本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2025-10-06 |
Chondroitin sulfate proteoglycan 4 increases invasion of recessive dystrophic epidermolysis bullosa-associated cutaneous squamous cell carcinoma by modifying transforming growth factor-β signalling
2024-Dec-23, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljae295
PMID:39018437
|
研究论文 | 本研究探讨硫酸软骨素蛋白聚糖4在隐性营养不良性大疱性表皮松解症相关皮肤鳞状细胞癌中通过调节TGF-β信号通路增强肿瘤侵袭性的机制 | 首次揭示CSPG4通过调节SMAD3磷酸化增强TGF-β信号通路,从而促进RDEB cSCC肿瘤侵袭的新机制 | 研究主要基于体外细胞系和肿瘤模型,缺乏体内动物实验验证 | 评估CSPG4在RDEB cSCC中的表达和功能作用 | RDEB cSCC细胞系、RDEB cSCC肿瘤组织、非RDEB cSCC肿瘤组织 | 癌症生物学 | 皮肤鳞状细胞癌 | 免疫组织化学、单细胞RNA测序 | 体外全层肿瘤模型 | 基因表达数据、组织病理学图像 | 多个RDEB cSCC细胞系、已发表的scRNA-Seq数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 102 | 2025-10-06 |
CFTR represses a PDX1 axis to govern pancreatic ductal cell fate
2024-Dec-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.111393
PMID:39687022
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了CFTR蛋白通过调控PDX1轴决定胰腺导管细胞命运的机制 | 发现CFTR蛋白水平(而非通道功能)通过维持PTEN和GSK3β活性来抑制PDX1表达,调控胰腺细胞命运 | 研究基于CF雪貂模型,在人类中的直接适用性需进一步验证 | 探究CFTR缺失导致胰腺重塑的分子机制 | 囊性纤维化雪貂模型的胰腺组织 | 分子生物学 | 囊性纤维化 | bulk RNA-seq, scRNA-seq, ATAC-seq | NA | 转录组数据,表观基因组数据 | CF雪貂模型 | NA | 单细胞RNA测序,转座酶可及染色质测序 | NA | NA |
| 103 | 2025-10-06 |
Cycling alpha cells in regenerative drug-treated human pancreatic islets may serve as key beta cell progenitors
2024-Dec-17, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101832
PMID:39626675
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序发现人类胰岛中循环α细胞可能是β细胞再生的关键前体细胞 | 首次揭示DYRK1A抑制剂通过靶向循环α细胞促进其转分化为β细胞的机制 | 作用机制尚未完全阐明,需要进一步验证 | 探索DYRK1A抑制剂促进β细胞再生的分子机制 | 人类胰岛细胞 | 单细胞组学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | 谱系轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 104 | 2025-10-06 |
Elucidating Sex-Specific Immune Profiles in a Breast Cancer Model
2024-Dec-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms252313113
PMID:39684829
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序等技术揭示乳腺癌模型中性别特异性免疫特征差异 | 首次在雌雄ER+乳腺癌转基因小鼠模型中系统比较性别相关的激素和免疫景观差异 | 研究基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 | 阐明乳腺癌中性别特异性免疫反应特征 | MMTV-PyMT转基因小鼠模型的雌雄ER+乳腺癌 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 全片免疫组织化学, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 图像数据, 细胞计数数据 | 转基因小鼠乳腺肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 105 | 2025-10-06 |
Sex-specific regulatory architecture of pancreatic islets from subjects with and without type 2 diabetes
2024-Dec, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-024-00313-z
PMID:39567827
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和单核ATAC测序技术,结合激素分泌和生物能量学分析,揭示了2型糖尿病患者胰岛细胞中性别特异性调控机制 | 首次在人类胰岛中系统揭示2型糖尿病性别差异的表观遗传调控机制,发现性别染色体和常染色体在疾病状态下的不同调控模式 | 样本量相对有限(52名供体),且为观察性研究,无法确定因果关系 | 探究2型糖尿病患者胰岛细胞中性别特异性调控机制及其与疾病发生的关系 | 人类胰腺胰岛细胞(来自52名2型糖尿病患者和非糖尿病供体) | 单细胞多组学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序, 单核ATAC测序, 激素分泌测定, 生物能量学分析, GWAS | NA | 单细胞转录组数据, 表观基因组数据, 生理功能数据 | 52名人类供体(包括2型糖尿病患者和非糖尿病对照) | NA | 单细胞RNA测序, 单核ATAC测序 | NA | NA |
| 106 | 2025-10-06 |
Resolving the design principles that control postnatal vascular growth and scaling
2024-Dec-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.10.627758
PMID:39713449
|
研究论文 | 本研究揭示了出生后主动脉生长的设计原则,发现其扩张与脊柱长度而非体重相关,并通过两波细胞增殖和内皮细胞挤出实现稳态生长 | 首次发现主动脉生长与脊柱长度直接相关,识别了两波具有独特细胞周期动力学的增殖波,并证明内皮细胞挤出对稳态生长至关重要 | 研究主要聚焦于主动脉,未涉及其他血管类型;遗传模型仅限于软骨发育不全 | 解析控制出生后血管生长和比例缩放的设计原则 | 小鼠主动脉和血管细胞 | 发育生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 数学建模, 多尺度计算方法 | 数学模型 | 基因表达数据, 细胞增殖数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 107 | 2025-10-06 |
MatriCom: a scRNA-Seq data mining tool to infer ECM-ECM and cell-ECM communication systems
2024-Dec-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.10.627834
PMID:39763937
|
研究论文 | 开发了一个名为MatriCom的scRNA-Seq数据挖掘工具,用于推断ECM-ECM和细胞-ECM通讯系统 | 基于独特的MatriComDB数据库(包含25,000多个经过整理的相互作用),专门针对基质组蛋白相互作用设计,能考虑ECM蛋白相互作用的特定规则 | NA | 开发工具以挖掘scRNA-Seq数据并推断ECM组分之间以及不同细胞群体与ECM之间的通讯 | 哺乳动物基质组基因(约1,000个基因中的80%)及其相互作用 | 生物信息学 | 癌症或纤维化疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 整合了46个scRNA-Seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 108 | 2025-10-06 |
Evaluating the role of IER3+ macrophages in the prognosis of liver fibrosis by bulk and single-cell transcriptional analyses
2024-Dec, ILIVER..
DOI:10.1016/j.iliver.2024.100132
PMID:40635861
|
研究论文 | 通过批量RNA测序和单细胞RNA测序分析,建立肝纤维化预后模型并研究IER3+巨噬细胞在肝纤维化中的作用 | 首次建立包含IER3、AKR1B10、ADCY1和PGM1四个基因的肝纤维化巨噬细胞相关预后特征模型,并通过单细胞分析发现IER3在髓系细胞中的特异性表达 | 研究依赖于公共数据库数据,样本量有限,需要进一步实验验证 | 探索肝纤维化的复杂发病机制并识别能够预测肝纤维化预后的关键遗传标志物 | 肝纤维化患者样本和健康对照 | 生物信息学 | 肝纤维化 | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, 免疫组织化学染色 | 预后预测模型 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的三个数据集(GSE84044、GSE130970、GSE15654) | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 109 | 2025-10-06 |
Single-cell analysis with childhood and adult systemic lupus erythematosus
2024-12, Autoimmunity
IF:3.3Q3
DOI:10.1080/08916934.2023.2281228
PMID:38347676
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析儿童和成人系统性红斑狼疮患者外周血单核细胞的组成和转录特征差异 | 首次在单细胞水平比较儿童和成人系统性红斑狼疮患者的PBMC组成和转录特征,识别出潜在治疗靶点和生物标志物 | 发病机制仍不明确,样本量未明确说明 | 比较儿童和成人系统性红斑狼疮患者外周血单核细胞的组成和转录特征差异 | 儿童和成人系统性红斑狼疮患者及匹配的健康捐赠者的外周血单核细胞 | 单细胞组学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 110 | 2025-10-06 |
Neutralization of the autophagy-repressive tissue hormone DBI/ACBP (diazepam binding inhibitor, acyl-CoA binding protein) enhances anticancer immunosurveillance
2024-12, Autophagy
IF:14.6Q1
DOI:10.1080/15548627.2024.2411854
PMID:39419485
|
研究论文 | 研究通过中和自噬抑制因子DBI/ACBP来增强抗癌免疫监视 | 首次发现DBI/ACBP可作为自噬检查点,其中和能增强效应T细胞浸润并改善癌症控制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证尚不充分 | 探索DBI/ACBP在癌症免疫监视中的作用机制 | 癌症患者血浆样本和小鼠癌症模型 | 癌症免疫学 | 乳腺癌、非小细胞肺癌、肉瘤 | 单细胞RNA测序、单克隆抗体中和 | NA | 血浆样本、基因表达数据 | 癌症易感综合征患者和普通癌症患者群体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 111 | 2025-10-06 |
Tppp3 is a novel molecule for retinal ganglion cell identification and optic nerve regeneration
2024-12-29, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-024-01917-6
PMID:39734233
|
研究论文 | 本研究探索Tppp3分子在视网膜神经节细胞识别和视神经再生中的作用 | 首次揭示Tppp3在哺乳动物视网膜神经节细胞中的表达及其促进轴突再生的功能 | 研究仅限于啮齿类动物模型,尚未在更高等的哺乳动物中进行验证 | 探索促进中枢神经系统轴突再生的分子调控机制 | 视网膜神经节细胞(RGCs) | 神经科学 | 中枢神经系统损伤 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠、猕猴和人类视网膜神经节细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 112 | 2025-10-06 |
Integrated Mendelian randomization and single-cell RNA-sequencing analyses identified OAS1 as a novel therapeutic target for erectile dysfunction via targeting fibroblasts
2024-Dec-24, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-024-00587-7
PMID:39716299
|
研究论文 | 本研究通过整合孟德尔随机化和单细胞RNA测序分析,首次确定OAS1是通过靶向成纤维细胞治疗勃起功能障碍的新治疗靶点 | 首次整合单细胞RNA测序、孟德尔随机化分析与eQTL/pQTL数据来寻找ED治疗新靶点 | 需要进一步的实验和临床研究来验证OAS1在ED病理中的功能作用和治疗相关性 | 识别勃起功能障碍的新型治疗靶点 | 勃起功能障碍患者 | 生物信息学 | 勃起功能障碍 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析, eQTL分析, pQTL分析 | NA | 基因表达数据, 基因型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 113 | 2025-10-06 |
MAIT cell plasticity enables functional adaptation that drives antibacterial immune protection
2024-12-06, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adp9841
PMID:39642244
|
研究论文 | 本研究揭示了MAIT细胞的可塑性及其在抗菌免疫保护中的功能适应机制 | 首次在体内定义了MAIT1和MAIT17细胞亚群的可塑性,发现MAIT17细胞能够表型和功能转化为MAIT1细胞 | NA | 探究MAIT细胞的可塑性及其在抗菌免疫保护中的作用 | 小鼠和人类MAIT细胞 | 免疫学 | 细菌感染 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 114 | 2025-10-06 |
THBS2 + cancer-associated fibroblasts promote EMT leading to oxaliplatin resistance via COL8A1-mediated PI3K/AKT activation in colorectal cancer
2024-Dec-28, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02180-y
PMID:39732719
|
研究论文 | 本研究揭示THBS2+癌症相关成纤维细胞通过COL8A1介导的PI3K/AKT通路激活促进上皮间质转化,导致结直肠癌奥沙利铂耐药 | 首次发现THBS2+CAF亚群通过COL8A1-ITGB1相互作用激活PI3K/AKT通路促进EMT和奥沙利铂耐药的新机制 | NA | 探索特定CAF亚群促进结直肠癌奥沙利铂耐药的分子机制 | 结直肠癌细胞和癌症相关成纤维细胞 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学分析 | NA | 基因表达数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 115 | 2025-10-06 |
Spatial Proteomics towards cellular Resolution
2024-Dec-25, Expert review of proteomics
IF:3.8Q1
DOI:10.1080/14789450.2024.2445809
PMID:39710940
|
综述 | 本文概述了基于非靶向质谱的空间蛋白质组学工作流程及其向细胞分辨率发展的最新进展 | 强调空间蛋白质组学向细胞分辨率发展的技术突破,包括组织解剖、样品处理、生物信息学和液相色谱-质谱技术的进步 | 需要进一步发展数据分析和开发细胞或亚细胞水平的自动化智能组织解剖技术 | 推动空间蛋白质组学向细胞分辨率发展,深化对组织微环境空间组织的理解 | 组织微环境中的蛋白质空间分布 | 空间生物学 | NA | 非靶向质谱、液相色谱-质谱联用 | NA | 蛋白质组数据 | NA | NA | 空间蛋白质组学 | NA | 基于质谱的空间蛋白质组学工作流程 |
| 116 | 2025-10-06 |
Prostate luminal cell plasticity and cancer
2024-Dec-25, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.217430
PMID:39730086
|
综述 | 本文综述了前列腺管腔细胞可塑性在癌症中的作用及其对治疗耐药性的影响 | 整合了单细胞RNA测序和遗传谱系追踪技术揭示前列腺癌进展中的细胞可塑性和克隆动态变化 | 表观遗传改变如何影响肿瘤免疫原性仍是待研究领域 | 探讨前列腺细胞可塑性在癌症发展和治疗耐药中的作用机制 | 前列腺癌细胞、小鼠模型 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 遗传谱系追踪 | 基因工程小鼠模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 117 | 2025-10-06 |
FABP5+ macrophages contribute to lipid metabolism dysregulation in type A aortic dissection
2024-Dec-25, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.113438
PMID:39447410
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了FABP5+巨噬细胞在A型主动脉夹层脂质代谢失调中的关键作用 | 首次系统评估主动脉夹层中非免疫细胞与免疫细胞间的相互作用及其对代谢的影响,并发现FABP5+巨噬细胞的新亚群 | 研究结果仍需在更大样本中进一步验证,机制研究尚待深入 | 阐明A型主动脉夹层的脂质代谢景观及其病理机制 | A型主动脉夹层患者和模型小鼠 | 多组学分析 | 心血管疾病 | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, 脂质代谢组学 | NA | RNA序列数据, 代谢组学数据 | TAAD模型小鼠和TAAD患者(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 脂质代谢组学 | NA | NA |
| 118 | 2025-10-06 |
Distinct Inflammatory Programs Underlie the Intramuscular Lipid Nanoparticle Response
2024-12-03, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.4c08490
PMID:39563529
|
研究论文 | 本研究通过分析肌肉注射脂质纳米颗粒(LNP)后的免疫反应,揭示了两种不同的炎症基因表达程序 | 首次发现不同化学组成的LNP会诱导截然不同的炎症反应程序,并证明mRNA与LNP协同作用提供有效疫苗接种所需的先天免疫刺激 | 研究仅针对9种LNP进行评估,可能未涵盖所有可能的LNP类型 | 评估mRNA/LNP技术的免疫原性机制 | 脂质纳米颗粒(LNP)及其在肌肉组织中的免疫反应 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 9种不同化学组成的LNP | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 119 | 2025-10-06 |
Spatial diversity of in vivo tissue immunity
2024-12-26, International immunology
IF:4.8Q2
DOI:10.1093/intimm/dxae051
PMID:39177484
|
综述 | 本文探讨了免疫系统在活体组织中的空间多样性及其功能意义 | 通过前沿空间分析技术揭示免疫细胞与非免疫细胞在特定营养和氧气环境中形成功能性免疫生态位 | NA | 理解组织内免疫细胞的空间分布规律及其与微环境的相互作用机制 | 肝脏、肾脏、肠道和肺等器官中的免疫细胞及组织微环境 | 空间转录组学 | 炎症性疾病 | 活体成像、空间转录组学 | NA | 空间转录组数据、活体成像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 120 | 2025-10-06 |
Endothelial response to blood-brain barrier disruption in the human brain
2024-Dec-26, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.187328
PMID:39724015
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和透射电子显微镜分析,揭示了人类脑内皮细胞对超声介导血脑屏障破坏的急性反应机制 | 首次在人类临床试验中直接观察脑内皮细胞对血脑屏障破坏的转录组和超微结构响应 | 样本量有限,仅针对复发性胶质母细胞瘤患者进行研究 | 探究人类脑内皮细胞对血脑屏障破坏的分子和结构响应机制 | 复发性胶质母细胞瘤患者的脑内皮细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 透射电子显微镜 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | I期临床试验患者(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |