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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-12-17 |
A Bi-Specific T Cell-Engaging Antibody Shows Potent Activity, Specificity, and Tumor Microenvironment Remodeling in Experimental Syngeneic and Genetically Engineered Models of GBM
2025-Jan-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.18.628714
PMID:39763755
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研究论文 | 本研究开发了一种靶向IL13Rα2的双特异性T细胞衔接抗体,并在具有完整免疫系统的胶质母细胞瘤小鼠模型中评估了其疗效、作用机制及对肿瘤微环境的重塑作用 | 首次在具有完整免疫系统的原位胶质瘤和基因工程小鼠模型中,系统评估了双特异性T细胞衔接抗体的治疗机制及其对免疫抑制性肿瘤微环境的调控作用 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中进行验证;且仅针对IL13Rα2这一靶点 | 探究双特异性T细胞衔接抗体在胶质母细胞瘤中的治疗机制及对肿瘤微环境的影响 | 表达IL13Rα2的胶质母细胞瘤细胞、小鼠T细胞及肿瘤微环境中的免疫细胞 | NA | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、多色流式细胞术、多重免疫荧光、多参数磁共振成像 | NA | 基因表达数据、影像数据、细胞表型数据 | 多个临床前胶质母细胞瘤模型中的小鼠样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2 | 2025-12-17 |
FastCCC: A permutation-free framework for scalable, robust, and reference-based cell-cell communication analysis in single cell transcriptomics studies
2025-Jan-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.27.635115
PMID:39975391
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研究论文 | 本文介绍了一种名为FastCCC的无置换框架,用于单细胞转录组学研究中的细胞间通讯分析,该框架具有可扩展性、鲁棒性,并能利用参考数据进行增强分析 | 提出了首个无置换的快速分析框架,通过快速傅里叶变换卷积计算p值,无需置换检验;引入了模块化代数操作框架以捕获广泛的CCC模式;构建了首个包含19种组织类型、450多种细胞类型、约1600万细胞的人类CCC参考面板 | NA | 开发一种可扩展、鲁棒且基于参考的单细胞转录组学细胞间通讯分析方法 | 单细胞转录组数据中的细胞间通讯 | 单细胞转录组学 | COVID-19 | 单细胞RNA-seq | 快速傅里叶变换卷积、模块化代数操作框架 | 单细胞转录组数据 | 参考面板包含约1600万细胞,涵盖19种组织类型和450多种细胞类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3 | 2025-12-17 |
Pathogenesis of Germinal Matrix Hemorrhage: Insights from Single-Cell Transcriptomics
2025-01, Annual review of pathology
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综述 | 本文综述了利用单细胞转录组学揭示产前人脑生发基质中神经发生和血管生成的新机制,以及免疫-血管相互作用在其中的关键角色 | 应用单细胞转录组学技术,首次系统揭示了生发基质中免疫-血管相互作用在血管形态发生中的关键作用,以及促炎因子如何破坏该过程导致出血 | 本文为综述性文章,主要总结现有研究进展,未报告新的原始实验数据 | 阐明早产儿生发基质出血的发病机制,探索潜在治疗干预靶点 | 产前人脑生发基质的神经干细胞、血管细胞及免疫细胞 | 单细胞组学 | 新生儿脑出血 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2025-12-17 |
Challenges and Opportunities in the Clinical Translation of High-Resolution Spatial Transcriptomics
2025-01, Annual review of pathology
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综述 | 本文综述了高分辨率空间转录组学技术在临床转化中的挑战与机遇,探讨了其在疾病机制识别和个性化治疗指导方面的潜力 | 强调了空间转录组学作为分子显微镜在亚细胞分辨率下数字化基因表达的革命性发展,并讨论了多模态数据与深度学习整合的前景 | 指出了高分辨率空间转录组学技术快速临床转化中仍存在的挑战,如技术整合和临床研究设计复杂性 | 旨在推动空间转录组学技术在临床病理学中的应用,以实现对组织生物学和病理学的整体理解 | 常规收集和存档的临床样本,包括完整组织切片 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学技术 | 深度学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5 | 2025-12-17 |
Significance of SUMOylation in breast cancer progression: a comprehensive investigation using single-cell analysis and bioinformatics
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1675874
PMID:41357242
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研究论文 | 本研究利用bulk和单细胞RNA测序,结合生物信息学方法,全面探究了SUMOylation在乳腺癌进展中的作用,并鉴定了预后生物标志物和潜在治疗靶点 | 首次通过整合bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq和机器学习方法,系统性地鉴定了与乳腺癌SUMOylation相关的枢纽基因,并基于这些基因的表达模式将患者分为具有不同预后、免疫和药物反应特征的分子亚型 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,缺乏前瞻性临床队列验证;单细胞分析样本量相对有限;功能实验验证不足 | 探究SUMOylation在乳腺癌进展中的分子网络,鉴定预后生物标志物和潜在治疗应用 | 乳腺癌组织和正常乳腺组织 | 生物信息学 | 乳腺癌 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 机器学习 | 机器学习(未指定具体模型) | 转录组数据 | 1,445个乳腺癌样本和113个正常样本(bulk RNA-seq);单细胞RNA-seq样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 6 | 2025-12-16 |
Single-cell RNA sequencing reveals cellular diversity and gene expression dynamics in maize root development
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1666531
PMID:41393869
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,解析了玉米根尖发育过程中的细胞多样性和基因表达动态 | 首次在单细胞分辨率下绘制了玉米根尖的转录组图谱,揭示了不同于拟南芥和水稻的激素相关基因表达模式,并识别了细胞命运决定的关键候选调控因子 | 研究仅聚焦于根尖区域,未涵盖整个根系;功能推断基于生物信息学分析,缺乏直接的实验验证 | 阐明玉米根发育的分子基础及细胞异质性 | 玉米根尖细胞 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 伪时间分析、加权基因共表达网络分析 | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量(玉米根尖细胞) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7 | 2025-12-16 |
Single-cell RNA-seq reveals breast cancer heterogeneity and identifies TCP1 as a therapeutic target in breast cancer
2025, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.20451
PMID:41394417
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术解析乳腺癌的肿瘤异质性,并识别TCP1作为潜在治疗靶点 | 通过单细胞RNA测序高分辨率揭示乳腺癌肿瘤微环境中的细胞异质性,首次将KRT17阳性亚群与干细胞样表型及患者生存分层关联,并验证TCP1在乳腺癌细胞迁移和侵袭中的关键作用 | 研究样本量相对有限(68个标本),且主要基于回顾性数据分析,需要进一步功能实验和临床试验验证TCP1的治疗潜力 | 解析乳腺癌的肿瘤异质性并识别新的治疗靶点 | 乳腺癌患者肿瘤样本(68个标本)及乳腺癌细胞系 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),拷贝数变异推断(inferCNV) | 无监督聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 68个乳腺癌标本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8 | 2025-12-16 |
Single-cell profiling identifies heterogeneity of the immune microenvironment in healthy, primary and lymph node metastatic BC
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1690992
PMID:41394809
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和免疫组织化学数据,揭示了乳腺癌中肿瘤内皮细胞的异质性及其与免疫微环境的相互作用 | 鉴定了两种先前未表征的、肿瘤富集的内皮细胞亚型EC4和EC5,揭示了它们在乳腺癌亚型中的特异性功能适应和预后意义,并发现了这些新EC亚群与免疫细胞(特别是CD8+T细胞和巨噬细胞)之间新颖的、亚型特异性的通讯 | 研究样本量相对有限(约12个样本),且主要基于转录组学分析,功能验证有待进一步深入 | 阐明乳腺癌及其淋巴结转移中肿瘤内皮细胞的异质性及其与免疫微环境的复杂相互作用,以揭示发病机制并寻找治疗靶点 | 乳腺癌原发肿瘤、淋巴结转移组织和健康组织中的细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 约98,000个细胞(来自约12个样本) | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 9 | 2025-12-16 |
Efferocytosis-induced metabolic shift in bone macrophages drives lactate production and modulates inflammation and osteoclastogenesis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1650465
PMID:41394808
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析吞噬凋亡成骨细胞的骨髓巨噬细胞,揭示了两个独特的巨噬细胞亚群,这些亚群表现出增强的糖酵解代谢和抗炎基因特征,并探讨了乳酸在调节骨微环境中的作用 | 首次在骨巨噬细胞中通过单细胞RNA测序识别出efferocytosis诱导的两个独特亚群,并揭示了其糖酵解代谢转变及乳酸产生对骨微环境的调节作用 | 研究主要基于体外实验,未在体内模型中验证;样本来源有限,仅使用骨髓来源的巨噬细胞;未深入探讨乳酸调节的具体分子机制 | 探究巨噬细胞吞噬凋亡成骨细胞后的代谢转变及其对骨微环境炎症和破骨细胞生成的影响 | 骨髓来源的巨噬细胞、凋亡的成骨细胞 | 单细胞组学 | 骨代谢疾病 | 单细胞RNA测序、qRT-PCR、代谢组学分析、乳酸ELISA | NA | 单细胞RNA测序数据、代谢组学数据、基因表达数据 | 未明确指定样本数量,但基于骨髓来源巨噬细胞的单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10 | 2025-12-16 |
Unveiling the novel value of TREM1 in the proneural-mesenchymal transition of glioma via tumor-associated macrophages
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1662351
PMID:41394801
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研究论文 | 本研究揭示了TREM1在胶质母细胞瘤中通过肿瘤相关巨噬细胞介导的神经前-间质转化中的新作用 | 首次将TREM1在TAMs中鉴定为驱动GBM神经前-间质转化的关键生物标志物,并通过TLR4/PI3K/AKT/mTOR轴阐明其作用机制 | 样本量相对较小(7名患者),且体内实验仅使用了腹腔给药模型,可能无法完全反映临床情况 | 探究TREM1在胶质母细胞瘤神经前-间质转化中的作用及其机制 | 胶质母细胞瘤患者样本、肿瘤相关巨噬细胞、恶性细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, mRNA测序, 加权基因共表达网络分析, LASSO-Cox回归 | NA | 单细胞RNA测序数据, mRNA测序数据 | 7名胶质母细胞瘤患者的24,366个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 11 | 2025-12-16 |
Integrated multi-omics elucidates PRNP knockdown-mediated chemosensitization to gemcitabine in pancreatic ductal adenocarcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1667835
PMID:41394830
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据,系统探讨了胰腺导管腺癌中吉西他滨耐药的机制,并鉴定出朊病毒蛋白基因PRNP为关键耐药基因 | 首次整合多组学数据(包括单细胞RNA测序和空间转录组学)并结合机器学习算法,系统揭示了PRNP通过双重通路(促进上皮-间质转化和抑制铁死亡)驱动吉西他滨耐药,并发现PRNP在化疗后特定癌症相关成纤维细胞亚群中富集,与免疫抑制肿瘤微环境的建立相关 | 研究主要基于体外细胞实验和动物模型,临床验证尚不充分;耐药机制的具体信号通路细节有待进一步阐明 | 系统研究胰腺导管腺癌中吉西他滨耐药的机制,并识别新的治疗靶点 | 胰腺导管腺癌细胞系、小鼠模型和临床患者数据 | 机器学习 | 胰腺癌 | 微阵列、转录组学、蛋白质组学、单细胞RNA测序、空间转录组学 | 机器学习算法 | 多组学数据 | 胰腺癌细胞系、小鼠模型和临床患者数据(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 12 | 2025-12-16 |
Single-cell transcriptomics reveals pathogen interactions and T cell reprogramming in HIV and Mycobacterium tuberculosis co-infection
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1680538
PMID:41394852
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学揭示了HIV和结核分枝杆菌共感染中的病原体相互作用及T细胞重编程机制 | 通过单细胞RNA测序结合有向无环图伪时间轨迹分析,首次系统描绘了从健康到HIV感染再到共感染的免疫细胞动态变化,并识别了Th1/Th17失衡和MHC-I偏向的T细胞信号重编程作为潜在干预靶点 | 研究样本来源于未治疗初诊患者,可能无法反映长期或治疗后的免疫状态变化,且仅关注外周血单个核细胞,未涉及组织特异性免疫反应 | 探究HIV和结核分枝杆菌共感染中病原体相互作用机制及宿主免疫重塑过程 | 健康对照、HIV单感染和HIV-Mtb共感染初诊患者的未治疗外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 艾滋病 | 单细胞RNA测序 | 有向无环图伪时间轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | 健康对照、HIV单感染和HIV-Mtb共感染初诊患者的未治疗外周血单个核细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 13 | 2025-12-16 |
Mechanistic Study of CD90-Positive Synovial Fibroblasts in the Invasion and Recurrence of Pigmented Villonodular Synovitis
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S549953
PMID:41394900
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研究论文 | 本研究通过整合RNA测序和微阵列数据分析色素沉着绒毛结节性滑膜炎(PVNS)的转录组,揭示了CD90+PDPN+滑膜成纤维细胞在滑膜侵袭和骨吸收中的关键作用 | 首次结合scRNA-seq数据识别了PVNS滑膜中的16个细胞亚群,并突出了CD90+PDPN+滑膜成纤维细胞在炎症因子分泌、骨降解和侵袭特性中的新角色 | 研究主要基于公共数据集和体外实验,未来需要体内实验和临床样本验证这些细胞作为治疗靶点的潜力 | 探究PVNS的发病机制,特别是CD90+PDPN+滑膜成纤维细胞在疾病侵袭和复发中的作用 | 色素沉着绒毛结节性滑膜炎(PVNS)和骨关节炎(OA)的滑膜组织 | 数字病理学 | 色素沉着绒毛结节性滑膜炎 | RNA-seq, 微阵列, scRNA-seq, 免疫组织化学染色, 免疫荧光染色, Western blot, 流式细胞术, transwell迁移和侵袭实验, 伤口愈合实验 | NA | 基因表达谱数据, 单细胞RNA测序数据 | 来自GSE3698、GSE175626和GSE176133数据集的PVNS和OA滑膜样本 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 14 | 2025-12-16 |
Machine Learning and Mendelian Randomization Identify Allergic Rhinitis as Nasopharyngeal Carcinoma Risk Factor With Validated Potential Candidate Biomarkers
2025, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/ijog/2281787
PMID:41395113
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研究论文 | 本研究结合单细胞转录组学与孟德尔随机化方法,揭示了过敏性鼻炎与鼻咽癌之间的因果关系及潜在分子机制 | 首次整合单细胞RNA测序与孟德尔随机化分析,系统解析鼻咽癌的细胞异质性并验证过敏性鼻炎作为风险因素的因果关联 | 样本量相对有限,且主要基于遗传变异分析,需要进一步实验验证分子机制 | 探究过敏性鼻炎与鼻咽癌发病之间的因果关系及分子通路 | 鼻咽癌组织样本及相邻正常组织 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序,孟德尔随机化分析 | NA | 单细胞转录组数据,遗传变异数据 | 未明确具体数量,但涉及NPC及正常组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 15 | 2025-12-16 |
A Multi-Faceted Approach to Explore the Role of Inflammatory CAFs, Providing Prognostic Value and Therapeutic Implications in Lung Adenocarcinoma
2025, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/ijog/6004629
PMID:41395115
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研究论文 | 本研究通过整合公共数据库的批量RNA数据和单细胞RNA测序数据,识别了肺腺癌中的炎性癌症相关成纤维细胞亚群,并构建了一个基于iCAF特征的预后标志物,用于预测患者预后、免疫景观和治疗反应 | 首次在肺腺癌中系统性地识别并表征了炎性癌症相关成纤维细胞亚群,并利用多算法机器学习构建了一个新的预后标志物,同时通过功能实验验证了关键基因PFN2的促癌作用 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,需要进一步的前瞻性临床研究验证;功能实验仅在细胞系中进行,缺乏体内模型验证 | 阐明肺腺癌中炎性癌症相关成纤维细胞的特性及其临床意义,并开发有效的预后预测工具 | 肺腺癌患者及其肿瘤微环境中的炎性癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 机器学习算法 | RNA测序数据 | 来自多个公共数据库的肺腺癌患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 16 | 2025-12-16 |
Single-Cell Profiling Identifies Reward Behavior-Related Neurons and Alterations in the Ventral Tegmental Area Based on Arvcf-Knockout Mouse Model
2025, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.1030
PMID:41395251
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研究论文 | 本研究基于Arvcf基因敲除小鼠模型,通过单细胞转录组学等技术,识别了腹侧被盖区中与奖赏行为相关的神经元亚群及其在尼古丁诱导奖赏中的作用 | 首次在单细胞分辨率下揭示了Arvcf基因敲除对腹侧被盖区神经元亚群的影响,并发现了一种与奖赏行为显著相关的谷氨酸能-多巴胺能组合神经元亚群 | 研究基于小鼠模型,结果向人类转化需进一步验证;单细胞测序技术可能无法完全捕获所有细胞类型或低表达基因 | 探究Arvcf基因在腹侧被盖区神经元多样性及奖赏行为相关细胞亚群中的作用机制 | 野生型和Arvcf基因敲除小鼠的腹侧被盖区组织,涉及尼古丁暴露处理 | 数字病理学 | 成瘾行为 | 单核RNA测序(snRNA-seq),神经蛋白质组学,多重免疫荧光成像,代谢物检测 | 小鼠基因敲除模型 | 单细胞转录组数据,蛋白质组数据,成像数据 | 96,240个细胞,来自野生型和Arvcf基因敲除小鼠,有或无尼古丁处理 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 17 | 2025-12-15 |
Exploratory spatial transcriptomic profiling of peritumoral Th2 immune polarization in HPV-positive oropharyngeal cancer
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1732480
PMID:41383514
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析,探索了HPV阳性口咽癌中肿瘤周围Th2免疫极化与淋巴转移的关系 | 首次在HPV阳性口咽癌中应用空间转录组学技术,揭示了肿瘤周围淋巴滤泡区域中Th2偏向性免疫与抑制淋巴转移的潜在关联 | 样本量较小(6例患者),属于探索性研究,需要更大规模的验证 | 阐明HPV阳性口咽癌早期淋巴转移高发但预后良好的矛盾现象背后的免疫机制 | 来自6名腭扁桃体来源口咽鳞状细胞癌患者的福尔马林固定石蜡包埋组织样本 | 空间转录组学 | 口咽癌 | 空间转录组学分析 | NA | 空间转录组数据 | 6例患者 | NA | 空间转录组学 | GeoMx Digital Spatial Profiler | NA |
| 18 | 2025-12-15 |
Epigenetic control of antigen presentation failure in osteosarcoma: from single-cell chromatin maps to therapeutic strategies
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1728091
PMID:41383594
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综述 | 本文综述了骨肉瘤中抗原呈递失败的染色质调控机制,并探讨了基于单细胞染色质图谱的治疗策略 | 整合单细胞ATAC-seq与单细胞及空间转录组学,揭示HLA/NLRC5/干扰素轴的可逆性表观遗传抑制机制 | 临床疗效仍需验证,需考虑克隆选择、干扰素信号保留及联合治疗方案的优化 | 阐明骨肉瘤抗原呈递失败的表观遗传机制并开发治疗策略 | 骨肉瘤肿瘤-免疫生态系统中的恶性克隆、分化状态及免疫细胞微环境 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞ATAC-seq, 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 染色质可及性数据, 转录组数据, 空间数据 | NA | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 19 | 2025-12-15 |
Inflammation-driven mechanisms in endometrial cancer: pathways from inflammatory microenvironment remodeling to immune escape
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1689114
PMID:41383623
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综述 | 本文综述了炎症微环境在子宫内膜癌进展中的作用,重点阐述了其促进免疫逃逸和治疗抵抗的机制,并探讨了潜在的干预策略 | 系统性地阐述了子宫内膜癌中炎症微环境重塑到免疫逃逸的完整通路,并强调了单细胞分析和空间转录组学等新技术在揭示可操作分子模式和开发个体化策略方面的潜力 | 文中提到的肿瘤内异质性、动态变化的免疫环境以及缺乏可靠的生物标志物等仍是重大挑战 | 阐明炎症微环境在子宫内膜癌免疫逃逸和治疗抵抗中的作用机制,并探索新的治疗干预靶点 | 子宫内膜癌 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 单细胞分析,空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 20 | 2025-12-15 |
Single-cell transcriptomics identifies FOSL1-regulated IGFBP3+ melanoma subtype as a neuro-immunoregulatory signaling hub facilitating tumor progression
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1662869
PMID:41383633
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析,识别出FOSL1调控的IGFBP3+黑色素瘤亚型,该亚型作为神经免疫调节信号枢纽促进肿瘤进展 | 首次将IGFBP3+黑色素瘤亚型与FOSL1转录因子关联,并揭示其作为神经免疫相互作用枢纽在肿瘤微环境中的关键作用 | 研究主要基于公共数据库的单细胞RNA测序数据,实验验证仅限于体外细胞系模型,缺乏体内动物模型验证 | 揭示黑色素瘤的细胞异质性,识别分子靶点和促肿瘤亚型 | 黑色素瘤细胞及其肿瘤微环境中的其他细胞类型 | 单细胞转录组学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | Seurat, Harmony, PySCENIC, CellChat | 单细胞RNA测序数据 | 来自GEO数据库的黑色素瘤单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |