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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2026-03-05 |
Sirtuin1 Suppresses Calcium Oxalate Nephropathy via Inhibition of Renal Proximal Tubular Cell Ferroptosis Through PGC-1α-mediated Transcriptional Coactivation
2024-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202408945
PMID:39498889
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了Sirtuin1通过PGC-1α介导的转录共激活抑制肾近端小管细胞铁死亡,从而减轻草酸钙晶体诱导的肾损伤的机制 | 首次在草酸钙肾病模型中应用单细胞转录组测序技术,并揭示了Sirt1/PGC-1α/NRF2/GPX4信号轴在调控肾小管细胞铁死亡中的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体样本或临床试验中得到验证 | 探究草酸钙晶体诱导肾损伤的分子机制,并寻找潜在的治疗靶点 | 草酸钙肾病小鼠模型的肾脏样本 | 数字病理学 | 肾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 草酸钙肾病小鼠的肾脏样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 142 | 2026-03-05 |
Single-Cell RNA Sequencing Uncovers Pathological Processes and Crucial Targets for Vascular Endothelial Injury in Diabetic Hearts
2024-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202405543
PMID:39475009
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了糖尿病心脏中血管内皮损伤的病理过程和关键调控靶点 | 首次在糖尿病小鼠心脏组织中构建单细胞转录图谱,识别了内皮细胞异质性并发现关键转录因子Ets1的保护作用 | 研究仅基于小鼠模型,未在人类样本中验证,且病理阶段覆盖可能有限 | 探究糖尿病心脏血管内皮损伤的机制和细胞异质性 | 瘦素受体敲除(db/db)糖尿病小鼠的心脏组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个病理阶段的db/db糖尿病小鼠心脏组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 143 | 2026-03-05 |
AIP1 Regulates Ocular Angiogenesis Via NLRP12-ASC-Caspase-8 Inflammasome-Mediated Endothelial Pyroptosis
2024-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202405834
PMID:39527457
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序,在氧诱导视网膜病变模型中,鉴定出血管内皮细胞特异性抗血管生成因子AIP1,并揭示其通过抑制NLRP12-ASC-caspase-8炎症小体介导的内皮细胞焦亡来调控病理性眼内血管生成 | 首次鉴定出AIP1作为血管内皮细胞特异性抗血管生成因子,并揭示了一个新的非经典炎症小体NLRP12-ASC-caspase-8在介导内皮细胞焦亡和促进视网膜新生血管形成中的作用机制 | NA | 探究炎症调控病理性眼内血管生成的分子机制 | 血管内皮细胞、氧诱导视网膜病变模型 | NA | 视网膜病变 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 144 | 2026-03-05 |
Spatiotemporal Molecular Architecture of Lineage Allocation and Cellular Organization in Tooth Morphogenesis
2024-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202403627
PMID:39535354
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研究论文 | 本研究通过整合空间转录组和单细胞RNA测序,描述了牙齿形态发生中谱系分配和细胞组织的高分辨率全基因组分子模式 | 发现牙齿形态发生中88%的谱系物种在初始牙蕾中已出现,而非传统认为的顺序出现;揭示了牙乳头的一种先前未被识别的萌芽样模式,以及釉质结在时空中的连续分化层次;建立了指导牙齿形态发生的调控网络,涉及机械转导信号 | NA | 研究牙齿形态发生中的时空分子架构,包括谱系分配和细胞组织 | 牙齿形态发生过程中的细胞和组织 | 数字病理学 | 牙齿发育异常 | 空间转录组测序, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 145 | 2026-03-02 |
Protocol for Xenium spatial transcriptomics studies using fixed frozen mouse brain sections
2024-12-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103420
PMID:39535916
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研究论文 | 本文介绍了一种使用固定冷冻小鼠脑切片进行Xenium空间转录组学研究的实验方案 | 证明了除10× Genomics验证的FFPE和新鲜冷冻切片外,固定冷冻薄脑切片也兼容Xenium平台,并提供优异的成像和定量结果 | NA | 开发适用于Xenium空间转录组学平台的固定冷冻小鼠脑切片实验流程 | 固定冷冻的小鼠脑切片 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium | Xenium分析仪 |
| 146 | 2026-03-02 |
Fibroblast growth factor 2 enhances BMSC stemness through ITGA2-dependent PI3K/AKT pathway activation
2024-12, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.31423
PMID:39188080
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研究论文 | 本研究揭示了成纤维细胞生长因子2通过上调整合素α2表达并激活PI3K/AKT通路来增强骨髓间充质干细胞干性的分子机制 | 首次结合转录组学和单细胞测序技术,系统性地鉴定并验证了FGF2和ITGA2在调控BMSC干性中的关键作用,并阐明了其通过PI3K/AKT通路发挥功能的分子机制 | 研究主要在体外细胞模型中进行,缺乏体内动物实验验证;未深入探讨其他可能参与的信号通路 | 探索增强骨髓间充质干细胞干性维持的策略以提高其治疗潜力 | 骨髓间充质干细胞 | 干细胞生物学 | NA | 转录组学分析,单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 147 | 2026-03-01 |
Elevated Shear Stress Modulates Heterogenous Cellular Subpopulations to Induce Vascular Remodeling
2024-12, Tissue engineering. Part A
DOI:10.1089/ten.TEA.2023.0362
PMID:38753711
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研究论文 | 本研究通过动物模型、单细胞RNA测序和组织病理学方法,探究了高剪切应力如何通过调控异质性细胞亚群诱导血管重塑 | 首次在单细胞分辨率下全面研究了高剪切应力诱导血管重塑的分子机制,并精确操控血流以表征所有重要的细胞亚群 | 研究基于大鼠动物模型,结果向人类临床转化的有效性有待进一步验证 | 探究高剪切应力诱导血管重塑的分子机制,以寻找预防动静脉瘘失败的新疗法 | 大鼠隐静脉中的细胞亚群,特别是内皮细胞和巨噬细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,组织病理学 | NA | 单细胞转录组数据,组织病理学图像 | 大鼠隐静脉样本(高剪切应力组与无高剪切应力对照组) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 148 | 2026-02-28 |
Single-cell profiling of the amphioxus digestive tract reveals conservation of endocrine cells in chordates
2024-12-20, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adq0702
PMID:39705360
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了文昌鱼消化道的细胞特征,包括其分段结构和细胞簇多样性,并强调了内分泌样细胞的保守性 | 首次在文昌鱼消化道中发现并描述了三种分泌胰岛素样、胰高血糖素样和生长抑素样肽的内分泌样细胞,揭示了脊椎动物消化系统进化的关键线索 | 研究基于模型生物文昌鱼,可能不完全代表所有脊椎动物的进化过程,且功能验证仅限于特定基因敲除线 | 探索脊椎动物消化系统的进化起源,通过分析原始脊索动物文昌鱼的消化道细胞特征 | 文昌鱼(amphioxus)的消化道组织 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序,批量组织测序,基因敲除 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 149 | 2026-02-27 |
Single cell and TCR analysis of immune cells from AAV gene therapy-dosed Duchenne muscular dystrophy patients
2024-Dec-12, Molecular therapy. Methods & clinical development
DOI:10.1016/j.omtm.2024.101349
PMID:39524974
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和T细胞受体测序,分析了接受AAV基因治疗的杜氏肌营养不良症患者治疗前后的外周血单个核细胞,以探究免疫反应机制 | 首次在AAV基因治疗临床试验中结合单细胞转录组和TCR测序,揭示了治疗后T细胞干扰素反应基因的诱导以及特定TCR克隆的扩增,并发现部分扩增克隆与既往疱疹病毒感染相关 | 样本量较小(仅5名参与者),且仅有一例发生血栓性微血管病,限制了统计效力与普遍性结论的得出 | 探究高剂量AAV基因治疗在杜氏肌营养不良症患者中引发的免疫反应机制,特别是血栓性微血管病发生的潜在原因 | 接受AAV基因治疗的杜氏肌营养不良症患者的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 杜氏肌营养不良症 | 单细胞RNA测序,T细胞受体测序 | NA | 单细胞转录组数据,TCR序列数据 | 5名患者治疗前后的外周血单个核细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 150 | 2026-02-25 |
A novel biomarker of COVID-19: MMP8 emerged by integrated bulk RNAseq and single-cell sequencing
2024-12-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-82227-8
PMID:39730651
|
研究论文 | 本研究通过整合bulk RNA-seq和单细胞测序数据,发现MMP8是COVID-19的一个新型生物标志物和潜在治疗靶点 | 首次通过整合bulk RNA-seq、单细胞测序和药理学数据库,鉴定出MMP8作为COVID-19的关键生物标志物,并揭示其在髓系细胞中的异质性表达及细胞间相互作用机制 | 研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证;样本量未明确说明;未涉及机制的功能性验证 | 阐明COVID-19的病理进展和分子改变,寻找诊断和治疗靶点 | 健康供体、非重症和重症COVID-19患者 | 生物信息学 | COVID-19 | bulk RNA-seq, 单细胞测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 151 | 2026-02-25 |
A Single-Cell RNA Sequencing Guided Multienzymatic Hydrogel Design for Self-Regenerative Repair in Diabetic Mandibular Defects
2024-12, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202410962
PMID:39436107
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术指导设计了一种多酶水凝胶支架,用于促进糖尿病下颌骨缺损的自再生修复 | 首次结合单细胞RNA测序分析揭示糖尿病环境下NO和ROS阻碍巨噬细胞重极化的关键机制,并据此设计具有双功能(NO清除和ROS清除)的多酶水凝胶支架 | 研究主要针对糖尿病下颌骨缺损模型,尚未验证在其他骨缺损类型或更广泛糖尿病并发症中的适用性 | 开发能够恢复糖尿病环境下生理性骨重塑功能的骨组织工程材料 | 糖尿病下颌骨缺损模型中的巨噬细胞、骨髓间充质干细胞和内皮细胞 | 组织工程与再生医学 | 糖尿病骨缺损 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 152 | 2026-02-25 |
Nanomaterial-Mediated Reprogramming of Macrophages to Inhibit Refractory Muscle Fibrosis
2024-12, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202410368
PMID:39548911
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研究论文 | 本研究开发了一种功能化纳米材料,通过调控巨噬细胞极化来抑制难治性肌肉纤维化 | 利用聚乙烯亚胺功能化的纳米材料捕获细胞游离核酸,通过TLR7/9-NF-κB信号通路调控巨噬细胞表型,从而改变纤维-脂肪祖细胞亚群平衡 | 研究主要针对口面部肌肉纤维化,在其他类型肌肉或组织中的适用性需进一步验证 | 开发治疗难治性肌肉纤维化的新策略 | 巨噬细胞和纤维-脂肪祖细胞 | 生物医学工程 | 肌肉纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 153 | 2026-02-20 |
A novel multi-omics approach for identifying key genes in intervertebral disc degeneration
2024-12, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.slast.2024.100223
PMID:39528158
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研究论文 | 本研究采用多组学方法结合单细胞RNA测序、差异基因表达分析和孟德尔随机化,揭示了椎间盘退变的关键基因和遗传结构 | 首次整合单细胞RNA测序与孟德尔随机化分析,识别出与椎间盘退变相关的关键调控基因SLC40A1、PTGS2和GABARAPL1,并揭示了软骨细胞的动态基因表达模式 | 研究依赖于公开可用的单细胞数据集,样本来源和数量可能有限,且未进行实验验证 | 阐明椎间盘退变的遗传结构和关键基因,为治疗提供潜在靶点 | 椎间盘退变相关的细胞类型和基因 | 生物信息学 | 椎间盘退变 | 单细胞RNA测序, 差异基因表达分析, 孟德尔随机化 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 154 | 2026-02-15 |
Single-cell gene regulatory network analysis for mixed cell populations
2024-Dec, Quantitative biology (Beijing, China)
DOI:10.1002/qub2.64
PMID:41674874
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研究论文 | 本文提出了一种名为VMPLN的算法,用于从混合细胞群体的单细胞RNA测序数据中联合推断不同细胞类型的基因调控网络 | 开发了VMPLN算法,通过变分推理方法联合估计混合细胞群体中不同细胞类型的基因调控网络,避免了传统两步法(先聚类再推断)中聚类不确定性导致的网络估计不准确问题 | 未明确说明算法在计算效率或大规模数据集上的可扩展性限制 | 从单细胞RNA测序数据中准确推断混合细胞群体的基因调控网络 | 单细胞RNA测序数据中的混合细胞群体 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 混合泊松对数正态模型(MPLN),变分推理 | 单细胞RNA测序计数数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 155 | 2026-02-15 |
Novel insights into immunopathogenesis and crucial biomarkers between primary open-angle glaucoma and systemic lupus erythematosus
2024-Dec, iMetaOmics
DOI:10.1002/imo2.27
PMID:41676113
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研究论文 | 本研究通过整合分析基因表达数据,揭示了系统性红斑狼疮与原发性开角型青光眼之间的免疫病理机制关联,并识别了关键生物标志物和潜在治疗药物 | 首次通过多组学方法(包括差异表达分析、加权基因共表达网络分析、机器学习、免疫浸润分析和单细胞转录组分析)系统性探索SLE与POAG的共同生物标志物和免疫病理机制,并利用分子对接预测潜在治疗药物 | 研究主要基于公共数据库的基因表达数据,实验验证仅在人小梁网干细胞中进行RT-qPCR,缺乏临床样本或动物模型的进一步验证 | 识别系统性红斑狼疮和原发性开角型青光眼的共同生物标志物及潜在治疗药物,阐明两者关联的免疫病理机制 | 基因表达数据(来自GEO数据库的GSE27276、GSE50772和GSE148371数据集)和人小梁网干细胞 | 生物信息学 | 系统性红斑狼疮和原发性开角型青光眼 | 差异表达分析、加权基因共表达网络分析、基因富集分析、机器学习、miRNA和转录因子分析、免疫浸润分析、单细胞转录组分析、分子对接、RT-qPCR | 机器学习(具体模型未指定) | 基因表达数据 | 基于三个GEO数据集(GSE27276、GSE50772、GSE148371),具体样本数量未明确 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | NA |
| 156 | 2026-02-14 |
Identifying cell-type-specific spatially variable genes with ctSVG
2024-Dec-19, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5655066/v1
PMID:39764138
|
研究论文 | 本文提出了一种名为ctSVG的计算方法,专门用于在单细胞分辨率下识别细胞类型特异性空间可变基因 | 开发了ctSVG方法,能够准确分配Visium方块至细胞,并识别出与样本范围SVGs或细胞类型标记基因不重叠的新基因,从而更充分利用空间位置信息 | NA | 旨在解决先前方法在识别空间可变基因时未能充分利用空间位置信息的问题 | Visium HD空间转录组学数据 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium HD | Visium HD空间转录组学平台 |
| 157 | 2026-02-13 |
Transcriptomic Analysis of Air-Liquid Interface Culture in Human Lung Organoids Reveals Regulators of Epithelial Differentiation
2024-12-02, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13231991
PMID:39682739
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序全面分析了气液界面培养对人类肺类器官上皮细胞分化的影响 | 利用单细胞RNA测序技术首次系统揭示了气液界面培养如何通过调控特定信号通路促进纤毛细胞分化 | 研究仅基于体外类器官模型,未在体内验证;样本量相对有限 | 识别影响上皮细胞分化的关键因素,以开发体外呼吸模型 | 人类肺类器官中的上皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确指定样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 158 | 2026-02-13 |
Electroacupuncture Slows Experimental Myopia Progression by Improving Retinal Mitochondrial Function: A Study Based on Single-Cell RNA Sequencing
2024-12, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202400269
PMID:39404059
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,建立了透镜诱导型近视(LIM)及电针(EA)干预下豚鼠视网膜细胞的完整图谱,并揭示了EA通过改善视网膜线粒体功能来减缓实验性近视进展的潜在机制 | 首次在单细胞水平上建立了LIM和EA干预下豚鼠视网膜的综合图谱,并发现了EA通过上调视锥细胞和Müller胶质细胞中线粒体呼吸链相关基因(如COX3、ND4、ND2)的表达来改善视网膜线粒体功能,从而减缓近视进展 | 研究仅在豚鼠模型中进行,结果是否适用于人类近视尚需进一步验证;研究主要基于基因表达分析,功能验证实验相对有限 | 探索电针(EA)减缓实验性近视进展的潜在分子机制 | 透镜诱导型近视(LIM)的豚鼠模型 | 数字病理学 | 近视 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量,涉及LIM和EA处理的豚鼠视网膜组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 159 | 2026-02-13 |
Age-Related ECM Stiffness Mediates TRAIL Activation in Muscle Stem Cell Differentiation
2024-12, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202400334
PMID:39601528
|
研究论文 | 本研究探讨了年龄相关的细胞外基质硬化如何通过TRAIL通路影响肌肉干细胞分化,揭示了其在肌肉再生障碍中的作用机制 | 首次结合单细胞RNA测序和体外基质工程,系统解析了年龄和基质硬度对肌肉干细胞分化的协同影响,并发现TRAIL通路在年龄相关纤维化群体中的特异性激活 | 研究主要基于体外模型和动物实验,人类肌肉组织的直接证据尚不充分;BAPN治疗的长期效果和副作用未深入评估 | 阐明年龄相关ECM硬化导致肌肉干细胞功能障碍的分子机制 | 年轻和年老小鼠的肌肉干细胞 | 单细胞组学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 年轻和年老肌肉干细胞在软/硬基质上的四组对比实验 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 160 | 2026-02-09 |
Single-cell RNA sequencing of appendiceal adenocarcinoma reveals a low proportion of epithelial cells and a fibroblast enriched tumor microenvironment
2024-Dec, ESMO gastrointestinal oncology
DOI:10.1016/j.esmogo.2024.100094
PMID:41646948
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,首次对阑尾腺癌的肿瘤微环境进行了深入分析,揭示了其与结直肠癌的差异 | 首次将单细胞RNA测序技术应用于阑尾腺癌研究,揭示了其肿瘤微环境中成纤维细胞的富集特征和独特的细胞组成 | 样本量较小(仅3例阑尾腺癌和1例结直肠癌患者),可能限制结果的普遍性 | 探索阑尾腺癌的单细胞水平特征,以支持其作为独立疾病实体的分类 | 阑尾腺癌和结直肠癌患者的腹膜转移样本 | 数字病理学 | 阑尾腺癌 | 单细胞RNA测序 | k-means聚类分析 | 单细胞RNA测序数据 | 3例阑尾腺癌和1例结直肠癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 5' 单细胞RNA测序 |