单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1	2025-09-18	YBX1/CD36 positive feedback loop-mediated lipid accumulation drives metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease 2025, International journal of biological sciences IF:8.2Q1 DOI:10.7150/ijbs.105798 PMID:40083711	研究论文	本研究揭示了YBX1/CD36正反馈环路在代谢功能障碍相关脂肪性肝病（MASLD）中驱动脂质积累的新机制	首次发现YBX1与CD36之间存在正反馈调控关系，并证明该环路促进肝脏脂质积累	研究主要基于小鼠模型和细胞实验，人类临床验证尚需进一步研究	探究MASLD的发病机制及YBX1在该疾病中的作用	肝细胞、小鼠模型、人类肝脏样本	肝脏代谢疾病研究	代谢功能障碍相关脂肪性肝病	单细胞测序、透射电子显微镜、生物学和组织学分析	基因敲除小鼠模型	测序数据、显微图像、组织学数据	基因敲除小鼠和LOXP小鼠模型，原代肝细胞，人类肝脏样本
2	2025-09-18	Analysis of head and neck cancer scRNA-seq data identified PRDM6 promotes tumor progression by modulating immune gene expression 2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2025.1596916 PMID:40936897	研究论文	通过分析头颈癌单细胞RNA测序数据，发现PRDM6通过调控免疫基因表达促进肿瘤进展	首次揭示PRDM6在诱导免疫应答基因表达促进肿瘤细胞增殖中的新功能，并发现HPV病毒癌蛋白通过上调PRDM6表达与HPV阳性头颈癌相关	NA	探索头颈鳞状细胞癌的免疫机制及肿瘤进展驱动因素	头颈癌患者样本的单细胞RNA测序数据	生物信息学	头颈癌	scRNA-seq, IRIS3调控子推断工具	NA	单细胞RNA测序数据	头颈癌患者样本（数量未明确说明）
3	2025-09-18	MAIT Cells with High PFN1 Expression Mediate Immune Activation and Metabolic Reprogramming in Psoriasis 2025, Clinical, cosmetic and investigational dermatology DOI:10.2147/CCID.S535795 PMID:40948612	研究论文	本研究通过整合单细胞RNA测序和遗传分析，揭示了MAIT细胞及其高表达基因PFN1在银屑病免疫激活和代谢重编程中的关键作用	首次发现MAIT细胞中PFN1高表达与银屑病风险相关，并系统揭示了其通过IL6-JAK-STAT3信号通路和糖酵解途径介导免疫代谢异常	样本量较小（3例银屑病 vs 2例对照），且PFN1表达与银屑病风险无显著遗传共定位	探索银屑病的细胞和分子机制，重点关注免疫细胞功能异常和代谢重编程	银屑病患者皮肤组织中的免疫细胞，特别是MAIT细胞亚群	生物信息学	银屑病	scRNA-seq, bulk RNA-seq, eQTL-based Mendelian randomization, 富集分析	NA	单细胞转录组数据、批量RNA测序数据、遗传数据	5例样本（3例银屑病患者，2例健康对照）
4	2025-09-18	Enhancing natural killer cell anti-tumour activity through macrophage manipulation 2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2025.1656925 PMID:40948757	综述	本文综述了通过调控巨噬细胞增强自然杀伤细胞抗肿瘤活性的策略	聚焦巨噬细胞与NK细胞互作在肿瘤免疫中的双向调节作用，并探讨利用表型重极化、选择性清除等技术增强NK细胞功能的治疗新策略	NA	探讨肿瘤微环境中巨噬细胞与NK细胞的相互作用机制及治疗应用	巨噬细胞和自然杀伤细胞（NK细胞）	肿瘤免疫学	癌症	单细胞RNA测序、空间转录组学、蛋白质组学	NA	NA	NA
5	2025-09-18	Multi-omics approach to personalised treatment: insights into thrombus-derived exosome regulation in cardiomyocyte ferritinophagy 2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2025.1607355 PMID:40948766	研究论文	本研究通过多组学方法揭示血栓来源外泌体通过'FENDRR-m6A-NCOA4'轴调控心肌细胞铁蛋白自噬的机制及其与免疫炎症反应的关联	首次发现冠状动脉血栓外泌体中的lncRNA FENDRR通过m6A修饰调控铁蛋白自噬，并揭示免疫细胞通过该通路参与心肌损伤的免疫炎症反应	NA	系统分析1型心肌梗死中铁蛋白自噬的机制及其与免疫炎症反应的潜在联系	1型心肌梗死患者的冠状动脉血栓样本及心肌细胞模型	多组学分析	心血管疾病	转录组测序、单细胞RNA测序、RIP、FISH、ChIP、m6A甲基化实验	NA	RNA序列数据、功能实验数据	1型心肌梗死患者的冠状动脉血栓样本
6	2025-09-18	Dissecting the immune evasion and therapeutic resistance mechanisms in EGFR/TP53 co-mutated non-small cell lung cancer: implications for targeted and immunotherapy strategies 2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2025.1652213 PMID:40948762	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术解析EGFR/TP53共突变非小细胞肺癌的免疫逃逸和治疗抵抗机制	首次在单细胞层面揭示EGFR/TP53共突变NSCLC中恶性细胞亚群通过协同作用驱动CD8+ T细胞耗竭和免疫排斥微环境形成的转录调控网络	样本量较小（仅4例进行单细胞测序），需更大队列验证和功能研究支持临床转化	探究EGFR/TP53共突变非小细胞肺癌的分子机制及治疗策略	非小细胞肺癌患者肿瘤样本	肿瘤免疫学	肺癌	单细胞RNA测序, NGS	NA	RNA测序数据	40例NSCLC患者肿瘤样本（其中4例进行单细胞测序）
7	2025-09-18	Integrative transcriptomic and machine learning analyses identify HDAC9 as a key regulator of mitochondrial dysfunction and senescence-associated inflammation in diabetic nephropathy 2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2025.1627173 PMID:40948769	研究论文	通过整合转录组学和机器学习分析，识别HDAC9作为糖尿病肾病中线粒体功能障碍和衰老相关炎症的关键调控因子	首次整合bulk RNA-seq、WGCNA、机器学习方法和scRNA-seq数据，系统性鉴定糖尿病肾病中与线粒体功能障碍及衰老相关的枢纽基因，并功能验证HDAC9的致病作用	研究主要基于体外细胞模型（HK-2细胞），缺乏体内动物实验验证；样本来源和数量未明确说明	探究糖尿病肾病中线粒体功能障碍、细胞衰老和炎症的分子机制，并寻找潜在诊断标志物和治疗靶点	糖尿病肾病（DN）患者肾脏组织样本和高糖诱导的HK-2细胞系	生物信息学	糖尿病肾病	RNA-seq, scRNA-seq, WGCNA, SVM机器学习, siRNA基因敲低	SVM	转录组数据	NA
8	2025-09-18	Research trends and hotspots in the tumor microenvironment of ovarian cancer: a bibliometrics and visualization study from 2005 to 2024 2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2025.1605695 PMID:40948776	文献计量学研究	通过对2005-2024年卵巢癌肿瘤微环境研究的文献计量与可视化分析，揭示该领域的研究趋势和热点	首次系统性地对卵巢癌TME领域进行长达20年的文献计量分析，并识别出关键研究热点如免疫检查点抑制剂和单细胞RNA测序技术	研究基于WoSCC数据库的1720篇文章，可能未涵盖所有相关文献	分析卵巢癌肿瘤微环境领域的研究发展趋势和热点主题	卵巢癌肿瘤微环境相关研究文献	文献计量学	卵巢癌	文献计量分析、可视化分析	NA	文献数据	1720篇相关文章来自WoSCC数据库
9	2025-09-18	Single-cell profiling delineates the tumor microenvironment and immunological networks in patient-derived uterine leiomyosarcoma 2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2025.1653096 PMID:40948800	研究论文	通过单细胞RNA测序描绘了子宫平滑肌肉瘤的肿瘤微环境和免疫网络	首次构建了子宫平滑肌肉瘤的单细胞图谱，识别了转移易感细胞亚群(U11-EDARADD)和以耗竭CD8+T细胞、M2巨噬细胞及N2中性粒细胞为主的免疫抑制微环境	研究基于单个初治患者的转移病灶样本，样本量较小	解析子宫平滑肌肉瘤的肿瘤微环境特征和免疫抑制机制	子宫平滑肌肉瘤患者转移病灶和正常子宫肌层组织	单细胞组学	子宫平滑肌肉瘤	scRNA-seq, 多重免疫荧光(mpIF), CNV分析	NA	单细胞转录组数据	1例ULSA患者的多个转移病灶（盆腔、直肠、腹膜、膀胱）和5例正常子宫肌层对照
10	2025-09-18	Deciphering the role of myofibroblasts in microvascular invasion of hepatocellular carcinoma 2025, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1 DOI:10.3389/fphar.2025.1596181 PMID:40949143	研究论文	本研究通过单细胞分析揭示肌成纤维细胞在肝细胞癌微血管侵袭中的关键作用及潜在机制	首次在单细胞层面系统解析肌成纤维细胞亚群（特别是MF2细胞）通过CAMK2N1基因调控血管生成和MVI形成的机制	研究主要基于公共数据库数据，实验验证仅限于细胞系水平	阐明肝细胞癌微血管侵袭的细胞群体和分子网络机制	肝细胞癌患者样本和HCC细胞系	癌症生物学	肝细胞癌	scRNA-seq, RNA-seq, 功能富集分析, 细胞通讯分析, 细胞轨迹分析, CCK-8, 划痕实验, transwell实验	Seurat, DAVID, CellChat, Monocle 2	单细胞RNA测序数据, bulk RNA测序数据, 实验数据	来自公共数据库的HCC单细胞和RNA-seq数据集（具体样本数未明确说明）
11	2025-09-18	Integrating microarray data and single-cell RNA-seq reveals correlation between kit and nmyc in mouse spermatogonia stem cell population 2025, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1 DOI:10.3389/fcell.2025.1634347 PMID:40950403	研究论文	本研究整合微阵列数据和单细胞RNA测序，揭示小鼠精原干细胞群体中Kit与Nmyc基因的关联及其在分化中的关键作用	结合WGCNA和scRNA-seq技术，首次系统揭示Kit基因在RA信号通路介导的精原干细胞分化中的核心调控作用	研究仅限于小鼠模型，需进一步通过基因编辑技术和人类模型验证治疗潜力	解析精原干细胞的分子特征及其在精子发生中的调控机制	小鼠睾丸样本中分离的精原干细胞	生殖生物学	男性不育症	CD49f-MACS分选、矩阵选择、免疫细胞化学、基因本体富集分析、WGCNA、scRNA-seq、PPI网络构建	NA	基因表达数据（微阵列和单细胞RNA测序）	小鼠睾丸样本中分离的精原干细胞群体
12	2025-09-18	Comprehensive analysis of the papillary thyroid carcinoma identifies CSGALNACT1 as a proliferation driver and prognostic biomarker 2025, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1 DOI:10.3389/fcell.2025.1638348 PMID:40950406	研究论文	通过整合单细胞RNA测序数据，构建甲状腺乳头状癌高分辨率细胞图谱，并鉴定CSGALNACT1作为增殖驱动因子和预后生物标志物	首次在PTC中构建包含29个细胞亚群的高分辨率图谱，发现CSGALNACT1是上皮细胞特异性独立预后基因并验证其促增殖功能	研究仅基于20个人类甲状腺样本，样本量相对有限	解析甲状腺乳头状癌的细胞异质性并确定预后决定因素	人类甲状腺组织样本（健康与肿瘤组织）	数字病理学	甲状腺癌	单细胞RNA测序(scRNA-seq), LASSO回归, 伪时序分析	Cox比例风险模型, LASSO回归模型	单细胞转录组数据	20个人类甲状腺样本
13	2025-09-18	Identification of Novel Biomarkers Associated with Corticosteroid Resistance in Asthma by Bioinformatics Analysis and Experimental Validation 2025, Journal of inflammation research IF:4.2Q2 DOI:10.2147/JIR.S527640 PMID:40951447	研究论文	通过生物信息学分析和实验验证识别与哮喘中皮质类固醇抵抗相关的新型生物标志物	首次结合WGCNA和差异表达分析识别TNS1、ABCC4和TNFRSF21作为香烟烟雾诱导的哮喘皮质类固醇抵抗的关键生物标志物，并发现TNS1促进巨噬细胞M2极化的新机制	研究基于公共数据库和有限样本验证，需进一步扩大临床样本和功能实验确认机制	探索香烟烟雾诱导的哮喘皮质类固醇抵抗的潜在生物标志物和治疗靶点	哮喘患者、哮喘小鼠模型和Raw264.7细胞系	生物信息学	哮喘	RNA-seq, 差异表达分析, WGCNA, GO/KEGG富集分析, ROC分析, CIBERSORT, 单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	GSE230048和GSE13896数据集（样本数量未明确说明），哮喘患者和小鼠模型验证样本
14	2025-09-18	Role of endothelial cell markers in prognosis of hepatocellular carcinoma: Integrating bioinformatics analysis and experimental validation 2025, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0331580 PMID:40956822	研究论文	本研究通过整合生物信息学分析和实验验证，识别了肝细胞癌中内皮细胞特异性标志物并构建了预后多基因特征	在单细胞水平探索内皮细胞在肝细胞癌中的作用，并开发了新的多基因预后特征	样本量相对较小（12个HCC样本），需要更大规模的研究验证	识别内皮细胞特异性标志物并开发肝细胞癌的预后预测模型	肝细胞癌患者组织样本和公开数据库中的转录组数据	生物信息学	肝细胞癌	scRNA-seq, Lasso-Cox回归分析, IHC, Western blotting	多基因特征模型	单细胞转录组数据, 组织蛋白表达数据	12个HCC样本（scRNA-seq），TCGA和ICGC队列验证
15	2025-09-18	Molecular mechanism of LncRNA MALAT1 in regulating hepatocellular carcinoma progression via the miR-383-5p/PRKAG1 axis and its role in the tumor immune microenvironment 2025, Frontiers in oncology IF:3.5Q2 DOI:10.3389/fonc.2025.1613596 PMID:40958861	研究论文	本研究揭示了LncRNA MALAT1通过miR-383-5p/PRKAG1轴调控肝细胞癌进展的分子机制及其在肿瘤免疫微环境中的作用	首次系统阐明MALAT1通过竞争性结合miR-383-5p上调PRKAG1表达的新机制，并发现PRKAG1通过调控免疫细胞浸润和细胞间通讯重塑肿瘤免疫微环境	NA	探究MALAT1-PRKAG1轴在肝细胞癌发病机制中的作用及临床意义	肝细胞癌组织和细胞系	肿瘤分子生物学	肝细胞癌	多组学分析、生物信息学分析（GEPIA2、TCGA）、细胞实验、单细胞RNA测序、CIBERSORT分析、GO/KEGG富集分析	NA	基因组数据、转录组数据、单细胞测序数据	基于TCGA等公共数据库的肝细胞癌样本及实验验证的细胞系
16	2025-09-18	Personalised immunotherapy strategies informed by single cell profiling in thyroid cancer: a mini review 2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2025.1651088 PMID:40959084	综述	本文探讨了单细胞分析如何指导甲状腺癌个性化免疫治疗策略的发展	通过单细胞分析揭示甲状腺癌中不同细胞状态与免疫微环境的关联，并指导新型组合疗法开发	NA	总结单细胞分析在甲状腺癌免疫治疗中的应用与前景	甲状腺癌肿瘤细胞和免疫细胞	数字病理	甲状腺癌	单细胞转录组测序，空间转录组，CITE-seq	NA	转录组数据，空间转录组数据，蛋白质表达数据	超过150,000个肿瘤和免疫细胞转录组
17	2025-09-18	A multi-omic analysis reveals a predictive value of tertiary lymphoid structures in improving the prognosis of colorectal cancer patients with BRAF mutation 2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2025.1662573 PMID:40959083	研究论文	本研究通过多组学分析探讨三级淋巴结构（TLS）对改善BRAF突变结直肠癌患者预后的预测价值	首次系统评估TLS特征（位置、数量、成熟度）与BRAF突变状态的关联，并揭示TLS可能抵消BRAF突变不良预后的作用	样本量有限（200例组织病理学评估），且为回顾性分析，需进一步前瞻性验证	探究TLS是否能够改善BRAF突变结直肠癌患者的预后	结直肠癌患者（含BRAF野生型和突变型）	肿瘤免疫微环境	结直肠癌	单细胞RNA测序、批量RNA测序、LASSO回归、ESTIMATE/CIBERSORT免疫浸润分析	10基因预后模型（基于LASSO回归构建）	基因组数据、转录组数据、组织病理学图像	TCGA队列+5个GEO数据集（GSE146771等）的RNA-seq数据，以及200例CRC患者的组织切片
18	2025-09-18	Single-cell RNA-seq reveals a repair pattern in cystic lesions in steroid induced osteonecrosis of the femoral head 2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2025.1626337 PMID:40959091	研究论文	利用单细胞RNA测序技术揭示类固醇诱导股骨头坏死中囊性病变的修复机制和细胞异质性	首次在SIONFH囊性病变中鉴定出8种细胞类型，并将软骨细胞细分为5个功能亚群，发现CLIC3+表达的肥大软骨细胞群可能驱动骨矿化和成骨分化	仅基于3例患者样本，样本量较小，需进一步验证	探究类固醇诱导股骨头坏死（SIONFH）中囊性病变的转录组特征和修复机制	SIONFH患者的囊性病变组织	单细胞组学	骨坏死疾病	scRNA-seq（单细胞RNA测序），组织学检测	NA	单细胞转录组数据，组织病理学数据	3例SIONFH患者的囊性病变样本
19	2025-09-18	Single-cell RNA sequencing and proteomics uncover SIRPα-CD47 immune checkpoint and glycolysis-driven immune evasion in cardiac myxoma 2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2025.1652645 PMID:40959090	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和蛋白质组学揭示了心脏黏液瘤中SIRPα-CD47免疫检查点和糖酵解驱动的免疫逃逸机制	首次在心脏黏液瘤中发现ap-CAF细胞通过趋化因子招募免疫细胞、证实肿瘤细胞来源于间充质干细胞、揭示糖酵解通路激活和SIRPα-CD47免疫检查点的作用机制	NA	深入解析心脏黏液瘤的微环境组成、细胞生长机制和免疫逃逸策略	心脏黏液瘤组织样本	数字病理学	心脏肿瘤	单细胞RNA测序, 蛋白质组学, western blot, 类器官模型	NA	单细胞转录组数据, 蛋白质组数据	NA
20	2025-09-18	Spermidine potentiates anti-tumor immune responses and immunotherapy sensitivity in breast cancer 2025, Journal of Cancer IF:3.3Q2 DOI:10.7150/jca.113235 PMID:40959110	研究论文	本文探讨了亚精胺在乳腺癌中增强抗肿瘤免疫反应和免疫治疗敏感性的作用	发现亚精胺丰度与CD8⁺ T细胞浸润和激活显著正相关，并证实外源性补充亚精胺可直接促进CD8⁺ T细胞活化	NA	阐明亚精胺在乳腺癌免疫调节中的具体角色和治疗潜力	乳腺癌标本和CD8⁺ T细胞	肿瘤免疫学	乳腺癌	多组学分析（bulk和单细胞RNA测序）、免疫组化/多重免疫组化（IHC/mIHC）	NA	测序数据、图像数据	NA