单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 620 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2024-12-19 |
Single-cell transcriptomic analysis and luteolin treatment reveal three adipogenic genes, including Aspn, Htra1 and Efemp1
2024-Dec-09, Biochimica et biophysica acta. Molecular and cell biology of lipids
DOI:10.1016/j.bbalip.2024.159585
PMID:39662603
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析比较了高脂饮食和普通饮食喂养的小鼠皮下脂肪组织中的脂肪干细胞和前体细胞的转录组差异，并研究了膳食黄酮木犀草素对这些差异基因表达的影响 | 本文首次揭示了木犀草素通过上调Aspn、Htra1和Efemp1基因抑制3T3-L1细胞脂肪生成的作用 | 本文仅在细胞和小鼠模型中验证了结果，尚未在人体中进行验证 | 旨在通过单细胞转录组分析识别肥胖相关的新脂肪生成基因，并研究木犀草素对其表达的影响 | 脂肪干细胞和前体细胞、3T3-L1细胞 | 数字病理学 | 肥胖 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 三组独立的小鼠单细胞RNA测序数据，以及3T3-L1细胞实验 |
| 142 | 2024-12-19 |
Single-cell analysis reveals a unique microenvironment in peri-implantitis
2024-Dec, Journal of clinical periodontology
IF:5.8Q1
DOI:10.1111/jcpe.13982
PMID:38566468
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了种植体周围炎的独特微环境 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了种植体周围炎与健康个体和牙周炎患者在微环境上的差异，特别是发现了CXCL13+纤维母细胞亚群在种植体周围炎中的显著增加 | 研究样本量较小，且仅限于特定患者群体，可能影响结果的普适性 | 揭示种植体周围炎的独特微环境 | 种植体周围炎患者的组织样本 | NA | 牙周疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 种植体周围炎患者、健康个体和牙周炎患者的组织样本 |
| 143 | 2024-12-19 |
Association of circulating cytokine levels and tissue-infiltrating myeloid cells with achalasia: results from Mendelian randomization and validation through clinical characteristics and single-cell RNA sequencing
2024-12, Journal of gastroenterology
IF:6.9Q1
DOI:10.1007/s00535-024-02155-2
PMID:39377966
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研究论文 | 本文研究了食管失弛缓症与循环细胞因子水平及组织浸润髓系细胞之间的关系，通过孟德尔随机化分析和单细胞RNA测序验证了潜在机制 | 首次通过孟德尔随机化和单细胞RNA测序结合的方法，揭示了食管失弛缓症中特定细胞因子和髓系细胞的作用机制 | 研究样本量较小，且仅基于FinnGen数据库的数据，可能存在地域和人群的局限性 | 探讨食管失弛缓症的免疫失调机制，并寻找潜在的治疗靶点 | 循环细胞因子水平、组织浸润髓系细胞、食管失弛缓症患者 | NA | 食管失弛缓症 | 孟德尔随机化、单细胞RNA测序、酶联免疫吸附测定 | NA | 基因组数据、蛋白质数据、单细胞RNA测序数据 | 47种细胞因子的cis-eQTLs/pQTLs数据，以及来自FinnGen的食管失弛缓症GWAS数据 |
| 144 | 2024-12-19 |
Gastric Cancer Actively Remodels Mechanical Microenvironment to Promote Chemotherapy Resistance via MSCs-Mediated Mitochondrial Transfer
2024-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202404994
PMID:39392399
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研究论文 | 本文研究了胃癌通过间充质基质细胞介导的线粒体转移重塑机械微环境以促进化疗耐药的机制 | 首次揭示了胃癌细胞通过间充质基质细胞介导的线粒体转移，利用细胞外基质的机械信号促进化疗耐药的机制 | 研究仅限于体外实验和部分患者的样本分析，需要进一步的临床验证 | 探讨胃癌对奥沙利铂耐药的机制，并寻找可能的干预策略 | 胃癌患者的肿瘤组织和间充质基质细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞测序 | NA | 组织 | 部分奥沙利铂耐药的胃癌患者 |
| 145 | 2024-12-19 |
Statistical inference with a manifold-constrained RNA velocity model uncovers cell cycle speed modulations
2024-Dec, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02471-8
PMID:39482463
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研究论文 | 本文提出了一种结合速度场和流形估计的贝叶斯RNA速度模型，用于研究细胞周期中的基因调控动态 | 引入了一种新的贝叶斯模型，将速度场和流形估计结合在一个统一的框架中，提供了统计控制，并识别了显式动力系统的参数 | NA | 解决现有RNA速度算法缺乏统计控制和动态一致性的问题，并研究细胞周期中的基因调控动态 | 细胞周期中的基因表达动态 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA速度分析 | 贝叶斯模型 | 基因表达数据 | NA |
| 146 | 2024-12-19 |
Molecular Lineages and Spatial Distributions of Subplate Neurons in the Human Fetal Cerebral Cortex
2024-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202407137
PMID:39495628
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和单细胞RNA测序技术，揭示了人类胎儿大脑皮层中子板神经元（SPNs）的分子谱系和空间分布 | 首次通过空间转录组学和单细胞RNA测序技术，揭示了人类胎儿大脑皮层中子板神经元的分子起源和发育谱系 | 研究仅涵盖了妊娠10至25周的胎儿大脑皮层，未涉及更早或更晚的发育阶段 | 揭示人类胎儿大脑皮层中子板神经元的分子起源和发育谱系 | 人类胎儿大脑皮层中的子板神经元（SPNs） | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 妊娠10至25周的人类胎儿大脑皮层样本 |
| 147 | 2024-11-07 |
Mapping out multiple sclerosis with spatial transcriptomics
2024-Dec, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-024-01798-x
PMID:39501034
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 148 | 2024-12-19 |
IL1RAP Blockade With a Monoclonal Antibody Reduces Cardiac Inflammation and Preserves Heart Function in Viral and Autoimmune Myocarditis
2024-Dec, Circulation. Heart failure
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研究论文 | 本文研究了通过单克隆抗体阻断IL1RAP（IL-1受体辅助蛋白）在病毒性和自身免疫性心肌炎中的治疗效果 | 本文首次提出通过阻断IL1RAP来治疗心肌炎，相较于单独阻断IL-1，这种方法更为高效 | 本文的研究仅在BALB/c小鼠模型中进行，尚未在人类中验证其疗效 | 探索IL1RAP阻断在病毒性和自身免疫性心肌炎中的治疗潜力 | BALB/c小鼠模型中的病毒性和自身免疫性心肌炎 | NA | 心血管疾病 | 空间转录组学（Visium 10× Genomics） | NA | 基因表达数据 | 每组10-11只BALB/c小鼠 |
| 149 | 2024-12-19 |
Ionizing radiation inhibits zebrafish embryo hatching through induction of tissue inhibitors of metalloproteinases (TIMPs) expression
2024-Dec, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.17318
PMID:39547957
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研究论文 | 研究探讨了电离辐射对斑马鱼胚胎孵化过程中组织金属蛋白酶抑制剂（TIMPs）表达的影响 | 首次揭示了电离辐射通过诱导TIMPs表达抑制斑马鱼胚胎孵化的分子机制 | 研究仅在斑马鱼胚胎中进行了实验，未涉及其他物种 | 探究电离辐射对水生生物和人类发育的生物学影响 | 斑马鱼胚胎及其孵化过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 暴露于5 Gy电离辐射的斑马鱼胚胎 |
| 150 | 2024-12-19 |
Probe set selection for targeted spatial transcriptomics
2024-Dec, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02496-z
PMID:39558096
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Spapros的端到端探针集选择管道，用于优化基因集的特异性和细胞内表达变异，以解析空间上不同的细胞群体 | Spapros能够优化基因集的特异性和细胞内表达变异，从而在细胞类型识别和表达变异恢复方面优于其他选择方法 | NA | 开发一种新的方法来选择用于空间转录组学的最佳探针集，以捕捉组织中的空间信号 | 探针集选择方法及其在空间转录组学中的应用 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 成年肺组织样本 |
| 151 | 2024-12-19 |
Meta-analysis of single-cell RNA sequencing co-expression in human neural organoids reveals their high variability in recapitulating primary tissue
2024-Dec, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3002912
PMID:39621752
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meta-analysis | 本文通过单细胞RNA测序数据的meta分析，研究了人类神经类器官在重现胎儿/初级组织生物学方面的变异性和复现性 | 提出了一个保留共表达框架，为不同神经类器官提供细胞类型特异性的保真度测量，有助于揭示异质性神经类器官实验中的统一变异轴 | 未明确指出具体的局限性 | 研究人类神经类器官在重现胎儿/初级组织生物学方面的精确性 | 人类初级脑组织和神经类器官的单细胞RNA测序数据 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 初级脑组织包含295万细胞，51个数据集；神经类器官包含159万细胞，173个数据集 |
| 152 | 2024-12-11 |
Improved tool for scRNA-seq analysis
2024-Dec, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-02040-x
PMID:39653731
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 153 | 2024-12-19 |
Single-Cell RNA Sequencing Uncovers Pathological Processes and Crucial Targets for Vascular Endothelial Injury in Diabetic Hearts
2024-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202405543
PMID:39475009
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了糖尿病心脏中血管内皮损伤的病理过程和关键靶点 | 首次通过单细胞测序技术揭示了糖尿病心脏中血管内皮细胞损伤的异质性和关键转录因子Ets1的保护作用 | 研究仅在db/db糖尿病小鼠模型中进行，结果的普适性有待进一步验证 | 揭示糖尿病心脏中血管内皮损伤的机制及其异质性 | 糖尿病心脏中的血管内皮细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | db/db糖尿病小鼠心脏组织样本 |
| 154 | 2024-12-19 |
AIP1 Regulates Ocular Angiogenesis Via NLRP12-ASC-Caspase-8 Inflammasome-Mediated Endothelial Pyroptosis
2024-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202405834
PMID:39527457
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研究论文 | 本研究揭示了AIP1通过NLRP12-ASC-Caspase-8炎症小体介导的血管内皮细胞焦亡调控病理性眼血管生成的机制 | 首次发现AIP1通过抑制NLRP12-ASC-Caspase-8炎症小体介导的血管内皮细胞焦亡来抑制病理性眼血管生成 | 研究仅在氧诱导的视网膜病变模型中进行，需进一步验证在其他眼血管疾病中的适用性 | 探讨炎症在病理性眼血管生成中的调控机制 | 血管内皮细胞和病理性眼血管生成 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 155 | 2024-12-19 |
Spatiotemporal Molecular Architecture of Lineage Allocation and Cellular Organization in Tooth Morphogenesis
2024-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202403627
PMID:39535354
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研究论文 | 本文描述了牙齿形态发生中谱系分配和细胞组织的时空分子结构，通过整合空间转录组和单细胞RNA测序构建了高分辨率的基因组范围分子模式 | 发现了牙乳头类似发芽的图案模式，揭示了牙结节在时间和空间上的连续分化层次，建立了指导牙齿形态发生的调控网络，并成功追踪了导致牙齿发育不良的基因到特定的时间点和细胞类型 | NA | 研究牙齿形态发生中的时空组织 | 牙齿形态发生中的谱系分配和细胞组织 | NA | NA | 空间转录组和单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 156 | 2024-12-19 |
Cytokine expression and cytokine-mediated cell-cell communication during skeletal muscle regeneration revealed by integrative analysis of single-cell RNA sequencing data
2024-Dec, Journal of cell communication and signaling
IF:3.6Q3
DOI:10.1002/ccs3.12055
PMID:39691872
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研究论文 | 本文通过整合分析单细胞RNA测序数据，揭示了骨骼肌再生过程中细胞因子的表达及其介导的细胞间通讯 | 首次全面分析了骨骼肌再生过程中不同细胞类型对细胞因子的广泛和动态表达，并揭示了再生过程中双向的细胞间通讯 | 研究仅限于小鼠模型，且依赖于公开的单细胞RNA测序数据 | 揭示骨骼肌再生过程中细胞因子的表达及其在细胞间通讯中的作用 | 小鼠骨骼肌再生过程中的细胞因子表达和细胞间通讯 | NA | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA | 15个公开的单细胞RNA测序数据集，涵盖小鼠骨骼肌在再生早期的时间点（损伤后0、2、5和7天） |
| 157 | 2024-12-18 |
CFTR represses a PDX1 axis to govern pancreatic ductal cell fate
2024-Dec-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.111393
PMID:39687022
|
研究论文 | 本研究探讨了CFTR蛋白在胰腺导管细胞命运中的调控作用，揭示了CFTR通过抑制PDX1轴来影响胰腺重塑的机制 | 首次揭示了CFTR蛋白通过维持PTEN和GSK3β的激活来限制PDX1表达，从而调控胰腺导管细胞命运的细胞自主机制 | 研究仅基于CF小动物模型，结果的临床相关性需要进一步验证 | 探讨CFTR蛋白在胰腺导管细胞命运中的调控作用及其对胰腺重塑的影响 | CF小动物模型中的胰腺导管细胞和胰岛功能 | NA | 囊性纤维化 | RNA测序（RNA-seq），单细胞RNA测序（scRNA-seq），转座酶可及染色质测序（ATAC-seq） | NA | 基因表达数据，染色质可及性数据 | CF小动物模型 |
| 158 | 2024-12-18 |
Single-cell transcriptomic reveals the peritoneal microenvironmental change in long-term peritoneal dialysis patients with ultrafiltration failure
2024-Dec-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.111383
PMID:39687014
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研究论文 | 研究揭示了长期腹膜透析患者在超滤失败情况下腹膜微环境的变化 | 首次通过单细胞转录组测序揭示了长期腹膜透析患者在超滤失败情况下腹膜微环境中中性粒细胞和巨噬细胞亚群的变化 | 研究样本量较小，可能无法全面代表所有长期腹膜透析患者的微环境变化 | 探讨长期腹膜透析患者在超滤失败情况下腹膜微环境的变化及其机制 | 长期腹膜透析患者的腹膜微环境，包括中性粒细胞、巨噬细胞和间皮细胞 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本量未在摘要中提及 |
| 159 | 2024-12-18 |
Aberrant Chitinase 3-Like 1 Expression in Basal Cells Contributes to Systemic Sclerosis Fibrosis
2024-Dec-17, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202310169
PMID:39686726
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研究论文 | 本研究探讨了异常表达的壳多糖酶3样1（Chi3L1）在基底细胞中对系统性硬化症（SSc）纤维化的贡献 | 首次揭示了Chi3L1在SSc纤维化中的作用，并证明了Chi3L1通过与IL-17RA相互作用介导纤维化，为SSc的治疗提供了新的靶点 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，尚需进一步的临床验证 | 揭示系统性硬化症纤维化的机制，并寻找潜在的治疗靶点 | 系统性硬化症患者的皮肤细胞和纤维化过程 | NA | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 系统性硬化症患者和健康对照者的皮肤细胞，以及Chi3L1缺陷小鼠 |
| 160 | 2024-12-18 |
Olaparib and Radiotherapy Induce Type I Interferon- and CD8+ T Cell-Dependent Sensitization to Immunotherapy in Pancreatic Cancer
2024-Dec-17, Molecular cancer therapeutics
IF:5.3Q1
DOI:10.1158/1535-7163.MCT-24-0210
PMID:39688341
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研究论文 | 研究探讨了PARP抑制剂奥拉帕利与放疗联合使用在胰腺癌中诱导I型干扰素和CD8+ T细胞依赖的免疫治疗敏感性 | 首次证明奥拉帕利增强放疗诱导的I型干扰素介导的免疫信号，从而增强胰腺癌对αPD-L1免疫治疗的敏感性 | 研究主要基于小鼠模型，临床试验结果尚未完全验证 | 验证奥拉帕利与放疗联合使用在胰腺癌中诱导免疫治疗敏感性的机制 | 胰腺导管腺癌（PDAC） | NA | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |