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当前共找到 2164 篇文献,本页显示第 181 - 200 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
181 2026-01-17
Efficient and accurate detection of viral sequences at single-cell resolution reveals putative novel viruses perturbing host gene expression
2025-Jan-02, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一种基于高度保守氨基酸域的方法,用于在批量及单细胞转录组学数据中高效、准确地检测病毒序列,并应用于识别恒河猴PBMC数据中的潜在新病毒 该方法不依赖参考基因组,能保留单细胞分辨率,通过细胞条形码追踪,覆盖超过10万种RNA病毒物种,实现病毒存在与宿主基因表达的并行分析 未明确提及具体样本量或实验验证细节,可能受限于数据质量和病毒保守域的覆盖范围 开发一种高效准确的病毒检测方法,以理解病毒感染对人类健康的影响并预测潜在流行病 病毒序列(特别是RNA病毒)及宿主基因表达,应用于恒河猴外周血单个核细胞数据 生物信息学 病毒感染 高通量测序,单细胞转录组学 基于保守氨基酸域的检测方法 转录组学数据 NA NA 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq NA NA
182 2026-01-16
Cross-species analyses of thymic mimetic cells reveal evolutionarily ancient origins and both conserved and species-specific elements
2025-Jan-14, Immunity IF:25.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了人类、小鼠和斑马鱼的胸腺模拟细胞,揭示了其进化上的古老起源以及物种特异性和保守性元素 首次在人类儿科供体中高分辨率地描绘了胸腺模拟细胞的单细胞图谱,并进行了跨物种比较分析,突出了神经内分泌和肌肉亚型的多样化 研究主要基于儿科供体样本,可能无法完全代表成人或疾病状态下的胸腺模拟细胞特征 探究胸腺模拟细胞的进化起源、物种间保守性及适应性,以理解其在自身免疫中的潜在作用 人类儿科供体、小鼠和斑马鱼的胸腺模拟细胞 单细胞组学 自身免疫疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 人类儿科供体的纯化胸腺模拟细胞区室 NA 单细胞RNA-seq NA NA
183 2026-01-16
Analysis of intracellular and intercellular crosstalk from omics data
2025, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本文提出了一种名为“Ulisse”的分析方法,用于评估组学数据中细胞内和细胞间分子相互作用的改变 开发了Ulisse方法,补充了现有富集分析、通路串扰分析和细胞间通讯分析方法的不足,特别关注控制过程或细胞间相互作用的组分改变,并采用两种不同的零模型支持串扰量化 仅以三阴性乳腺癌单细胞RNA测序数据作为概念验证,未在其他疾病或数据类型中广泛验证 评估组学数据中细胞内和细胞间分子相互作用的可能改变 基因列表(通常来自组学或多组学研究) 生物信息学 乳腺癌 单细胞RNA测序 网络分析、零模型 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
184 2026-01-15
inDrops-2: a flexible, versatile and cost-efficient droplet microfluidic approach for high-throughput scRNA-seq of fresh and preserved clinical samples
2025-Jan-11, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 本文介绍了inDrops-2,一种开源、灵活且成本效益高的液滴微流控单细胞RNA测序技术,适用于新鲜和保存的临床样本 inDrops-2技术以6倍低于商业系统的成本,实现了与最先进商业系统相匹配的灵敏度,并支持指数和线性扩增两种协议 NA 开发一种高灵敏度、低成本、适用于大规模单细胞RNA测序的开源技术 人类肺癌样本中的新鲜和保存细胞 单细胞测序 肺癌 单细胞RNA测序 NA RNA序列数据 多个人类肺癌样本 NA 单细胞RNA-seq inDrops-2 开源液滴微流控单细胞RNA测序平台,支持指数和线性扩增协议
185 2026-01-15
Phase 1 study of chidamide in combination with venetoclax, azacitidine, aclarubicin, cytarabine and G-CSF for refractory/relapsed acute myeloid leukemia: clinical safety, efficacy, and correlative analysis
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究评估了西达本胺联合维奈托克、阿扎胞苷、阿柔比星、阿糖胞苷和G-CSF(CACAG-VEN方案)在复发/难治性急性髓系白血病(R/R-AML)患者中的疗效、安全性及相关生物学机制 首次在R/R-AML患者中评估CACAG-VEN联合方案的疗效和安全性,并利用单细胞RNA测序揭示了治疗后MCL1、HIF1A和ABCC1下调等分子机制 样本量较小(34例患者),为单臂I期研究,缺乏对照组,随访时间中位数为461天,可能不足以评估长期疗效和安全性 评估CACAG-VEN方案作为R/R-AML挽救诱导治疗的安全性和疗效,并探索其分子作用机制 复发或难治性急性髓系白血病(R/R-AML)患者 数字病理学 白血病 单细胞RNA测序 NA 临床数据,单细胞RNA测序数据 34例R/R-AML患者(难治性17例,复发17例),其中4例患者在治疗前后进行了骨髓样本的单细胞RNA测序(共8个样本) NA 单细胞RNA-seq NA NA
186 2026-01-14
HapCNV: A Comprehensive Framework for CNV Detection in Low-input DNA Sequencing Data
2025-Jan-07, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一个名为HapCNV的综合性统计框架,用于在单倍体或低输入DNA测序数据中进行数据标准化和CNV检测 HapCNV通过构建新颖的基因组位置特异性伪参考,利用初步细胞聚类方法选择无偏参考,有效保留常见CNV,并在模拟和真实寄生虫数据集中显示出优于现有方法的性能,尤其对短CNV检测更准确 未在摘要中明确提及 开发一个针对单倍体或低细胞数DNA测序数据的CNV检测框架,以克服现有方法在单倍体基因组和参考样本选择上的局限性 单倍体和二倍体生物的低输入DNA测序数据,包括单细胞或少数细胞测序数据 机器学习 NA 低输入DNA测序,包括低细胞和单细胞测序 统计框架 DNA测序数据 未在摘要中明确指定 NA NA NA NA
187 2026-01-14
Molecular landscape of the mouse adrenal gland and adjacent adipose tissue by spatial transcriptomics
2025, Folia histochemica et cytobiologica IF:1.7Q4
研究论文 本研究利用空间转录组学技术,生成了成年雄性小鼠肾上腺及其邻近脂肪组织的高分辨率分子图谱 首次提供了成年雄性小鼠肾上腺的空间分辨转录组参考图谱,揭示了肾上腺分区、更新和区域间相互作用的细胞与分子框架 研究仅针对成年雄性CD1 IGS小鼠,未涉及雌性、其他品系或不同发育阶段,可能限制结果的普适性 旨在解析肾上腺分区和皮质更新的分子机制,以及肾上腺与周围组织的相互作用 成年CD1 IGS雄性小鼠的肾上腺及其邻近的棕色和白色脂肪组织 空间转录组学 NA 空间转录组学 无监督聚类、差异基因表达分析、通路和基因本体富集、细胞类型反卷积、伪时间轨迹推断 空间转录组数据 成年CD1 IGS雄性小鼠的肾上腺样本 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium CytAssist 10x Genomics Visium CytAssist平台
188 2026-01-13
Spatiotemporal Cellular Dynamics of Germinal Center Reaction in Coronavirus Disease 2019 Lung-Draining Lymph Node Based on Imaging-Based Spatial Transcriptomics
2025-01, Laboratory investigation; a journal of technical methods and pathology
研究论文 本研究利用成像空间转录组学技术,揭示了SARS-CoV-2感染非人灵长类动物后,肺引流淋巴结中免疫细胞组成和组织结构在初次感染、恢复期和再感染期间的动态变化,重点关注生发中心反应和免疫记忆形成 首次应用成像空间转录组学技术,在空间维度上解析COVID-19感染过程中肺引流淋巴结的细胞动态和转录组模式,揭示了生发中心形成与免疫细胞互作的新机制 研究基于非人灵长类动物模型,结果可能不完全适用于人类;样本规模未明确,可能限制统计效力 阐明SARS-CoV-2感染后淋巴结构恢复的细节及其对免疫记忆的影响,以优化疫苗策略和精准治疗干预 非人灵长类动物的肺引流淋巴结组织 空间转录组学 COVID-19 成像空间转录组学 NA 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
189 2026-01-10
Brain aging and rejuvenation at single-cell resolution
2025-Jan-08, Neuron IF:14.7Q1
综述 本文综述了单细胞组学技术在脑衰老与年轻化研究中的应用,探讨了细胞类型特异性变化、细胞间相互作用以及年轻化干预策略 利用单细胞组学技术提供了脑衰老的高维无偏视图,并强调了组合年轻化方法的潜力 NA 探讨脑衰老的细胞机制及年轻化干预策略 脑细胞 数字病理学 老年疾病 单细胞转录组学 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
190 2026-01-10
Lysophosphatidylcholine as a Novel Diagnostic Biomarker in Kawasaki Disease: Based on Immunometabolism-Related Signature
2025, Journal of inflammation research IF:4.2Q2
研究论文 本研究通过代谢组学和单细胞RNA测序技术,探索川崎病中脂质代谢紊乱,并鉴定出溶血磷脂酰胆碱作为新型诊断生物标志物 首次将溶血磷脂酰胆碱(LPC)鉴定为川崎病的潜在诊断生物标志物,并结合单细胞RNA测序揭示了单核细胞中脂质代谢相关基因与炎症反应的关联 研究样本量有限,未进行大规模队列验证,且LPC作为生物标志物的敏感性和特异性有待进一步提高 探索川崎病的代谢紊乱机制并寻找新型诊断生物标志物 川崎病患者 数字病理学 川崎病 非靶向代谢组学、靶向脂质组学、ELISA、单细胞RNA测序 NA 代谢组数据、脂质组数据、单细胞RNA测序数据 未明确说明具体样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
191 2026-01-10
Single-Cell Sequencing Uncovers a TMSB10-Expressing Fibroblast Subpopulation Driving Renal Fibrosis in Diabetic Nephropathy
2025, Diabetes, metabolic syndrome and obesity : targets and therapy
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,识别并验证了在糖尿病肾病中驱动肾纤维化的TMSB10高表达成纤维细胞亚群 首次在糖尿病肾病中鉴定出TMSB10高表达的成纤维细胞亚群,并揭示其通过TGF-β/SMAD通路调控纤维化的新机制 样本量有限,且使用小鼠成纤维细胞模型进行验证,需在人类原代细胞中进一步确认 阐明糖尿病肾病中肾纤维化的细胞和分子驱动因素 人类糖尿病肾病及对照肾脏样本,以及NIH-3T3成纤维细胞和糖尿病小鼠模型 数字病理学 糖尿病肾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 公开可用的单细胞RNA测序数据集(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
192 2026-01-10
Single-Cell Transcriptomics Reveal Microenvironment Alterations in Canine Peri-Implantitis
2025, Mediators of inflammation IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过建立犬类种植体周围炎模型,利用单细胞RNA测序技术首次在单细胞分辨率下比较了软硬组织在疾病中的重塑过程,揭示了牙龈和牙槽骨微环境中不同的炎症相关细胞亚群扩增和信号通路 首次在单细胞分辨率下提供了种植体周围炎软硬组织重塑的比较图谱,发现了牙龈和牙槽骨微环境中独特的细胞亚群扩增(如IL6+/IL18BP+内皮细胞、CXCL8+成纤维细胞)以及牙槽骨中APOD+成纤维细胞驱动的C3-C3AR1信号通路 研究基于犬类模型,其向人类临床的转化仍需进一步验证;样本量可能有限;流式细胞术验证虽补充了发现,但功能实验有待深入 探究种植体周围炎在牙龈和牙槽骨微环境中的组织特异性异质性和分子细胞动力学,以寻找潜在治疗靶点并验证犬类模型的转化相关性 比格犬的牙龈和牙槽骨组织(来自疾病模型和健康对照) 数字病理学 种植体周围炎 单细胞RNA测序, 流式细胞术 NA 单细胞转录组数据 比格犬模型中的牙龈和牙槽骨组织样本(具体数量未在摘要中明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
193 2026-01-10
Mitochondrial Dysfunction and Immune Cell Infiltration in Diabetic Kidney Disease: A Mendelian Randomization and Multiomics Study
2025, Mediators of inflammation IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过孟德尔随机化和多组学方法,探讨了线粒体功能障碍和免疫细胞浸润在糖尿病肾病发病机制中的因果作用和复杂相互作用 结合孟德尔随机化、单细胞RNA测序和外周血单核细胞分析,首次系统性地揭示了特定线粒体基因表达与免疫细胞特征在糖尿病肾病中的因果关联和介导作用 研究主要基于观察性数据和遗传学关联,需要进一步的实验验证来确认因果机制 阐明线粒体功能障碍和免疫细胞浸润在糖尿病肾病发病中的因果作用和分子机制 糖尿病肾病患者、肾脏组织中的足细胞和肾小管细胞、外周血单核细胞 生物信息学 糖尿病肾病 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序, 差异基因表达分析 NA 遗传学数据, 单细胞转录组数据, 基因表达数据 未明确说明具体样本数量,涉及糖尿病肾病患者的肾脏组织和外周血单核细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
194 2026-01-09
YAP Overcomes Mechanical Barriers to Induce Mitotic Rounding and Adult Cardiomyocyte Division
2025-Jan-07, Circulation IF:35.5Q1
研究论文 本研究探讨了YAP5SA如何克服机械障碍,诱导成年心肌细胞进行有丝分裂圆化和分裂 揭示了YAP5SA通过克服心肌微环境的机械约束,促进成年心肌细胞重新进入细胞周期并进行分裂的新机制 研究主要基于YAP5SA过表达模型,可能未完全反映生理条件下的调控机制 探究成年哺乳动物心肌细胞细胞周期停滞的维持机制及YAP诱导的再进入机制 成年哺乳动物心肌细胞 细胞生物学 心血管疾病 单细胞RNA测序、克隆分析、标记基因分析 NA RNA测序数据、功能研究数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
195 2026-01-09
Stem Cell Niche: iPSC-Based Assembloids for Modeling Human Hematopoiesis
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
研究论文 本文介绍了一种基于诱导多能干细胞生成模拟骨髓微环境的3D组装体协议,用于研究人类造血调控和疾病建模 开发了患者特异性3D骨髓模拟组装体,可精确控制细胞组成和遗传背景,成功模拟了骨髓增殖性肿瘤的关键特征 NA 研究人类造血调控机制和骨髓微环境重塑 诱导多能干细胞、人类原代间充质基质细胞、骨髓模拟3D组装体 数字病理学 骨髓增殖性肿瘤 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
196 2026-01-09
Pan-Cancer Analysis of Enhancer-Induced PAN3-AS1 and Experimental Validation as a WFDC13-Promoting Factor in Colon Cancer
2025, Oncology research IF:2.0Q3
研究论文 本研究通过泛癌分析揭示了长链非编码RNA PAN3-AS1的致癌特性,并在结肠癌中实验验证了其通过竞争性结合miR-423-5p促进WFDC13表达的机制 首次在泛癌水平系统分析PAN3-AS1的诊断、预后价值及其与免疫微环境的关系,并揭示了增强子活性调控PAN3-AS1表达的新机制 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,缺乏体内实验验证;药物筛选部分仅为虚拟预测,未进行实验验证 探究PAN3-AS1在泛癌中的致癌特性及其在结肠癌中的具体调控机制 PAN3-AS1长链非编码RNA及其在多种癌症(特别是结肠癌)中的表达与功能 生物信息学 结肠癌 单细胞转录组学、染色质免疫沉淀、荧光素酶活性测定、RNA免疫沉淀、虚拟筛选、分子对接 NA 转录组数据、单细胞RNA-seq数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
197 2026-01-09
AGPAT3 Regulates Immune Microenvironment in Osteosarcoma via Lysophosphatidic Acid Metabolism
2025, Oncology research IF:2.0Q3
研究论文 本研究探讨了AGPAT3通过溶血磷脂酸代谢调控骨肉瘤免疫微环境的作用 首次将AGPAT3与骨肉瘤预后及免疫微环境调控联系起来,并发现其通过LPA-TAM-LPAR6轴抑制细胞毒性T细胞功能 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,缺乏体内实验验证 探索甘油脂代谢在骨肉瘤中的作用及其对免疫微环境的调控机制 骨肉瘤细胞、肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)及免疫细胞 生物信息学 骨肉瘤 单细胞RNA测序、LASSO回归、虚拟筛选 NA RNA测序数据、单细胞数据 来自TARGET数据库的骨肉瘤样本及单细胞RNA测序数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
198 2026-01-09
ETV4-Mediated PD-L1 Upregulation Promotes Immune Evasion and Predicts Poor Immunotherapy Response in Melanoma
2025, Oncology research IF:2.0Q3
研究论文 本研究揭示了转录因子ETV4通过上调PD-L1促进黑色素瘤免疫逃逸,并预测免疫治疗反应不良 首次发现ETV4作为关键转录因子调控PD-L1表达,介导黑色素瘤免疫逃逸,并可作为免疫治疗反应的预测生物标志物 研究主要聚焦于黑色素瘤和肝细胞癌,其他癌症类型中的ETV4功能尚未验证 阐明ETV4在肿瘤免疫逃逸中的作用及其作为免疫治疗预测生物标志物的潜力 黑色素瘤和肝细胞癌患者样本、肿瘤细胞、免疫细胞及小鼠模型 肿瘤免疫学 黑色素瘤 单细胞RNA测序、功能研究、小鼠模型 NA 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 未明确指定样本数量,但包括黑色素瘤和肝细胞癌患者样本及小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
199 2026-01-09
STC2+ Malignant Cell State Associated with EMT, Tumor Microenvironment Remodeling, and Poor Prognosis Revealed by Single-Cell and Spatial Transcriptomics in Colorectal Cancer
2025, Oncology research IF:2.0Q3
研究论文 本研究通过单细胞和空间转录组学,在结直肠癌中鉴定出一种与上皮-间质转化、肿瘤微环境重塑及不良预后相关的STC2+恶性细胞亚群 整合多组学方法识别了空间富集于肿瘤区域且代谢重编程的STC2+恶性细胞亚群,揭示了其作为信号枢纽及潜在治疗靶点的新作用 NA 旨在识别结直肠癌中利用缺氧和果糖代谢等替代代谢途径改变肿瘤微环境的恶性亚群,并解析其细胞间信号网络和空间组织 结直肠癌组织样本,包括肝转移样本 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序,空间转录组学,多组学整合分析 NA RNA测序数据,空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
200 2026-01-09
ELK4 Promotes Vasculogenic Mimicry in Oral Squamous Cell Carcinoma via Driving DHFR Transcriptional Activation
2025, Oncology research IF:2.0Q3
研究论文 本研究揭示了ELK4通过驱动DHFR转录激活促进口腔鳞状细胞癌中血管生成拟态形成的机制 首次发现ELK4/DHFR轴在口腔鳞状细胞癌血管生成拟态中的关键调控作用,并阐明其表观遗传机制 研究主要基于体外实验和生物信息学分析,缺乏体内动物模型验证 阐明口腔鳞状细胞癌中血管生成拟态的调控机制 口腔鳞状细胞癌细胞 数字病理学 口腔鳞状细胞癌 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, H3K27ac ChIP-seq, ChIP-qPCR NA 基因表达数据, 表观遗传数据 来自TCGA和GEO数据库的样本 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 染色质免疫沉淀测序 NA NA
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