单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202501-202501] [清除筛选条件]
当前共找到 2148 篇文献,本页显示第 2041 - 2060 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
2041 2025-01-07
Single-cell RNA-sequencing and genome-wide Mendelian randomisation along with abundant machine learning methods identify a novel B cells signature in gastric cancer
2025-Jan-06, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和全基因组孟德尔随机化结合多种机器学习方法,识别出胃癌中的一种新型B细胞特征 结合单细胞RNA测序、孟德尔随机化和机器学习方法,识别出胃癌中的新型B细胞特征,并发现NFKBIE作为潜在的生物标志物和治疗靶点 研究依赖于公开数据库的数据,可能存在样本选择偏差 识别胃癌中的新型B细胞特征,并探索其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 胃癌患者的单细胞RNA测序数据和批量RNA测序数据 数字病理学 胃癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、批量RNA测序、孟德尔随机化、机器学习 机器学习集成方法 RNA测序数据 从GEO数据库获取的单细胞RNA测序数据集 NA NA NA NA
2042 2025-01-07
Optimized methods for scRNA-seq and snRNA-seq of skeletal muscle stored in nucleic acid stabilizing preservative
2025-Jan-04, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本文开发了一种从保存在Allprotect®组织试剂中的人类骨骼肌中获取高质量细胞和细胞核的协议,用于单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单核RNA测序(snRNA-seq) 开发了一种从存档组织中获取高质量单细胞基因组材料的新协议,解决了国际多中心研究和存档组织研究中新鲜起始材料的障碍 流式细胞仪分选虽然成功富集了更高质量的细胞和细胞核,但导致输入材料总体减少 优化从存档骨骼肌组织中获取高质量单细胞和单核RNA测序材料的方法 人类骨骼肌组织 单细胞测序 NA scRNA-seq, snRNA-seq NA RNA测序数据 NA NA NA NA NA
2043 2025-01-07
The molecular mechanism of gemcitabine in inhibiting the HIF-1α/VEGFB/FGF2/FGFR1 signaling pathway for ovarian cancer treatment
2025-Jan-03, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过分析卵巢癌单细胞RNA测序数据和吉西他滨治疗后的转录组数据,揭示了缺氧诱导因子1α(HIF-1α)在调节治疗过程中的关键作用 揭示了HIF-1α在吉西他滨治疗卵巢癌中的分子机制,特别是其通过调节VEGF-B表达抑制FGF2/FGFR1信号通路的角色 研究主要基于体外实验,需要进一步的体内实验验证 探索吉西他滨治疗卵巢癌的分子机制 卵巢癌细胞 分子生物学 卵巢癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq),转录组分析 NA RNA测序数据,转录组数据 NA NA NA NA NA
2044 2025-01-07
Machine learning based identification of an amino acid metabolism related signature for predicting prognosis and immune microenvironment in pancreatic cancer
2025-Jan-03, BMC cancer IF:3.4Q2
研究论文 本研究通过整合10种机器学习算法,识别出与胰腺癌预后和免疫微环境相关的氨基酸代谢特征,并验证了其在不同队列中的有效性 结合10种机器学习方法,首次识别出基于4个基因的氨基酸代谢特征,并揭示了其与胰腺癌预后、免疫微环境及治疗反应的关联 研究依赖于机器学习算法的组合,可能存在模型选择和参数优化的局限性 探索氨基酸代谢特征在胰腺癌预后和免疫微环境中的作用 胰腺癌患者 机器学习 胰腺癌 机器学习算法、GSEA、TMB分析、药物敏感性分析、CIBERSORT、ssGSEA、单细胞转录组学、qPCR、免疫组化 多种机器学习算法组合 基因表达数据、单细胞转录组数据、临床数据 内部和外部队列的胰腺癌患者样本 NA NA NA NA
2045 2025-01-07
Potential role of P4HB in the tumor microenvironment and its clinical prognostic value: a comprehensive pan-cancer analysis and experimental validation with a focus on KIRC
2025-Jan-03, Cancer cell international IF:5.3Q1
研究论文 本文通过全面的泛癌分析和实验验证,探讨了P4HB在肿瘤微环境中的潜在作用及其在肾透明细胞癌(KIRC)中的临床预后价值 首次全面分析了P4HB在泛癌中的表达及其与肿瘤微环境的关系,并通过实验验证了P4HB在肾透明细胞癌中的致癌作用 研究主要基于TCGA和HPA数据库,实验验证仅限于肾透明细胞癌细胞,未涉及其他癌症类型 探讨P4HB在肿瘤微环境中的作用及其在肾透明细胞癌中的临床预后价值 泛癌数据及肾透明细胞癌细胞 数字病理学 肾癌 单细胞测序、免疫细胞浸润分析、集落形成实验、伤口愈合实验 NA RNA和蛋白质表达数据 TCGA数据库中的泛癌数据及肾透明细胞癌细胞 NA NA NA NA
2046 2025-01-07
Aspiration of acidified milk induces milk allergy by activating alveolar macrophages in mice
2025-Jan, Allergology international : official journal of the Japanese Society of Allergology IF:6.2Q1
研究论文 本研究通过开发一种新型小鼠模型,探讨了胃食管反流(GER)在牛奶过敏(CMA)发展中的潜在致病机制,并阐明了肺部先天免疫与CMA之间的免疫学联系 开发了一种利用天然抗原并遵循生理性气道致敏途径的新型小鼠模型,命名为酸化牛奶吸入诱导过敏模型,该模型可能更接近临床场景 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人体中验证 探讨胃食管反流在牛奶过敏发展中的作用及其免疫学机制 小鼠 免疫学 牛奶过敏 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 小鼠模型 RNA测序数据 未明确提及具体样本数量 NA NA NA NA
2047 2025-01-07
TPD52 as a Therapeutic Target Identified by Machine Learning Shapes the Immune Microenvironment in Breast Cancer
2025-Jan, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2
研究论文 本研究利用机器学习方法探讨了肿瘤蛋白D52(TPD52)在乳腺癌中作为关键免疫调节因子的作用 通过机器学习方法识别TPD52作为乳腺癌免疫微环境的关键调节因子,并结合单细胞RNA测序和体外验证进行研究 未提及具体样本量,可能限制了结果的普适性 探讨TPD52在乳腺癌免疫微环境中的作用及其作为治疗靶点的潜力 乳腺癌及其免疫微环境 机器学习 乳腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA测序数据 NA NA NA NA NA
2048 2025-01-06
Increased lamina propria B cells play roles in fructose-induced hypertension of Dahl salt-sensitive rats
2025-Jan-15, Life sciences IF:5.2Q1
研究论文 本文研究了高果糖饮食对Dahl盐敏感大鼠高血压的影响,特别是肠道固有层B细胞的作用 通过单细胞RNA测序技术,首次揭示了高果糖饮食诱导的高血压中肠道固有层B细胞的作用 研究仅针对Dahl盐敏感大鼠,未涉及其他动物模型或人类样本 探讨高果糖饮食诱导的高血压中免疫细胞的作用 Dahl盐敏感大鼠和Dahl盐抵抗大鼠 免疫学 高血压 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA序列数据 Dahl盐敏感大鼠和Dahl盐抵抗大鼠,每组接受自来水或20%果糖溶液4周 NA NA NA NA
2049 2025-01-06
Transcriptomic DN3 clock neuron subtypes regulate Drosophila sleep
2025-Jan-03, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 本文利用单细胞RNA测序技术,对果蝇大脑中的时钟神经元进行了全面的转录组细胞类型普查,特别关注了DN3神经元亚型及其在睡眠调节中的作用 首次对果蝇大脑中DN3时钟神经元进行了全面的转录组分析,揭示了其12个不同的基因表达簇,并发现这些神经元通过G蛋白偶联受体促进睡眠 研究主要集中于果蝇模型,结果在人类或其他哺乳动物中的适用性尚不明确 探索时钟神经元在睡眠调节中的作用 果蝇大脑中的DN3时钟神经元 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 果蝇大脑中的DN3时钟神经元 NA NA NA NA
2050 2025-01-06
Transcriptome and DNA methylation profiling during the NSN to SN transition in mouse oocytes
2025-Jan-03, BMC molecular and cell biology IF:2.4Q4
研究论文 本研究通过单细胞转录组和DNA甲基化分析,探讨了小鼠卵母细胞从非包围核仁(NSN)到包围核仁(SN)阶段的转变过程中的分子变化 开发了一个分类器,能够从单细胞或批量RNA-seq数据中推断染色质状态,并识别了SN卵母细胞中与不寻常染色质修饰组合相关的晚期甲基化区域 研究主要集中在小鼠卵母细胞,结果可能不直接适用于其他物种 探讨小鼠卵母细胞在NSN到SN转变过程中的转录组和DNA甲基化变化 小鼠卵母细胞 生物信息学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、单细胞亚硫酸氢盐测序(scBS-seq) NA 单细胞转录组数据、DNA甲基化数据 NA NA NA NA NA
2051 2025-01-06
Inhibition of METTL14 overcomes CDK4/6 inhibitor resistance driven by METTL14-m6A-E2F1-axis in ERα-positive breast cancer
2025-Jan-03, Journal of nanobiotechnology IF:10.6Q1
研究论文 本文研究了ERα阳性乳腺癌中CDK4/6抑制剂耐药性的机制,并提出了通过抑制METTL14来克服耐药性的策略 首次通过全基因组CRISPR/Cas9文库筛选结合单细胞测序技术,鉴定出METTL14是CDK4/6抑制剂敏感性的决定因素,并发现了一种新型METTL14抑制剂WKYMVM 研究主要基于实验室模型和临床样本,尚未进行大规模临床试验验证 探索ERα阳性乳腺癌中CDK4/6抑制剂耐药性的机制,并寻找克服耐药性的方法 ERα阳性乳腺癌细胞和临床样本 癌症研究 乳腺癌 全基因组CRISPR/Cas9文库筛选、单细胞测序 NA 基因表达数据、临床样本数据 临床样本和实验室模型 NA NA NA NA
2052 2025-01-06
Specifically blocking αvβ8-mediated TGF-β signaling to reverse immunosuppression by modulating macrophage polarization
2025-Jan-02, Journal of experimental & clinical cancer research : CR IF:11.4Q1
研究论文 本文研究了通过特异性阻断αvβ8介导的TGF-β信号通路来逆转免疫抑制,并通过调节巨噬细胞极化来抑制肿瘤生长 开发了一种特异性抗αvβ8抗体130H2,并通过单细胞RNA测序和冷冻电镜单颗粒分析揭示了其作用机制,证明了其在体内外的高效抗肿瘤效果 αvβ8的表达谱仍存在争议,且抗αvβ8抗体的抗肿瘤机制尚未完全阐明 研究αvβ8在肿瘤中的表达及其在TGF-β信号通路中的作用,开发并评估特异性抗αvβ8抗体的抗肿瘤效果 人类肿瘤样本、小鼠模型、人类外周血单核细胞(PBMCs)、巨噬细胞、食蟹猴 肿瘤免疫学 肿瘤 单细胞RNA测序、冷冻电镜单颗粒分析、药代动力学研究 NA RNA测序数据、冷冻电镜图像、药代动力学数据 多种人类肿瘤样本、小鼠模型、人类PBMCs、食蟹猴 NA NA NA NA
2053 2025-01-06
ImageDoubler: image-based doublet identification in single-cell sequencing
2025-Jan-02, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文介绍了一种基于图像的模型ImageDoubler,用于在单细胞测序中识别双联体和缺失样本 ImageDoubler利用Fluidigm单细胞测序图像数据,显著提高了双联体检测效率,F1分数比现有基于基因组的方法至少提高了33.1% 当前基于基因组的技术存在局限性,尤其是在同质细胞群体中效果不佳,并可能引入实验过程中的偏差 开发一种更有效的双联体检测方法,以解决单细胞测序中的数据误读问题 单细胞测序中的双联体和缺失样本 数字病理学 NA Fluidigm单细胞测序 基于图像的模型 图像 NA NA NA NA NA
2054 2025-01-06
Molecular and spatial analysis of tertiary lymphoid structures in Sjogren's syndrome
2025-Jan-02, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文通过结合单细胞RNA测序、空间转录组学和蛋白质组学技术,研究了Sjogren综合征和干燥综合征患者小唾液腺中的三级淋巴结构,构建了其形成和功能关键成分的细胞和空间图谱 确认了成纤维细胞状态的存在,并识别了具有潜在免疫功能的周细胞/壁细胞状态,为自身免疫和癌症中与三级淋巴结构相关的情况提供了关键治疗线索 NA 研究三级淋巴结构在Sjogren综合征和干燥综合征中的形成和功能机制 Sjogren综合征和干燥综合征患者的小唾液腺 分子生物学 Sjogren综合征 单细胞RNA测序、空间转录组学、蛋白质组学 NA RNA序列数据、蛋白质数据 Sjogren综合征和干燥综合征患者的小唾液腺样本 NA NA NA NA
2055 2025-01-06
Trigger inducible tertiary lymphoid structure formation using covalent organic frameworks for cancer immunotherapy
2025-Jan-02, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文探讨了使用共价有机框架(COF)诱导三级淋巴结构(TLS)形成以增强癌症免疫治疗效果的方法 利用共价有机框架(COF)诱导TLS形成,并通过单细胞测序分析揭示了其通过促进细胞因子过度分泌来实现的机制 研究仅在MC38和4MOSC1两种雌性肿瘤模型中进行验证,尚未在更广泛的肿瘤类型中测试 探索诱导TLS形成的有效策略以增强癌症免疫治疗效果 三级淋巴结构(TLS)和共价有机框架(COF) 癌症免疫治疗 癌症 单细胞测序分析 MC38和4MOSC1雌性肿瘤模型 NA NA NA NA NA NA
2056 2025-01-06
Spatiotemporal dynamics of early oogenesis in pigs
2025-Jan-02, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序(scRNA-seq)和空间转录组学(ST)技术,探索了猪早期卵子发生过程中的时空基因表达谱和卵巢微环境的空间组织 首次揭示了猪卵巢中生殖细胞在卵子发生过程中的“皮质到髓质”分布模式,并验证了NOTCH信号和细胞外基质蛋白在调控生殖细胞命运中的关键作用 研究主要基于猪模型,尽管与人类具有保守性,但仍需进一步验证其在人类中的适用性 探索早期卵子发生的时空动态及其调控机制 猪卵巢中的生殖细胞和体细胞 生物信息学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间转录组学(ST) NA 基因表达数据、空间转录组数据 猪卵巢组织 NA NA NA NA
2057 2025-01-06
Gastric cancer-derived exosomal let-7 g-5p mediated by SERPINE1 promotes macrophage M2 polarization and gastric cancer progression
2025-Jan-02, Journal of experimental & clinical cancer research : CR IF:11.4Q1
研究论文 本研究揭示了胃癌细胞通过SERPINE1调控外泌体let-7 g-5p转移,促进巨噬细胞M2极化的新机制 首次发现SERPINE1通过调控外泌体let-7 g-5p转移促进巨噬细胞M2极化,为胃癌免疫治疗提供了新的靶点 研究主要基于体外实验和小鼠模型,临床转化仍需进一步验证 揭示胃癌细胞中SERPINE1驱动恶性表型和M2巨噬细胞极化的分子机制,为选择性靶向M2极化TAMs提供新的治疗靶点 胃癌细胞和巨噬细胞 肿瘤免疫学 胃癌 单细胞测序、外泌体干预实验、小RNA测序、Western blotting、CoIP实验、蛋白质芯片、ChIP实验、双荧光素酶报告实验 NA 转录组数据、临床数据、单细胞测序数据、外泌体RNA数据 胃癌组织和邻近组织样本、小鼠异种移植肿瘤模型 NA NA NA NA
2058 2025-01-06
Pan-cancer drivers of metastasis
2025-Jan-02, Molecular cancer IF:27.7Q1
研究论文 本文通过单细胞转录组分析研究了六种癌症类型中转移性和非转移性肿瘤的基因调控程序,揭示了驱动转移进展的核心基因特征和转录因子网络 发现了SP1和KLF5作为关键调控因子,分别在多个癌症类型的转移过程中发挥驱动和抑制作用,并揭示了SP1在癌细胞生存、侵袭性生长和转移定植中的角色 研究样本仅限于六种癌症类型,可能无法完全代表所有癌症的转移机制 揭示跨癌症转移的核心基因调控程序 六种癌症类型中的转移性和非转移性肿瘤 癌症研究 癌症 单细胞转录组分析 NA 转录组数据 超过200名患者的肿瘤样本 NA NA NA NA
2059 2025-01-06
CD206+ Trem2+ macrophage accumulation in the murine knee joint after injury is associated with protection against post-traumatic osteoarthritis in MRL/MpJ mice
2025, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本文研究了小鼠膝关节损伤后CD206+ Trem2+巨噬细胞的积累与MRL/MpJ小鼠对创伤后骨关节炎的保护作用之间的关系 通过单细胞RNA测序技术,揭示了MRL/MpJ小鼠在创伤后骨关节炎中表现出更强的抗炎反应,特别是CD206+ Trem2+巨噬细胞的富集 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中进行验证 探讨创伤后骨关节炎(PTOA)发展或消退的分子机制 C57BL/6J(B6)和MRL/MpJ(MRL)小鼠的膝关节 数字病理学 骨关节炎 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 C57BL/6J(B6)和MRL/MpJ(MRL)小鼠的膝关节样本 NA NA NA NA
2060 2025-01-06
Uncovering NK cell sabotage in gut diseases via single cell transcriptomics
2025, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学揭示了自然杀伤(NK)细胞在肠道疾病中的破坏作用,并比较了溃疡性结肠炎(UC)和结直肠癌(CRC)的免疫病理反应 首次通过单细胞RNA测序数据集分析了UC和CRC患者结肠组织中的免疫细胞特征,并揭示了UC和CRC中NK细胞介导的免疫反应及其特异性通路 研究样本量未明确说明,且未探讨其他免疫细胞在UC和CRC中的潜在作用 揭示UC和CRC的免疫微环境及NK细胞介导的免疫反应,为免疫治疗提供潜在靶点 健康供体、UC患者和CRC患者的结肠组织 单细胞转录组学 溃疡性结肠炎、结直肠癌 单细胞RNA测序、免疫染色、激光共聚焦显微镜 NA 单细胞RNA测序数据、图像数据 未明确说明 NA NA NA NA
回到顶部