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当前共找到 2148 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-02-12 |
MRGPRX2-expressing mast cells are increased in the GI tract of individuals with active inflammatory bowel disease and hereditary α-tryptasemia
2025, Frontiers in allergy
IF:3.3Q2
DOI:10.3389/falgy.2025.1726096
PMID:41647192
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研究论文 | 本研究探讨了遗传性α-类胰蛋白酶血症（HαT）患者胃肠道中MRGPRX2表达肥大细胞的增加及其在炎症性肠病（IBD）中的作用 | 首次在HαT背景下，结合空间转录组学和质谱流式细胞术，揭示了胃肠道肥大细胞表型改变及MRGPRX2表达上调与IBD活动的关联 | 样本量较小（空间转录组学n=8，质谱流式n=14），且仅针对特定肠道部位（降结肠和小肠）进行分析，可能限制结果的普适性 | 阐明HαT对胃肠道肥大细胞表型及MRGPRX2表达的影响，探索其在IBD症状发生中的潜在机制 | 遗传性α-类胰蛋白酶血症（HαT）患者及匹配的非HαT对照者的肠道组织样本 | 空间转录组学 | 炎症性肠病 | 空间转录组分析、质谱流式细胞术（CyTOF）、微滴数字PCR（ddPCR）、基因分型 | NA | 组织样本、转录组数据、蛋白质表达数据 | 854份生物样本库IBD样本进行基因分型；空间转录组分析8例（HαT=4，对照=4）；质谱流式分析14例（HαT=5，对照=9） | NA | 空间转录组学、单细胞蛋白质组学 | NA | NA |
| 2 | 2026-02-12 |
Multi-omics integration and machine learning-driven construction of an immunogenic cell death prognostic model for colon cancer and functional validation of FCGR2A
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1746907
PMID:41657770
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研究论文 | 本研究通过多组学整合与机器学习构建了一个基于免疫原性细胞死亡（ICD）相关基因的结肠癌预后模型，并验证了关键基因FCGR2A的功能 | 首次系统性地利用ICD相关基因构建结肠癌预后模型，结合单细胞RNA-seq数据解析T细胞状态，并通过大量机器学习模型组合优化特征选择 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，缺乏前瞻性临床队列验证；体外功能实验仅针对单个基因（FCGR2A） | 开发基于免疫原性细胞死亡的预后模型，探索其与肿瘤免疫微环境及治疗敏感性的关联 | 结肠腺癌（COAD）患者 | 机器学习 | 结肠癌 | 转录组学分析、单细胞RNA-seq、机器学习模型构建 | 随机生存森林（Random Survival Forest） | 转录组数据、临床数据、单细胞RNA-seq数据 | TCGA和GTEx的结肠腺癌患者数据，以及GSE17538和GSE38832作为外部验证队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3 | 2026-02-12 |
Multi-omics characterization of RNF157 expression patterns in hepatocellular carcinoma and development of an RNF157-associated prognostic signature
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1738424
PMID:41657776
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研究论文 | 本研究通过整合多组学和单细胞分析，表征了肝细胞癌中E3泛素连接酶RNF157的表达模式，开发了一个RNF157相关的预后特征，并探讨了其与肿瘤微环境的关系 | 在单细胞分辨率下表征RNF157在肝细胞癌中的异质性表达模式，并基于此开发了一个新的预后特征模型 | 预后模型的预测性能中等，需要独立验证才能临床应用 | 表征RNF157在肝细胞癌中的表达模式，开发预后特征，并探索其与肿瘤微环境的关系 | 肝细胞癌患者样本 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 多组学分析, 流式细胞术 | 预后特征模型 | RNA表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 来自TCGA、GEO数据库和scRNA-seq数据集(GSE149614)的临床和RNA表达数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2026-02-12 |
Integrative multi-omics and experimental analyses implicate PTK2 as a lorazepam-associated biomarker and potential therapeutic target in ovarian cancer
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1744802
PMID:41657774
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学分析和实验验证，发现PTK2是劳拉西泮与卵巢癌之间的潜在生物标志物和治疗靶点 | 首次将神经活性药物劳拉西泮与卵巢癌的分子靶点联系起来，并通过空间转录组学揭示了PTK2在肿瘤微环境中的特异性分布 | 研究主要基于生物信息学分析和体外细胞实验，缺乏体内动物模型验证和临床样本的直接药效学证据 | 识别和验证劳拉西泮与卵巢癌共有的分子靶点，以发现新的生物标志物和治疗机制 | 卵巢癌相关基因与劳拉西泮潜在靶点的交集基因，特别是PTK2基因 | 计算生物学 | 卵巢癌 | qPCR, CCK-8, 克隆形成, 伤口愈合, 流式细胞术, 单细胞转录组学, 空间转录组学 | Lasso-Cox模型 | 基因表达数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5 | 2026-02-12 |
Single-cell RNA-seq reveals a key role for Vibrio cholerae Mak toxins in Tetrahymena pyriformis killing and bacterial survival
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1729243
PMID:41657991
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA-seq技术揭示了霍乱弧菌Mak毒素在杀死四膜虫和细菌在EFVs中存活的关键作用 | 首次利用单细胞转录组学分析霍乱弧菌暴露于四膜虫时的异质性基因表达，并识别出Mak毒素作为抵抗原生动物捕食和EFVs内存活的关键介质 | 研究仅关注霍乱弧菌和四膜虫的相互作用，分子机制细节仍需进一步探索 | 探究霍乱弧菌抵抗原生动物捕食的分子机制及其在EFVs中的存活策略 | 霍乱弧菌和四膜虫 | 单细胞转录组学 | 霍乱 | 单细胞RNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 5,344个细菌细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6 | 2026-02-12 |
BMP and NODAL paracrine signalling regulate the totipotent-like cell state in embryonic stem cells
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1720355
PMID:41660012
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和计算框架，探讨了细胞间通讯如何调控胚胎干细胞中的全能样细胞状态，揭示了BMP和NODAL信号通路的关键作用 | 首次结合单细胞RNA测序和计算建模，系统分析胚胎干细胞中配体-受体相互作用，并功能验证BMP和NODAL信号在调控全能样细胞状态中的核心角色 | 研究主要基于体外培养系统，可能无法完全模拟体内胚胎发育的复杂环境，且信号通路的调控机制仍需进一步在体内验证 | 探究细胞间通讯在调控胚胎干细胞命运转变中的作用，特别是针对全能样细胞状态 | 异质性胚胎干细胞群体，尤其是模拟两细胞期胚胎的全能样细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 计算框架（用于建模配体-受体相互作用和下游调控效应） | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7 | 2026-02-12 |
Single-cell transcriptomics reveals keratinocyte dynamic processes associated with S100a4 expression in psoriasiform dermatitis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1744860
PMID:41660613
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了S100a4表达在银屑病样皮炎中与角质形成细胞动态过程相关的机制 | 首次结合CRISPR/Cas9基因敲除小鼠模型和单细胞RNA测序技术，系统解析了S100A4在银屑病发病中的细胞特异性转录景观和调控机制，特别是发现了Klf9介导的Krt15转录失调作为角化过度关键驱动因素的新机制 | 研究基于小鼠模型，结果向人类银屑病的直接转化需进一步验证；单细胞测序样本量相对有限，可能未完全捕获所有细胞亚群异质性 | 探究S100A4在银屑病发病中的具体功能及相关分子机制 | S100a4基因敲除小鼠的皮肤组织及角质形成细胞 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），CRISPR/Cas9基因编辑，生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确具体样本数量，但涉及不同处理组的小鼠皮肤组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8 | 2026-02-12 |
SLC12A7 serves as a prognostic and immunotherapeutic biomarker identified by multi-omics analysis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1712579
PMID:41668766
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研究论文 | 通过多组学分析，发现SLC12A7可作为多种癌症的预后和免疫治疗生物标志物 | 首次对SLC12A7进行泛癌分析，揭示其在肿瘤微环境中的异质性及与免疫细胞浸润和免疫检查点基因表达的关联 | 研究主要基于公共数据库和体外实验，缺乏体内实验验证和临床样本的直接验证 | 阐明SLC12A7在癌症中的潜在致癌作用，并评估其作为预后和免疫治疗靶点的临床相关性 | 多种癌症类型，特别是肝细胞癌 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 转录组学分析、单细胞RNA测序、体外功能实验 | NA | 转录组数据、临床数据、单细胞RNA测序数据 | 来自TCGA、GTEx、cBioPortal、TIMER 2.0和GEO数据库的多个癌症数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2026-02-12 |
Integrated single-cell and spatial transcriptomics combined with whole-exome sequencing reveal key hub genes and epithelial heterogeneity in bladder cancer
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1748105
PMID:41669266
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞、空间转录组和全外显子组测序数据，揭示了膀胱癌中的上皮细胞异质性，并识别出与肿瘤突变负荷相关的关键枢纽基因 | 首次整合单细胞RNA-seq、空间转录组和全外显子组测序数据，结合Ro/e算法识别出与肿瘤突变负荷（TMB）相关的关键上皮细胞亚群Epi14，并从中鉴定出枢纽基因ABRACL和ARPC3 | 样本量相对有限（13个单细胞样本，30个WES样本），且为回顾性分析，需要进一步的功能实验和更大规模的前瞻性队列验证 | 阐明膀胱癌上皮细胞的异质性及其功能状态，以改善未来的诊断和治疗策略 | 膀胱癌（BLCA）患者样本中的细胞，特别是癌症相关上皮细胞 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA-seq，全外显子组测序（WES），空间转录组学，qPCR，Western blot | 随机生存森林（RSF），CellChat，CytoTRACE，Monocle2，spacexr，PROGENy | 单细胞转录组数据，批量转录组数据，外显子组测序数据，空间转录组数据 | 13个单细胞RNA-seq样本，514个批量转录组样本，30个全外显子组测序样本，共77,263个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学，全外显子组测序 | NA | NA |
| 10 | 2026-02-09 |
CRISPR-based genetic screens in human pluripotent stem cells derived neurons and brain organoids
2025-Jan, Cell and tissue research
IF:3.2Q3
DOI:10.1007/s00441-024-03934-2
PMID:39585363
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综述 | 本文综述了基于CRISPR的功能基因组学筛选方法在人类多能干细胞衍生的神经元和脑类器官中的应用，以研究神经发育障碍的发病机制 | 结合CRISPR基因筛选与单细胞RNA测序技术，揭示人类神经细胞中遗传变异的下游基因和细胞通路，为神经发育障碍提供新见解 | 存在当前挑战，如技术应用的限制和未来方向需进一步探索 | 利用CRISPR技术研究神经发育障碍的遗传机制和潜在治疗策略 | 人类多能干细胞衍生的神经元和脑类器官 | 自然语言处理 | 神经发育障碍 | CRISPR基因编辑，单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11 | 2026-02-09 |
A monocyte-derived blood transcriptomic signature reveals systemic immunosuppression in HCC and partial reversal following curative therapy
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1717978
PMID:41646974
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了早期肝细胞癌（HCC）诱导的系统性免疫抑制转录组特征，并发现治愈性治疗可部分逆转该特征，同时开发了一个源自单核细胞的23基因血液标志物，具有诊断和预后潜力 | 首次在早期HCC患者中通过纵向单细胞RNA测序（治疗前后）结合健康对照，系统描绘了肿瘤负荷及其切除对系统性免疫转录组的重塑，并鉴定出一个与肿瘤组织免疫抑制特征一致的CD14+单核细胞亚群及其23基因标志物 | 样本量较小（仅6名患者），治疗后随访时间较短（1-3个月），且未完全恢复至健康水平 | 阐明肿瘤负荷及其切除如何重塑系统性免疫转录组，并提取具有诊断和预后潜力的血液标志物 | 早期肝细胞癌（HCC）患者、健康对照者、外周血单个核细胞（PBMCs）、肿瘤及癌旁肝组织免疫细胞 | 单细胞组学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、bulk PBMC转录组分析 | NA | 单细胞转录组数据、bulk转录组数据 | 6名早期HCC患者（治疗前后配对样本）及6名年龄匹配的健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2026-02-09 |
Single-cell and machine learning integration reveals OS-driven CCND1 promotes an aggressive phenotype in papillary thyroid carcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1722524
PMID:41646983
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和机器学习方法，揭示了氧化应激驱动的CCND1在甲状腺乳头状癌中促进侵袭性表型的关键作用 | 首次在单细胞水平上系统评估了氧化应激与甲状腺乳头状癌的关系，并利用机器学习模型识别出CCND1、SOX4和TFF3作为关键生物标志物，同时通过体外实验验证了氧化应激直接驱动CCND1过表达的机制 | 研究主要基于生物信息学分析和体外细胞模型，缺乏体内实验验证和临床样本的深入功能验证 | 识别甲状腺乳头状癌中与氧化应激相关的生物标志物，为临床诊断和治疗提供潜在靶点 | 甲状腺乳头状癌组织、正常甲状腺组织以及TPC-1细胞系 | 数字病理学 | 甲状腺乳头状癌 | 单细胞RNA测序, 机器学习, 加权基因共表达网络分析, 伪时间分析, CellChat分析, 蛋白质印迹, 免疫印迹, ROS检测, 细胞活力测定 | 机器学习模型 | 单细胞RNA测序数据, 独立验证数据集, 体外实验数据 | 未明确指定样本数量，但使用了PTC和正常甲状腺组织的单细胞RNA测序数据以及TPC-1细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 13 | 2026-02-07 |
Exploring the Expanded Role of Astrocytes in Primate Brain Evolution via Changes in Gene Expression
2025, Brain, behavior and evolution
DOI:10.1159/000544004
PMID:39907990
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综述 | 本文探讨了灵长类大脑进化中星形胶质细胞基因表达和调控的变化，以解释其形态学表型差异 | 聚焦于灵长类进化中星形胶质细胞的基因表达和调控变化，结合诱导多能干细胞和单细胞RNA测序等新技术，动态解析其复杂性 | NA | 理解灵长类进化中星形胶质细胞的变化及其在神经系统疾病中的作用 | 灵长类大脑中的星形胶质细胞 | 自然语言处理 | 阿尔茨海默病, 帕金森病 | 诱导多能干细胞, 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 14 | 2026-02-07 |
Dissecting the immune evasion and therapeutic resistance mechanisms in EGFR/TP53 co-mutated non-small cell lung cancer: implications for targeted and immunotherapy strategies
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1652213
PMID:40948762
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了EGFR/TP53共突变非小细胞肺癌中促进免疫逃逸和治疗抵抗的协调转录网络 | 首次在单细胞水平上解析了EGFR/TP53共突变NSCLC的免疫微环境，并发现了由STAT1/ETS1转录程序调控的关键免疫抑制和耐药基因网络 | 样本量较小（仅4个样本用于单细胞分析），需要在更大的患者队列和功能研究中进一步验证 | 探究EGFR/TP53共突变非小细胞肺癌中导致侵袭性亚型和治疗抵抗的分子机制 | 非小细胞肺癌患者的肿瘤样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，靶向二代测序 | NA | RNA测序数据 | 40例NSCLC患者样本（其中4例用于单细胞分析） | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Genomics平台 | NA |
| 15 | 2026-02-07 |
Spatial regulation of ribosomal protein gene expression revealed by spatial transcriptomic analysis in the water fern Ceratopteris richardii
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1728120
PMID:41635689
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术分析水蕨Ceratopteris richardii的孢子体发育，揭示了核糖体蛋白基因在组织间的空间表达调控 | 首次在水蕨中应用空间转录组学技术，并发现核糖体相关功能在几乎所有组织域中普遍富集，且核糖体蛋白基因及其旁系同源物在不同组织间存在差异表达模式 | 研究仅针对水蕨一种植物，且未深入探讨核糖体蛋白基因差异表达的具体功能机制 | 阐明植物发育过程中基因表达的空间调控机制 | 水蕨Ceratopteris richardii的孢子体发育组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 16 | 2026-02-07 |
Comprehensive analysis of IGFL1 in colorectal cancer and its promotion of tumour progression via inhibition of lipophagy
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1719525
PMID:41635856
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证，揭示了IGFL1在结直肠癌中的表达上调及其通过抑制脂噬促进肿瘤进展的机制 | 首次全面阐明IGFL1在结直肠癌中的致癌作用，并发现其通过抑制脂噬这一新机制促进肿瘤进展 | 研究主要基于细胞系实验和公共数据库分析，缺乏体内动物模型验证和更大规模的临床队列验证 | 阐明IGFL1在结直肠癌中的功能作用及其分子机制 | 结直肠癌组织样本、TCGA和GEO数据库数据、结直肠癌细胞系SW620和HCT116 | 生物信息学 | 结直肠癌 | RNA测序、免疫组化、单细胞RNA测序、生物信息学分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据、单细胞测序数据 | TCGA和GEO数据库中的结直肠癌样本、临床组织样本、SW620和HCT116细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 17 | 2026-02-06 |
A multi-omics approach combining causal inference and in vivo validation identifies key protein drivers of alcohol-associated liver disease
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1714502
PMID:41497980
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研究论文 | 本研究通过整合人类遗传学与多组学数据，结合因果推断和体内验证，识别并验证了酒精相关性肝病（ALD）的四个关键因果蛋白驱动因子 | 首次系统性地将孟德尔随机化（MR）因果推断框架与单细胞转录组学和体内小鼠模型验证相结合，以区分ALD的关联性生物标志物与因果驱动因子，并揭示了由促炎性髓系细胞与稳态肝细胞功能平衡调控的新型致病轴 | 研究主要基于欧洲血统人群的遗传和蛋白质组数据，其发现可能无法直接推广到其他人群；体内验证仅在小鼠模型中进行，需要在人类组织或临床试验中进一步确认 | 旨在揭示酒精相关性肝病（ALD）的分子致病机制，并识别潜在的治疗靶点 | 人类血浆蛋白质组数据、ALD全基因组关联研究（GWAS）数据、小鼠ALD模型的肝组织 | 生物信息学，多组学整合分析 | 酒精相关性肝病 | 孟德尔随机化（MR），单细胞RNA测序（scRNA-seq），功能富集分析，汇总数据孟德尔随机化（SMR） | 因果推断模型（两样本MR），小鼠慢性加暴饮乙醇喂养模型 | 蛋白质组数据，遗传关联数据，单细胞转录组数据 | 大规模血浆蛋白质组和ALD GWAS数据（具体样本数未在摘要中提供），以及小鼠模型数据 | NA | 血浆蛋白质组学，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 18 | 2026-02-06 |
A multi-omics features-based approach integrating immunogenicity and inflammation enhances immunotherapy benefit in clear cell renal cell carcinoma
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1596719
PMID:41640425
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研究论文 | 本研究开发了一种基于炎症和免疫特征的多组学机器学习模型，用于预测透明细胞肾细胞癌患者对免疫检查点阻断治疗的响应和生存 | 整合炎症和免疫特征的多组学机器学习模型，相比单一生物标志物（如PD-L1表达、TMB）展现出更优的预测能力，并能将患者分为具有不同治疗响应和预后的亚型 | NA | 预测透明细胞肾细胞癌患者对免疫检查点阻断治疗的响应和生存，以指导精准免疫治疗 | 透明细胞肾细胞癌患者 | 机器学习 | 肾细胞癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 机器学习模型 | 基因组和转录组数据 | 超过1900名自身免疫性肾病患者和超过1000名接受ICB治疗的ccRCC患者 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 19 | 2026-02-06 |
Mechanistic insights into Shenqi Dihuang decoction in the treatment of immunoglobulin a nephropathy
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1714263
PMID:41640677
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研究论文 | 本研究通过网络药理学、机器学习、单细胞RNA测序和体外实验，探讨了参芪地黄汤治疗IgA肾病的潜在分子机制 | 首次通过整合多组学数据和机器学习方法，系统性地揭示了参芪地黄汤治疗IgA肾病的关键靶点FOS、MCL1和CCND1，并构建了相关的分子调控网络 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验，缺乏动物模型或临床试验的验证 | 探索参芪地黄汤治疗IgA肾病的分子作用机制 | IgA肾病（免疫球蛋白A肾病）患者数据及体外细胞模型 | 生物信息学 | 肾病 | 单细胞RNA测序，分子对接，基因集富集分析，免疫细胞浸润分析 | 机器学习特征选择，列线图 | 基因表达数据，单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 20 | 2026-02-05 |
HPV integration in head and neck cancer: downstream splicing events and expression ratios linked with poor outcomes
2025-Jan-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.17.633627
PMID:39896613
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研究论文 | 本研究通过分析头颈鳞状细胞癌的RNA-seq数据，探讨HPV整合对临床预后的影响，并识别相关生物标志物 | 首次基于RNA特征（如HPV-人类融合转录本和HPV基因转录比例）对HPV整合阳性患者进行分类，并揭示其与较差临床结局的关联 | 研究主要依赖RNA数据，DNA整合事件仅来自部分队列，可能未全面覆盖所有整合模式 | 探究HPV整合在头颈癌中的致癌机制及其与临床预后的关系 | 头颈鳞状细胞癌患者样本 | 数字病理学 | 头颈癌 | RNA-seq | NA | RNA序列数据 | 261个HPV相关HNSCC样本（包括bulk和单细胞RNA-seq）及102名HPV阳性参与者的DNA整合事件 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |