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当前共找到 2188 篇文献，本页显示第 1981 - 2000 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1981 | 2025-10-07 |
GraphVelo allows for accurate inference of multimodal velocities and molecular mechanisms for single cells
2025-Jan-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.03.626638
PMID:39677753
|
研究论文 | 提出基于图机器学习的方法GraphVelo，用于从单细胞数据中准确推断多模态速度和分子机制 | 通过图机器学习方法将RNA速度扩展到多模态数据，保留向量大小和方向信息，揭示基因、病毒与宿主细胞之间的定量非线性调控关系 | 需要依赖现有方法推断的RNA速度作为输入，对复杂转录动态、低表达或缺乏剪接动态的基因可能仍有局限 | 开发能够从高通量单细胞快照数据中提取时间分辨信息的方法 | 单细胞数据，包括病毒-宿主相互作用组和多组学数据集 | 机器学习 | NA | scRNA-seq, 多组学分析 | 图机器学习 | 单细胞RNA测序数据，多模态数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，多组学 | NA | NA |
| 1982 | 2025-02-06 |
Biologically inspired heterogeneous learning for accurate, efficient and low-latency neural network
2025-Jan, National science review
IF:16.3Q1
DOI:10.1093/nsr/nwae301
PMID:39758128
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研究论文 | 本文提出了一种受生物启发的异质学习机制，用于构建准确、高效且低延迟的神经网络 | 结合了自抑制突触和神经元异质性的神经科学发现，创新性地提出了具有增强学习和记忆能力的脉冲神经网络（SNN） | 未明确提及具体限制 | 追求与生物神经网络相媲美的准确性、效率和低延迟的人工神经网络 | 脉冲神经网络（SNN）及其在AI任务中的应用 | 机器学习 | 脑部疾病 | scRNA-seq | SNN | 单细胞RNA测序数据 | 未明确提及具体样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 1983 | 2025-02-05 |
Bioinformatics combining machine learning and single-cell sequencing analysis to identify common mechanisms and biomarkers of rheumatoid arthritis and ischemic heart failure
2025-Jan-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2025.e41641
PMID:39897930
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研究论文 | 本研究结合机器学习和单细胞测序分析，旨在识别类风湿性关节炎（RA）和缺血性心力衰竭（IHF）的共同机制和生物标志物 | 通过整合多个RA和IHF数据集的RNA测序数据，识别出177个共同差异表达基因，并通过PPI网络分析和机器学习确定了五个枢纽基因，揭示了炎症免疫反应在RA患者IHF进展中的关键作用 | 研究依赖于现有数据集，可能受到样本量和数据质量的限制 | 识别RA和IHF的共同机制和生物标志物，为早期诊断、个性化治疗和预防策略提供方向 | 类风湿性关节炎（RA）和缺血性心力衰竭（IHF）患者 | 生物信息学 | 类风湿性关节炎, 缺血性心力衰竭 | RNA测序, 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 机器学习 | RNA测序数据 | 五个RA和IHF数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 1984 | 2025-02-05 |
Multi-omics analysis of core E3 ubiquitin ligase identifies prognostic biomarkers associated with immune infiltration and drug sensitivity in lung adenocarcinoma
2025, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.104837
PMID:39895786
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研究论文 | 本文通过多组学分析核心E3泛素连接酶，识别了与肺腺癌免疫浸润和药物敏感性相关的预后生物标志物 | 首次系统研究了E3泛素连接酶在肺腺癌中的表达、预后、免疫浸润、药物敏感性及潜在分子机制，并发现其与不良预后和特定免疫细胞浸润相关 | 研究主要基于数据库分析和计算机模拟，缺乏实验验证 | 研究E3泛素连接酶在肺腺癌中的调控作用及其作为预后和药物敏感性标志物的潜力 | 肺腺癌（LUAD）患者及肿瘤细胞系 | 生物信息学 | 肺癌 | 多组学分析、免疫荧光分析、免疫组化、单细胞分析、空间转录组学、分子对接 | NA | 基因表达数据、药物敏感性数据、免疫浸润数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1985 | 2025-02-05 |
Integrating of Radiomics and Single-cell Transcriptomics Uncovers the Crucial Role of γδ T Cells in Lung Adenocarcinoma
2025, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.105586
PMID:39895781
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研究论文 | 本研究通过整合放射组学和单细胞转录组学，揭示了γδ T细胞在肺腺癌中的关键作用 | 首次结合多组学数据研究γδ T细胞在肺腺癌中的功能，并建立了基于放射组学的预测模型 | γδ T细胞在肿瘤中的双重作用及其对肺腺癌的影响仍存在争议 | 探讨γδ T细胞在肺腺癌中的功能及其对免疫治疗的影响 | 肺腺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 放射组学、单细胞转录组学 | 预测模型 | CT图像、单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1986 | 2025-02-05 |
Integration of Single-Cell and Bulk Transcriptomes to Identify a Poor Prognostic Tumor Subgroup to Predict the Prognosis of Patients with Early-stage Lung Adenocarcinoma
2025, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.105926
PMID:39895784
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组数据，识别了早期肺腺癌的不良预后肿瘤亚群，并构建了预后模型 | 首次利用单细胞RNA测序技术研究早期肺腺癌的肿瘤微环境特征，并开发了一个基于KRT8和PERP的新型预后模型 | 研究主要依赖于已发表的文献和数据库中的细胞标记物，可能限制了新细胞类型的发现 | 研究早期肺腺癌的肿瘤微环境特征并开发预后模型 | 早期肺腺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），逆转录定量聚合酶链反应（RT-qPCR），蛋白质印迹（western blot） | 预后模型 | 转录组数据 | 未明确提及具体样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 1987 | 2025-02-05 |
Integrated Multi-omics Data Analysis and In Vitro Validation Reveal the Crucial Role of Glycogen Metabolism in Gastric Cancer
2025, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.104424
PMID:39895799
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研究论文 | 本研究旨在探讨胃癌中的糖原代谢，并开发基于糖原的风险评分模型以预测胃癌预后 | 首次整合多组学数据分析和体外验证，揭示了糖原代谢在胃癌中的关键作用，并开发了一个新的糖原风险评分模型 | 研究中使用的数据集主要来自公开数据库，可能缺乏某些特定人群的代表性 | 研究胃癌中的糖原代谢及其对预后的影响 | 胃癌患者及其相关数据 | 生物信息学 | 胃癌 | ssGSEA方法、共识聚类分析、单细胞测序 | 糖原风险评分模型 | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 33种肿瘤类型的患者表达谱、4个胃癌批量测序数据集、1个单细胞测序数据集、IMvigor210免疫治疗队列 | NA | NA | NA | NA |
| 1988 | 2025-02-05 |
Crotonylation-Related Prognostic Model of Esophageal Squamous Cell Carcinoma Based on Transcriptome Analysis and Single-Cell Sequencing Analysis
2025, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S493800
PMID:39895826
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学方法探讨了crotonylation相关基因在食管鳞状细胞癌（ESCC）中的作用，并构建了预后模型 | 首次在ESCC中研究了crotonylation相关基因的作用，并利用单细胞测序分析评估了细胞通讯和伪时间动态 | 研究依赖于公开数据集，未进行实验验证 | 探讨crotonylation相关基因在ESCC中的作用及其预后价值 | 食管鳞状细胞癌（ESCC）患者 | 生物信息学 | 食管癌 | 转录组分析、单细胞测序分析 | LASSO回归模型 | 基因表达数据 | 三个ESCC数据集，包含24个crotonylation相关基因 | NA | NA | NA | NA |
| 1989 | 2025-02-05 |
Sonic hedgehog medulloblastoma cells in co-culture with cerebellar organoids converge towards in vivo malignant cell states
2025 Jan-Dec, Neuro-oncology advances
IF:3.7Q2
DOI:10.1093/noajnl/vdae218
PMID:39896075
|
研究论文 | 本研究通过将Sonic hedgehog髓母细胞瘤（SHH-MB）细胞与小脑类器官共培养，探讨了非恶性肿瘤微环境对SHH-MB细胞表型特性的影响 | 开发了一种新型的体外SHH-MB模型，揭示了微环境对肿瘤细胞状态的非细胞自主性诱导作用 | 研究仅基于两种SHH-MB细胞系，可能无法完全代表所有SHH-MB亚型的特性 | 识别由非恶性肿瘤微环境驱动的SHH-MB细胞表型特性 | Sonic hedgehog髓母细胞瘤（SHH-MB）细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 两种SHH-MB细胞系与小脑类器官共培养 | NA | NA | NA | NA |
| 1990 | 2025-02-05 |
Single-cell analysis reveals islet autoantigen's immune activation in type 1 diabetes patients
2025-Jan, Journal of clinical biochemistry and nutrition
IF:2.0Q3
DOI:10.3164/jcbn.24-86
PMID:39896168
|
研究论文 | 本研究利用单细胞测序技术，全面检测了1型糖尿病患者外周血单核细胞在GAD、IA-2和胰岛素抗原重叠肽刺激下的基因表达和T细胞受体库 | 首次在单细胞水平上揭示了1型糖尿病患者胰岛自身抗原的免疫激活机制，并发现了T细胞受体β链在特定配对中的单克隆增加 | 样本量较小，仅包括20名男性患者，且仅对其中4名进行了BD Rhapsody系统分析 | 研究1型糖尿病的发病机制，寻找潜在的治疗靶点 | 1型糖尿病患者的外周血单核细胞 | 单细胞测序 | 1型糖尿病 | 单细胞测序，T细胞受体库分析 | NA | 单细胞基因表达数据，T细胞受体序列数据 | 20名男性1型糖尿病患者，其中4名进行了BD Rhapsody系统分析 | NA | NA | NA | NA |
| 1991 | 2025-02-05 |
CLEC11A-Driven Molecular Mechanisms in Intervertebral Disc Degeneration: A Comprehensive Multi-Omics Study
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S505296
PMID:39897524
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法探讨了CLEC11A在椎间盘退变（IVDD）中的分子机制 | 结合MR、转录组测序和单细胞转录组学，首次揭示了CLEC11A通过调控炎症介质ARTN和血清代谢物在IVDD中的关键作用 | 研究主要基于体外实验，缺乏体内实验验证 | 揭示IVDD的遗传发病机制和关键驱动因素 | 椎间盘退变（IVDD） | 生物信息学 | 椎间盘退变 | MR、转录组测序、单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据、单细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1992 | 2025-10-07 |
MetaQ: fast, scalable and accurate metacell inference via single-cell quantization
2025-Jan-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56424-6
PMID:39885131
|
研究论文 | 提出MetaQ算法，通过单细胞量化实现快速、可扩展且准确的元细胞推断 | 将元细胞概念化为生物学相似细胞的集体祖先，通过离散码本量化细胞，将计算复杂度从指数级降低到线性级 | NA | 克服大规模单细胞测序数据分析的计算障碍 | 单细胞测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | 量化算法 | 单细胞测序数据 | 数百万细胞规模的数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1993 | 2025-10-07 |
Role of hepatocyte RIPK1 in maintaining liver homeostasis during metabolic challenges
2025-Jan-31, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.96798
PMID:39886919
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研究论文 | 本研究揭示了肝细胞中RIPK1在代谢挑战期间维持肝脏稳态的关键作用 | 首次发现肝细胞特异性RIPK1缺失会增强短期禁食诱导的肝损伤和炎症反应 | 研究主要基于小鼠模型，人类相关性需要进一步验证 | 探究RIPK1在代谢应激下维持肝脏稳态的分子机制 | 肝细胞特异性RIPK1缺陷小鼠（雄性和雌性） | 分子生物学 | 肝病 | 单细胞RNA测序，转录组分析 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据，单细胞测序数据 | 肝细胞特异性RIPK1缺陷小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1994 | 2025-10-07 |
Combining Single-Cell RNA Sequencing and Mendelian Randomization to Explore Novel Drug Targets for Parkinson's Disease
2025-Jan-31, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-025-04700-3
PMID:39890696
|
研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序和孟德尔随机化方法探索帕金森病的新型药物靶点 | 首次将单细胞RNA测序与孟德尔随机化方法结合，系统分析细胞毒性CD4+T细胞在帕金森病中的作用并鉴定新的药物靶点 | 研究结果需要进一步的功能验证和临床试验确认 | 探索帕金森病的致病机制和潜在药物靶点 | 帕金森病患者和健康对照者的外周血T细胞 | 生物信息学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 伪时间序列分析, 细胞间通讯分析, 代谢通路分析, GO和KEGG富集分析 | 孟德尔随机化模型, 贝叶斯共定位分析 | 单细胞RNA测序数据, 全基因组关联研究数据, 批量转录组测序数据 | 帕金森病患者和健康对照者的外周血T细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量转录组测序 | NA | NA |
| 1995 | 2025-10-07 |
Assessment of XCI skewing and demonstration of XCI escape region based on single-cell RNA sequencing: comparison between female Grave's disease and control
2025-Jan-31, BMC molecular and cell biology
IF:2.4Q4
DOI:10.1186/s12860-025-00533-z
PMID:39891056
|
研究论文 | 基于单细胞RNA测序评估X染色体失活偏斜并鉴定XCI逃逸区域，比较女性Graves病与对照组的差异 | 首次在单细胞水平比较自身免疫性疾病（Graves病）与正常女性的X染色体失活偏斜模式和逃逸基因 | 样本量较小（仅1例患者和1例对照），需要更大规模研究验证 | 探究X染色体失活偏斜和逃逸在自身免疫性疾病性别差异中的作用机制 | 女性Graves病患者和正常女性对照 | 单细胞基因组学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 2例（1例Graves病患者，1例正常对照） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1996 | 2025-10-07 |
Flexible analysis of spatial transcriptomics data (FAST): a deconvolution approach
2025-Jan-31, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-025-06054-y
PMID:39891065
|
研究论文 | 提出了一种基于正则化非负矩阵分解的空间转录组学去卷积方法FAST | 开发了无需参考数据的灵活去卷积方法，能够整合基因表达数据、空间信息和组织学信息 | NA | 开发高分辨率空间转录组学数据的去卷积分析方法 | 空间转录组学数据 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | 正则化非负矩阵分解(NMF) | 基因表达数据、空间数据、组织学图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1997 | 2025-10-07 |
Multi-omics analysis reveals that neutrophil extracellular traps related gene TIMP1 promotes CRC progression and influences ferroptosis
2025-Jan-31, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03643-y
PMID:39891145
|
研究论文 | 通过多组学分析发现中性粒细胞胞外诱捕网相关基因TIMP1促进结直肠癌进展并影响铁死亡 | 首次将中性粒细胞胞外诱捕网相关基因TIMP1与结直肠癌进展及铁死亡联系起来，并通过机器学习筛选出关键基因 | 未明确说明样本量大小，研究主要基于生物信息学分析和体外实验验证 | 探索中性粒细胞胞外诱捕网在结直肠癌中的新标志物以辅助治疗 | 结直肠癌细胞和中性粒细胞胞外诱捕网相关基因 | 生物信息学 | 结直肠癌 | RNA转录组测序，单细胞转录组分析，机器学习，Western blot，Transwell，细胞划痕实验，细胞克隆形成实验 | 机器学习模型 | 转录组数据，单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1998 | 2025-10-07 |
Exploratory analysis of a Novel RACK1 mutation and its potential role in epileptic seizures via Microglia activation
2025-Jan-31, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03350-5
PMID:39891152
|
研究论文 | 通过单细胞转录组测序和全外显子测序技术，发现RACK1基因新突变RACK1-p.L206P通过激活小胶质细胞影响神经元兴奋性，导致癫痫发作 | 首次发现RACK1-p.L206P突变通过增强小胶质细胞功能影响神经元兴奋性和突触功能，揭示了癫痫发病的新分子机制 | NA | 探索RACK1基因突变在癫痫发病机制中的作用 | 人类小胶质细胞、小鼠模型、海马神经元 | 神经科学 | 癫痫 | 单细胞转录组测序(scRNA-seq)、全外显子测序(WES)、CRISPR/Cas9基因编辑 | NA | 基因测序数据、电生理数据、免疫组织化学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 全外显子测序 | NA | NA |
| 1999 | 2025-10-07 |
Ionizing radiation-induced disruption of Rela-Bclaf1-spliceosome regulatory axis in primary spermatocytes causing spermatogenesis dysfunction
2025-Jan-31, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-025-02067-5
PMID:39891142
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研究论文 | 本研究揭示了电离辐射通过破坏Rela-Bclaf1-剪接体调控轴导致初级精母细胞功能障碍的机制 | 首次发现IR通过抑制NF-κB/Rela和Bclaf1活性破坏剪接体通路，并证实NF-κB激动剂可通过上调Bclaf1修复剪接异常 | 研究仅使用小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探究电离辐射导致精子发生障碍的分子机制及潜在治疗策略 | Balb/c小鼠睾丸组织及精子发生过程 | 生殖生物学 | 男性不育症 | Bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, Western blotting, RT-qPCR | NA | 基因表达数据，组织学图像 | 小鼠睾丸模型 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2000 | 2025-10-07 |
Myeloid cell-derived apCAFs promote HNSCC progression by regulating proportion of CD4+ and CD8+ T cells
2025-Jan-31, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-025-03290-1
PMID:39891284
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研究论文 | 本研究揭示了头颈鳞状细胞癌中抗原呈递癌症相关成纤维细胞来源于髓系细胞并通过调节CD4+/CD8+T细胞比例促进肿瘤进展的机制 | 首次发现HNSCC中apCAFs来源于髓系细胞，阐明MIF通过激活JAK/STAT3通路驱动这一转分化过程，并证实apCAFs通过调节CD4+/CD8+T细胞比例促进肿瘤进展 | NA | 探索头颈鳞状细胞癌中抗原呈递癌症相关成纤维细胞的来源、机制和功能 | 头颈鳞状细胞癌肿瘤微环境中的抗原呈递癌症相关成纤维细胞 | 肿瘤免疫学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞转录组测序, 细胞轨迹分析, Cellchat分析, 谱系追踪实验, TCGA数据库分析, 体内实验 | NA | 单细胞转录组数据, 临床数据库数据, 实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |