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当前共找到 2168 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-05-16 |
Efficient Predictor for Immunotherapy Efficacy: Detecting Pan-Clones Effector Tumor Antigen-Specific T Cells in Blood by Nanoparticles Loading Whole Tumor Antigens
2025-01, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202409913
PMID:39498880
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研究论文 | 开发一种通过纳米颗粒加载全肿瘤抗原检测血液中泛克隆效应肿瘤抗原特异性T细胞的方法，用于预测免疫治疗效果 | 首次提出利用纳米颗粒加载全细胞肿瘤抗原来激活和检测血液中泛克隆效应肿瘤抗原特异性T细胞，将ETASTs与其他T细胞的区别转化为激活和非激活状态，通过检测激活状态和细胞毒性功能标记物实现区分 | 检测方法可能受ETASTs与其他T细胞表型重叠影响；研究仅在肺癌中验证，其他癌症类型需进一步确认；样本量信息未明确 | 开发一种高效、非侵入性的生物标志物，用于预测免疫治疗疗效 | 肺癌患者、健康个体、良性肺结节患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 纳米颗粒加载全肿瘤抗原，单细胞测序 | NA | 细胞数据 | 未明确 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 2 | 2026-05-16 |
Deficiency of FABP7 Triggers Premature Neural Differentiation in Idiopathic Normocephalic Autism Organoids
2025-01, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202406849
PMID:39556706
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研究论文 | 该研究通过分析正常头围自闭症谱系障碍个体来源的脑类器官，发现FABP7缺失会触发神经干细胞过早分化，并揭示了FABP7/MEK通路在其中的作用 | 首次从正常头围自闭症患者的前瞻性出生队列中建立iPSC来源的脑类器官模型，结合多细胞系和时间序列单细胞RNA测序，揭示了FABP7/MEK通路在神经干细胞异常分化中的关键作用 | 未提及具体局限性 | 探究正常头围自闭症谱系障碍个体中神经发育异常的分子机制 | 正常头围自闭症谱系障碍个体的诱导多能干细胞来源的脑类器官 | 机器学习 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 文本 | 多细胞系和时间序列样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 3 | 2026-05-16 |
Control of Cellular Differentiation Trajectories for Cancer Reversion
2025-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202402132
PMID:39661721
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研究论文 | 提出单细胞布尔网络推断与控制框架BENEIN，通过调控主调控因子将结直肠癌细胞逆转为正常样肠上皮细胞 | 首次开发了基于单细胞转录组数据的布尔网络控制框架，能够识别并调控分化轨迹中的主调控因子，实现癌症逆转 | 未提及框架对其他癌症类型或组织的适用性，且体内外实验样本量有限 | 识别并控制细胞分化轨迹中的主调控因子，诱导癌细胞逆转 | 人类大肠单细胞转录组数据及结直肠癌细胞 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 布尔网络 | 转录组数据 | 人类大肠单细胞样本（未具体说明数量）及体外和体内实验样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4 | 2026-05-16 |
Spatial and Single-Cell Transcriptomics Unraveled Spatial Evolution of Papillary Thyroid Cancer
2025-01, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202404491
PMID:39540244
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研究论文 | 整合单细胞RNA测序和空间转录组学，揭示甲状腺乳头状癌的空间演化机制 | 首次结合单细胞RNA测序与空间转录组学解析甲状腺乳头状癌的空间异质性和演化路径，发现肿瘤细胞通过增强有氧代谢、抑制mRNA翻译及蛋白质合成、以及细胞间相互作用驱动多路径演化，并识别出恶性与转移基因足迹 | 单细胞RNA测序丢失空间信息，空间转录组学分辨率有限，可能遗漏稀有细胞亚型；需要更大样本验证足迹的诊断价值 | 阐释甲状腺乳头状癌的空间异质性、恶性进展和转移机制，提出改进的诊断策略 | 甲状腺乳头状癌肿瘤细胞及其正常甲状腺细胞 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5 | 2026-05-15 |
Tertiary Lymphoid Structure in Dental Pulp: The Role in Combating Bacterial Infections
2025-01, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202406684
PMID:39465672
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和多重免疫荧光染色揭示了人类牙髓中三级淋巴结构（TLS）在对抗细菌感染中的作用 | 首次在牙髓中发现三级淋巴结构，并鉴定出CCL3可能为TLS形成的关键驱动因子 | TLS在免疫反应中的具体角色及其形成调控分子仍不完全确定 | 研究牙髓中三级淋巴结构在抗细菌感染免疫反应中的形成和功能 | 健康和发炎的人类牙髓组织以及小鼠牙髓炎模型 | 数字病理学 | 牙髓炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类牙髓组织（健康与发炎）和小鼠牙髓炎模型样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于人类牙髓样本的单细胞分析 |
| 6 | 2026-05-15 |
Targeting SLITRK4 Restrains Proliferation and Liver Metastasis in Colorectal Cancer via Regulating PI3K/AKT/NFκB Pathway and Tumor-Associated Macrophage
2025-01, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202400367
PMID:39499724
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研究论文 | 该研究通过分析结直肠癌患者原发癌旁组织、肿瘤和肝转移灶的转录组，发现SLITRK4是肝转移中上调最显著的基因，并通过体外和体内实验证实其促进肿瘤发生、侵袭、迁移和血管生成，抑制SLITRK4可抑制肿瘤生长和肝转移，机制涉及PI3K/AKT/NFκB通路激活及肿瘤相关巨噬细胞浸润和极化 | 首次发现SLITRK4在结直肠癌肝转移中高表达并通过调控PI3K/AKT/NFκB通路和肿瘤相关巨噬细胞促进转移，并利用脂质聚合物杂化纳米颗粒递送siRNA实现靶向治疗 | 未提及具体局限性 | 探索结直肠癌肝转移的新型驱动因子SLITRK4的功能及潜在治疗靶点 | 结直肠癌患者原发癌旁组织、肿瘤组织和肝转移组织，以及体外细胞模型和体内小鼠模型 | 机器学习 | 结直肠癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据, 单细胞转录组数据 | 人类患者组织样本（原发癌旁、肿瘤和肝转移）和小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 用于单细胞RNA测序 |
| 7 | 2026-05-15 |
Identifying Multiomic Signatures of X-Linked Retinoschisis-Derived Retinal Organoids and Mice Harboring Patient-Specific Mutation Using Spatiotemporal Single-Cell Transcriptomics
2025-01, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202405818
PMID:39503290
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研究论文 | 本研究采用多组学方法，结合单细胞RNA测序和时空转录组学，识别由患者特异性突变引起的X连锁视网膜劈裂症衍生视网膜类器官和小鼠的多组学特征 | 首次利用多模态方法（高吞吐量单细胞RNA测序和时空转录组学）在两种XLRS样模型（基因工程小鼠和患者衍生视网膜类器官）中全面解析疾病特异性转录组特征，并发现慢性内质网应激/eIF2信号通路作为保守疾病通路，为治疗提供新靶点 | 未明确说明研究局限性 | 阐明X连锁视网膜劈裂症（XLRS）的转录组特征和病理机制，探索潜在治疗靶点 | 携带患者特异性p.R209C突变的基因工程Rs1小鼠和患者衍生视网膜类器官 | 数字病理学 | X连锁视网膜劈裂症 | 单细胞RNA测序, 时空转录组学, 蛋白质组学, Western印迹 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 蛋白质组数据 | 基因工程Rs1小鼠和患者衍生视网膜类器官（具体数量未提供） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium Single Cell 3'用于单细胞RNA测序，10x Visium用于空间转录组学 |
| 8 | 2026-05-15 |
PD-1+CD8+ T Cell-Mediated Hepatocyte Pyroptosis Promotes Progression of Murine Autoimmune Liver Disease
2025-01, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202407284
PMID:39494472
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和体外实验，揭示了PD-1+CD8+ T细胞通过颗粒酶B和穿孔素-1诱导肝细胞焦亡，促进自身免疫性肝病进展的机制 | 首次发现PD-1+CD8+ T细胞亚群在自身免疫性肝病中通过GSDMD介导的焦亡途径发挥致病作用，并证明CAR-T细胞清除该细胞群可缓解疾病 | 研究主要基于小鼠模型，结果向人类疾病的转化需要进一步验证；焦亡通路的详细分子机制尚未完全阐明 | 阐明自身免疫性肝病中效应通路的特异性机制，寻找潜在治疗靶点 | dnTGFβRII Aire小鼠模型中的肝脏自身反应性CD8 T细胞及肝细胞 | 数字病理学 | 自身免疫性肝病 | NGS, 单细胞测序, 体外分析 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞测序平台 |
| 9 | 2026-05-15 |
Landscape of the Peripheral Immune Response Induced by Intraoperative Radiotherapy Combined with Surgery in Early Breast Cancer Patients
2025-01, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202308174
PMID:39494578
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和T细胞受体测序，分析早期乳腺癌患者术中放疗联合手术后的外周免疫反应 | 首次全面分析术中放疗联合手术诱导的外周免疫反应，揭示了CD8Teff_GZMK细胞毒性增加、MIF信号通路变化及T细胞克隆扩增等新发现 | 研究样本量较小，且仅关注早期乳腺癌患者，缺乏长期随访数据 | 探究术中放疗联合手术对早期乳腺癌患者外周免疫细胞的影响 | 早期乳腺癌患者的外周血单个核细胞 | 自然语言处理 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序, 流式细胞术, 共培养实验 | NA | 基因表达数据 | 早期乳腺癌患者的外周血样本，具体数量未在摘要中说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 用于单细胞RNA测序和单细胞T细胞受体测序 |
| 10 | 2026-05-12 |
SpatialSNV: A novel method for identifying and analyzing spatially resolved SNVs in tumor microenvironments
2025-01-06, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giaf065
PMID:40515555
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研究论文 | 开发了一种名为SpatialSNV的新方法，用于识别和分析肿瘤微环境中空间分辨的单核苷酸变异 | 首次利用多种空间转录组平台识别肿瘤切片中的有效SNV，揭示SNV反映区域肿瘤进化轨迹并超越RNA表达变化，发现肿瘤边缘具有独特突变谱，且新SNV随距离递减 | 未明确指出局限性 | 理解肿瘤微环境中SNV的动态及其对肿瘤免疫串扰的影响，并识别潜在治疗靶点 | 肿瘤组织切片中的单核苷酸变异 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | 多种空间转录组平台 | NA |
| 11 | 2026-05-12 |
SeuratExtend: streamlining single-cell RNA-seq analysis through an integrated and intuitive framework
2025-01-06, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giaf076
PMID:40627366
|
研究论文 | SeuratExtend是一个基于Seurat框架的R包，通过集成多种工具和数据库，简化单细胞RNA-seq数据分析流程 | 通过统一R接口集成多个流行Python工具（如scVelo、Palantir、SCENIC），并引入通路水平分析和簇注释的新应用 | 未提及具体局限性 | 为scRNA-seq数据提供集成、直观且用户友好的分析框架 | 肿瘤相关高内皮小静脉和自身炎症性疾病的scRNA-seq数据 | 机器学习 | 癌症, 自身炎症性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2026-05-12 |
A framework to mine laser microdissection-based omics data and uncover regulators of pancreatic cancer heterogeneity
2025-01-06, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giaf101
PMID:40910795
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研究论文 | 提出并验证了一个优化框架，用于对激光显微切割获取的多个空间分辨肿瘤区域进行RNA测序，以揭示胰腺导管腺癌的异质性及其调控机制 | 开发了LMD-seq优化框架，提高了检测低表达基因的灵敏度，优于单细胞RNA-seq方法，特别在识别稀有肿瘤细胞群体和低表达转录程序方面 | 未在标题和摘要中明确说明研究的局限性 | 挖掘基于激光显微切割的组学数据，揭示胰腺癌异质性的调控因子 | 胰腺导管腺癌的多个空间分辨肿瘤区域 | 机器学习 | 胰腺癌 | RNA测序 | NA | 测序数据 | 未在标题和摘要中明确说明样本数量 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 多个空间分辨激光显微切割肿瘤区域的RNA测序 |
| 13 | 2026-05-12 |
AEnet: a practical tool to construct the splicing-associated phenotype atlas at a single cell level
2025-01-06, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giaf110
PMID:40990037
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research paper | AEnet是一种结合基因表达与可变剪接模式的新型方法，用于在单细胞水平构建剪接相关表型图谱 | 首次将基因表达水平与可变剪接模式整合，提出'细胞亚群'新概念，并识别关键剪接事件及其调控机制 | 单细胞测序数据存在测序深度浅、高丢失率和批次效应等固有局限性 | 开发AEnet工具以剖析细胞异质性并定义细胞亚群 | 肿瘤细胞、泛癌免疫细胞和胚胎细胞 | machine learning | cancer | scRNA-seq | AEnet | gene expression profiles and splicing patterns | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 14 | 2026-05-12 |
GTestimate: improving relative gene expression estimation in scRNA-seq using the Good-Turing estimator
2025-01-06, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giaf084
PMID:41159548
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研究论文 | 提出了基于Good-Turing估计器的GTestimate方法，改进了scRNA-seq中相对基因表达估计并开发了验证方法cta-seq | 首次将Good-Turing估计器应用于单细胞RNA-seq数据标准化，解决传统方法忽略未观测基因的问题，并开发了细胞靶向PCR扩增方法cta-seq进行验证 | 未提及具体局限性，但依赖Seurat工作流可能限制了与其他工具的兼容性 | 改进单细胞RNA-seq数据中相对基因表达估计的准确性 | 单细胞RNA-seq数据中的相对基因表达估计 | 机器学习 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, PCR扩增 | Good-Turing估计器 | 基因表达数据 | 4个示例数据集 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 15 | 2026-05-12 |
Unsupervised multiscale clustering of single-cell transcriptomes to identify hierarchical structures of cell subtypes
2025-01-06, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giaf111
PMID:41066207
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研究论文 | 开发一种无监督多尺度聚类方法MSC，用于从单细胞转录组数据中识别细胞亚型的层次结构 | 提出多尺度聚类方法MSC，通过构建稀疏细胞-细胞关联网络，能够在多个分辨率下无监督识别新的细胞类型和亚型，并揭示有生物学意义的细胞层次结构 | 未在摘要中明确提及局限性 | 开发一种能够更精细解析单细胞RNA测序数据中细胞层次结构的无监督聚类方法 | 模拟银标准、金标准数据以及真实疾病单细胞RNA测序数据中的细胞群体 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | MSC（多尺度聚类） | 单细胞转录组数据 | NA（未明确样本数量） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 16 | 2026-05-12 |
Microglia phagocytosis of PNNs mediates PV-positive interneuron dysfunction and associated gamma oscillations in neuroinflammation-induced cognitive impairment in mice
2025-01-01, Neuropharmacology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.neuropharm.2024.110205
PMID:39489286
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研究论文 | 研究揭示小胶质细胞吞噬周神经网介导PV阳性中间神经元功能障碍及γ振荡在神经炎症诱导的小鼠认知损伤中的作用 | 首次发现小胶质细胞通过ApoE介导的周神经网吞噬作用导致PV阳性中间神经元功能障碍和γ振荡异常，从而引发认知损伤，并通过抑制ApoE或过表达Hapln1改善损伤 | 研究仅使用小鼠模型，未在人类样本中验证；长期神经炎症的影响未评估 | 探讨神经炎症引起认知损伤中周神经网与ApoE的关联机制 | C57BL/6J小鼠和CX3CR1-CreERT2小鼠 | 数字病理学 | 认知障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 17 | 2026-05-12 |
Spatial transcriptomics reveals Inhba/Smad2/E2f4 axis in Lrp2high thecal cell proliferation in androgen-induced PCOS mice
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1633254
PMID:40831751
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research paper | 利用空间转录组学揭示雄激素诱导的PCOS小鼠模型中Lrp2高表达膜细胞增殖的Inhba/Smad2/E2f4轴 | 首次通过空间转录组学在细胞分辨率下揭示PCOS小鼠卵巢中Lrp2高表达膜细胞亚群及其Inhba/Smad2/E2f4信号轴对细胞增殖的调控作用 | 研究基于小鼠模型，尚未在人类PCOS卵巢组织中进行验证；功能验证仅限于体外细胞实验，缺乏体内数据支持 | 阐明PCOS中膜细胞异常增殖的分子机制 | DHEA诱导的PCOS小鼠模型中的卵巢膜细胞 | spatial transcriptomics | 多囊卵巢综合征 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | DHEA诱导的PCOS小鼠模型卵巢组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 18 | 2026-05-12 |
Identification of Dendritic Cell-Associated Genes in COPD Based on Bioinformatics
2025, International journal of chronic obstructive pulmonary disease
IF:2.7Q2
DOI:10.2147/COPD.S543753
PMID:41185886
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研究论文 | 通过生物信息学预测和实验验证，识别慢性阻塞性肺疾病（COPD）肺组织中与树突状细胞相关的基因 | 首次利用单细胞RNA测序和加权基因共表达网络分析综合鉴定COPD中树突状细胞相关基因，并通过体内外实验验证了RASGRP3、C1QB、BLOC1S2和VSIG4的表达变化 | 未提供明确局限性信息 | 利用生物信息学预测和实验验证，识别COPD患者肺组织中与树突状细胞相关的关键基因 | COPD患者肺组织及香烟烟雾诱导的肺气肿小鼠模型 | 生物信息学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、RNA测序（RNA-seq）、加权基因共表达网络分析（WGCNA）、实时定量PCR（RT-qPCR）、蛋白质印迹法（Western blot） | NA | 基因表达数据 | 多个公开数据集（GSE196638、GSE26296、GSE38974）及小鼠模型（香烟烟雾诱导肺气肿小鼠和骨髓来源树突状细胞） | NA | scRNA-seq、RNA-seq | NA | NA |
| 19 | 2026-05-12 |
ER Stress-Related Biomarkers in Chronic Obstructive Pulmonary Disease: A Comprehensive Transcriptome, Mendelian Randomization, and Machine-Learning Analysis
2025, International journal of chronic obstructive pulmonary disease
IF:2.7Q2
DOI:10.2147/COPD.S548160
PMID:41328289
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研究论文 | 通过转录组分析、孟德尔随机化和机器学习方法，识别慢性阻塞性肺疾病（COPD）中内质网应激相关基因DNAJB1作为风险基因及其诊断价值 | 首次整合单细胞测序、孟德尔随机化和机器学习方法，系统鉴定DNAJB1作为COPD风险基因，并建立包含9个关键基因的诊断生物标志物组合 | 研究基于公开数据集，需要进一步在独立队列中验证；孟德尔随机化揭示的因果关联需更深入的机制研究证实 | 探究内质网应激相关基因DNAJB1在COPD发病中的风险角色及临床诊断价值 | 慢性阻塞性肺疾病患者及对照样本的转录组数据和遗传变异数据 | 机器学习 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序、微阵列分析、孟德尔随机化 | 机器学习分类器 | 基因表达数据、遗传变异数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、微阵列分析 | NA | NA |
| 20 | 2026-05-12 |
Two-Step Positive Selection Method for the Magnetic Isolation of Lymphatic Endothelial Cells
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4706-6_2
PMID:40859071
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研究论文 | 描述了一种利用双抗体磁珠分选法从组织中分离淋巴内皮细胞（LEC）的方法 | 采用两步阳性选择策略，结合双抗体标记，高效富集稀有淋巴内皮细胞，解决了常规分离方法中LEC纯度低的问题 | 未提及与其他分离方法的直接比较，可能对组织来源和细胞状态有依赖性 | 开发一种可靠的稀有细胞分离方法，用于研究淋巴内皮细胞在生理和病理状态下的功能 | 淋巴内皮细胞（LEC） | 分子生物学 | NA | 磁珠分选 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |