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当前共找到 2164 篇文献,本页显示第 1 - 20 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1 2026-03-29
SwarmMAP: Swarm Learning for Decentralized Cell Type Annotation in Single Cell Sequencing Data
2025-Jan-16, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文开发了一种名为SwarmMAP的基于群体学习(Swarm Learning)的机器学习方法,用于在单细胞测序数据中以去中心化的方式自动进行细胞类型注释 首次将群体学习应用于单细胞测序数据的细胞类型注释,实现了在无需交换原始数据的情况下进行去中心化模型训练,解决了数据隐私和可扩展性问题 摘要中未明确提及具体的研究局限性 开发一种标准化、自动化且保护隐私的跨数据集细胞类型注释方法 人类心脏、肺和乳腺组织的单细胞转录组数据 机器学习 NA 单细胞测序 基于Swarm Learning的机器学习模型 单细胞转录组数据 摘要中未提供具体样本数量,涉及多个数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2 2026-03-29
RARS1 inhibits ENO1 ubiquitination and degradation to protect against ferroptosis in hepatocellular carcinoma
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究探讨了RARS1基因在肝细胞癌(LIHC)进展中的作用及其作为治疗靶点的潜力 首次揭示了RARS1通过抑制ENO1的泛素化和降解来保护肝细胞癌免受铁死亡的影响,并基于AR-DEGs对LIHC进行了分子亚型分类 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,缺乏体内实验验证,且药物敏感性分析仅限于AH.6809一种化合物 研究RARS1在肝细胞癌进展中的作用及其治疗潜力 肝细胞癌(LIHC)患者和细胞系 生物信息学与分子生物学 肝细胞癌 差异表达分析、Cox回归分析、非负矩阵分解(NMF)、转录组学、单细胞测序、空间转录组学 NA 转录组数据、单细胞数据、空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
3 2026-03-28
Decreased miR-486-5p is involved in lipopolysaccharide-induced HTR-8/SVneo cell dysfunction by promoting SMAD2 expression
2025-01-01, Reproduction (Cambridge, England)
研究论文 本研究探讨了miR-486-5p/Smad2通路在脂多糖诱导的绒毛外滋养细胞功能障碍及早期妊娠丢失发病机制中的作用 揭示了miR-486-5p通过靶向SMAD2调控绒毛外滋养细胞侵袭和TNFα产生的新机制,并利用单细胞RNA测序数据验证了SMAD2在复发性流产患者中的表达变化 研究主要基于细胞系HTR-8/SVneo和动物模型,人类样本验证有限,且未深入探讨其他潜在靶点或通路 阐明miR-486-5p在早期妊娠丢失发病机制中的具体作用及其分子通路 绒毛外滋养细胞(EVT)系HTR-8/SVneo、LPS诱导的早期妊娠丢失模型、人类蜕膜单细胞RNA测序数据 生殖医学 早期妊娠丢失 单细胞RNA测序、转录组分析、细胞功能实验 NA 基因表达数据、细胞实验数据 细胞系实验及公共数据库(GEO)中的人类样本数据 NA 单细胞RNA测序 NA NA
4 2026-03-28
Modeling reproductive and pregnancy-associated tissues using organ-on-chip platforms: challenges, limitations, and the high throughput data frontier
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology IF:4.3Q2
综述 本文综述了使用器官芯片平台建模生殖和妊娠相关组织的挑战、局限性以及高通量数据前沿 探讨了器官芯片技术在生殖和妊娠领域应用的创新点,包括克服现有平台限制的新方法,如空间转录组学和成像流式细胞术 描述了器官芯片平台的局限性,如细胞数量少、上清液体积低、制造材料限制以及分子和生化检测的不足 旨在评估器官芯片技术在生殖和妊娠相关生理病理建模及药物评估中的应用潜力和挑战 生殖和妊娠相关的器官芯片平台 生物医学工程 NA 空间转录组学、成像流式细胞术、外泌体分析 NA 图像、分子数据 NA NA 器官芯片、微生理系统 NA NA
5 2026-03-25
High fat diet-induced loss of pituitary plasticity in aging female mice with ablated leptin signaling in somatotropes
2025, Frontiers in endocrinology IF:3.9Q2
研究论文 本研究探讨高脂饮食对缺乏生长激素细胞中瘦素受体的老年雌性小鼠垂体转录组功能的影响 首次揭示高脂饮食通过下调翻译调控通路和减少多潜能细胞表达,损害老年小鼠垂体可塑性,尤其在瘦素受体缺失突变体中更显著 研究仅基于小鼠模型,未涉及人类样本;样本量相对较小;未深入探讨高脂饮食诱导的氧化应激具体分子机制 探究高脂饮食如何影响缺乏生长激素细胞瘦素受体的老年雌性小鼠垂体转录组功能 10月龄缺乏生长激素细胞瘦素受体的雌性突变小鼠及其同窝对照小鼠 单细胞转录组学 肥胖相关代谢疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、生物信息学分析、葡萄糖耐量测试、代谢笼监测 NA 单细胞转录组数据、血清激素和细胞因子数据 老年雌性突变小鼠和对照小鼠,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
6 2026-03-25
MFSD12 promotes proliferation, metastasis and invasion of hepatocellular carcinoma cells and its potential correlation with HAVCR2/LGALS9 immune checkpoint axis
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究探讨了MFSD12在肝细胞癌(LIHC)进展中的潜在作用,发现其高表达与不良预后相关,并可能通过促进肿瘤细胞增殖、迁移和侵袭,以及与HAVCR2/LGALS9免疫检查点轴相互作用来调节肿瘤免疫微环境 首次在泛癌分析中揭示MFSD12在LIHC中的特异性高表达,并通过单细胞RNA测序和功能实验验证其在肿瘤细胞和先天淋巴样细胞中的表达,以及通过MFSD12-siRNA调控HAVCR2/LGALS9免疫检查点轴的新机制 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,缺乏体内模型验证,且MFSD12与HAVCR2/LGALS9轴的具体相互作用机制尚未完全阐明 探究MFSD12在肝细胞癌进展中的潜在作用及其与免疫检查点轴的相关性 肝细胞癌(LIHC)细胞及肿瘤微环境中的免疫细胞 数字病理学 肝癌 单细胞RNA测序,免疫组化分析,生物信息学分析 NA 基因表达数据,单细胞RNA测序数据,临床数据 基于TCGA、GEO和ArrayExpress数据库的泛癌数据集,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
7 2026-03-25
A Multi-Faceted Approach to Explore the Role of Inflammatory CAFs, Providing Prognostic Value and Therapeutic Implications in Lung Adenocarcinoma
2025, International journal of genomics IF:2.6Q2
研究论文 本研究通过整合批量RNA数据和单细胞RNA测序数据,识别了肺腺癌中的炎性癌症相关成纤维细胞亚型,并开发了一个基于iCAF的预后特征,用于预测患者临床结局、免疫景观和治疗反应 首次在肺腺癌中系统性地识别并表征了iCAF亚型,并利用机器学习算法筛选出四个关键基因构建了ICAFBS预后特征,同时通过功能研究验证了PFN2作为潜在治疗靶点 研究主要基于公共数据库数据,缺乏前瞻性临床验证,且功能研究仅限于细胞系水平,未涉及动物模型或临床试验 探索肺腺癌中炎性癌症相关成纤维细胞的特征及其临床意义,开发预后预测模型并寻找潜在治疗靶点 肺腺癌患者样本数据及肺腺癌细胞系 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序,批量RNA测序,机器学习算法 机器学习算法(未指定具体模型) RNA测序数据 多个公共数据库中的肺腺癌样本数据,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq NA NA
8 2026-03-25
Comprehensive Single-Cell Characterization of LDL in the Ovarian Cancer Microenvironment and Its Prognostic Implications
2025, Mediators of inflammation IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析,系统揭示了低密度脂蛋白在卵巢癌微环境中的分布、功能通路及预后价值,并构建了一个有效的预后预测模型 首次在单细胞水平上全面表征LDL在卵巢癌微环境中的分布和功能,并构建了基于多队列验证的LDL相关卵巢癌预后特征模型 研究主要基于转录组数据,缺乏对LDL蛋白水平或代谢功能的直接验证 阐明LDL在卵巢癌肿瘤微环境中的具体作用机制及其预后意义 卵巢癌患者的单细胞转录组数据及八个队列的批量RNA-seq数据 数字病理学 卵巢癌 单细胞RNA测序,批量RNA测序 机器学习模型 转录组数据 涉及多个队列的卵巢癌患者样本,具体数量未在摘要中明确 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
9 2026-03-25
Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals an Inflammatory Antigen-Presenting Macrophages Subtype Drive Vitiligo Pathogenesis Through STAT1-Mediated Dual Mechanisms
2025, Mediators of inflammation IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析揭示了白癜风中一种未表征的炎症性抗原呈递巨噬细胞亚型,通过STAT1介导的双重机制驱动疾病发病 首次在白癜风中鉴定出一种新的炎症性抗原呈递巨噬细胞亚型(Mac-InflamAP),并阐明其通过STAT1介导的直接抑制黑素细胞和增强T细胞活化的双重机制 研究主要基于单细胞转录组数据和实验验证,但样本量可能有限,且体内外实验的转化应用需进一步验证 阐明巨噬细胞在白癜风发病机制中的异质性和功能,特别是通过STAT1介导的机制 健康与白癜风患者的皮肤组织,包括巨噬细胞、T细胞和黑素细胞 数字病理学 白癜风 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
10 2026-03-25
Integrative Genomic and Single-Cell Insights Into Efferocytosis-Mediated Immune Regulation in Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2025, Mediators of inflammation IF:4.4Q2
研究论文 本文通过整合基因组学和单细胞技术,探讨了efferocytosis在透明细胞肾细胞癌中的免疫调节作用及其预后意义 首次在ccRCC中系统量化efferocytosis通路活性,并构建了基于岭回归的预后模型,结合多组学整合和单细胞空间转录组学鉴定出RAC1作为关键风险基因 研究主要基于生物信息学分析,实验验证相对有限,且样本来源和平台可能引入偏差 阐明efferocytosis在ccRCC中的预后价值和分子机制,以发现潜在生物标志物和治疗靶点 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)患者样本 生物信息学 肾细胞癌 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 免疫组化, 基因组学分析 岭回归模型 基因组数据, 转录组数据, 单细胞数据, 空间转录组数据, 蛋白质数据 未明确指定样本数量,但使用了多个独立数据集 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
11 2026-03-25
Glioblastoma Prognosis and Therapeutic Response Predicted by a Cancer-Associated Fibroblasts Risk Score
2025, Mediators of inflammation IF:4.4Q2
研究论文 本研究基于癌症相关成纤维细胞特征,开发了一个用于预测胶质母细胞瘤预后和治疗反应的评分模型 首次系统性地将CAFs相关特征整合到GBM预后模型中,并构建了包含风险评分和临床病理特征的列线图,提高了预测准确性 研究主要依赖公共数据库数据,缺乏前瞻性临床验证,且样本量可能有限 开发一个基于CAFs的预后模型,以改善GBM患者的精确分层和治疗策略 胶质母细胞瘤患者及其肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞 数字病理学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序 回归分析模型 单细胞RNA测序数据 来自多个公共数据库的GBM相关数据,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
12 2026-03-24
Myeloid-driven immunosuppression in head and neck cancer: single-cell ATAC/RNA and spatial transcriptomic perspectives
2025, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
综述 本文综述了单细胞ATAC/RNA测序和空间转录组学在揭示头颈癌中髓系细胞驱动的免疫抑制机制方面的进展,并评估了相关的转化机遇 整合单细胞多组学(ATAC/RNA)与空间转录组学数据,系统解析了头颈癌中不同于经典淋巴细胞耗竭的、以髓系细胞为中心的免疫抑制新机制(如SPP1 TAM屏障、cDC1/IL-12不足、CXCL8-CXCR1/2驱动的中性粒细胞迁移),并提出了将这些发现与现有疗法(如PD-1抑制剂、EGFR抗体)及新兴髓系检查点(如CD47-SIRPα、PI3Kγ、CXCR1/2)相结合的精准免疫治疗新策略 存在HPV状态异质性、检测方法标准化有限、预测性生物标志物缺乏等挑战,限制了临床转化应用 总结并评估单细胞多组学和空间转录组学在解析头颈鳞状细胞癌(HNSCC)髓系免疫抑制机制及指导精准免疫治疗方面的进展与转化潜力 头颈鳞状细胞癌(HNSCC)中的髓系免疫细胞(如肿瘤相关巨噬细胞、树突状细胞、中性粒细胞)及其介导的免疫抑制微环境 数字病理学 头颈癌 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA 单细胞多组学数据, 空间转录组数据 NA NA 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
13 2026-03-23
Single Cell Profiling in the Sox10Dom Hirschsprung Mouse Implicates Hox Genes in Enteric Neuron Trajectory Allocation
2025, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,探究了Sox10Dom突变对小鼠肠道神经系统发育中神经元轨迹分配的影响,并首次将Hox基因表达变化与神经元轨迹改变相关联 首次在Sox10Dom突变模型中,通过单细胞RNA测序揭示了Hox基因(特别是Hoxa6)表达变化与肠道神经元轨迹分配异常的关联 研究基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类疾病;样本量相对较小,且仅聚焦于早期发育阶段 探究Sox10缺陷如何改变肠道神经元比例,并阐明其在早期肠道神经系统发育中的作用机制 Sox10+/+和Sox10Dom/+同窝小鼠的肠道神经系统祖细胞、发育中神经元和肠胶质细胞 单细胞组学 先天性巨结肠症 单细胞RNA测序,免疫组织化学,杂交链式反应 NA 单细胞转录组数据,图像数据 Sox10+/+和Sox10Dom/+同窝小鼠的肠道神经系统细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
14 2026-03-23
Spatial transcriptomics reveals distinct role of monocytes/macrophages with high FCGR3A expression in kidney transplant rejections
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究利用空间转录组学技术,揭示了高表达FCGR3A的单核细胞/巨噬细胞在肾移植排斥反应中的关键作用 首次在肾移植排斥反应中,通过空间转录组学识别出高表达FCGR3A的单核细胞/巨噬细胞亚群,并关联其空间分布与组织病理学特征 研究基于有限的人类肾移植活检样本,未涉及长期随访或功能验证实验 探究先天免疫细胞亚群在肾移植排斥反应中的具体作用机制 人类肾移植物的福尔马林固定石蜡包埋核心针活检样本 空间转录组学 肾移植排斥反应 空间转录组学 NA 空间转录组数据 人类肾移植活检样本(具体数量未明确) NA 空间转录组学 NA NA
15 2026-03-21
Gut microbial production of lithocholic acid reprograms pro-resolutive macrophages to enhance vedolizumab responsiveness via the TGR5/FXR-NF-κB axis
2025-Jan-02, The ISME journal
研究论文 本研究揭示了肠道微生物代谢物石胆酸通过TGR5/FXR-NF-κB轴重编程巨噬细胞为促消退表型,从而增强克罗恩病患者对维多珠单抗治疗反应性的机制 首次阐明肠道微生物来源的石胆酸通过调控巨噬细胞表型转换来增强维多珠单抗疗效的分子机制,并发现TGR5/FXR-NF-κB轴在这一过程中的关键作用 研究主要基于人源化小鼠模型,临床验证尚需进一步开展;机制研究多依赖体外实验,体内复杂微环境的影响需更深入探索 探究克罗恩病患者对维多珠单抗治疗反应差异的机制,寻找预测治疗反应的生物标志物 克罗恩病患者肠道微生物代谢物、肠道巨噬细胞、人源化小鼠结肠炎模型 微生物组学与免疫学 克罗恩病 宏基因组学、代谢组学、单细胞RNA测序、转录组分析、粪便微生物移植 人源化小鼠模型 基因组数据、代谢组数据、转录组数据 未明确说明具体样本数量,涉及临床供体粪便样本和人源化小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
16 2026-03-21
Deciphering the Complexities of Pulmonary Hypertension: The Emergent Role of Single-Cell Omics
2025-Jan, American journal of respiratory cell and molecular biology IF:5.9Q1
综述 本文综述了单细胞组学技术在肺动脉高压研究中的应用与进展 系统阐述了单细胞转录组学如何超越传统批量分析的限制,揭示肺动脉高压中复杂的细胞生态系统、细胞间相互作用和亚型转变,为发现新的治疗靶点和生物标志物提供了前所未有的精细视角 面临单细胞RNA测序分辨率需进一步提高、人体组织样本处理存在技术障碍、以及需要整合多种组学方法以全面理解疾病分子机制等挑战 探讨单细胞组学技术在理解肺动脉高压复杂病理机制和推动精准医疗发展中的作用 肺动脉高压患者的肺组织细胞,特别是内皮细胞、平滑肌细胞、周细胞和免疫细胞 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
17 2026-03-21
CellChat for systematic analysis of cell-cell communication from single-cell transcriptomics
2025-01, Nature protocols IF:13.1Q1
研究论文 本文介绍了CellChat v2,一个用于从单细胞转录组数据中推断和分析细胞间通信网络的更新计算工具 CellChat v2通过简化的质量作用模型量化细胞间信号通信概率,整合了配体-受体核心相互作用及辅助因子调制,并提供了系统比较分析和交互式探索功能 协议执行时间取决于数据集大小,且需要基本的R语言和单细胞数据分析知识,但无需专门的生物信息学培训 开发并应用计算工具来系统分析单细胞转录组数据中的细胞间通信网络 单细胞转录组数据中的细胞群体及其通信网络 计算生物学 NA 单细胞转录组测序 基于质量作用的简化模型 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
18 2026-03-21
CX3CR1+ Monocytes/Macrophages Promote Regional Immune Injury in Mesangial Proliferative Glomerulonephritis through Crosstalk with Activated Mesangial Cells
2025, Research (Washington, D.C.)
研究论文 本研究揭示了在系膜增生性肾小球肾炎中,活化的系膜细胞与CX3CR1+单核细胞/巨噬细胞通过CX3CL1-CX3CR1轴相互作用,促进肾小球局部免疫损伤的机制 首次通过单细胞RNA测序和细胞通讯分析,明确了CX3CL1-CX3CR1轴在MsPGN局部免疫损伤中的核心作用,并验证了靶向该轴的抗体(quetmolimab)的治疗潜力 NA 阐明系膜增生性肾小球肾炎中局部免疫损伤的分子机制,并探索新的治疗靶点 IgA肾病患者的临床标本、MsPGN动物模型、系膜细胞、单核细胞/巨噬细胞 数字病理学 肾脏疾病 单细胞RNA测序, RNA-seq, Luminex多重免疫分析, 分子分析 NA 单细胞转录组数据, 基因表达数据, 蛋白质数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
19 2026-03-21
Fibroblast-derived interleukin-11 as a potential biomarker for intestinal fibrostenosis in Crohn's disease
2025, Therapeutic advances in gastroenterology IF:3.9Q1
研究论文 本研究探讨了白细胞介素-11(IL-11)作为克罗恩病(CD)相关肠道纤维狭窄潜在生物标志物的价值 首次通过转录组学、血清检测和单细胞RNA测序综合验证了成纤维细胞来源的IL-11在CD肠道纤维狭窄中的表达增加及其促纤维化功能 这是一项观察性研究,样本量有限,且未在独立队列中进行外部验证 研究白细胞介素在检测CD相关肠道纤维狭窄中的价值 克罗恩病患者的肠道组织样本和血清样本 生物信息学 克罗恩病 RNA测序,实时聚合酶链反应,免疫组织化学,单细胞RNA测序,Luminex血清检测 NA 转录组数据,血清蛋白数据,单细胞RNA测序数据 来自CD手术切除的配对组织样本(非受累和纤维狭窄段)及血清样本 NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
20 2026-03-21
High-resolution single-cell RNA sequencing using canFam4 reveals novel immune subsets and checkpoint programs in healthy dogs
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究使用10x Genomics平台和canFam4基因组,通过单细胞RNA测序构建了健康小型犬外周白细胞的单细胞图谱,揭示了51个独特的免疫亚群及其免疫检查点机制 首次使用更新后的canFam4基因组进行高分辨率单细胞RNA测序,在健康犬中识别出多个在canFam3.1研究中未被充分代表的免疫亚群,并揭示了免疫检查点程序如PDCD1、LAG3、CD274和CTLA4在免疫稳态中的新功能关联 样本仅来自六只健康小型犬,可能无法完全代表所有犬种或健康状况,且研究主要基于转录组数据,缺乏蛋白质水平验证 旨在通过高分辨率单细胞RNA测序全面解析健康犬的免疫异质性,识别新的免疫亚群并探索免疫检查点机制 健康小型犬的外周白细胞 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 6只健康小型犬,共30,040个高质量转录本 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Genomics平台用于单细胞RNA测序
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