单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 699 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2025-10-06 |
Generation of a fluorescent hESC reporter line (Kle033-A-1) for the isolation of distinct midbrain progenitor cell types
2024-12, Stem cell research
IF:0.8Q4
DOI:10.1016/j.scr.2024.103523
PMID:39383604
|
研究论文 | 本研究通过CRISPR/Cas9技术构建了荧光标记的人胚胎干细胞报告系，用于分离中脑多巴胺能前体细胞 | 首次利用CRISPR/Cas9技术构建特异性荧光报告细胞系，实现两种中脑多巴胺能前体细胞（Rgl1和ProgM）的分离 | NA | 开发帕金森病细胞替代疗法的精确策略 | 人胚胎干细胞、中脑多巴胺能前体细胞 | 干细胞研究 | 帕金森病 | CRISPR/Cas9基因编辑、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 162 | 2025-10-06 |
Single-Cell Analysis of Bone Marrow CD8+ T Cells in Myeloid Neoplasms Reveals Pathways Associated with Disease Progression and Response to Treatment with Azacitidine
2024-12-01, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-24-0310
PMID:39485042
|
研究论文 | 通过单细胞分析研究骨髓CD8+ T细胞在髓系肿瘤中的作用机制及其与阿扎胞苷治疗反应的关系 | 首次发现CD57+CXCR3+ CD8+ T细胞亚群与阿扎胞苷治疗反应及患者生存率的相关性，并揭示IFN和TGF-β信号通路在治疗反应中的关键作用 | 样本量相对有限（104例），且仅针对骨髓样本进行分析 | 探索髓系肿瘤中CD8+ T细胞的功能变化及其在疾病进展和治疗反应中的作用机制 | 骨髓CD8+ T细胞 | 单细胞分析 | 髓系肿瘤（包括骨髓增生异常综合征和急性髓系白血病） | 单细胞RNA测序，质谱流式细胞术，流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据，流式细胞数据 | 104例治疗前骨髓样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 163 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Identifies Senescent Osteocytes That Trigger Bone Destruction in Breast Cancer Metastasis
2024-12-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-0857
PMID:39312185
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析发现衰老骨细胞是乳腺癌骨转移中引发骨破坏的关键因素 | 首次揭示乳腺癌骨转移中骨细胞发生早衰并产生促破骨细胞生成的衰老相关分泌表型 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，人类样本验证相对有限 | 探究乳腺癌骨转移中骨微环境重编程的机制 | 乳腺癌骨转移小鼠模型和患者样本中的骨细胞 | 单细胞组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，多重原位杂交，人工智能辅助分析 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | 乳腺癌骨转移小鼠和患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 164 | 2025-10-06 |
Dynamic Evolution of Fibroblasts Revealed by Single-Cell RNA Sequencing of Human Pancreatic Cancer
2024-12-01, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-23-0489
PMID:39485038
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示人类胰腺癌中成纤维细胞的动态演化过程 | 结合单细胞RNA测序与空间转录组学分析，开发新方法注释癌细胞基因组改变，首次系统揭示成纤维细胞在胰腺癌中的时空分化轨迹和细胞间互作网络 | NA | 研究胰腺导管腺癌中肿瘤微环境的基质重塑机制 | 正常、炎症和恶性胰腺组织 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 165 | 2025-10-06 |
Precision targeting of β-catenin induces tumor reprogramming and immunity in hepatocellular cancers
2024-Dec-12, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5494074/v1
PMID:39711542
|
研究论文 | 本研究开发了一种靶向β-catenin的siRNA脂质纳米颗粒疗法，可重编程肿瘤微环境并增强免疫治疗在肝癌中的疗效 | 首次证明靶向β-catenin的LNP-CTNNB1可通过重编程肿瘤细胞信号和免疫微环境，克服Wnt活性肝癌对免疫检查点抑制剂的耐药性 | 研究主要基于临床前模型，需要在人类临床试验中进一步验证 | 开发针对β-catenin突变肝细胞癌的新型治疗策略，克服免疫治疗耐药性 | β-catenin突变的肝细胞癌模型和患者 | 数字病理 | 肝癌 | 单细胞转录组学, 空间转录组学, siRNA技术 | NA | 转录组数据, 空间转录组数据 | 多个免疫活性HCC模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 166 | 2025-10-06 |
Derivation of transplantable human thyroid follicular epithelial cells from induced pluripotent stem cells
2024-12-10, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2024.10.004
PMID:39515316
|
研究论文 | 本研究从人类诱导多能干细胞成功分化出可移植的甲状腺滤泡上皮细胞 | 开发了表达NKX2-1和PAX8位点荧光标记物的新型iPSC系，建立了无血清培养基逐步分化方案 | iPSC来源的甲状腺滤泡细胞在体内无法挽救甲状腺功能减退症 | 开发治疗术后和先天性甲状腺功能减退症的新型治疗方法 | 人类诱导多能干细胞分化的甲状腺滤泡细胞 | 干细胞与再生医学 | 甲状腺功能减退症 | 单细胞RNA测序，异种移植 | NA | 基因表达数据，蛋白质检测数据 | 多个iPSC细胞系，无甲状腺免疫缺陷小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 167 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics reveals molecular cues underlying the site specificity of the adult mouse oral mucosa and its stem cell niches
2024-12-10, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2024.10.007
PMID:39547226
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术揭示成年小鼠口腔黏膜及其干细胞微环境的分子特征 | 首次应用空间转录组学技术系统解析口腔黏膜不同部位的分子特征，并鉴定出成纤维细胞生长因子通路作为口腔上皮干细胞的潜在微环境因子 | 研究仅限于小鼠模型，人类口腔黏膜可能存在物种特异性差异 | 解析成年小鼠口腔黏膜部位特异性的分子机制及其干细胞微环境维持机制 | 成年小鼠的舌部、颊部和腭部口腔黏膜组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学(tomo-seq)，类器官形成效率检测 | NA | 空间转录组数据，类器官实验数据 | 成年小鼠的多个口腔部位组织样本 | NA | 空间转录组学 | tomo-seq | NA |
| 168 | 2025-10-06 |
Bone morphogenetic protein 4 induces hematopoietic stem cell development from murine hemogenic endothelial cells in culture
2024-12-10, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2024.10.005
PMID:39547225
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现BMP4信号在E9.5造血内皮细胞中激活，并证明BMP4可诱导早期造血内皮细胞分化为造血干细胞 | 首次发现BMP4是促进早期造血内皮细胞向造血干细胞分化的关键因子，为体外诱导造血干细胞提供了新方法 | 研究仅使用小鼠胚胎细胞，尚未在人类细胞中验证 | 阐明早期造血内皮细胞向造血干细胞分化的信号需求 | 小鼠胚胎E9.5和E10.5时期的造血内皮细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠胚胎E9.5和E10.5时期的造血内皮细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 169 | 2025-10-06 |
Binding profiles for 961 Drosophila and C. elegans transcription factors reveal tissue-specific regulatory relationships
2024-Dec-23, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.279037.124
PMID:39438113
|
研究论文 | 本研究通过系统分析果蝇和线虫的转录因子结合位点，揭示了组织特异性调控关系 | 首次在两个主要模式生物中系统性地构建了转录因子结合位点图谱，提出了'元峰'概念并建立了机器学习模型识别细胞类型特异性调控因子 | 研究主要基于模式生物，结果向其他物种的普适性需要进一步验证 | 构建转录因子结合位点图谱并解析调控网络 | 果蝇和线虫的转录因子 | 基因组学 | NA | ChIP-seq, 单细胞RNA-seq | 机器学习模型 | 基因组测序数据，转录组数据 | 961个转录因子（果蝇605个，线虫356个），识别460万个结合位点 | NA | 染色质免疫沉淀测序，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 170 | 2025-10-06 |
Reprogramming of epidermal keratinocytes by PITX1 transforms the cutaneous cellular landscape and promotes wound healing
2024-Dec-20, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.182844
PMID:39480496
|
研究论文 | 本研究通过在小鼠皮肤表皮中异位表达PITX1转录因子，揭示了其促进伤口愈合的机制 | 首次发现PITX1能将皮肤角质细胞重编程为类口腔角质细胞状态，并改变细胞间通讯模式 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类临床验证 | 探究PITX1在角质细胞身份确定、细胞间相互作用和伤口愈合能力中的作用 | 小鼠皮肤和口腔（颊）黏膜组织 | 单细胞生物学 | 伤口愈合障碍 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 基因表达数据，空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 171 | 2025-10-06 |
Flotillin-2 dampens T cell antigen sensitivity and functionality
2024-Dec-20, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.182328
PMID:39499901
|
研究论文 | 本研究揭示Flotillin-2蛋白通过调节T细胞受体纳米簇形成来抑制T细胞对抗原的敏感性和功能 | 首次发现Flotillin-2通过调控T细胞受体表面纳米簇形成来调节T细胞抗原敏感性阈值 | 机制研究尚未完全阐明Flotillin-2调节T细胞受体簇集的具体分子途径 | 探究Flotillin-2在T细胞抗原敏感性调节中的作用机制 | T细胞、Flotillin-2缺陷小鼠模型 | 免疫学 | 癌症、慢性感染 | 单细胞RNA测序、超分辨率显微镜 | NA | 基因表达数据、显微镜图像 | Flotillin-2缺陷小鼠T细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 172 | 2025-10-06 |
Estimating and correcting index hopping misassignments in single-cell RNA-seq data
2024-Dec-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.21.619353
PMID:39484535
|
研究论文 | 本研究开发了一种估计和校正单细胞RNA测序数据中索引跳跃错误分配的方法 | 通过差异表达分析识别特征基因来量化索引跳跃错误率，并提出了简单的计算校正方法 | 方法依赖于存在具有不同表达谱的细胞类型，且校正效果可能因数据集而异 | 估计和校正单细胞RNA测序中的索引跳跃错误分配问题 | 小鼠皮肤细胞的混合群体 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 1152个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 板式单细胞RNA测序 |
| 173 | 2025-10-06 |
scTrends: A living review of commercial single-cell and spatial 'omic technologies
2024-Dec-11, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2024.100723
PMID:39667347
|
综述 | 本文提供了关于商业单细胞和空间组学技术的动态综述，涵盖关键技术方法和行业趋势 | 采用动态综述形式持续跟踪快速发展的技术领域，系统梳理从成熟到新兴的商业平台 | NA | 为生物医学研究和药物开发领域提供单细胞与空间组学技术的商业化与应用导航 | 商业单细胞和空间组学技术平台 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序、空间转录组学 | NA | 组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 微流控, 板式方法, 组合索引, 下一代测序, 成像技术 | NA | NA |
| 174 | 2025-10-06 |
Synovial tissue myeloid dendritic cell subsets exhibit distinct tissue-niche localization and function in health and rheumatoid arthritis
2024-12-10, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.11.004
PMID:39609125
|
研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学分析滑膜组织树突状细胞亚群在健康和类风湿关节炎中的组织定位和功能差异 | 首次在人类滑膜组织中鉴定出具有不同功能和定位的树突状细胞亚群，揭示了它们在类风湿关节炎发病机制中的特异性作用 | 研究主要基于组织活检样本，样本量相对有限，且未能完全阐明树突状细胞功能调控的分子机制 | 探索滑膜组织树突状细胞亚群在类风湿关节炎免疫耐受失衡中的作用机制 | 人类滑膜组织活检样本中的树突状细胞亚群 | 单细胞生物学 | 类风湿关节炎 | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 共培养系统 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 滑膜组织活检样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 175 | 2025-10-06 |
Tissue-resident natural killer cells support survival in pancreatic cancer through promotion of cDC1-CD8 T activity
2024-Dec-10, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.92672
PMID:39656086
|
研究论文 | 本研究揭示了组织驻留自然杀伤细胞通过促进cDC1-CD8 T细胞活性在胰腺癌中支持生存的作用机制 | 首次证明电离辐射联合CCR5抑制剂和PD1阻断疗法能通过招募组织驻留NK细胞增强CD8 T细胞活性，提出新型治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据来自单细胞测序队列，需要进一步临床验证 | 探索胰腺癌免疫抑制微环境中增强抗肿瘤免疫应答的新机制 | 胰腺导管腺癌(PDAC)小鼠模型和人类PDAC单细胞测序队列 | 免疫肿瘤学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 小鼠原位PDAC肿瘤模型和人类PDAC单细胞测序队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 176 | 2025-10-06 |
Left atrial single-cell transcriptomics reveals amphiregulin as a surrogate marker for atrial fibrillation
2024-Dec-02, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-07308-w
PMID:39622943
|
研究论文 | 通过左心房单细胞转录组学揭示双调蛋白作为心房颤动的替代标志物 | 首次在单细胞水平揭示左心房中单核-巨噬细胞的异质性及其通过EGF信号与成纤维细胞的相互作用，并发现AREG在房颤患者中特异性上调 | 样本来源有限，需要更大规模研究验证AREG作为生物标志物的临床价值 | 识别心房颤动患者的单核-巨噬细胞异质性、细胞间相互作用及功能性生物标志物 | 左心房组织样本及患者血清样本 | 单细胞转录组学 | 心房颤动 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | Cell-Chat分析 | 单细胞转录组数据, 血清生物标志物数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq | NA | NA |
| 177 | 2025-10-06 |
Mechanism of multifunctional adaptor protein SHARPIN regulating myocardial fibrosis and how SNP mutation affect the prognosis of myocardial infarction
2024-12, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2024.167467
PMID:39159699
|
研究论文 | 本研究揭示了SHARPIN蛋白在心肌纤维化中的分子机制及其SNP突变对心肌梗死预后的影响 | 首次阐明SHARPIN在心肌纤维化中的具体作用机制，并发现rs117299156 SNP突变与心肌梗死患者卒中风险的关联 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 探究SHARPIN蛋白调控心肌纤维化的分子机制及其SNP突变对心肌梗死预后的影响 | 小鼠心脏成纤维细胞、人类心脏组织、心肌梗死患者 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞测序、转录组分析、腺病毒shRNA感染 | NA | 基因表达数据、临床数据 | SHARPIN+/-和野生型小鼠模型、人类心脏组织样本、心肌梗死患者队列 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 178 | 2025-10-06 |
UBAP2 contributes to radioresistance by enhancing homologous recombination through SLC27A5 ubiquitination in hepatocellular carcinoma
2024-12, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2024.167481
PMID:39186963
|
研究论文 | 本研究揭示了UBAP2通过泛素-蛋白酶体途径降解SLC27A5增强同源重组，从而导致肝细胞癌放射抵抗的机制 | 首次发现UBAP2通过调控SLC27A5稳定性影响同源重组过程，提出UBAP2/SLC27A5轴作为肝细胞癌放射增敏新靶点 | 研究主要基于体外和动物实验，需要进一步临床验证 | 探索肝细胞癌放射抵抗的分子机制 | 肝细胞癌 | 单细胞测序 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，转录组分析 | tSNE评分模型 | 单细胞RNA测序数据，转录组数据 | 人类HCC样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 179 | 2025-10-06 |
CD36-mediated accumulation of MDSCs exerts abscopal immunosuppressive responses in hepatocellular carcinoma after insufficient microwave ablation
2024-12, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2024.167493
PMID:39233261
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示肝癌微波消融后远端未消融肿瘤中CD8+T细胞减少和MDSCs积累的免疫抑制机制 | 首次发现CD36介导的MDSCs积累在微波消融后发挥远端免疫抑制作用，并证实CD36抑制剂可逆转此免疫抑制 | 仅纳入2例初治患者样本，样本量较小；动物模型仍需进一步验证 | 阐明肝癌不完全微波消融后远端未消融肿瘤的免疫微环境变化 | 肝癌患者肿瘤组织样本和双侧肝癌小鼠模型 | 数字病理 | 肝癌 | 单细胞RNA测序，RNA测序，流式细胞术，多色免疫荧光 | NA | 单细胞RNA测序数据，RNA测序数据，流式细胞数据，免疫荧光图像 | 2例初治肝癌患者（各含2个病灶），双侧肝癌小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq，RNA-seq | NA | NA |
| 180 | 2025-10-06 |
Machine learning based analysis of single-cell data reveals evidence of subject-specific single-cell gene expression profiles in acute myeloid leukaemia patients and healthy controls
2024-12, Biochimica et biophysica acta. Gene regulatory mechanisms
DOI:10.1016/j.bbagrm.2024.195062
PMID:39366464
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序数据和机器学习分析急性髓系白血病患者与健康对照的个体特异性基因表达谱 | 发现祖细胞可用于高精度(>70%)个体水平分类，揭示患者异质性的分子决定因素 | 使用公开可用数据，样本来源和数量可能有限 | 通过单细胞数据分析探索AML患者与健康对照的基因表达差异 | 急性髓系白血病患者和健康对照的单核细胞、树突细胞和祖细胞群体 | 机器学习 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |