单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 699 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2025-10-06 |
Detecting Rhythmic Gene Expression in Single-cell Transcriptomics
2024-12, Journal of biological rhythms
IF:2.9Q2
DOI:10.1177/07487304241273182
PMID:39377613
|
研究论文 | 评估常用节律检测方法在单细胞RNA测序数据中的可靠性，并提出适用于单细胞数据的昼夜节律基因检测策略 | 首次系统评估昼夜节律检测方法在单细胞转录组数据中的应用效果，并提出结合子采样和谐波回归的新策略 | 未明确说明使用的具体数据集规模和验证方法 | 开发适用于单细胞RNA测序数据的昼夜节律基因检测方法 | 单细胞转录组数据中的节律性基因表达 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 谐波回归 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 122 | 2025-10-06 |
A protocol for time-resolved transcriptomics through metabolic labeling and combinatorial indexing
2024-12-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103356
PMID:39356643
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研究论文 | 提出一种通过代谢标记和组合索引进行时间分辨转录组学分析的优化实验方案 | 开发了自动化友好的代谢标记与单细胞RNA测序组合索引协议，能够捕获基因表达的时间动态信息 | NA | 解决单细胞转录组学在时间动态研究中的局限性 | RNA代谢标记和单细胞转录组分析 | 单细胞转录组学 | NA | 4-硫尿苷(4sU)代谢标记，组合索引单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 123 | 2025-10-06 |
Protocol for mapping T cell activation using single-cell RNA-seq
2024-12-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103409
PMID:39427308
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研究论文 | 本文提供了一个基于抗CD3/CD28磁珠刺激和单细胞RNA测序的T细胞激活研究方案 | 开发了结合抗CD3/CD28磁珠刺激与单细胞RNA测序的标准化T细胞激活研究流程 | NA | 建立研究T细胞激活的标准化实验方案 | 人类外周血单个核细胞和CD4 T细胞 | 单细胞组学 | 免疫相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 124 | 2025-10-06 |
Protocol for isolating specific C. elegans neuron types for bulk and single-cell RNA sequencing
2024-12-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103439
PMID:39514392
|
研究论文 | 本文介绍了一种分离特定秀丽隐杆线虫神经元类型用于基因表达分析的实验方案 | 开发了针对秀丽隐杆线虫特定神经元类型的分离方案，适用于批量RNA测序和单细胞RNA测序 | NA | 建立神经元特异性分离和基因表达分析的技术方案 | 秀丽隐杆线虫的特定神经元类型 | 单细胞测序技术 | NA | RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 125 | 2025-10-06 |
A protocol for acquiring high-quality single-cell multi-omics data from human peripheral blood
2024-12-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103430
PMID:39488839
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研究论文 | 本文提出了一种从人外周血获取高质量单细胞多组学数据的实验方案 | 开发了改进的单细胞多组学样本处理方法，整合了单细胞测序、全基因组测序以及代谢组和蛋白质组分析 | NA | 建立获取高质量单细胞多组学数据的标准化实验流程 | 人外周血单个核细胞 | 单细胞多组学 | NA | 单细胞测序, 全基因组测序, 代谢组分析, 蛋白质组分析 | NA | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 126 | 2025-10-06 |
Protocol for Xenium spatial transcriptomics studies using fixed frozen mouse brain sections
2024-12-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103420
PMID:39535916
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研究论文 | 本文介绍了使用固定冷冻小鼠脑切片进行Xenium空间转录组学研究的实验方案 | 证明了除10x Genomics验证的FFPE和新鲜冷冻切片外，固定冷冻薄脑切片也与Xenium平台兼容，并提供优异的成像和定量结果 | NA | 开发适用于Xenium平台的空间转录组学实验方案 | 小鼠脑组织切片 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达空间数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium | Xenium分析仪 |
| 127 | 2025-10-06 |
Protocol for using scCURE to construct an immunotherapy outcome prediction model
2024-12-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103476
PMID:39661506
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研究论文 | 介绍使用scCURE构建免疫治疗结果预测模型的协议 | 开发了基于单细胞RNA测序的scCURE方法，通过识别免疫治疗期间变化和未变化的细胞来构建预测模型 | NA | 构建免疫治疗结果预测模型 | 癌症患者 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | scCURE | 单细胞RNA测序数据, 批量RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 128 | 2025-10-06 |
Profiling low-mRNA content cells in complex human tissues using BD Rhapsody single-cell analysis
2024-12-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103475
PMID:39661509
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研究论文 | 本文介绍了一种使用BD Rhapsody单细胞分析平台高效回收低mRNA含量免疫细胞的实验方案 | 开发了针对前列腺、肺和肝组织的优化组织解离方案，结合Sample Tag抗体标记技术，显著提高了低mRNA含量免疫细胞的回收效率 | 仅针对特定组织类型（前列腺、肺、肝）进行了验证，未涉及其他组织类型 | 解决单细胞RNA测序中低mRNA含量免疫细胞难以成功回收的技术难题 | 人类前列腺、肺和肝组织中的低mRNA含量免疫细胞 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | BD Biosciences | single-cell RNA-seq | BD Rhapsody | BD Rhapsody单细胞分析系统，采用微孔板单细胞捕获技术 |
| 129 | 2025-10-06 |
SRSF2 is essential for maintaining pancreatic beta-cell identity and regulating glucose homeostasis in mice
2024-12, Biochimica et biophysica acta. Molecular cell research
DOI:10.1016/j.bbamcr.2024.119845
PMID:39265887
|
研究论文 | 本研究揭示了剪接因子SRSF2在维持小鼠胰腺β细胞特性和调节葡萄糖稳态中的关键作用 | 首次发现SRSF2缺失会导致β细胞从适应性阶段向适应不良阶段转变，并丧失细胞特性 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探究SRSF2对胰腺β细胞存活和葡萄糖稳态的影响 | 小鼠胰腺β细胞和Min6细胞系 | 分子生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | 10月龄SRSF2敲除小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 130 | 2025-10-06 |
Generation of a fluorescent hESC reporter line (Kle033-A-1) for the isolation of distinct midbrain progenitor cell types
2024-12, Stem cell research
IF:0.8Q4
DOI:10.1016/j.scr.2024.103523
PMID:39383604
|
研究论文 | 本研究通过CRISPR/Cas9技术构建了荧光标记的人胚胎干细胞报告系，用于分离中脑多巴胺能前体细胞 | 首次利用CRISPR/Cas9技术构建特异性荧光报告细胞系，实现两种中脑多巴胺能前体细胞（Rgl1和ProgM）的分离 | NA | 开发帕金森病细胞替代疗法的精确策略 | 人胚胎干细胞、中脑多巴胺能前体细胞 | 干细胞研究 | 帕金森病 | CRISPR/Cas9基因编辑、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 131 | 2025-10-06 |
Single-Cell Analysis of Bone Marrow CD8+ T Cells in Myeloid Neoplasms Reveals Pathways Associated with Disease Progression and Response to Treatment with Azacitidine
2024-12-01, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-24-0310
PMID:39485042
|
研究论文 | 通过单细胞分析研究骨髓CD8+ T细胞在髓系肿瘤中的作用机制及其与阿扎胞苷治疗反应的关系 | 首次发现CD57+CXCR3+ CD8+ T细胞亚群与阿扎胞苷治疗反应及患者生存率的相关性，并揭示IFN和TGF-β信号通路在治疗反应中的关键作用 | 样本量相对有限（104例），且仅针对骨髓样本进行分析 | 探索髓系肿瘤中CD8+ T细胞的功能变化及其在疾病进展和治疗反应中的作用机制 | 骨髓CD8+ T细胞 | 单细胞分析 | 髓系肿瘤（包括骨髓增生异常综合征和急性髓系白血病） | 单细胞RNA测序，质谱流式细胞术，流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据，流式细胞数据 | 104例治疗前骨髓样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 132 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Identifies Senescent Osteocytes That Trigger Bone Destruction in Breast Cancer Metastasis
2024-12-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-0857
PMID:39312185
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析发现衰老骨细胞是乳腺癌骨转移中引发骨破坏的关键因素 | 首次揭示乳腺癌骨转移中骨细胞发生早衰并产生促破骨细胞生成的衰老相关分泌表型 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，人类样本验证相对有限 | 探究乳腺癌骨转移中骨微环境重编程的机制 | 乳腺癌骨转移小鼠模型和患者样本中的骨细胞 | 单细胞组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，多重原位杂交，人工智能辅助分析 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | 乳腺癌骨转移小鼠和患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 133 | 2025-10-06 |
Dynamic Evolution of Fibroblasts Revealed by Single-Cell RNA Sequencing of Human Pancreatic Cancer
2024-12-01, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-23-0489
PMID:39485038
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示人类胰腺癌中成纤维细胞的动态演化过程 | 结合单细胞RNA测序与空间转录组学分析，开发新方法注释癌细胞基因组改变，首次系统揭示成纤维细胞在胰腺癌中的时空分化轨迹和细胞间互作网络 | NA | 研究胰腺导管腺癌中肿瘤微环境的基质重塑机制 | 正常、炎症和恶性胰腺组织 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 134 | 2025-10-06 |
Precision targeting of β-catenin induces tumor reprogramming and immunity in hepatocellular cancers
2024-Dec-12, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5494074/v1
PMID:39711542
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研究论文 | 本研究开发了一种靶向β-catenin的siRNA脂质纳米颗粒疗法，可重编程肿瘤微环境并增强免疫治疗在肝癌中的疗效 | 首次证明靶向β-catenin的LNP-CTNNB1可通过重编程肿瘤细胞信号和免疫微环境，克服Wnt活性肝癌对免疫检查点抑制剂的耐药性 | 研究主要基于临床前模型，需要在人类临床试验中进一步验证 | 开发针对β-catenin突变肝细胞癌的新型治疗策略，克服免疫治疗耐药性 | β-catenin突变的肝细胞癌模型和患者 | 数字病理 | 肝癌 | 单细胞转录组学, 空间转录组学, siRNA技术 | NA | 转录组数据, 空间转录组数据 | 多个免疫活性HCC模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 135 | 2025-10-06 |
Derivation of transplantable human thyroid follicular epithelial cells from induced pluripotent stem cells
2024-12-10, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2024.10.004
PMID:39515316
|
研究论文 | 本研究从人类诱导多能干细胞成功分化出可移植的甲状腺滤泡上皮细胞 | 开发了表达NKX2-1和PAX8位点荧光标记物的新型iPSC系，建立了无血清培养基逐步分化方案 | iPSC来源的甲状腺滤泡细胞在体内无法挽救甲状腺功能减退症 | 开发治疗术后和先天性甲状腺功能减退症的新型治疗方法 | 人类诱导多能干细胞分化的甲状腺滤泡细胞 | 干细胞与再生医学 | 甲状腺功能减退症 | 单细胞RNA测序，异种移植 | NA | 基因表达数据，蛋白质检测数据 | 多个iPSC细胞系，无甲状腺免疫缺陷小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 136 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics reveals molecular cues underlying the site specificity of the adult mouse oral mucosa and its stem cell niches
2024-12-10, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2024.10.007
PMID:39547226
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术揭示成年小鼠口腔黏膜及其干细胞微环境的分子特征 | 首次应用空间转录组学技术系统解析口腔黏膜不同部位的分子特征，并鉴定出成纤维细胞生长因子通路作为口腔上皮干细胞的潜在微环境因子 | 研究仅限于小鼠模型，人类口腔黏膜可能存在物种特异性差异 | 解析成年小鼠口腔黏膜部位特异性的分子机制及其干细胞微环境维持机制 | 成年小鼠的舌部、颊部和腭部口腔黏膜组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学(tomo-seq)，类器官形成效率检测 | NA | 空间转录组数据，类器官实验数据 | 成年小鼠的多个口腔部位组织样本 | NA | 空间转录组学 | tomo-seq | NA |
| 137 | 2025-10-06 |
Bone morphogenetic protein 4 induces hematopoietic stem cell development from murine hemogenic endothelial cells in culture
2024-12-10, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2024.10.005
PMID:39547225
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现BMP4信号在E9.5造血内皮细胞中激活，并证明BMP4可诱导早期造血内皮细胞分化为造血干细胞 | 首次发现BMP4是促进早期造血内皮细胞向造血干细胞分化的关键因子，为体外诱导造血干细胞提供了新方法 | 研究仅使用小鼠胚胎细胞，尚未在人类细胞中验证 | 阐明早期造血内皮细胞向造血干细胞分化的信号需求 | 小鼠胚胎E9.5和E10.5时期的造血内皮细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠胚胎E9.5和E10.5时期的造血内皮细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 138 | 2025-10-06 |
Binding profiles for 961 Drosophila and C. elegans transcription factors reveal tissue-specific regulatory relationships
2024-Dec-23, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.279037.124
PMID:39438113
|
研究论文 | 本研究通过系统分析果蝇和线虫的转录因子结合位点，揭示了组织特异性调控关系 | 首次在两个主要模式生物中系统性地构建了转录因子结合位点图谱，提出了'元峰'概念并建立了机器学习模型识别细胞类型特异性调控因子 | 研究主要基于模式生物，结果向其他物种的普适性需要进一步验证 | 构建转录因子结合位点图谱并解析调控网络 | 果蝇和线虫的转录因子 | 基因组学 | NA | ChIP-seq, 单细胞RNA-seq | 机器学习模型 | 基因组测序数据，转录组数据 | 961个转录因子（果蝇605个，线虫356个），识别460万个结合位点 | NA | 染色质免疫沉淀测序，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 139 | 2025-10-06 |
Reprogramming of epidermal keratinocytes by PITX1 transforms the cutaneous cellular landscape and promotes wound healing
2024-Dec-20, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.182844
PMID:39480496
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研究论文 | 本研究通过在小鼠皮肤表皮中异位表达PITX1转录因子，揭示了其促进伤口愈合的机制 | 首次发现PITX1能将皮肤角质细胞重编程为类口腔角质细胞状态，并改变细胞间通讯模式 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类临床验证 | 探究PITX1在角质细胞身份确定、细胞间相互作用和伤口愈合能力中的作用 | 小鼠皮肤和口腔（颊）黏膜组织 | 单细胞生物学 | 伤口愈合障碍 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 基因表达数据，空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 140 | 2025-10-06 |
Flotillin-2 dampens T cell antigen sensitivity and functionality
2024-Dec-20, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.182328
PMID:39499901
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研究论文 | 本研究揭示Flotillin-2蛋白通过调节T细胞受体纳米簇形成来抑制T细胞对抗原的敏感性和功能 | 首次发现Flotillin-2通过调控T细胞受体表面纳米簇形成来调节T细胞抗原敏感性阈值 | 机制研究尚未完全阐明Flotillin-2调节T细胞受体簇集的具体分子途径 | 探究Flotillin-2在T细胞抗原敏感性调节中的作用机制 | T细胞、Flotillin-2缺陷小鼠模型 | 免疫学 | 癌症、慢性感染 | 单细胞RNA测序、超分辨率显微镜 | NA | 基因表达数据、显微镜图像 | Flotillin-2缺陷小鼠T细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |