未观察到的蛋白质表达 | scTEL模型通过计算方式显著降低了蛋白质表达测序的实验成本，并提供了一个统一框架来整合多个CITE-seq数据集 | 未提及具体局限性 | 揭示细胞异质性，降低蛋白质表达测序的实验成本 | 单细胞RNA和蛋白质表达数据 | 机器学习 | NA | CITE-seq, scRNA-seq | Transformer | RNA和蛋白质表达数据 | 公共CITE-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 2064 | 2025-01-02 |
Single-cell sequencing analysis reveals cetuximab resistance mechanism and salvage strategy in colorectal cancer
2025-Jan, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70151
PMID:39739554
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2065 | 2025-01-05 |
CircMVP promotes METTL3 activation mediated CTNNB1 m6A modification in the inhibition of colorectal cancer in B7-H3 dependence antitumor immunity
2025, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.105324
PMID:39744434
|
研究论文 | 本研究探讨了环状RNA circMVP在结直肠癌（CRC）中通过促进METTL3激活介导的CTNNB1 m6A修饰，抑制B7-H3依赖的抗肿瘤免疫反应的机制 | 揭示了circMVP通过METTL3介导的m6A修饰调控β-catenin表达，进而影响B7-H3依赖的抗肿瘤免疫反应的新机制 | 研究主要基于体外实验和动物模型，临床样本的验证仍需进一步扩大 | 阐明circRNA与结直肠癌抗肿瘤免疫抑制之间的调控关系 | 结直肠癌患者样本和细胞系 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | qRT-PCR、RNA pull-down、单细胞RNA测序、EMSA、RNA免疫沉淀、染色质免疫沉淀、多核糖体分析 | NA | RNA测序数据、临床样本数据 | 结直肠癌患者样本和细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 2066 | 2025-01-05 |
Genetically Predicted Immune Cell Traits Mediate the Causal Association Between Plasma Metabolites and Colorectal Cancer
2025, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.101011
PMID:39744475
|
研究论文 | 本研究通过两步两样本孟德尔随机化方法，评估了1400种血浆代谢物、731种免疫细胞特征与结直肠癌之间的因果关系，并探讨了免疫细胞特征在其中的中介作用 | 首次使用两步两样本孟德尔随机化方法，结合单细胞RNA测序技术，揭示了血浆代谢物通过特定免疫细胞特征影响结直肠癌的因果机制 | 研究依赖于GWAS汇总数据，可能受到混杂因素的影响，且样本量虽大但具体样本类型未明确说明 | 探讨血浆代谢物与结直肠癌之间的因果关系，以及免疫细胞特征在其中的中介作用 | 1400种血浆代谢物、731种免疫细胞特征与结直肠癌 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 两步两样本孟德尔随机化(MR)、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因组关联研究(GWAS)汇总数据、单细胞RNA测序数据 | NA（未明确说明具体样本数量，但涉及1400种血浆代谢物和731种免疫细胞特征） | NA | NA | NA | NA |
| 2067 | 2025-01-05 |
Mitochondrial Gene Scoring System: Predicting Prognosis and Precision Therapy for TACE Non-Response in Hepatocellular Carcinoma Patients
2025, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.103946
PMID:39744494
|
研究论文 | 本文开发了两个独立的线粒体评分系统，用于预测肝细胞癌（HCC）患者的预后和经动脉化疗栓塞（TACE）无反应的可能性 | 开发了两个独立的线粒体评分系统（RPS和RDS），用于预测HCC患者的预后和TACE无反应的可能性，并探索了TACE无反应患者的替代疗法 | 未提及具体样本量，可能限制了结果的普遍性 | 预测HCC患者的预后和TACE无反应的可能性，并探索替代疗法 | 肝细胞癌（HCC）患者 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | LASSO Cox回归分析、LASSO逻辑回归分析 | 基因数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2068 | 2025-01-05 |
Cell-type-specific regulators landscape and regulatory mechanisms underlying pyroptosis in uterine corpus endometrial carcinoma
2025, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.100547
PMID:39744500
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，研究了子宫体子宫内膜癌（UCEC）中与细胞焦亡相关基因的景观及其调控机制 | 首次在UCEC组织中通过单细胞RNA测序揭示了细胞焦亡相关基因的表达模式，并验证了其在肿瘤组织中的异常病理特征 | 研究主要依赖于单细胞RNA测序数据，可能受到样本量和数据质量的限制 | 探讨UCEC中细胞焦亡相关基因的表达模式及其在肿瘤发生和发展中的作用 | 6089个UCEC组织细胞 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq），RNA测序，定量实时PCR，免疫组织化学 | NA | RNA测序数据，病理图像 | 6089个UCEC组织细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 2069 | 2025-01-05 |
The cellular signaling crosstalk between memory B cells and tumor cells in nasopharyngeal carcinoma cannot be overlooked: Their involvement in tumor progression and treatment strategy is significant
2025, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.101420
PMID:39744570
|
研究论文 | 本研究通过单细胞多组学分析探讨了鼻咽癌中B细胞亚群的分子生物标志物和预后因素，并研究了其潜在机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术全面分析了鼻咽癌中B细胞亚群的多样性及其与肿瘤细胞的相互作用，揭示了C4 CD86+记忆B细胞在肿瘤进展中的关键作用 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据，缺乏体内实验验证，且样本量有限，可能影响结果的普适性 | 探讨鼻咽癌中B细胞亚群的分子机制及其在肿瘤进展和治疗中的作用 | 鼻咽癌患者肿瘤和血液样本中的B细胞亚群 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序 | PCA, Monocle, Slingshot, CellChat, LASSO回归, Cox回归 | 单细胞RNA测序数据 | 鼻咽癌患者的肿瘤和血液样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2070 | 2025-01-05 |
Unveiling the Prognostic Power and Immune Landscape of MyD88 in Breast Cancer: an Integrative Bioinformatics and IHC Approach
2025, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.103403
PMID:39744584
|
研究论文 | 本研究结合生物信息学和免疫组织化学方法，探讨了MyD88在乳腺癌中的预后意义和免疫学影响 | 首次整合bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq和IHC技术，全面分析MyD88在乳腺癌中的表达及其与免疫景观的关联 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步的实验验证来确认MyD88的机制和治疗潜力 | 探索MyD88在乳腺癌中的预后价值和免疫学作用 | 乳腺癌患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 免疫组织化学(IHC) | NA | RNA-seq数据, 单细胞RNA-seq数据, 免疫组织化学图像 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2071 | 2025-01-05 |
Integrated Mendelian Randomization and Single-Cell Transcriptomics Analysis Identifies Critical Blood Biomarkers and Potential Mechanisms in Epilepsy
2025-Jan, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.70172
PMID:39753851
|
研究论文 | 本研究通过整合孟德尔随机化和单细胞转录组学分析，识别了与癫痫相关的关键血液生物标志物和潜在机制 | 结合孟德尔随机化和单细胞转录组学分析，揭示了癫痫的遗传倾向和免疫环境动态，并开发了抗癫痫药物反应的预测模型 | 研究主要基于外周血样本和动物模型，可能无法完全反映人类大脑中的复杂情况 | 探索癫痫的遗传因素和免疫环境动态，识别关键基因和潜在机制 | 癫痫患者的外周血样本和癫痫小鼠模型 | 基因组学 | 癫痫 | 孟德尔随机化、单细胞转录组学分析、eQTLGen、全基因组关联研究、CIBERSORT | 预测模型 | 基因表达数据、蛋白质组数据 | 癫痫患者的外周血样本和癫痫小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 2072 | 2025-01-04 |
Single-cell RNA sequencing: an emerging tool revealing dysregulated innate and adaptive immune response at single cell level in Kawasaki disease
2025-Jan, Expert review of clinical immunology
IF:3.9Q2
DOI:10.1080/1744666X.2024.2401105
PMID:39230194
|
综述 | 本文探讨了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在揭示川崎病（KD）中失调的先天和适应性免疫反应中的关键作用 | 利用scRNA-seq技术，以比以往方法更高的分辨率揭示KD的病理生理学，特别是在免疫细胞转录组特征和信号/反应途径方面的应用 | 尽管scRNA-seq提供了高分辨率的细胞水平数据，但其在KD中的诊断、预后和治疗潜力仍需进一步研究验证 | 探讨scRNA-seq在KD中的诊断、预后和治疗潜力，并重新强调其在KD免疫细胞转录组特征和信号/反应途径中的关键作用 | 川崎病（KD）患者的免疫细胞 | 数字病理学 | 川崎病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2073 | 2025-01-04 |
Decreased miR-486-5p is involved in lipopolysaccharide-induced HTR-8/SVneo cell dysfunction by promoting SMAD2 expression
2025-Jan-01, Reproduction (Cambridge, England)
DOI:10.1530/REP-23-0502
PMID:39475824
|
研究论文 | 本研究揭示了miR-486-5p/Smad2通路在脂多糖（LPS）诱导的绒毛外滋养层细胞（EVT）功能障碍及早期妊娠丢失（EPL）发病机制中的作用 | 首次揭示了miR-486-5p通过调控SMAD2表达在LPS诱导的EVT功能障碍及EPL中的具体分子机制 | 研究主要基于细胞模型，缺乏体内实验验证 | 探讨miR-486-5p在早期妊娠丢失中的作用及其分子机制 | HTR-8/SVneo细胞系及人类蜕膜单细胞RNA测序数据 | 分子生物学 | 妊娠并发症 | 单细胞RNA测序 | 细胞模型 | RNA测序数据 | 人类蜕膜单细胞RNA测序数据集及GEO数据库中的转录组数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 2074 | 2025-01-03 |
Single-cell omics: experimental workflow, data analyses and applications
2025-Jan, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-023-2561-0
PMID:39060615
|
综述 | 本文全面总结了单细胞组学技术的最新进展，特别是方法学部分 | 单细胞组学技术在生物医学领域具有突破性进展，提供了对复杂疾病（如癌症）的深刻理解 | NA | 指导研究人员选择适当的单细胞测序及相关数据分析方法 | 单细胞组学技术 | 生物医学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 单细胞组学数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2075 | 2025-01-03 |
A specific inflammatory suppression fibroblast subpopulation characterized by MHCII expression in human dilated cardiomyopathy
2025-Jan, Molecular and cellular biochemistry
IF:3.5Q3
DOI:10.1007/s11010-024-04939-9
PMID:38462549
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，识别了人类扩张型心肌病（DCM）中一种特定的抗原呈递成纤维细胞亚群，并探讨了其在炎症抑制中的作用 | 首次识别并描述了DCM中一种特定的抗原呈递成纤维细胞亚群（apFB），并揭示了其在炎症抑制中的关键作用 | 研究样本量较小，仅包括4个健康供体和6个DCM患者的心脏组织 | 探讨扩张型心肌病（DCM）中成纤维细胞的异质性及其与免疫细胞的相互作用 | 人类左心室组织，包括健康供体和DCM患者的心脏组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（ScRNA-Seq） | NA | RNA测序数据 | 10个心脏组织（4个健康供体和6个DCM患者） | NA | NA | NA | NA |
| 2076 | 2025-01-03 |
The heterogeneity of cellular metabolism in the tumour microenvironment of hepatocellular carcinoma with portal vein tumour thrombus
2025-Jan, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13738
PMID:39189673
|
研究论文 | 本研究通过多组学组合全面分析了肝细胞癌（HCC）、门静脉癌栓（PVTT）和正常肝样本的代谢异质性 | 首次在多组学水平上描绘了HCC和PVTT中非恶性细胞的代谢异质性景观，并确定了PVTT形成和发展的代谢特征 | NA | 研究肝细胞癌及其门静脉癌栓的代谢异质性 | 肝细胞癌（HCC）、门静脉癌栓（PVTT）和正常肝样本 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、荧光多重免疫组化 | NA | RNA测序数据、空间转录组数据、免疫组化数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2077 | 2025-01-03 |
Dissecting the cell microenvironment of ovarian endometrioma through single-cell RNA sequencing
2025-Jan, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2638-9
PMID:39470923
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术解析卵巢子宫内膜异位囊肿的细胞微环境 | 首次在单细胞水平上对卵巢子宫内膜异位囊肿的细胞微环境进行了全面解析，并识别了与疾病相关的关键细胞类型和分子特征 | 研究样本量相对较小，且未涉及长期随访数据 | 揭示卵巢子宫内膜异位囊肿的分子和细胞机制，以改善诊断和治疗策略 | 卵巢子宫内膜异位囊肿患者的子宫内膜组织 | 数字病理学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 超过52,000个单细胞，来自卵巢子宫内膜异位囊肿患者和健康捐赠者的子宫内膜组织 | NA | NA | NA | NA |
| 2078 | 2025-01-03 |
Resolving the developmental mechanisms of cardiac microthrombosis of SARS-CoV-2 based on single-cell transcriptome analysis
2025-Jan, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-023-2624-9
PMID:39470924
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析，探讨了SARS-CoV-2感染引起的心脏微血栓形成的发育机制 | 首次通过单细胞测序技术揭示了SARS-CoV-2感染心脏微血栓形成过程中，MYO1ERASGEF1B单核细胞衍生巨噬细胞在免疫系统过度激活和外在凝血途径启动中的关键作用 | 研究样本量有限，且仅针对右心室游离壁组织，可能无法全面反映心脏其他部位的情况 | 研究SARS-CoV-2感染引起的心脏微血栓形成的分子机制 | 健康供体、在特征性凝血异常（CAC）高凝期死亡的患者、在CAC纤溶期死亡的患者的心脏组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 61,187个细胞，包含24种免疫细胞亚群和13种心脏驻留细胞亚群 | NA | NA | NA | NA |
| 2079 | 2025-01-03 |
Bayesian Phylogenetic Lineage Reconstruction with Loss of Heterozygosity Mutations Derived from Single-Cell RNA Sequencing
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4310-5_1
PMID:39745633
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于单细胞RNA测序的贝叶斯方法，用于从推断的杂合性缺失（LOH）事件重建细胞谱系 | 使用单细胞RNA测序数据，结合贝叶斯方法重建细胞谱系，并标注细胞表型和发育时间点 | 该方法目前仅应用于特定小鼠模型，尚未广泛验证 | 研究细胞谱系重建方法，以了解细胞发育历史 | Emx1+皮质投射神经元和胶质细胞谱系 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 贝叶斯模型 | RNA测序数据 | C57Bl/6J (B6) 和 CAST/EiJ (CA) 杂交F1小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 2080 | 2025-01-03 |
Lineage Recording in Human Brain Organoids with iTracer
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4310-5_5
PMID:39745637
|
研究论文 | 本文详细介绍了iTracer在人类大脑类器官中记录细胞谱系的应用协议 | iTracer结合了报告基因条形码和可诱导的CRISPR-Cas9标记，与单细胞和空间转录组学兼容，用于探索大脑类器官发育过程中的克隆性和谱系动态 | NA | 研究人类器官发育过程中的细胞谱系关系 | 人类大脑类器官 | 生物医学工程 | NA | iTracer, 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 单细胞和空间转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |